Anderson Rodrigues dos Santos

This individual is a highly accomplished professional in the field of Computer Science. They hold a degree in Computer Science from the Catholic University of Minas Gerais, Brazil and have pursued further education with a Master's degree in Computer Science specializing in Artificial Intelligence from the esteemed Federal University of Minas Gerais, Brazil. They have also achieved a Ph.D. in Bioinformatics from the same university. Their extensive experience includes making significant contributions in the assembly and annotation of the first genome project conducted entirely in Minas Gerais, Brazil related to the bacterium Corynebacterium pseudotuberculosis. They have utilized computer science extensively for the assembly and annotation of genomes. Their skills and expertise led them to be a post-doctoral fellow at the UFMG's Laboratory of Cellular and Molecular Genetics in the year 2012, where they were responsible for coordinating masters and doctoral students involved in assembling, annotating, and analyzing several bacterial genomes. Since 2013, they have been an accomplished professor at the Federal University of Uberlândia, Faculty of Computing. Some of the courses they teach include databases, programming in languages like C, Java, and optimization. They have also been a part of the computer science post-graduate program guiding master's students since 2014. Additionally, they lead the Comp2Bio laboratory, which aims to provide students with a background in Computer Science with Biological knowledge, completing their formation. With their skills and expertise, they have contributed significantly to the field of Computer Science and Bioinformatics.

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Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioinformática

2008 - 2012

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: A GENÔMICA COMO FERRAMENTA PARA SELEÇÃO DE ALVOS CONTRA A LINFADENITE CASEOSA
, Ano de obtenção: 2012. Dr. Vasco Ariston de Carvalho Azevedo. Coorientador: Dr. Artur Luiz da Silva. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Corynebacterium pseudotuberculosis; Montagem e anotação de genomas completos; Banco de Dados Relacional; Vacinologia Reversa (VR); Análise de sequencias biologicas; Proteômica. Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Mestrado em Ciências da Computação

1997 - 1999

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Construção de uma base de conhecimento para projetos de redes telefonicas utilizando KADS, Ano de Obtenção: 1999
José Lopes de Siqueira Neto.Palavras-chave: CommonKADS; Lisp; AutoCAD; Telefonia; Redes.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Linguagens de Programação. Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Sistemas de Informação.

Aperfeiçoamento em Bioinformática

2007 - 2007

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Não procede.. Ano de finalização: 2007
Orientador: Gloria Regina Franco

Graduação em Ciência da Computação

1991 - 1995

Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, PUC Minas

Pós-doutorado

2012 - 2013

Pós-Doutorado. , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.

Formação complementar

2014 - 2014

Extensão universitária em Formação de Professores Autores em EaD. (Carga horária: 100h). , Universidade Federal de Uberlândia, UFU, Brasil.

2010 - 2010

Clonagem e expressão de antígenos recombinantes. (Carga horária: 80h). , Universidade Federal de Pelotas, UFPEL, Brasil.

2010 - 2010

Plataforma de Seqüenciamento de Nova Geração. (Carga horária: 90h). , Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Inteligência Artificial.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Banco de Dados.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Linguagens de Programação.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Organização de eventos

SANTOS, A. R. ; NASCIMENTO, M. Z. . IX Workshop de Teses e Dissertações em Ciências da Computação (WTDCC). 2015. (Outro).

Santos, A.R. ; PINTO, A. C. ; CERDEIRA, L. T. ; RAMOS, R. T. J. ; ALMEIDA, S. S. ; SOARES, S. C. ; D'AFONSECA, V. ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, M. P. ; AZEVEDO, V. . Plataforma de Sequenciamento de Nova Geração. 2010. (Outro).

Santos, A.R. ; PINTO, A. C. ; CERDEIRA, L. T. ; RAMOS, R. T. J. ; ORELLANA, S. C. ; ALMEIDA, S. S. ; SOARES, S. C. ; D'AFONSECA, V. ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, M. P. ; AZEVEDO, V. . I Workshop Bioinformática. 2009. (Outro).

Participação em eventos

International Conference And Expo On Clinical Microbiology. International Conference And Expo On Clinical Microbiology. 2022. (Congresso).

International Conference And Expo On Clinical Microbiology. A bridging centrality plugin for GEPHI and a case study for mycobacterium tuberculosis H37Rv. 2022. (Congresso).

X-meeting 2018 - 14th International Conference of the AB3C. 2018. (Congresso).

III SIFBIO - Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática. 2014. (Simpósio).

VIII Workshop de teses e dissertações em Ciência da Computação.Reduzindo a Supervisão de Monte Carlo em Agentes para Go - Por: Gabriel Santos. 2014. (Oficina).

VIII Workshop de teses e dissertações em Ciência da Computação.Algoritmos Evolutivos Multiobjetivos aplicados ao Problema de Roteamento Multicast com Qualidade de Serviços - Por: Thiago Fialho. 2014. (Oficina).

VI Encontro de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia (ENAPEBI).Mature Epitope Density - A strategy for detecting exported prokariotic proteins related to antigenicity. 2012. (Encontro).

7th International Conference of th Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting. The Corynebacterium pseudotuberculosis pan genomics reverse vaccinology. 2011. (Congresso).

56th Congresso Brasileiro de Genética. Identificação de desordem proteica em proteoma de Corynebacterium Pseudotuberculosis usando dados de Phage Display. 2010. (Congresso).

6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. A singular value decomposition approach for improved taxonomy classification of biological sequences. 2010. (Congresso).

Uso de ferramentas de bioinformática na predição de epitopos de células B e T.Predição de epitopos lineares por meio de álgebra linear. 2009. (Oficina).

