Leandro de Oliveira Santos

Possui doutorado (2017) e mestrado (2012) em Ciências Biológicas (Biofísica) pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF) na Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Graduado em Biomedicina pela Universidade Severino Sombra - Vassouras/RJ (2009) e especialização em Biologia Forense pela Universidade Castelo Branco/Bioforense (2014). Pós-doutorado (2018) pelo Laboratório de Biologia Molecular de Vírus, sob supervisão da Dra. Clarissa Damaso e pelo Laboratoire de Pharmacologie Cellulaire - Institut des Biomolécules Max Mousseron, Faculté de Pharmacie, Université de Montpellier, França (2019), sob supervisão do Dr. Nicolas Floquet. Atualmente pós-doutorando no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) no Instituto Nacional de Câncer (INCA), sob supervisão da Dr. Mariana Boroni. Possui experiência nas áreas de biologia computacional (bioinformática), especialmente nas análises das grandes ômicas (i. e. genômica, fiologenia/filogenômica, metagenômica, transcriptômica, genômica comparativa), montagem e anotação de genomas, bem como, modelagem e dinâmica molecular. Também possui experiência em técnicas laboratoriais de biologia molecular de humanos e microrganismos, genética básica e forense, análises clínicas, análises e manipulação genética de microrganismos e especialmente sequenciamentos do tipo SANGER e NGS.

Informações coletadas do Lattes em 23/05/2023

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Biológicas: Biofísica

2013 - 2017

Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho - UFRJ
Título: Organização genômica, fisiologia e patogenicidade de cepas de Vibrio parahaemolyticus isoladas em território Brasileiro
, Ano de obtenção: 2017. Drª Wanda Maria Almeida von Krüger. Coorientador: Dr. Paulo Mascarello Bisch. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Vibrio parahaemolyticus; Genomica; sistema PhoB/PhoR; Fisiologia; Patogenicidade.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)

2010 - 2012

Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho - UFRJ
Título: Estudos filogeográficos e evolutivos das espécies do gênero Vibrio por análises de bioinformática e modelagem comparativa, Ano de Obtenção: 2012
Paulo Mascarello Bisch.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Filogeografia; Filogenética; Vibrio; Bioinformática.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Especialização em Biologia Forense

2012 - 2014

Universidade Castelo Branco
Título: Identificação de Vítimas de Desastres em Massa: Um Enfoque nas Práticas de Genética Forense
Orientador: Dra. Selma Lílian Sallenave Sales

Graduação em Biomedicina

2006 - 2009

Universidade de Vassouras
Título: Avaliação da determinação de perfis STR autossômicos de amostras forenses em função da natureza biológica e do tempo de armazenagem laboratorial
Orientador: Profª Drª. Selma Lílian Sallenave Sales

Pós-doutorado

2021

Pós-Doutorado. , Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional - INCA, INCA, Brasil. , Bolsista do(a): Instituto Nacional de Câncer, INCA, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

2018 - 2019

Pós-Doutorado. , Laboratoire de Pharmacologie Cellulaire - IBMM, IBMM, França. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

2017 - 2018

Pós-Doutorado. , Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho - UFRJ, IBCCF, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular / Especialidade: Bioinformática.

Formação complementar

2016 - 2016

Curso de Verão sobre Abordagens Metagenomicas e Descoberta de Vírus. (Carga horária: 30h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2015 - 2015

Anotação de Genomas. (Carga horária: 36h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Análise de Transcritomas e microRNAs. (Carga horária: 36h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Montagem de Genomas. (Carga horária: 36h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Genética Forense - Módulo II (Estudos de Casos). (Carga horária: 10h). , DNA Forense - Peritos Associados e Análises Laboratoriais, DNA Forense, Brasil.

2015 - 2015

Métodos de Análise FIlogenética e Filogenômica. (Carga horária: 36h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2014 - 2014

Extensão universitária em Perícia Judicial. (Carga horária: 10h). , Universidade Castelo Branco, UCB/RJ, Brasil.

2013 - 2013

Escola de Altos Estudos em Genômica Funcional. (Carga horária: 90h). , Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho - UFRJ, IBCCF, Brasil.

2011 - 2011

Algoritmos e Programação. (Carga horária: 44h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.

2010 - 2010

Probabilidade e Estatística em Bioinformática. (Carga horária: 8h). , Escola Brasileira de Bioinformática, EBB, Brasil.

2010 - 2010

Biologia de Sistemas. (Carga horária: 40h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.

2010 - 2010

Métodos de Genômica Comparativa. (Carga horária: 8h). , Escola Brasileira de Bioinformática, EBB, Brasil.

2010 - 2010

Bioinformática Estrutural de Proteínas. (Carga horária: 8h). , Escola Brasileira de Bioinformática, EBB, Brasil.

2009 - 2009

Bioinformatics Tools. (Carga horária: 10h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2009 - 2009

Modelagem e Dinâmica Molecular. (Carga horária: 9h). , Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.

