Alessandra Lima da Silva

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• LIMA, ALESSANDRA ; CAROLINA BARBOSA CAETANO, ANA ; HURTADO CASTILLO, RAQUEL ; GONÇALVES DOS SANTOS, ROSELANE ; LUCAS NERES RODRIGUES, DIEGO ; DE JESUS SOUSA, THIAGO ; Kato, Rodrigo Bentes ; VINICIUS CANÁRIO VIANA, MARCUS ; CYBELLE PINTO GOMIDE, ANNE ; FIGUEIRA ABURJAILE, FLAVIA ; TIWARI, SANDEEP ; JAISWAL, ARUN ; GALA-GARCÍA, ALFONSO ; SEYFFERT, NÚBIA ; LUIZ DE PAULA CASTRO, THIAGO ; BRENIG, BERTRAM ; MATIUZZI DA COSTA, MATEUS ; MARIA SELES DORNELES, ELAINE ; LE LOIR, YVES ; AZEVEDO, VASCO . Comparative genomic analysis of ovine and other host associated isolates of Staphylococcus aureus exhibit the important role of mobile genetic elements and virulence factors in host adaptation. GENE , v. 855, p. 147131, 2023.

• PEREIRA, CARINE RODRIGUES ; Kato, Rodrigo Bentes ; ARAÚJO, FABRÍCIO ALMEIDA ; DA SILVA, ALESSANDRA LIMA ; DOS SANTOS, ROSELANE GONÇALVES ; DE JESUS SOUSA, THIAGO ; NEIA, RAQUEL COSTA ; DA SILVA, SAULO BRITTO ; WILLIAMSON, CHARLES H.D. ; GILLECE, JOHN ; LAGE, ANDREY PEREIRA ; O'CALLAGHAN, DAVID ; PICKARD, DEREK ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCA ; DE CARVALHO AZEVEDO, VASCO ARISTON ; FOSTER, JEFFREY T. ; DORNELES, ELAINE MARIA SELES . Genomic investigation of antimicrobial resistance in Brucella abortus strains isolated from cattle in Brazil. GENE REPORTS , v. 31, p. 101777, 2023.

• PEREIRA, CARINE RODRIGUES ; DE JESUS SOUSA, THIAGO ; LIMA DA SILVA, ALESSANDRA ; GONÇALVES DOS SANTOS, ROSELANE ; MINHARRO, SÍLVIA ; COSTA CUSTÓDIO, DIRCEIA APARECIDA ; PICKARD, DEREK J. ; O?CALLAGHAN, DAVID ; FOSTER, JEFFREY T. ; DE CASTRO SOARES, SIOMAR ; JUCA RAMOS, ROMMEL THIAGO ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES ; MATIUZZI DA COSTA, MATEUS ; LAGE, ANDREY PEREIRA ; AZEVEDO, VASCO ; SELES DORNELES, ELAINE MARIA . First report and whole-genome sequencing of Pseudochrobactrum saccharolyticum in Latin America. MICROBES AND INFECTION , v. 24, p. 105018, 2022.

• GONÇALVES DOS SANTOS, ROSELANE ; CASTILLO, RAQUEL HURTADO ; NERES RODRIGUES, DIEGO LUCAS ; LIMA, ALESSANDRA ; FERREIRA DOS ANJOS, WILLIAM ; RIFICI, CLAUDIA ; ATTILI, ANNA RITA ; TIWARI, SANDEEP ; JAISWAL, ARUN KUMAR ; SPIER, SHARON J. ; MAZZULLO, GIUSEPPE ; MORAIS-RODRIGUES, FRANCIELLY ; PINTO GOMIDE, ANNE CYBELLE ; LIMA DE JESUS, LUÍS CLÁUDIO ; ABURJAILE, FLAVIA FIGUEIRA ; BRENIG, BERTRAM ; CUTERI, VINCENZO ; LUIZ DE PAULA CASTRO, THIAGO ; SEYFFERT, NÚBIA ; SANTOS, ANDERSON . Comparative genomic analysis of the Dietzia genus: an insight into genomic diversity, and adaptation. RESEARCH IN MICROBIOLOGY , v. 173, p. 103998, 2022.

