Marcel Parolin Jackowski

Atualmente, Professor Associado do departamento de Ciência da Computação, Instituto de Matemática e Estatística (IME) da Universidade de São Paulo (USP), ele é mestre (1997) e doutor (2001) em Ciências da Computação pela Wright State University e livre-docente pela USP (2017). Realizou seu pós-doutoramento em análise de imagens por Ressonância Magnética na Yale University (2001-2004), e posteriormente assumiu a posição de cientista-pesquisador pela Yale University School of Medicine (2004-2006). Sua área de atuação em pesquisa é a Medicina Computacional, que inclui o desenvolvimento de metodologias para o processamento e análise de imagens biomédicas. Ele é o responsável pelo Medical Imaging Group (MIG), sediado no IME-USP, que visa o desenvolvimento de pesquisa e formação de profissionais com foco de atuação em medicina computacional.

Informações coletadas do Lattes em 10/07/2024

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciência da Computação

1997 - 2001

Wright State University, Wright
Título: A Computer-Aided Design System for 3D Medical Image Segmentation
Orientador: Ardeshir Goshtasby
Bolsista do(a): Dayton Area Graduate Studies Institute, DAGSI, Estados Unidos.

Mestrado em Ciência da Computação

1995 - 1997

Wright State University, Wright
Título: Segmentation of MR brain images for delineation of tumors,Ano de Obtenção: 1997
Orientador: Ardeshir Goshtasby
Bolsista do(a): Wright State University, Wright, Estados Unidos.

Graduação em Ciência da Computação

1990 - 1993

Pontifícia Universidade Católica do Paraná
Título: RITMAN: Sistema Automático de Pesquisa de Rotas Ótimas na Rede Integrada de Transporte de Curitiba
Orientador: Maria Alexandra da Cunha

Curso técnico/profissionalizante

1987 - 1989

Organização Paranaense de Ensino Técnico

Pós-doutorado

2017

Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: A bioimaging tour in human health, Ano de obtenção: 2017., Palavras-chave: bioimagens; multimodalidade; multiescala., Grande área: Ciências da Saúde

2001 - 2003

Pós-Doutorado. , Yale University, YALE, Estados Unidos.

Formação complementar

2003 - 2003

Developer's Training for VTK. (Carga horária: 12h). , Kitware, KITWARE, Estados Unidos.

2002 - 2002

Brainvoyager. (Carga horária: 12h). , University Of Maastricht, MAASTRICHT, Holanda.

2002 - 2002

Analysis of fMRI. (Carga horária: 20h). , University of Wisconsin - Milwaukee, UWM, Estados Unidos.

2000 - 2000

Advanced Programming With IDL. (Carga horária: 20h). , Wright State University, Wright, Estados Unidos.

1992 - 1992

C++ Programming Language. (Carga horária: 20h). , Wright State University, Wright, Estados Unidos.

1992 - 1992

English Language and American Culture. (Carga horária: 20h). , Wright State University, Wright, Estados Unidos.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Processamento e Análise de Imagens Médicas.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Computação Gráfica.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Visão Computacional.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Aprendizagem computacional.

Grande área: Ciências da Saúde / Área: Medicina / Subárea: Radiologia Médica.

Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica.

Organização de eventos

SAVOY-NAVARRO, A. ; VAQUERO, J. J. ; ALLPORT, P. ; GARRIDO, M. C. ; CATTAI, A. ; COTTER, G. ; HEWITT, J. ; READHEAD, A. ; SHIPSEY, I. ; UNNO, Y. ; TOWNSEND, D. ; XIE, Q. ; ZIEGLER, S. ; FONOFF, E. ; GUBITOSO, M. D. ; OTADUY, M. C. ; LEPINE, J. ; LOPES, C. G. ; NEMMEN, R. ; REHDER, G. ; SANTOS, E. M. ; SUAIDE, A. A. P. ; JACKOWSKI, M.P. . 4th Summer School on INtelligent signal processing for FrontIEr Research and Industry. 2017. (Outro).

Participação em eventos

23rd Annual Meeting and Exhibition (ISMRM).Alterations in Myofiber Architecture in Response to Left Ventricular Pressure Overload are Associated with the Upregulation of Genes Encoding for Cell Adhesion and Matrix Remodeling. 2015. (Encontro).

SCMR - Euro CMR 2015 Joint Scientific Sessions. Differential response of the left and right ventricles to pressure overload revealed with diffusion tensor MRI tractography of the heart in vivo. 2015. (Congresso).

SPIE Medical Imaging. Characterization of vascular tree architecture using the Tokunaga taxonomy. 2015. (Congresso).

Brazil-UK Frontiers of Engineering Symposium.A Cloud-based Medical Imaging Exploration and Analysis System.. 2014. (Simpósio).

Joint Annual Meeting International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM).Detection of Infarcted and Arrhythmogenic Myocardium with DTI Tractography and Electroanatomical Voltage Mapping. 2014. (Encontro).

XXVII SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images. Graph Based Characterization of Microcirculation in Sepsis Using Sidestream Dark Field Imaging. 2014. (Congresso).

20th IEEE International Conference on Image Processing (ICIP). Image foresting transform with geodesic star convexity for interactive image segmentation. 2013. (Congresso).

21st Annual Meeting & Exhibition (ISMRM).Diffusion MRI Tractography of the Developing Human Fetal Heart. 2013. (Encontro).

SPIE Medical Imaging. A centerline-based estimator of vessel bifurcations in angiography images. 2013. (Congresso).

XXVI SIBGRAPI Conference on Graphics Patterns and Images. Assessment of Steganographic Methods in Medical Imaging. 2013. (Congresso).

15th Annual Scientific Sessions (SCMR).Diffusion MRI Tractography of the Human Heart In Vivo at End-Diastole and End-Systole v. 2012. (Encontro).

20th Annual Meeting and Exhibition (ISMRM).Diffusion MRI Tractography of the Human Heart In Vivo Reveals Differences in Myofiber Organization at End-Diastole and End-Systole. 2012. (Encontro).

19th Annual Meeting of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM). Beyond Qualitative Tractography: A Novel & Reproducible Technique for the Quantitative Analysis of Cardiac Diffusion MR Tractography Datasets In Vivo. 2011. (Congresso).

