Vinícius Augusto Carvalho de Abreu

Possui graduação em Ciência da Computação pelo Centro Universitário do Estado do Pará (2008) e doutorado direto em Bioinformática pela Universidade Federal de Minas Gerais (2014) - conceito 7, com doutorado sanduiche no Max Planck Institute Informatics na Alemanha e pós-doutorado no Programa de Pós Graduação em Ciência pelo Centro de Energia Nuclear na Agricultura - CENA/USP - conceito 7. Atualmente é professor adjunto na Universidade Federal do Pará, lotado na Faculdade de Computação. Tem experiência no desenvolvimento de ferramentas em Bioinformática e workflow, atuando principalmente nos seguintes temas: genômica, predição de redes de regulação gênica, workflow e desenvolvimento de software e algoritmos voltadas a problemas biológicos e de políticas públicas.

Informações coletadas do Lattes em 24/11/2024

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioinformática

2010 - 2014

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: CMRegNet ? uma plataforma de análise interativa para estudar redes regulatórias transcricionais dos gêneros Corynebacterium e Mycobacterium
Orientador: em Max-Planck-Institut für Informatik ( Jan Baumbach)
com , Ano de obtenção: 2014. Vasco Ariston de Carvalho Azevedo. Coorientador: Sintia Silva de Almeida. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Pangenômica; Analise comparativa; pipeline.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Setores de atividade: Educação; Pesquisa e desenvolvimento científico; Outras atividades profissionais, científicas e técnicas.

Graduação em Ciência da Computação

2003 - 2008

Centro Universitário do Estado do Pará
Título: TV Digital: um estudo comparativo dos padrões de Middleware.
Orientador: Alessandra Natasha Alcantara Barreiros

Pós-doutorado

2024

Pós-Doutorado. , Universidad de Buenos Aires, UBA, Argentina. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra

2015 - 2018

Pós-Doutorado. , Centro de Energia Nuclear na Agricultura, CENA/USP, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

2014 - 2015

Pós-Doutorado. , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.

Formação complementar

2016 - 2016

Metagenômica: conceitos e aplicações. (Carga horária: 70h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2016 - 2016

1st International Workshop on Cyanobacteria Natural Products. (Carga horária: 140h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2015 - 2015

CBAB - FERR. de BIOINFO. APLIC. ÀS ANA. DE RNA-SEQ. (Carga horária: 32h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2014 - 2014

PHP Advanced WebServices + Ajax. (Carga horária: 20h). , PHPrime, PHPRIME, Brasil.

2014 - 2014

PHP Advanced 2 (Saidas Avançadas). (Carga horária: 20h). , PHPrime, PHPRIME, Brasil.

2014 - 2014

Workshop de Capacitacao para Biocuradoria de Termos GO. (Carga horária: 15h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2013 - 2013

Latin American eScience workshop "Turning Data into Insight". (Carga horária: 45h). , Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

2013 - 2013

Introduction to Systems Biology Modeling. (Carga horária: 30h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2011 - 2011

Course Completion. (Carga horária: 192h). , Western Town College, WTC, Canadá.

2011 - 2011

Workshop de Montagem e anotação de Genomas Bacteri. (Carga horária: 104h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2010 - 2010

CBAB: Plataforma de Sequenciamento de Nova Geração. (Carga horária: 90h). , Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.

2010 - 2010

Curso de Estatística Aplicada Utilizando o R. (Carga horária: 48h). , Fundação Ezequiel Dias, FUNED, Brasil.

2010 - 2010

2º Curso de Nivelamento em Bioinformática. (Carga horária: 70h). , FIOCRUZ MINAS - Centro de Pesquisas René Rachou, CPQRR, Brasil.

2005 - 2005

JAI7:Design Avaliação de Tecnol. Web-acessível /WIE: O uso de softw. livre. (Carga horária: 30h). , Universidade do Vale do Rio dos Sinos, UNISINOS, Brasil.

2004 - 2004

Delphi Básico. (Carga horária: 10h). , Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.

2002 - 2002

Manutenção e Montagem de Micro Computadores. (Carga horária: 48h). , SENAI - Departamento Regional do Pará, SENAI/DR/PA, Brasil.

1996 - 1996

Windows, Word, Excel. (Carga horária: 40h). , Mr. Chip Cursos de Computação, MC, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática/Especialidade: Bioinformática.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Banco de Dados.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Rede de regulação.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Metagenômica.

Organização de eventos

ABREU, V. A. C. . II SIMPÓSIO do progama de PÓS-DOUTORADO da USP no CENA. 2017. (Outro).

ABREU, V. A. C. ; NAVARRETE, A. A. ; RIGONATO, J. ; ISHIDA, J. K. . Primeiro Simpósio dos Pós Doutores da USP. 2016. (Outro).

ABREU, VINÍCIUS A.C. ; ANDREOTE, A. P. D. ; FIORE, M. F. . 1st International Workshop on Cyanobacterial Natural Products. 2016. (Congresso).

SILVA, A. ; SCHNEIDER, M. P. C. ; ABREU, V. A. C. ; ALMEIDA, S. S. ; ALI, A. ; D'AFONSECA, V. ; RAMOS, R. T. J. ; MELO, H. ; GUIMARAES, L. C. ; CERDEIRA, L. ; LOPES, T. ; SÁ, P. ; AZEVEDO, V. . Curso CBAB - Plataforma de Sequenciamento de Nova Geração. 2010. (Outro).

