Roberto Hirata Junior

Roberto Hirata Jr. (1964 - ) is married to Nina S. Tomita Hirata and they have two sons and one daughter. His education was entirely in public schools. He holds a degree in Physics (IF-USP) and a degree in Mathematics (IME-USP). During his undergrad's studies, he has participated of three scientific trainings: Diferential Topology (one year, under Prof. Dr. Paulo F. Leite), Computational Mathematics (one year, under Prof. Dr. Ciro Patarra) and Computing Day (two years, under Prof. Dr. Valdemar W. Setzer). Besides helping to shape the Computing Day, he has lead the software team to produce all the software for the activity, and is the coauthor of two publications related to the activity. He got a MSc degree in Computer Science (1997) under Prof. Dr. Junior Barrera for his work on morphological segmentation and fast algorithms for basic morphological operators. During his master's, he has participated in three Journal papers and some conference papers, participated in the Olivetti's project to build a hand written signature identifier and in the MMorph project, a software for Mathematical Morphology for Khoros and MATLAB. He has got a PhD degree in Computer Science (2001) also under Dr. Barrera for his work on Aperture operators, a theme that has generated several other international works. As part of his PhD's training, he has worked under Prof. Dr. Edward Russel Dougherty in the Texas A&M University during one year and 4 months. His last works during the PhD were related to bioinformatics. He has build a software to automatic segment microarray images and also a software to analyse microarray data; both works resulted in papers in Journals. After his PhD, he has been hired as a researcher and professor for the SENAC College of Computer Science and Technology where he co-lead the Computer Vision group (2 PhDs, 2 MSc and 3 MSc candidates). This group had a strong link to industry and gave consulting and short courses to partners as EMBRAER. His research is focused in Computer Vision and Machine Learning. Besides his collaboration with Dr. Barrera's group, he is also worked in collaboration with Prof. Dr. Eduardo Jordao Neves in a group called Mathematical Analysis of Interacting Gene Expression Systems (MAIGES). This group cooperated mainly wiith Dr. Luis Fernando Lima Reis and their work had been cover of two editions of one of the most prestigious journal in Cancer research, besides several other journal and conference papers. His teaching experience started in 1986 for the Computing Day, he has teached for SENAC College of Computer Science and Technology and currentely is an associate professor for IME-USP.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Ciências da Computação

1997 - 2001

Universidade de São Paulo
Título: Projeto de Operadores Morfológicos para Imagens e Sinais - Abordagem de reticulados finitos discretos
Orientador: Junior Barrera
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Morfologia Matemática; Projeto Automático de Operadores; Aprendizado PAC; Reticulados finitos; Reticulados discretos; Processamento de Imagens. Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia / Especialidade: Processamento de Sinais Biológicos. Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software).

Mestrado em Ciências da Computação

1993 - 1997

Universidade de São Paulo
Título: Segmentação de Imagens por Morfologia Matemática,Ano de Obtenção: 1997
Orientador: Junior Barrera
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Processamento de Imagens; Morfologia Matemática; Segmentação de Imagens; Algoritmos eficientes; Paradigma de segmentação morfológica.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Processamento Gráfico (Graphics). Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Engenharia de Software. Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software); Educação Superior; Qualidade e Produtividade.

Graduação em Bacharelado Em Física

1985 - 1990

Universidade de São Paulo

Graduação em Licenciatura Em Matemática

1983 - 1990

Universidade de São Paulo

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Pós-doutorado

2013

Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: Análise de dados e imagens: da análise exploratória ao modelo de reticulados, Ano de obtenção: 2013., Palavras-chave: Classificadores; Image Processing; Mathematical Morphology; Mineração de dados; Reticulados finitos., Grande área: Ciências Exatas e da Terra

2001 - 2003

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Alemão

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

Japonês

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Processamento Gráfico (Graphics).

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Quantitativa.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Software Básico.

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Organização de eventos

BARRERA, J. ; BANON, G. J. F. ; BRAGA NETO, U. ; HIRATA JR., R. . Simpósio Internacional de Morfologia Matemática. 2007. (Congresso).

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Participação em eventos

Jornadas Argentinas de Informática. Gene Expression Data Analysis. 2010. (Congresso).

Jornadas Argentinas de Informática. Machine Learning Applied to Gene Expression Data. 2010. (Congresso).

26o Colóquio Brasileiro de Matemática. Projeto de operadores de imagens: novos avanços usando multirresolução e combinação de classificadores. 2007. (Congresso).

Regulamentacao das Profissoes em Tecnologias da Informacao.Regulamentacao das Profissoes em Tecnologias da Informacao. 2005. (Seminário).

6th International Meeting of the Microarray Gene Expression Data Society. Remarks on analysis of gene expression robustness. 2003. (Congresso).

6th International Meeting of the Microarray Gene Expression Data Society. Molecular classifiers based on gene cliques. 2003. (Congresso).

A Biotecnologia e o Futuro da Agricultura.A Biotecnologia e o Futuro da Agricultura. 2003. (Seminário).

I Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease. 2002. (Simpósio).

New leads in experimental and clinical gene targeting in cancer. 2002. (Simpósio).

Technoimage 2002. Análise de dados e imagens de microarray. 2002. (Congresso).

VIth Brazilian School of Probability.Microarray Image Analysis. 2002. (Simpósio).

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Participação em bancas

Aluno: Josivan Pereira da Silva

KURASHIMA, C. S.; FERREIRA, F. T.;Hirata Jr., Roberto. Reconstrução Facial Tridimensional com Malha Poligonal em Teleconferências com Ponto de Vista Livre. 2016. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Luís Roberto Pereira de Paula

Marco Antônio Gutierrez; Marcel Parolin Jackowski;Hirata Jr., Roberto. Segmentação de Imagens SPECT/Gated-SPECT do miocárdio e geração de um mapa polar. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Rodrigo Bernardo Pimentel

Hirata Jr., RobertoCarlos S. SantosGoldman, Alfredo. Localização em dispositivos móveis utilizando sinais de redes Wi-Fi. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Thiago Meireles Paixão

Hirata Jr., Roberto; Morimoto, Carlos H.; João Eduardo Kogler Jr.. Rastreamento de objetos utilizando reconhecimento estrutural de padrões. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Rodrigo Assirati Dias