2009 - 2009

Introdução a Docagem Molecular. (Carga horária: 9h). , Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.

2009 - 2009

Monitoria de Bioinformática pela Universidade. , UNIVERSIDADE DE VASSOURAS, FUSVE, Brasil.

2008 - 2008

Extensão universitária em II Curso de Inverno de Bioinformática. (Carga horária: 35h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2008 - 2008

Extensão universitária em Cultivo de Céls. Animais e Fund. de Fisio. Celular. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2008 - 2008

Curso de Perícia Criminal (Ciências Forenses). , Integra Cursos, INTEGRA, Brasil.

2008 - 2008

Curso de Perícia Criminal (Toxicologia Forense). , Integra Cursos, INTEGRA, Brasil.

2008 - 2008

Biotecnologia Aplicada à Pesquisa. (Carga horária: 40h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.

2008 - 2008

Genética Forense. (Carga horária: 16h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2007 - 2007

Fun. e Mét. de Bio. Mol. no Diag. Laboratorial. (Carga horária: 16h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2007 - 2007

Monitoria de Química Geral pela Universidade. (Carga horária: 360h). , Universidade Severino Sombra, USS, Brasil.

2006 - 2006

A Biomedicina no Século XXI. , UNIVERSIDADE DE VASSOURAS, FUSVE, Brasil.

2006 - 2006

XVII Curso de Primeiros Socorros. , Universidade Severino Sombra, USS, Brasil.

2006 - 2006

A Farmacologia das Drogas de Abuso. , UNIVERSIDADE DE VASSOURAS, FUSVE, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Francês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Alemão

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

Japonês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular/Especialidade: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos/Especialidade: Genética Forense.

Organização de eventos

SANTOS, L. O. ; PATRICIO, B. F. C. ; SCHNELLRATH, L. C. ; MEDAGLIA, M. L. G. . 2 Curso de Verão - Biologia Celular e Molecular. 2015. (Outro).

Participação em eventos

Oncobiologia. 2022. (Simpósio).

X-meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C. Análise de geômica comparativa de cepas clínicas e ambientais de Vibrio parahaemolyticus isoladas no Brasil: foco em seus potenciais de virulência. 2016. (Congresso).

I Jornada de Biomedicina - Unigranrio.Introdução às Ferramentas de Bioinformática e a Inserção do Biomédico na Era das Ômicas. 2015. (Encontro).

Workshop de Técnicas em Biologia Celular e Molecular.Descobrindo o uso das ferramentas de bioinformática: da pesquisa à clínica. 2015. (Oficina).

XL Congresso da Sociedade Brasileira de Biofísica. Comparative Genomic Analysis of Brazilian Isolates of Vibrio parahaemolyticus. 2015. (Congresso).

1 Congresso Nacional da Associação Brasileira de Antropologa Forense. 2014. (Congresso).

9th Conference Louis Pasteur Emerging Infectious Diseases.Genomic Assembly Improvement Of Two Newly Sequenced Brazilian Isolates Of Vibrio parahaemolyticus Using An Hybrid Approach. 2014. (Simpósio).

Vibrio Congress 2014. Comparative Analysis of Genomics and Proteomics of Two Newly Sequenced Brazilian Isolates of Vibrio parahaemolyticus. 2014. (Congresso).

X-meeting 2013. 2013. (Congresso).

17ª Semana de Extensão - Agenda Acadêmica da Universidade Federal Fluminense.X Prêmio Josué de Castro de Extensão. 2012. (Encontro).

V Latin American Postgraduate Programa of Biophysics Course. 2012. (Outra).

XXXVII Brazilian Biophysical Society Congress. 2012. (Congresso).

XXXVII Brazilian Biophysical Society Congress. Molecular Modelling of the Housekeeping Proteins PyrH, RecA, Mdh and RpoA Between the Core Vibrio Species Group. 2012. (Congresso).

IV Exposição do Instituto Biomédico 0 EXPO IB 2011.Aplicações da Bioinformática em Estudos de Filogeografia. 2011. (Oficina).

The Fourth Conference on the Biology of Vibrios. Phylogeographic studies of Vibrio species by bioinformatic analysis of gyrB, pyrH and recA genes. 2011. (Congresso).

Brazilian Symposium on Bioinformatics. 2010. (Simpósio).

II Simpósio em Genética e Evolução da UFRJ. 2010. (Simpósio).

International Workshop on Genomic Databases. 2010. (Oficina).

IV Fórum da Rede Proteômica do Rio de Janeiro.Organização de banco de dados genômico e proteômico para análises filogeográfica de vibrios. 2010. (Outra).

12 Encontro Nacional de Biomedicina.Avaliação da influência do tempo de armazenagem na obtenção de perfis de DNA em amostras de indivíduos não identificados nos IMLS do Estado do Rio de Janeiro. 2009. (Encontro).

IV Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB 2009). 2009. (Simpósio).