Participação em eventos

XIII - Semana de Informática CESIT/UEA.Bioinformática: Fundamento, Perspectivas, tendências e Avaliações no Âmbito de Amazônia Sustentável. 2019. (Seminário).

10th European Workshop on the Molecular Biology of Cyanobacteria!.Genomic and genotypic characterization of Cylindrospermopsis raciborskii. 2017. (Outra).

1° Simpósio do Programa de Pós-doutorandos da Universidade de São Paulo.Comissao Organizadora. 2016. (Simpósio).

1a Escola de Pesquisadores da USP. 2016. (Seminário).

Brazilian-International Congress of Genetics. EVALUATION OF GENETIC PLASTICITY AMONG STRAINS OF CYLINDROSPERMOPSIS. 2016. (Congresso).

Latin American eScience workshop "Turning Data into Insight". 2013. (Oficina).

Microbiota: the bacteria that govern us. 2013. (Simpósio).

X-Meeting BSB 2013. CMRegNet: A database of transcriptional regulatory network. 2013. (Congresso).

26 Congresso Brasileiro de Microbiologia. 2011. (Congresso).

7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (AB3C) and 3rd International Conference of the Ibero Ameriacan Society for Bioinformatics (SolBio). CpDB: A relational database schema and tools for bacterial genomes annotation and posgenome research. 2011. (Congresso).

7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (AB3C) and 3rd International Conference of the IberoAmeriacan Society for Bioinformatics (SolBio). De Novo Genome Assembly Course. 2011. (Congresso).

International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting. Improvement of access to tools used in genetic and apidemiology studies through th development of a web interface for the DIVERGENOME platform. 2009. (Congresso).

XXV Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2005. (Congresso).

Participação em bancas

Aluno: Raíssa Lorena Silva da Silva

ALVES, R. C. O.; MORAIS, J. M.; FRANCES, R. S. K.;ABREU, V. A. C.. Arandom Forest Classifier for Prokaryotes Gene Prediction. 2020. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Fernando Henrique Correr

MARGARIDO, G. R. A.; CARNEIRO, M. S.; VERDI, M. C. Q.;ABREU, V. A. C.. Perfis de expressão gênica temporal de cana-de-açúcar infectada por ferrugem alaranjada. 2017. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz da Universidade de São Paulo.

Aluno: THAIS ANDRADE GERMANO

de Abreu, V. A. C.; SHAH, M.; CECCATTO, V. M.; MIRANDA, M. R. A.; LOPES, M. M. A.; COSTA, J. H.. Análise Transcriptômica de pedúnculos de caju (Anacardium occidentale) durante o desenvolvimento em genótipos apresentando cores e firmezas diferentes. 2020. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade Federal do Ceará.

Aluno: Igor Oliveira Duarte

MELO, V. M. M.; SILVA, A. L. C.;de Abreu, V. A. C.. Montagem e análise do genoma "Bacillus vallismortis" TIM68: uma bactéria produtora de surfactantes". 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade Federal do Ceará.

Aluno: Elias Sena Moraes

PIRES, Y. P.; ARAUJO, F. P. O.;ABREU, V. A. C.. Caminho do Açai: Um jogo para auxiliar no ensino do caminho mínimo em grafos não direcionados. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Felipe Gusmão Araujo

COUTO, D.C.C.; FRANCES, R. S. K.;de Abreu, V. A. C.. DOCUMENTAÇÃO ÁGIL PARA DESENVOLVIMENTO DE UM APLICATIVO MÓVEL DE RESULTADOS MICROBIOLÓGICOS (MICAPP). 2020.

Aluno: Rodrigo de Britto Pontes Rodrigues Pará

R.B.P.R. Pará;ABREU, V. A. C.. Um Estudo Comparativo de Ferramentas de Binning de Metagenomas Utilizando Dados Simulados Micobriano. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Walder Lobo Marques

MOTA, M.P; VIEGAS, R. J.;Abreu, Vinícius A. C.. AMAZONIZE: Uma proposta de Ferramenta para promover a cultura amazônica. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Jéssica de Paula Figueira Ribeiro

COUTO, D.C.C.; KAHWAGE, C.M.C.; RODRIGUES, A.L.F.;ABREU, V. A. C.. Desenvolvimento de um jogo mobile para promover a preservação do boto na região amazônica. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Expedido Augusto Cardoso Nobre Filho

KAHWAGE, C.M.C.; COUTO, D.C.C.;ABREU, V. A. C.. ARTICULAFONO - Protótipo em android para auxiliar crianças com problemas de dicção. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Matheus Seabra de Carvalho Vieira Coelho

PINTO, G.H.L.; SARAIVA, F.O.;ABREU, V. A. C.. REST ou GRAPHQL? Um estudo comparativo do desempenho entre arquiteturas de serviços web. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

YASOJIMA, E.K.K.; QUADRO, C.J.F.;ABREU, V. A. C.. Algoritmos e Programação de Computadores. 2019. Universidade Federal Rural da Amazônia.

QUADRO, C.J.F.; SOUZA, J.V.;ABREU, V. A. C.. Estrutura e Banco de Dados. 2019. Universidade Federal Rural da Amazônia.