Hirata Jr., RobertoGoldman, Alfredo; Bruno Richard Shultze. Um middleware para processamento bioestatístico em grades computacionais. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Lucas Padovani Trias

Romero Tori; Regina Melo Silveira;Hirata Jr., Roberto. Janela 3D: uma ferramenta de tele-comunicação visual sensível ao ponto de vista do usuário. 2009. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Grace Anne Pontes Borges

FERREIRA, J. E.; Jorge Rady de Almeida Jr.;Hirata Jr., Roberto. Fluxo de dados em redes de Petri coloridas e em grafos orientados a atores. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: David da Silva Pires

Hirata Jr., Roberto; VELH, L. C. P. R.;CESAR JUNIOR, R. M.. Rastreamento de componentes conexas em vídeo 3D para obtenção de estruturas tridimensionais. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Arnaldo Câmara Lara

CESAR JUNIOR, R. M.Hirata Jr., RobertoLOTUFO, R. A.. Segmentação de Movimento Usando Morfologia Matemática. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Regis de Abreu Barbosa

Morimoto, Carlos H.;HIRATA JR., R.; Traina, Agma J. M.. Detecção e rastreamento de faces e características faciais com aplicação em indexação de vídeo e estimação da orientação de faces. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jesús Pascual Mena Chalco

CESAR JUNIOR, R. M.HIRATA JR., R.; CARRER, H.. Identificação de Regiões Codificantes de Proteina através da Transformada Modificada de Morlet. 2005. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

Aluno: Marcio Calixto Cabral

Morimoto, Carlos H.;HIRATA JR., R.; Zuffo, Marcelo K.. Interação baseada em gestos de mãos e cabeça para ambientes de realidade virtual utilizando visão computacional. 2005. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carlos da Silva dos Santos

Hirata Jr., RobertoBarrera, Junior; João Eduardo Kogler Jr.;CESAR JUNIOR, R. M.; MASCARENHAS, N. D. D.. Construção de atributos binários baseada em análise de interações. 2010. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: David da Silva Pires

CESAR JUNIOR, R. M.; Morimoto, Carlos H.;Hirata Jr., Roberto. Rastreamento de componentes conexas em vídeo 4D. 2010. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Leyza Elemeri Baldo Dorini

Alexandre Xavier Falcão; Aparecido Nilceu Marana; Hélio Pedrini; LEITE, N. J.;Hirata Jr., Roberto. Transformações de Imagens Baseadas em Morfologia Matemática. 2009. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Franklin César Flores

LOTUFO, R. A.; José Eduardo Cogo Castanho;Hirata Jr., Roberto; TOZZI, C. L.; José Mario De Martino. Um Método Interativo para a Segmentação Morfológica de Objetos em Sequências de Imagens. 2009. Tese (Doutorado em Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Alexandre Gonçalves Silva

LOTUFO, R. A.ZAMPIROLLI, F. A.Hirata Jr., Roberto; TOZZI, C. L.; José Mario De Martino. Uso de Árvore de Componentes para Filtragem, Segmentação. 2009. Tese (Doutorado em Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Thiago Teixeira dos Santos

Morimoto, Carlos H.;Hirata Jr., Roberto; Traina, Agma J. M.; Anna Helena Reali Costa; Hélio Pedrini. Detecção e rastreamento de múltiplos objetos em condição de oclusão severa por meio de integração de suporte sob restrição homográfica. 2009. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Priscila Braga Caliope

Emílio Del Moral Hernández; Fátima Nelsizeuma Sombra de Medeiros;Hirata Jr., Roberto; Sebastião Gomes dos Santos Filho; Ivette Frida Cymbaum Oppenheim. Caracterização de nanofibras através de técnicas de processamento de imagens. 2009. Tese (Doutorado em Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: João Henrique Burckas Ribeiro

HASHIMOTO, R. F.Hirata Jr., Roberto; Hae Yong Kim; Alexandre Xavier Falcão; Fernando Mendes de Azevedo. Aprendizado Computacional baseado em distância a segmentos de reta. 2009. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Carolina Quirino Simões

Aline Maria da Silva; Wilson Araújo da Silva Jr.; Helena Paula Brentani; Mari Cleide Sogayar;Hirata Jr., Roberto. Planejamento, gerenciamento e análise de dados de microarranjos de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico de cânceres humanos. 2009. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Celina Maki Takemura

Paulo Eduardo Santo;CESAR JUNIOR, R. M.HIRATA JR., R.; Anna Helena Reali Costa; Olga Regina Pereira Bellon. Modelagem de posições relativas de formas complexas para análise de configuração espacial: entre e ao longo de. 2008. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: João Paulo Papa

Alexandre Xavier Falcão;Hirata Jr., Roberto; Hélio Pedrini; Jacques Wainer; Leila Maria Garcia Fonseca. Classificação Supervisionada de Padrões Utilizando Floresta de Caminhos Ótimos. 2008. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Silvia Cristina Dias Pinto

CESAR JUNIOR, R. M.; RODA, V. O.; GONCALVES NETO, L.;HIRATA JR., R.; TRAVIESO, G.. Análise de formas 3D usando wavelets 1D, 2D e 3D. 2005. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carlos Ramon Pantaleon Dionisio

Hae Yong Kim; Ana Reali Costa; Roseli de Deus Lopes; Gilson Antonio Giraldi;Hirata Jr., Roberto. Características de formas planas invariantes sob transformações de similaridade e afim. 2005. Tese (Doutorado em Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Francisco de Assis Zampirolli

HIRATA JR., R.LOTUFO, R. A.; DORNELLAS, M. C.; TOZZI, C. L.; LEITE, N. J.. Transformada de Distância por Morfologia Matemática. 2003. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Alexandre Rossi Paschoal

Ariane Machado-Lima;Hirata Jr., Roberto; Patrícia Severino. Caracterização de RNA não codificante em Apis mellifera (abelha) e Nasonia Vitripennis (vespa). 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fábio Roberto de Miranda

Hirata Jr., Roberto; João Eduardo Kogler Jr.;SOARES, F. A.. Tarefas visuais para comparação de sistemas de visão computacional. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Talita Perciano Costa Leite

Hirata Jr., Roberto; MASCARENHAS, N. D. D.; Marcel Parolin Jackowski. Segmentação de imagens com estruturas finas. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Kelly Rosa Braghetto

