Denys Ewerton da Silva Santos

Engenheiro Químico (2016) e Mestre e Doutor em Química (2017, 2021) pela Universidade Federal de Pernambuco, UFPE. Tem experiência na área de Química, com ênfase em Química Computacional. Trabalhou desde 2012 em atividades relacionadas a simulação de peptídeos antimicrobianos e sua interação com membranas bacterianas (P. aeruginosa), simulação de Polymer Brushes e sua interação com moléculas de DNA para entendimento do processo de DNA delivery e desenvolvimento de pacotes computacionais de análise de superfícies biológica.Atualmente Denys é o coordenador do Laboratório de Modelagem Molecular e Métodos Computacionais Avançados, onde dirige pesquisas na área de Química Teórica aplicada a processos de Drug Design, Drug Delivery, desenvolvimento de algoritmos computacionais e simulações de interfaces químicas biológicas, orgânicas e inorgânicas.

Informações coletadas do Lattes em 04/08/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Química

2017 - 2021

Universidade Federal de Pernambuco
Título: SUAVE: UMA FERRAMENTA PARA ANÁLISE DE PROPRIEDADES DEPENDENTES DE CURVATURA EM INTERFACES QUÍMICAS
, Ano de obtenção: 2021. Thereza Amélia Soares da Silva. Coorientador: Kaline Coutinho. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Membrana Lipídica; Interfaces químicas; Simulação computacional; Propriedades estruturais; Ferramentas de análise; Curvatura. Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Quimica Computacional.

Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química

2016 - 2017

Universidade Federal de Pernambuco
Título: Simulações Atomísticas da Polimixina B em Membrana Externas de Bactérias Gram- Negativas Susceptíveis ou Resistentes: Primeiros Estágios do Mecanismo de Ação, Ano de Obtenção: 2017
Thereza Amélia Soares da Silva.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: P. aeruginosa; Polimixina.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Teórica. Setores de atividade: Outras atividades profissionais, científicas e técnicas.

Graduação em Engenharia Química

2011 - 2016

Universidade Federal de Pernambuco
Título: DESENVOLVIMENTO DE MODELOS ATOMÍSTICOS DE POLYMER BRUSHES E SUA DINÂMICA MOLECULAR
Orientador: Maria de Los Angeles Perez F. Palha
com Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Ensino Médio (2º grau)

2008 - 2010

Escola Monsenhor Jonas Menezes e Silva

Formação complementar

2021 - 2021

Informações sobre produtos químicos: onde buscar e como interpretar?. (Carga horária: 2h). , Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil.

2020 - 2020

Data Science e Machine Learning na prática: introdução e aplicações na ind. (Carga horária: 12h). , Fundação Coordenação de Projetos, Pesquisas e Estudos Tecnológicos, COPPETEC, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Quimica Computacional.

Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Civil / Subárea: Métodos numéricos aplicados à engenharia.

Participação em eventos

47th Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society.Exploring the Mechanical Properties of Soft Materials: Beyond Lipid Membrane Composition. 2023. (Encontro).

V Congresso Regional da SBBf.SUAVE: UMA METODOLOGIA COMPUTACIONAL PARA AVALIAÇÃO DE INTERFACES. 2019. (Encontro).

XLIV Congresso Anual da Sociedade Brasileira de Biofísica. Gaussian Curvature and Elastic Energy Variations of Gram- Negative P. aeruginosa Susceptible and Resistant Chemotypes in Presence of Antimicrobial Peptide Polymyxin B. 2019. (Congresso).

Geometry of Soft Matter.SuAVE: a computational tool for the assessment of curved surfaces. 2018. (Simpósio).

V Encontro Anual de BIOFÍSICA.SUAVE: UMA FERRAMENTA PARA AVALIAÇÃO DE PROPRIEDADES DEPENDENTES DE CURVATURA EM SUPERFÍCIES GENÉRICAS. 2018. (Encontro).

XLIII Congress of the Brazilian Biophysical Society. SuAVE: a new computational perspective for analyzing biological systems. 2018. (Congresso).

6º Stint Workshop on Cell-Biomaterials Interface.THE VALIDATION OF POLYMER BRUSH MODELS: ACCOUNTING FOR  NEW VARIABLES. 2017. (Encontro).