Simpósio Comemorativo - 15 anos Laboratório de Física-Biológica.Bioinformatics analysis of mitochondrial Cytb, COI and COIII genes as potential tools to identify endangered species of the brazilian fauna. 2009. (Simpósio).

VII Congresso Iberoamericano de Biofísica 2009. Bioinformatics analysis of mitochondrial 12S, 16S and COII genes as potential tools to identify endangered species of the brazilian fauna. 2009. (Congresso).

X-meeting 2009. Bioinformatics analysis of mitochondrial Cytb, COI and COIII genes as potential tools to identify endangered especies of the brazilian fauna. 2009. (Congresso).

Auriculopuntura. 2008. (Outra).

Curso de Extensão: Cultivo de Células Animais e Fundamentos de Fisologia Celular (UFRJ). 2008. (Outra).

Curso de Inverno: Biotecnologia Aplicada à Pesquisa (Fiocruz). 2008. (Outra).

Curso de Perícia Criminal (Ciências Forenses). 2008. (Outra).

Curso de Perícia Criminal (Toxicologia Forense). 2008. (Outra).

Doping no Atletismo. 2008. (Outra).

Função Renal: fisiologia e fisiopatologia. 2008. (Outra).

I Encontro de Egressos do Curso de Biomedicina. 2008. (Encontro).

II Curso de Inverno de Bioinformática (USP). 2008. (Outra).

Utilização de Levedura como Modelo de Estudo dos Efeitos Tóxicos e Carcinogênicos Causados por Metais Pesados. 2008. (Outra).

VIII Semana Severino Sombra - Perícias por DNA: Uso e Limitações. 2008. (Outra).

V Jornada de Biomedicina da USS. 2008. (Encontro).

Curso de Extensão: "Fundamentos e Métodos de Biologia Molecular Utilizados no Diagnóstico Laboratorial" pela cateIBCCF/UFRJ. 2007. (Outra).

II Simpósio Internacional de Terapias Avançadas & Células-Tronco. 2007. (Simpósio).

IV Jornada de Biomedicina da USS. 2007. (Encontro).

IV Jornada de Biomedicina da USS - Mini-curso: Atualizações no diagnóstico laboratorial de infecções virais. 2007. (Encontro).

IV Jornada de Biomedicina da USS- Mini-curso: Bases da acupuntura e a importância para o sistema de saúde: a participação efetiva do biomédico e dos demais profissionais habilitados. 2007. (Encontro).

Projeto intitulado "Biomedicina em Foco: O Biomédico como Peça Fundamental da Pesquisa". 2007. (Outra).

Curso de Atualização intitulado "H.P.V papiloma vírus". 2006. (Seminário).

Curso Intracongresso "Laboratório e DST/ AIDS: Do Exame a Fresco à Biologia Molecular". 2006. (Congresso).

Feira de Saúde: Hematócrito e Tipagem Sanguínea.Serviço Voluntariado. 2006. (Outra).

Feira de Saúde: Tipagem Sanguínea.Serviço Voluntariado. 2006. (Outra).

II Congresso Brasileiro de AIDS. 2006. (Congresso).

III Jornada de Biomedicina da USS. 2006. (Outra).

III Jornada de Biomedicina da USS - Mini-Curso: A Biomedicina no Século XXI. 2006. (Outra).

III Jornada de Biomedicina da USS - Mini-Curso: A Farmacologia das Drogas de Abuso. 2006. (Outra).

O Desafio do Uso de Células-Tronco. 2006. (Outra).

Palestra intitulada "O Biomédico no Mercado de Trabalho". 2006. (Outra).

VI Congresso da Sociedade Brasileira de Doenças Sexualmente Transmissíveis. 2006. (Congresso).

XVII Curso de Primeiros Socorros. 2006. (Outra).

Participação em bancas

Aluno: Rafael Nicolay Baptista da Silva

SANTOS, L. O.; SILVA, M. L.; SCHERER, N.; COSTA, L. T.. Desenvolvimento de Metodologias Computacionais para Análises de Bibliotecas Ômicas: Aplicação em Metagenômica. 2017. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Jorge Gomes Borges

SANTOS, L. O.. Aspectos relavantes sobre amostras de DNA de contato (TOUCH DNA): "Uma Ferramenta Promissora de Identificação Humana na Área Forense". 2016. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Biologia Forense) - Universidade Castelo Branco.

Aluno: Daniela dos Santos Oliveira

SANTOS, L. O.. A Importância do Exame de DNA na Identificação de Vítimas de Desastres em Massa. 2016. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Biologia Forense) - Universidade Castelo Branco.

Aluno: Gabriel Fernando Costa da Fonseca

SANTOS, L. O.; CABRAL, L. M.; ALVES, G. G.; SEIXAS, V. C.. Ferramentas ômicas aplicadas ao câncer. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal Fluminense.

Aluno: Marcos Vinícius Geraldes

SANTOS, L. O.; MARTINS, R. V. N.; SILVA, M. L.; AFONSO, A. O.. Análise in silico de genes relacionados à resistência aos fármacos antituberculose. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis.

