Jorge Guerra Pires

I have accomplished my bachelor degree in Production Engineering (Engenharia de Produção), awarded by Federal University of Ouro Preto (UFOP, Universidade Federal de Ouro Preto, Brasil). My main focus was optimization, mainly mathematical-computational models (2005-2009). I have attended my master degree in science on the framework of the double diploma programme between Italy (University of L'Aquila) and Poland (Gdansk University of Technology): recognized in Brazil by USP as bioinformatics. I have focused on Systems Biology and Computational Intelligence (2010-2012), however the programme provided a strong background in physics and mathematics. I have accomplished my PhD in Information Engineering (focused on biomathematics), recognized by USP as Bioinformatics (2014-2017).

Informações coletadas do Lattes em 11/10/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ingegneria e scienze dell'informazione

2014 - 2017

Università degli Studi dell'Aquila
Título: Mathematical modeling in energy homeostasis, appetite control and food intake with a special attention to ghrelin
Orientador: Costanzo Manes
Coorientador: Pasquale Palumbo. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: ghrelin; mathematical physiology; mathematical biology; hormonal control; leptin; insulin. Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Mestrado em Technical physics

2010 - 2012

Gdansk University of Technology
Título: On the applicability of computational Intelligence in transcription network modelling, Ano de Obtenção: 2012
Orientador: Pasquale Palumbo
Coorientador: Amabile Tatone. Palavras-chave: Gene Expression; Systems Biology; Computational Intelligence; Numerical Simulations; Neural Networks.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia / Especialidade: Modelagem de Fenômenos Biológicos. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Systems Biology.

Mestrado em Mathematical Engineering

2010 - 2012

University of L'Aquila
Título: On the applicability of Computational Intelligence in Transcription Networks Modeling, Ano de Obtenção: 2012
Orientador: Pasquale Palumbo
Coorientador: Amabile Tatone. Palavras-chave: Systems Biology; Numerical Simulations; Gene Expression; Neural Networks; Modelagem matemática.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia / Especialidade: Modelagem de Fenômenos Biológicos.

Graduação em Engenharia de Produção

2005 - 2009

Universidade Federal de Ouro Preto
Título: Engenharia do produto: desenvolvimento de um filme para auxiliar profissionais das áreas médica e médica no tratamento correto da icterícia
Orientador: Prof. Dra. Andrea Gomes Campos Bianchi

Pós-doutorado

2017 - 2018

Pós-Doutorado. , Universidade Federal da Bahia, UFBA, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Formação complementar

2019 - 2019

Radiobiologia. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2018 - 2018

Introdução à Teoria de Redes. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal da Bahia, UFBA, Brasil.

2018 - 2018

1st LARS-IASC School on Computational Statistics and Data Science. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal da Bahia, UFBA, Brasil.

2016 - 2016

The Interplay Between Big Data and Sparsity in Control and Systems Identifi. (Carga horária: 20h). , Centrale Supelec, SACLAY, França.

2016 - 2016

Tools for nonlinear control, Lyapunov function, positivity, applications. (Carga horária: 21h). , University of L'Aquila, UAQ, Itália.

2016 - 2016

1st SYSBIO.IT School on Computational Systems Biology. (Carga horária: 15h). , Università degli Studi Milano-Bicocca, UNIMIB, Itália.

2015 - 2015

Mathematical Thermodynamics of complex fluids. (Carga horária: 21h). , Centro Internazionale Matematico Estivo, CIME, Itália.

2013 - 2013

Controle de sistemas inteligentes. (Carga horária: 2h). , BRICS-CCI & CBIC 2013, BRICS-CCI & CBIC, Brasil.

2013 - 2013

An introduction to swarm intelligence. (Carga horária: 4h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2013 - 2013

On natural Computation. (Carga horária: 2h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2013 - 2013

Redes Neurais Artificiais. (Carga horária: 2h). , BRICS-CCI & CBIB 2013, BRICS-CCI & CBIB, Brasil.

2013 - 2013

Spiking Neural Networks. , Pontifíca Universidade do Rio de Janeiro, PUC-RIO, Brasil.

2013 - 2013

Dynamics in Complex Networks. (Carga horária: 64h). , Instituto de Estudos Avançados - USP, IEA-USP, Brasil.

2012 - 2012

Intensive programme in biofluids. , University of L'Aquila, UAQ, Itália.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Bem.

Italiano

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Polonês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Quantitativa.

