Ângelo Amâncio Duarte

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• BARROS, GEORGE OLIVEIRA ; NATHAN ANDRADE MULLER DA SILVA, JOSÉ ; MACHADO DE SOUSA PROENÇA, HENRIQUE ; ALMEIDA ARAÚJO, STANLEY ; CAMPOS WANDERLEY, DAVID ; REBOUÇAS DE OLIVEIRA, LUCIANO ; LUIS CONRADO DOS-SANTOS, WASHINGTON ; AMANCIO DUARTE, ANGELO ; DE BARROS VIDAL, FLAVIO . Enhancing Podocyte Degenerative Changes Identification With Pathologist Collaboration: Implications for Improved Diagnosis in Kidney Diseases. IEEE Journal of Translational Engineering in Health and Medicine-JTEHM , v. 12, p. 635-642, 2024.

• SOUZA, LUIZ ; SILVA, JEFFERSON ; CHAGAS, PAULO ; Duarte, Angelo ; SANTOS, WASHINGTON LC-DOS ; OLIVEIRA, LUCIANO . Mouse-to-human transfer learning for glomerulus segmentation. Computer Methods In Biomechanics And Biomedical Engineering-Imaging And Visualization , v. 1, p. 1-10, 2023.

• CALUMBY, RODRIGO T. ; DUARTE, A. A. ; SANTOS, EMANUELE ; SARDER, PINAKI ; DOS-SANTOS, WASHINGTON L.C. ; OLIVEIRA, LUCIANO R. . Toward Real-World Computational Nephropathology. Clinical Journal of the American Society of Nephrology , v. 18, p. 809-812, 2023.

• CHAGAS, PAULO ; SOUZA, LUIZ ; PONTES, IZABELLE ; CALUMBY, RODRIGO ; ANGELO, MICHELE ; Duarte, Angelo ; LC-DOS SANTOS, WASHINGTON ; OLIVEIRA, LUCIANO . Uncertainty-aware membranous nephropathy classification: A Monte-Carlo dropout approach to detect how certain is the model. Computer Methods In Biomechanics And Biomedical Engineering-Imaging And Visualization , v. 1, p. 1-11, 2022.

• DOS-SANTOS, WASHINGTON L. C. ; DE FREITAS, LUIZ A. R. ; DUARTE, ANGELO A. ; ANGELO, MICHELE F. ; OLIVEIRA, LUCIANO R. . Computational pathology, new horizons and challenges for anatomical pathology. Surgical and Experimental Pathology , v. 5, p. 10, 2022.

• SILVA, JEFFERSON ; SOUZA, LUIZ ; CHAGAS, PAULO ; CALUMBY, RODRIGO ; SOUZA, BIANCA ; PONTES, IZABELLE ; Duarte, Angelo ; PINHEIRO, NATHANAEL ; SANTOS, WASHINGTON ; OLIVEIRA, LUCIANO . Boundary-aware glomerulus segmentation: Toward one-to-many stain generalization. COMPUTERIZED MEDICAL IMAGING AND GRAPHICS , v. 2022, p. 102104, 2022.

• SANTOS, JUSTINO DUARTE ; VERAS, RODRIGO DE M.S. ; SILVA, ROMUERE R.V. ; ALDEMAN, NAYZE L.S. ; ARAÚJO, FLÁVIO H.D. ; DUARTE, ANGELO A. ; TAVARES, JOÃO MANUEL R.S. . A hybrid of deep and textural features to differentiate glomerulosclerosis and minimal change disease from glomerulus biopsy images. Biomedical Signal Processing and Control , v. 70, p. 103020, 2021.

• CHAGAS, PAULO ; SOUZA, LUIZ ; ARAÚJO, IKARO ; ALDEMAN, NAYZE ; Duarte, Angelo ; ANGELO, MICHELE ; DOS-SANTOS, WASHINGTON L.C. ; OLIVEIRA, LUCIANO . Classification of glomerular hypercellularity using convolutional features and support vector machine. ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN MEDICINE , v. 103, p. 101808, 2020.

• Góes-Neto, Aristóteles ; DINIZ, MARCELO V.C. ; CARVALHO, DANIEL S. ; BOMFIM, GILBERTO C. ; DUARTE, ANGELO A. ; BRZOZOWSKI, JERZY A. ; PETIT LOBÃO, THIERRY C. ; PINHO, SUANI T.R. ; EL-HANI, CHARBEL N. ; ANDRADE, ROBERTO F.S. . Comparison of complex networks and tree-based methods of phylogenetic analysis and proposal of a bootstrap method. PeerJ , v. 6, p. e4349, 2018.

• CARNEIRO, L. S. ; DUARTE, ANGELO A. . Diferenças no Desempenho de Aplicações Paralelas em Clusters Físicos e Virtuais (Differences in the Performance of Parallel Applications in Physical and Virtual Clusters). IEEE Latin America Transactions , v. 16, p. 604, 2018.

• Barros, Austeclino M ; LOBAO, T. P. ; PINHO, SUANI T.R. ; EL-HANI, CHARBEL N. ; ANDRADE, ROBERTO F.S. ; GO'ES-NETO, ARISTO'TELES ; Duarte, Angelo A . SCANNET: A Software for Identification of Communities in Networks. IEEE Latin America Transactions , v. 16, p. 1787-1794, 2018.

• ARAUJO, JANAY STEFANY CARNEIRO ; DE SOUZA, BRUNO CRUZ ; COSTA JUNIOR, DAVID BACELAR ; OLIVEIRA, LARISSA DE MATTOS ; SANTANA, ISIS BUGIA ; Duarte, Angelo Amâncio ; LACERDA, PEDRO SOUSA ; DOS SANTOS JUNIOR, MANOELITO COELHO ; LEITE, FRANCO HENRIQUE ANDRADE . Identification of new promising Plasmodium falciparum superoxide dismutase allosteric inhibitors through hierarchical pharmacophore-based virtual screening and molecular dynamics. JOURNAL OF MOLECULAR MODELING , v. 24, p. 220, 2018.

• DE MATTOS OLIVEIRA, LARISSA ; ARAÚJO, JANAY STEFANY CARNEIRO ; BACELAR COSTA JUNIOR, DAVID ; SANTANA, ISIS BUGIA ; Duarte, Angelo Amâncio ; LEITE, FRANCO HENRIQUE ANDRADE ; BENEVIDES, RAQUEL GUIMARÃES ; COELHO DOS SANTOS JUNIOR, MANOELITO . Pharmacophore modeling, docking and molecular dynamics to identify Leishmania major farnesyl pyrophosphate synthase inhibitors. JOURNAL OF MOLECULAR MODELING (ONLINE) , v. 24, p. 314, 2018.

• VAZ, ALINE B.M. ; FONSECA, PAULA L.C. ; LEITE, LAURA R. ; BADOTTI, FERNANDA ; SALIM, ANNA C.M. ; ARAUJO, FLAVIO M.G. ; CUADROS-ORELLANA, SARA ; DUARTE, ÂNGELO A. ; ROSA, CARLOS A. ; OLIVEIRA, GUILHERME ; Góes-Neto, Aristóteles . USING Next-Generation Sequencing (NGS) TO UNCOVER DIVERSITY OF WOOD-DECAYING FUNGI IN NEOTROPICAL ATLANTIC FORESTS. Phytotaxa , v. 295, p. 1, 2017.