III AsBioSim.SuAVE: an alternative for assessment of curved surfaces. 2017. (Oficina).

XIX Simpósio Brasileiro de Química Teórica.SuAVE: a computational tool for the assessment of curved surfaces. 2017. (Simpósio).

II AsBioSim.Polymixin B and its mechanism of action over different membrane chemotypes. 2016. (Oficina).

VII SBQ Nordeste. Modelagem computacional e estudo da Dinâmica Molecular de sistemas de Polymer Brushes frente a diferentes ambientes químicos. 2016. (Congresso).

4º Stint Workshop on Cell-Biomaterials Interface.MOLECULAR DYNAMICS OF ANTIMICROBIAL PEPTIDES AND THEIR ACTION OVER GRAM-NEGATIVE BACTERIAL OUTER MEMBRANES. 2015. (Encontro).

5º Stint Workshop on Cell-Biomaterials Interface.POLYMER DYNAMICS: THE DEVELOPMENT OF MOLECULAR MODELS. 2015. (Encontro).

43º Reunião anual da SBBq. Molecular Dynamics Simulations of Polymixin B, E and M and its Binding Mechanism to the outer membrane of Pseudomona aeruginosa. 2014. (Congresso).

XXII CONIC (Congresso de Iniciação Científica). Dinâmica estrutural das variantes de polimixina e seu mecanismo de ação sobre membranas externas de P. Aeruginosa. 2014. (Congresso).

3º Stint Workshop on Cell-Biomaterials Interface. 2013. (Encontro).

III reunião geral do INCT-INAMI.Simulações Computacionais da Ação de Variantes da Polimixina Sobre a Membrana Externa de Bactérias Gram-Negativa. 2013. (Encontro).

Participação em bancas

Aluno: Eduardo Victor Santana dos Anjos

PAVAO, A. C.; TABOSA, J. W. R.;SANTOS, D. E. S.. Mecânica Quântica do Confinamento em Curvas Espirais: Modo zero e Transições Eletrônicas de Polienos Lineares. 2025. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Júlio Cesar de Melo Simões

LONGO, R. L.;SANTOS, D. E. S.; VIANA, I. F. T.; LINS, R. D.. Caracterização termodinâmica da resposta imune humoral contra a proteína do envelope de DENV. 2025. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Emerson Goncalves Moreira

LINS, R. D.; COELHO, D. F.;SANTOS, DENYS E. S.; LONGO, R. L.; CRUZ, C. H. B.; MIYAJIMA, F.; PASCUTTI, P. G.. Explorando o papel das interações proteína-proteína para vigilância e inibição do SARS-CoV-2. 2024. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química - Universidade Federal de Pernambuco) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Jéssica Itaiane Ramos de Souza

SANTOS, D. E. S.; LONGO, R. L.; BARBOSA, M. C. B.; APOLINARIO, S. W. S.; LIMA, F. S.. Propriedades Topológicas Das Redes De Ligações De Hidrogênio Na Água Em Diferentes Condições. 2023. Tese (Doutorado em Ciência de Materiais) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: SIMONE DA SILVA SIMÕES

FALCAO, E. H. L.; RIBEIRO, A. S.; FECHINE, G. J. M.;SANTOS, D. E. S.. Interação Não-Covalente Entre Filmes De Grafeno E Derivados Do 1,3,4-Oxadiazol. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Química - Universidade Federal de Pernambuco) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Gisela Camila Paz Sales

SANTOS, D. E. S.; NEVES, J. L.. SÍNTESE DE HIDROGÉIS: uma ferramenta para a elucidação estrutural via RMN.. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Iara Alves Freire

SANTOS, D. E. S.; LIMA FILHO, N. M. D.. Avaliação do reuso de um catalisador desativado de reforma de metano na remoção de corante em efluente têxtil. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia Química) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Vinícius Firmino dos Santos

SANTOS, DENYS E.S.; SOARES, THEREZA A.; LINS, ROBERTO D.; FERRAZ, M. V.. Simulações Computacionais da Adsorção de Nucleotídeos em Escovas Poliméricas de Poli(Metacrilato de Dimetilaminoetila). 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Larissa Dias da Silva

SANTOS, DENYS E. S.; SOARES, THEREZA A.; FERRAZ, M. V.; LINS, ROBERTO D.. Parametrização de inibidores da Enzima 3-Hidróxi-Quinurenina Transaminase. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco.

