Rodrigo de Paula Baptista

Possui graduação em Biomedicina (2008) pela Universidade FUMEC e é doutor pelo programa de doutorado em Bioinformatica na Universidade Federal de Minas Gerais (2014). Foi Bolsista de Desenvolvimento tecnológico industrial (DTI) pela rede genoma minas (RGMG) (2009-2010) trabalhando com sequenciamento sanger. Foi representante discente do colegiado de Bioinformática da UFMG (2011-2013). Pos doutorado no departamento de parasitologia na UFMG (2014-2015) e na University of Georgia, Estados Unidos, no Center for tropical and Emerging Global Diseases -CTEGD (2015-2019). Atuou como Research Assistant Professor nos departamentos de Doenças Tropicais (CTEGD) e Instituto de Bioinformatica (IOB) na University of Georgia. Tem experiência nas áreas de Genômica, Genética de População, Filogenia e Biologia Molecular, com ênfase em Bioinformática e Biologia Molecular de parasitos, atuando principalmente nos seguintes temas: (1) Bases moleculares da patogenia da doença de Chagas; (2) Estrutura populacional e ecoepidemiologia de parasitos; (3) Diagnóstico molecular de infecções parasitárias; (4) Montagem e anotação de genomas de parasitos; (5) genômica comparativa; (6) Transcriptômica; e (7) Metagenômica. Atualumente atua como pesquisador e professor adjunto no Houston Methodist Academic and Research Institute, liderando o grupo de Genomica e Bioinformatica do Departemento de doencas infecciosas. Trabalho focado em patogenos eucariotos e procariotos aplicado a clinica.

Informações coletadas do Lattes em 23/07/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioinformática

2010 - 2014

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Aplicação de abordagens bioinformáticas no estudo da estrutura populacional de Trypanosoma cruzi
Orientador: em University of Georgia ( Jessica C. Kissinger)
com Andréa Mara Macedo. Coorientador: Daniella Castanheira Bartholomeu. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Parasitologia / Subárea: Protozoologia de Parasitos. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Graduação em Biomedicina

2005 - 2008

Universidade FUMEC
Título: CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR DE ISOLADOS DE T. CRUZI PROVENIENTES DE PACIENTES CHAGÁSICOS DOS ESTADOS DE MINAS GERAIS E RIO GRANDE DO NORTE
Orientador: Andréa Mara Macedo

Pós-doutorado

2014

Pós-Doutorado. , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Biotecnologia Ambiental e Recursos Naturais / Especialidade: Biodiversidade. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica.

2015 - 2019

Pós-Doutorado. , University of Georgia, UGA, Estados Unidos. , Bolsista do(a): National Institute of Health, NIH, Estados Unidos. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Parasitologia. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica.

Formação complementar

2014 - 2014

?Genomics for working with pathogens?. (Carga horária: 32h). , European Molecular Biology Laboratory - Bioinformatics Institute, EMBL - EBI, Grã-Bretanha.

2014 - 2014

Bacterial Metagenomics. (Carga horária: 3h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2014 - 2014

Phage genomics and metagenomics. (Carga horária: 3h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2014 - 2014

Intensive Publicase Workshop. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2013 - 2013

Introdução à Linguagem de Programação Perl. (Carga horária: 30h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2012 - 2012

Curso RNAseq. (Carga horária: 45h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2010 - 2010

Perl for Bioinformatics and Computation Biology. (Carga horária: 3h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2010 - 2010

2º Curso de nivelamento em Bioinformática. (Carga horária: 70h). , Centro de Excelência em Bioinformática - Fiocruz/CPqRR, CEBIO, Brasil.

2008 - 2008

Bioinformática de proteínas. (Carga horária: 4h). , Fundação para o Desenvolvimento da UNESP, FUNDUNESP, Brasil.

2008 - 2008

Sequênciamento de DNA: do humano ao personalizado. (Carga horária: 6h). , Fundação para o Desenvolvimento da UNESP, FUNDUNESP, Brasil.

2007 - 2007

Aplicação do exame do DNA na elucidação de crimes. (Carga horária: 6h). , Fundação para o Desenvolvimento da UNESP, FUNDUNESP, Brasil.

2006 - 2006

Perfil genético em tumores humanos. (Carga horária: 6h). , Fundação para o Desenvolvimento da UNESP, FUNDUNESP, Brasil.

2005 - 2005

Imunologia. (Carga horária: 5h). , Faculdade de Medicina do Triângulo Mineiro, FMTM, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Alemão

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Parasitologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

Participação em eventos

III International Workshop on Environmental Microbiology. 2014. (Outra).

2013 Institute of Bioinformatics State-of-the-Art Next Generation Sequence Analysis Symposium. 2013. (Simpósio).

2013 XXIV Molecular Parasitology Meeting. Solving the population structure of Trypanosoma cruzi: a look at the non-Esmo parent. 2013. (Congresso).

VI Encontro de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia. 2012. (Encontro).

XI International Conference on Molecular Epidemiology and evolutionary Genetics of infectious Diseases. Evidence of Significant Recombination Among Trypanosoma cruzi II Strains From Minas Gerais. 2012. (Congresso).

XXVIII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXIX Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. Detection of target sites in genomic sequences for phylogenetic studies using logistic regression: application on T.cruzi amastin gene. 2012. (Congresso).