• BARROS, GEORGE O. ; NAVARRO, BRENDA ; Duarte, Angelo ; DOS-SANTOS, WASHINGTON L. C. . PathoSpotter-K: A computational tool for the automatic identification of glomerular lesions in histological images of kidneys. Scientific Reports , v. 7, p. 46769, 2017.

• Duarte, Angelo ; QUEIROZ, ARTUR T. L. ; TOSTA, RAFAEL ; CARVALHO, AUGUSTO M. ; BARBOSA, CARLOS HENRIQUE ; BELLIO, MARIA ; DE OLIVEIRA, CAMILA I. ; Barral-Netto, Manoel . Prediction of CD8+ Epitopes in Leishmania braziliensis Proteins Using EPIBOT: In Silico Search and In Vivo Validation. PLoS One , v. 10, p. e0124786, 2015.

• JUNIOR, MANOELITO C ; de Assis, Sandra Aparecida ; GO'ES-NETO, ARISTO'TELES ; DUARTE, ÂNGELO AMÂNCIO ; ALVES, RICARDO JOSÉ ; JUNIOR, MOACYR COMAR ; Taranto, Alex Gutterres . Structure-based drug design studies of UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphosrylase, a key enzyme for the control of witches' broom disease. Chemistry Central Journal , v. 7, p. 48, 2013.

• Pinheiro, Antonio Anderson Freitas ; Taranto, Alex Gutterres ; Duarte, Angelo Amâncio ; Neto, Aristóteles Góes ; da Hora Júnior, Braz Tavares ; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães ; dos Santos Júnior, Manoelito Coelho ; de Assis, Sandra Aparecida ; Duarte, Angelo A . Homology modeling studies of beta(1,3)-D-glucan synthase of Moniliophthora perniciosa. International Journal of Quantum Chemistry , v. n/a, p. n/a-n/a, 2012.

• Andrade, Bruno B ; Reis-Filho, Antonio ; Barros, Austeclino M ; Souza-Neto, Sebastiao M ; Nogueira, Lucas L ; Fukutani, Kiyoshi F ; Camargo, Erney P ; Camargo, Luis MA ; Barral, Aldina ; Duarte, Angelo ; Barral-Netto, Manoel . Towards a precise test for malaria diagnosis in the Brazilian Amazon: comparison among field microscopy, a rapid diagnostic test, nested PCR, and a computational expert system based on artificial neural networks. MALARIA JOURNAL , v. 9, p. 117, 2010.

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• Santos, Justino ; Machado, Vinicius ; OLIVEIRA, LUCIANO ; SANTOS, WASHINGTON ; ALDEMAN, NAYZE ; Duarte, Angelo ; Veras, Rodrigo . Glomerulosclerosis Identification Using a Modified Dense Convolutional Network. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.New York: Springer International Publishing, 2022, v. 13653, p. 237-252.

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• DUARTE, A. A. ; Michele F. Angelo ; LOULA, A. C. ; PIRES, Matheus Giovani ; Nilton S. Dantas . Entrepreneurship in a Curriculum Redesign of Computer Engineering. In: Jerker Björkqvist; Mikko-Jussi Laakso; Janne Roslöf; Raija Tuohi; Seppo Virtanen. (Org.). International Conference on Engineering Education 2012 ? Proceedings. 1ed.Turku: Turku University of Applied Sciences, 2012, v. , p. 253-258.

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• SANTOS, G. A. S. ; DUARTE, A. A. ; REXACHS, D. ; LUQUE, E. . Providing Non-stop Service for Message-Passing Based Parallel Applications with RADIC. In: Emilio Luque, Tomàs Margalef and Domingo Benítez. (Org.). Euro-Par 2008 - Parallel Processing. : Springer Berlin / Heidelberg, 2008, v. 5168, p. 58-67.

• DUARTE, A. A. ; REXACHS, D. ; LUQUE, E. . An Intelligent Management of Fault Tolerance in Cluster Using RADICMPI. In: Bernd Mohr, Jesper Träff, Joachim Worringen, Jack Dongarra. (Org.). RECENT ADVANCES IN PARALLEL VIRTUAL MACHINE AND MESSAGE PASSING INTERFACE. 1ed.: Springer Berlin / Heidelberg, 2006, v. 4192, p. 150-157.

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• SOUZA, J. ; ARGOLLO,E. ; DUARTE, A. A. ; REXACHS, D. ; LUQUE, E. . Fault Tolerant Master-Worker over a Multi-Cluster Architecture. In: G.R. Joubert, W.E. Nagel, F.J. Peters, O. Plata, P. Tirado and E. Zapata. (Org.). Parallel Computing: Current & Future Issues of High-End Computing. Jülich - Germany: Jon von Neumann Institute for Computing, 2005, v. 33, p. 465-473.

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• SANTOS, WASHINGTON ; REBOUÇAS, LUCIANO ; Duarte, Angelo ; VIDAL, FLAVIO ; BARROS, GEORGE ; WANDERLEY, DAVID . PodNet: Ensemble-based Classification of Podocytopathy on Kidney Glomerular Images. In: 17th International Conference on Computer Vision Theory and Applications, 2022, Online Streaming. Proceedings of the 17th International Joint Conference on Computer Vision, Imaging and Computer Graphics Theory and Applications, 2022. p. 405.

• REHEM, J. M. C. ; DOS-SANTOS, W. L. C. ; DUARTE, ANGELO A. ; OLIVEIRA, L. R. ; Michele F. Angelo . Automatic glomerulus detection in renal histological images. In: SPIE Medical Imaging conference 11603: Digital and Computational Pathology, 2021. Medical Imaging 2021: Digital Pathology. Bellingham, Washington, USA: SPIE - international society for optics and photonics, 2021.

• AGUIAR, E. C. ; CALUMBY, R. T. ; OLIVEIRA, L. R. ; DOS-SANTOS, W. L. C. ; Duarte, Angelo A . PathoSpotter-Search: A Content-Based Image Retrieval Tool for Nephropathology. In: SIBGRAPI 2021 - 34th Conference on Graphics, Patterns and Images, 2021, Virtual. SIBGRAPI 2021 - 34th Conference on Graphics, Patterns and Images, 2021.

• CHAGAS, PAULO ; SOUZA, LUIZ ; CALUMBY, RODRIGO ; PONTES, IZABELLE ; ARAÚJO, STANLEY ; Duarte, Angelo ; PINHEIRO, NATHANAEL ; SANTOS, WASHINGTON ; OLIVEIRA, LUCIANO . Toward unbounded open-set recognition to say "I don't know" for glomerular multi-lesion classification. In: Seventeenth International Symposium on Medical Information Processing and Analysis, 2021, Campinas. 17th International Symposium on Medical Information Processing and Analysis, 2021. p. 51.

• ARAUJO, I. C. ; DOS-SANTOS, WASHINGTON L. C. ; DUARTE, A. A. ; SCHNITMAN, L. . Automated Detection of Segmental Glomerulosclerosis in Kidney Histopathology. In: XIII Brazilian Congress on Computational Intelligence (CBIC 2017), 2017, Niterói - RJ. Proceedings of XIII Brazilian Congress on Computational Intelligence, 2017.

• de Santana, Fernanda Castelo Branco ; Duarte, Angelo Amâncio ; Ragni, Mirco ; Lepikson, Herman Augusto ; BITENCOURT, A. C. P. . New Approach to Calculate Adiabatic Curves of Bound States and Reactive Scattering in Quantum Chemistry Problems. In: 16th International Conference on Computational Science and Its Applications (ICCSA 2016), 2016, Beijing. Computational Science and Its Applications ? ICCSA 2016, 2016. v. 9786. p. 455-469.