• VALDEZ-BAEZ, JUAN ; DA COSTA, FRANCIELLY MORAIS RODRIGUES ; PINTO GOMIDE, ANNE CYBELLE ; PROFETA, RODRIGO ; DA SILVA, ALESSANDRA LIMA ; SOUSA, THIAGO DE JESUS ; VIANA, MARCUS VINÍCIUS CANÁRIO ; BENTES KATO, RODRIGO ; AMERICO, MONIQUE FERRARY ; DOS SANTOS FREITAS, ANDRIA ; CARVALHO, RODRIGO DIAS DE OLIVEIRA ; BRENIG, BERTRAM ; MARTINS, FLAVIANO SANTOS ; ABURJAILE, FLAVIA ; AZEVEDO, VASCO . Comparative Genomics and In Silico Evaluation of Genes Related to the Probiotic Potential of Bifidobacterium breve 1101A. Bacteria , v. 1, p. 161-182, 2022.

• DA SILVA, JÉSSICA GABRIELLE VIDAL ; VIEIRA, ANGÉLICA THOMAZ ; SOUSA, THIAGO J. ; VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; PARISE, DOGLAS ; SAMPAIO, BRUNA ; DA SILVA, ALESSANDRA LIMA ; DE JESUS, LUÍS CLÁUDIO LIMA ; DE CARVALHO, PEDRO KÁSSIO RIBEIRO MATOS LOUREIRO ; DE CASTRO OLIVEIRA, LETÍCIA ; ABURJAILE, FLAVIA FIGUEIRA ; MARTINS, FLAVIANO S. ; NICOLI, JACQUES ROBERT ; GHOSH, PREETAM ; BRENIG, BERTRAM ; AZEVEDO, VASCO ; GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO . Comparative genomics and in silico gene evaluation involved in the probiotic potential of Bifidobacterium longum 51A. GENE , v. 795, p. 145781, 2021.

• DA SILVA, ALESSANDRA LIMA ; ABREU, ANA PAULA DE ; Mariano, Diego ; Caixeta, Felipe ; Santos, Fenícia Brito ; LAGE, FERNANDA STUSSI D. ; Quintanilha-Peixoto, Gabriel ; HILÁRIO, HERON. O. ; XAVIER, JOICYMARA. S. ; QUEIROZ, LUCIO. R. ; DE TOLEDO, NAYARA EVELIN ; TAVARES, RAPHAEL ; Kato, Rodrigo Bentes ; DOS SANTOS, ROSELANE GONÇALVES ; SOARES, STELLAMARIS ; GOES, WANESSA. M. ; NOGUEIRA, WYLERSON. G. ; BATISTA, THIAGO. M. ; ORTEGA, JOSÉ MIGUEL ; DE CARVALHO, VASCO ARISTON AZEVEDO . From In-Person to the Online World: Insights Into Organizing Events in Bioinformatics. Frontiers in Bioinformatics , v. 1, p. 1, 2021.

• ADELINO, TALITA ÉMILE RIBEIRO ; GIOVANETTI, MARTA ; FONSECA, VAGNER ; XAVIER, JOILSON ; DE ABREU, ÁLVARO SALGADO ; DO NASCIMENTO, VALDINETE ALVES ; DEMARCHI, LUIZ HENRIQUE FERRAZ ; OLIVEIRA, MARLUCE APARECIDA ASSUNÇÃO ; DA SILVA, VINÍCIUS LEMES ; DE MELLO, ARABELA LEAL E. SILVA ; CUNHA, GABRIEL MURICY ; SANTOS, ROSELENE HANS ; DE OLIVEIRA, ELAINE CRISTINA ; JÚNIOR, JORGE ANTÔNIO CHAMON ; DE MELO IANI, FELIPE CAMPOS ; DE FILIPPIS, ANA MARIA BISPO ; DE ABREU, ANDRÉ LUIZ ; DE JESUS, RONALDO ; DE ALBUQUERQUE, CARLOS FREDERICO CAMPELO ; SILVA, A. L. . Field and classroom initiatives for portable sequence-based monitoring of dengue virus in Brazil. Nature Communications , v. 12, p. 2296, 2021.

• VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; PROFETA, RODRIGO ; DA SILVA, ALESSANDRA LIMA ; HURTADO, RAQUEL ; CERQUEIRA, JANAÍNA CANÁRIO ; RIBEIRO, BRUNA FERREIRA SAMPAIO ; ALMEIDA, MARCELLE OLIVEIRA ; MORAIS-RODRIGUES, FRANCIELLY ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; OLIVEIRA, MANUELA ; TAVARES, LUÍS ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; WATTAM, ALICE REBECCA ; BARH, DEBMALYA ; GHOSH, PREETAM ; SILVA, ARTUR ; AZEVEDO, VASCO . Taxonomic classification of strain PO100/5 shows a broader geographic distribution and genetic markers of the recently described Corynebacterium silvaticum. PLoS One , v. 15, p. e0244210, 2020.

• Sousa, Thiago ; DA SILVA, ALESSANDRA LIMA ; Mariano, Diego . WordPress sem fronteiras: do básico à construção de sites completos. 1. ed. Alfahelix, 2020. 136p .

• CARVALHO, F. ; MARIANO, D. ; BOMFIM, M. ; FIORINI, G. ; BASTOS, L. ; ABREU, A. P. ; PAIXAO, V. ; SANTOS, L. ; SILVA, J. ; PUELLES, A. ; SILVA, A. L. ; MELO-MINARDI, R. C. . Using Natural Language Processing for Context Identification in COVID-19 Literature.. In: Marcelo S. Reis; Raquel C. de Melo-Minardi. (Org.). Lecture Notes in Computer Science. 1ed.Baar, Switzerland: Springer Cham, 2023, v. 13954, p. 70-81.

• Mariano, Diego ; Nogueira, Wylerson G. ; Goes, Wanessa M. ; dos Santos, Roselane G. ; Kato, Rodrigo Bentes ; Toledo, Nayara ; Queiroz, Lucio R. ; Hilário, Heron O. ; Quintanilha-Peixoto, Gabriel ; Lage, Fernanda S. D. ; Santos, Fenícia Brito ; Caixeta, Felipe ; de Abreu, Ana Paula ; DA SILVA, ALESSANDRA LIMA ; Xavier, Joicymara S. . Uma estratégia para engajamento de participantes de eventos online. BIOINFO - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 1ed.: Alfahelix, 2021, v. , p. 1-.

