Ricardo Diogo Righetto
Especializado em processamento de imagens e análise de dados de diferentes técnicas de microscopia eletrônica de varredura e de transmissão. Atualmente é pesquisador de pós-doutorado no Biozentrum da Universidade de Basel, onde atua no desenvolvimento de métodos computacionais para processamento de dados de crio-microscopia eletrônica (cryo-EM) orientadas à biologia estrutural.
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Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Structural Biology
2015 - 2019
Biozentrum der Universität Basel
Título: Single Particle 2D Electron Crystallography for Membrane Protein Structure Determination
Orientador: Henning Stahlberg
Bolsista do(a): Fellowships for Excellence International PhD Program, FFE, Suiça.
Mestrado em Engenharia Elétrica
2012 - 2014
Universidade Estadual de Campinas
Título: Classificação de Diversidade Estrutural em Dados de Crio-ME através de Comitês de Agrupadores,Ano de Obtenção: 2014
Fernando José Von Zuben.Coorientador: Rodrigo Villares Portugal. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Graduação em Engenharia Elétrica
2006 - 2011
Universidade Estadual de Campinas
Título: Desenvolvimento de ferramentas para o mapeamento bidimensional de deformação a partir da análise de imagens
Orientador: Antonio J. Ramirez
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Pós-doutorado
2019
Pós-Doutorado. , Biozentrum der Universität Basel, BZ, Suiça. , Bolsista do(a): Swiss National Science Foundation, SNF, Suiça.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Alemão
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Processamento Gráfico (Graphics).
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas/Especialidade: Proteínas.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Estatística/Especialidade: Análise de Dados.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Áreas Clássicas de Fenomenologia e suas Aplicações/Especialidade: Ótica.
Participação em eventos
EMBO practical course on image processing for cryo-EM.Classification of Structural Diversity on Cryo-EM Datasets by Cluster Ensembles. 2013. (Oficina).
5th Brazil School for Single-Particle Cryo-EM.Validation of EM Image Clustering. 2012. (Oficina).
III Curso de Bioinformática: Algoritmos e técnicas computacionais para montagem e análise de genomas - LGE/IB-Unicamp. 2011. (Outra).
Curso Básico de Capacitação em Propriedade Intelectual, INPI/Inova Unicamp. 2007. (Outra).
Produções bibliográficas
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2019 Righetto, Ricardo D. ; BIYANI, NIKHIL ; KOWAL, JULIA ; CHAMI, MOHAMED ; STAHLBERG, HENNING . Retrieving high-resolution information from disordered 2D crystals by single-particle cryo-EM. Nature Communications , v. 10, p. 1722, 2019.
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2019 SCHMIDLI, CLAUDIO ; ALBIEZ, STEFAN ; RIMA, LUCA ; RIGHETTO, RICARDO ; MOHAMMED, INAYATULLA ; OLIVA, PAOLO ; KOVACIK, LUBOMIR ; STAHLBERG, HENNING ; BRAUN, THOMAS . Microfluidic protein isolation and sample preparation for high-resolution cryo-EM. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA (ONLINE) , v. 116, p. 15007-15012, 2019.
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2018 BIYANI, NIKHIL ; SCHERER, SEBASTIAN ; Righetto, Ricardo D. ; KOWAL, JULIA ; CHAMI, MOHAMED ; STAHLBERG, HENNING . Image processing techniques for high-resolution structure determination from badly ordered 2D crystals. JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY , v. 203, p. 120-134, 2018.
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2018 MCLEOD, ROBERT A. ; DIOGO RIGHETTO, RICARDO ; STEWART, ANDY ; STAHLBERG, HENNING . MRCZ - A file format for cryo-TEM data with fast compression. JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY , v. 201, p. 252-257, 2018.