• COSTA, D. A. ; DUARTE, A. A. ; DUARTE, D. S. R. ; SCHNITMAN, L. . Detection and classification of the periorbital wrinkles in 2D images. In: XI Workshop de Visão Computacional (WVC 2015), 2015, São Carlos. Proceedings of WVC 2015. São Carlos: EESC/USP, 2015. p. 259-264.

• DUARTE, A. A. ; BITTENCOURT, J. C. N. ; ROCHA, A. S. ; SANTOS, J. A. . Avaliando a Eficácia de Problemas Aplicados em uma Disciplina de Sistemas Digitais Usando Aprendizagem Baseada em Problemas. In: XXXIX Congresso Brasileiro de Educação em Engenharia, 2011, Blumenal. Anais do COBENGE 2011, 2011.

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• Barros, Austeclino M ; Barral-Netto, Manoel ; DUARTE, A. A. ; Andrade, Bruno B . Sistema Especialista de Apoio ao Diagnóstico da Malária Assintomática Baseado em Redes Neurais Artificiais. In: Workshop de Trabalhos de Iniciação Científica e Graduação Bahia-Alagoas-Sergipe (WTICG-BASE), 2010, Maceió. Anais do Workshop de Trabalhos de Iniciação Científica e Graduação Bahia-Alagoas-Sergipe, 2010.

• REIS, Marco A. ; Duarte, Angelo A ; SCHNITMAN, L. ; MELO, Silvio A. B. V. . A Utilização de Redes Bayesianas no Processo Decisório de Intervenções em Equipamentos. In: XVIII Congresso Brasileiro de Automática, 2010, Bonito, MS. Anais do XVIII Congresso Brasileiro de Automática, 2010.

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• DUARTE, A. A. ; FONTES, A. B. . Identificação de um modelo bilinear de uma coluna de destilação de tolueno. In: II SEMINÁRIO NACIONAL DE CONTROLE E AUTOMAÇÃO, 2001, Salvador. II Seminário Nacional de Controle e Automação. Salvador: AINST - Associação dos Profissionais de Instrumentação da Bahia, 2001.

• SOUZA, B. C. ; SANTOS, I. A. ; SANTOS, G. C. ; SANTOS JUNIOR, M. C. ; DUARTE, A. A. . NatProDb's expasion with chemical structures for the search of enzymes inhibitors for the Moniliophtera perniciosa. In: The 6th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry (BRAZMEDCHEM2012), 2012, Canela. The 6th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry (BRAZMEDCHEM2012), 2012.

• GURGEL, C. A. ; GABRIELA, M. ; RODRIGUES, M. S. ; CAVALCANTE, B. ; SILVA, V. A. ; SOLANO, B. ; SOARES, M. ; Duarte, Angelo ; ROCHA, G. . In-silico Approach to Uncover Biomarkers and Therapeutic Targets in Metastatic Oral Squamous Cell Carcinoma. In: EACR 2025 Congress: Innovative Cancer Science, 2025, Lisbon, Portugal. Molecular Oncology Volume 19: Special Issue: EACR 2025 Congress: Innovative Cancer Science, 16-19 June 2025. Cambridge, United Kingdom: FEBSPRESS, 2025. v. 19. p. 61-61.

• RODRIGUES, M. S. ; CAVALCANTE, B. ; ROCHA, G. ; DUARTE, ANGELO A. ; SILVA, V. A. ; GURGEL, C. A. . Combining in silico and in vitro approaches to repurpose candidate drugs for oral squamous cell carcinoma. In: EACR 2025 Congress: Innovative Cancer Science, 2025, Lisbon, Portugal. Molecular Oncology Volume 19: Special Issue: EACR 2025 Congress: Innovative Cancer Science. Cambridge, United Kingdon: FEBSPRESS, 2025. v. 19. p. 448-448.

• ROCHA, G. ; TOFALINI, M. G. ; RODRIGUES, M. S. ; CAVALCANTE, B. ; SILVA, V. A. ; SOARES, M. ; SOLANO, B. ; Duarte, Angelo ; GURGEL, C. A. . Machine Learning-Driven Drug Repositioning for Oral Squamous Cell Carcinoma: A Predictive Approach Using Affinity2Vec. In: EACR 2025 Congress: Innovative Cancer Science, 2025, Lisbon, Portugal. Molecular Oncology Volume 19: Special Issue: EACR 2025 Congress: Innovative Cancer Science. Canbridge, United Kingdom: FEBSPRESS, 2025. v. 19. p. 62-62.

• SANTOS, A. S. ; OLIVEIRA, LUCIANO R. ; DOS-SANTOS, WASHINGTON L. C. ; DUARTE, ANGELO A. . Addressing Class Imbalance in Renal Amyloidosis Classification: A Comparative Study of Few-Shot Learning and Conventional Machine Learning Techniques. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DUARTE, ANGELO A. . PathoSpotter: Onde Estamos e Para Onde Vamos. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DUARTE, ANGELO A. . Abrindo a Caixa Preta da Inteligência Artificial. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Duarte, Angelo Amâncio . PathoSpotter Roadmap. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Duarte, Angelo Amâncio . Supercomputação: O que é e o que ela pode fazer por você. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DUARTE, A. A. . TRANSLATING PATHOLOGY TO COMPUTACIONAL SCIENCES. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• DUARTE, ÂNGELO AMÂNCIO . Massa véi, tô na universidade... e agora?. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• BARROS, G. O. ; DOS-SANTOS, W. L. C. ; DUARTE, A. A. . PathoSpotter: Um Sistema para Classificação de Glomerulopatias a partir de Imagens Histológicas Renais. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SOUZA, B. C. ; SANTOS, I. A. ; SANTOS, G. C. ; SANTOS JUNIOR, M. C. ; DUARTE, A. A. . NATPRODB'S EXPANSION WITH CHEMICAL STRUCTURE FOR THE SEARCH OF ENZYMES INHIBITORS FOR THE MONILIOPHTERA PERNICIOSA. 2012. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• DUARTE, A. A. ; PORSANI, M. J. ; KISLANSKY, P. . Combinando Técnicas Computacionais de Alto Desempenho para a Solução Mínimos Quadrados de Sistemas Lineares de Grande Porte. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• REIS, Marco A. ; Duarte, Angelo A ; SCHNITMAN, L. ; MELO, Silvio A. B. V. . A Utilização de Redes Bayesianas no Processo Decisório de Intervenção em Equipamentos. 2010. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2024 - Atual

  PATHOSPOTTER: um sistema computacional para auxílio ao diagnóstico de lesões histopatológicas renais, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador., Financiador(es): Universidade Estadual de Feira de Santana - Auxílio financeiro.

• 2024 - Atual

  USO DE INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL PARA AUXÍLIO NO MONITORAMENTO DE MARCADORES DE ATIVIDADE E CRONICIDADE DE DOÊNÇA FALCIFORME, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (4) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Luciano Rebouças de Oliveira - Integrante / ANGELO, MICHELE - Integrante / DOS-SANTOS, WASHINGTON L.C. - Integrante / ALDEMAN, NAYZE L.S. - Integrante / Emanuele Marques dos Santos - Integrante / Rodrigo de Melo Souza Veras - Integrante / Isabela Pimenta Soares - Integrante / Maria Brandão Tavares - Integrante.