• BASTOS, L. L. ; ROCHA, R. E. O. ; MARIANO, D. C. B. ; SANTOS, L. M. ; FIORINI, G. C. ; PUELLES, A. L. A. ; PAIXAO, V. M. ; SILVA, A. L. ; ABREU, A. P. ; LIMA, L. H. F. ; MELO-MINARDI, R. C. . Prospecting Drugs Target in Kinetoplastid Ribosomes. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SILVA, A. L. ; FIORINI, G. ; CONCEICAO, I. M. ; COSTA, S. S. ; BAPTISTA, G. ; CAMARGO, T. M. N. ; OLIVEIRA, B. S. ; NOGUEIRA, WYLERSON. G. ; MELO-MINARDI, R. C. ; MARIANO, D. C. B. . BIOINFO: the first Brazilian journal of scientific dissemination of bioinformatics and computational biology in Portuguese. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• BENTES KATO, RODRIGO ; NERES RODRIGUES, DIEGO LUCAS ; VALDEZ-BAEZ, JUAN ; dos Santos, Roselane G. ; TOSTA, S. F. O. ; SILVA, A. L. ; CYBELLE PINTO GOMIDE, ANNE ; GALA-GARCÍA, ALFONSO ; RODRIGUES DA COSTA, FRANCIELLY MORAIS ; AZEVEDO, V. A. C. . Comparative genomics analysis and classification of the Lactobacillus casei species. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CERQUEIRA, JANAÍNA CANÁRIO ; PROFETA, R. ; SILVA, A. L. ; CASTILLO, RAQUEL HURTADO ; ALMEIDA, MARCELLE OLIVEIRA ; SOUSA, THIAGO DE JESUS ; LUCAS NERES RODRIGUES, DIEGO ; VALDEZ-BAEZ, JUAN ; DA COSTA, FRANCIELLY MORAIS RODRIGUES ; CYBELLE PINTO GOMIDE, ANNE ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; WATTAM, ALICE REBECCA ; AZEVEDO, V. A. C. ; VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO . Taxonomy and comparative genomics of a Corynebacterium ulcerans strain isolated from Pig, previously identifield as C. pseudotuberculosis. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• NERES RODRIGUES, DIEGO LUCAS ; VALDEZ-BAEZ, JUAN ; dos Santos, Roselane G. ; TOSTA, S. F. O. ; SILVA, A. L. ; GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO ; BENTES KATO, RODRIGO ; GALA-GARCÍA, ALFONSO ; MORAIS-RODRIGUES, FRANCIELLY ; AZEVEDO, VASCO . Comparação filogenômica de seis linhagens e classificação dentro do gênero de Lactobcillus casei. 2019. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• NERES RODRIGUES, DIEGO LUCAS ; VALDEZ-BAEZ, JUAN ; dos Santos, Roselane G. ; SILVA, A. L. ; TOSTA, S. F. O. ; HURTADO CASTILLO, RAQUEL ; GALA-GARCÍA, ALFONSO ; GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO ; Kato, Rodrigo Bentes ; COSTA, R. A. ; CERQUEIRA, JANAÍNA CANÁRIO ; MORAIS-RODRIGUES, FRANCIELLY ; AZEVEDO, VASCO . Brief Comparative Genomics about Lactobacillus casei. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SILVA, ALESSANDRA LIMA . Vigilância de Arbovírus no Brasil. 2019. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• SILVA, A. L. . Palestra: GNU/Linux e Bioinformática: outro casamento perfeito. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• VIANA, MARCUS VINÍCIUS CANÁRIO ; KUMAR, A. ; SILVA, A. L. ; SAMPAIO, BRUNA ; PROFETA, R. ; BACHA, S. B. J. ; GUIMARAES, L. C. ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; TIWARI, SANDEEP ; WATTAM, ALICE REBECCA ; AZEVEDO, V. A. C. ; SILVA, ARTUR . In silico identification of drug and vaccine targets in Corynebacterium ulcerans. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• NESIO, R. ; SILVA, A. L. ; PARISE, M. ; DA COSTA, FRANCIELLY MORAIS RODRIGUES ; Parise, D ; BENTES KATO, RODRIGO ; GOES NETO, A. ; AZEVEDO, V. A. C. . BBLASTER - An optimization to obtain unified reports on homologous genes using BLAST.. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SAMPAIO, BRUNA ; CAETANO, A. C. B. ; SILVA, A. L. ; dos Santos, Roselane G. ; VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; PROFETA, R. ; SEYFFERT, NÚBIA ; LE LOIR, YVES ; BRENIG, BERTRAM ; AZEVEDO, V. A. C. ; LUIZ DE PAULA CASTRO, THIAGO . Complete genome sequence of Staphylococcus aureus strain O17. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SILVA, ALESSANDRA LIMA . Análises de seleção positiva em escala genômica de Corynebacterium pseudotuberculosis, C. ulcerans e C. diphtheriae. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• SILVA, ALESSANDRA LIMA . Descubra novas estratégias contra patógenos. 2018. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• SILVA, A. L. ; FREITAS, L. M. . R script to HLA epitope predictor based in matrix frequency: training and performance comparisons. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• SILVA, A. L. ; SILVA, M. M. ; CANDIDO, E. M. B. ; TOMAZI, L. ; FREITAS, L. M. ; NISHIYAMA, P. B. . Jogo das Super Frutas: uma proposta lúdica para o ensino de melhoramento genético vegetal. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SILVA, A. L. ; Mariana Rebouças ; ALVES, C. ; BRITTO, F. F. ; Eliana Maffei ; AMARAL, C. L. F. . ANÁLISE CITOGENÉTICA DE GENÓTIPOS DE HÍBRIDOS PUTATIVOS ORIUNDOS DO CRUZAMENTO DE GENÓTIPOS DE MARACUJÁ MELÃO( PASSIFLORA QUADRANGULARIS ) E MARACUJÁ DO MATO( PASSIFLORA CINCINNATA),. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERRAZ, D.S. ; SANTOS, A. C. ; SILVA, A. L. ; Leandro Freiras . Evaluation of the robustness of genes method as a test to indicate the occurrence of natural selection in simulated sequences. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Mariana Rebouças ; BRITTO, F. F. ; SILVA, A. L. ; Jordânia dos Santos Sousa ; CRUZ, J. O. ; AMARAL, C. L. F. . AVALIAÇÃO DA COMPATIBILIDADE INTRAESPECÍFICA DE GENÓTIPOS DE MARACUJAZEIROS. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Flávio Flores Britto ; AMARAL, C. L. F. ; Valcimar D. L. ; Francis Silva ; SILVA, A. L. ; Mariana Rebouças . Análise do teor de sólidos solúveis totais-SST(Brix) em frutos de genótipos de maracujá- melão (Passiflora quadrangularis ). 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• ALVES, C. ; BRITTO, F. F. ; Valcimar D. L. ; Francis Silva ; SANTOS, A. C. ; Jordânia dos Santos Sousa ; SILVA, A. L. ; Mariana Rebouças ; CRUZ, J. O. ; SILVA, J. P. L. . Avaliação de caracteres agronômicos de maracujazeiros (Passiflora spp.) utilizados em procedimentos de hibridização no município de Vitória da Conquista- B, Brasil. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• BRITTO, F. F. ; Francis Silva ; Valcimar D. L. ; SILVA, A. L. ; Mariana Rebouças ; AMARAL, C. L. F. . CARACTERIZAÇÃO AGRONÔMICA DE GENÓTIPOS DE MARACUJÁ-MELÃO(PASSIFLORA QUADRANGULARIS) UTILIZADOS NO PROGRAMA DE MELHORAMENTO GENÉTICO DA UNIVERSIDADE ESTADUAL DO SUDOESTE DA BAHIA EM VITÓRIA DA CONQUISTA-BA,BRASIL. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2023 - Atual