CESAR JUNIOR, R. M.Hirata Jr., RobertoHASHIMOTO, R. F.. Técnicas de mineração de dados para descoberta de modelos de processos de negócios. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Alexandre Ricardo Nardi

FERREIRA, J. E.; Francisco Carlos da Rocha Reverbel;Hirata Jr., Roberto. Uma arquitetura de baixo acoplamento para execução de padrões de controle de fluxo em grades. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carlos da Silva dos Santos

Hirata Jr., RobertoCESAR JUNIOR, R. M.; Fábio Gagliardi Cozman. Construção de atributos binários baseada em análise de interações. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: João Henrique Burckas Ribeiro

HASHIMOTO, R. F.; Marco Dimas Gubitoso;Hirata Jr., Roberto. Aprendizado computacional baseado em distância a segmentos de retas. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Daniel Oliveira Dantas

BARRERA, J.CESAR JUNIOR, R. M.Hirata Jr., Roberto. Segmentacao e reconhecimento de gestos em tempo real com cameras e aceleracao grafica. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Priscila Braga Caliope

Emílio Del Moral Hernández;Hirata Jr., Roberto; Ana Neilde Rodrigues da Silva. Caracterização de Imagens de Nanofibras através de Técnicas de Inteligência Artificial e Processamento de Imagens. 2007. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Thiago Teixeira dos Santos

SANTOS, T. T.; Morimoto, Carlos H.;HIRATA JR., R.CESAR JUNIOR, R. M.. Aplicações de aspectos perceptuais da visão humana à indexação e recuperação de informação em imagens e vídeo. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Carolina Q

Simões, Ana C. Q.;HIRATA JR., R.NEVES, E. J.; FERREIRA, J. E.. Simoes. Gerenciamento e análise de dados de microarrays de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico do câncer de próstata humano. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Thiago Teixeira dos Santos

Morimoto, Carlos H.;CESAR JUNIOR, R. M.Hirata Jr., Roberto. Aplicações de aspectos perceptuais da visão humana à indexação e recuperação de informação em imagens e vídeo. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Celina Maki Takemura

Takemura, Celina M.;CESAR JUNIOR, R. M.HIRATA JR., R.; Morimoto, Carlos H.. Modelagem de posições relativas de formas complexas para análise de configuração espacial. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Carolina Quirino Simões

CARRER, H.; FERREIRA, J. E.;Hirata Jr., Roberto. Análise e armazenamento de dados de microarray. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Celina Maki Takemura

CESAR JUNIOR, R. M.Hirata Jr., Roberto; Morimoto, Carlos H.. Modelagem de posições relativas de formas complexas para análise de configuração espacial: entre e ao longo de. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

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Comissão julgadora das bancas

Antonio Elias Fabris

Antonio Elias Fabris; Barrera, Junior; Mascarenhas, Nelson D.A.. Segmentação de Imagens por Morfologia Matemática. 1997. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação - IME) - Universidade de São Paulo.

Antonio Elias Fabris

Barrera, Junior; Mascarenhas, Nelson D.A.;Antonio Elias Fabris. Segmentação de Imagens por Morfologia Matemática. 1996. Exame de qualificação (Mestrando em Matemática Aplicada, IME) - Universidade de São Paulo.

Nelson Delfino d'Ávila Mascarenhas

MASCARENHAS, NELSON D. A.. SEGMENTAÇÃO DE IMAGENS POR MORFOLOGIA MAEMÁTICA. 1997. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Nelson Delfino d'Ávila Mascarenhas

MASCARENHAS, NELSON D. A.. PROJETO DE OPERADORES MORFOLÓGICOS PARA IMAGENS E SINAIS. 2001. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Sergio Shiguemi Furuie

HIRATA JUNIOR, R.;FURUIE, S. S.. Projeto de Operadores Morfológicos para Imagens e Sinais: abordagem de reticulados finitos discretos. 2001. Tese (Doutorado em Matemática) - Universidade de São Paulo.

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Orientou

Antonio Abello

Adversarial Networks for Super resolution; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Gianluca T

Ciccarelli; Redes Adversariais para Geração de Frames Intermediários em "Animes"; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Mariane Valerio Gonzales

A Importância da Análise Detalhada dos Erros na Classificação de Imagens de Planktons; Início: 2017; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Francisco Caio Maia Rodrigues

Aumentação de exemplos com aplicações em detecção de planktons; Início: 2016; Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Lilian Nogueira de Faria

A definir; Início: 2016; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Rafael Will Macedo de Araujo

Análise demográfica baseada em visão computacional e aprendizado de máquina; Início: 2014; Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Nury Yuleny Arosquipa

Um Estudo Comparativo de Métodos de Segmentação de Documentos Antigos; 2016; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Roberto Hirata Junior;

André Vinícius Lopes

Redes Neurais Convolucionais Aplicadas ao Projeto de Operadores de Imagens; 2015; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Adèle Helena Ribeiro

Análise de expressõ es gênicas com erros de medida e aplicação em dados reais; 2014; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Gabriel Preti

Ferramentas estatísticas e computacionais na análise de fraudes; 2014; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Artur André A

M; Oliveira; Cidades inteligentes, visão computacional, vegetação urbana, Google Street View; 2014; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Jefferson Serafim Ascaneo

Um estudo de algoritmos de reconstrução, focalização e segmentação de imagens de holografia digital para o aprimoramento da classificação de organismos planctônicos; 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Leissi Margarita Castañeda León

Detecção de objetos em vídeos usando misturas de modelos baseados em partes deformáveis obtidas de um conjunto de imagens; 2012; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Luis Roberto P

Paula; Segmentação de imagens SPECT/Gated-SPECT do miocárdio e geração de um mapa polar; 2011; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística,; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Rodrigo Bernardo Pimentel

Localização em dispositivos móveis utilizando sinais de redes Wi-Fi; 2011; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Thiago M

Paixão; Rastreamento de objetos utilizando reconhecimento estrutural de padrões: uma abordagem com modelo estático; 2010; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Rafael de O

L; Gonçalves; A importância dos atributos de cores em PDI e CBIR; 2010; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Rodrigo Assirati Dias

Um middleware para processamento bioestatístico em grades computacionais; 2009; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística,; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Arnaldo Câmara Lara

Segmentação de Movimento Usando Morfologia Matemática; 2007; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Daniel André Vaquero

Projeto Multirresolução de Operadores Morfológicos a Partir de Exemplos; 2004; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Roberto Hirata Junior;