• 2022 - 2023

  Searching for renal biopsy images by explanatory semantic attributes, Descrição: A recurrent problem for pathologists is finding biopsy images on past-case databases considering a target image. In Nephropathology, visual searches are carried out by considering the characteristics of renal structures and their relationship with some diseases. The automatic characterization of histology images would allow finding other similar anatomical images, favoring the determination of the clinical significance of some diseases. Although there is software in medical practice capable of identifying globally similar images, they are not capable of finding relevant content based on semantic attributes, such as type and extension of a lesion, or changes in structures, for example. By exploring deep-learning techniques, the project herein proposes to develop a unique system that will be able to find images based on explanatory attributes in large repositories. It is expected that software with such characteristics leverages the research on the relevance of kidney histological lesions for more accurate diagnosis, and consequently more precise activity, chronicity, and prognosis estimates of renal diseases.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Washington Luis Conrado dos Santos - Integrante / Luciano Rebouças de Oliveira - Coordenador / Paulo Chagas - Integrante / Luiz Otávio Souza Júnior - Integrante., Financiador(es): Terumo Foundation - Auxílio financeiro.

• 2018 - Atual

  SISTEMA COMPUTACIONAL PARA AUXÍLIO AO DIAGNÓSTICO DE LESÕES HISTOPATOLÓGICAS RENAIS EM LARGA ESCALA., Descrição: Neste projeto propomos o desenvolvimento de um sistema computacional de reconhecimento de lesões histológicas, o qual vem sendo desenvolvido nos dois últimos anos e poderá ser usado para 1) treinamento de especialistas em Patologia hepática e renal, áreas nas quais é crítica a carência de profissionais no Brasil e no mundo; 2) suporte à médicos patologistas que trabalham em áreas remotas, na tomada de decisões para o diagnóstico adequado de doenças hepáticas e renais; 3) seleção e classificação de material didático para fins acadêmicos e 4) facilitar a pesquisa em larga escala de associações clinicopatológicas entre lesões histológicas do fígado e do rim, com sinais e sintomas clínicos de doenças. Até este momento, não existem outros sistemas computacionais capazes de fazer a identificação automática de imagens histológicas relacionadas a doenças hepáticas ou renais, embora exista intensa pesquisas para desenvolvimento de sistemas computacionais para suporte à análise automática de neoplasias em biópsias de pele, estômago, pulmão e próstata. Esta proposta tem como perspectiva contribuir com soluções para importantes problemas de saúde pública de elevado custo social e econômico, principalmente para o SUS. Por exemplo, sabe-se que as glomerulopatias representam a terceira causa mais frequente de insuficiência renal crônica, e estima-se que cerca de 8 dos recursos do SUS são consumidos com o tratamento de doença renal crônica incluindo terapêutica substitutiva e complicações (Sancho, 2008). Acresça-se a isso o fato dessas doenças provocarem uma expressiva perda de qualidade de vida e horas de trabalho produtivo, com grande impacto negativo na economia das famílias. O sistema que propomos neste projeto, denominado PathoSpotter, é um sistema computacional para classificação de imagens histológicas de lesões renais e hepáticas a partir da imagem digital de uma biópsia, baseando-se para isso em métodos de Visão Computacional e Inteligência Artificial. Dispomos de um dataset composto por aproximadamente 90 mil imagens geradas no curso de 20 anos de uma rotina diagnóstica de biópsias hepáticas e renais.Até o momento, como prova de conceito, produzimos um módulo do sistema, denominado PathoSpotter-K, capaz de identificar um tipo de lesão histológica glomerular de proliferação celular, componente presente em várias glomerulonefrites. Esse módulo produziu discussões em fóruns tecnológicos (Barros, 2015) e um artigo em periódico científico de relevância (Barros et al., 2017).Um dos objetivos deste projeto é a catalogação adequadas destas imagens através da melhoria dos métodos computacionais de classificação das lesões, para que possam futuramente ser organizadas como biorrepositório e daí serem utilizadas em ensino e pesquisa por outros grupos. Este projeto foi aprovado pelo Comitê de Ética para Pesquisa Envolvendo Seres Humanos do Instituto Gonçalo Moniz (FIOCRUZ), Protocolos N 188/09 e N 1.817.574, e envolve a colaboração da FIOCRUZ-BA (que mantém o Serviço de Referência em Patologia Hepática e Renal para rede de hospitais públicos de referência do Estado da Bahia) e pelo Laboratório de Computação de Alto Desempenho da Universidade Estadual de Feira de Santana.Estima-se que o projeto possibilitará a formação de pelo menos quatro mestrandos (um outro estudante já concluiu o mestrado), pelo menos um doutorando e a criação de um núcleo multidisciplinar de estudos na área de Patologia Digital.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Michele Fulvia Angelo - Integrante / Washington Luis Conrado dos Santos - Integrante / Luciano Rebouças de Oliveira - Integrante / Luiz Antônio Rodrigues de Freitas - Integrante / Ikaro Campos de Araújo - Integrante / JEZIEL RIBEIRO LAGO - Integrante / GILDASIO DO NASCIMENTO SANTOS JUNIOR - Integrante / IZABELLE ROCHA PONTES - Integrante / JONATHAN MOREIRA CARDOZO REHEM - Integrante / Flávio de Barros Vidal - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2018

  PATHOSPOTTER: SISTEMA COMPUTACIONAL PARA O ESTUDO DE ASSOCIAÇÕES ANATOMOCLÍNICAS EM LARGA ESCALA, Descrição: Neste projeto propomos a criação de um sistema semiautomático para classificação de imagens histológicas de lesões dos rins e do fígado. Esse sistema permitirá, a partir de uma imagem usada como tema, a varredura rápida de bancos de imagens e recuperação de imagens semelhantes. Não existem plataformas adequadas para a seleção de imagens histológicas. As aplicações de um sistema como esse são inúmeras: treinamento e educação médica continuada, assistência ao diagnóstico de lesões, permitirá a pesquisa em larga escala de associações entre lesões histológicas do fígado e do rim e sinais e sintomas clínicos, contribuindo para maior consistência dos diagnósticos e refinando a classificação de enfermidades. Para o desenvolvimento deste projeto contamos com um grupo multidisciplinar constituído por médicos patologistas e engenheiros da área de computação, além de um banco de cerca de 50 mil imagens geradas a partir biópsias hepáticas e renais. Um dos objetivos deste projeto é o incremento desse banco de imagens e sua definição como biorepositório, com vistas a sua agregação a um museu virtual de Patologia possibilitando seu uso em ensino e pesquisa. Esse projeto será desenvolvido pelos Laboratório de Patologia e Bio-Intervenção da Fiocruz-BA que mantém o Serviço de Referência em Patologia Hepática e Renal, para rede de hospitais públicos de referência do Estado da Bahia e pelo Laboratório de Computação de Alto Desempenho (LaCAD) da Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS). O desenvolvimento do projeto incluirá a formação de dois mestrandos e a criação de um núcleo multidisciplinar de estudos na área de seleção semiautomática de imagens e correlação anatomoclínica. Valor financiado R$67.200,00. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / George de Oliveira Barros - Integrante / Washington Luis Conrado dos Santos - Coordenador / Luiz Antônio Rodrigues de Freitas - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

• 2015 - Atual

  Rede PathoSpotter, Descrição: Rede pesquisa sobre patologia computacional envolvendo várias instituições.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (8) / Mestrado acadêmico: (4) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Washington Luis Conrado dos Santos - Coordenador / Luciano Rebouças de Oliveira - Integrante.

