Jose Ricardo Murari Pires

possui graduação em química pela Universidade de São Paulo (1991), doutorado em química orgânica pela Universidade de São Paulo (1998) e Pós-doutorado em biologia estrutural no Leibniz-Institut fur Molekulare Pharmakolgie, Alemanha (1999-2002). Atualmente é professor associado da Universidade Federal do Rio de Janeiro. Tem experiência na área de Bioquímica, atuando principalmente nos seguintes temas: Biologia Estrutural, estrutura de proteínas por Ressonância Magnética Nuclear, mapeamento de interações entre proteínas e proteína-ligante e em Química medicinal atuando principalmente nos temas Relações quantitativas entre estrutura química e atividade biológica (QSAR e QSAR-3D).

Informações coletadas do Lattes em 24/08/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado

1998 - Atual

Universidade de São Paulo
Título: Investigação de compostos nitrofurânicos com atividade antimicrobiana: Síntese, determinação de propriedades físico-químicas, relações entre estrutura química e atividade biológica
Antonia Tavares do Amaral. Palavras-chave: 3d Qsar; Antibacterial Activity; Classical Qsar; Hplc; Lipophilicity; Nitrofuran Derivatives. Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Orgânica / Especialidade: Síntese Orgânica. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Farmacologia. Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos; Fabricação de Produtos Químicos; Desenvolvimento de Programas (Software) e Prestação de Serviços em Informática.

Graduação

1991 - Atual

Universidade de São Paulo

Pós-doutorado

1999 - 2002

Pós-Doutorado. , Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie - Berlin, FMP-BERLIN, Alemanha. , Bolsista do(a): Deutscher Akademischer Austauschdienst, DAAD, Alemanha. , Grande área: Ciências Biológicas

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Alemão

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química.

Participação em eventos

FeSBE 2008 - XXIII Reunião Anual. Ligand-receptor interactions measured by SPR (Biacore), calorimetry and NMR. 2008. (Congresso).

22nd International Conference on Magnetic Resonance. Structural Genomics. 2006. (Congresso).

13th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships.Interaction of proline-rich peptides and the wild-type and L30K mutant and WW domains of the human YAP65 studied in solution by NMR spectroscopy. 2000. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: Willy Jablonka

PIRES, J. R.. Clonagem, expressão, purificação e caracterização de SIT4 e TAP42, um complexo fosfatase de Saccharomyces cerevisiae. 2006. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Theo Luiz Ferraz de Souza

PIRES, J. R.. Caracterização da estabilidade do domínio BIR3 da proteína inibidora de apoptose XIAP e de sua interação com o peptídeo AVPI da proteína Smac/DIABLO: implicações na apoptose e no câncer. 2006. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Carolina Cruzeiro da Silva

PIRES, J. R.. Parte I: Estudos estruturais por RMN do peptídeo anticoccidiano PW2 em solução com a sonda paramagnética TOAC. Parte II: Espectroscopia de RMN dentro da célula: Inibição da expressão autóloga reduz a lise celular de E. coli.. 2006. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Carolina Galvão Sarzedas

PIRES, J. R.. Estudos estruturais do peptídeo de fusão do vírus da estomatite vesicular por RMN na presença de vesículas lipídicas e micelas de SDS. 2006. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Leonardo de Castro Palmieri

PIRES, J. R.. Estudo do enovelamento e agregação do monômero da proteína amiloidogênica transtirretina (M-TTR). 2005. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Francisco Gomes Neto

PIRES, J. R.. Interação e estudo estrutural do peptídeo PW2 com membranas fosfolipídicas por ressonância magnética nuclear. 2005. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Humberto Antunes de Almeida Filho

PIRES, J. R.. Aplicação de sondas intrínsecas na caracterização físico-química de proteinas: 77Se e cofatores NADPH e FAD no modelo tioredoxina 1 - tioredoxina redutase 1 de Saccharomices cerevisiae. 2005. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Vitor Hugo Pomin

PIRES, J. R.. 2-dessulfatação seletiva de fucanas sulfatadas: uma abordagem para preparação de oligossacarídeos com estrutura definida. 2005. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Monica Santos de Freitas

PIRES, J. R.; DA POIAN, A. T.; GALLER, R.; SILVA, J. L.; FOGUEL, D.; GASPAR, L. P.. Estudos dos Mecanismos Envolvidos na Aquisição do Estado Fusogênico Viral: Alfavírus (Mayaro) e Filovírus (Ebola) como modelos. 2003. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Gisele Cardoso de Amorin

PIRES, J. R.. Determinação da estrutura da forma reduzida da Tioredoxina 2 de Saccharomyces cerevisae por ressonância magnética nuclear. 2003. Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Fabiana Pestana Albernaz

PIRES, J. R.. Estudos estruturais da alça menor da Ca2+ ATPase de retículo sarcoplasmático por ressonância magnética nuclear e sua interação com a Ca2+ ATPase íntegra. 2006. Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Sheila Maria Barbosa de Lima

PIRES, J. R.. O vírus da hepatite C e o bacteriófago MS2 como modelos para o estudo da estabilidade e dinâmica viral. 2005. Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Pires, J. R.. Concurso Publico para provimento de cargo de professor adjunto. 2015. Universidade Federal de Minas Gerais.