Jorge Luis Guevara Dias

Modelos de aprendizado supervisionado usando métodos kernel, conjuntos fuzzy e medidas de probabilidade; 2015; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Arnaldo Câmara Lara

Descritor de bordas e quantização espacial flexível aplicados a categorização de objetos; 2013; Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Talita Perciano Costa Leite

Detecção de estruturas finas e ramificadas em imagens usando campos aleatórios de Markov e informação perceptual; 2012; Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Igor dos Santos Montagner

W-operator learning using linear models for both gray-level and binary inputs; 2011; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Carlos da Silva dos Santos

Construção de atributos binários baseada em análise de interações; 2010; Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

João Paulo dos Santos Mota

Plataforma de colaboração para auxílio às administrações municipais; 2012; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Lucas Ikeda França

Tema Identificador de plágio para o Adessowiki; ; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Adèle Helena Ribeiro

Análise de Sinais de um Sensor Piroelétrico; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Matemática Aplicada e Computacional) - Universidade de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Alexandre Ouno Atoji

Implementação de uma grade BOINC no CEC com aplicações para codificação de vídeos; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

André Shoji Asato e Rafael de O

Lopes Gonçalves; Acessibilidade para deficientes visuais para cores; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Rodrigo Luiz Marques Flores

BOINC + R: Executando rotinas de bioinformática em grades oportunistas; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Edson Kenji Ninomiya e José Antonio Cardoso Marum Jr

; Visualizador de Múltiplos Vídeos; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Andre de M

Folli e Bruno H; Yoshimura e Gustavo A; Nery; Adequabilidade do Kepler para pacotes de Bioinformática do R; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Rodrigo Assirati Dias

A dotNet Grid Computer; 2004; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Paula Akemi Nishimoto

A dotNet Grid Computer; 2004; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Eric Rodrigo Ramos

Design Patterns for DIP; 2004; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Bianca Bacci Fernandes

Design Patterns for DIP; 2004; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia; Orientador: Roberto Hirata Junior;

César Passoni

Traffic analysis with image processing; 2004; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Camila Garcia Nunes

Traffic analysis with image processing; 2004; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Ana Carolina Rodrigues

Análise de dados em linguagem natural extraídos do Twitter utilizando técnicas de aprendizado de máquina; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Letras) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Antonio Augusto Abello

Análise de imagens de planktons; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências de Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Rodrigo Marques Flores

R-GeneCliques; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Rafael Crivellari Saliba Schouery

Computador Hipo; 2005; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Rodrigo Assirati Dias

Análise de dados de microarrays; 2003; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia, Serviço de Ensino e Aprendizagem do Comércio; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Rodrigo Assirati Dias

Análise de dados de microarrays; 2002; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia, Serviço de Ensino e Aprendizagem do Comércio; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Paula Akemi Nishimoto

O uso do Mathcad para o auxílio no ensino de programação; 2002; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia, Serviço de Ensino e Aprendizagem do Comércio; Orientador: Roberto Hirata Junior;

Michel Koji Mizusaka

Uma aplicação de aprendizado não-supervisionado para desembaralhar imagens; 2002; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia, Serviço de Ensino e Aprendizagem do Comércio; Orientador: Roberto Hirata Junior;

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  • MONTAGNER, I. S. ; HIRATA JR., R. ; HIRATA, N. S. T. . TRIOS - an open source toolbox for training image operators from samples. In: Conference on Graphics, Patterns and Images, 25 (SIBGRAPI), 2012, Ouro Preto. Workshop of Works in Progress (WIP) in SIBGRAPI 2012 (XXV Conference on Graphics, Patterns and Images). Los Alamitos: IEEE Computer Society Conference Publishing Services, 2012. p. 45-46.

  • Rafael de O. L. Gonçalves ; André Shoji Asato ; HIRATA JR., R. . Sistema de Acessibilidade a Cores - Visocor. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 2010, Gramado. Workshop of Undergraduate Works, 2010.

  • Higa, Carlos ; HASHIMOTO, R. F. ; Hirata Jr., Roberto ; HIRATA, N. S. T. ; Carlos S. Santos . Inference of gene regulatory network using temporal coefficient of determination obtained from ergodic Markov chains. In: Genomic Signal Processing and Statistics - GENSIPS, 2009, Minneapolis. IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics, 2009. p. 1-4.

  • Luis Roberto Pereira de Paula ; Carlos S. Santos ; Marco Antônio Gutierrez ; Marina Rebelo ; Hirata Jr., Roberto . MIV: A Cardiac Image Visualizer. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing - Sibgrapi, 2009, Rio de Janeiro. 22nd Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing. SIBGRAPI, 2009, 2009.

  • Higa, Carlos ; HASHIMOTO, R. F. ; Hirata Jr., Roberto ; HIRATA, N. S. T. . Considerations on Using CoD for Inference of Gene Regulation Networks. In: 4th X-Meeting, 2008, Salvador. 4th X-Meeting, 2008. p. 1-4.

  • RIBEIRO, A. H. ; SOLER, J. M. P. ; HIRATA JR., R. . Two-color microarray data analysis taking into account probe-level inaccuracies. In: ISCB-Latin America x-Meeting on Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014, Belo Horizonte. ISCB-Latin America x-Meeting on Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014.

  • Grynberg, Priscila ; Passos-Silva, Danielle Gomes ; Hirata Jr, Roberto ; Macedo, Andrea Mara ; NEVES, E. J. ; Machado, Carlos Renato ; Franco, Glória Regina . Analysis of Trypanosoma cruzi gene expression in response to ionizing radiation using the DNA microarray technique. In: ISCB Latin America Conference, 2010, Montevideo. ISCB Latin America Conference, 2010.

  • Talita Perciano Costa Leite ; Hirata Jr., Roberto ; CESAR JUNIOR, R. M. . An Image Simulator of Soil Profiles with Plant Roots for Image Segmentation. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 2009, Rio de Janeiro. Anais do XXII Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 2009, 2009.

  • Grynberg, Priscila ; Passos-Silva, Danielle Gomes ; Hirata Jr, Roberto ; Macedo, Andrea Mara ; Machado, Carlos Renato ; Bartholomeu, Daniella Castanheira ; Franco, Glória Regina . Analysis of Trypanosoma cruzi Gene Expression in Response to Ionizing Radiation using the DNA Microarray Technique. In: X-meeting 2009 - 5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. X-meeting Eletronic Abstracts Book 2009, 2009.