Participação em bancas

Aluno: Fernanda Rodrigues Oliveira

NOMURA, S.; ROSA, P. F.;Santos, A.R.; SILVA, F. O.; PARREIRA, F. J.. Um Novo Sistema e-Health para Monitoramento Remoto de Pacientes em Atenção Domiciliar. 2023. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Gumercindo Rodrigues Chaves Neto

SANTOS, A. R.; BONATO, V.; JULIA, R. M. S.; NASCIMENTO, M. Z.; BARBOZA, F. L. M.. Técnicas de Machine Learning Aplicadas à Predição de Tendência em Ativos Financeiros Negociados na B3. 2023. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Marlon de Alencar Rocha

FERNANDES, M. A.; GABRIEL, P. H. R.; CARNEIRO, M. G.;SANTOS, A. R.; RAMPAZZO, P. C. B.. Análise de um Algoritmo de Estimação de Distribuição Híbrido no Problema de Escalonamento de Tarefas Independentes. 2023. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: William Ferreira dos Anjos

Santos, Anderson R; AMARAL, L. R.; SANTOS, M. A.. GENPPI: um software autônomo para predição ab initio de redes de interação entre proteínas bacterianas. 2021. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Luiz Gustavo de Sousa Oliveira

SANTOS, A. R.; SIQUEIRA NETO, J. L.; GABRIEL, P. H. R.; BARIONI, M. C. N.. Predição de Proteínas de Bactérias Secretadas Por Vias Não Clássicas" por Luiz Gustavo de Sousa Oliveira. 2020. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Getúlio de Morais Pereira

SANTOS, A. R.; FERNANDES, M. A.; CAMPOS, S. V. A.. Características inerentes a medidas de centralidade e uso de algoritmos de aprendizado de máquina para classificação de bridging nodes. 2018. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Cláudio Douglas Gouveia Linhares

LINHARES, C. D. G.; TRAVENCOLO, B. A. N.; PAIVA, J. G. S.;SANTOS, A. R.. Técnicas de Análise Visual de Redes Temporais. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Luiz Carlos Felix Carvalho

FERNANDES, M. A.; SOARES, A. S.;SANTOS, A. R.. Algoritmo híbrido multiobjetivo para o problema Flexible Job Shop. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Lucio Paccori Lima

SANTOS, M. A.;SANTOS, A. R.; COUTO, B. R. G. M.; CAMPOS FILHO, F. F.; CAMPELO, J. A. F. G.; ORTEGA, J. M.; PINTO, L. P.. Algoritmos Para Mineração De Dados Utilizando Regressão Logística - Aplicação Em Bioinformática Estrutural. 2023. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Carmelina Figueiredo Vieira Leite

SANTOS, M. A.; SANTOS, L. H. S.; ORTEGA, J. M.; COUTO, B. R. G. M.; STARLING, C. E. F.;SANTOS, A. R.. A new method for ligand-based virtual screening using linear algebra. 2020. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Gabriela da Silva Guimarães

TEIXEIRA, S. C.;Santos, A.R.; SILVA, R. M. G.. Potential CD73 Inhibitors: A Computational Analysis of Natural Products. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Bioquímica) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Lucio Paccori Lima

ORTEGA, J. M.; COUTO, B. R. G. M.; CAMPELO, J. A. F. G.;Santos, A.R.. Novos Algoritmos para Classificação Estrutural de Proteínas. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Leonardo Saponi de Souza

Santos, A.R.; SOARES, A. S.; ARAUJO, R. D.. Evolução Incremental do Sistema exomaDB: Modernização Tecnológica e Implementação de Módulo de Visualização de Anotações Genômicas. 2025. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Felipe Barcelos Ribeiro

ABDALA, D. D.; NASCIMENTO, M. Z.;Santos, A.R.. Clusterpub: um sistema para clusterização de artigos científicos. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Rafael Faria Macedo Gonçalves

SOARES, A. S.; BRITO, L. F. A.;Santos, A.R.. Desenvolvimento e Integração de API REST para a Comunicação entre o Pannotator e o Medpipe. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Amanda Silva Moreira

MOREIRA, A. S.;Santos, A.R.. Classificação de proteínas expostas na superficie com Random Forest. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Amanda Silva Moreira

SOARES, A. S.; GABRIEL, P. H. R.;SANTOS, A. R.. Predição de Proteínas Expostas na Superfície com Random Forest. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Bruno Henrique Ferreira Torres

BACKES, A. R.;SANTOS, A. R.; NOMURA, S.. A influência tecnológica no ensino no contexto da pandemia Covid-19. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Vı́tor Hugo Honorato Tiago

SANTOS, A. R.; FERNANDES, M. A.; LIMA, M. A. V.. Predição de proteínas exportadas por meio de Redes Neurais Artificiais. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Gabriel Rodrigues da Silva

SILVA, G. R.; ALBERTINI, M. K.; ABDALA, D. D.;SANTOS, A. R.. Projeto de um novo algoritmo para mesclagem de agrupamentos de dados. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Marco Antônio dos Santos

SANTOS, A M; GABRIEL, P. H.; ESCARPINATI, M. C.;Santos, A.R.. Algoritmo Multiobjetivo para o Problema de Sequenciamento de Tarefas em Múltiplas Máquinas. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia.

Aluno: Manuella Souza Silvério

BONETTI, A. M.;Vieira, Carlos U.Santos, Anderson R. dos. Caracterização parcial do genoma e transcriptoma Mitocondrial de Melipona Scuttelares. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal de Uberlândia.

RODRIGUES, C. C.;SANTOS, ANDERSON RODRIGUES DOS; FERREIRA, D. P. L.. EDITAL 094/2013 - Processo seletivo simplificado para contratação de professor substituto. 2013. Universidade Federal de Uberlândia.

Orientou

Gustavo Henrique Leal da Fonseca

GenPPi: Análise Comparativa de Interações Proteína-Proteína via Aprendizado de Máquina em Quatro Cepas de Kosakonia cowanii Isoladas no Triângulo Mineiro; Início: 2025; Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia; (Orientador);

Davi Mota Campos

GenPPi: Análise Comparativa de Interações Proteína-Proteína via Aprendizado de Máquina em Quatro Cepas de Kosakonia cowanii Isoladas no Triângulo Mineiro; Início: 2025; Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; (Orientador);

Allisson William da Silva

Melhoria da quantidade e qualidade de predições do Genppi via uso do Random Forest em Common Lisp para identificar similaridade proteica; 2025; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia, ; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Luiz Gustavo de Sousa Oliveira

Predição de proteínas de bactérias secretadas por vias não clássicas; ; 2020; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia, ; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

William Ferreira dos Anjos

GenPPI - Software para geração de redes de interação entre proteínas bacterianas; 2018; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Getúlio de Morais Pereira