7th international conference of the brazilian association for Bioinformatics and Computational Biology. DETECTION OF TARGET SITES IN GENOMIC SEQUENCES FOR PHYLOGENETIC STUDIES USING LOGISTIC REGRESSION: APPLICATION ON T.CRUZI AMASTIN GENE. 2011. (Congresso).

XXVII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. Sex or not: that is the question for Trypanosoma cruzi. 2011. (Congresso).

6th international conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Genetic Variability of Trypanosoma cruzi II by correlations between Nuclear and Mitochondrial genome (KDNA) associated with clinical manifestations of chagas disease. 2010. (Congresso).

XXVI Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXVII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. Genetic Variability of Trypanosoma cruzi II by correlations between Nuclear and Mitochondrial genome (KDNA) associated with clinical manifestations of chagas disease. 2010. (Congresso).

Simpósio Internacional comemorativo do centenário da descoberta da doença de Chagas.Trypanosoma cruzi molecular characterization applying the bidirectional PCR amplification of a specific allele (Bi-PASA) technique for NADH dehydrogenase subunit I (ND1). 2009. (Simpósio).

XIII internacional congress of protistology/XXV Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology/XXXVI Annual Meeting on basic Research in Chagas' Disease. Bidirectional PCR Amplification of a specific Allele (Bi-PASA) technique applied for NADH dehydrogenase subunit I (ND1) from T.cruzi. 2009. (Congresso).

11º Encontro Regional de Biomedicina.Caracterização molecular do Trypanosoma cruzi: Otimização da técnica de PCR-RFLP para análise do gene citocromo oxidase subunidade II (COII). 2008. (Encontro).

54º Congresso Brasileiro de Genética. Correlação entre Casos de Infertilidade Masculina e as Ocupações dos Pacientes de uma clínica de reprodução assistida de Belo Horizonte.. 2008. (Congresso).

IX Encontro de Pesquisa do Instituto de Ciências Biológicas/ IV Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia. 2008. (Encontro).

XXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia / XXXV Reunião Anual sobre pesquisa básica em Doença de Chagas. Trypanosoma cruzi molecular characterization: optimization of PCR-RFLP technique for cytocrome oxidase subunit II gene analysis.. 2008. (Congresso).

10º Encontro Regional de Biomedicina. 2007. (Encontro).

2º Congresso Mineiro de Alergia e Imunologia Clínica/ Encontro do Grupo Brasileiro de Imunologia Clínica. 2007. (Congresso).

9º Encontro regional de Biomedicina. 2006. (Encontro).

2ª Semana do Conhecimento da Facudade de Ciências da Saúde - FUMEC.Tratamento de água: o problema do calcário. 2005. (Seminário).

III Encontro Mineiro de Biomedicina. 2005. (Encontro).

XII Seminário do IPEC.A fisiologia do Coração. 2001. (Seminário).