  • Grynberg, Priscila ; Passos-Silva, Danielle Gomes ; Hirata Jr, Roberto ; Macedo, Andrea Mara ; NEVES, E. J. ; Machado, Carlos Renato ; Bartholomeu, Daniella Castanheira ; Franco, Glória Regina . Analysis of Trypanosoma cruzi gene expression in response to ionizing radiation using the microarray technique. In: IV Meeting in Fundamental Aspects of DNA Repair and Mutagenesis, 2009, Belo Horizonte. IV Meeting in Fundamental Aspects of DNA Repair and Mutagenesis, 2009.

  • REIS, L. F. ; CARVALHO, A. F. ; NEVES, E. J. ; HIRATA JR., R. ; MARTINS, W. K. ; MONTAGNINI, A. L. ; SOARES, F. A. . Molecular Classifieres for gastric cancer and non-malignant diseases of the gastric mucosa. In: AACR 2003, 2003, Toronto. AACR 2003, 2003.

  • ESTEVES, G. P. ; DANTAS, D. O. ; HIRATA JR., R. ; NEVES, E. J. ; BARRERA, J. ; REIS, L. F. ; CARVALHO, A. F. . A Study on some parameters that may influence cDNA microarrays analysis. In: Congresso Nacional de Genética, 2002, Águas de Lindóia. Congresso Nacional de Genética, 2002.

  • GOMES, L. I. ; STOLF, B. S. ; ESTEVES, G. P. ; MARTINS, W. K. ; HIRATA JR., R. ; NEVES, E. J. ; REIS, L. F. ; CARVALHO, A. F. . Assesment of bias introduced by RNA amplification for microarray hybridization. In: Congresso Nacional de Genética, 2002, Águas de Lindóia. Congresso Nacional de Genética, 2002.

  • STOLF, B. S. ; CARVALHO, A. F. ; MARTINS, W. K. ; RUNZA, F. B. ; HIRATA JR., R. ; NEVES, E. J. ; SOARES, F. A. ; KOWALSK, P. L. ; CARVALHO, M. B. ; REIS, L. F. . Identification of genes differentially expressed in thyroid tumors. In: Congresso Nacional de Genética, 2002, Águas de Lindóia. Congresso Nacional de Genética, 2002.

  • SILVA, R. L. A. ; MACKAY, A. ; CARVALHO, A. F. ; RUNZA, F. B. ; HIRATA JR., R. ; NEVES, E. J. ; HARE, M. O. ; REIS, L. F. . Identification of genes with altered expression in human mammary luminal cell lines as a consequence of ERBB (HER2-neu) overexpression. In: Congresso Nacional de Genética 2002, 2002, Águas de Lindóia. Congresso Nacional de Genética 2002, 2002.

  • MEIRELES, S. I. ; CARVALHO, A. F. ; HIRATA JR., R. ; MONTAGNINI, A. L. ; MARTINS, W. K. ; RUNZA, F. B. ; MENDONCA, C. E. ; SOARES, F. A. ; NEVES, E. J. ; REIS, L. F. . Identification of molecular markers in gastric cancer by cDNA arrays. In: Congresso Nacional de Genética 2002, 2002, Águas de Lindóia. Congresso Nacional de Genética 2002, 2002.

  • BAGATTINI, R. ; GORJÃO, R. ; TAMINATO, A. ; CHEN, G. ; DRIESSCHE, N. V. ; SANTOS, T. T. ; OKIDA, G. T. ; HIRATA JR., R. ; FERREIRA, J. E. ; NEVES, E. J. ; BARRERA, J. ; KUSPA, A. ; SHAULSKY, G. ; SOUZA, G. M. . A role for yaka, camp and pka in the nitrosoative/oxidative stress response of dictyostelium discoideum cells. In: International Dictyostelium Conference, 2001, La Jolla, California - USA, 2001.

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Outras produções

Perciano, Talita ; Hirata Jr., Roberto ; CESAR JUNIOR, R. M. . A Plant Root Simulator. 2009.

Flores, Rodrigo ; Hirata Jr., Roberto ; DIAS, R. A. . Geneplot. 2008.

Schouery, Rafael, C. S. ; HIRATA JR., R. ; SETZER, V. W. . HIPO - Computador Hipotético. 2007.

DIAS, R. A. ; HIRATA JR., R. . A dotNet Grid Computer. 2005.

HIRATA JR., R. ; HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, J. . PAC Library - Probably Approximate Correct library functions. 1997.

HIRATA JR., R. . Introdução à bioinformática. 2006. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

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Projetos de pesquisa

  • 2016 - Atual

    Storage, Modeling and Analysis of Dynamical Systems for e-Science Applications, Descrição: The astonishing fast rate of technology evolution has given rise to a new era of scientific knowledge discovery. This new age of science, known as e-Science, is described as the new great computational and multidisciplinary team science requiring novel methodologies for data storage, modeling and analysis. In particular, the development of transactional and analytical software systems for e-Science applications when viewed from a dynamic systems perspective, presents a number of new computational challenges. Among them are the scientific knowledge discovery processes, which involve frequent changes of requirements for data storage, modeling and analysis. The need to address scientific dynamic systems in order to cope with complex applications of e-Science has woken up the scientific community for the development of robust and evolutionary software systems to meet these new challenges. Dynamical system is the classical mathematical formalism to represent phenomena that evolute with time, which are of great interest in science. In this project, our main goal is to develop computational models and methodologies to support e-Science applications viewed as dynamic systems. Our fundamental research covers three key research areas, namely storage, modeling, and analysis of dynamic systems. These research areas are significant and relevant to the FAPESP e-Science Program since many of the present e-Science challenges are related to the proper treatment of dynamic systems. Hence, we plan to develop and apply computational methodologies that will ease the development of e-Science applications, thereby contributing to the improvement of worldwide scientific knowledge, while respecting legal and ethical restrictions in data management.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / João Eduardo Ferreira - Coordenador / Ronaldo Fumio Hashimoto - Integrante / Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Paulo Sergio Graziano Magalhães - Integrante.