Orientou

VITOR RABELO DELGADO

O impacto cultural das TICs na sociedade da informação: breves considerações e apontamentos em Ciência da Informação; Início: 2023; Dissertação (Mestrado em Ciência da Informação) - Universidade Federal do Pará; (Orientador);

Thiago Castro da Conceição

Interactive Metagenomic (INTMETA); Início: 2023; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

MARCOS FERNANDO SOARES COSTA

Dissertação; Início: 2022; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará; (Orientador);

Reno Silva Nooblath

Genômica comparativa de Cylindrospermopsis; Início: 2022; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará; (Orientador);

Péricles Lopes Machado

Início: 2024; Universidade Federal do Pará;

Tayrine De Souza Rocha

Analise de visualização multidimensional para dados multi-ômicos; 2023; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará, ; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

MAYARA COSTA PINHEIRO

Uso das tecnologias de Inteligência Artificial na Ciência da Informação brasileira; 2022; Dissertação (Mestrado em Ciência da Informação) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

Tayana Freire Sizo

Ciência da Informação: Gestão da Informação e seu impacto sobre o quadro social de uma cooperativa de crédito; 2021; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-graduação em Ciência da Informação - PPGCI) - Universidade Federal do Pará, ; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

Tiffany Vitoria Menezes Da Rocha

Trabalho de Conclusão de Curso; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Administração) - Universidade Federal do Pará; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

Valquiria Ferreira Lacerda

Trabalho de Conclusão de Curso; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Administração) - Universidade Federal do Pará; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

Pedro Augusto Farias de Souza

Theobroma database; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistema de Informação) - Universidade Federal do Pará; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

José Maria Junior Lopes Perdigão

Trabalho de Conclusão de Curso; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistema de Informação) - Universidade Federal do Pará; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

Pedro Augusto Farias de Souza

TheobromaDB - Um banco de dados do genoma e transcriptoma de Theobroma; 2023; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará, Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

João Lucas Dantas Silva

Uma estratégia de mineração de genoma utilizando aprendizagem de máquina na predição de cluster de Genes biossintéticos; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

José Maria Junior Lopes Perdigão

Abordagens de Bioinformática para Caracterizar Genomas e Metagenomas com Foco em Cianobacterias; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

Wellington Silva Santos

Utilização de Técnicas de Aprendizado de Máquina para predição de genes biossintéticos; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

Rafael Jose Poznyakov de Andrade

ABORDAGENS DE BIOINFORMÁTICA PARA CARACTERIZAR GENOMAS DE CYLINDROSPERMOPSIS RACIBORSKII CENA 302 e CENA 303; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado e licenciatura em Ciência Biológicas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz da Universidade de São Paulo; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

Cássio de Jesus Faria

Anotação Funcional de diferentes isolados de Corynebacterium pseudotuberculosis; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Graduação em Farmácia) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

Laiane Alves Leao

Desenvolvimento de um software gerenciador de amostras de diversas linhagens de diferentes organismos; ; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu;

Produções bibliográficas

  • ALVES, RAFAEL MOYSÉS ; DE ABREU, VINICIUS A C ; OLIVEIRA, RAFAELY PANTOJA ; ALMEIDA, JOÃO VICTOR DOS ANJOS ; DE OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; SILVA, SAURA R ; PASCHOAL, ALEXANDRE R ; DE ALMEIDA, SINTIA S ; DE SOUZA, PEDRO A F ; FERRO, JESUS A ; MIRANDA, VITOR F O ; FIGUEIRA, ANTONIO ; DOMINGUES, DOUGLAS S ; VARANI, ALESSANDRO M . Genomic decoding of Theobroma grandiflorum (cupuassu) at chromosomal scale: evolutionary insights for horticultural innovation. GigaScience , v. 13, p. 1-19, 2024.

  • DE MATOS, JÉSSICA PEREIRA ; RIBEIRO, DILSON FAGUNDES ; DA SILVA, ANA KARLA ; DE PAULA, CAMILA HENRIQUES ; CORDEIRO, ISABELLA FERREIRA ; LEMES, CAMILA GRACYELLE DE CARVALHO ; SANCHEZ, ANGÉLICA BIANCHINI ; ROCHA, LORRANA CACHUITE MENDES ; GARCIA, CAMILA CARRIÃO MACHADO ; ALMEIDA, NALVO F. ; ALVES, RAFAEL MOYSES ; DE ABREU, VINICIUS A. C. ; VARANI, ALESSANDRO M. ; MOREIRA, LEANDRO MARCIO . Diversity and potential functional role of phyllosphere-associated actinomycetota isolated from cupuassu (Theobroma grandiflorum) leaves: implications for ecosystem dynamics and plant defense strategies. MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS , v. 299, p. 1-21, 2024.

  • DE ABREU, VINICIUS A.C. ; MOYSÉS ALVES, RAFAEL ; SILVA, SAURA R. ; FERRO, JESUS A. ; DOMINGUES, DOUGLAS S. ; MIRANDA, VITOR F.O. ; VARANI, ALESSANDRO M. . Comparative analyses of Theobroma cacao and T. grandiflorum mitogenomes reveal conserved gene content embedded within complex and plastic structures. GENE , v. 849, p. 146904, 2023.