XXIV SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images. Three-dimensional synthetic blood vessel generation using stochastic L-systems. 2011. (Congresso).

13th Annual Scientific Sessions (SCMR).Regional matrix metalloproteinase activation correlates with microstructure diffusion tensor indices post myocardial infarction. 2010. (Encontro).

15th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition, CIARP. Vessel Centerline Tracking in CTA and MRA Images Using Hough Transform. 2010. (Congresso).

18th Annual Meeting of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine.Assessment of Myocardial Heterogeneity using the Supertoroid-Based Representation of DT-MRI. 2010. (Encontro).

23rd SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images.A Brownian motion simulator for analysis of water diffusion signal in neuronal tissue: an investigation of DT-MRI patterns in the brain. 2010. (Simpósio).

25th International Conference of Image and Vision Computing. Computer-Assisted Segmentation of Brain Tumor Lesions from Multi-sequence Magnetic Resonance Imaging Using the Mumford-Shah Model. 2010. (Congresso).

17th Annual Meeting & Exhibition (ISMRM). Myocardial Remodeling in Chronic Porcine Model: A DT-MRI Study Using the Toroid-Based Representation. 2009. (Congresso).

11th International Conference Medical Image Computing and Computer-Aided Interventio. Physical-space refraction-corrected transmission ultrasound computed tomography made computationally practical. 2008. (Congresso).

12ème Congrès du GRAMM. Application du Modèle Toroïdale à la Caractérisation Structurelle du Cerveau Humain en IRM de Diffusion. 2008. (Congresso).

14th WW on Schizophrenia and Bipolar Disorders. Voxel-Based Study of Diffusion Tensor Imaging in Bipolar I Disorder: Exploratory Analysis, and Focus on Frontal White Matter and Corpus Callosum. 2008. (Congresso).

16th Annual Meeting & Exhibition (ISMRM).Toroid-Based Characterization of Cardiac DT-MRI. 2008. (Encontro).

13th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM).BioIImage Suite: New tools for funcional image analysis. 2007. (Encontro).

62nd Annual Society of Biological Psychiatry Meeting.Anterior Cingulum Abnormalities in Bipolar Disorder Determined. 2007. (Encontro).

Annual Sessions of the American Psychiatric Association - Medscape Perspectives.Abnormalities in white matter structure in autism spectrum disorders detected by diffusion tensor imaging. 2007. (Encontro).

BMES 2007 Annual Fall Meeting.Macrostructure Quantification Using Toroidal Metric Derived From DTMRI: Phantom Validation. 2007. (Encontro).

3rd International Symposium on Biomedical Imaging ? IEEE. Brain Shape Characterization from Deformation. 2006. (Congresso).

9th Annual Scientific Sessions - Society for Cardiovascular Magnetic Resonance (SCMR).Reconstruction of Myocardial Fiber Sheets using Diffusion Tensor Imaging. 2006. (Encontro).

11th Annual Meeting of the Human Brain Mapping.Abnormal Cingulum in Patients with Bipolar Disorder: a Diffusion Tensor Imaging Study. 2005. (Encontro).

8th International Conference Medical Image Computing and Computer-Aided Intervention. A Computer-Aided Design System for Revision of Segmentation Errors. 2005. (Congresso).

7th International Conference Medical Image Computing and Computer Aided Intervention MICCAI. Estimation of Anatomical Connectivity by Anisotropic Front Propagation and Diffusion Tensor Imaging. 2004. (Congresso).

70th Annual Scientific Convention & Meeting Society of Biological Psychiatry.Corpus Callosum in Maltreated Children with PTSD: A diffusion tensor imaging study. 2003. (Encontro).

48th Society of Nuclear Medicine Annual Meeting (SNM).CRASIS - An Automated Coregistration Software Program for Brain Images. 2001. (Encontro).

SIGGRAPH Annual Conference. 2001. (Congresso).

SPIE's Symposium on Medical Imaging 2000: Image Processing.Representing 3D regions with rational Gaussian surfaces. 2000. (Simpósio).

SPIE's Symposium on Medical Imaging 1999: Image Processing.Interactive Tools for Image Segmentation. 1999. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: Leando Ticlia de La Cruz

HIRATA, N. S. T.; MEDEIROS, F. N. S.;Jackowski, Marcel P. Quantificação de angiogênese em imagens de membranas corioalantóicas de embrião de galinha. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Lucy Alsina Choque Mansilla

MIRANDA, P. A. V.; PAPA, J. P.;Jackowski, Marcel P. Transformada imagem-floresta com funções de conexidade não suaves: pesos adaptativos, polaridade de borda e restrições de forma. 2014. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Marlon Polo de Melo

De Melo, MP; Sobreira C;Jackowski, M. P.; Filipe, JC. Método de apoio à pesquisa e ao diagnóstico clínico na identificação de acometimento em diferentes tipos de fibras musculares por meio de imagens histopatolófgicas. 2013. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Sylvio Ximenez de Azevedo Neto

TERADA, R.; Takada HH;Jackowski, M. P.. Cifra Multicanal para maior segurança em redes TCP/IP. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Miguel Angel Galarreta Valverde

JACKOWSKI, M.; HASHIMOTO, R. F.; M. A. Gutierrez. Geração de redes vasculares sintéticas tridimensionais utilizando sistemas de Lindenmayer estocásticos e parametrizados. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Hugo Cesar Pessotti

MACEDO, A. A.; GRUBER, A.;JACKOWSKI, M.. Uso de mapeamento conceitual para redução da descontinuidade semântica na recuperação de imagens microscópicas de carcinoma tireoidiano. 2012. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Luís Roberto Pereira de Paula

H. J. Roberto; M. A. Gutierrez;JACKOWSKI, M.. Segmentação de Imagens SPECT/Gated-SPECT do miocárdio e geração de um mapa polar. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jihan Mohammad Zoghbi

JACKOWSKI, M.MAMEDE, M.; HASHIMOTO, R. F.. Segmentação de lesões cerebrais em imagens de ressonância magnética utilizando modelos deformáveis. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Felipe Massicano