  • 2015 - Atual

    Combinação de características locais e globais em aprendizagem de operadores de imagens, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nina Sumiko Tomita Hirata em 04/08/2016., Descrição: O problema de projeto de operadores morfológicos pode ser modelado no contexto de aprendizagem de máquina como um problema de aprendizado de uma função local que mapeia o padrão observado em cada ponto da imagem para um valor de saída. Uma característica interessante dos operadores morfológicos é o fato de eles permitirem uma interpretação intuitiva de seus efeitos, uma vez que sua concepção é fortemente baseada em explorar informação de forma e de topologia. Além disso, eles são formalmente bem caracterizados por fundamentos teóricos sólidos. Porém, por construção, operadores morfológicos não possuem propriedades interessantes como invariância à escala e à rotação e também não levam em consideração informações globais ou de contexto. Neste projeto, o objetivo principal é avançar os métodos existentes para projeto de operadores morfológicos para que estes sejam capazes de tratar objetos de diferentes escalas e levem em consideração informações globais e de contexto. Para tanto, a principal ideia a ser explorada é o uso de descritores de características diversas citados na literatura da área, de forma acoplada ao arcabouço de combinação de operadores. Deverão ser investigados os aspectos teóricos, estatísticos e práticos associados. Aplicações em processamento de imagens de documentos são planejadas como meio para validação dos métodos a serem desenvolvidos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / Nina Sumiko Tomita Hirata - Coordenador / Igor do Santos Montagner - Integrante / Ana Lucia Lima Marreiros Maia - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    NAP - eScience, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Roberto Marcondes Cesar Junior em 22/03/2015., Descrição: A ciência moderna é crescentemente interdisciplinar e intensiva em dados. Na área de ciências da vida, por exemplo, com o surgimento de plataformas de alto desempenho para imagem e estudos genômicos o gargalo não está mais na aquisição de dados mas sim no seu processamento, análise, armazenamento e transferência. Esse cenário levou ao desenvolvimento de novas metodologias matemáticas e de ciência da computação para o tratamento de grande volume de dados, conhecidas hoje como e-Science. Entre os recursos mais importantes para e-Science estão a computação em nuvem e o uso de ferramentas de análise on-line. É também imperativo que a aquisição e inclusão de dados oriundos de plataformas de alto desempenho em bancos, para posterior análise e transferência, obedeçam a critérios estabelecidos ex ante por uma curadoria (data engineering). Essa nova arquitetura de tratamento de dados é essencial para que a descoberta científica nos principais domínios do conhecimento não venha a ser detida pelo ?dilúvio de dados? (Baraniuk RG, Science.2011. 331:717-8). A presente proposta centra-se na criação do Núcleo de e-Science da USP como uma resposta institucional para a formação de uma rede de laboratórios da Universidade de São Paulo capaz de: i) liderar iniciativas em desenvolvimento e difusão de metodologias computacionais aplicáveis à captura, armazenamento, manutenção e análise de dados gerados por plataformas de alto desempenho em domínios como medicina e biologia; ii) organizar a formação de recursos humanos nessa área ; iii) gerar, difundir e transferir tecnologia em e-Science.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / Roberto Marcondes César Junior - Coordenador.

  • 2013 - Atual

    Aprendizagem de operadores de imagens - Aplicações em detecção de objetos e segmentação de imagens, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nina Sumiko Tomita Hirata em 26/09/2018., Descrição: Dado o volume crescente de imagens geradas atualmente, a importância de métodos de processamento e análise que possam ser facilmente adaptados para diferentes t ipos de imagens está cada vez mais evidente. Dentre tarefas comuns em processame nto de imagens destacam-se a segmentação e a detecção de objetos de interesse. De um lado, os operadores morfológicos são ferramentas poderosas que podem ser utilizados na solução dessas tarefas. De outro lado, aprendizagem computacional é uma abordagem que permite a adaptação de métodos de processamento de um contexto para outro. A aliança desses dois vem gerando técnicas de aprendizagem de opera dores morfológicos a partir de imagens de treinamento. No entanto, os resultados satisfatórios ainda estão restritos ao contexto de processamento de imagens binárias. Este projeto de pesquisa visa avanços no estado-da-arte em aprendizagem d e operadores morfológicos para imagens níveis de cinza, e especialmente voltados para os problemas de detecção de objetos e segmentação de imagens. Uma das cont ribuições esperadas desta proposta é a solução de problemas reais de detecção e segmentação de objetos em imagens de diferentes áreas tais como Astronomia, Oceanografia e Biologia, em colaborações multidisciplinares mantidas pelos membros da equipe.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / Carlos da Silva dos Santos - Integrante / Hirata, Nina S.T. - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2011 - 2014

    Métodos e Técnicas para Exploração e Análise de Bioimagens, Descrição: A demanda pela análise de imagens oriundas das mais variadas subáreas biomédicas e biológicas tem nitidamente crescido nos últimos anos. Além dos desafios computacionais diretamente relacionados à natureza da análise em questão, tais como a complexidade das imagens e o grande volume e tipos de problemas, verificam-se desafios relacionados à multidisciplinaridade e à necessidade de melhor integração de resultados gerados no tratamento de diferentes problemas. Este projeto de pesquisa propõe a investigação, desenvolvimento e validação de métodos e técnicas inovadoras para exploração e análise de bioimagens. Para viabilizar essa investigação, diversos subprojetos, todos relacionados a algum problema de análise de bioimagens e que envolvem colaborações com pesquisadores das áreas biológicas, são contemplados nesta proposta. Adicionalmente, está previsto o desenvolvimento de um ambiente unificado para exploração e análise de imagens, que terá papel importante para operacionalizar e viabilizar o desenvolvimento dos métodos e técnicas, melhorar as interações em colaborações multidisciplinares e permitir reaproveitamento de resultados. Com isso, esta proposta visa contribuir para formação de competência nacional em análise de bioimagens.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (2) . , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / Nina Sumiko Tomita Hirata - Coordenador / Ronaldo Fumio Hashimoto - Integrante / Roberto Marcondes César Junior - Integrante / Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Fabrício Martins Lopes - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2011 - 2013