Orientou

Leonardo Bartkevihi Di Piero

Estrutura, Dinâmica e seleção de ligantes de ribose-5-fostafato isomerase isoforma 2 (RPIB2) de T; cruzi e M; tuberculosis; Início: 2016; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Coorientador);

Guilherme Caldas de Andrade

Estrutura; Dinâmica e Ligantes de prolil isomerase FKBP12 de T; brucei e M; tuberculosis; Início: 2016; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Coorientador);

Carlos Alexandre da Silva Rezende

Caracterizacao estrutural da defensina Microplusina de Boophilus microplus; 2010; Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, ; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Rachel Santos de Menezes

Caracterização estrutural do domínio IK kinetoplastídeo-específico de proteínas relacionadas a calpaína; 2010; Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, ; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Rodolpho do Aido Machado

Chagasina, um inibidor de cisteína-protease de T; cruzi: Estrutura, dinâmica e mapeamento da interação com a cruzipaína; 2006; Dissertação (Mestrado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Evérton Dias D'Andrea

Structural Genomics of Kinetoplastids: structure determination, dynamicssss and functional insights into the proteins Q4D6Q6 and Q4DY78; 2016; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Aracelys Lopez Catilla

Emprego da Espectroscopia de RMN no Estudo da Interação de Sticholysinas e modelos miméticos de Membrana e em Genomica Estrutural de Tripanossomatídeos; 2015; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Rodolpho do Aido Machado

Estudos estruturaisl da proteína FKBP12 de Trypanosoma brucei; 2012; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Rachel Santos de Menezes

Caracterizacao estrutural de uma proteina de Trypanossoma brucei contendo o domínio Meta; 2011; Tese (Doutorado em Química Biológica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Rodolpho do Aido Machado

Estrutura de RMN do domínio WW1 da proteína FBP11 e estudo da sua interação com peptídeo rico em prolina; 2004; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biofísica) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Luisa da Silva Espindola

Produção do domínio catalítico de fosfodiesterase B1 de T; brucei (TBRPDEB1) e avaliação farmacológica de possíveis inibidores N-acilidrazonicos; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Giovanna Ricon Couce de Menezes

Avaliação dinâmica da estrutura de um subdomínio n-terminal (NSD) da adenilato ciclase (ESAG4) de T; brucei por RMN; ; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Juliana Orlandi de Oliveira

Avaliação dinâmica da estrutura de um subdomínio N-terminal (NSD) da adenilato ciclase (ESAG4) de T; brucei por RMN; ; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Albaniza Liuana Ribeiro do Nascimento

Genomica Estrutural de Tripanossomatideos e triagem de ligantes para alvos; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Hailton Alves de Melo

Preparação da proteína FKPB12 de T, brucei pra estudos de estrutura por RMN; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Wellington Fernandes da Silva

Preparação da proteína Q4CZ18 de T; cruzi para estudos estruturais por RMN; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Raquel da Mota Domingues

Caracterização estrutural de proteínas conservadas em cinetoplastídeos; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Diego Vieira da Silva

Expressão e Purificação de proteínas conservadas em Kinetoplastideos para estudos de RMN; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Bioquímica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Ricardo Murari Pires;

Produções bibliográficas

BARTKEVIHI, LEONARDO ; CARUSO, ÍCARO P. ; MARTINS, BRUNA ; Pires, José R. M. ; OLIVEIRA, DANIELLE M. P. ; ANOBOM, CRISTIANE DINIS ; ALMEIDA, FABIO C. L. . Insights into the Substrate Uptake Mechanism of Mycobacterium Tuberculosis Ribose 5-Phosphate Isomerase and Perspectives on Drug Development. Biophysica , v. 3, p. 139-157, 2023.
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Projetos de pesquisa

2002 - Atual

Caracterizacao estrutural de proteinas conservadas em cinetoplastídeos, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Jose Ricardo Murari Pires - Coordenador.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Bioquímica Médica. , Av. Brigadeiro Trompowiski s/n CCS Bloco E, sala 10, Ilha do Fundão, 21941-590 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil, Telefone: (21) 25626756, Fax: (21) 38814155

Experiência profissional

2002 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

08/2002
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Ciências Biomédicas.,Linhas de pesquisa