Características inerentes a medidas de centralidade e uso de algoritmos de aprendizado de máquina para classificação de bridging nodes; 2015; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia, ; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Leonardo Saponi de Souza

Evolução Incremental do Sistema exomaDB: Modernização Tecnológica e Implementação de Módulo de Visualização de Anotações Genômicas; 2025; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Felipe Barcelos Ribeiro

Clusterpub: um sistema para clusterização de artigos científicos; 2024; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Rafael Faria Macedo Gonçalves

Desenvolvimento e Integração de API REST para a Comunicação entre o Pannotator e o Medpipe; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Amanda Silva Moreira

Predição de Proteínas Expostas na Superfície com Random Forest; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Vitor Hugo Honorato Tiago

Predição de proteínas exportadas pro meio de Redes Neurais Artificiais; 2020; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Tatiane Fernanda de Souza Silva

Modelagem molecular: predição de estruturas de peptídeos pelo método ab initio; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Murilo Marques Armelin Gomes

Implementação de um filtro para ruídos para agrupamento em bases de dados bibliográficas utilizando a Indexação Semântica Latente; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Willian Apolinário Lopes

Análise sobre a predominância genética na anotação de um organismo; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Israel Cortes Rodrigues

Mapeamento de Interações Proteína-Proteína Comuns a Bactérias do Grupo CMNR e Análise de Interações; 2013; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Eudes Guilherme Vieira Barbosa

ANÁLISE DE PSEUDOGENES EM DIFERENTES LINHAGENS DE CORYNEBACTERIUM PSEUDOTUBERCULOSIS; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Davi Mota Campos

Capacitando profissionais de saúde e educadores no diagnóstico de doenças raras e na interpretação genómica por meio da bioinformática; 2025; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Murilo Alves Beppler

Capacitando profissionais de saúde e educadores no diagnóstico de doenças raras e na interpretação genómica por meio da bioinformática; 2025; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Lucas Ramos Fernandes da Silva

Estudo da oxidação anaeróbica de metano via relação sinérgica entre organismos archaea e bactéria utilizando algoritmos de anotação de genomas, construção e análise de rede de interação proteica e análise de dados via bancos de dados relacionais; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Gestão da Informação) - Universidade Federal de Uberlândia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Matheus Ribeiro Prado

Estudo da oxidação anaeróbica de metano via relação sinérgica entre organismos archaea e bactéria utilizando algoritmos de anotação de genomas, construção e análise de rede de interação proteica e análise de dados via bancos de dados relacionais; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Gestão da Informação) - Universidade Federal de Uberlândia, Pró-Reitoria de Graduação da Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Iury Gregório Godoy

The GenPPI tool enhanced Protein Interaction Network Generation with Machine Learning-Based Protein Similarity Inference; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Gestão da Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Murilo Alves Beppler

Estudo da oxidação anaeróbica de metano via relação sinérgica entre organismos archaea e bactéria utilizando algoritmos de anotação de genomas, construção e análise de rede de interação proteica e análise de dados via bancos de dados relacionais; 2024; Iniciação Científica - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Carlos Augusto Dantas Marquez

Estudo da oxidação anaeróbica de metano via relação sinérgica entre organismos archaea e bactéria utilizando algoritmos de anotação de genomas, construção e análise de rede de interação proteica e análise de dados via bancos de dados relacionais; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Gabriel Chagas Lanes

Técnicas computacionais para filtragem e otimização de performance de classificadores criados por aprendizagem de máquina supervisionado para diagnóstico da SarsCov2; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Uberlândia, Fundação de Apoio Universitário; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Rodrigo Borges Machado

Melhorias no preditor de proteínas virulentas de procariotos Medpipe (Mature Epitope Density - MED); 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

João Barbosa de Souza Neto

EasyQuizzer ? Software gerador de testes com permutações diferentes por aluno e distribuição equilibrada de alternativas; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Salomão Oliveira Alves

Incorporação do local subcelular de proteínas e propensão a vacinas no software Pannotator utilizando-se do software MEDpipe; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Arthur Rodrigues Cruz

EasyQuizzer ? Software gerador de testes com permutações diferentes por aluno e distribuição equilibrada de alternativas; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Jean Carlo Oliveira Santos

EasyQuizzer ? Software gerador de testes com permutações diferentes por aluno e distribuição equilibrada de alternativas; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Israel Cortes Rodrigues

Mapeamento de Interações Proteína-Proteína Comuns a Bactérias do Grupo CMNR e Análise de Interações de Subgrafos; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade Federal de Uberlândia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Gustavo Santos de Oliveira

Geração e análise de dados de Redes de Interação Proteína-Proteína utilizando um Banco de Dados Relacional; 2015; Orientação de outra natureza; (Biotecnologia) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Gustavo Augusto Ferreira

Modelagem e simulação de uma infecção causada por um helminto do gênero Strongyloides; 2015; Orientação de outra natureza; (Biotecnologia) - Universidade Federal de Uberlândia; Orientador: Anderson Rodrigues dos Santos;

Produções bibliográficas

  • DE AVILA, NATANAEL BORGES ; COSTA SANTOS, ANA CAROLINA ; CORREA, JOBERTH LEE ; BONETTI, ANA MARIA ; UEIRA-VIEIRA, CARLOS ; dos Santos, Anderson Rodrigues . In silico interactome analysis reveals distinct and complementary metabolic roles of bacteria in stingless bee larval food. COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL , v. 31, p. 377-388, 2026.

  • CORREA, JOBERTH LEE ; SANTOS, ANA CAROLINA COSTA ; CERQUEIRA, RAFAELA CAVALCANTE ; dos Santos, Anderson Rodrigues ; CASSEMIRO, NADLA SOARES ; CAROLLO, CARLOS ALEXANDRE ; RODRIGUES, TAMIRIS SABRINA ; BONETTI, ANA MARIA ; TEBALDI, NILVANIRA DONIZETE ; UEIRA-VIEIRA, CARLOS . In vitro effects of Bacillus velezensis strain Mandacaium against Xanthomonas citri pv. glycines: genomic and metabolomic insights. Scientific Reports , v. 1, p. 1-47, 2026.