    Desafios em Projeto Multinível de Operadores Morfológicos, Descrição: Projetar operadores morfológicos que apresentam bom desempenho em problemas de processamento e análise de imagens não é, em geral, uma tarefa simples. Uma abordagem útil para auxiliar o projeto de operadores é sua formulação como um problema de aprendizagem computacional: pares de imagens entrada-saída são utilizados como amostras de treinamento para gerar, via técnicas de aprendizagem computacional, um operador que procura mapear as imagens de entrada para as respectivas imagens de saída. No contexto considerado, esses operadores são caracterizados por uma função local que depende de uma vizinhança na imagem em torno do ponto a ser processado. Vizinhanças muito pequenas restringem a classe de operadores, gerando erro de restrição, e vizinhanças muito grandes resultam em imprecisão, gerando muita variância. Uma abordagem promissora recentemente proposta para balancear esses dois tipos de erro no caso de operadores binários é o projeto multinível de operadores. Nessa abordagem, o treinamento é realizado em múltiplos níveis, de forma a combinar em cada nível os resultados dos níveis anteriores. A escolha dos parâmetros dessa abordagem multinível tem sido realizada, por enquanto, manualmente. Este projeto de pesquisa pretende investigar aspectos práticos e teóricos dessa abordagem; em particular, pretende automatizar a escolha de parâmetros e estender a abordagem multinível para operadores sobre imagens em tons e cinza.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / Nina Sumiko Tomita Hirata - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2011 - Atual

    Modelos e Métodos de e-Science para Ciências da Vida e Agrárias, Descrição: A ciência moderna é crescentemente interdisciplinar e intensiva em dados. Na área de ciências da vida, por exemplo, com o surgimento de plataformas de alto desempenho para análise de imagens e estudos genômicos, o gargalo não está mais na aquisição de dados mas sim no seu armazenamento, processamento, análise e visualização. Este cenário levou ao surgimento de um novo campo de pesquisa ? eScience ? que combina pesquisa avançada em computação e em modelagem matemática para permitir e acelerar pesquisa em outros domínios do conhecimento, desde as ciências exatas até as humanidades e artes. A eScience envolve a chamada "computação centrada em dados" (data-intensive computing), com a busca de soluções para gerenciamento de grandes volumes de dados produzidos por (e para) experimentos científicos, para que a descoberta científica não venha a ser detida pelo ?dilúvio de dados?. Este projeto visa a criação de uma rede colaborativa de eScience para acelerar pesquisa avançada em ciências da vida (biologia, medicina, oceanografia) e ciências agrárias. Está estruturado em torno de cinco linhas de pesquisa ? biologia de sistemas, planejamento de safras, computação visual, modelagem matemática e bancos de dados. Dentro dessas linhas, serão tratadasquestões em aberto associadas às principais componentes de um ambiente de pesquisa em eScience: armazenamento, processamento, análise e visualização de grandes volumes de dados científicos. Os pesquisadores principais têm histórico de cooperação e coordenação de projetos nessas linhas. Questões de interoperabilidade permeiam todo o projeto. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / Junior Barrera - Integrante / Roberto Marcondes César Junior - Coordenador / Alexandre Xavier Falcão - Integrante / Luciano da Fontoura Costa - Integrante / Cláudia Maria Bauzer Medeiros - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2008 - 2010

    Redes de interação gênica ``semeadas'' por cliques, Descrição: No presente projeto de pesquisa pretende-se estudar subsistemas biológicos dentro de um sistema complexo usando o modelo de Redes Booleanas Probabilísticas e a abordagem de aprendizado estatístico e computacional. O número de genes a ser considerado no subsistema é pequeno de forma a viabilizar as inferências entre os genes de estudo e, simplificar os modelos matemáticos e computacionais. A importância deste trabalho é que os algoritmos desenvolvidos podem ajudar pesquisadores a encontrar genes ainda não conhecidos envolvidos em importante processos biológicos, além de fortalecer a colaboração dos grupos envolvidos (Brasil, Argentina e USA).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Coordenador / Nina Sumiko Tomita Hirata - Integrante / Ronaldo Fumio Hashimoto - Integrante / Rodrigo Assirati Dias - Integrante / Santos, Carlos S. - Integrante / Rodrigo Flores - Integrante / Carlos Higa - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2008 - Atual

    Expressão genica em tumores do estomago e do esofago: da biologia ao diagnóstico, Descrição: Os tumores da porção superior do trato digestivo (esôfago e estômago) representam um importante desafio na pesquisa sobre o câncer. A grande maioria dos pacientes é diagnosticada tardiamente e, por conseqüência, com prognóstico bastante limitado. Enquanto os adenocarcinomas de estômago representam a segunda maior cause de morte relacionada ao câncer, os adenocarcinomas do esôfago apresentam a maior taxa de crescimento percentual nos Estados Unidos e Europa, assim como nas populações de maior renda no hemisfério sul. Os adenocarcinomas do estômago e do esôfago estão freqüentemente associados a processos inflamatórios da mucosa normal. Esse processo inflamatório crônico leva à substituição da mucosa normal por um tecido colunar do tipo intestinal, denominado metaplasia intestinal do estômago e que, no esôfago, recebe a denominação de mucosa de Barrett. Essas duas patologias não devem ser consideradas doenças pré-malígnas, uma vez que a taxa de transformação em adenocarcinomas é reduzida, mas representam o fator de risco mais importante para os adenocarcinomas dos dois órgãos. Usando a metodologia de microarranjos de DNA, estudamos as características moleculares de amostras de tecido representando mucosa normal, metaplasia intestinal e adenocarcinomas desses dois órgãos. Com base nestes dados, aplicamos ferramentas matemáticas e estatísticas para identificar assinaturas moleculares capazes de classificar precisamente as amostras. Também, foi possível definir um conjunto de alterações em vias metabólicas relacionadas aos processos inflamatórios e de metabolismo de glicerolípedes que poderão contribuir para o entendimento da origem e dos processos moleculares envolvidos na transformação maligna. Neste projeto, pretendemos criar uma rede de instituições e pesquisadores com tradição de pesquisa em tumores de estomago e esôfago que permitirá acesso a um número maior de amostras com dados clínicos e epidemiológicos associados. Com essas amostras, pretendemos estabelecer uma. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (5) Doutorado: (5) . , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / Luis Fernando Reis - Coordenador / Neves, E Jordão - Integrante.

  • 2006 - Atual

    Aprendizado computacional na descoberta de marcadores moleculares para câncer, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Coordenador.