Produções bibliográficas

Baptista, Rodrigo P. ; LI, YIRAN ; SATERIALE, ADAM ; SANDERS, MANDY J. ; BROOKS, KAREN L. ; TRACEY, ALAN ; ANSELL, BRENDAN R.E. ; JEX, AARON R. ; COOPER, GARRETT W. ; SMITH, ETHAN D. ; XIAO, RUI ; DUMAINE, JENNIFER E. ; GEORGESON, PETER ; POPE, BERNARD J. ; BERRIMAN, MATTHEW ; STRIEPEN, BORIS ; COTTON, JAMES A. ; KISSINGER, JESSICA C. . Long-read assembly and comparative evidence-based reanalysis of genome sequences reveal expanded transporter repertoire and duplication of entire chromosome ends including subtelomeric regions. GENOME RESEARCH , v. 32, p. 203-213, 2022.
LI, YIRAN ; Baptista, Rodrigo P. ; MEI, XIAOHAN ; KISSINGER, JESSICA C. . Small and intermediate size structural RNAs in the unicellular parasite Cryptosporidium parvum as revealed by sRNA-seq and comparative genomics. Microbial Genomics , v. 8, p. na, 2022.
PADILHA, DAYANE AZEVEDO BENETTI FILHO, VILMAR MOREIRA, RENATO SIMÕES SORATTO, TATIANY APARECIDA TEIXEIRA MAIA, GUILHERME AUGUSTO CHRISTOFF, ANA PAULA BARAZZETTI, FERNANDO HARTMANN SCHÖRNER, MARCOS ANDRÉ FERRARI, FERNANDA LUIZA MARTINS, CAROLINA LEITE KAWAGOE, ERIC KAZUO WACHTER, JULIA KINETZ SACHET, PAULA BAPTISTELLA, ANTUANI RAFAEL SCHLINDWEIN, ALINE DAIANE COELHO, BRUNA KELLET FERNANDES, SANDRA BIANCHINI ROVARIS, DARCITA BUERGER DEBIASI DOS ANJOS, MARLEI PICKLER MELO, FERNANDA ROSENE BITTENCOURT, BIANCA CUNHA, STHEFANI MENEGHETTI, KARINE LENA WENDT, NESTOR MADALOZ, TÂMELA ZAMBONI , et al. RODRIGUES, MARCUS VINÍCIUS DUARTE SOUZA, DORIS SOBRAL MARQUES MORAES, MILENE HÖEHR DE BAPTISTA, RODRIGO DE PAULA TOLEDO-SILVA, GUILHERME RAZZERA, GUILHERME GRISARD, EDMUNDO CARLOS STOCO, PATRICIA HERMES DE OLIVEIRA, LUIZ FELIPE VALTER BAZZO, MARIA LUIZA FONGARO, GISLAINE WAGNER, GLAUBER ; Emergence of Two Distinct SARS-CoV-2 Gamma Variants and the Rapid Spread of P.1-like-II SARS-CoV-2 during the Second Wave of COVID-19 in Santa Catarina, Southern Brazil. Viruses-Basel , v. 14, p. 695, 2022.
VALDIVIA, HUGO O. ; ROATT, BRUNO M. ; BAPTISTA, RODRIGO DE PAULA ; OTTINO, JENNIFER ; COQUEIRO-DOS-SANTOS, ANDERSON ; SANDERS, MANDY J. ; REIS, ALEXANDRE B. ; COTTON, JAMES A. ; BARTHOLOMEU, DANIELLA C. . Replacement of Leishmania (Leishmania) infantum Populations in an Endemic Focus of Visceral Leishmaniasis in Brazil. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 12, p. na, 2022.
PIERRE-LOUIS, EDWIN ; ETHERIDGE, MENNA G. ; DE PAULA BAPTISTA, RODRIGO ; KHAN, ASIS ; CHASEN, NATHAN M. ; ETHERIDGE, RONALD D. . Disruption of Toxoplasma gondii-Induced Host Cell DNA Replication Is Dependent on Contact Inhibition and Host Cell Type. mSphere , v. 7, p. na, 2022.
LI, YIRAN ; Baptista, Rodrigo P. ; SATERIALE, ADAM ; STRIEPEN, BORIS ; KISSINGER, JESSICA C. . Analysis of Long Non-Coding RNA in Cryptosporidium parvum Reveals Significant Stage-Specific Antisense Transcription. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 10, p. na, 2021.
WANG, WEI ; PENG, DUO ; Baptista, Rodrigo P. ; LI, YIRAN ; KISSINGER, JESSICA C. ; TARLETON, RICK L. . Strain-specific genome evolution in Trypanosoma cruzi, the agent of Chagas disease. PLoS Pathogens , v. 17, p. e1009254, 2021.
COBB, DAVID W. ; KUDYBA, HEATHER M. ; VILLEGAS, ALEJANDRA ; HOOPMANN, MICHAEL R. ; Baptista, Rodrigo P. ; BRUTON, BAYLEE ; KRAKOWIAK, MICHELLE ; MORITZ, ROBERT L. ; MURALIDHARAN, VASANT . A redox-active crosslinker reveals an essential and inhibitable oxidative folding network in the endoplasmic reticulum of malaria parasites. PLoS Pathogens , v. 17, p. e1009293, 2021.
RAMAKRISHNAN, SRINIVASAN ; UNGER, LINN M. ; Baptista, Rodrigo P. ; CRUZ-BUSTOS, TERESA ; DOCAMPO, ROBERTO . Deletion of a Golgi protein in Trypanosoma cruzi reveals a critical role for Mn2+ in protein glycosylation needed for host cell invasion and intracellular replication. PLoS Pathogens , v. 17, p. e1009399, 2021.
NAMASIVAYAM, SIVARANJANI ; Baptista, Rodrigo P. ; XIAO, WENYUAN ; HALL, ERICA M. ; DOGGETT, JOSEPH S. ; TROELL, KARIN ; KISSINGER, JESSICA C. . A novel fragmented mitochondrial genome in the protist pathogen and related tissue coccidia. GENOME RESEARCH , v. 31, p. 852-865, 2021.
RAMAKRISHNAN, SRINIVASAN ; Baptista, Rodrigo P. ; ASADY, BEEJAN ; HUANG, GUOZHONG ; DOCAMPO, ROBERTO . TbVps41 regulates trafficking of endocytic but not biosynthetic cargo to lysosomes of bloodstream forms of. FASEB JOURNAL , v. 35, p. na, 2021.
BEAUDRY, MEGAN S. ; THOMAS, JESSE C. ; Baptista, Rodrigo P. ; SULLIVAN, AMANDA H. ; NORFOLK, WILLIAM ; DEVAULT, ALISON ; ENK, JACOB ; KIERAN, TROY J. ; RHODES, OLIN E. ; PERRY'DOW, K. ALLISON ; ROSE, LAURA J. ; BAYONA'VÁSQUEZ, NATALIA J. ; OLADEINDE, ADELUMOLA ; LIPP, ERIN K. ; SANCHEZ, SUSAN ; GLENN, TRAVIS C. . Escaping the fate of Sisyphus: assessing resistome hybridization baits for antimicrobial resistance gene capture. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY , v. 23, p. 7523-7537, 2021.