  • NUNES MOREIRA COSTA, GUILHERME ; SANTOS, ANA CAROLINA COSTA ; DOS SANTOS PASCHOAL, TAMIRES ; GARCIA, ANNA PAULA MARTINS ; dos Santos, Anderson Rodrigues ; UEIRA-VIEIRA, CARLOS . Screening of Microorganisms Isolated from Stingless Bees' Larval Food in the Biocontrol of. Journal Of Nematology , v. 57, p. 1, 2025.

  • SILVA, SAMUEL DE SOUZA E ; DE AVILA, NATANAEL BORGES ; DA SILVA, ALISSON WILLIAM ; DA SILVA, LUCAS RAMOS FERNANDES ; PRADO, MATHEUS RIBEIRO ; BEPPLER, MURILO ALVES ; dos Santos, Anderson Rodrigues . Beyond Methane Oxidation: The Protein Landscape of -2a Reveals an Integrated System for Diazotrophy and Membrane Fortification. Environmental Microbiology Reports , v. 17, p. 1, 2025.

  • UEIRA'VIEIRA, CARLOS ; SANTOS, ANA CAROLINA COSTA ; ARAÚJO, THAYANE NOGUEIRA ; AUGUSTO, SOLANGE CRISTINA ; DE AVILA, NATANAEL BORGES ; BONETTI, ANA MARIA ; dos Santos, Anderson Rodrigues . A Deep Metagenomic Snapshot as a Proof-of-Concept for Resource Generation: Simultaneous Assembly of Host, Food, and Microbiome Genomes From Stingless Bee Larval Food. Ecology and Evolution , v. 15, p. 1, 2025.

  • SILVA, ALISSON ; MARQUEZ, CARLOS ; GODOY, IURY ; SILVA, LUCAS ; PRADO, MATHEUS ; BEPPLER, MURILO ; AVILA, NATANAEL ; TRAVENÇOLO, BRUNO ; Santos, Anderson R. . Improving protein interaction prediction in GenPPi: a novel interaction sampling approach preserving network topology. BMC BIOINFORMATICS , v. 26, p. 296, 2025.

  • OLIVEIRA, LUIZ ; LANES, GABRIEL ; Santos, Anderson . Enhancing omics analyses of bacterial protein secretion via non-classical pathways. NEURAL COMPUTING & APPLICATIONS , v. 1, p. 1, 2024.

  • SILVA, MATHEUS H. ; BATISTA, LETÍCIA L. ; MALTA, SERENA M. ; SANTOS, ANA C. C. ; MENDES-SILVA, ANA P. ; BONETTI, ANA M. ; UEIRA-VIEIRA, CARLOS ; dos Santos, Anderson R. . Unveiling the Brazilian kefir microbiome: discovery of a novel Lactobacillus kefiranofaciens (LkefirU) genome and in silico prospection of bioactive peptides with potential anti-Alzheimer properties. BMC GENOMICS , v. 25, p. 1, 2024.

  • GONÇALVES, RAFAEL ; Santos, Anderson . Pannotator integrated with Medpipe provides immunological and subcellular location features using a microservice. Biomedical Informatics , v. 1, p. 1, 2024.

  • TEBALDI, NILVANIRA DONIZETE ; MOTA, LARA CAROLINE BORGES MOREIRA ; CORRÊA, JOBERTH LEE ; SANTOS, ANA CAROLINA COSTA ; SANTOS, ANDERSON RODRIGUES DOS ; UEIRA-VIEIRA, CARLOS . First report of causing bacterial blight on Coffea arabica. PLANT DISEASE , v. 1, p. 1, 2024.

  • SANTOS, ANA CAROLINA COSTA ; BORGES, LUIZA DINIZ FERREIRA ; ROCHA, NINA DIAS COELHO ; DE CARVALHO AZEVEDO, VASCO ARISTON ; BONETTI, ANA MARIA ; dos Santos, Anderson Rodrigues ; DA ROCHA FERNANDES, GABRIEL ; DANTAS, RAQUEL CRISTINA CAVALCANTI ; UEIRA-VIEIRA, CARLOS . Bacteria, yeasts, and fungi associated with larval food of Brazilian native stingless bees. Scientific Reports , v. 13, p. 5147, 2023.

  • RODOVALHO, VINÍCIUS DE REZENDE ; DA LUZ, BRENDA SILVA ROSA ; NICOLAS, AURÉLIE ; Jardin, Julien ; BRIARD-BION, VALÉRIE ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; Santos, A.R. ; JAN, GWÉNAËL ; LOIR, YVES LE ; AZEVEDO, V. ; GUÉDON, ÉRIC . Different culture media and purification methods unveil the core proteome of -derived extracellular vesicles. microLife , v. 4, p. 1-15, 2023.

  • GOMES, MURILO MARQUES ARMELIN ; DOS ANJOS, WILLIAM FERREIRA ; JAISWAL, ARUN KUMAR ; Tiwari, Sandeep ; GHOSH, PREETAM ; Barh, Debmalya ; Azevedo, Vasco ; Santos, Anderson . Implementation of a Noise Filter for Grouping in Bibliographic Databases using Latent Semantic Indexing. International Journal of Bioinformatics and Intelligent Computing , v. 2, p. 1, 2023.

  • DE SOUSA OLIVEIRA, LUIZ GUSTAVO ; LANES, GABRIEL CHAGAS ; RODRIGUES DOS SANTOS, ANDERSON . Accelerating High-Performance Classification of Bacterial Proteins Secreted Via Non-Classical Pathways: No Needing for Deepness. Journal of Biotechnology and Biomedicine , v. 06, p. 514-523, 2023.

  • COSTA, ARTHUR ROBERTO ; CHIDEROLI, ROBERTA TORRES ; LANES, GABRIEL CHAGAS ; FERRARI, NATÁLIA AMOROSO ; CHICOSKI, LARISSA MELO ; BATISTA, CATIANE ESTEFANI ; PANDOLFI, VICTOR CÉSAR FREITAS ; WARE, CYNTHIA ; GRIFFIN, MATT J. ; Santos, Anderson Rodrigues ; CARVALHO AZEVEDO, VASCO ARISTON ; COSTA, MATEUS MATIUZZI ; PÁDUA PEREIRA, ULISSES . Multiplex PCR assay for correct identification of the fish pathogenic species of Edwardsiella genus reveals the presence of E. anguillarum in South America in strains previously characterized as E. tarda. JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY , v. 132, p. 4225-4235, 2022.