Helio Yoriyaz; Alberto S. Todo;JACKOWSKI, M.. Quantificação de imagens tomográficas para cálculo de dose em diagnose e terapia em medicina nuclear. 2010. Dissertação (Mestrado em Tecnologia Nuclear) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Bruno Pera

MORIMOTO, C. H.;JACKOWSKI, M.; OLIVEIRA NETO, M. M.. Reconstrução de faces a partir de múltiplas imagens utilizando um modelo de referência e um conjunto de pontos de controle. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: João Vitor Baldini Soares

SOARES, J. V. B.; MARCONDES, R.;JACKOWSKI, M.; FALCAO, A.. Segmentação de vasos sangüíneos em imagens de retina usando wavelets e classificadores estatísticos. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maysa Malfiza Garcia de Macedo

JACKOWSKI, M.; HASHIMOTO, R. F.; MIRANDA, P. A. V.; M. A. Gutierrez; Conci, A.. Detecção e extração de redes vasculares usando transformada de Hough. 2012. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Marcus Vinicius Zanneti

Geraldo B. Filho; Acioly L. T. de Larceda;JACKOWSKI, M.; O. V. Forlenza; Vieira, R. M. Classificação automatizada de padrões morfológicos cerebrais complexos em indivíduos com primeiro episódio psicótico: avaliação de desempenho diagnóstico. 2012. Tese (Doutorado em Psiquiatria) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paulo Vechiatto de Miranda

FALCAO, A.;JACKOWSKI, M.; MARCONDES, R.; PEDRINI, H.. Reconhecimento e Delineamento Sinérgicos de Objetos em Imagens com Aplicações em Medicina. 2009. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Thiago Teixeira Santos

MORIMOTO, C. H.; H. J. Roberto; TRAINA, A. J. M.; PEDRINI, H.;JACKOWSKI, M.. Detecção e rastreamento de múltiplos objetos em oclusão: integração de múltiplas câmeras por transformada de Hough. 2009. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: John Sims

M. A. Gutierrez; KIM, H. Y.;Jackowski, Marcel P. Directional Analysis of Cardiac Lenft Ventricular Motion in Medical Images. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Lúcio Valentin

JACKOWSKI, MARCEL; WASSERMANN, R.; NUNES, F. L. S.. Representação de informações não-estruturadas de laudos de exames radiológicos através de modelagem interativa de grafos conceituais. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Anderson Carlso Moreira Tavares

Jackowski, Marcel P; J. Barrera; MIRANDA, P. A. V.. Segmentação de Superfícies Homogêneas Utilizando Espaços Perceptual de Cores e Aprendizagem de Máquina. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Pedro Luiz Santos Serra

NAVARRO, R.;Jackowski, Marcel P. Cálculo da Fração de Vazio em Escoamentos Bifásicos (gás/líquido) a partir da identificação de bolhas em imagens digitais. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Tecnologia Nuclear - Reatores) - Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares.

Aluno: Rafael Liberato Roberto

FERREIRA, J. E.; PORTO, F. A. M.;Jackowski, Marcel P. Reduzindo a complexidade da adaptação de instâncias em Sistemas de Informação Cientes de Processos. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jihan Zoghbi

Jackowski, Marcel P; J. Barrera;KOH, I. H. J.. Detecção e Caracterização de Degeneração da Microcirculação em Pacientes com Sepse Usando Imagens por Sidestream Dark Field. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Felipe Massicano

Helio Yoriyaz;JACKOWSKI, M.; DURHAM, A.. Desenvolvimento de um sistema de planejamento em radioterapia, braquiterapia, medicina nuclear e BNCT com o uso código MCNP/MCNPX. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Tecnologia Nuclear - Reatores) - Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares.

Aluno: Gabriela Paola Ribeiro Banon

Fonseca Pinto, A. C.; Sterman, F. A.; Domingos, L. O.; Hagen, S. C. F.;JACKOWSKI, M.. Mensurações radiográficas computadorizadas da silhueta cardíaca de Poodles clinicamente normais e portadores de doença degenerativa valvar de mitral. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Clínica Cirúrgica Veterinária) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maya Malfiza Garcia de Macedo

JACKOWSKI, M.; MARCONDES, R.; AMARO, E.. Detecção e extração de redes vasculares usando transformada de Hough. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Marcelo Hashimoto

MARCONDES, R.; TORRES, R. S.; MORIMOTO, C. H.; H. J. Roberto;JACKOWSKI, M.. Detecção de Objetos por Reconhecimento de Grafos-Chave. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Aluno: [Nome removido após solicitação do usuário]

MARCONDES, R.; HASHIMOTO, R. F.;JACKOWSKI, M.. Análise de Formas de Estruturas de Ramificação. 2007 - Instituto de Matemática e Estatística.

Aluno: Guilherme Policicio Rey

H. J. Roberto; MORIMOTO, C. H.;Jackowski, Marcel P. Um arcabouço para aquisição e análise de imagens RGB-D. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Caio de Moraes Braz

MIRANDA, P. A. V.; H. J. Roberto;Jackowski, Marcel P. Segmentação de Imagens pela Transformada Imagem-Floresta com Faixa de Restrição Geodésica. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jefferson Serafim Ascaneo

H. J. Roberto; LOPES, R.;Jackowski, Marcel P. Um estudo de algoritmos de reconstrução, focalização e segmentação de imagens de holografia digital para o aprimoramento da classificação de organismos planctônicos. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Leandro Ticlia de La Cruz

HIRATA, N.;JACKOWSKI, M.; MIRANDA, P. A. V.. Quantificação de angiogênese em imagens de membranas corioalantóicas de embrião de galinha. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fabio Rafael da Rosa

MORIMOTO, C. H.; H. J. Roberto;JACKOWSKI, MARCEL PAROLIN. Realidade Aumentada usando Imagens Anamórficas. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Lucy Choque Mansilla

Paulo Miranda; HIRATA, N.;Jackowski, M. P.. Segmentação de Imagens Via Transformada Imagem-Floresta com Funções de Conexidade Não Suaves. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: David Macedo da Conceição

JACKOWSKI, M.; J. Barrera; Marcondes, R.. Segmentação de estruturas de substância branca cerebral via modelos deformáveis em imagens do tensor de difusão. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: William Seiti Mizuta