  • LABBÉ, FRÉDÉRIC ; ABDELADHIM, MAHA ; ABRUDAN, JENICA ; ARAKI, ALEJANDRA SAORI ; ARAUJO, RICARDO N. ; ARENSBURGER, PETER ; BENOIT, JOSHUA B. ; BRAZIL, REGINALDO PECANHA ; BRUNO, RAFAELA V. ; BUENO DA SILVA RIVAS, GUSTAVO ; CARVALHO DE ABREU, VINICIUS ; CHARAMIS, JASON ; COUTINHO-ABREU, ILIANO V. ; DA COSTA-LATGÉ, SAMARA G. ; DARBY, ALISTAIR ; DILLON, VIV M. ; EMRICH, SCOTT J. ; FERNANDEZ-MEDINA, DANIELA ; FIGUEIREDO GONTIJO, NELDER ; FLANLEY, CATHERINE M. ; et.al . Genomic analysis of two phlebotomine sand fly vectors of Leishmania from the New and Old World. PLoS Neglected Tropical Diseases , v. 17, p. e0010862, 2023.

  • ROCHA, T. S. ; SOUZA, A. F. ; COSTA, H. S. ; FRANCES, R. S. K. ; ALMEIDA, S. S. ; de Abreu, V. A. C. . Multidimensional Visualization For Multi-Omics Data Analysis. REVISTA FISIO&TERAPIA , v. 27, p. 1-29, 2023.

  • DE ABREU, VINICIUS A. C. ; PERDIGÃO, JOSÉ ; ALMEIDA, SINTIA . Metagenomic Approaches to Analyze Antimicrobial Resistance: An Overview. Frontiers in Genetics , v. 11, p. 1, 2021.

  • POPIN, RAFAEL VICENTINI ; DELBAJE, ENDREWS ; ABREU, VINICIUS AUGUSTO CARVALHO DE ; RIGONATO, JANAINA ; DÖRR, FELIPE AUGUSTO ; PINTO, ERNANI ; SIVONEN, KAARINA ; FIORE, MARLI FATIMA . Genomic and Metabolomic Analyses of Natural Products in Nodularia spumigena Isolated from a Shrimp Culture Pond. Toxins , v. 12, p. 141, 2020.

  • BRESSAN, EDUARDO ANDRADE ; CARVALHO, IGOR ARAÚJO SANTOS DE ; BORGES, MARIA TERESA MENDES RIBEIRO ; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO ; SILVA, EDSON FERREIRA DA ; GAZAFFI, RODRIGO ; SHIRASUNA, REGINA TOMOKO ; Abreu, Vinícius ; POPIN, RAFAEL V. ; FIGUEIRA, ANTONIO ; OLIVEIRA, GIANCARLO CONDE XAVIER . Assessment of Gene Flow to Wild Relatives and Nutritional Composition of Sugarcane in Brazil. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY , v. 8, p. 1-9, 2020.

  • Abreu, Vinicius A. C. ; POPIN, RAFAEL V. ; ALVARENGA, DANILLO O. ; SCHAKER, PATRICIA D. C. ; HOFF-RISSETI, CAROLINE ; VARANI, ALESSANDRO M. ; FIORE, MARLI F. . Genomic and Genotypic Characterization of Cylindrospermopsis raciborskii: Toward an Intraspecific Phylogenetic Evaluation by Comparative Genomics. Frontiers in Microbiology , v. 9, p. 1-12, 2018.

  • ALMEIDA, SINTIA ; SOUSA, CASSIANA ; ABREU, V. A. C. ; DINIZ, CARLOS ; DORNELES, ELAINE M. S. ; Lage, Andrey P. ; Barh, Debmalya ; AZEVEDO, V. . Exploration of Nitrate Reductase Metabolic Pathway in Corynebacterium pseudotuberculosis. International Journal of Genomics , v. 2017, p. 1-12, 2017.

  • ALMEIDA, SINTIA ; DORNELES, ELAINE M. S. ; DINIZ, CARLOS ; Abreu, Vinícius ; SOUSA, CASSIANA ; ALVES, JORIANNE ; Carneiro, Adriana ; BAGANO, PRISCILLA ; SPIER, SHARON ; BARH, DEBMALYA ; LAGE, ANDREY P. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; Azevedo, Vasco . Quadruplex PCR assay for identification of Corynebacterium pseudotuberculosis differentiating biovar Ovis and Equi. BMC Veterinary Research , v. 13, p. '-8, 2017.

  • POPIN, RAFAEL VICENTINI ; RIGONATO, JANAINA ; ABREU, VINICIUS AUGUSTO CARVALHO ; ANDREOTE, ANA PAULA DINI ; SILVEIRA, SAVÊNIA BONOTO ; ODEBRECHT, CLARISSE ; FIORE, MARLI FATIMA . Draft Genome Assembly of the Bloom-Forming Cyanobacterium Strain CENA596 in Shrimp Production Ponds. Genome Announcements , v. 4, p. e00466-16, 2016.

  • Abreu, Vinicius A. C. ; ALMEIDA, SINTIA ; TIWARI, SANDEEP ; HASSAN, SYED SHAH ; MARIANO, DIEGO ; Silva, Artur ; Baumbach, Jan ; Azevedo, Vasco ; RÖTTGER, RICHARD . CMRegNet-An interspecies reference database for corynebacterial and mycobacterial regulatory networks. BMC Genomics , v. 16, p. 452, 2015.