  • GONÇALVES DOS SANTOS, ROSELANE ; CASTILLO, RAQUEL HURTADO ; NERES RODRIGUES, DIEGO LUCAS ; LIMA, ALESSANDRA ; FERREIRA DOS ANJOS, WILLIAM ; RIFICI, CLAUDIA ; ATTILI, ANNA RITA ; Tiwari, Sandeep ; JAISWAL, ARUN KUMAR ; SPIER, SHARON J. ; MAZZULLO, GIUSEPPE ; MORAIS-RODRIGUES, FRANCIELLY ; PINTO GOMIDE, ANNE CYBELLE ; LIMA DE JESUS, LUÍS CLÁUDIO ; ABURJAILE, FLAVIA FIGUEIRA ; BRENIG, BERTRAM ; CUTERI, VINCENZO ; LUIZ DE PAULA CASTRO, THIAGO ; Seyffert, Núbia ; Santos, Anderson ; et.al . Comparative genomic analysis of the Dietzia genus: an insight into genomic diversity, and adaptation. RESEARCH IN MICROBIOLOGY , v. 174, p. 103998, 2022.

  • PEREIRA, GETULIO ; GHOSH, PREETAM ; Santos, Anderson . A Bridging Centrality Plugin for GEPHI and a Case Study for Mycobacterium Tuberculosis H37Rv. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics , v. 18, p. 2741-2746, 2021.

  • ANJOS, WILLIAM F. ; LANES, GABRIEL C. ; AZEVEDO, VASCO A. ; Santos, Anderson R. . GENPPI: standalone software for creating protein interaction networks from genomes. BMC BIOINFORMATICS , v. 22, p. 596, 2021.

  • Silva, Artur ; Ramos, Rommel ; CARNEIRO, ADRIANA ; ALMEIDA, SINTIA ; De Abreu, Vinicius ; Santos, Anderson ; Soares, Siomar ; Pinto, Anne ; GUIMARÃES, LUIS ; Barbosa, Eudes ; Schneider, Paula ; Miyoshi, Anderson . Next-Generation Sequencing and Assembly of Bacterial Genomes. In: Debmalya Barh , Vasudeo Zambare, Vasco Azevedo. (Org.). OMICS-Applications in Biomedical, Agricultural, and Environmental Sciences. 1ed.Boca Raton: CRC Press, 2013, v. 1, p. 367-383.

  • Carneiro, A. R. ; Ali, A. ; SANTOS, A. R. ; PINTO, A. C. ; Rocha, Aryanne A. M. C. ; BARBOSA, E. ; CERDEIRA, L. T. ; RAMOS, R. T. J. ; ALMEIDA, S. S. ; SOARES, S. C. ; ABREU, V. A. C. ; SCHNEIDER, M. P. ; SILVA, A. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Whole genome annotation: in silico analysis. In: Asst. Prof. Dr. Mahmood Akhavan Mahdavi. (Org.). Bioinformatics: Trends and Methodologies. : Intech, 2011, v. , p. 679-703.

  • AZEVEDO, V. ; SILVA, A. ; MIYOSHI, A. ; BOREM, A. ; ABREU, V. A. C. ; ALMEIDA, S. S. ; AMÁDIO, A ; BARBOSA, M S R ; Carneiro, A. R. ; CERDEIRA, L. T. ; D'AFONSECA, V. ; GUEDES, R. L. M. ; MELO, H. V. F. ; OLIVEIRA, R. S. ; ORTEGA, J. M. ; RAMOS, R. T. J. ; SANTOS, A. R. ; SCHNEIDER, M. P. . Anotação Funcional de Genomas Realizada Computacionalmente. In: Azevedo, V; Silva, A L C; Miyoshi, A; Schneider, M P; Borém, A. (Org.). Manual Prático ? Teórico: Sequenciamento, Montagem e Anotação de Genomas Bacterianos. Viçosa: Universidade Federal de, 2011, v. , p. 91-109.

  • SOARES, S. C. ; SILVA, A. ; RAMOS, R. T. J. ; CERDEIRA, L. T. ; Ali, A. ; SANTOS, A. R. ; PINTO, A. C. ; CASSIANO, A.A.M. ; FIGUEIRA, F. ; Carneiro, A. R. ; Guimarães, Luís Carlos ; BARBOSA, E. ; ALMEIDA, S. S. ; ABREU, V. A. C. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Plasticidade Genômica e Evolução Bacteriana. Informativo SBM, 26 CBM - Foz do Iguaçu, p. 8 - 31, 01 out. 2011.

  • RUIZ, J. ; Santos, A.R. ; PINTO, A. C. ; RESENDE, D. M. ; CERDEIRA, L. T. ; RAMOS, R. T. J. ; ORELLANA, S. C. ; ALMEIDA, S. S. ; SOARES, S. C. ; D'AFONSECA, V. ; AZEVEDO, V. ; SILVA, A. . Segunda Revolução Genômica: Utilização de Sequenciadores de Nova Geração. Informativo SBM, Informática, p. 15/11 - 18, 06 nov. 2009.