Grande área: Engenharias / Área: Engenharia de Produção / Subárea: Pesquisa Operacional/Especialidade: Programação Linear, Não-Linear, Mista e Dinâmica.

Grande área: Engenharias / Área: Engenharia de Produção / Subárea: Engenharia do Produto/Especialidade: Desenvolvimento de Produto.

Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia/Especialidade: Modelagem de Sistemas Biológicos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Systems Biology.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Engenharia Elétrica / Subárea: Computational Intelligence.

Organização de eventos

PIRES, J. G. ; Kolodkin, A ; Matteo Barberis, M ; ANDRADE, R. F. S . Data science and mathematical modeling applied to biological systems: How mathematical models can be advantageous for data scientists and statisticians. 2018. (Outro).

PIRES, J. G. ; Di Marco Antinisca ; MASEDU, F.Masedu ; REIS, A. J. R. . Computational Intelligence and Biomathematics. 2017. (Outro).

Participação em eventos

Thursday Morning Science.Thursday Morning Science. 2021. (Seminário).

V Encontro em Modelagem Matemática e Computacional do Crescimento Tumoral. 2019. (Outra).

First Conference on Statistics and Data Science. Stochastic models in medicine and life sciences: a short-term dynamics for ghrelin. 2018. (Congresso).

III Congresso Brasileiro de Jovens Pesquisadores em Matemática Pura, Aplicada e Estatística. Stochastic models in medicine and life sciences: a short-term dynamics for ghrelin. 2018. (Congresso).

XXXVIII Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional. 2018. (Congresso).

2016 joint meeting of the European Society for Mathematical and Theoretical Biology and the Society for Mathematical Biology. "A Mathematical Model for Ghrelin: energy homeostasis and appetite control"/"Design and development of new products: a crash course in biomathematics". 2016. (Congresso).

Poster week.On the mathematical modeling in gene expression estimation: an initial discussion on PBM and BM. 2016. (Oficina).

Thursday Morning Science TMS.A Mathematical Model for Ghrelin: Energy homeostasis and appetite control. 2016. (Encontro).

17th Portuguese Conference on Artificial Intelligence. 2015. (Congresso).

The 1st SyBSyM Lake Como School, Systems Biology and Systems Medicine: precision biotechnology and therapies.On the mathematical modeling in gene expression estimation: an initial discussion on PBM and BM. 2014. (Outra).

Bioinformatics and Compiutational Intelligence. 2013. (Simpósio).

BRICS-CCI & CBIC 2013. Neural Networks in Transcription Networks: An alternative and complementary approach for the observer-based method. 2013. (Congresso).

Complex Systems Symposium. 2013. (Simpósio).

II Workshop and School on Dynamics, Transport and Control in Complex Networks ? ComplexNet.On the mathematical modelling in gene expression estimation. 2013. (Outra).

Mathematical Models and Methods for Living Systems.On the mathematical modeling in gene expression estimation: an initial discussion on PBM and BM. 2013. (Outra).

Intensive Programme on Biofluid.Designing a neural network for transcription Networks. 2012. (Seminário).

SIMPEP (Simpósio de Engenharia de Produção).Papers accepted. 2012. (Simpósio).

1º escola luso-brasileira de computação evolutiva. Mutação por Matriz de Covariância Amostral da População em Estratégias Evolutivas. 2009. (Congresso).

IX Encontro brasileiro de Redes Neurais. 2009. (Congresso).

XVI SIMPEP.DESENVOLVIMENTO DE UM PROGRAMA BASEADO EM OTIMIZAÇÃO PARA O PROBLEMA DE MISTURA. 2009. (Simpósio).

XVI SIMPEP.PROJETO E DESENVOLVIMENTO DE PRODUTO: PROPOSTA E DESENVOLVIMENTO DE DISPOSITIVO ELETRÔNICO ORGÂNICO PARA AUXILIAR NO TRATAMENTO DA ICTERÍCIA. 2009. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: EVANDRO PEREIRA DE SOUZA

PIRES, J. G.; NEVES, A. G. M.; MOREIRA, C. H. C.; FERREIRA, E. M.. Um estudo do processo evolutivo de Moran em grafos. 2019. Dissertação (Mestrado em Matemática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Eliza Maria Ferreira

NEVES, A. G. M.; MOREIRA, C. H. C.; MISTRO, D. C.; LIMA, P. C.;PIRES, J. G.. PROBABILIDADES DE FIXAÇÃO ASSINTÓTICAS PARA O PROCESSO DE MORAN COM DUAS ESTRATÉGIAS E O PROCESSO DE MORAN PARA TRÊS ESTRATÉGIAS. 2019. Tese (Doutorado em Matemática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Orientou