  • Pacheco, Luis G. C. ; Mattos-Guaraldi, Ana L. ; SANTOS, CAROLINA S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; GUIMARÃES, LUIS C. ; Abreu, Vinícius ; PEREIRA, FELIPE L. ; Soares, Siomar C. ; Dorella, Fernanda A. ; CARVALHO, ALEX F. ; LEAL, CARLOS G. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; RAMOS, JULIANA N. ; VIEIRA, VERONICA V. ; FARFOUR, ERIC ; GUISO, NICOLE ; Hirata, Raphael ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J. ; et.al . Draft Genome Sequences of Two Species of -Difficult-to-Identify- Human-Pathogenic Corynebacteria: Implications for Better Identification Tests. Journal of Genomics , v. 3, p. 82-84, 2015.

  • OLIVEIRA, L. C. ; SARAIVA, T. D. L. ; SOARES, S. C. ; RAMOS, R. T. J. ; SA, P. H. C. G. ; Carneiro, A. R. ; MIRANDA, F. ; FREIRE, M. ; RENAN, W. ; JUNIOR, A. F. O. ; SANTOS, A. R. ; PINTO, A. C. ; SOUZA, B. M. ; CASTRO, C. P. ; Diniz, C. A. A. ; ROCHA, C. S. ; Mariano, D. C. B. ; DE AGUIAR, E. L. ; FOLADOR, E. L. ; ABREU, V. A. C. ; et.al . Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118, a GABA-Producing Strain. Genome Announcements , v. 2, p. e00980-14-e00980-14, 2014.

  • Hassan, S. S. ; Sandeep Tiwari ; GUIMARÃES, L. C. ; JAMAL, S. B. ; FOLADOR, E. L. ; SHARMA, N. B. ; SOARES, S. C. ; ALMEIDA, S. S. ; Amjad Ali ; POVOA, F. D. ; ABREU, V. A. C. ; JAIN, N. ; BHATTACHARYA, A. ; JUNEJA, L. ; MIYOSHI, A. ; SILVA, A. ; Barh, Debmalya ; TURJANSKI, A. G. ; AZEVEDO, V. ; FERREIRA, R. S. ; et.al . Proteome scale comparative modeling for conserved drug and vaccine targets identification in Corynebacterium pseudotuberculosis. BMC Genomics , v. 15, p. S3, 2014.

  • TIWARI, SANDEEP ; DA COSTA, MARCÍLIA PINHEIRO ; ALMEIDA, SINTIA ; HASSAN, SYED SHAH ; JAMAL, SYED BABAR ; OLIVEIRA, ALBERTO ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; ROCHA, FLAVIA ; DE ABREU, VINÍCIUS AUGUSTO CARVALHO ; DORELLA, FERNANDA ; HIRATA, RAFAEL ; DE OLIVEIRA, DIANA MAGALHAES ; DA SILVA TEIXEIRA, MARIA FÁTIMA ; Silva, Artur ; BARH, DEBMALYA ; Azevedo, Vasco . C. pseudotuberculosis Phop confers virulence and may be targeted by natural compounds. Integrative Biology: a new journal of quantitative biosciences from nano to macro , v. 1, p. 1-1, 2014.

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Outras produções

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Soares, Siomar C. ; ABREU, V. A. C. ; RAMOS, R. T. J ; CERDEIRA, L. T. ; SILVA, A. ; Baumbach, Jan ; Trost, Eva ; Tauch, Andreas ; MYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . PIPS: Pathogenicity Island Prediction Software. 2012.

ABREU, V. A. C. . Cyanobacteria genome assembling. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

POPIN, RAFAEL VICENTINI ; RIGONATO, JANAINA ; ABREU, VINICIUS ; ANDREOTE, ANA PAULA DINI ; SILVEIRA, SAVÊNIA BONOTO ; ODEBRECHT, C. ; FIORE, MARLI FATIMA . Nodularia spumigena. 2016. (Montagem de Genoma bacteriano).

Pacheco, LGC ; Mattos-Guaraldi, Ana L. ; SANTOS, CAROLINA S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; GUIMARÃES, LUIS C. ; ABREU, VINICIUS ; PEREIRA, FELIPE L. ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; Dorella, F. A. ; CARVALHO, A. F. ; LEAL, CARLOS G. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; RAMOS, JULIANA N. ; VIEIRA, VERONICA V. ; FARFOUR, ERIC ; GUISO, NICOLE ; HIRATA, RAFAEL ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel ; et.al . Corynebacterium xerosis ATCC 373. 2015. (Montagem de Genoma bacteriano).

PACHECO, L. G. C. ; Mattos-Guaraldi, AL ; SANTOS, CAROLINA S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Guimaraes, L. C. ; ABREU, VINICIUS ; PEREIRA, FELIPE L. ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; DORELLA, FERNANDA ; CARVALHO, ALEX F. ; LEAL, CARLOS G. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; RAMOS, JULIANA N. ; VIEIRA, VERONICA V. ; FARFOUR, ERIC ; GUISO, NICOLE ; Hirata, Raphael ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel ; et.al . Corynebacterium minutissimum 1941. 2015. (Montagem de Genoma bacteriano).

Ruiz, Jerônimo C. ; D'AFONSECA, V. ; Artur Luiz da Costa da Silva ; Ali, Amjad ; Pinto, Anne C. ; Santos, Anderson ; Rocha, A. A. C. M. ; Lopes, Débora O. ; Dorella, F. A. ; Pacheco, LGC ; ALMEIDA, SINTIA ; LUIZ DE PAULA CASTRO, THIAGO ; ABREU, VINICIUS ; Trost, E. ; Baumbach, Jan ; Schneider, ; McCulloch, John ; Cerdeira, Louise ; Ramos, Rommel ; Zerlotini, Adhemar ; et.al . Corynebacterium pseudotuberculosis C231. 2011. (Montagem de Genoma bacteriano).