  • Santos, A.R. . A bridging centrality plugin for GEPHI and a case study for mycobacterium tuberculosis H37Rv. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • SANTOS, A. R. ; PEREIRA, V. B. ; BARBOSA, E. ; BAUMBACH, J. ; TURK, M. Z. ; SILVA, A. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Mature Epitope Density - A strategy for detecting exported prokariotic proteins related to antigenicity. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • SANTOS, A. R. ; BARBOSA, E. ; FIAUX, K. ; GOSH, P. ; CHAITANKAR, V. ; SILVA, A. ; Miyoshi, A. ; Barh, D. ; AZEVEDO, V. . PANNOTATOR: An automated tool for annotation of pan-genomes. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • SANTOS, A. R. ; Carneiro, A. R. ; GALA-GARCIA, A. ; PINTO, A. C. ; Barh, Debmalya ; BARBOSA, E. ; Dorella, F. A. ; AZEVEDO, V. . The Corynecabcterium pseudotuberculosis pan genomics reverse vaccinology. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • ABREU, V. A. C. ; SANTOS, A. R. ; ALMEIDA, S. S. ; FIGUEIRA, F. ; BARBOSA, E. ; FIAUX, K. ; SILVA, A. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . CpDB: A relational database schema and tools for bacterial genomes annotation and posgenome research. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • BARBOSA, E. ; SANTOS, A. R. ; Guimarães, Luís Carlos ; ABREU, V. A. C. ; PINTO, A. C. ; FIAUX, K. ; ALMEIDA, S. S. ; AZEVEDO, V. . PSEUDOGENE ANALYSIS IN FIVE STRAINS OF CORYNEBACTERIUM PSEUDOTUBERCULOSIS. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • Santos, A.R. . Bancos de dados relacionais para Montagem e Anotação de Genomas. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • SANTOS, A. R. ; SANTOS, M. A. ; MCCULLOCH, J. A. ; BAUMBACH, J. ; OLIVEIRA, G. C. ; SILVA, A. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . A singular value decomposition approach for improved taxonomy classification of biological sequences. 2010. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • ALMEIDA, S. S. ; Seyffert, Núbia ; PRUDÊNCIO, C.R. ; SANTOS, F.A.A. ; SOARES, S. C. ; D'AFONSECA, V. ; PINTO, A. C. ; SANTOS, A. R. ; CASSIANO, A.A.M. ; FARIA, C.L. ; MIYOSHI, A. ; MOORE, R. ; GOULART, L.R. ; AZEVEDO, V. . Identificação de desordem proteica em proteoma de Corynebacterium Pseudotuberculosis usando dados de Phage Display. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • PINTO, A. C. ; SANTOS, A. R. ; ALMEIDA, S. S. ; SOARES, S. C. ; FARIA, C.J. ; MAGALHÃES, A. ; RUIZ, J. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Estudo da arquitetura genômica de duas linhagens do patogêno Corynebacterium Pseudotuberculosis e seu estilo de vida. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • SOARES, S. C. ; ABREU, V. A. C. ; MCCULLOCH, J. A. ; D'AFONSECA, V. ; RAMOS, R. T. J. ; Ali, A. ; SANTOS, A. R. ; PINTO, A. C. ; ALMEIDA, S. S. ; SILVA, A. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . PIPS: pathogenicity island prediction software. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • Santos, A.R. ; SANTOS, M. A. ; RUIZ, J. ; MCCULLOCH, J. A. ; OLIVEIRA, G. C. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Uma abordagem para produzir matrizes de distâncias por meio da decomposição de valores singulares. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Santos, A.R. ; SANTOS, M. A. ; AZEVEDO, V. ; OLIVEIRA, G. C. . Predição de epitopos lineares por meio da álgebra linear. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • COSTA, P. ; ALMEIDA, A. ; DANTAS, N. ; LIMA, L. ; COSTA, E. ; SANTOS, A. R. ; FERNANDES, G. ; BASILE, A. ; SANTOS, M. ; SILVA, M. . Cancer Specific Imaging. Nevada: CSREA Press, 2018 (Expanded abstract).

Outras produções

Santos, A.R. ; ANJOS, W. F. ; LANES, G. C. ; AZEVEDO, V. A. . GENPPI: standalone software for the creation of protein interaction networks from genomes. 2020.

SANTOS, A. R. ; PEREIRA, G. M. . Bridging Centrality Plugin for GEPHI. 2018.

SANTOS, A. R. . CpDB: Relational database schema and tools for bacterial genome annotation. (sourceforge.net/projects/cpdb/). 2012.

dos Santos, A.R. . Revisão de artigo para o periódico Evidence-based Complementary and Alternative Medicine (ISSN 1741-4288) - 1 Revisão. 2020.

SANTOS, A. R. . Revisão de Projetos de Iniciação Científica Voluntária (PIVIC) para a Faculdade de Computação da UFU - 22 Revisões. 2019.

SANTOS, A. R. . Comp2Bio - Computer Science for Biology. 2020; Tema: Modelos de aprendizado de máquina e software para geração e análise de redes de interação entre proteínas. (Site).

Santos, A.R. . Seleção e Modelagem Estrutural de Alvos Vacinais. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SANTOS, A. R. . CpDB: Relational database schema and tools for bacterial genome annotation. (sourceforge.net/projects/cpdb/). 2012. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Cursodegraduação).

SANTOS, A. R. ; AZEVEDO, V. . Tópicos Especiais em Genética e Evolução II (Anotação de genomas) - BIG 847. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SANTOS, A. R. ; AZEVEDO, V. . Estrutura e Função do Genoma - BIG 866. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Santos, A.R. . Workshop Montagem e Anotação de Genomas (Anotação automática de Genomas). 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

RUIZ, J. ; Santos, A.R. ; PINTO, A. C. ; RESENDE, D. M. ; ALMEIDA, S. S. ; SOARES, S. C. ; D'AFONSECA, V. . Montagem e Anotação de Genoma. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SCHNEIDER, M. P. ; AZEVEDO, V. ; RUIZ, J. ; RESENDE, D. M. ; RAMOS, R. T. J. ; WANDERSON, S. M. ; Santos, A.R. ; PINTO, A. C. ; ORELLANA, S. C. ; OLIVEIRA, L. M. ; D'AFONSECA, V. ; CERDEIRA, L. T. ; ALMEIDA, S. S. . Bioinformática Next-Gen: Montagem e Anotação de Genomas Bacterianos Completos. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Santos, A.R. . Programação usando a biblioteca gráfica Directx 9.0 via a linguagem C++. 2007. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Curso de graduação).

Santos, A.R. . Usabilidade. 2007. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Curso de graduação).