JACKOWSKI, M.; HIRATA, N.; RINO NETO, J.. Automatização da análise cefalométrica a partir de imagens tridimensionais de tomografia computadorizada. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paulo Carlos Ferreira dos Santos

GUBITOSO, M. D.;Jackowski, M. P.; SATO, L. M.. Ferramentas para Extração de Informações de Desempenho em GPUs NVIDIA. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Luiz Fernando Oliveira Corte Real

JACKOWSKI, M.; M. A. Gutierrez; QUEIROZ, M. G.. Codificação e compressão iterativa de sinais biomédicos. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Beraldo Costa Leal

GUBITOSO, M. D.; BATISTA, D. M.;JACKOWSKI, M.. Uma arquitetura modular baseada em sistema de arquivos para monitoramento de pacotes de rede no sistema operacional GNU/Linux. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Renata Callado Borges

JACKOWSKI, M.; VICENTE, R.; OTADUY, M. C. G.. Síntese de imagens de difusão por ressonância magnética com aplicações em neuroimagem. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Sylvio Ximenez de Azevedo

TERADA, R.;JACKOWSKI, M.; ALBINI, L. C. P.. Vulnerabilidade e Segurança do Protocolo A5 do GSM. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Adam Ferreira Leite

GUBITOSO, M. D.;JACKOWSKI, M.; MASCARENHAS, W. F.; CAMPOS, E. G. L.. Otimização de fluxo de caixa usando algoritmos genéticos em placas gráficas: um experimento. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

Aluno: Cristiano Perez Garcia

HIRATA, N.; MIRANDA, P. A. V.;Jackowski, M. P.. Segmentação de Estruturas Cerebrais em Exames de Tomografia Computadorizada. 2011.

Aluno: Miguel Angel Galarreta Valverde

JACKOWSKI, M.; H. J. Roberto; HASHIMOTO, R. F.. Redes Vasculares Sintéticas: Uma metodologia de geração utilizando L-systems estocásticos. 2011. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

TANAKA, H.; CUNHA, W. C.;JACKOWSKI, M.. Concurso de provas e títulos para provimento de cargo da carreira de Magistério Superior da UFABC, EDITAL: 141/2009. 2009. Universidade Federal do ABC.

JACKOWSKI, M.; Zuffo, M. K.; Magalhães, L. P.; Kogler, J. E.; Marcondes, R.. Concurso Público de Professor Doutor - Roberto Hirata Júnior. 2008. Universidade de São Paulo.

Orientou

Thiago Nunes

Aceleração de registro não linear de imagens médicas por hardware gráfico; Início: 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Rafael Manzo

Análise de Imagens de Ressonância Magnética por Espectro de Difusão; Início: 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Caio Valente

Renderização de ambientes públicos realistas com modelagem dinâmica de iluminação; Início: 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Rafael Sampaio

Segmentação de imagens de ressonância magnética de tempo real (rtMRI); Início: 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Igor Topcin

Um sistema de gerenciamento de workflows para análise de imagens médicas em nuvem; Início: 2012; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Miguel Angel Galarreta Valverde

Parametrização e caracterização de estruturas vasculas tridimensionais em imagens angiográficas; Início: 2013; Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Jihan Zoghbi

Um método computacional para a análise de alterações microvasculares e teciduais de órgãos na sepse usando a técnica de imagens Sidestream Dark Field (SDF); Início: 2012; Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Lúcio Valentin

A COMPUTER-AIDED DIAGNOSTIC IMAGING REPORT SYSTEM USING JOINT TEXT-IMAGE MINING; Início: 2011; Tese (Doutorado em doutorado em tecnologia e Sociedade) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná; (Orientador);

David Macedo da Conceição

Avaliação de medidas de similaridade entre tensores aplicada a imagens do tensor de difusão por ressonância magnética; 2014; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Renata Callado Borges

Simulador de Imagens de Ressonância Magnética de Difusão; 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Luiz Fernando Oliveira Corte Real

Codificação e compressão iterativa de sinais biomédicos; 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Miguel Angel Galarreta Valverde

Geração de redes vasculares sintéticas tridimensionais utilizando sistemas de Lindenmayer estocásticos e parametrizados; 2012; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Jihan Zoghbi

Segmentação de Tumores Cerebrais em Imagens de Ressonância Magnética; 2011; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Maysa Malfiza Garcia Macedo

Detecção e caracterização de redes vasculares usando a transformada de Hough em imagens angiográficas; 2012; Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Choukri Mekkaoui

Visualização e Representação de Campos Tensoriais de Difusão; 2008; Athinoula A; Martinos Center for Biomedical Imaging,; Marcel Parolin Jackowski;

Thiago Nunes

Marching cubes usando CUDA e OpenCL: Uma avaliação de desempenho; 2012; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Rafael Reggiani Manzo e Giancarlo Rigo

Integração de campos vetoriais com auxílio de hardware: Aplicação de OpenCL em VTK; 2012; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Rafael Sampaio

Métodos de esteganografia em imagens médicas; 2012; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Andrew Toshiaki Nakayama Kurauchi e Victor Harada

Pandora's Box Graphics Engine: Uma Engine Gráfica com Aplicação em Visualização Científica; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Hugo Hiroshi Kondo e Otávio J

M; Santana; MIPRenderer: Uma ferramenta para realizar projeções MIP de angiogramas utilizando VTK e Qt; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Luiz Fernando Corte Real

Simulação do Movimento Browniano em 3D em Tempo Real; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Daniel Ferreira Santos e Eduardo B

Mascarenhas Apolinário; Reconstrução e Síntese de Cenários Tridimensionais a partir de Imagens Estereoscópicas; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Marcos Bonci

Medsquare: Plataforma Modular Para Exploração de Imagens Tomográficas; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Omar Mahmoud Abou e Otavio Moura do Nascimento

Criação de portais renderizados em mundos 3D; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Tamar Rudnick

Neuropathological Abnormalities of the Corpus Callosum in Bipolar Disorder: A Diffusion Tensor Imaging Study; 2004; 20 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bachelor in Psychology) - Yale University; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Renata Callado Borges

Criação de Imagens Sintéticas de Ressonância Magnética de Difusão; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

Ben Thomson

Segmentation of Vasculature from CT images; 2005; Orientação de outra natureza - Yale University - School of Medicine; Orientador: Marcel Parolin Jackowski;

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Jackowski, M. P. ; GOSHTASBY, Ardeshir ; SATTER, M. . Representing 3D regions with rational Gaussian surfaces. 2000. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Jackowski, M. P. ; GOSHTASBY, Ardeshir ; SATTER, M. . Interactive Tools for Image Segmentation. 1999. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

MEKKAOUI, C. ; CONSTABLE, R Todd ; JACKOWSKI, M. . Toroid-Based Characterization of Diffusion Tensor Fields. 2009.