Aluno: Lucas de Azevedo Vizani

SANTOS, L. O.; GARRIDO, R. G.; GRUSZKOWSKI, C. C. B.. MITOGEN ACTIVATED PROTEIN KINASE (MAPK-P38): ABORDAGENS ESTRUTURAIS E COMPUTACIONAIS. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis.

Aluno: Thamires Lima Magalhães Carvalho

SANTOS, L. O.; AFONSO, P. P.; BAPTISTA, M. A. S.. Comparação entre marcadores genéticos de STR e SNP para análises forenses.. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estácio de Sá.

SANTOS, L. O.. XIV Prêmio Josué de Castro de Extensão. 2016. Universidade Federal Fluminense.

SANTOS, L. O.. XIII Prêmio Josué de Castro de Extensão. 2015. Universidade Federal Fluminense.

SANTOS, L. O.. XII Prêmio Josué de Castro de Extensão. 2014. Universidade Federal Fluminense.

SANTOS, L. O.. X Prêmio Josué de Castro de Extensão. 2012. Universidade Federal Fluminense.

Orientou

Lucas Aleixo Leal Pedroza

Caracterização de subpopulações de macrófagos associados a resposta à imunoterapias em melanoma em resolução celular e espacial; Início: 2022; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal de Pernambuco; (Orientador);

Luís Felipe Madeira Martins de Sá

Avaliação do perfil molecular por imunohistoquímica do glioma difuso de baixo grau 2 de pacientes acompanhados no Instituto Nacional do Câncer; Início: 2022; Iniciação científica (Graduando em Medicina) - Universidade Estácio de Sá; (Orientador);

ANNA CAROLINA DA COSTA ARCANJO

Galleria mellonella como modelo para estudo de patogenicidade das bactérias do gênero Vibrio; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Centro Universitário Hermínio da Silveira; Orientador: Leandro de Oliveira Santos;

Wanessa de Azevedo Jorge

Estudo comparativo entre marcadores STR dos cromossomos Y e X para fins forenses; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estácio de Sá; Orientador: Leandro de Oliveira Santos;