Projetos de pesquisa

  • 2025 - Atual

    GenPPi: Análise Comparativa de Interações Proteína-Proteína via Aprendizado de Máquina em Quatro Cepas de Kosakonia cowanii Isoladas no Triângulo Mineiro, Descrição: Este projeto de 12 meses investiga as redes de interações proteína-proteína (PPIs) em quatro cepas deKosakonia cowanii (UFU H1: CP160410, UFU D1: CP162577, UFU G119: CP160412, UFU I87:CP162576), isoladas de cafeeiros no Triângulo Mineiro e com genomas depositados pelo proponente.Estas bactérias exibem dualidade funcional: potencial como Promotoras de Crescimento Vegetal (PGPB)e, pioneiramente (Pereira et al., 2024, Plant Disease), capacidade de causar queima foliar em café. Acompreensão molecular destes fenótipos é limitada pela ausência de dados experimentais de PPIs. Parasuprir esta lacuna, utilizaremos abordagem computacional avançada com foco na formação de dois bol-sistas IC. Empregaremos a ferramenta GenPPi e Aprendizado de Máquina (ML) para gerar um modelopreditivo de PPIs específico para Kosakonia. A performance será avaliada comparativamente ao modelogenérico do GenPPi. Os bolsistas Davi Mota Campos e Gustavo Henrique Leal da Fonseca serão trei-nados na metodologia. O modelo validado será aplicado para predizer as redes das quatro cepas. Davianalisará as redes das cepas UFU H1 (CP160410) e UFU D1 (CP162577), enquanto Gustavo analisará asredes das cepas UFU G119 (CP160412) e UFU I87 (CP162576). Ambos integrarão dados topológicos(Gephi, R) com anotações funcionais/patogênicas (PANNOTATOR/Medpipe). O objetivo é compararas redes e identificar proteínas/módulos chave relacionados aos mecanismos de PGPB/patogenicidade.Espera-se gerar conhecimento inédito, capacitar dois alunos em bioinformática/ML, e produzir dadospara futuras publicações.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Anderson Rodrigues dos Santos - Coordenador / Ana Carolina Costa Santos - Integrante / Carlos Ueira-Vieira - Integrante / NILVANIRA DONIZETE TEBALDI - Integrante.

  • 2024 - 2025

    Capacitando profissionais de saúde e educadores no diagnóstico de doenças raras e na interpretação genómica por meio da bioinformática., Descrição: O projeto de pesquisa tem como objetivo conscientizar e disseminar informações sobre doenças genéticas raras, com foco especial na Atrofia Muscular Espinhal (SMA). A metodologia de pesquisa abrange várias etapas, como sequenciamento do exoma completo e do genoma completo para identificação de variações genéticas, teste genético para análise de mutações no DNA, avaliação clínica detalhada, testes de triagem como o teste do pezinho, estudos de imagem por ressonância magnética e tomografias, e testes laboratoriais como exames de sangue e biópsias.A bioinformática desempenha um papel fundamental em todas as fases do processo de pesquisa. Especificamente, as ferramentas BWA e GATK são utilizadas para análise e processamento dos dados laboratoriais e genéticos gerados. O BWA é empregado para mapear sequências de DNA em um genoma de referência, enquanto o GATK é utilizado para identificar variantes genéticas. A integração de ferramentas de informática (como sites para armazenar metadados) e técnicas de bioinformática, incluindo o AlphaFold e o GROMACS, fortalece a pesquisa e contribui para um diagnóstico mais preciso e terapias mais direcionadas para os pacientes afetados por doenças genéticas raras.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Anderson Rodrigues dos Santos - Coordenador / Ana Carolina Costa Santos - Integrante / Carlos Ueira-Vieira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

  • 2023 - 2024

    Estudo da oxidação anaeróbica de metano via relação sinérgica entre organismos archaea e bactéria utilizando algoritmos de anotação de genomas, construção e análise de rede de interação proteica e análise de dados via bancos de dados relacionais, Descrição: As imensas quantidades de metano e dióxido de carbono congeladas que existem no leito dos oceanos representam uma ameaça, se liberadas para a atmosfera, devido ao aquecimento global. Este projeto aborda a oxidação anaeróbica do metano. O metano é um gás de efeito estufa mais potente que o dióxido de carbono. A relação simbiótica entre bactérias redutoras de sulfeto e archaea metano-tróficas anaeróbicas conseguem inativar o metano por meio da oxidação anaeróbica do metano (AOM).Este projeto inicia-se com uma revisão literária sobre a AOM para identificar os principais organismos envolvidos e como estes se relacionam do ponto de vista bioquímico. Vamos mapear as proteínas citadas nestes processos e realizar uma extensa anotação automática dos genomas das espécies envolvidas utilizando um software (PANNOTATOR) desenvolvido pelo coordenador deste projeto. O nosso foco será identificar proteínas para as quais não há relatos na literatura sobre suas participações em processos bioquímicos conhecidos, mas que podem desempenhar um papel relevante no sucesso da AOM. O coordenador deste projeto também desenvolveu o software (GENPPI) que será utilizado para construção ab initio de redes de interação proteica entre todos os genomas conhecidos tanto do gênero de archaeas quanto do gênero de bactérias envolvidas. Também utilizando software desenvolvido pelo coordenador do projeto, os grafos gerados pelo GENPPI serão analisados na tentativa de identificar prováveis proteínas chave envolvidas na AOM, mas não descritas nos processos bioquímicos conhecidos (Bridging Centrality plugin for GEPHI). Os resultados obtidos serão armazenados em um esquema de banco de dados relacionais implementado via o SGBD PostgreSQL para cruzamento de dados e geração de relatórios em linguagem SQL.Assim, esperamos contribuir para o conhecimento sobre a oxidação anaeróbica do metano, identificando potenciais proteínas envolvidas nesse processo e ampliando a compreensão dos mecanismos subjacentes à AOM, contribuindo para melhor entendimento do efeito estufa do planeta.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Anderson Rodrigues dos Santos - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Bolsa / Universidade Federal de Uberlândia - Bolsa., Número de produções C, T & A: 6

  • 2020 - 2023

    Sistema de triagem remota baseada em inteligência artificial para enfrentamento da COVID-19 e condições de saúde correlatas., Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Vasco Ariston de Carvalho Azevedo em 29/10/2020., Descrição: Desenvolver aplicativo de teletriagem em dispositivo móvel, com análise de dados sintomáticos por inteligência artificial, em projeto piloto no Hospital Eduardo de Menezes - BH para auxiliar no diagnóstico diferencial de COVID-19 e condições correlatas, como SARS, doença febril aguda e pneumonia.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anderson Rodrigues dos Santos - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Coordenador.