Taisiya Shepelyuk

2016 SMB/ECMTB mentoring programme; 2016; Orientação de outra natureza; (2016 joint meeting of the European Society for Mathematical and Theoretica) - University of Nottingham; Orientador: Jorge Guerra Pires;

Produções bibliográficas

PIRES, JORGE GUERRA . Machine learning in medicine using JavaScript: building web apps using TensorFlow.js for interpreting biomedical datasets. REVISTA DE INFORMÁTICA TEÓRICA E APLICADA: RITA , v. 31, p. 32-49, 2024.
Guerra Pires, Jorge . SnakeChat: a conversational-AI based app for snake classification. Qeios , v. 1, p. 1-29, 2024.
Guerra Pires, Jorge . Data Science Using OpenAI: Testing Their New Capabilities Focused on Data Science. Qeios , v. 1, p. 1-28, 2024.
PIRES, JORGE GUERRA ; DIAS BRAGA, LUIZ HENRIQUE . SnakeFace: a transfer learning based app for snake classification. REVISTA BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO APLICADA , v. 15, p. 80-95, 2023.
PIRES, J.G. . ALGUNS INSIGHTS EM STARTUPS: VENCENDO O DILEMA DA `PERSONALIZAÇÃO VS. CUSTO? DA MEDICINA DE PRECISÃO?. REVISTA GESTÃO & SAÚDE (BRASÍLIA) , v. 10, p. 261-275, 2019.
PIRES, JORGE GUERRA . A hybrid algorithm for parameter estimation of the short-ghrelin dynamics. ITEGAM- Journal of Engineering and Technology for Industrial Applications (ITEGAM-JETIA) , v. 4, p. 85-90, 2018.
PIRES, J. G. . Taste and the regulation of food intake: insights and comments. REVISTA GESTÃO & SAÚDE (BRASÍLIA) , v. 8, p. 180-195-195, 2017.
PIRES, J.G. ; BORRI, A. ; De Gaetano, A. ; MANES, C. ; PALUMBO, P. . A short-term dynamical model for ghrelin. IFAC-PAPERSONLINE , v. 50, p. 11011-11016, 2017.
PIRES, J. G. . Fisiologia matem?tica, biologia matem?tica, e biomatem?tica: leptina e a busca pelo controle de peso. REVISTA GESTÃO & SAÚDE (BRASÍLIA) , v. 6, p. 2982, 2015.
PIRES, J. G. . Uma Iniciação às Equações Diferenciais Estocásticas: discussões e insights sem minudência matemática. Anais - SIMPEP , v. XXII, p. 1-15, 2015.
PIRES, J. G. . Biomechanics, computational Intelligence, and systems biology with application on vitreous dynamics using Java: An incipient discussion. Academia Journal of Scientific Research , v. 2, p. 007-018, 2014.
PIRES, J. G. ; MAGGIO, R. ; MANES, C. ; Palumbo, P. . On the importance of pharmacokinetics and pharmacodynamics in engineering sciences as an inter- and multidisciplinary field: an introductory analysis. Anais - SIMPEP , v. XXI, p. 1, 2014.
PIRES, J. G. ; MANES, C. ; Palumbo, P. . On the importance of optimal control theory in engineering sciences as a complementary and supplementary methodology to Operations Research: a case-study analysis. Anais - SIMPEP , v. XXI, p. 1, 2014.
PIRES, J. G. ; MAGGIO, R. ; MANES, C. ; Palumbo, P. . Engineering Sciences: pharmacokinetics and pharmacodynamics as an inter- and multidisciplinary field. REVISTA GESTÃO & SAÚDE (BRASÍLIA) , v. 6, p. 1055-67, 2014.
PIRES, J.G. . Uma introdução aos métodos matemáticos nas ciências da vida: aprendendo sobre modelos computacionais e matemáticos aplicados à biologia e medicina. 1. ed. , 2022. v. 1. 252p .
PIRES, J.G. . O mercado da criatividade Regulamentação da profissão de pesquisador acadêmico e científico no Brasil. 1. ed. Ouro Preto: publicação indepedente/Amazon Kindle, 2022. 85p .
PIRES, J.G. . Introdução à pesquisa científica: aprenda sobre a pesquisa científica e como ela pode ser parte da sua carreira. 1. ed. Ouro Preto: publicação indepedente, 2022. v. 2. 160p .
PIRES, J. G. . Qual o real papel do revisor acadêmico? Como jogar uma espécie de loteria, propensa a polarização e facilmente abusada. 1. ed. Ouro Preto: Edição do autor, 2022. v. 1. 165p .
PIRES, J.G. . Computational Thinking: How computers think, decide and learn, when human limits start and computers champ. Vol.1. 1. ed. edição do autor, 2022. v. 1. 220p .
PIRES, J.G. . Manual de bolso do jovem pesquisador: da iniciação científica ao pós-doutorado, vol. 1.: iniciação científica. 1. ed. publicação independente, 2022. v. 1. 179p .
PIRES, JORGE GUERRA . Neural Networks in Transcription Networks: An Alternative and Complementary Approach for the Observer-Based Method. In: 2013 BRICS Congress on Computational Intelligence & 11th Brazilian Congress on Computational Intelligence (BRICSCCI & CBIC), 2013, Ipojuca. 2013 BRICS Congress on Computational Intelligence and 11th Brazilian Congress on Computational Intelligence, 2013. p. 282.