Produções bibliográficas

CAETANO, MÔNICA MARIA MAGALHÃES ; MOREIRA, GABRIELA ALVES ; SILVA, MARIA ROMÉRIA DA ; GUIMARÃES, GABRIELA RAPOZO ; SANTOS, LEANDRO DE OLIVEIRA ; PACHECO, AMANDA DE AMBRÓSIO ; SIQUEIRA, RAONI PAIS ; MENDES, FLÁVIA CARNEIRO ; MARQUES DA SILVA, EDUARDO DE ALMEIDA ; JUNIOR, ABELARDO SILVA ; RANGEL FIETTO, JULIANA LOPES ; SAITO, ÂNGELA ; BORONI, MARIANA ; BRESSAN, GUSTAVO COSTA . Impaired expression of serine/arginine protein kinase 2 (SRPK2) affects melanoma progression. Frontiers in Genetics , v. 13, p. 979735, 2022.
MOREIRA, GABRIELA ALVES ; CAETANO, MÔNICA MARIA MAGALHÃES ; DO VALE, JULIANA ALVES ; DE PAIVA, JANINE CERQUEIRA ; GONÇALVES, VICTOR HUGO SOUSA ; ALMEIDA, ALISSON ANDRADE ; SILVA, LUCAS VIANA GOMES ; MARTIM, FERNANDA REBELLATO GIORDANO ; DE ANDRADE BARROS, MARCUS VINÍCIUS ; GUIMARÃES, GABRIELA RAPOZO ; DE OLIVEIRA SANTOS, LEANDRO ; DE SOUZA, ANA PAULA MARTINS ; MACHADO-NEVES, MARIANA ; TEIXEIRA, RÓBSON RICARDO ; SILVA-JÚNIOR, ABELARDO ; FIETTO, JULIANA LOPES RANGEL ; BORONI, MARIANA ; DE OLIVEIRA, LEANDRO LICURSI ; BRESSAN, GUSTAVO COSTA . The SRPK inhibitor N-(2-(piperidin-1-yl)-5-(trifluoromethyl)phenyl) isonicotinamide (SRPIN340) increases the immune response against metastatic melanoma in mice. BIOCHEMICAL PHARMACOLOGY , v. 203, p. 115161, 2022.
SANTOS, LEANDRO DE O. ; DE LANNA, CRISTÓVÃO A. ; ARCANJO, ANNA CAROLINA DA C. ; BISCH, PAULO M. ; VON KRÜGER, WANDA M. A. . Genotypic Diversity and Pathogenic Potential of Clinical and Environmental Vibrio parahaemolyticus Isolates From Brazil. Frontiers in Microbiology , v. 12, p. 10.3389, 2021.
DE OLIVEIRA SANTOS, LEANDRO ; GUEDES, IAMÊ ALVES ; AZEVEDO, SANDRA MARIA FELICIANO DE OLIVEIRA ; PACHECO, ANA BEATRIZ FURLANETTO . Occurrence and diversity of viruses associated with cyanobacterial communities in a Brazilian freshwater reservoir. BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 52, p. 773-785, 2021.
GUIMARÃES, GABRIELA RAPOZO ; ALMEIDA, PALLOMA PORTO ; DE OLIVEIRA SANTOS, LEANDRO ; RODRIGUES, LEANE PERIM ; DE CARVALHO, JULIANA LOTT ; BORONI, MARIANA . Hallmarks of Aging in Macrophages: Consequences to Skin Inflammaging. Cells , v. 10, p. 1323, 2021.
SANTOS, L. O. . Avanço da imunização contra SARS-CoV-2 e o impacto no controle da disseminação das novas variantes. In: Antônio Neres Norberg; Bianca Magnelli Mangiavacchi; Carlos Henrique Medeiros de Souza; Fernanda Castro Manhães; Nadir Francisca Sant?Anna. (Org.). COVID-19: Saúde e interdisciplinaridade 2. 1ed.Ponta Grossa: Atena, 2021, v. 2, p. 189-205.
SANTOS, L. O. ; NORBERG, A. N. ; SOUZA, C. H. M. ; MANHAES, F. C. ; SANTANNA, N. F. . Desenvolvimento de vacinas contra SARS-CoV-2. In: Antônio Neres Norberg; Carlos Henrique Medeiros de Souza; Fernanda Castro Manhães; Nadir Francisca Sant?Anna. (Org.). COVID-19: saúde e interdisciplinaridade. 1ed.Campos dos Goytacazes: Encontrografia, 2020, v. 1, p. 179-194.
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SANTOS, L. O. ; BISCH, P. M. . Phylogeographic studies of Vibrio species by bioinformatic analysis of gyrB, pyrH and recA genes. In: The Fourth Conference on the Biology of Vibrios, 2011, Santiago de Compostela. Abstract Book, 2011. p. 43-44.
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SANTOS, L. O. ; VALIM, N. C. P. ; OLIVEIRA, L. R. ; LIRIO, R. C. ; VILLELA, C. G. . AVALIAÇÃO FARMACOLÓGICA DO EXTRATO FOLICULAR DE DESMONCUS POLYACANTHOS: ENFOQUE ANTIINFLAMATÓRIO. In: Encontro Nacional de Iniciação Científica - ENIC, 2008, Vassouras - RJ. Encontro Nacional de Iniciação Científica - Resumos, 2008.
SANTOS, L. O. ; OLIVEIRA, L. R. ; PAREDES, R. S. ; OLIVEIRA, C. C. S. ; CORTEZ JR, J. C. ; CORTEZ, P. P. . AIDS na Terceira Idade: Realidade ou Ficção?. In: VI Encontro de Iniciação Científica da USS, 2007, Vassouras - RJ. VI Encontro de Iniciação Científica da USS - Resumos, 2007.
SANTOS, L. O. ; BISCH, P. M. ; KRUGER, W. M. A. V. . Comparative genomic analysis of clinical and environmental strains of Vibrio parahaemolyticus isolated in Brazil: insight into their virulence potential. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
SANTOS, L. O. ; LANNA, C. ; BISCH, P. M. ; KRUGER, W. M. A. V. . Identification of Pho regulon genes and Pho box-like sequences in genomes of clinical and environmental isolates of Vibrio parahaemolyticus from Brazil. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
LANNA, C. ; SANTOS, L. O. ; BISCH, P. M. ; KRUGER, W. M. A. V. . Genotypic characterization of Vibrio parahaemolyticus strains isolated in Brazil. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