• 2013 - 2017

  REDES COMPLEXAS BIOLÓGICAS COMO FERRAMENTA PARA BUSCA DE BIOMARCADORES E ALVOS TERAPÊUTICOS EM DOENÇAS PARASITÁRIAS., Descrição: O projeto visa o uso de redes complexas biológicas na busca por biomarcadores de susceptibilidade e resistência na leishmaniose tegumentar experimental e humana, bem como na malária, utilizando ferramentas da área de bioinformática, busca in silico de fármacos e estratégias vacinais para o tratamento da leishmaniose, busca de polimorfirmo gênico no parasito associado à manifestação clínica de doença. As leishmanioses e a malária são sérios problemas de saúde pública mundial, com grande presença no Brasil, especialmente nas regiões Norte/Nordeste. Os achados deverão contribuir para entendimento das bases moleculares associadas a essas enfermidades e poderão ter implicações futuras no desenho mais racional de estratégias vacinais e de tratamento. A leishmaniose e a malária são os alvos principais de investigação do grupo proponente. Entretanto, esse estudo abrirá perspectivas de utilização da mesma abordagem computacional para investigar mecanismos similares em outras enfermidades importantes no nosso meio. A equipe da proposta é interdisciplinar e conta com pesquisadores de diferentes áreas de conhecimento, com qualidade e regularidade na produção científica/tecnológica. Nosso Núcleo Central de Pesquisa (NCP) é formado pela proponente Valéria Borges pesquisadora da FIOCRUZ-BA que apresenta contribuição na área da leishmaniose, Roberto Andrade pesquisador da UFBA, com contribuição na área de estudos de redes complexas e Aristotéles Neto pesquisador da UESF, com experiência em análise computacional e bioinformática.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Suani Tavares Rubim de Pinho - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Integrante / Rafael Tosta Santos - Integrante / Manoel Barral Neto - Integrante / Artur Trancoso Lopo de Queiroz - Integrante / Aline de Oliveira Machado - Integrante / Andrezza Kariny Miranda de Souza - Integrante / Aullus Galassi Marques Rego - Integrante / Austeclino Magalhaes Barros Júnior - Integrante / Charbel Niño El-Hani - Integrante / Daniella Castanheira Bartholomeu - Integrante / Daniel Santana de Carvalho - Integrante / Franco Henrique Andrade Leite - Integrante / Gilberto Cafezeiro Bomfim - Integrante / Hayna Malta Santos - Integrante / Jaqueline França Costa - Integrante / Johan Van Weyenbergh - Integrante / Marcelo Santos Castilho - Integrante / Patrícia Sampaio Tavares Veras - Integrante / Tayane Leite Cerqueira - Integrante / Thierry Corrêa Petit Lobão - Integrante / Tiago Antônio de Oliveira Mendes - Integrante / Vanessa Riesz Salgado - Integrante / Valeria de Matos Borges - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2013 - 2015

  SUPORTE À IMPLANTAÇÃO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM COMPUTAÇÃO APLICADA DA UEFS, Descrição: O projeto se propõe a auxiliar a implantação do Programa de Pós-Graduação em Computação Aplicada (PGCA) da Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS), o qual iniciará suas atividades acadêmicas no segundo semestre de 2013 com a primeira turma de Mestrado Acadêmico. A meta principal é o aumento da nota do Programa na próxima avaliação da CAPES, de forma a garantir a perpetuidade do Mestrado e a criação de um curso de Doutorado nos próximos cinco anos. O projeto tem a intenção de fomentar a cooperação entres os professores do programa e pesquisadores de outras instituições, além de viabilizar a manutenção da infra-estrutura física e do parque de equipamentos de informática dos laboratórios. Para isso, está sendo solicitado apoio para compras de passagens aéreas e para o pagamento de diárias tanto para os docentes e discentes do Programa participarem em encontros científicos e conferências, quanto para os pesquisadores que o Programa pretende convidar para colaborar na realização de suas atividades acadêmicas, tais como bancas de qualificação e mestrado ou reuniões de pesquisa e orientação. Além das verbas solicitadas para atender as demandas de mobilidade, estão sendo pedidos recursos para auxiliar no custeio de algumas atividades operacionais do programa, bem como recursos que servirão para realizar manutenção em máquinas e equipamentos dos diversos laboratórios que pertencem à infra-estrutura do Programa. Os recursos são importantíssimos para garantir um bom começo às atividades do Programa, já que o mesmo não receberá qualquer provisão da CAPES em 2013.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador.

• 2011 - 2015

  PIPA - Plataforma Integrada para Desenvolvimento e Pesquisa em Poços Automatizados de Produção de Petróleo, Descrição: Disponibilizar recursos do laboratório de Elevação Artificial da Escola Politécnica da UFBA para desenvolver, integrar e validar métodos e técnicas aplicáveis aos métodos de elevação artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Cícero Alexandre Brandao de Paula - Coordenador / Antonio Cláudio Lopes de Araujo - Integrante / José Francisco dos Santos Corrêa - Integrante / Luiz Henrique Santos Torres - Integrante / Jaguaraci Oliveira Sá - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro / Petróleo Brasileiro S/A - BA - Remuneração / Petróleo Brasileiro S/A - BA - Bolsa.

• 2011 - 2013

  PREVISÃO DE EPÍTOPOS T CD8+ NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS: UMA ABORDAGEM COMPUTACIONAL, Descrição: As Leishmanias são protozoários agentes etiológicos das leishianioses. O controle da infecção está associado com a presença de linfócitos T CD8+ específicos contra leishmania. Esses epítopos são importantes para o desenvolvimento de terapias e vacinas. Nosso objetivo é usar métodos in-silico para identificar no proteoma de L. braziliensis, epítopos CD8 usando uma ferramenta web robot automatizado, com vários algoritmos de previsão de epítopos disponíveis na internet.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Integrante / Artur Trancoso Lopo de Queiroz - Coordenador / Aldina Maria Prado Barral - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2012

  ANÁLISE COMPARATIVA E ADAPTAÇÃO DE ALGORITMOS COMPUTACIONAIS PARA COMPARAÇÃO, CLASSIFICAÇÃO E ARMAZENAMENTO DE ESTRUTURAS MOLECULARES EXTRAÍDAS DE PLANTAS DO SEMI-ÁRIDO, Descrição: A computação de alto desempenho têm sido aplicada com sucesso ao problema do cálculo de similaridade entre proteínas. Esse cálculo é uma das ferramentas chave que pesquisadores da área de farmácia e biologia utilizam para se orientar na pesquisa de novos fármacos e para estudar as funções biológicas e as propriedades das proteínas. A arquitetura CUDA da NVIDIA vem recebendo muita atenção da comunidade científica por se apresentar como uma arquitetura de alto desempenho prática e de baixo custo, viabilizando redução dos tempos de cálculo de similaridade. Diversos algoritmos têm sido utilizados para realizar o cálculo da similaridade mas poucos são os que já foram codificados para aproveitar os recursos dessa plataforma. Esse projeto se propõe a pesquisar, estudar e comparar alguns algoritmos de cálculo de similaridade, de forma a implementá-los na arquitetura CUDA. Um dos objetivos do projeto é criar um banco de dados de estruturas de compostos extraídos de plantas do semi-árido e utilizar os algoritmos implementados para criar um sistema de cálculo de similaridade que será utilizado para facilitar o estudo das propriedades biológicas e farmacológicas dos compostos cadastrados. O projeto trabalhará com a arquitetura CUDA em três plataformas de hardware distintas, duas baseadas em microcomputadores comerciais com placas gráficas compatíveis com a arquitetura e uma baseada em hardware dedicado da NVIDIA. O objetivo é permitir o comportamento dos algoritmos possa ser avaliado em todos os ambientes computacionais onde poderão ser executados. Embora seja um projeto envolvendo fortemente a aplicação de conhecimentos da área de ciência da computação, o projeto apresenta uma forte interação com pesquisadores e alunos da área de farmácia. Como resultados espera-se não só a divulgação dos conhecimentos oriundos mas também a criação de um sistema computacional que possa ser utilizado para agilizar os cálculos de similaridade que serão realizados com as proteínas extraídas das plantas do semi-árido.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Manoelito Coelho dos Santos Júnior - Integrante / Luan Carlos dos Santos Batista - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2010 - 2012