DE LUCA, ELIANA ; ÁLVAREZ-NARVÁEZ, SONSIRAY ; MABONI, GRAZIELI ; Baptista, Rodrigo P. ; NEMETH, NICOLE M. ; NIEDRINGHAUS, KEVIN D. ; LADNER, JASON T. ; LORCH, JEFFREY M. ; KOROLEVA, GALINA ; LOVETT, SEAN ; PALACIOS, GUSTAVO F. ; SANCHEZ, SUSAN . Comparative Genomics Analyses Support the Reclassification of Bisgaard Taxon 40 as Mergibacter gen. nov., With Mergibacter septicus sp. nov. as Type Species: Novel Insights Into the Phylogeny and Virulence Factors of a Pasteurellaceae Family Member Associated With Mortality Events in Seabirds. Frontiers in Microbiology , v. 12, p. na, 2021.
JANSSEN, LUIS ; DE ALMEIDA, FELIPE MARQUES ; DAMASCENO, THAIS AMANDA SILVA ; BAPTISTA, RODRIGO DE PAULA ; PAPPAS, GEORGIOS JOANNIS ; DE CAMPOS, TATIANA AMABILE ; MARTINS, VICENTE DE PAULO . A Novel Multidrug Resistant, Non-Tn4401 Genetic Element-Bearing, Strain of Klebsiella pneumoniae Isolated From an Urban Lake With Drinking and Recreational Water Reuse. Frontiers in Microbiology , v. 12, p. na, 2021.
Baptista, Rodrigo P. ; COOPER, GARRETT W. ; KISSINGER, JESSICA C. . Challenges for Cryptosporidium Population Studies. Genes , v. 12, p. 894, 2021.
VIANA DE ALMEIDA, LAILA ; LUÍS REIS-CUNHA, JOÃO ; COQUEIRO-DOS-SANTOS, ANDERSON ; FLÁVIA RODRIGUES-LUÍS, GABRIELA ; DE PAULA BAPTISTA, RODRIGO ; DE OLIVEIRA SILVA, SORAIA ; NORMA DE MELO, MARIA ; CASTANHEIRA BARTHOLOMEU, DANIELLA . Comparative genomics of Leishmania isolates from Brazil confirms the presence of Leishmania major in the Americas. INTERNATIONAL JOURNAL FOR PARASITOLOGY , v. 51, p. 1047-1057, 2021.
SHIN, PEI-TSZ ; BAPTISTA, RODRIGO DE PAULA ; O?NEILL, CONNOR M. ; WALLIS, CONNOR ; REAVES, BARBARA J. ; WOLSTENHOLME, ADRIAN J. . Comparative sequences of the Wolbachia genomes of drug-sensitive and resistant isolates of Dirofilaria immitis. VETERINARY PARASITOLOGY , v. 286, p. 109225, 2020.
BUTLER, JOSHUA H. ; Baptista, Rodrigo P. ; VALENCIANO, ANA L. ; ZHOU, BIN ; KISSINGER, JESSICA C. ; TUMWEBAZE, PATRICK K. ; ROSENTHAL, PHILIP J. ; COOPER, ROLAND A. ; YUE, JIAN-MIN ; CASSERA, MARIA B. . Resistance to Some But Not Other Dimeric Lindenane Sesquiterpenoid Esters Is Mediated by Mutations in a Esterase. ACS Infectious Diseases , v. 6, p. 2994-3003, 2020.
LI, YIRAN ; Baptista, Rodrigo P. ; KISSINGER, JESSICA C. . Noncoding RNAs in Apicomplexan Parasites: An Update. TRENDS IN PARASITOLOGY , v. 36, p. 835-849, 2020.
SATERIALE, ADAM ; ?LAPETA, JAN ; BAPTISTA, RODRIGO ; ENGILES, JULIE B. ; GULLICKSRUD, JODI A. ; HERBERT, GILLIAN T. ; BROOKS, CARRIE F. ; KUGLER, EMILY M. ; KISSINGER, JESSICA C. ; HUNTER, CHRISTOPHER A. ; STRIEPEN, BORIS . A Genetically Tractable, Natural Mouse Model of Cryptosporidiosis Offers Insights into Host Protective Immunity. Cell Host & Microbe , v. 26, p. 135-146.e5, 2019.
Baptista, Rodrigo P. ; KISSINGER, JESSICA C. . Is reliance on an inaccurate genome sequence sabotaging your experiments?. PLoS Pathogens , v. 15, p. e1007901, 2019.
MABONI, GRAZIELI ; KRIMER, PAULA ; BAPTISTA, RODRIGO ; LORTON, ANA ; ANDERSON, CHRISTINA ; SANCHEZ, SUSAN . Laboratory diagnostics, phylogenetic analysis and clinical outcome of a subcutaneous Mycoleptodiscus indicus infection in an immunocompetent cat. BMC Veterinary Research , v. 15, p. 354, 2019.
Baptista, Rodrigo P. ; REIS-CUNHA, JOAO LUIS ; DEBARRY, JEREMY D. ; Chiari, Egler ; KISSINGER, JESSICA C. ; BARTHOLOMEU, DANIELLA C. ; Macedo, Andrea M. . Assembly of highly repetitive genomes using short reads: the genome of discrete typing unit III Trypanosoma cruzi strain 231. Microbial Genomics , v. 4, p. 156, 2018.
QUARESMA, PATRÍCIA FLÁVIA ; DE BRITO, CRISTIANA FERREIRA ALVES ; RUGANI, JERONIMO MARTELETO NUNES ; FREIRE, JANAÍNA DE MOURA ; BAPTISTA, RODRIGO DE PAULA ; MORENO, ELIZABETH CASTRO ; GONTIJO, RAQUEL CARVALHO ; REGO, FELIPE DUTRA ; DINIZ, JOAQUIM EDEMILSON ; MELO, MARIA NORMA ; GONTIJO, CÉLIA MARIA FERREIRA . Distinct genetic profiles of Leishmania (Viannia) braziliensis associate with clinical variations in cutaneous-leishmaniasis patients from an endemic area in Brazil. PARASITOLOGY , v. 145, p. 1-9, 2018.
FUSELLI, S. ; BAPTISTA, R. P. ; PANZIERA, A. ; MAGI, A. ; GUGLIELMI, S. ; TONIN, R. ; BENAZZO, A. ; BAUZER, L. G. ; MAZZONI, C. J. ; BERTORELLE, G. . A new hybrid approach for MHC genotyping: high-throughput NGS and long read MinION nanopore sequencing, with application to the non-model vertebrate Alpine chamois (Rupicapra rupicapra). HEREDITY , v. 121, p. 293, 2018.
MOURÃO, LUIZA CARVALHO ; BAPTISTA, RODRIGO DE PAULA ; DE ALMEIDA, ZÉLIA BARBOSA ; GRYNBERG, PRISCILA ; PUCCI, MAÍRA MAZZONI ; CASTRO-GOMES, THIAGO ; FONTES, COR JESUS FERNANDES ; RATHORE, SUMIT ; SHARMA, YAGYA D. ; DA SILVA-PEREIRA, ROSIANE A. ; BEMQUERER, MARCELO PORTO ; BRAGA, ÉRIKA MARTINS . Anti-band 3 and anti-spectrin antibodies are increased in Plasmodium vivax infection and are associated with anemia. Scientific Reports , v. 8, p. 8762, 2018.