JACKOWSKI, M. ; PAPADEMETRIS, X. . Bioimagesuite. 2006.

JACKOWSKI, M. . CADSEG: Computer Aided Design Software for Segmentation of Medical Images. 2001.

JACKOWSKI, M. ; GOSHTASBY, Ardeshir . SKINSEG: Skin Cancer Segmentation Software. 1999.

JACKOWSKI, M. . DOCTOR: A program for delineation of brain tumors. 1997.

JACKOWSKI, M. ; ZANELLA, M. C. . RITMAN: Um novo jeito de pegar ônibus em Curitiba. 1994.

Jackowski, M. P. . Emissão de 05 Pareceres para a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP). 2015.

Jackowski, M. P. . Emissão de 05 Pareceres para a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP). 2014.

Jackowski, M. P. . Emissão de 05 Pareceres para a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP). 2013.

Jackowski, M. P. . Aula sobre: Processamento e Análise de Imagens do Tensor de Difusão, na Rede de Hospitais Sarah Kubitschek em Brasília/ DF. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

2016 - Atual

Armazenagem, Modelagem e Análise de Sistemas Dinâmicos para Aplicações, Descrição: A surpreendente e rápida evolução da tecnologia deu origem a uma nova era de descoberta de conhecimento científico. Essa nova era da ciência, conhecida como e-Science é descrita como uma nova ciência computacional e composta por uma equipe multidisciplinar que exige novas metodologias para o armazenamento, modelagem e análise de dados. Em particular, o desenvolvimento de sistemas de software transacionais e analíticos para aplicações e-Science visto como sistemas dinâmicos apresenta novos desafios computacionais. Entre eles, destacam-se os desafios dos processos de descoberta de conhecimento científico que, na maioria das vezes, envolvem mudanças frequentes de requisitos para armazenagem, modelagem e análise de dados. A necessidade de abordar sistemas dinâmicos científicos para tratar complexas aplicações de e-Science despertou a comunidade científica para a necessidade de sistemas de software robustos e evolutivos para atender a esses novos desafios. Sistema dinâmico é um arcabouço matemático clássico para representar fenômenos que evoluem no tempo e que são de grande interesse na ciência. Neste projeto, nosso principal objetivo é desenvolver modelos computacionais e metodologias para apoiar as aplicações e-Science. Nossa pesquisa fundamental cobre três principais áreas: armazenagem, modelagem e análise de sistemas dinâmicos. Essas áreas de pesquisa são importantes e relevantes para o Programa e-Science FAPESP já que muitos dos desafios atuais de e-Science estão relacionadas ao tratamento adequado dos sistemas dinâmicos. Assim, pretendemos desenvolver e aplicar metodologias computacionais que irão facilitar o desenvolvimento de aplicações e-Science contribuindo assim para a melhoria do conhecimento científico mundial, respeitando as restrições legais e éticas na gestão de dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Roberto Hirata Júnior - Integrante / Junior Barrera - Integrante / Marco Dimas Gubitoso - Integrante / Routo Terada - Integrante / João Eduardo Ferreira - Coordenador / Paulo Sergio Graziano Magalhães - Integrante / André Fujita - Integrante / André Santanché - Integrante / Antonio Maria Francisco Luiz Jose Bonomi - Integrante / Ariane Machado Lima - Integrante / Carlos Eduardo Driemeier - Integrante / Cléver Ricardo Guareis de Farias - Integrante / David Corrêa Martins Junior - Integrante / Ester Cerdeira Sabino - Integrante / Fábio Vale Scarpare - Integrante / Gisela Tunes da Silva - Integrante / Henrique Coutinho Junqueira Franco - Integrante / Karina Valdivia Delgado - Integrante / Leliane Nunes de Barros - Integrante / Luciano Vieira de Araújo - Integrante / Marcelo da Silva Reis - Integrante / Marcio Katsumi Oikawa - Integrante / Maria Teresa Borges Pimenta Barbosa - Integrante / Michelle Cristina Araujo Picoli - Integrante / Márcio Ferreira da Silva - Integrante / Otavio Cavalett - Integrante / Vera Lúcia Reis de Gouveia - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2016 - Atual

Diagnóstico Diferencial de Transtornos Persistentes de Fala Utilizando Imagens Dinâmicas do Trato Vocal por Ressonância Magnética, Descrição: Crianças com transtornos residuais ou persistentes da fala (TRPF) apresentam dificuldades na produção da fala em idades superiores às esperadas para a aquisição total das regras fonológicas de um idioma, comprometendo a comunicação social e alfabetização. Os TRPF englobam uma expressiva diversidade de quadros que podem estar associados ou decorrer de alterações fonológicas motoras da fala ou alterações vocais. Como várias dessas características podem ser observadas em diferentes quadros de alteração de fala, é fundamental o desenvolvimento de metodologias que auxiliem na tomada de decisão para o diagnóstico diferencial e condução do tratamento adequado. Recentes avanços na técnica de imagens por ressonância magnética (RM) possibilitaram a observação dos processos ocultos de articulação durante a produção da fala em tempo real. Este projeto de pesquisa tem como objetivo principal a diferenciação das alterações da produção da fala em crianças com apraxia da fala e crianças com outros quadros de transtornos de fala utilizando imagens dinâmicas de RM do trato vocal. Serão desenvolvidas metodologias para identificação de padrões articulatórios a partir das imagens RM, que serão correlacionados com avaliações de input e output dos processamentos de fala. Com este trabalho pretende-se atingir um salto conceitual no processo de diagnóstico diferencial de TRPF, com a integração de RM e técnicas avançadas de análise de imagem na bateria de avaliações fonoaudiológicas. Este projeto é uma parceria internacional entre USP, UNIFESP, TAMU e MGH, unindo especialistas em Fonoaudiologia, processamento de fala, aquisição de imagens e análise de imagens médicas. O produto final deste esforço em conjunto possibilitará o manejo adequado e a reabilitação de crianças com déficits de comunicação oral, reduzindo os custos associados com saúde e educação.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Coordenador / Andrea Parolin Jackowski - Integrante / Choukri Mekkaoui - Integrante / Clara Regina Brandão de Ávila - Integrante / Ricardo Gutierrez-Osuna - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2014 - 2015