  Desenvolvimento de Métodos de Bioinformática Para a Busca In Silico de Epítopos T CD8+ Humanos no Proteoma de L. Braziliensis, Descrição: As Leishmanias são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças no homem, conhecidas como leishmanioses. O tratamento é problemático e uma vacina seria útil. No Brasil, o principal agente causal da leishmaniose tegumentar no homem é a L. Viannia braziliensis. Durante o período de 2000 a 2008, foram registrados 22385 casos de leishmaniose tegumentar no Brasil sendo que a Bahia foi responsável pelo registro e 14% dos casos reportados em 2008 (portal.saude.gov.br - acessado em 2 de junho de 2009). A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, altamente destrutiva e de difícil tratamento. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Quase a totalidade do conhecimento de imunopatogênese e mecanismos de proteção nas leishmanioses decorre de estudos com L. major e pouco se sabe sobre a L. braziliensis. Há várias indicações que a L. braziliensis difere da L. major em muitos aspectos, inclusive quanto aos mecanismos de proteção. É provável que uma vacina desenvolvida para L. major não tenha efeito protetor contra a L. braziliensis, e poderá mesmo ter efeito deletério. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I humano e, por consequência, capazes de ativar linfócitos T CD8, uma população celular associada com proteção contra a infecção por patógenos intracelulares. Os epítopos serão identificados por meio de um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros, in vivo, no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose causada por L. braziliensis. A estratégia proposta neste projeto poderá diminuir substancialmente os custos de desenvolvimento de uma vacina contra a infecção por L. braziliensis, ao direcionar os estudos para os epitopos escolhidos racionalmente, com provável redução do tempo de avaliação de candidatos vacinais. Ademais, esta estratégia poderá permitir uma redução também no número de animais a serem empregados em testes, o que contempla os aspectos fundamentais de ética no uso de animais de experimentação.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador / Rafael Tosta Santos - Integrante / Artur Trancoso Lopo de Queiroz - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2009 - 2015

  Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia - Geofísica de Petróleo (INCT-GP), Descrição: O INCT-GP se propõe a articular grupos e pesquisadores de geofísica, geologia e engenharia de reservatórios para atuarem de forma integrada na pesquisa e na formação de recursos humanos para a área de Exploração e Estudo de Reservatórios (EER) de Petróleo e Gás.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Ricardo André Reis - Integrante / Ana Cláudia Fiorin Pianesso - Integrante / MIlton José Porsani - Coordenador / Olivar Antonio Lima de Lima - Integrante / Hedison Kiuity Sato - Integrante / Reynam da Cruz Pestana - Integrante / Amin Bassrei - Integrante / Roberto Max de Argollo - Integrante / Antonio Expedito G. Azevedo - Integrante / Jessé Carvalho Costa - Integrante / Cícero Roberto Teixeira Regis - Integrante / Luiz Rijo - Integrante / Marcos Welby Correa Silva - Integrante / Ellen de Nazaré Souza Gomes - Integrante / Lourenildo Barbosa Leite - Integrante / Walter Eugênio de Medeiros - Integrante / Aderson Farias do Nascimento - Integrante / Jose Antonio Morais Moreira - Integrante / Roberto Hugo Bielschowsky - Integrante / Paulo Sérgio Lucio - Integrante / Joerg D. Wilhelm Schleicher - Integrante / Martin Tygel - Integrante / Lúcio Tunes dos Santos - Integrante / Maria Amélia Novais Schleicher - Integrante / Ricardo C. Azevedo Biloti - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2012

  MAICE - Métodos de elevação e LEA-BCS, Descrição: Utilização do MAICE para a modelagem do conhecimento especialista visando a análise e diagnóstico dos métodos de elevação artificial baseados no BM, BCP, GLI e BCS e implantação do Laboratório LEA-BCS para modelagem, testes e validação de sistemas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (12) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Ricardo André Reis - Integrante / Ana Cláudia Fiorin Pianesso - Integrante / Antonio Carlos Peixoto Bittencourt - Integrante / Fabrício Mota Oliveira - Integrante / Humberto Giudice Sposito - Integrante / Luis Henrique Santos Torres - Integrante / Tatiana Dias Silva - Integrante / Cícero Alexandre Brandao de Paula - Integrante / Frederico Carneiro Andrade - Integrante / Albert Oliveira Lopes - Integrante / Carlos Alberto Bezerra de Souza - Integrante / Ivo Casais de Carvalho - Integrante / Lairton Santos Lima - Integrante / Paulo André Oliveira Libonati - Integrante / Antonio Cláudio Lopes de Araujo - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro - Rio de Janeiro - Matriz - Auxílio financeiro.

• 2008 - 2009

  Sistema Computacional de Apoio à Modelagem de Ondas Marítmas, Descrição: O objetivo geral desse projeto é o desenvolvimento de um sistema computacional baseado em computação gráfica, que será distribuído gratuitamente sobre licença GPL, e que servirá para apoiar o estudo e a modelagem da influência das ondas marítimas sobre o transporte de sedimentos na costa.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Arnaldo Bispo de Jesus - Integrante / Abilio Carlos da Silva Pinto Bittencourt - Integrante / Iracema Reimão Silva - Integrante / Jorge Luiz Falcão Perrone - Integrante / Edeyson Andrade Gomes - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2007 - 2010

  COMPGRAFS: Implantação de uma Infra-Estrutura para Computação em Grade na UEFS, Descrição: Este projeto de infra-estrutura propõe a implementação de computação em grade (com re-estruturação da rede envolvida) e a criação de um cluster agregado a esta grade contanto como beneficiados diretos dezessete pesquisadores em cinco grupos de pesquisa da UEFS. Trata-se de uma plataforma integradora de computação distribuída, baseada em software-livre, de baixo custo que irá prover um ambiente necessário para o estudo e desenvolvimento de diversas tecnologias da informação e comunicação que necessitam de computação de alto desempenho, oferecendo: poder de processamento ocioso dos recursos computacionais disponíveis; acesso a um cluster com alto poder de processamento; acesso multi-usuário e pervasivo; processamento contínuo e confiável; grande expansibilidade da base instalada; escalabidade de aplicações executadas, e serviço consistente e padronizado. Com base nesta infra-estrutura serão desenvolvidas pesquisas nas áreas de redes de computadores, sistemasdistribuídos, engenharia de software, computação visual, sistemas inteligentes, controle, instrumentação e sistemas embutidos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Antonio Lopes Apolinário Junior - Coordenador / Angelo Conrado Loula - Integrante / Fabiana Cristina Bertoni - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2004 - 2007

  Procesamiento de Altas Prestaciones: Arquitectura, Entornos de Desarrollo y Aplicaciones, Descrição: Título del proyecto: ?Procesamiento de Altas Prestaciones: Arquitectura, Entornos de Desarrollo y Aplicaciones? TIC-2004-03388 Entidad financiadora: Ministerio de Educación y Ciencia. Duración, desde: 2004 hasta: 2007 Cuantía de la subvención: 517.000 ? Investigador principal: Emilio Luque Número de investigadores participantes: 35. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Emilio Luque - Coordenador., Financiador(es): Ministerio de Educacion Y Ciencia - Bolsa.