REIS-CUNHA, JOÃO LUÍS ; Baptista, Rodrigo P. ; RODRIGUES-LUIZ, GABRIELA F. ; COQUEIRO-DOS-SANTOS, ANDERSON ; VALDIVIA, HUGO O. ; DE ALMEIDA, LAILA VIANA ; CARDOSO, MARIANA SANTOS ; D?ÁVILA, DANIELLA ALCHAAR ; DIAS, FERNANDO HUGO CUNHA ; FUJIWARA, RICARDO TOSHIO ; GALVÃO, LÚCIA M. C. ; Chiari, Egler ; CERQUEIRA, GUSTAVO COUTINHO ; BARTHOLOMEU, DANIELLA C. . Whole genome sequencing of Trypanosoma cruzi field isolates reveals extensive genomic variability and complex aneuploidy patterns within TcII DTU. BMC GENOMICS , v. 19, p. 816, 2018.
DHARA, ANIMESH ; DE PAULA BAPTISTA, RODRIGO ; KISSINGER, JESSICA C. ; SNOW, E. CHARLES ; SINAI, ANTHONY P. . Ablation of an Ovarian Tumor Family Deubiquitinase Exposes the Underlying Regulation Governing the Plasticity of Cell Cycle Progression in. mBio , v. 8, p. 1846, 2017.
REIS-CUNHA, JOÃO LUÍS ; RODRIGUES-LUIZ, GABRIELA F. ; VALDIVIA, HUGO O. ; Baptista, Rodrigo P. ; MENDES, TIAGO A. O. ; DE MORAIS, GUILHERME LOSS ; GUEDES, RAFAEL ; Macedo, Andrea M. ; BERN, CARYN ; GILMAN, ROBERT H. ; LOPEZ, CARLOS TALAVERA ; ANDERSSON, BJÖRN ; VASCONCELOS, ANA TEREZA ; BARTHOLOMEU, DANIELLA C. . Chromosomal copy number variation reveals differential levels of genomic plasticity in distinct Trypanosoma cruzi strains. BMC Genomics , v. 16, p. 499, 2015.
VALDIVIA, HUGO O. ; REIS-CUNHA, JOÃO LUÍS ; RODRIGUES-LUIZ, GABRIELA F. ; BAPTISTA, RODRIGO DE PAULA ; BALDEVIANO, G. C. ; GERBASI, Robert V. ; DOBSON, D. E. ; PRATLONG, F. ; BASTIEN, P. ; LESCANO, A. G. ; BEVERLEY, S. M. ; BARTHOLOMEU, DANIELLA C. . Comparative genomic analysis of Leishmania (Viannia) peruviana and Leishmania (Viannia) braziliensis. BMC Genomics , v. 16, p. 715, 2015.
BAPTISTA, RODRIGO DE PAULA ; D'ÁVILA, DANIELLA ALCHAAR ; SEGATTO, MARCELA ; VALLE, ÍTALO FARIA DO ; FRANCO, GLÓRIA REGINA ; VALADARES, HELDER MAGNO SILVA ; GONTIJO, ELIANE DIAS ; GALVÃO, LÚCIA MARIA DA CUNHA ; PENA, SÉRGIO DANILO JUNHO ; Chiari, Egler ; MACHADO, CARLOS RENATO ; MACEDO, ANDRÉA MARA . Evidence of substantial recombination among Trypanosoma cruzi II strains from Minas Gerais. Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 22, p. 183-191, 2014.
FERREIRA, KEILA ADRIANA MAGALHÃES ; FAJARDO, EMANUELLA FRANCISCO ; Baptista, Rodrigo P. ; MACEDO, ANDREA MARA ; LAGES-SILVA, ELIANE ; RAMÍREZ, LUIS EDUARDO ; PEDROSA, ANDRÉ LUIZ . Species-specific markers for the differential diagnosis of Trypanosoma cruzi and Trypanosoma rangeli and polymorphisms detection in Trypanosoma rangeli. Parasitology Research (1987. Print) , v. 113, p. 2199-2207, 2014.
Carranza, Julio César ; Valadares, Helder M.S. ; D¿Ávila, Daniella A. ; Baptista, Rodrigo P. ; Moreno, Margoth ; Galvão, Lúcia M.C. ; Chiari, Egler ; Sturm, Nancy R. ; Gontijo, Eliane D. ; Macedo, Andrea M. . Trypanosoma cruzi maxicircle heterogeneity in Chagas disease patients from Brazil. International Journal for Parasitology , v. 39, p. 963-973, 2009.
BAPTISTA, R. P. ; KATO, R. B. ; COUTO, B. R. G. M. ; PAPPA, G. L. ; BELCHIOR, J. C. ; SANTOS, M. A. ; MACEDO, A. M. . Detection of target sites in genomic sequences for phylogenetic studies using logistic regression: application on T.cruzi amastin gene. In: XXVIII Annual meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXIX Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2012, Caxambu. XXVIII Annual meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXIX Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2012.
BAPTISTA, R. P. ; D¿Ávila, Daniella A. ; SEGATTO, M. ; VALADARES, H. M. S. ; Galvão, Lúcia M.C. ; Chiari, Egler ; MACEDO, A. M. ; MACHADO, C. R. . Evidence of Significant Recombination Among Trypanosoma cruzi II Strains From Minas Gerais. In: 11th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases, 2012, New Orleans. 11th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases, 2012.
BAPTISTA, R. P. ; D¿Ávila, Daniella A. ; Valadares, Helder M.S. ; SEGATTO, M. ; Galvão, Lúcia M.C. ; Chiari, Egler ; MACEDO, A. M. ; MACHADO, C. R. . Sex or not: that is the question for Trypanosoma cruzi. In: XXVII Annual meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2011, Foz do Iguaçu. XXVII Annual meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2011.
BAPTISTA, R. P. ; D¿Ávila, Daniella A. ; VALADARES, H. M. S. ; Galvão, Lúcia M.C. ; Gontijo, Eliane D. ; MACEDO, A. M. ; MACHADO, C. R. ; Chiari, Egler . Genetic Variability of Trypanosoma cruzi II by correlations between Nuclear and Mitochondrial genome (KDNA) associated with clinical manifestations of chagas disease. In: 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010, Ouro Preto. 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010.