Projetos de pesquisa

  • 2020 - Atual

    Genoma e transcriptoma do Theobroma grandiflorum (cupuaçu): uma abordagem comparativa, evolutiva e funcional., Descrição: O cupuaçuzeiro (Theobroma grandiflorum), membro da família Malvaceae, é uma das espécie mais populares da Amazônia brasileira. A polpa dos frutos do cupuaçu é muito apreciada para preparo de sucos, doces, licores, geleias, sorvetes e outros produtos alimentícios. As sementes são utilizadas na fabricação de chocolate em pó, tabletes (cupulate) e na indústria de cosméticos. Apesar dos produtores da fruta aproveitarem cada vez mais de seus recursos, incentivando uma cadeia produtiva na região Amazônica, a cultura do cupuaçu ainda é pouco explorada e seus produtos poucos conhecidos em abrangência nacional. Em adição, diversas doenças afetam a cultura, dentre elas a vassoura-de-bruxa, ocasionada pelo fungo Moniliophthora perniciosa, causando grandes perdas de produtividade. Nesse sentido, programas de melhoramento já alcançaram genótipos resistentes e mais produtivos, porém, a base molecular de resistência a este patógeno, bem como a diversidade genômica desta espécie ainda é pouco conhecida. Por exemplo, embora o cupuaçu pertença ao mesmo gênero do cacaueiro (Theobroma cacao), espécie da qual se obtém o chocolate, e que foi amplamente estudada sob o ponto de vista molecular, genômico e funcional no decorrer da última década; ainda muito pouco se é conhecido a respeito do genoma do cupuaçu, que apresenta 2n=20 e tamanho estimado em 448-Mb. Desta forma, o cupuaçu surge como um excelente candidato para estudos moleculares e de genômica comparativa, principalmente frente a sua espécie congênere, o cacaueiro. Esta proposta de pesquisa pretende realizar o sequenciamento genômico e transcriptômico por plataformas de alto rendimento de dois genótipos de Theobroma grandiflorum e compará-los frente aos genomas sequenciados da espécie congênere T. cacao (genótipos Criollo e Matina) disponível em bases de dados públicas. O objetivo principal deste projeto é de gerar novos conhecimentos sobre a organização, evolução e funções de componentes do genoma de T. grandiflorum, desvendando a evolução de famílias gênicas relacionadas com a composição química dos frutos e mecanismos relacionados com a interação planta-patógeno, desta forma gerando novos subsídios para a exploração sustentável da biodiversidade da Amazônia.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Coordenador / Sintia Silva de Almeida - Integrante / Alessandro de Mello Varan - Integrante / Rafael Moyses Alves - Integrante.

  • 2019 - Atual

    Monitoramento do estado nutricional da população brasileira atendida na atenção primária à saúde: representatividade, cobertura, confiabilidade e qualidade dos dados obtidos por meio do SISVAN, Descrição: CHAMADA MS-SCTIE-DECIT / CNPQ Nº 26/2019 ? PESQUISAS EM ALIMENTAÇÃO E NUTRIÇÃO ? Eixo 2 ? Pesquisa multitemáticas em alimentação em nutrição. Processo 442642/2019-9. Este projeto objetiva avaliar a qualidade dos dados inseridos no Sistema de Vigilância Alimentar e Nutricional (SISVAN) considerando todas as fases do curso da vida e estimar o número mínimo de pessoas a serem avaliadas no SISVAN para que as prevalências dos desvios nutricionais sejam representativas da população atendida na Atenção Primária à Saúde, e dos municípios, estados e Distrito Federal, macrorregião e Brasil... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Coordenador / Daniela Lopes Gomes - Integrante / Terezinha Ferreira de Oliveira - Integrante / Marinalva Cardoso Maciel - Integrante / Thiago Poleto - Integrante / Andréa das Graças Ferreira Frazão - Integrante / Naiza Nayla Bandeira de Sá - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

  • 2015 - Atual

    Genômica Comparativa E Pangenômica De Diferentes Espécies Do Gênero Corynebacterium, Descrição: Tecnologias de sequenciamento de nova geração têm o potencial para decifrar a diversidade genômica a um custo moderado e elevada confiabilidade e tem sido aplicados com sucesso no sequenciamento de genomas do gênero Corynebacterium. No gênero, destacam-se os microrganismos C. diphtheriae e C. jeikeium, os agentes causadores da difteria e de infecções nosocomiais, respectivamente; e também C. glutamicum, altamente utilizada na produção de aminoácidos, como L-aspartato e L-lisina; e C. pseudotuberculosis, patógeno de interesse veterinário. Assim, o presente trabalho reúne esforços para caracterizar o genoma de diferentes espécies de Corynebacterium. Essa abordagem pode auxiliar na realização de inferências quanto à epidemiologia e estilo de vida do gênero, bem como entender a interação patógeno-hospedeiro. Além disso, a pangenômica permitirá a caracterização da arquitetura genômica e estabelecimento do genoma central do gênero.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sintia Silva de Almeida - Coordenador / Hassan, S. S. - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Sandeep Tiwari - Integrante / LEANDRO DE JESUS BENEVIDES - Integrante / Thiago J Sousa - Integrante.