Classification of Gender and Ethnicity using 3D Modeling and Multi-resolution Operators, Descrição: Pesquisa e desenvolvimento de metodologias para classificação de gênero e raça em vídeos de câmeras de segurança.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Roberto Hirata Júnior - Integrante / Junior Barrera - Coordenador., Financiador(es): Hitachi - Central Research Laboratory - Cooperação.
2013 - Atual

Busca inteligente em laudos e imagens de ultrassonografia, Descrição: Este projeto tem como objetivo a pesquisa e desenvolvimento de uma ferramenta de software capaz de realizar pesquisas em laudos e imagens de exames de ultrassonografia feitos através do Sistema Único de Saúde (SUS). Este projeto será realizado em parceria com o Instituto de Pesquisa e Ensino em Medicina Diagnóstica e Terapêutica (IPmed), que disponibilizará a base de dados. O desenvolvimento desta ferramenta possibilitará a extração de informações sobre a situação da saúde dessa parcela da população que utiliza os serviços do SUS.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Coordenador / LÚCIO VALENTIN - Integrante., Financiador(es): IPMED - Auxílio financeiro.
2012 - Atual

Um método computacional para a análise de alterações microvasculares e teciduais de órgãos na sepse usando a técnica de imagens Sidestream Dark Field (SDF), Descrição: Novos métodos diagnósticos e terapêuticos no suporte do paciente séptico pouco vem modificando o cenário da evolução com elevado índice de mortalidade. O comprometimento progressivo da microcirculação, relacionado com o aumento da intensidade da resposta inflamatória sistêmica na sepse, tem sido considerado o "motor" da gênese da Síndrome de Disfunção de Múltiplos Órgãos que frequentemente evolui para o óbito. No entanto, apesar da reconhecida importância da disfunção microcirculatória, ainda carece de método de análise capaz de correlacionar a gravidade da sepse com o grau de comprometimento da microhemodinâmica capturada pelo microscópio portátil Sidestream Dark Field Imaging (SDF). A classificação da gravidade da sepse por meio da análise da disfunção microcirculatória seria de grande contribuição no diagnóstico da gravidade e na conduta terapêutica. Neste contexto, este projeto tem como objetivo desenvolver uma metodologia computacional para a determinação do grau de comprometimento microvascular e tecidual na sepse. Métodos: As imagens da microcirculação de órgãos abdominais foram capturadas com SDF após a indução da sepse com letalidades conhecidas mediante a inoculação IV de 3 de E.coli em ratos Wistar-EPM, 250 a 300 gramas. As imagens coletadas in vivo serão submetidas à análise com variados métodos computacionais que possam mensurar o grau de comprometimento da microhemodinâmica em fases distintas de gravidade da sepse. Após a escolha do método de análise, a sua validação será realizada comparando-se com a análise histológica dos respectivos órgãos de onde foram geradas as imagens in vivo. Ao final do projeto espera-se produzir um meio de diagnóstico rápido, em tempo real, contribuindo como um método de monitoramento da sepse.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Coordenador / Jihan Zoghbi - Integrante / IVAN HONG JUN KOH - Integrante.
2011 - 2013

Representação Supertoroidal do Tensor de Difusão: Análise da Substância Branca Cerebral no Transtorno Bipolar, Descrição: A substância branca (SB) tem importância fundamental na compreensão das funções ce- rebrais tendo em vista a rede de comunicação neural que ela estabelece. Sabe-se que os transtornos psiquiátricos, incluindo o transtorno afetivo bipolar (TAB), estão associados a anormalidades sutis de SB que demandam métodos robustos e eficientes de análise. A imagem por tensor de difusão (DTI) é uma modalidade promissora de imagens capaz de caracterizar alterações estruturais em SB. No entanto, a sua natureza multidimensional e multivariada faz com que o estudo neuropatológico em TAB torne-se uma tarefa desafia- dora. Assim, faz-se necessário o uso de métodos de análise de DTI que sejam robustos e apropriados para entendermos o papel destas anormalidades. Este projeto visa o desen- volvimento e a avaliação de uma nova metodologia de análise utilizando a representação supertoroidal do tensor de difusão. O objetivo desta representação é aprimorar a caracte- rização da SB de forma visual e quantitativa através de novos índices de difusividade e anisotropia. Experimentos utilizando phantoms revelaram que estes índices são sensíveis à mudanças estruturais e que podem descrever alterações no cérebro. Resultados prelimi- nares utilizando DTI de um cérebro humano normal mostraram que tratos de SB podem ser identificados sem ambiguidades pelo modelo supertoroidal. Para avaliar a eficácia desta nova metodologia, imagens DTI de pacientes com transtorno bipolar e de indiví- duos saudáveis serão analisadas e comparadas estatisticamente. Desta forma, esperamos que esta abordagem possa avançar o conhecimento da neurofisiologia do TAB e trazer informações inéditas para a caracterização da SB em ou. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Coordenador / Mekkaoui, Choukri - Integrante / Sheila Caetano - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2010 - Atual