BAPTISTA, R. P. ; D¿Ávila, Daniella A. ; VALADARES, H. M. S. ; Galvão, Lúcia M.C. ; Gontijo, Eliane D. ; MACEDO, A. M. ; MACHADO, C. R. ; Chiari, Egler . Genetic Variability of Trypanosoma cruzi II by correlations between Nuclear and Mitochondrial genome (KDNA) associated with clinical manifestations of chagas disease. In: XXVI Annual meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXVII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2010, Foz do Iguaçu. XXVI Annual meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXVII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2010.
BAPTISTA, R. P. ; VALADARES, H. M. S. ; MACHADO, C. R. ; FRANCO, G. R. ; PENA, S. D. J. ; MACEDO, A. M. . Bidirectional PCR amplification of a specific allele (Bi-PASA) technique applied for NADH dehydrogenase Subunit 1 (ND1) from Trypanosoma cruzi.. In: XIII International Congress of Protistology/XXV Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXVI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2009, Armação dos Búzios. XIII International Congress of Protistology/XXV Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology/ XXXVI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2009.
BAPTISTA, R. P. ; VALADARES, H. M. S. ; MACHADO, C. R. ; FRANCO, G. R. ; PENA, S. D. J. ; MACEDO, A. M. . Trypanosoma cruzi molecular characterization applying the Bidirectional PCR amplification of a specific allele (Bi-PASA) technique for NADH dehydrogenase subunit 1 (ND1). In: Simpósio Internacional Comemorativo do Centenário da Descoberta da Doença de Chagas, 2009, Rio de Janeiro. Simpósio Internacional Comemorativo do Centenário da Descoberta da Doença de Chagas, 2009.
BAPTISTA, R. P. ; VALADARES, H. M. S. ; MACHADO, C. R. ; FRANCO, G. R. ; PENA, S. D. J. ; MACEDO, A. M. . Caracterização Molecular do Trypanosoma cruzi: optimização da técnica de RFLP-PCR para a análise do gene citocromo oxidase subunidade II (COII). In: 11º encontro regional de Biomedicina, 2008, Botucatu - SP. Anais do congresso, 2008. v. 11. p. 19-19.
BAPTISTA, R. P. ; VALADARES, H. M. S. ; MACHADO, C. R. ; FRANCO, G. R. ; PENA, S. D. J. ; MACEDO, A. M. . Trypanosoma cruzi molecular characterization: optimization of PCR-RFLP technique for cytochrome oxidase subunit II (COII) gene analysis.. In: XXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de protozoologia / XXXV Reunião Anual sobre pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2008, Águas de Lindóia - SP. XXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de protozoologia / XXXV Reunião Anual sobre pesquisa Básica em Doença de Chagas livro de anais do congresso, 2008. p. 71-71.
BAPTISTA, R. P. ; CHAGAS, D. L. C. ; DEJEAN, N. R. ; LIMA, T.T.S. ; NEVES, S. R. S. ; MORAES, L. A. M. ; CAETANO, J. P. J. ; PENNA, M. L. F. . Correlação de casos de infertilidade masculina e a ocupação dos pacientes de uma clinica de reprodução assistida de Belo Horizonte. In: 54º Congresso Brasileiro de Genética, 2008, Salvador - BA. 54º Congresso Brasileiro de Genética livro de anais do congresso, 2008. p. 46-46.
BAPTISTA, R. P. ; VALADARES, H. M. S. ; MACHADO, C. R. ; FRANCO, G. R. ; PENA, S. D. J. ; MACEDO, A. M. . TRYPANOSOMA CRUZI MOLECULAR CHARACTERIZATION: OPTIMIZATION OF PCR-RFLP TECHNIQUE FOR CYTOCHROME OXIDASE SUBUNIT II (COII) GENE ANALYSIS.. In: 11th Regional Meeting of Biomedicine - ISSN 1678-9199, 2008, Botucatu - SP. The Journal of Venomous Animals and Toxins Including Tropical Diseases (Online). Botucatu - São Paulo: CEVAP, 2008. v. 14. p. 814-814.
BAPTISTA, R. P. ; MACEDO, A. M. ; KISSINGER, J. C. . Solving the population structure of Trypanosoma cruzi: a look at the non-Esmo parent. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
BAPTISTA, R. P. ; D¿Ávila, Daniella A. ; SEGATTO, M. ; VALADARES, H. M. S. ; Galvão, Lúcia M.C. ; Chiari, Egler ; MACHADO, C. R. ; MACEDO, A. M. . Avaliando a presença de Recombinação sexuada entre cepas distintas de T. cruzi da linhagem TcII em Minas Gerais. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
BAPTISTA, R. P. ; D¿Ávila, Daniella A. ; SEGATTO, M. ; VALADARES, H. M. S. ; Galvão, Lúcia M.C. ; Chiari, Egler ; MACEDO, A. M. ; MACHADO, C. R. . Evidence of Significant Recombination Among Trypanosoma cruzi II Strains From Minas Gerais. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
SANTOS, V. C. ; PEDROSO, J. S. ; BAPTISTA, R. P. ; FRANCO, G. R. ; MACHADO, C. R. ; MACEDO, A. M. . PCR multiplex do gene gpi de Trypanosoma cruzi: um candidato a marcador molecular. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).
BAPTISTA, R. P. ; D¿Ávila, Daniella A. ; SEGATTO, M. ; VALADARES, H. M. S. ; Galvão, Lúcia M.C. ; Chiari, Egler ; MACEDO, A. M. ; MACHADO, C. R. . Sex or not: that is the question for Trypanosoma cruzi. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
BAPTISTA, R. P. ; VALADARES, H. M. S. ; MACHADO, C. R. ; FRANCO, G. R. ; PENA, S. D. J. ; MACEDO, A. M. . Caracterização Molecular do Trypanosoma cruzi: otimização da técnica de PCR-RFLP para análise do gene citocromo oxidase subunidade II (COII). 2008. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Projetos de pesquisa