  • 2020 - 2023

    Diagnóstico dos Sars-Cov-2 por meio de Inteligência Artificial, Projeto certificado pela empresa ImunoScan Engenharia Molecular em 30/10/2020., Descrição: Amostras de saliva são 'digitalizadas' via o aparelho FTIR gerando um espectro de 1798 intensidades de sinais que são utilizadas para treinar algoritmos de Inteligência Artificial no diagnóstico da COVID.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anderson Rodrigues dos Santos - Integrante / GOULART, LUIZ RICARDO - Coordenador / THULIO MARQUEZ CUNHA - Integrante / MARIO MACHADO MARTINS - Integrante / ROBINSON SABINO SILVA - Integrante., Número de produções C, T & A: 2

  • 2020 - 2023

    Diagnóstico de doença renal crônica via inteligência artificial alimentadas por descritores metabólicos, Descrição: A doença renal crônica (DRC) é um problema global de saúde pública. A ausência de marcadores confiáveis, precisos, de baixo custo e de fácil utilização para o diagnóstico precoce e monitoramento da DRC contribui para que os pacientes cheguem tardiamente ao tratamento, gerando perda da qualidade de vida e aumento do custo aos serviços de saúde. Neste sentido, as estratégias ômicas são fundamentais para identificar novos biomarcadores da doença que permitam diagnosticar precocemente, monitorar a progressão e, eventualmente, melhorar a resposta terapêutica. Sendo assim, o objetivo do projeto é desenvolver, por meio de tecnologias ômicas e inteligência artificial, plataformas para aprimoramento do diagnóstico precoce e monitoramento da DRC. O estudo será realizado com indivíduos saudáveis (sem DRC) e doentes renais crônicos, classificados nos diferentes estágios da doença. Os indivíduos saudáveis (sem DRC) e doentes renais crônicos sem diálise serão selecionados no Centro de Saúde Escola Jaraguá e Ambulatórios da Universidade Federal de Uberlândia (UFU). Os pacientes em diálise serão selecionados no Setor de Hemodiálise do Hospital de Clínicas da UFU. Para as análises de metabolômica, proteômica e lipidômica serão coletados sangue, urina e saliva de 40 pacientes em cada estágio da DRC e 40 pacientes saudáveis, totalizando 280 indivíduos avaliados. As análises propostas serão realizadas no Laboratório de Nanobiotecnologia da UFU, por meio da espectrometria de massa. Espera-se desenvolver uma plataforma para diagnóstico e monitoramento da DRC, que seja rápida, acessível, precisa e que englobe múltiplos biomarcadores para uma ampla abordagem da DRC e suas comorbidades. Esta plataforma poderá aprimorar o diagnóstico precoce da DRC, bem como avaliar a progressão da doença e auxiliar na melhoria da resposta terapêutica. Além disso, buscaremos entender o efeito de características individuais (sociodemográficas, clínicas, antropométricas e nutricionais) no perfil metabólico.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Anderson Rodrigues dos Santos - Integrante / LUCIANA SARAIVA DA SILVA - Integrante / LUIZ RICARDO GOULART - Coordenador / GABRIEL CHAGAS LANES - Integrante.

  • 2013 - 2018

    Desenvolvimento de algoritmos e técnicas em Bioinformática para estudo de genomas de patógenos humanos procariotos, Descrição: Desenvolvimento de plugin para cálculo de medidas de centralidades em grafos de interação entre proteínas, desenvolvimento de software para gerar grafos de interações entre proteínas de uma mesma espécie, comandos linux para tratar sequências de proteínas de DNA, Esquemas Relacionais de bancos de dados para armazenar e pesquisar genomas de procariotos. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Anderson Rodrigues dos Santos - Coordenador., Número de produções C, T & A: 7

Prêmios

2013

Aprovado em Concurso Publico para Professor Adjunto das Ciências da Computação, Universidade Federal de Uberlândia - UFU.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Universidade Federal de Uberlândia, Centro de Ciências Exatas e Tecnologia, Faculdade de Ciências da Computação. , Av. João Naves de Ávila, 2.121, Bloco 1B - Sala 1B148, Santa Mônica, 38400902 - Uberlândia, MG - Brasil, Telefone: (34) 32394573

Experiência profissional

2013 - Atual

Universidade Federal de Uberlândia

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: PROFESSOR ADJUNTO, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 03/2015 - 07/2015

    Ensino, Ciência da Computação, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Inteligência Artificial

2007 - 2007

Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, PUC Minas

Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor temporário, Carga horária: 6

2000 - 2000

Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, PUC Minas

Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor temporário, Carga horária: 16

Atividades

  • 08/2007 - 12/2007

    Ensino, Ciência da Informação, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, 17091 ? INTERFACE HOMEM-MÁQUINA

  • 08/2007 - 12/2007

    Ensino, Jogos Digitais, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, 20637 - PROGRAMAÇÃO COM BIBLIOTECA GRÁFICA II (DirectX 9 e MS Visual Studio C++)

  • 02/2000 - 11/2000

    Ensino, Engenharia Elétrica, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Algoritmos e programação em linguagem C

  • 02/2000 - 02/2000

    Ensino, Ciências Contábeis, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Sistemas Gerenciadores de Bancos de Dados, Linguagem SQL e Recursos avançados de planilhas eletrônicas

1995 - 2000

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas, Carga horária: 40

Atividades

  • 08/1995 - 05/2000

    Serviços técnicos especializados , Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação.Serviço realizado, Desenvolvedor de Software.

2000 - 2007

Oi/TELEMAR NORTE LESTE SA

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: ANALISTA DE SISTEMAS, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Gerente de projetos

2000 - 2000

Faculdade de Informática do Oeste de Minas Gerais

Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor temporário, Carga horária: 16

Atividades

  • 02/2000 - 06/2000

    Ensino, Informática, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Programação em lógica com Prolog

2000 - 2000

Faculdade Metropolitana de Belo Horizonte

Vínculo: Professor convidado, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 16

Outras informações:
Defesa de disciplina para a faculdade obter a licença de funcionamento frente ao MEC.