  • 2014 - Atual

    Desenvolvimento de abordagens de bioinformática para caracterizar genomas de Cianobactéria de biomas brasileiros / Biodiversity of cyanobacteria and their bioactive compounds from under-explored Brazilian habitats, Descrição: Cyanobacteria produce potent toxins but are also prolific source of bioactive compounds (e.g. drugs) and enzymes. In this joint project Finnish and Brazilian teams will investigate the biodiversity of cyanobacteria in diverse habitats of Brazil. Strains will be isolated and screened for bioactive compounds and corresponding genes and biosynthetic enzymes new to science. The structures of the most promising compounds will be solved and their production yields improved by gene technology.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (4) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Janaina Rigonato - Integrante / FIORE, MARLI FATIMA - Coordenador / Augusto Etchegaray - Integrante / David P. Fewer - Integrante / Jouni Jokela - Integrante / Kaarina Sivonen - Integrante / Ernani Pinto - Integrante / Alessandro de Mello Varan - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2013 - 2014

    Caracterização das vias de utilização de fontes de carbono e nitrogênio de 15 linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Sintia Silva de Almeida em 16/04/2014., Descrição: Tecnologias de sequenciamento de nova geração têm o potencial para decifrar a diversidade genômica a um custo moderado. Corynebacterium pseudotuberculosis, é parasita intracelular facultativo, responsável por causar enfermidades infecto-contagiosas de caráter crônico. A doença se apresenta de diferentes formas, de acordo com o hospedeiro acometido. Linhagens de C. pseudotuberculosis mostram alta adaptabilidade para diversos nichos ecológicos e são capazes de crescer em algumas fontes carbono, bem como existem linhagens capazes de realizar a redução de nitrato. O objetivo deste trabalho será descobrir as bases genéticas e as características específicas de cada linhagem relacionadas a habilidade da bactéria utilizar fontes específicas de carbono e nitrogênio. Serão analisados 15 genomas completos de C. pseudotuberculosis, para identificação das vias de degradação de carboidratos e redução de nitrato. Genes constituintes destas vias serão identificados em bancos de dados como KEGG, serão construídos clusters de proteínas ortólogas para comparação entre todos os genomas. Validação experimental será realizada por fenotipagem, e validação da função das vias de redução de nitrato existentes será realizada por interrupção gênica e confirmada por PCR. Com este trabalho inédito para a espécie nós pretendemos utilizar genômica comparativa e validação experimental para tentar entender e caracterizar vias metabólicas ainda não conhecidas em C. pseudotuberculosis... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Sintia Silva de Almeida - Coordenador / CARLOS DINIZ - Integrante.

  • 2013 - Atual

    Biologia Computacional-REDE DE COOPERAÇÃO ACADÊMICA PARA O ESTUDO E DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS PARA A GENÔMICA ESTRUTURAL E FUNCIONAL, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Vasco Ariston de Carvalho Azevedo em 20/01/2017., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (4) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Coordenador / Jose Miguel Ortega - Integrante / Adriana Ribeiro Carneiro - Integrante / Sintia Silva de Almeida - Integrante / Siomar Castro Soares - Integrante / Sandeep Tiwari - Integrante / Artur Luiz Da Costa da Silva - Integrante / Rafael Baraúna - Integrante / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Integrante / Leticia de Oliveria Castro - Integrante / Lucas Breicher - Integrante / Romel Thiago Juca Ramos - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

  • 2007 - 2010

    PRODIS: Um Sistema de Integração de Dados de Proteômica, Descrição: Integração dos resultados de análises genômica, transcriptômica e proteômica para permitir a identificação e caracterização de proteínas do parasita Schistosoma mansoni e a criação de um banco de dados para armazenar dados de proteômica e transcriptômica de S. mansoni bem como de outros organismos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Herbert Rausch Fernandes - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante / Celina do Val - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2006 - 2010

    Sequenciamento do genoma de Corynebacterium pseudotuberculosis, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Vasco Ariston de Carvalho Azevedo em 15/02/2013., Descrição: Corynebacterium pseudotuberculosis biovar ovis 1002 - The genus Corynebacterium belongs to a suprageneric group of actinomycetes, which also includes the genera Mycobacterium, Nocardia and Rhodococcus. These gram-positive bacteria (termed the CMN group) constitute a very heterogeneous group; however the various species share particular characteristics, such as: (i) mycolic acid-containing cell walls; and (ii) high G+C content (50-72%). The genomes of several species of this group have already been completely sequenced; this fact reflects the considerable medical, veterinary and biotechnological importance of these organisms. C. pseudotuberculosis, an important animal pathogen, is the etiological agent of a disease that is commonly called caseous lymphadenitis (CLA) or cheesy gland. This disease is found in all the world s major sheep and goat production areas, causing significant economic losses worldwide, mainly due to the reduction of wool, meat and milk yields, decreased reproductive efficiencies of affected animals and condemnation of carcasses and skins in abattoirs. In some cases, the infection produces few obvious clinical signs in the animal, remaining unrecognized until a post-mortem examination has been carried out and, making it difficult to obtain definitive data about prevalence of the disease. Noteworthy, despite its importance for animal health, this bacterium is poorly characterized. Only three virulence factors have been identified in C. pseudotuberculosis: (i) cell wall toxic lipids, related to abscess formation; (ii) phospholipase D, a sphingomyelin-degrading exotoxin; and (iii) 40-kDa serine protease, an immunogenic protein. Furthermore, few genes involved on the mechanisms employed by C.pseudotuberculosis during infection are currently known. Once its complete genome sequence becomes available, it will be possible to better understand the molecular and genetic basis of virulence of this bacterium. RECURSOS: R$1.900.000,00.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Coordenador / Sintia Silva de Almeida - Integrante / Santos, Anderson R. - Integrante / Siomar Castro Soares - Integrante., Financiador(es): Fundação de Apoio à Educação e Desenvolvimento Tecnológico de MG - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