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2017 BIYANI, NIKHIL ; Righetto, Ricardo D. ; MCLEOD, ROBERT ; CAUJOLLE-BERT, DANIEL ; CASTANO-DIEZ, DANIEL ; GOLDIE, KENNETH N. ; STAHLBERG, HENNING . Focus: The interface between data collection and data processing in cryo-EM. JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY , v. 198, p. 124-133, 2017.
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2017 PASCOAL, CAMILA CRISTINA ; ISLAM, ZEYAUL ; ADAMOSKI, DOUGLAS ; FERREIRA, IGOR MONTEZE ; RIGHETTO, RICARDO DIOGO ; BETTINI, JEFFERSON ; PORTUGAL, RODRIGO VILLARES ; YUE, WYATT W. ; GONZALEZ, ANA ; DIAS, SANDRA MARTHA GOMES ; AMBROSIO, ANDRE LUIS BERTELI . The origin and evolution of human glutaminases and their atypical C-terminal ankyrin repeats. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY , v. 292, p. jbc.M117.787291, 2017.
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2014 TORRES, E.A. ; MONTORO, F. ; RIGHETTO, R.D. ; RAMIREZ, A.J. . Development of high-temperature strain instrumentation for in situ SEM evaluation of ductility dip cracking. JOURNAL OF MICROSCOPY , v. n/a, p. n/a-n/a, 2014.
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2013 STROPPA, DANIEL G ; RIGHETTO, RICARDO D ; MONTORO, LUCIANO A ; HOUBEN, LOTHAR ; BARTHEL, JURI ; CORDEIRO, MARCO AL ; LEITE, EDSON R ; WENG, WEIHAO ; KIELY, CHRISTOPHER J ; RAMIREZ, ANTONIO J . Assessment of a nanocrystal 3-D morphology by the analysis of single HAADF-HRSTEM images. Nanoscale Research Letters , v. 8, p. 475, 2013.
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2011 RIGHETTO, R. D. ; STROPPA, D. G. ; MONTORO, L. A. ; RAMIREZ, A. J. . MEGACELL: A nanocrystal model construction software for HRTEM multislice simulation. ULTRAMICROSCOPY , v. 111, p. 1077-1082, 2011.
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RIGHETTO, R. D. ; PORTUGAL, R. V. ; ZUBEN, F. J. V. . Classificação de Diversidade Estrutural em Dados de Microscopia Eletrônica de Transmissão através de Comitês de Máquinas. In: VI Encontro de Alunos e Docentes do DCA, 2013, Campinas. Anais do VI Encontro de Alunos e Docentes do DCA, 2013.
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RIGHETTO, R. D. ; ZUBEN, F. J. V. ; PORTUGAL, R. V. . Validation of Structural Diversity on Cryo-Electron Microscopy Datasets by Clustering Algorithms. In: 43a. Reunião Anual da SBBq, 2014, Foz do Iguaçu. 43a. Reunião Anual da SBBq, 2014.
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BELATINI JR., L. R. ; RIGHETTO, R. D. ; MONTEIRO, M. F. G. ; SILVA, C. A. ; ZUBEN, F. J. V. ; VAN HEEL, M. ; PORTUGAL, R. V. . A hyperspace viewer: visualization and classification of large image datasets. In: Gordon Research Conference on Three-Dimensional Electron Microscopy (3DEM), 2013, New London. Gordon Research Conference on Three-Dimensional Electron Microscopy (3DEM), 2013.
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STROPPA, D. G. ; RIGHETTO, R. D. ; MONTORO, L. A. ; LEITE, E. R. ; RAMIREZ, A. J. . Reconstruction of Nanocrystals 3D Morphology by HAADF-HRSTEM. In: X Encontro da SBPMat, 2011, Gramado. X Encontro da SBPMat, 2011.
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RAMIREZ, A. J. ; STROPPA, D. G. ; MONTORO, L. A. ; ISAAC, A. C. ; RIGHETTO, R. D. ; LEITE, E. R. . Non-conventional electron tomography of nanostructures. In: X Encontro da SBPMat, 2011, Gramado. X Encontro da SBPMat, 2011.