Discriminação Diagnóstica e Avaliação Longitudinal de Alterações Cerebrais, Imunológicas e Moleculares Estado-Dependentes em Indivíduos com Primeiro Episódio Psicótico, Descrição: O presente projeto propõe-se a estudar pacientes com primeiro episódio psicótico e de mania (transtorno bipolar tipo I) provenientes de uma região circunscrita da cidade de São Paulo combinando parâmetros de neuroimagem, medidas de atividade inflamatória (dosagem de citocinas e expressão genética) e biologia molecular (determinação de atividade de enzima fosfolipase A2) através de um desenho longitudinal, intra-sujeito. Seus objetivos compreendem: avaliar a capacidade de discriminação diagnóstica entre pacientes apresentando seu primeiro episódio psicótico, primeiro episódio de mania e controles saudáveis utilizando métodos de classificação de padrões morfológicos complexos; confirmar a existência de alterações morfométricas, de anisotropia e difusividade cerebrais estado-dependentes na esquizofrenia e transtorno bipolar, a fim de investigar a hipótese de que os estados psicóticos e maníacos agudos estariam associados a alterações cerebrais volumétricas e microestruturais agudas, e ponderar a influência destes estados na acurácia do classificador por ressoância magnética; avaliar a atividade inflamatória sistêmica dos pacientes em relação aos controles na fase aguda e após 2 meses de remissão através de medidas de citocinas e expressão de genes relacionados às respostas imunes Th1, Th2 e Th17; e dosar a atividades das enzima PLA2 responsável pela metabolização de fosfolipídeos de membrana celular, nos pacientes em comparação aos controles na fase aguda e após 2 meses de remissão. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / ZANETTI, M. V. - Integrante / BUSATTO, G. F. - Coordenador / Paulo Rossi Menezes - Integrante / Marcia Scafzufca - Integrante / Wagner Gattaz - Integrante / Luiza Guilherme Guglielmi - Integrante / Leda Leme Talib - Integrante / Simone Regina dos Santos - Integrante / Christos Dvatzikos - Integrante.
2004 - 2006

White Matter Analysis from MR Diffusion Imaging, Descrição: Develop methods for robust and accurate connectivity measurement in white matter and parcellation of white matter; evaluate and validate white matter methods using synthetic, phantom and real images; study and evaluate the application of these methods for measuring regional white matter differences.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Maolin Qiu - Integrante / Todd Constable - Integrante / Lawrence Staib - Coordenador., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro.
2004 - 2006

In-vivo detection and quantification of matrix metalloproteinases using evolution of post-myocardial infarction, Descrição: In-vivo detection and quantification of MMP activity and changes in LV deformation and geometry post-MI.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Albert J Sinusas - Coordenador / Lawrence Staib - Integrante., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro.

Projetos de desenvolvimento

2006 - 2011

Bioimage Suite: A multiplatform image analysis package, Descrição: BioImage Suite is an integrated image analysis software suite developed at Yale and (will be) released under the GNU General Public License. BioImage Suite has been extensively used at different labs at Yale for the last 3-4 years. BioImage Suite has extensive capabilities for both neuro/cardiac and abdominal image analysis and state of the art visualization. Many packages are available that are highly extensible, and provide functionality for image visualization and registration, surface editing, cardiac 4D multi-slice editing, diffusion tensor image processing, mouse segmentation and registration, and much more. It can be intergrated with other biomedical image processing software, such as FSL and SPM. This site provides information, downloads, documentation, and other resources for users of the software.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Xenophon Papademetris - Coordenador / Hirohito Okuda - Integrante., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
2014 - Atual

A Cloud-based Medical Imaging Exploration and Analysis Platform, Descrição: Desenvolvimento de uma plataforma de análise de imagens médicas baseada em nuvem.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Coordenador / Mekkaoui, Choukri - Integrante.
2006 - 2011

Bioimage Suite: A multiplatform image analysis package, Descrição: BioImage Suite is an integrated image analysis software suite developed at Yale and (will be) released under the GNU General Public License. BioImage Suite has been extensively used at different labs at Yale for the last 3-4 years. BioImage Suite has extensive capabilities for both neuro/cardiac and abdominal image analysis and state of the art visualization. Many packages are available that are highly extensible, and provide functionality for image visualization and registration, surface editing, cardiac 4D multi-slice editing, diffusion tensor image processing, mouse segmentation and registration, and much more. It can be intergrated with other biomedical image processing software, such as FSL and SPM. This site provides information, downloads, documentation, and other resources for users of the software.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Xenophon Papademetris - Coordenador / Hirohito Okuda - Integrante., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
2014 - Atual

A Cloud-based Medical Imaging Exploration and Analysis Platform, Descrição: Desenvolvimento de uma plataforma de análise de imagens médicas baseada em nuvem.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Coordenador / Mekkaoui, Choukri - Integrante.
2006 - 2011

Bioimage Suite: A multiplatform image analysis package, Descrição: BioImage Suite is an integrated image analysis software suite developed at Yale and (will be) released under the GNU General Public License. BioImage Suite has been extensively used at different labs at Yale for the last 3-4 years. BioImage Suite has extensive capabilities for both neuro/cardiac and abdominal image analysis and state of the art visualization. Many packages are available that are highly extensible, and provide functionality for image visualization and registration, surface editing, cardiac 4D multi-slice editing, diffusion tensor image processing, mouse segmentation and registration, and much more. It can be intergrated with other biomedical image processing software, such as FSL and SPM. This site provides information, downloads, documentation, and other resources for users of the software.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Xenophon Papademetris - Coordenador / Hirohito Okuda - Integrante., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
2014 - Atual

A Cloud-based Medical Imaging Exploration and Analysis Platform, Descrição: Desenvolvimento de uma plataforma de análise de imagens médicas baseada em nuvem.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Coordenador / Mekkaoui, Choukri - Integrante.
2006 - 2011

Bioimage Suite: A multiplatform image analysis package, Descrição: BioImage Suite is an integrated image analysis software suite developed at Yale and (will be) released under the GNU General Public License. BioImage Suite has been extensively used at different labs at Yale for the last 3-4 years. BioImage Suite has extensive capabilities for both neuro/cardiac and abdominal image analysis and state of the art visualization. Many packages are available that are highly extensible, and provide functionality for image visualization and registration, surface editing, cardiac 4D multi-slice editing, diffusion tensor image processing, mouse segmentation and registration, and much more. It can be intergrated with other biomedical image processing software, such as FSL and SPM. This site provides information, downloads, documentation, and other resources for users of the software.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Xenophon Papademetris - Coordenador / Hirohito Okuda - Integrante., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
2014 - Atual