PIRES, J. G. . ON THE IMPORTANCE OF BIOLOGY IN ENGINEERING SCIENCES: BIOMATHEMATICS AND BIOENGINEERING SCIENCES. In: SIMPEP (Simpósio de Engenharia de Produção), 2013, Bauru. Anais SIMPEP. Bauru: SIMPEP, 2013. v. XX. p. 1-12.
PIRES, J. G. . Design and Development of New Products: Modeling the Vitreous Dynamics. In: SIMPEP (Simpósio de Engenharia de Produçõa), 2012, Bauru, São Paulo. GESPRO. Bauru: UNESP, 2012. v. XIX.
PIRES, J. G. ; Palumbo, P. . Software Engineering: Designing a program based on Computational Intelligence applied to Transcription Network Modeling. In: SIMPEP (Simpósio de Engenharia de Produçõa), 2012, Bauru, São Paulo. GESPRO. Bauru: UNESP, 2012. v. XIX.
PIRES, J. G. ; DUARTE, ANDRÉ SILVEIRA ; BIANCHI, RODRIGO FERNANDO ; SANTOS, ZIRLENE ALVES DA SILVA ; BIANCHI, Andrea . PROJETO E DESENVOLVIMENTO DE PRODUTO: PROPOSTA E DESENVOLVIMENTO DE DISPOSITIVO ELETRÔNICO ORGÂNICO PARA AUXILIAR NO TRATAMENTO DA ICTERÍCIA. In: SIMPEP, 2009, Bauru. SIMPEP, 2009.
PIRES, J. G. . DESENVOLVIMENTO DE UM PROGRAMA BASEADO EM OTIMIZAÇÃO PARA O PROBLEMA DE MISTURA. In: SIMPEP, 2009, Bauru. Simpósio de Engenharia de Produção. Bauru: UNESP, 2009. v. XVI.
PIRES, J.G. ; Dias Braga, LH . SnakeFace: a transfer learning based app for snake classification. REVISTA BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO APLICADA , 2023.
PIRES, J. G. ; Di Marco Antinisca ; MASEDU, F.Masedu . Introduction to Matlab for medical doctors and biologists. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
PIRES, J. G. . A hybrid algorithm for parameter estimation of the ghrelin dynamics based on in vivo data. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
PIRES, J. G. . A crash course in biomathematics: a tutorial. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
PIRES, J. G. . Neural Networks in Transcription Networks: An alternative and complementary approach for the observer-based method. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
PIRES, J. G. . On the mathematical modelling in gene expression estimation. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).
PIRES, J. G. . NA IMPORTÂNCIA DA BIOLOGIA EM ENGENHARIAS: BIOMATEMÁTICA E BIOENGENHARIAS. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
PIRES, J. G. . Planejamento e desenvolvimento de Novos Produtos: Modelando a dinâmica do Vítreo. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
PIRES, J. G. ; Palumbo, P. . Software Enginnering: Design and development of program based on computational intelligence applied to transcription networks. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
PIRES, J. G. . On the applicability of Computational Intelligence in Transcription Network Modeling: Designing a Neural Network for Transcription Networks. 2012. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).
PIRES, J. G. . Algumas discussões em Redes Biológicas: Teoria, perspectivas e aplicações. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).
PIRES, J. G. . DESIGNING A NEURAL NETWORK FOR TRANSCRIPTION NETWORKS WITH A SUGGESTIVE REFERENCE TO BIOFLUID DYNAMICS. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
PIRES, J. G. . Neural Computing: designing a neural network for transcription network. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
PIRES, J. G. ; Felipe Campelo ; GUIMARAES., F. G. . Mutação por Matriz de Covariância Amostral da População em Estratégias Evolutivas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
PIRES, J. G. ; BIANCHI, Andrea . MODELAGEM FÍSICO-MATEMÁTICA DE UM DISPOSITIVO AUXILIAR NO TRATAMENTO DA ICTERÍCIA. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
PIRES, J. G. ; DUARTE, ANDRÉ SILVEIRA ; BIANCHI, RODRIGO FERNANDO ; SANTOS, ZIRLENE ALVES DA SILVA ; BIANCHI, Andrea . Design and Development of New products: proposal and development of a electronic device for assisting in the neonatal jaundice treatment?. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
PIRES, J. G. . Development of Program based on the blend problem. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
PIRES, JORGE GUERRA . Robodoc: a conversational-AI based app for medical conversations. MedRXiv, 2024 (Preprints).
DUARTE, ANDRÉ SILVEIRA ; PIRES, J. G. ; Vasconcelos, Cláudia K. ; Ferreira, Giovana R. ; BIANCHI, RODRIGO FERNANDO ; BIANCHI, Andrea . Blue-light dosimeter based on luminescent polymers and measuring device 2009 (Demostração).