Projetos de desenvolvimento

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação. . , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação. . , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação. . , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante.Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

  • 2008 - 2014

    SIGLA-Prot: Um Sistema Integrado de Gerência de Laboratórios, Descrição: O SIGLA é um projeto que visa a construção de um sistema integrado de gerência de laboratórios, baseado nos conceitos de Workflow e Laboratory Information Management System (LIMS). Visando a qualidade dos dados e da informação.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vinicius Augusto Carvalho de Abreu - Integrante / Sérgio Vale Aguiar Campos - Coordenador / Alexandre Melo - Integrante / Alessandra Conceicao Faria Aguiar Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa - Bolsa.

Prêmios

2016

International Workshopon Cyanobacterial NaturalProducts, Center for Nuclear Energy in Agriculture.

2011

Who Has Successfully Completed - Public Speaking Skills, Western Town College.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Universidade Federal do Pará, Instituto de CIências Exatas e Naturais - ICEN. , Rua Augusto Corrêa - até 937 - lado ímpar, Guamá, 66075110 - Belém, PA - Brasil, Telefone: (91) 32017103, URL da Homepage:

Experiência profissional

2021 - Atual

Universidade Federal do Pará

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Diretor de Faculdade, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2019 - Atual

Universidade Federal do Pará

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Prof. Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 04/2021

    Extensão universitária , Instituto de CIências Exatas e Naturais - ICEN.,Atividade de extensão realizada, Arquivo do Observatório Magnético de Tatuoca: digitalização e computação de dados de registro físico..

  • 01/2021

    Ensino, Ciência da Computação, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática

  • 06/2020

    Ensino, Ciência da Informação, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Tópicos Especiais - Tecnologias de informação e comunicação (TIC)

  • 01/2020

    Direção e administração, Instituto de CIências Exatas e Naturais - ICEN, Faculdade de Computação.,Cargo ou função, Vice-diretor.

  • 01/2019

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de CIências Exatas e Naturais - ICEN.,Linhas de pesquisa

  • 01/2019

    Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de CIências Exatas e Naturais - ICEN, Faculdade de Computação.,Linhas de pesquisa

  • 01/2019

    Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Educação Ambiental, Introdução a Ciência dos Computadores - ICC, Matemática Concreta, Programação de Computadores, Informática e Sociedade, Introdução à Bioinformática

2015 - 2018

Centro de Energia Nuclear na Agricultura

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 11/2015

    Pesquisa e desenvolvimento, Comissão de Pesquisa.,Linhas de pesquisa

  • 09/2015

    Ensino, Ciências (Energia Nuclear na Agricultura), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, CEN-5789 - Genômica e Bioinformática

  • 06/2016 - 06/2016

    Treinamentos ministrados , Divisão de Produtividade Agroindustrial e Alimentos - DVPROD.,Treinamentos ministrados, 1st International Workshop on Cyanobacterial Natural Products, Hands on computer: Cyanobacteria genome assembling

  • 06/2016 - 06/2016

    Outras atividades técnico-científicas , Divisão de Produtividade Agroindustrial e Alimentos - DVPROD, Divisão de Produtividade Agroindustrial e Alimentos - DVPROD.,Atividade realizada, Poster Evaluator in the 1st InternationalWorkshoponCyanobacterialNaturalProducts.

2014 - 2015

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós doutorado, Carga horária: 40

2010 - 2014

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Discente, Enquadramento Funcional: Doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2008 - 2010

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Bolsista DTI do Projeto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Desenvolvimento no projeto SIGLA; Desenvolvimento no projeto PRODIS; Demais atividades de pesquisas relacionada a bioinformática.

Atividades

  • 09/2012 - 09/2012

    Ensino, Bioinformática, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Palestra: Inter-species gene regulatory network transfer through evolutionary conservation between multiple species

2011 - 2012

Max-Planck-Institut für Informatik

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado sanduíche - PDSE/CAPES, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2010 - 2010

Fundação Ezequiel Dias

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Bolsista DTI Nível 4, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Desenvolvimento de sistema para o núcleo de Bioinformática da FUNED.

2005 - 2005

Processamento de Dados do Estado do Pará

Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20

Outras informações:
Manutenção e Administração do Sistema Lótus Notes. Inclusão, Edição e Exclusão de Usuários, Servidores e Serviços.

2007 - 2008

Sol Informática

Vínculo: Funcionário, Enquadramento Funcional: Técnico, Carga horária: 44

Outras informações:
Suporte técnico a micros, servidores, usuários e ao site da empresa.

2005 - 2006

TIM Celular S/A

Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 36

Outras informações:
Desenvolvimento de Macros em VB para ferramentas de apoio a vendas e contas de parceiros da TIM. Operação da base de dados para estudos comparativo do mercado consumidor e concorrência.