Victor Emanoel Armini Caldas

Pesquisador em biofísica na Universidade de Amsterdam e no Insituto de Fisica Atomica e Molecular (AMOLF). Tenho interesse na interface entre física e biologia, com foco do desenvolvimento de tecnologias para análise de sistemas complexos a partir de imagens e microscopia. Atualmente trabalho com padrões de forrageamento (foraging patterns) e estrutura e coneções de redes em micorriza. Outros projetos involvem o desenvolvimento de dispositivos de microfluídica e programaçãoem código aberto para análise de imagens. Possui doutorado pela Universisidade de Groningen (Países Baixos - 2016) onde desenvolvi técnicas de microscopia de fluorescência para estudar o comportamento de proteínas envolvidas no reparo de DNA e maquinaria de replicação em procariotos. Ainda, possuo graduação em Ciências Físicas e Biomoleculares pela Universidade de São Paulo (2009) e mestrado em Fisica ? Física Biomolecular pela Universidade de São Paulo (2011).

Informações coletadas do Lattes em 31/08/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Biofísica

2011 - 2015

University Of Groningen
Título: Single-Molecule studies on DNA replication machinery
Orientador: Antoine van Oijen
Coorientador: Andrew Robinson. Bolsista do(a): Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek, NWO, Holanda. Palavras-chave: Biofísica; Molécula única; DNA replication.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

Mestrado em Física

2010 - 2011

Universidade de São Paulo
Título: Estudos cinéticos e estruturais da Adenosina Fosforibosil Transferase de Schistosoma mansoni,Ano de Obtenção: 2011
Otavio Henrique Thiemann.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Biofísica; DNA repair; Biologia Molecular Estrutural.Grande área: Ciências Biológicas

Graduação em Ciências Físicas e Biomoleculares

2006 - 2009

Universidade de São Paulo
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Pós-doutorado

2016

Pós-Doutorado. , Vrije Universiteit, VU, Holanda. , Bolsista do(a): European Research Council, ERC, Holanda. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: MIcroscopy.

Formação complementar

2014 - 2014

Dresden Summer School in Systems Biology. (Carga horária: 55h). , Center for Systems Biology Dresden, CSBD, Alemanha.

2009 - 2009

Workshop - Biofísica Quimica. (Carga horária: 5h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2007 - 2007

Extensão universitária em Genômica, Proteômica e Células-tronco. (Carga horária: 6h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2007 - 2007

I Curso de Inverno de Bioinformática. (Carga horária: 35h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2006 - 2006

Extensão universitária em Fisiologia Humana Avançada Aplicada à pesquisas ... (Carga horária: 30h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Single Molecule Microscopy.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Biofísica Molecular.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Biologia Celular.

Participação em eventos

Gordon Conference - Single Molecule Approaches to Biology. Single Molecule imaging of the SOS responde: tracking the DNA polymerases in live E. coli cells. 2012. (Congresso).

XXVI Annual Meeting of Brazilian Society for Protozoology. Selenocysteine Incorporation Machinery in Naegleria gruberi. 2010. (Congresso).

XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq) e XI Reunião da Panamerican Association for Biochemistry and Molecular Biology (PABMB). Study of Microbial Diversity of Brazilian Savanna Conserver Regions and a Eucalyptus Culture. 2008. (Congresso).

I Escola de Física Computacional Moderna. 2006. (Seminário).

São Carlos Special Medicinal Chemistry Meeting. 2006. (Encontro).