• 2001 - 2004

  Procesamiento Paralelo y Distribuido: Desde la especificación y Sintonización de Aplicaciones hasta la Arquitectura, Descrição: Título del proyecto: ?Procesamiento Paralelo y Distribuido: Desde la especificación y Sintonización de Aplicaciones hasta la Arquitectura? TIC-2001-2592 Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia y Tecnología Duración, desde: 2001 hasta: 2004 Cuantía de la subvención: 459.000 ? Investigador principal: Emilio Luque Número de investigadores participantes: 25. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Emilio Luque - Coordenador., Financiador(es): Ministerio de Ciencia y Tecnología - Bolsa.

Projetos de desenvolvimento

• 2011 - Atual

  ANÁLISE COMPARATIVA E ADAPTAÇÃO DE ALGORITMOS COMPUTACIONAIS PARA COMPARAÇÃO, CLASSIFICAÇÃO E ARMAZENAMENTO DE ESTRUTURAS MOLECULARES EXTRAÍDAS DE PLANTAS DO SEMI-ÁRIDO, Descrição: Projeto criará um sistema de consulta pública a um banco de dados de compostos com potencial farmacológico, extraídos de plantas do semi-árido nordestino. O sistema computacional de baseará na plataforma CUDA para a execução dos algoritmos de similaridade e os compostos a serem cadastradados são oriundos de projetos de pesquisa realizados pelo Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da UEFS. O projeto é financiado pela FAPEB sob termo de outorga PPP0063/2011.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Manoelito Coelho dos Santos Júnior - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  MAICE - Metodologia para Modelagem e Integração do Conhecimento Especialista, Descrição: Projeto para desenvolvimento de um sistema para modelagem de conhecimento especialista baseado em ferramentas de inteligência artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Fabrício Mota - Integrante / Pedro Kislansky - Integrante / Alexandre Franco - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Kuo Henco - Integrante / Carlos Vinicius de Oliveira Souza - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Garrete Alves Reis - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  ANÁLISE COMPARATIVA E ADAPTAÇÃO DE ALGORITMOS COMPUTACIONAIS PARA COMPARAÇÃO, CLASSIFICAÇÃO E ARMAZENAMENTO DE ESTRUTURAS MOLECULARES EXTRAÍDAS DE PLANTAS DO SEMI-ÁRIDO, Descrição: Projeto criará um sistema de consulta pública a um banco de dados de compostos com potencial farmacológico, extraídos de plantas do semi-árido nordestino. O sistema computacional de baseará na plataforma CUDA para a execução dos algoritmos de similaridade e os compostos a serem cadastradados são oriundos de projetos de pesquisa realizados pelo Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da UEFS. O projeto é financiado pela FAPEB sob termo de outorga PPP0063/2011.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Manoelito Coelho dos Santos Júnior - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  MAICE - Metodologia para Modelagem e Integração do Conhecimento Especialista, Descrição: Projeto para desenvolvimento de um sistema para modelagem de conhecimento especialista baseado em ferramentas de inteligência artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Fabrício Mota - Integrante / Pedro Kislansky - Integrante / Alexandre Franco - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Kuo Henco - Integrante / Carlos Vinicius de Oliveira Souza - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Garrete Alves Reis - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  ANÁLISE COMPARATIVA E ADAPTAÇÃO DE ALGORITMOS COMPUTACIONAIS PARA COMPARAÇÃO, CLASSIFICAÇÃO E ARMAZENAMENTO DE ESTRUTURAS MOLECULARES EXTRAÍDAS DE PLANTAS DO SEMI-ÁRIDO, Descrição: Projeto criará um sistema de consulta pública a um banco de dados de compostos com potencial farmacológico, extraídos de plantas do semi-árido nordestino. O sistema computacional de baseará na plataforma CUDA para a execução dos algoritmos de similaridade e os compostos a serem cadastradados são oriundos de projetos de pesquisa realizados pelo Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da UEFS. O projeto é financiado pela FAPEB sob termo de outorga PPP0063/2011.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Manoelito Coelho dos Santos Júnior - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

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  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

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  MAICE - Metodologia para Modelagem e Integração do Conhecimento Especialista, Descrição: Projeto para desenvolvimento de um sistema para modelagem de conhecimento especialista baseado em ferramentas de inteligência artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Fabrício Mota - Integrante / Pedro Kislansky - Integrante / Alexandre Franco - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Kuo Henco - Integrante / Carlos Vinicius de Oliveira Souza - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Garrete Alves Reis - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro.

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  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