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RIGHETTO, R. D. ; TORRES, E. A. ; RAMIREZ, A. J. . An integrated image processing tool for strain mapping of thermomechanical SEM in situ experimentation. In: 22a. Reunião Anual de Usuários do LNLS, 2011, Campinas. 22a. Reunião Anual de Usuários do LNLS, 2011.
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RIGHETTO, R. D. ; CALSAVARA, P. G. R. ; TORRES, E. A. ; RAMIREZ, A. J. . Integrated image processing techniques applied to strain mapping at in situ SEM experiments. In: 21st. International Congress on X-Ray Optics and Microanalysis, 2011, Campinas. 21st. International Congress on X-Ray Optics and Microanalysis, 2011.
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RIGHETTO, R. D. ; CALSAVARA, P. G. R. ; TORRES, E. A. ; RAMIREZ, A. J. . Strain mapping of engineering materials at in situ SEM experiments by an integrated image processing tool. In: X Encontro da SBPMat, 2011, Gramado. X Encontro da SBPMat, 2011.
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STROPPA, D. G. ; MONTORO, L. A. ; RIGHETTO, R. D. ; RAMIREZ, A. J. . MEGACELL:A nanocrystal models construction software for HRTEM multislice simulation. In: 17th International Microscopy Congress, 2010, Rio de Janeiro. Proceedings of the 17th International Microscopy Congress, 2010.
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RIGHETTO, R. D. ; TORRES, E. A. ; RAMIREZ, A. J. . Strain Mapping for in-situ SEM Experimentation. In: 17th International Microscopy Congress, 2010, Rio de Janeiro. Proceedings of the 17th International Microscopy Congress, 2010.
Outras produções
STROPPA, D. G. ; RIGHETTO, R. D. ; MONTORO, L. A. ; RAMIREZ, A. J. . MEGACELL. 2011.
Histórico profissional
Endereço profissional
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Universität Basel, Biozentrum. , Mattenstrasse 26, ., 4058 - Basel, - Suiça, Telefone: (41) 613873232
Experiência profissional
2012 - 2012
Center for Machine Perception, CTU PragueVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário
Outras informações:
Worked on unsupervised learning methods for estimation of image parameters from noisy datasets. Supervisor: Dr. Boris Flach
2011 - 2011
Laboratório Nacional de NanotecnologiaVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 30
Outras informações:
Estágio na área de processamento de imagens de microscopia eletrônica de varredura (SEM) e microscopia eletrônica de transmissão (TEM).
2011 - 2011
Universidade Estadual de CampinasVínculo: Bolsista PAD, Enquadramento Funcional: Auxiliar Didático, Carga horária: 8
Outras informações:
Auxiliar didático da disciplina EA722 - Laboratório de Princípios de Controle e Servomecanismo.
2011 - 2011
Universidade Estadual de CampinasVínculo: Bolsista PAD, Enquadramento Funcional: Auxiliar Didático, Carga horária: 8
Outras informações:
Auxiliar didático da disciplina EA619 - Laboratório de Análise Linear.
2007 - 2009
Universidade Estadual de CampinasVínculo: Bolsista FUNCAMP, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 40
Outras informações:
Analista de suporte de informática na Agência de Inovação INOVA Unicamp.
2009 - 2010
Laboratório Nacional de Luz SíncrotronVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 12
Outras informações:
Iniciação científica na área de processamento digital de imagens de microscopia eletrônica de varredura (SEM).
2005 - 2006
Motorola Industrial Ltda.Vínculo: Estagiário Técnico, Enquadramento Funcional: Estagiário Técnico, Carga horária: 30
Outras informações:
Estagiário de nível técnico da Engenharia de Testes na fábrica de telefones celulares de Jaguariúna-SP.
2005 - 2005
Colégio Técnico de CampinasVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 15
Outras informações:
Monitor do curso técnico de Eletroeletrônica.
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