Produções bibliográficas

2015 ROBINSON, ANDREW ; MCDONALD, JOHN P. ; CALDAS, VICTOR E. A. ; PATEL, MEGHNA ; WOOD, ELIZABETH A. ; PUNTER, CHRISTIAAN M. ; GHODKE, HARSHAD ; COX, MICHAEL M. ; WOODGATE, ROGER ; GOODMAN, MYRON F. ; VAN OIJEN, ANTOINE M. . Regulation of Mutagenic DNA Polymerase V Activation in Space and Time. PLOS Genetics (Online) , v. 11, p. e1005482, 2015.
2015 CALDAS, VICTOR E. A. ; PUNTER, CHRISTIAAN M. ; GHODKE, HARSHAD ; ROBINSON, ANDREW ; VAN OIJEN, ANTOINE M. . iSBatch: a batch-processing platform for data analysis and exploration of live-cell single-molecule microscopy images and other hierarchical datasets. Molecular Biosystems (Print) , v. 11, p. 2699-2708, 2015.
2014 POZZI, ELOISA ; MEGDA, CLAUDIA REGINA ; CALDAS, VICTOR E.A. ; DAMIANOVIC, MÁRCIA ; PIRES, EDUARDO CLETO . Microbial population in an aerated thermophilic reactor that treats recycled cardboard plant wastewater. Journal of Water Process Engineering , v. 4, p. 74-81, 2014.
2013 Del Nery, V. ; DAMIANOVIC, M.H.Z. ; Pozzi, E. ; DE NARDI, I.R. ; CALDAS, V. E. A. ; PIRES, E.C. . Long-term performance and operational strategies of a poultry slaughterhouse waste stabilization pond system in a tropical climate. Resources, Conservation and Recycling , v. 71, p. 7-14, 2013.
2013 DA SILVA, M.T.A. ; CALDAS, V.E.A. ; COSTA, F.C. ; SILVESTRE, D.A.M.M. ; THIEMANN, O.H. . Selenocysteine Biosynthesis and Insertion Machinery in Naegleria gruberi. Molecular and Biochemical Parasitology (Print) , v. 188, p. 87/7-90, 2013.
2011 SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO ; ALESSANDRO, FERNANDO ; CALDAS, VICTOR EMANOEL ARMINI ; MARÇAL, RAFAELA LEITE ; D'MUNIZ PEREIRA, HUMBERTO ; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE ; GARRATT, RICHARD CHARLES . Promiscuous interactions of human septins: The GTP binding domain of SEPT7 forms filaments within the crystal. FEBS Letters (Print) , v. 585, p. 3868-3873, 2011.
CALDAS, V. E. A. ; Alessandro, F ; Thiemann, O H . Study of microbial diversity of brazilian savanna conserved regions and a eucalyptus culture. In: XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2008, Águas de Lindóia - SP. Program and Index, 2008. v. 16. p. 133.
GHODKE, HARSHAD ; CALDAS, V. E. A. ; PUNTER, CHRISTIAAN M. ; VAN OIJEN, ANTOINE M. ; ROBINSON, ANDREW . Single-Molecule Specific Mislocalization of Red Fluorescent Proteins in Live Escherichia coli. Biophysical Journal (Print) , 2016.
CALDAS, R.A. ; CALDAS, V. E. A. ; PRADO, F.B. ; Groppo, FC ; CARIA, P.H.F. ; DARUGE JUNIOR, E. . Aplicação de métodos estatísticos e redes neurais em dados morfométricos da abertura piriforme e ossos nasais e sua importância forense. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Del Nery, V. ; Pozzi, E. ; Danianovic, M. ; CALDAS, V. E. A. ; Pires, E. . Caracterização das comunidades microbianas em lagoa facultativa em sobrecarga orgânica de um sistema de tratamento de água residuária de abaterouro de aves. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Megda, C. R. ; Pozzi, E. ; CALDAS, V. E. A. ; Pires, E. . Tratamento aeróbio termofílico de água residuária de industria de embalagem de papel em reator de leito móvel - desempenho e populações microbianas. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
CALDAS, V. E. A. ; Alessandro, F ; Thiemann, O H . Study of microbial diversity of brazilian savanna conserved regions and a eucalyptus culture. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

CALDAS, V. E. A. . To leave or not to leave: O não tão complicado mundo da pós-graduação no exterior. 2013; Tema: Pós-graduação no exterior em seus diversos aspectos. (Blog).

Prêmios

2011

Prêmio M. Issao, SBPqO - Sociedade Brasileira de Pesquisa Odontológica.

2008

Bolsa de Estudos, University of Illinois at Urbana-Champaign - Howard Hughes Medical Institute (UIUC/HHMI).

Histórico profissional

Endereço profissional

Vrije Universiteit Amsterdam. , De Boelelaan 1085,, Buitenveldert-West, 1081HV - Amsterdam, - Holanda, Telefone: (064) 8612901, URL da Homepage:

Experiência profissional

2011 - 2015

University Of Groningen

Vínculo: PhD Assistant, Enquadramento Funcional: PhD Assistant, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

10/2011 - 02/2012
Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Monitor - Biofísica Molecular

2010 - 2011

Universidade de São Paulo

Vínculo: Mestrado em Física Aplicada, Enquadramento Funcional: Aluno, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2006 - 2010

Universidade de São Paulo

Vínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Aluno, Carga horária: 20

Outras informações:
Estágio no laboratório de Cristalografia sob orientação do Prof. Dr. Otávio H. Thiemann

Atividades

06/2008 - 08/2011
Estágios , Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.,Estágio realizado, Estudos Cinéticos e Estrtuturais das proteinas Adenosina Desaminase (ADA) e Fosfo-Ribosil Trasnferase ( APRT) de Schistosoma mansoni.
06/2010 - 12/2010
Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Estágio PAE - Física Geral para Químicos
03/2010 - 06/2010
Ensino, Ciências Físicas e Biomoleculares, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Monitoria - Física Moderna, Física Moderna
05/2006 - 12/2009
Estágios , Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.,Estágio realizado, Análise de diversidade microbiana e parâmetros ecológicos baseada em técnicas de Biologia Molecular estudando o gene 16S rDNA.

2008 - 2009

University Of Illinois At Urbana-Champaign

Vínculo: Visiting Scholar in Physics, Enquadramento Funcional: Visiting Scholar, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

12/2008 - 03/2009
Estágios , Institute for Genomic Biology e Loomis Lab (Dept. of Physics), .,Estágio realizado, Mechanism of membrane fusion induced by SNARE proteins using fluorescence based single vesicle methods. Orientação: Prof. Taekjip Ha.

2016 - Atual

Vrije Universiteit Amsterdam

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 38, Regime: Dedicação exclusiva.