2011 - 2014

Linhagens filogenéticas de Trypanosom a cruzi: estudos populacionais e evolutivos e im plicações clínicas associadas à nova nom enclatura, Descrição: A doença de Chagas continua sendo um grande problem a de saúde publica no Brasil e outros países das Am éricas Central e Sul. Apesar dos inquestionáveis avanços no controle da transm issão vetorial e transfusional da infecção, cerca de 10 m ilhões de indivíduos encontram -se infectados, dos quais 25-30% evoluem para form as m ais graves da doença, levando à m orte 14.000 indivíduos por ano. Um a das questões atuais m ais intrigantes na doença de Chagas relaciona-se aos fatores determ inantes das diferentes form as clínicas, e m orbidade da doença. Um a das hipóteses m ais aceitas para explicar as diferenças clínicas reside na diversidade genética do Trypanosom a cruzi. Em bora diferentes m étodos bioquím icos, biológicos e m oleculares sejam utilizados para revelar esta diversidade, até bem pouco tem po, não havia consenso quanto à subdivisão do T. cruzi em linhagens principais. Som ente durante o Sim pósio Internacional Com em orativo dos 100 anos da Descoberta da Doença de Chagas, em 2009, chegou-se a um consenso em relação à subdivisão do táxon em seis Unidades Taxonôm icas Discretas (DTUs), que foram designadas com o T. cruzi I a VI. Estudos prelim inares sugerem que diferentes DTUs estão m ais ou m enos associadas às form as clinicas da doença, transm issão congênita e oral, resistência a quim ioterápicos, dentre outras características de grande im portância clinica e epidem iológica. Todavia, um a das m aiores lim itações para o am plo conhecim ento das propriedades específicas de cada linhagem e seu papel na form a clínica da doença, decorre da carência de m étodos padronizados para a inequívoca identificação das diferentes linhagens, bem com o da ausência de consenso em relação à estrutura populacional do parasito e relações filogenéticas entre os m esm os. No presente projeto, da ausência de consenso em relação à estrutura populacional do parasito e relações filogenéticas entre os m esm os. No presente projeto, pretendem os desenvolver ferram. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo de Paula Baptista - Integrante / Andréa Mara Macedo - Coordenador / Carlos Renato Machado - Integrante / Sérgio Danilo Junho Pena - Integrante / Chiari, Egler - Integrante / Daniella Castanheira Bartholomeu - Integrante / Ítalo Faria do Valle - Integrante / Viviane Corrêa Santos - Integrante.