SANTOS, DENYS E. S.. 27ª Jornada de Iniciação Científica FACEPE. 2023. Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco.

Orientou

Maria Isabel dos Santos Cavalcanti

Explorando a toxicidade da Fumonisina B1: Uma Abordagem Integrada de Estudos Computacionais para Entendimento de sua Hepatotoxicidade, Estresse Oxidativo, Atividade Hemolítica e Desestabilização de Membranas Lipídicas; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Sebastião Luiz da Silva Neto

Explorando Mecanismos de Remoção de Placas Beta-Amilóides: Um Passo Avançado na Luta Contra o Alzheimer; Início: 2024; Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Stella Nassif Ramadan Oliveira

Efeito do Estresse Oxidativo na Integridade das Membranas Lipídicas Cardíacas: Uma Análise Avançada com Modelos Coarse-Grain; Início: 2024; Iniciação científica (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal de Pernambuco; (Orientador);

Adriane Avací da Silva Brito

Design de novos antagonistas da enzima BACE1: Uma abordagem para combate da doença de Alzheimer; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco; (Orientador);

Giovanna Santos de Lima

Avaliação do stress oxidativo sobre proteínas e membrana celular vegetal; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Manuela Leal Nader

DESENVOLVIMENTO E APLICAÇÃO DE MODELO DE APRENDIZADO DE MÁQUINA NA IDENTIFICAÇÃO DE PROBLEMAS NO PROCESSO DE FERMENTAÇÃO ALCOÓLICA INDUSTRIAL A PARTIR DE DADOS EXPERIMENTAIS E TEÓRICOS; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Engenharia Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco; Orientador: Denys Ewerton da Silva Santos;

Vinícius Firmino dos Santos

Computational Simulations of the Nucleic Acid Capture by the Polymer Brush PDMAEMA; 2021; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Denys Ewerton da Silva Santos;

Larissa Dias da Silva

Design de novos antagonistas da enzima 3-Hidróxi-Quinurenina Transaminase de Aedes Aegypti; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Química) - Universidade Federal de Pernambuco, Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco; Orientador: Denys Ewerton da Silva Santos;

Maria Eduarda Gazal

Produto educativo audiovisual de curta duração com temática científica sobre a diferença entre ciência e pseudo-ciência; 2023; Iniciação Científica; (Graduando em Cinema e Audiovisual) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Denys Ewerton da Silva Santos;

Breno Soares Gazal

Modelos Atomísticos de Escovas Moleculares com Aplicações em Biomedicina; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia de Alimentos) - Universidade Federal de Pernambuco, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Denys Ewerton da Silva Santos;

Produções bibliográficas

  • NIETO, VINCENT ; CROWLEY, JACKSON ; SANTOS, DENYS ; MONTICELLI, LUCA . Molecular mechanism of lipid droplet biogenesis. BIOPHYSICAL JOURNAL , v. 123, p. 542a-543a, 2024.

  • SANTOS, DENYS E. S. ; DE NICOLA, ANTONIO ; DOS SANTOS, VINICIUS F. ; MILANO, GIUSEPPE ; SOARES, THEREZA A. . Exploring the Molecular Dynamics of a Lipid-A Vesicle at the Atom Level: Morphology and Permeation Mechanism. THE JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY. B (1997 : ONLINE) , v. 1, p. 1, 2023.

  • SANTOS, DENYS E. S. ; COUTINHO, KALINE ; SOARES, THEREZA A. . Surface Assessment Grid Evaluation (SuAVE) for Every Surface Curvature and Cavity Shape. Journal of Chemical Information and Modeling , v. 1, p. 1, 2022.

  • MESSIAS, ANDRESA ; SANTOS, DENYS E. S. ; PONTES, FREDERICO J. S. ; SOARES, THEREZA A. . The tug of war between Al 3+ and Na + for order-disorder transitions in lipid-A membranes. PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS , v. 23, p. 15127-15137, 2021.