  • 2006 - Atual

    Modelagem por redes (grafos) e técnicas de reconhecimento de padrões: estrutura, dinâmica e aplicações, Descrição: Dentre os desafios enfrentados atualmente pela pesquisa em reconhecimento de padrões, cabe ressaltar três linhas fundamentais: (a) problemas em que elementos devem ser descritos estruturalmente através de uma rede indicando conexões entre tais elementos; (b) problemas envolvendo a evolução da informação ao longo de alguma variável independente (e.g. tempo, no caso de seqüências de vídeo); (c) problemas envolvendo ambos aspectos, i.e. uma rede de elementos cuja dinâmica evolui ao longo de alguma variável independente. O presente projeto temático, unindo os grupos de visão do IME-USP e IFSC-USP, além de pesquisadores colaboradores de outras instituições, prevê o estudo, desenvolvimento e aplicação de técnicas de reconhecimento de padrões com esses três itens formando o tema de integração da pesquisa. Além da área de reconhecimento de padrões, o projeto inclui técnicas e problemas de visão computacional, processamento de imagens e de sinais e bioinformática, todas sendo áreas de trabalho dos pesquisadores proponentes. As atividades de pesquisa tratarão de aspectos de reconhecimento de padrões e de redes em ambas direções: (1) utilização de técnicas de reconhecimento de padrões para auxiliar na análise de redes em aplicações específicas; (2) desenvolvimento de técnicas de reconhecimento de padrões baseadas em redes. Esta linha de pesquisa incluirá a utilização de grafos em reconhecimento estrutural de padrões e raciocínio espacial. Os métodos em tais abordagens são marcados pelo fato que a tarefa de reconhecimento não envolve apenas os objetos em uma imagem, mas igualmente as relações entre tais objetos. Parte da importância da utilização dessas relações advém do fato que tais relações são frequentemente mais estáveis nas cenas que muitas propriedades dos objetos em si. Em particular, pretende-se explorar técnicas que descrevem a estrutura dos elementos em imagens através de grafos. Nesse caso, a rede é formada por elementos de uma imagem cujos arcos representam relaçõe. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (7) Doutorado: (5) . , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / Nina Sumiko Tomita Hirata - Integrante / Ronaldo Fumio Hashimoto - Integrante / Roberto Marcondes César Junior - Coordenador / Luciano da Fontoura Costa - Integrante.

  • 2004 - 2004

    Uma grade basead em .Net, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Coordenador.

  • 2004 - 2004

    Design Patterns em processamento de imagens, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Coordenador.

  • 2004 - 2004

    Análise de tráfego usando processamento de imagens, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Coordenador.

  • 2003 - 2006

    Classificadores de amostras biológicas baseadas na expressão de poucos genes., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Coordenador.

  • 2002 - 2004

    Identificação de Genes que Regulam Fenótipos de Interesse em Agropecuária através da Análise Computacional de Seqüências de Expressão, Descrição: Projeto CNPq - Pesquisador. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / Junior Barrera - Coordenador / Neves, E Jordão - Integrante.

  • 2000 - 2005

    Cooperation for Analysis of Gene Expression - FAPESP No.99/07390-0, Descrição: Projeto Temático FAPESP. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Roberto Hirata Junior - Integrante / Hugo Aguirre Armelin - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

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Prêmios

2008

Melhor poster no X-Meeting 2008, AB3C.

2007

Menção honrosa no Concurso de Teses e Dissertações do Sibgrapi 2007, SBC.

2002

Menção Honrosa no 10 siicusp, USP-CNPq.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade de São Paulo, Instituto de Matemática e Estatística. , Rua do Matão, 1010, Cidade Universitária, 05508-090 - Sao Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30915376, Fax: (11) 30916134, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2013 - Atual

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2004 - 2013

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2001 - 2004

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Carga horária: 20

    Atividades

    • 05/2016

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.,Cargo ou função, Coordenador de Programa de Pós-graduação.

    • 04/2009

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, .,Cargo ou função, Membro do conselho do departamento de ciência da computação.

    • 03/2009

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, .,Cargo ou função, Coordenador da Comissão de Informática.

    • 11/2008

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Coordenação do Programa de Pós-graduação da Ciência da Computação.

    • 08/2001

      Pesquisa e desenvolvimento , Núcleo de Bioinformática, .,Linhas de pesquisa

    • 01/2008 - 02/2009

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, .,Cargo ou função, Vice-coordenador da Comissão de Informática.

    • 06/2007 - 02/2009

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, .,Cargo ou função, Representante do departamento na Comissão de Informática.

  • 2003 - 2004

    Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia

    Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor V, Carga horária: 40

  • 2002 - 2003

    Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia

    Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto I, Carga horária: 40

  • 2001 - 2001

    Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia

    Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Assistente II, Carga horária: 40

    Atividades

    • 02/2004 - 08/2004

      Direção e administração, .,Cargo ou função, Coordenador de grupo de pesquisas.

    • 02/2004 - 08/2004

      Conselhos, Comissões e Consultoria, .,Cargo ou função, Membro representante da faculdade no Núcleo de Estudos Interamericanos do Embaixada dos Estados Unidos no Brasil.

    • 01/2004 - 08/2004

      Conselhos, Comissões e Consultoria, .,Cargo ou função, Membro representante no Conselho de Ética em Saúde das Faculdades SENAC.

    • 12/2003 - 08/2004

      Outras atividades técnico-científicas .,Atividade realizada, Árbitro para a revista Transactions on Image Processing - 1 artigo.

    • 08/2003 - 08/2004

      Outras atividades técnico-científicas .,Atividade realizada, Árbitro para o CNPq.

    • 07/2003 - 08/2004

      Conselhos, Comissões e Consultoria, .,Cargo ou função, Membro da comissão de reformulação do bacharelado em ciência da computação.

    • 07/2002 - 08/2004

      Outras atividades técnico-científicas .,Atividade realizada, Árbitro para a FAPESP.

    • 08/2001 - 08/2004

      Ensino, Processamento de Imagens, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Morfologia Matemática

    • 08/2001 - 07/2004

      Ensino, Bacharelado Em Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Algoritmos e Programação, Computador e sociedade, Engenharia de sistemas de informação, Técnicas de Construção de Programas, Tópicos especiais em engenharia de software

    • 08/2002 - 02/2004

      Direção e administração, Laboratório de Imagens, Visão e Estruturas Espaciais, .,Cargo ou função, Vice-coordenador de laboratório.