  Rede BIOINFO.com - a rede de divulgação científica em bioinformática, Descrição: Projetos de divulgação cientifica são catalizados pelo uso massivo de mídias sociais (blogs, redes sociais e plataformas de vídeos). No cenário em que fake news tem causado danos e preocupações, cientistas e pós-graduandos tem se posicionado nas mídias sociais almejando aproximar a ciência do público. A sociedade precisa da ciência para tomar decisões acertadas sobre diversas questões de grande relevância. A Bioinformática envolve a computação e a biologia, principalmente. Tem aplicação e impacto na biotecnologia, biomedicina, farmácia, medicina humana e veterinária, agronomia, e outras. Foi essencial no entendimento do SARS-CoV-2 a nível molecular e epidemiológico. O público normalmente desconhece a interação entre as ciências exatas e biológicas na resolução dos mais diversos problemas. Estudantes do ensino médio sequer vislumbram a possibilidade de seguir carreira que entrelace essas duas áreas. A missão do projeto é agregar iniciativas de comunicação da ciência complementares para divulgar a bioinformática e seus impactos econômicos e sociais. Propõe-se a criação de uma rede agregando 3 projetos, reconhecidos nacionalmente. Visamos o aprimoramento através do trabalho colaborativo, do compartilhamento de recursos e conhecimento na rede e a incubação de novos projetos. Os são: OnlineBioinfo, de ciência em vídeo com público aproximado de 10.000 inscritos; Revista Brasileira de Bioinformática, com 20 artigos de divulgação científica publicados e público de 11.000 leitores/ano e o curso anual organizado pelos discentes do PPG em Bioinformática/UFMG. Nas edições presenciais foram cerca de 600 participantes e, na edição online, 2.727. O suporte da FAPEMIG é essencial para o estabelecimento da rede e aprimoramento dos projetos e fomento a iniciativas de divulgação da ciência, tecnologia e inovação. A rede surgiu no PPG em Bioinformática/UFMG e tem o apoio da Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional (AB3C), que confere visibilidade nacional.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alessandra Lima da Silva - Integrante / MELO-MINARDI, RAQUEL. C. DE - Coordenador.