  • DE NICOLA, ANTONIO ; SOARES, THEREZA A. ; SANTOS, DENYS E.S. ; BORE, SIGBJØRN LØLAND ; SEVINK, G.J. AGUR ; CASCELLA, MICHELE ; MILANO, GIUSEPPE . Aggregation of Lipid A variants: A hybrid particle-field model. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS , v. 00, p. 129570, 2020.

  • MESSIAS, A. ; SANTOS, DENYS E. S. ; PONTES, FREDERICO J. S. ; LIMA, F. S. ; SOARES, T. A. . Out of Sight, Out of Mind: The Effect of the Equilibration Protocol on the Structural Ensembles of Charged Glycolipid Bilayers. MOLECULES , v. 25, p. 5120, 2020.

  • RUSU, VICTOR H. ; SANTOS, DENYS E. S. ; POLETO, MARCELO D. ; GALHEIGO, MARCELO M. ; GOMES, ANTÔNIO T. A. ; VERLI, HUGO ; SOARES, THEREZA A. ; LINS, ROBERTO D. . Rotational Profiler: A Fast, Automated, and Interactive Server to Derive Torsional Dihedral Potentials for Classical Molecular Simulations. Journal of Chemical Information and Modeling , v. 1, p. 1, 2020.

  • CAPELETTI, LARISSA BRENTANO ; OLIVEIRA, JESSICA FERNANDA AFFONSO ; LOIOLA, LÍVIA MESQUITA DIAS ; GALDINO, FLÁVIA ELISA ; SILVA SANTOS, DENYS EWERTON ; SOARES, THEREZA AMÉLIA ; OLIVEIRA FREITAS, RAUL ; CARDOSO, MATEUS BORBA . Gram-Negative Bacteria Targeting Mediated by Carbohydrate-Carbohydrate Interactions Induced by Surface-Modified Nanoparticles. Advanced Functional Materials , v. 00, p. 1904216, 2019.

  • SANTOS, DENYS EWERTON DA SILVA ; LI, DANYANG ; RAMSTEDT, MADELEINE ; GAUTROT, JULIEN E. ; SOARES, THEREZA A. . Conformational Dynamics and Responsiveness of Weak and Strong Polyelectrolyte Brushes: Atomistic Simulations of PDMAEMA and PMETAC. LANGMUIR , v. 35, p. 5037-5049, 2019.

  • LIMA, MANOELA ; NADER, MANUELA ; SANTOS, DENYS ; SOARES, THEREZA . Compatibility of GROMOS-Derived Atomic Parameters for Lipopolysaccharide Membranes with the SPC/E Water Model and Alternative Long-Range Electrostatic Treatments Using Single Nonbonded Cutoff and Atom-Based Charge Schemes. JOURNAL OF THE BRAZILIAN CHEMICAL SOCIETY , v. 00, p. 1-12, 2019.

  • SANTOS, DENYS EWERTON DA SILVA ; PONTES, FREDERICO ; LINS, ROBERTO D. ; COUTINHO, KALINE ; SOARES, THEREZA A. . SuAVE: A Tool for Analyzing Curvature-Dependent Properties in Chemical Interfaces. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING (ONLINE) , v. 00, p. acs.jcim.9b00569, 2019.

  • SANTOS, DENYS E. S. ; POL-FACHIN, LAÉRCIO ; LINS, ROBERTO D. ; SOARES, THEREZA A. . Polymyxin Binding to the Bacterial Outer Membrane Reveals Cation Displacement and Increasing Membrane Curvature in Susceptible but Not in Resistant Lipopolysaccharide Chemotypes. Journal of Chemical Information and Modeling , v. 57, p. 2181-2193, 2017.

  • SANTOS, DENYS E. S. ; PONTES, FREDERICO J. S. ; KALINE, LINS ; SOARES, THEREZA A. . SUAVE: UMA METODOLOGIA COMPUTACIONAL PARA AVALIAÇÃO DE INTERFACES QUÍMICAS CURVADAS. In: Encontro Anual da biofisica 2019, 2019, Recife. Blucher Biophysics Proceedings. São Paulo: Editora Blucher, 2019. p. 1.