SANTOS, L. O. ; BISCH, P. M. ; KRUGER, W. M. A. V. . Comparative Genomic Analysis of Brazilian Isolates of Vibrio parahaemolyticus. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
SANTOS, L. O. ; HOFFMANN, L. ; SILVA, R. ; URMENYI, T. ; BISCH, P. M. ; KRUGER, W. M. A. V. . Genomic Assembly Improvement Of Two Newly Sequenced Brazilian Isolates Of Vibrio parahaemolyticus Using An Hybrid Approach. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SANTOS, L. O. ; HOFFMANN, L. ; SILVA, R. ; URMENYI, T. ; BISCH, P. M. ; KRUGER, W. M. A. V. . Comparative Analysis of Genomics and Proteomics of Two Newly Sequenced Brazilian Isolates of Vibrio parahaemolyticus. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
SANTOS, L. O. . Técnicas em Biologia Molecular. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SANTOS, L. O. . Alinhamentos Múltiplos e Reconstrução Filogenética. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SANTOS, L. O. ; HOFFMANN, L. ; SILVA, R. ; URMENYI, T. ; BISCH, P. M. ; KRUGER, W. M. A. V. . Comparative Genomics of Two Newly Sequenced Brazilian Isolates of Vibrio parahaemolyticus. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
PERISSE, M. ; SANTOS, L. O. ; HOFFMANN, L. ; SILVA, R. ; URMENYI, T. ; BISCH, P. M. ; KRUGER, W. M. A. V. . Sequencing and Annotation of the Brazilian Vibrio parahaemolyticus isolate 20173 Genome. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
LANNA, C. ; SANTOS, L. O. ; HOFFMANN, L. ; SILVA, R. ; URMENYI, T. ; BISCH, P. M. ; KRUGER, W. M. A. V. . Sequencing and Annotation of the Genome of the Brazilian Vibrio parahaemolyticus Strain Cascavel. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
SANTOS, L. O. . Alinhamentos Múltiplos e Reconstrução Filogenética. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SANTOS, L. O. ; BISCH, P. M. . Molecular Modelling of the Housekeeping Proteins PyrH, RecA, Mdh and RpoA Between the Core Vibrio Species Group. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
SANTOS, L. O. ; BISCH, P. M. . Phylogeographic studies of Vibrio species by bioinformatic analysis of gyrB, pyrH and recA genes. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SANTOS, L. O. . Aplicações da Bioinformática em Estudos de Filogeografia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SANTOS, L. O. . Introdução à Bioinformática. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SANTOS, L. O. . Disciplina de Bioinformática. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).
SANTOS, L. O. ; BISCH, P. M. . Organização de banco de dados genômico e proteômico para análises filogeográfica de vibrios. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).
SANTOS, L. O. . Aplicações da Bioinformática em Estudos de Filogeografia. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SANTOS, L. O. . Análise Filogenética por Bioinformática: Filogeografia de Vibrios. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SANTOS, L. O. ; VIANEZ-JÚNIOR, J. L. S. G. ; BISCH, P. M. . BIOINFORMATICS ANALYSIS OF MITOCHONDRIAL CYTB, COI AND COIII GENES AS POTENTIAL TOOLS TO IDENTIFY ENDANGERED SPECIES OF THE BRAZILIAN FAUNA. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
SANTOS, L. O. ; VIANEZ-JÚNIOR, J. L. S. G. ; BISCH, P. M. . BIOINFORMATICS ANALYSIS OF MITOCHONDRIAL CYTB, COI AND COIII GENES AS POTENTIAL TOOLS TO IDENTIFY ENDANGERED SPECIES OF THE BRAZILIAN FAUNA. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
SANTOS, L. O. ; VIANEZ-JÚNIOR, J. L. S. G. ; BISCH, P. M. . Bioinformatics analysis of mitochondrial 12S, 16S and COII genes as potential tools to identify endangered species of the brazilian fauna. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
SANTOS, L. O. ; OLIVEIRA, L. R. ; VOIGT, D. D. ; FREITAS, N. ; PRATA, D. ; ARAUJO, K. ; SALLENAVE-SALES, S. L. . Avaliação de metodologias para extração de DNA na determinação de perfis STR autossômicos em ossadas de indivíduos não identificados nos IMLs do Estado do RJ. 2009. (Apresentação de Trabalho/Outra).
SANTOS, L. O. ; CUNHA, C. F. ; FREITAS, N. ; PRATA, D. ; ARAUJO, K. ; SALLENAVE-SALES, S. L. . Avaliação da influência do tempo de armazenagem na obtenção de perfis de DNA em amostras de indivíduos não identificados nos IMLS do Estado do Rio de Janeiro. 2009. (Apresentação de Trabalho/Outra).
SANTOS, L. O. ; VALIM, N. C. P. ; OLIVEIRA, L. R. ; LIRIO, R. C. ; VILLELA, C. G. . AVALIAÇÃO FARMACOLÓGICA DO EXTRATO FOLICULAR DE DESMONCUS POLYACANTHOS: ENFOQUE ANTIINFLAMATÓRIO. 2008. (Apresentação de Trabalho/Outra).
SANTOS, L. O. ; OLIVEIRA, L. R. ; PAREDES, R. S. ; OLIVEIRA, C. C. S. ; CORTEZ JR, J. C. ; CORTEZ, P. P. . AIDS na Terceira Idade: Realidade ou Ficção?. 2007. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Outras produções