Outras produções

PIRES, J. G. . ResearchGate. 2015; Tema: Scientific papers and discussions. (Rede social).

PIRES, J. G. . Academia Edu. 2015; Tema: Scientific papers and discussions. (Rede social).

PIRES, J. G. . Ghrelin, Insulin, and Leptin: a mathematical model approach. 2015; Tema: My current research as a PhD student. (Blog).

PIRES, J. G. . Ghrelin, leptin, and insulin. 2015; Tema: My PhD research. (Rede social).

PIRES, J. G. . Linkedin. 2015; Tema: General. (Rede social).

PIRES, J. G. . Jorge G Pires (Main). 2014; Tema: Short publications, papers, and miscellaneous topics, general purposes. (Blog).

PIRES, J. G. . Biologia Sistêmica. 2014; Tema: Biologia Sistêmica. (Blog).

PIRES, J. G. . Systems Biology and Learning Machine. 2014; Tema: Systems biology, computational intelligence. (Blog).

PIRES, J. G. . Stochastic models in life sciences and medicine. 2014; Tema: Stochastic models. (Blog).

PIRES, J.G. . Uma introdução aos métodos matemáticos nas ciências da vida: Aprendendo sobre modelos computacionais e matemáticos aplicados à biologia e medicina, vol. 1. 2022. (online course).

PIRES, J.G. . Uma introdução aos métodos matemáticos nas ciências da vida Aprendendo sobre modelos computacionais e matemáticos aplicados à biologia e medicina, vol. 1. 2021. .

PIRES, J.G. . Innovating with Biomathematics: The challenge of building user-friendly interfaces for computational biology. 2021. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

PIRES, J. G. . Data Science and Biomathematics: An introduction to mathematical modeling applied to biological systems with Matlab. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

PIRES, J. G. . Computacional Intelligence based image segmentation. 2018. (Relatório de pesquisa).

PIRES, J. G. ; Di Marco Antinisca ; MASEDU, F.Masedu . Introduction to Matlab for medical doctors and biologists. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

PIRES, J. G. ; Borri, A ; MANES, C. ; Palumbo, P. ; De Gaetano, A. . A Mathematical Model for Ghrelin: energy homeostasis and appetite control. 2016. (Poster).

PIRES, J. G. ; Pietrantoni, I ; MAGGIO, R. . Design and development of new products: a crash course in biomathematics . 2016. (Poster).

Projetos de pesquisa

2014 - 2017

Ghrelin mathematical modeling, Descrição: Insulin has been the only well understood hormones so far. In this project we aim at designing a more complete picture regarding energy homeostasis, that is to say, linking ghrelin, insulin, and leptin mathematically.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge Guerra Pires - Coordenador / Pasquale Palumbo - Integrante / Costanzo Manes - Integrante / Alessandro Borri - Integrante / Andrea De Gaetano - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 10

Prêmios

2018

Migliori tesi di dottorato di ricerca in discipline biomediche (best PhD thesis in biomedical disciplines), Fondazione Abruzzese per le Scienze della Vita ONLUS (FASVO).

2014

Best articles in teaching in engineering, UNESP-SIMPEP.