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• 2011 - Atual

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• 2009 - Atual

  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  MAICE - Metodologia para Modelagem e Integração do Conhecimento Especialista, Descrição: Projeto para desenvolvimento de um sistema para modelagem de conhecimento especialista baseado em ferramentas de inteligência artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Fabrício Mota - Integrante / Pedro Kislansky - Integrante / Alexandre Franco - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Kuo Henco - Integrante / Carlos Vinicius de Oliveira Souza - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Garrete Alves Reis - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  ANÁLISE COMPARATIVA E ADAPTAÇÃO DE ALGORITMOS COMPUTACIONAIS PARA COMPARAÇÃO, CLASSIFICAÇÃO E ARMAZENAMENTO DE ESTRUTURAS MOLECULARES EXTRAÍDAS DE PLANTAS DO SEMI-ÁRIDO, Descrição: Projeto criará um sistema de consulta pública a um banco de dados de compostos com potencial farmacológico, extraídos de plantas do semi-árido nordestino. O sistema computacional de baseará na plataforma CUDA para a execução dos algoritmos de similaridade e os compostos a serem cadastradados são oriundos de projetos de pesquisa realizados pelo Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da UEFS. O projeto é financiado pela FAPEB sob termo de outorga PPP0063/2011.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Manoelito Coelho dos Santos Júnior - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  MAICE - Metodologia para Modelagem e Integração do Conhecimento Especialista, Descrição: Projeto para desenvolvimento de um sistema para modelagem de conhecimento especialista baseado em ferramentas de inteligência artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Fabrício Mota - Integrante / Pedro Kislansky - Integrante / Alexandre Franco - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Kuo Henco - Integrante / Carlos Vinicius de Oliveira Souza - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Garrete Alves Reis - Integrante.Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  ANÁLISE COMPARATIVA E ADAPTAÇÃO DE ALGORITMOS COMPUTACIONAIS PARA COMPARAÇÃO, CLASSIFICAÇÃO E ARMAZENAMENTO DE ESTRUTURAS MOLECULARES EXTRAÍDAS DE PLANTAS DO SEMI-ÁRIDO, Descrição: Projeto criará um sistema de consulta pública a um banco de dados de compostos com potencial farmacológico, extraídos de plantas do semi-árido nordestino. O sistema computacional de baseará na plataforma CUDA para a execução dos algoritmos de similaridade e os compostos a serem cadastradados são oriundos de projetos de pesquisa realizados pelo Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da UEFS. O projeto é financiado pela FAPEB sob termo de outorga PPP0063/2011.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Manoelito Coelho dos Santos Júnior - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  MAICE - Metodologia para Modelagem e Integração do Conhecimento Especialista, Descrição: Projeto para desenvolvimento de um sistema para modelagem de conhecimento especialista baseado em ferramentas de inteligência artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Fabrício Mota - Integrante / Pedro Kislansky - Integrante / Alexandre Franco - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Kuo Henco - Integrante / Carlos Vinicius de Oliveira Souza - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Garrete Alves Reis - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  ANÁLISE COMPARATIVA E ADAPTAÇÃO DE ALGORITMOS COMPUTACIONAIS PARA COMPARAÇÃO, CLASSIFICAÇÃO E ARMAZENAMENTO DE ESTRUTURAS MOLECULARES EXTRAÍDAS DE PLANTAS DO SEMI-ÁRIDO, Descrição: Projeto criará um sistema de consulta pública a um banco de dados de compostos com potencial farmacológico, extraídos de plantas do semi-árido nordestino. O sistema computacional de baseará na plataforma CUDA para a execução dos algoritmos de similaridade e os compostos a serem cadastradados são oriundos de projetos de pesquisa realizados pelo Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da UEFS. O projeto é financiado pela FAPEB sob termo de outorga PPP0063/2011.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Manoelito Coelho dos Santos Júnior - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  MAICE - Metodologia para Modelagem e Integração do Conhecimento Especialista, Descrição: Projeto para desenvolvimento de um sistema para modelagem de conhecimento especialista baseado em ferramentas de inteligência artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Fabrício Mota - Integrante / Pedro Kislansky - Integrante / Alexandre Franco - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Kuo Henco - Integrante / Carlos Vinicius de Oliveira Souza - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Garrete Alves Reis - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  ANÁLISE COMPARATIVA E ADAPTAÇÃO DE ALGORITMOS COMPUTACIONAIS PARA COMPARAÇÃO, CLASSIFICAÇÃO E ARMAZENAMENTO DE ESTRUTURAS MOLECULARES EXTRAÍDAS DE PLANTAS DO SEMI-ÁRIDO, Descrição: Projeto criará um sistema de consulta pública a um banco de dados de compostos com potencial farmacológico, extraídos de plantas do semi-árido nordestino. O sistema computacional de baseará na plataforma CUDA para a execução dos algoritmos de similaridade e os compostos a serem cadastradados são oriundos de projetos de pesquisa realizados pelo Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da UEFS. O projeto é financiado pela FAPEB sob termo de outorga PPP0063/2011.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Manoelito Coelho dos Santos Júnior - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  MAICE - Metodologia para Modelagem e Integração do Conhecimento Especialista, Descrição: Projeto para desenvolvimento de um sistema para modelagem de conhecimento especialista baseado em ferramentas de inteligência artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Fabrício Mota - Integrante / Pedro Kislansky - Integrante / Alexandre Franco - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Kuo Henco - Integrante / Carlos Vinicius de Oliveira Souza - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Garrete Alves Reis - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  ANÁLISE COMPARATIVA E ADAPTAÇÃO DE ALGORITMOS COMPUTACIONAIS PARA COMPARAÇÃO, CLASSIFICAÇÃO E ARMAZENAMENTO DE ESTRUTURAS MOLECULARES EXTRAÍDAS DE PLANTAS DO SEMI-ÁRIDO, Descrição: Projeto criará um sistema de consulta pública a um banco de dados de compostos com potencial farmacológico, extraídos de plantas do semi-árido nordestino. O sistema computacional de baseará na plataforma CUDA para a execução dos algoritmos de similaridade e os compostos a serem cadastradados são oriundos de projetos de pesquisa realizados pelo Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da UEFS. O projeto é financiado pela FAPEB sob termo de outorga PPP0063/2011.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Manoelito Coelho dos Santos Júnior - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  MAICE - Metodologia para Modelagem e Integração do Conhecimento Especialista, Descrição: Projeto para desenvolvimento de um sistema para modelagem de conhecimento especialista baseado em ferramentas de inteligência artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Fabrício Mota - Integrante / Pedro Kislansky - Integrante / Alexandre Franco - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Kuo Henco - Integrante / Carlos Vinicius de Oliveira Souza - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Garrete Alves Reis - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro.

• 2011 - Atual

  ANÁLISE COMPARATIVA E ADAPTAÇÃO DE ALGORITMOS COMPUTACIONAIS PARA COMPARAÇÃO, CLASSIFICAÇÃO E ARMAZENAMENTO DE ESTRUTURAS MOLECULARES EXTRAÍDAS DE PLANTAS DO SEMI-ÁRIDO, Descrição: Projeto criará um sistema de consulta pública a um banco de dados de compostos com potencial farmacológico, extraídos de plantas do semi-árido nordestino. O sistema computacional de baseará na plataforma CUDA para a execução dos algoritmos de similaridade e os compostos a serem cadastradados são oriundos de projetos de pesquisa realizados pelo Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da UEFS. O projeto é financiado pela FAPEB sob termo de outorga PPP0063/2011.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Coordenador / Manoelito Coelho dos Santos Júnior - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS DE BIO-INFORMÁTICA PARA A BUSCA IN SILICO DE EPÍTOPOS T CD8+ HUMANOS NO PROTEOMA DE L. BRAZILIENSIS, Descrição: Descrição: As espécies de Leishmania são protozoários parasitos que causam um amplo espectro de doenças em mamíferos, conhecidas como leishmanioses. No Brasil, os principais agentes causais da leishmaniose tegumentar são a L. Viannia braziliensis, a L. Viannia guyanensis e a L. Viannia amazonensis. A L. braziliensis é responsável pelas formas mais graves da doença, incluindo a forma mucosa, a qual pode aparecer ao mesmo tempo em que a úlcera cutânea ou meses e até anos após a cura da doença cutânea. Na doença mucosa, ocorre uma resposta imune exagerada e, em casos avançados, pode haver destruição total da mucosa nasal. Em contraste com L. major, existem poucos grupos de pesquisa dedicados ao estudo da imunopatogênese causada por L. braziliensis, embora as doenças decorrentes dessa infecção representem um sério e importante problema de saúde pública em nosso país. É importante salientar também que L. braziliensis é a espécie mais diversa em termos genéticos biológicos, quando comparada com L. major e L. infantum. Sendo assim, o objetivo principal deste trabalho é usar métodos in-silico para identificar, a partir do proteoma de L. braziliensis, um conjunto de epítopos com potencial de ligação ao MHC-I, usando um software web robot automatizado, capaz de combinar um conjunto de algoritmos executados em servidores disponíveis para acesso público em sites na Internet. Acreditamos que os resultados obtidos permitirão estudos futuros no sentido de caracterizar estes epítopos e de avaliar a sua capacidade protetora, o que é de extrema importância para o desenvolvimento de vacinas para a leishmaniose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Barral-Netto, Manoel - Integrante / Camila Indiani de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  MAICE - Metodologia para Modelagem e Integração do Conhecimento Especialista, Descrição: Projeto para desenvolvimento de um sistema para modelagem de conhecimento especialista baseado em ferramentas de inteligência artificial.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Angelo Amâncio Duarte - Integrante / Leizer Schnitman - Coordenador / Fabrício Mota - Integrante / Pedro Kislansky - Integrante / Alexandre Franco - Integrante / Hermam Augusto Lepikson - Integrante / Kuo Henco - Integrante / Carlos Vinicius de Oliveira Souza - Integrante / George Anderson Novais Queiroz - Integrante / Garrete Alves Reis - Integrante., Financiador(es): Petróleo Brasileiro S/A - BA - Auxílio financeiro.

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