  • LIMA, MANOELA P. M. ; NADER, MANUELA ; SANTOS, DENYS E. S. ; SOARES, THEREZA A. . COMPATIBILIDADE DE PARÂMETROS DO CAMPO DE FORCA GROMOS PARA LIPOPOLISSACARÍDEO COM MODELOS DE AGUA SPC/E, RAIO DE CORTE SIMPLES PARA TERMOS NÃO-LIGADOS E CARGAS ATÔMICAS: PROPRIEDADES DINÂMICAS. In: Encontro Anual da biofisica 2019, 2019, Recife. Blucher Biophysics Proceedings. São Paulo: Editora Blucher, 2019. p. 148-150.

  • NADER, MANUELA ; LIMA, MANOELA P. M. ; SANTOS, DENYS E. S. ; SOARES, THEREZA A. . COMPATIBILIDADE DE PARÂMETROS DO CAMPO DE FORÇA GROMOS PARA LIPOPOLISSACARÍDEO COM MODELOS DE ÁGUA SPC/E, RAIO DE CORTE SIMPLES PARA TERMOS NÃO-LIGADOS E CARGAS ATÔMICAS: PROPRIEDADES ESTRUTURAIS. In: Encontro Anual da biofisica 2019, 2019, Recife. Blucher Biophysics Proceedings. São Paulo: Editora Blucher, 2019. p. 151.

  • SANTOS, VINICIUS FIRMINO DOS ; SANTOS, DENYS EWERTON DA SILVA ; SILVA, THEREZA AMÉLIA SOARES DA . SIMULAÇÕES COMPUTACIONAIS DO POLÍMERO METACRILATO DE DIMETILAMINOETILA (PDMAEMA) PARA CARREAMENTO DE ÁCIDOS NUCLÉICOS. In: Encontro Anual da biofisica 2019, 2019, Recife. Blucher Biophysics Proceedings, 2019. p. 198.

  • GAZAL, BRENO S. ; SANTOS, DENYS E. S. ; SOARES, THEREZA A. . DESENVOLVIMENTO DE MODELOS ATOMÍSTICOS PARA ESCOVAS MOLECULARES. In: Encontro Anual da biofisica 2019, 2019, Recife. Blucher Biophysics Proceedings. São Paulo: Editora Blucher, 2019. p. 159.

  • SANTOS, DENYS E. S. ; PONTES, FREDERICO J. S. ; COUTINHO, KALINE ; LINS, ROBERTO D. ; SOARES, THEREZA A. . SUAVE: UMA FERRAMENTA PARA AVALIAÇÃO DE PROPRIEDADES DEPENDENTES DE CURVATURA EM SUPERFÍCIES GENÉRICAS. In: Encontro Anual da Biofísica 2018, 2018, Pernambuco. Blucher Biophysics Proceedings. São Paulo: Editora Blucher, 2018. p. 35.

  • SILVA, LARISSA DIAS DA ; SANTOS, DENYS EWERTON DA SILVA ; ANJOS, JANAÍNA VERSIANI DOS ; SOARES, THEREZA AMÉLIA . NOVOS ANTAGONISTAS DA ENZIMA 3-HIDRÓXI-QUINURENINA TRANSAMINASE DE Aedes aegypti: SÍNTESE, ESTUDOS DE DOCKING MOLECULAR E ENSAIOS ENZIMÁTICOS. In: Encontro Anual da Biofísica 2018, 2018, Pernambuco. Blucher Biophysics Proceedings, 2018. p. 38.

  • SANTOS, DENYS ; PONTES, F. J. S. ; COUTINHO, KALINE ; LINS, R. D. ; SOARES, T. A. . SuAVE: a computational tool for the assessment of curved surfaces. In: XIX Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2017, Águas de Lindóia. XIX Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2017. v. 1. p. 1.