Prêmios

2012

Menção honrosa em apresentação na XXI semana de iniciação científica da UFMG, Pró-Reitoria de Pesquisa da UFMG.

2011

Melhor apresentação de Pôster - Bioquímica e Genômica de Parasitos e Vetores (Ítalo do Valle), II Encontro de Pesquisa em Parasitologia/Simpósio Satélite Dia Darwin - Parasitologia em Foco..

2008

VII Prêmio Carlos Roberto Rúbio de Iniciação Científica, Instituto de Biociências - Unesp.

2005

1º lugar da turma de biomedicina na modalidade apresentação de trabalhos científicos da 2ª semana do conhecimento da faculdade de ciencias da saúde - FUMEC, Universidade FUMEC.

Histórico profissional

Endereço profissional

Houston Methodist Research Institute. , 6670 Bertner Street, R6-219, Harris, 77030 - Houston, - Estados Unidos, Telefone: (346) 2388236, URL da Homepage:

Experiência profissional

2009 - 2010

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Bolsa DTI nivel V, Enquadramento Funcional: Técnico de sequenciamento genômico, Carga horária: 30, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Bolsista DTI Nivel V para o sequênciamento genômico dos fungos causadores da ferrugem do café, eucalipto e milho. Bolsa de Pesquisa tem natureza de auxiliar o beneficiário, rede genoma minas, na realização de estudos e ou pesquisas.

2009 - 2009

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Aluno, Enquadramento Funcional: Monitor de Biologia Molecular, Carga horária: 6

Outras informações:
Monitoria nas turmas de 3ºperiodo de ciências Biológicas, e 2º periodo de Farmácia da Universidade Federal de Minas Gerais.

2009 - 2009

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Aluno, Enquadramento Funcional: Inicação Científica, Carga horária: 40

Outras informações:
Desenvolvimento de um sistema de PCR multiplex baseado na estratégia de Bi-PASA envolvendo o gene ND1 de Trypanosoma cruzi. Iniciação Científica realizada no Laboratório de Genética Bioquímica do Departamento de Bioquímica e Imunologia no Instituto de Ciencias Biológicas da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Orientadora: Andréa Mara Macedo

2007 - 2009

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Aluno, Enquadramento Funcional: Iniciação científica, Carga horária: 25

Outras informações:
CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR DE ISOLADOS DE T. CRUZI PROVENIENTES DE PACIENTES CHAGÁSICOS DOS ESTADOS DE MINAS GERAIS E RIO GRANDE DO NORTE. Iniciação Científica realizada no Laboratório de Genética Bioquímica do Departamento de Bioquímica e Imunologia no Instituto de Ciencias Biológicas da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Orientadora: Andréa Mara Macedo

2020 - 2022

University of Georgia

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Research Assistant Professor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2015 - 2019

University of Georgia

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: PostDoctoral Research Associate, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2013 - 2013

University of Georgia

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Visiting schoolar, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Doutorado Sanduiche na "The Unversity of Georgia", Athens - Georgia,com bolsa provida pelo "U.S. National Institute of health - Infectious Disease Genomics and Bioinformatics Training Grant in Brazil". Durante esse projeto o doutorando Rodrigo de Paula Baptista desenvolveu um pipeline para montar e anotar o genoma da cepa TcIII 231 de Trypanosoma cruzi. Além disso ele desenvolveu análises evolutivas a partir dos resultados obtidos do genoma.

Atividades

01/2020 - 02/2022
Pesquisa e desenvolvimento, Center for Tropical and Emerging Global Diseases.,Linhas de pesquisa

2005 - 2007

Universidade FUMEC

Vínculo: Aluno, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 4

Outras informações:
Trabalho de iniciação científica baseado em uma análise de laudos de pacientes do sexo masculino de uma clinica de fertilidade da cidade de Belo Horizonte. O intuito do trabalho foi de achar uma correlação entre os problemas de fertilidade dos pacientes com suas respectivas ocupações e estilos de vida. Universidade FUMEC e Clinica Pró-Criar.

Atividades

08/2008 - 10/2008
Estágios , Faculdade de Ciências da Saúde - Universidade FUMEC.,Estágio realizado, Estágio supervisionado de análises clínicas III, realizado no Laboratório Francis de Análises Clinicas localizado em Belo horizonte, áreas de atuação: Microbiologia, Hematologia, Bioquímica, Imunologia, Parasitologia e coleta de materiais biológicos.
01/2008 - 04/2008
Estágios , Faculdade de Ciências da Saúde - Universidade FUMEC.,Estágio realizado, Estágio supervisionado de análises clínicas I/II, realizado no Hospital da Baleia localizado em Belo horizonte, áreas de atuação: Microbiologia, Hematologia, Bioquímica, Parasitologia e coleta de materiais biológicos. (288h).

2022 - Atual

Houston Methodist Research Institute

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Pesquisador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.