SANTOS, L. O. . Organismos geneticamente modificados (OGMs) - legislação e uso de OGMs. 2022. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . MCB485 - Bioinformática e Genômica Funcional. 2022. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SANTOS, L. O. . Organismos geneticamente modificados (OGMs) - legislação e uso de OGMs. 2021. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Biologia Molecular. 2021. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . MCB485 - Bioinformática e Genômica Funcional. 2021. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SANTOS, L. O. . Organismos geneticamente modificados (OGMs) - legislação e uso de OGMs. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Biologia Molecular. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . MCB485 - Bioinformática e Genômica Funcional. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SANTOS, L. O. . Organismos geneticamente modificados (OGMs) - legislação e uso de OGMs. 2019. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Biologia Molecular. 2019. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Organismos geneticamente modificados (OGMs) - legislação e uso de OGMs. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Biologia Molecular. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Organismos geneticamente modificados (OGMs) - legislação e uso de OGMs. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Genética Forense. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Organismos geneticamente modificados (OGMs) - legislação e uso de OGMs. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Genética Forense. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Genética Básica. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Organismos geneticamente modificados (OGMs) - legislação e uso de OGMs. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Genética Forense. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

SANTOS, L. O. . Técnicas em Biologia Molecular. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SANTOS, L. O. . Alinhamento Múltiplo e Análises Filogenéticas: Teórico e Prático. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SANTOS, L. O. . Técnicas em Biologia Molecular. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SANTOS, L. O. . Métodos Experimentais da Física em Biociências. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SANTOS, L. O. . Bioinformática - CFB 222. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SANTOS, L. O. . Filogeografia. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

2013 - Atual

Genômica Comparativa de Cepas de Vibrio Parahaemolyticus Isoladas no Brasil, Descrição: V. parahaemolyticus é uma bactéria encontrada em águas salobras e estuários na forma de vida livre ou associada a eucariotos marinhos. Além disso, o homem pode torna-se um potencial hospedeiro para V. parahaemolyticus ao ingerir esses frutos do mar contaminados com a bactéria. Além de causar gastroenterites, V. parahaemolyticus também pode causar infecção da pele quando em contato com ferimentos, desencadeando um processo necrosante em tecidos moles, chegando até uma septicemia. Já foram descritos importantes fatores de virulência para essa espécie como TDH, TRH e o fator de secreção do tipo 3 (T3SS), entretanto o completo funcionamento do processo patogênico ainda não é bem compreendido. O objetivo deste projeto é sequenciar cepas de V. parahaemolyticus isoladas no Brasil e realizar uma genômica comparativa principalmente na busca de novos fatores de virulência e genes relacionados com a captação e metabolismo de fosfato (importante para sobrevivência da bactéria no ambiente).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Leandro de Oliveira Santos - Integrante / Paulo Marcarello Bisch - Coordenador / Wanda Maria de Almeida von Krüger - Integrante.
2010 - Atual

Análise por Bioinformática de Genes Mitocondriais como Potenciais Ferramentas para Identificação de Espécies Ameaçadas de Extinção na Fauna Brasileira, Descrição: No Brasil, aproximadamente 657 espécies animais estão sobre controle no processo de comercialização, sendo divididas entre espécies comercializáveis, espécies sob controle e espécies ameaçadas de extinção. Das espécies ameaçadas de extinção podemos contabilizar 58 animais. É importante identificar espécies ameaçadas, para incentivar melhores legislações nacionais e internacionais. Sequenciamento de DNA é um método rápido de identificação, porém precisa de regiões genômicas variáveis flanqueadas por regiões conservadas que permitam o anelamento dos primers de PCR. O objetivo deste projeto é identificar regiões gênicas do genoma mitocondrial que possam servir de ferramenta para a identificação de espécies ameaçadas de extinção no Brasil, utilizando ferramentas de Bioinformática e Análises Filogenéticas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Leandro de Oliveira Santos - Coordenador / Paulo Marcarello Bisch - Integrante.
2010 - Atual

Estudos Evolutivos das Espécies do Gênero Vibrio por Modelagem Comparativa, Descrição: Bactérias do gênero Vibrio são Gram-negativas de ocorrência natural em ambientes marinhos, estuarinos e águas costeiras em todo o mundo. Existem mais de 85 espécies do gênero Vibrio. De todos as espécies, Vibrio cholerae, Vibrio parahaemolyticus e Vibrio vulnificus são os responsáveis pela vasta maioria das infecções humanas causadas por bactérias do gênero Vibrio. Uma variedade de eventos genômicos têm influenciado continuamente a evolução das espécies de Vibrio e as relações evolutivas entre organismos pode ser estudada por comparação entre macromoléculas. O objetivo deste projeto é entender melhor os processos evolutivos que regem esse gênero através da construção e comparação de modelos estruturais de proteínas selecionadas de espécies do gênero Vibrio.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Leandro de Oliveira Santos - Coordenador / Paulo Marcarello Bisch - Integrante.
2010 - Atual

Estudos Filogeográficos e Evolutivos das Espécies do Gênero Vibrio, Descrição: Bactérias do gênero Vibrio são Gram-negativas de ocorrência natural em ambientes marinhos, estuarinos e águas costeiras em todo o mundo. Existem mais de 85 espécies do gênero Vibrio. Vibrio cholerae, Vibrio parahaemolyticus e Vibrio vulnificus são os responsáveis pela vasta maioria das infecções humanas causadas por bactérias do gênero Vibrio. Filogeografia é uma área de estudo baseada nos princípios e processos que governam as distribuições geográficas das linhagens genealógicas, especialmente aquelas dentre e entre espécies intimamente relacionadas. O objetivo deste projeto é a reconstrução das relações filogenéticas entre espécies do gênero Vibrio, através da análise de determinadas sequências do genoma, levando em consideração localizações geográficas das linhagens de origem.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Leandro de Oliveira Santos - Coordenador / Paulo Marcarello Bisch - Integrante.