  • SANTOS, D. E. S. ; RUSSU, V. H. ; PONTES, F. J. S. ; DIAS, R. P. ; CUNHA, K. C. ; POL-FACHIN, L. ; SOARES, T. A. ; LINS, R. D. . Post-Processing Challenges in Simulations of Lipopolysaccharide Membranes and Aggregates. In: BRESCI - VIII Brasilian e-Science Workshop, 2014, Brasília. CSBC 2014. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação (SBC), 2014. p. 371-374.

  • PONTES, F. J. S. ; RUSSU, V. H. ; DIAS, R. P. ; HORA, G. A. C. ; SANTOS, D. E. S. ; FACHIN, L. P. ; LINS, R. D. ; SOARES, T. A. . Scalability of Molecular Dynamics Simulations of Lipopolysaccharide Membranes Using the GROMACS Software Package on Different Architectures. In: BRESCI - VIII Brasilian e-Science Workshop, 2014, Brasília. CSBC 2014. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação (SBC), 2014. p. 375-378.

  • SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. . SIMULAÇÕES COMPUTACIONAIS DE INTERAÇÕES ENTRE POLIMIXINA-B, POLIMIXINA-M E POLIMIXINA-E COM MEMBRANAS BACTERIANAS. In: XXII Congresso de Iniciação Científica, CONIC, 2014, Recife. XXII CONIC, 2014. p. 1-4.

  • SANTOS, DENYS E. S. ; SOARES, T. A. . Gaussian Curvature and Elastic Energy Variations of Gram- Negative P. aeruginosa Susceptible and Resistant Chemotypes in Presence of Antimicrobial Peptide Polymyxin B. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • SANTOS, D. E. S. ; PONTES, F. J. S. ; COUTINHO, KALINE ; LINS, R. D. ; SOARES, T. A. . SUAVE: UMA METODOLOGIA COMPUTACIONAL PARA AVALIAÇÃO DE INTERFACES. 2019. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • SANTOS, D. E. S. ; PONTES, F. J. S. ; COUTINHO, KALINE ; LINS, R. D. ; SOARES, T. A. . SuAVE: a new computational perspective for analyzing biological systems. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • SANTOS, D. E. S. ; PONTES, FREDERICO J. S. ; COUTINHO, KALINE ; LINS, R. D. ; SOARES, T. A. . SUAVE: UMA FERRAMENTA PARA AVALIAÇÃO DE PROPRIEDADES DEPENDENTES DE CURVATURA EM SUPERFÍCIES GENÉRICAS. 2018. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • SANTOS, D. E. S. ; PONTES, F. J. S. ; COUTINHO, KALINE ; LINS, R. D. ; SOARES, T. A. . SuAVE: a computational tool for the assessment of curved surfaces. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. . THE VALIDATION OF POLYMER BRUSH MODELS: ACCOUNTING FOR  NEW VARIABLES. 2017. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. . SuAVE: an alternative for assessment of curved surfaces. 2017. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • SANTOS, DENYS E.S. ; PONTES, F. J. S. ; COUTINHO, KALINE ; LINS, R. D. ; SOARES, T. A. . SuAVE: a computational tool for the assessment of curved surfaces. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. . Modelagem computacional e estudo da Dinâmica Molecular de sistemas de Polymer Brushes frente a diferentes ambientes químicos. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. . Polymixin B and its mechanism of action over different membrane chemotypes. 2016. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. . MOLECULAR DYNAMICS OF ANTIMICROBIAL PEPTIDES AND THEIR ACTION OVER GRAM-NEGATIVE BACTERIAL OUTER MEMBRANES. 2015. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. ; GAUTROT, J. E. E. . POLYMER DYNAMICS: THE DEVELOPMENT OF MOLECULAR MODELS. 2015. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. . Molecular Dynamics Simulations of Polymixin B, E and M and its Binding Mechanism to the outer membrane of Pseudomona aeruginosa. 2014. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. . Dinâmica estrutural das variantes de polimixina e seu mecanismo de ação sobre membranas externas de P. Aeruginosa. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. . Simulações Computacionais da Ação de Variantes da Polimixina Sobre a Membrana Externa de Bactérias Gram-Negativa. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Outras produções

SANTOS, D. E. S. ; SOARES, T. A. . SuAVE (Surface Assessment Via grid Evaluation). 2019.