A Cloud-based Medical Imaging Exploration and Analysis Platform, Descrição: Desenvolvimento de uma plataforma de análise de imagens médicas baseada em nuvem.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Coordenador / Mekkaoui, Choukri - Integrante.
2006 - 2011

Bioimage Suite: A multiplatform image analysis package, Descrição: BioImage Suite is an integrated image analysis software suite developed at Yale and (will be) released under the GNU General Public License. BioImage Suite has been extensively used at different labs at Yale for the last 3-4 years. BioImage Suite has extensive capabilities for both neuro/cardiac and abdominal image analysis and state of the art visualization. Many packages are available that are highly extensible, and provide functionality for image visualization and registration, surface editing, cardiac 4D multi-slice editing, diffusion tensor image processing, mouse segmentation and registration, and much more. It can be intergrated with other biomedical image processing software, such as FSL and SPM. This site provides information, downloads, documentation, and other resources for users of the software.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Xenophon Papademetris - Coordenador / Hirohito Okuda - Integrante., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
2014 - Atual

A Cloud-based Medical Imaging Exploration and Analysis Platform, Descrição: Desenvolvimento de uma plataforma de análise de imagens médicas baseada em nuvem.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Coordenador / Mekkaoui, Choukri - Integrante.
2006 - 2011

Bioimage Suite: A multiplatform image analysis package, Descrição: BioImage Suite is an integrated image analysis software suite developed at Yale and (will be) released under the GNU General Public License. BioImage Suite has been extensively used at different labs at Yale for the last 3-4 years. BioImage Suite has extensive capabilities for both neuro/cardiac and abdominal image analysis and state of the art visualization. Many packages are available that are highly extensible, and provide functionality for image visualization and registration, surface editing, cardiac 4D multi-slice editing, diffusion tensor image processing, mouse segmentation and registration, and much more. It can be intergrated with other biomedical image processing software, such as FSL and SPM. This site provides information, downloads, documentation, and other resources for users of the software.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Xenophon Papademetris - Coordenador / Hirohito Okuda - Integrante., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
2014 - Atual

A Cloud-based Medical Imaging Exploration and Analysis Platform, Descrição: Desenvolvimento de uma plataforma de análise de imagens médicas baseada em nuvem.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Coordenador / Mekkaoui, Choukri - Integrante.
2006 - 2011

Bioimage Suite: A multiplatform image analysis package, Descrição: BioImage Suite is an integrated image analysis software suite developed at Yale and (will be) released under the GNU General Public License. BioImage Suite has been extensively used at different labs at Yale for the last 3-4 years. BioImage Suite has extensive capabilities for both neuro/cardiac and abdominal image analysis and state of the art visualization. Many packages are available that are highly extensible, and provide functionality for image visualization and registration, surface editing, cardiac 4D multi-slice editing, diffusion tensor image processing, mouse segmentation and registration, and much more. It can be intergrated with other biomedical image processing software, such as FSL and SPM. This site provides information, downloads, documentation, and other resources for users of the software.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Marcel Parolin Jackowski - Integrante / Xenophon Papademetris - Coordenador / Hirohito Okuda - Integrante., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

Prêmios

2013

Honorable Mention: Assessment of Steganographic Methods in Medical Imaging, XXVI SIBGRAPI Conference on Graphics Patterns and Images.

2005

2nd Best Paper of the MICCAI conference of 2004, MICCAI.

2003

James Hudson Brown - Alexander Coxe Award, Yale University.

2000

Graduate Student Excellence Award, Wright State University.

1999

Graduate Council Scholar, Wright State University.

1994

Prêmio Marcelino Champagnat, PUC-PR.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade de São Paulo, Instituto de Matemática e Estatística. , Rua do Matão, 1010, Bloco CCSL, Sala 218, Cidade Universitária, 05508090 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30910752, URL da Homepage:

Experiência profissional

2006 - Atual

Universidade de São Paulo

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor MS-3, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

06/2006
Ensino, Ciências da Computação, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, MAC5744 - Computação Gráfica, MAC5753 - Sistemas Operacionais, MAC5918 - Processamento e Análise de Imagens Médicas, MAC6913 - Tópicos em Computação Gráfica
06/2006
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, MAC110 - Introdução à Ciência da Computação, MAC115 - Introdução à Computação para Ciências Exatas e Tecnologia, MAC420 - Introdução à Computação Gráfica, MAC438 - Programação Concorrente, MAC422 - Sistemas Operacionais, MAC468 - Tópicos em Computação Gráfica

2004 - 2006

Yale University

Vínculo: Funcionário (Faculty), Enquadramento Funcional: Pesquisador Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2001 - 2004

Yale University

Vínculo: Pósdoutorando, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40

Atividades

07/2004 - 06/2006
Pesquisa e desenvolvimento , School Of Medicine, Dept Of Diagnostic Radiology.,Linhas de pesquisa

1996 - 2001

Wright State University, Wright

Vínculo: Estudante, Enquadramento Funcional: Assistente de Pesquisa, Carga horária: 40

Atividades

01/1996 - 05/2001
Pesquisa e desenvolvimento , Dept Of Computer Science And Engineering, Intelligent Systems Laboratory.,Linhas de pesquisa

1990 - 1993

Pontifícia Universidade Católica do Paraná

Vínculo: Estudante, Enquadramento Funcional: Estudante, Carga horária: 20

Atividades

01/1991 - 12/1992
Estágios , Centro de Ciências Exatas e de Tecnologia, Laboratório Acadêmico de Informática.,Estágio realizado, Desenvolvimento de um pacote para Cálculo Numérico usando a linguagem Pascal.
06/1990 - 12/1990
Estágios , Centro de Ciências Exatas e de Tecnologia, Divisão de Processamento de Dados.,Estágio realizado, Desenvolvimento de software para o ambiente HP-9000, linguagens C e MUMPS.
01/1990 - 06/1990
Estágios , Centro de Ciências Exatas e de Tecnologia, Laboratório Acadêmico de Informática.,Estágio realizado, Traduzir software de Engenharia Civil da linguagem FORTRAN para a linguagem Turbo Pascal.