Prêmios

2016

Honorable mention Award, X-meeting 2016 - 12th International Conference of AB3C.

Histórico profissional

Endereço profissional

Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional - INCA. , Rua André Cavalcanti, n 37, 2o andar., Centro, 21941902 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil, Telefone: (021) 32076546, URL da Homepage:

Experiência profissional

2015 - 2016

Bioforense Projetos Educacionais

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Convidado, Carga horária: 4

Outras informações:
Professor convidado para a disciplina de genética básica

2017 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Carga horária: 40

2013 - 2017

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorando, Carga horária: 40

2010 - 2012

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrando, Carga horária: 40

2009 - 2010

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20

Outras informações:
Aluno de iniciação científica no Laboratório de Física-Biológica do Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho da Universidade Federal do Rio de Janeiro. Orientado pelo Prof Dr Paulo Mascarello Bisch e pelo Prof João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior, foram desenvolvidos trabalhos que visavam a determinação de relações filogenéticas, por genes mitocondriais, através de ferramentas da bioinformática, de espécies ameaçadas de extinção, bem como a definição de alvos genéticos na diferenciação das mesmas. Foram apresentados e publicados em anais de congressos dois trabalhos intitulados: ?Bioinformatics analysis of mitochondrial 12S, 16S and COII genes as potential tools to identify endangered species of the brazilian fauna? e ? Bioinformatics analysis of mitochondrial Cytb, COI and COIII genes as potential tools to identify endangered species of the brazilian fauna?.

Atividades

01/2012 - 06/2012
Ensino, Ciências Biológicas: Biotecnologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Bioinformática
01/2011 - 07/2011
Ensino, Ciências Biológicas: Biofísica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática (CFB 222)
01/2011 - 07/2011
Ensino, Ciências Biológicas: Biofísica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Métodos Exp da Física em Biociências (BMW 353)
01/2009 - 06/2010
Estágios , Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Laboratório de Física Biológica.,Estágio realizado, Desenvolvimento de projetos de pesquisa voltados para a área de Bioinformática e filogenética.

2008 - 2009

Instituto de Pesquisa e Perícias em Genética Forense (DGPTC/PCERJ)

Vínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 24

Outras informações:
Estagiário do Instituto de Pesquisa e Perícias em Genética Forense (DGPTC/IPCERJ) e orientado pela Profª Drª Selma Lílian Sallenave Sales, foi desenvolvido o trabalho de conclusão de curso intitulado "Avaliação na determinação de perfis STR autossômicos de amostras forenses em função da natureza biológica e do tempo de armazenagem laboratorial". Este trabalho foi parte integrante de um grande projeto que vem sendo desenvolvido no IPPGF, denominado Localizar, que visa a criação de um banco de perfis genéticos para fins de identificação de restos mortais de indivíduos não identificados pelos métodos convencionais. Como etapas desenvolvidas em laboratório foram realizados procedimentos como manuseio e pré-tratamento de amostras biológicas advindas do IMLAP, extrações de DNA, quantificação por PCR em tempo real, PCRs, análise dos resultados por eletroforese capilar e softwares específicos, dentre outros.

Atividades

08/2008 - 12/2009
Estágios , Instituto de Pesquisa e Perícias em Genética Forense (DGPTC/PCERJ).,Estágio realizado, Participação do Projeto de Pesquisa denominado Localizar bem como a elaboração do Trabalho de Conclusão de Curso.

2009 - 2009

Universidade Severino Sombra - Bioinformática

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário

Outras informações:
Estágio supervisionado pela Profª Joelma Freire de Mesquita, com objetivo de aprimorar as técnicas e conhecimentos no manuseio das ferramentas de bioinformática na solução de problemas biológicos.

Atividades

02/2009 - 07/2009
Estágios , Universidade Severino Sombra.,Estágio realizado, Conhecimento e aprimoramento de técnicas e ferramentas utilizadas pela bioinformática para resolução de problemas biológicos.

2009 - 2009

Hospital Universitário Sul Fluminense

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário

Outras informações:
Auxiliar no Laboratório nos setores de Bioquímica, Hematologia, Microbiologia, Parasitologia e Urinálise.

Atividades

02/2009 - 07/2009
Estágios , Hospital Universitário Sul Fluminense.,Estágio realizado, Auxiliar no Laboratório nos setores de Bioquímica, Hematologia, Microbiologia, Parasitologia e Urinálise.

2009 - 2009

Laboratório de Citogenética - HUSF

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário

Outras informações:
Auxiliar no Laboratório.

Atividades

02/2009 - 07/2009
Estágios , Laboratório de Citogenética - HUSF.,Estágio realizado, Auxiliar no Laboratório.