SANTOS, DENYS . Programação para Químicos. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Projetos de pesquisa

  • 2015 - 2019

    Bases Moleculares de Doenças Infecciosas: Resistência em Bactérias Gram-Negativas e Engenharia de Epítopos Imunorreativos, Descrição: Edital Programa de Apoio a Núcleos Emergentes - PRONEM - 08/2014 (Processo: APQ-0732-1.06/14). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Doutorado: (6) . , Integrantes: Denys Ewerton da Silva Santos - Integrante / Thereza Amélia Soares - Coordenador / Rafael Dhalia - Integrante / Roberto Dias Lins Neto - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.

  • 2015 - 2017

    Computational Simulations of the Polymer Brushes, Descrição: Royal Society International Exchange Scheme (Processo: NI140090). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Denys Ewerton da Silva Santos - Integrante / Thereza Amélia Soares - Coordenador / Julien Ezra Edouard Gautrot - Integrante., Financiador(es): The Royal Society - Newton Fund - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2015

    Simulações computacionais de peptídeos antimicrobianos catiônicos em membranas polissacarídicas de diferentes quimiotipos de Pseudomonas aeruginosa, Descrição: Edital Auxílio a Projetos de Pesquisa - APQ-FACEPE - 15/2012 (Processo: APQ-1013-1.06/12). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Denys Ewerton da Silva Santos - Integrante / Roberta P. Dias - Integrante / Thereza Amélia Soares - Coordenador / RAMSTEDT, MADELEINE - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2014

    Efeitos de peptídios antimicrobianos catiônicos na estrutura de membranas externas de diferentes quimiotipos de bactéria Gram-negativa Pseudomona aeruginosa, Descrição: Chamada Pública MCTI/CNPq No. 14/2012 - Universal 14/2012 (Processo: 470232/2012-9). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Denys Ewerton da Silva Santos - Integrante / Roberta P. Dias - Integrante / Thereza Amélia Soares - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2011 - 2019

    Understanding the Biocompatibility of Polymeric Biomaterial Surfaces., Descrição: STINT Call (Processo: IG2011-2048). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Denys Ewerton da Silva Santos - Integrante / Thereza Amélia Soares - Coordenador / Julien Ezra Edouard Gautrot - Integrante / RAMSTEDT, MADELEINE - Integrante., Financiador(es): The Swedish Foundation for International Cooperation in Research - Auxílio financeiro.

Prêmios

2018

Prêmio Dr. Oleg Vladimirovich Krasilnikov, 1º lugar e melhor pôster, V Encontro Anual de BIOFÍSICA.

2018

Prêmio Dr. Oleg Vladimirovich Krasilnikov, 2º lugar na Modalidade Pôster, V Encontro Anual de BIOFÍSICA.

2014

3º lugar das melhores apresentações da área de Ciências exatas e da Terra do XXII CONIC, CONIC - UFPE.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Universidade Federal de Pernambuco, Centro de Ciências Exatas e da Natureza, Departamento de Química Fundamental. , Avenida Jornalista Aníbal Fernandes, Cidade Universitária, 50740560 - Recife, PE - Brasil, Telefone: (81) 997429225, Ramal: 7472

Experiência profissional

2023 - Atual

Universidade Federal de Pernambuco

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto I, Regime: Dedicação exclusiva.

2019 - 2019

Universidade Federal de Pernambuco

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio em Docência, Carga horária: 4

2013 - 2016

Universidade Federal de Pernambuco

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno de Iniciação Científica (PIBIC), Carga horária: 20

2013 - 2014

Universidade Federal de Pernambuco

Vínculo: Voluntário, Enquadramento Funcional: Monitor de Eletroquímica, Carga horária: 12

2012 - 2013

Universidade Federal de Pernambuco

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitor de Física Experimental 1, Carga horária: 20

2012 - 2013

Universidade Federal de Pernambuco

Vínculo: Voluntário, Enquadramento Funcional: Aluno de Iniciação Científica, Carga horária: 20

2021 - 2022

BSArid Indústria Química

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Egenheiro de Processos / Responsável Técnico, Carga horária: 20