• 2022 - Atual

  AB INITIO: A Bioinformatics and Information technology Network for Intelligence, Technology and Innovation for Open biotechnological problems, Descrição: A Biotecnologia é o desenvolvimento e uso de tecnologias baseadas em processos biomoleculares visando produtos úteis para a sociedade. A Bioinformática trouxe avanços, elevando o entendimento no combate a patologias, redução e mitigação de danos ao meio ambiente, uso eficiente e limpo de fontes de energia, entre outros. Graças a avanços tecnológicos, cientistas e empresas têm acesso a enormes volumes de dados de ampla gama de organismos com potencial de uso biotecnológico. A sinergia entre a computação e a biologia é profícua, avançando a geração de conhecimento para inovação. Além disso, novas arquiteturas de redes neurais profundas têm sido úteis no desenvolvimento de técnicas inovadoras neste campo. O Programa de Pós-Graduação em Bioinformática da UFMG é o maior e mais tradicional na área no país, com tradição no desenvolvimento de ferramentas de Bioinformática para Biotecnologia. São pelo menos 26 softwares disponibilizados publicamente. Uma de nossas especialidades é a resolução de problemas através de modelos e algoritmos, gerando ferramentas. Nosso corpo docente e discente, diverso e qualificado, há duas décadas trabalha com problemas inovadores, coleta e analisa dados em larga escala, propõe soluções e implementa serviços baseados em técnicas do estado-da-arte, como inteligência artificial usando computação de alto desempenho. O mote deste projeto é levar o PPG em Bioinformática da UFMG a um novo nível no cenário da inovação. Pretendemos construir um ecossistema para o desenvolvimento de produtos e serviços gerados nas dissertações e teses. Pretendemos ainda acelerar ideias inovadoras passíveis de transferência tecnológica ou da criação de empresas. Criaremos uma trilha formativa guiando os alunos no desenvolvimento de produtos/serviços como resultado dos projetos, culminando em protótipos. Atrairemos um aglomerado de empresas para parcerias para desenvolvimento de ferramentas e desenvolvimento de dissertações/teses embasadas em encomendas tecnológicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (6) Doutorado: (6) . , Integrantes: Alessandra Lima da Silva - Integrante / MELO-MINARDI, RAQUEL. C. DE - Coordenador / Diego Cesar Batista Mariano - Integrante / Raquel Cardoso de Melo Minardi - Integrante / Sabrina Azevedo Silveira - Integrante / Leonardo Henrique França Lima - Integrante / José Miguel Ortega - Integrante / Aristóteles Góes Neto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2014 - 2016

  Seleção, amplificação e clonagem de genes codificadores de proteína de Trypanosoma cruzi preditos in silico com afinidade por MHC I, Descrição: Trypanosoma cruzi é agente etiológico da doença de Chagas, conhecida também como tripanossomíase americana. Ele é um protozoário responsável por infectar milhões de pessoas em tudo o mundo, sendo mais de dois milhões apenas no Brasil, e apresenta ampla distribuição no estado da Bahia. Foram coletadas sequências primárias de proteínas em banco de dados de sequências, contendo informações sobre a expressão nas fases tripomastigota metacíclica e amastigota, estágios no qual são encontrados em pacientes chagásicos. Foi realizada predição in silico dessas proteínas para a capacidade de serem reconhecidas pelo MHC classe I em humanos. Dentre esses, dois foram selecionados: trans-sialidase TcS I e N-myristoyl transferase, com o objetivo de amplificar, construir dois vetores com os genes codificadores dessas proteínas selecionadas clonados e transformação de Escherichia coli. Além da predição de ligação pelo MHC I, será realizada também predição de reconhecimento por células B, e reconhecimento por corte pelo proteasoma humano, para ampliar a predição de atividade imunogênica dessas proteínas. Essas proteínas poderão serem expressas e purificadas para utilizarmos na verificação da reatividade com soro de pacientes positivos para a doença de Chagas. Ambas apresentaram alta afinidade na predição in silico ao MHC de classe I, sendo prováveis alvos para construção de um perfil sorológico para pessoas naturalmente infectadas da região sudoeste da Bahia.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Alessandra Lima da Silva - Integrante / Anderson Coqueiro Santos - Integrante / Daniela Costa Silva - Integrante / Kamilla Menezes Oliveira - Integrante / Kleiton Paulino da Silva - Integrante / Taiana Tainá Silva Pereira - Integrante / Leandro Martins de Freitas - Coordenador / Brendon Oliveira Leite - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2013 - 2014

  Análise da robustez genética: robustez de genes codificadores de proteínas em diferentes organismos patogênicos e avaliação de novos métodos para sua determinação., Descrição: Fazer análises para detecção da ação da seleção natural usando métodos baseados na robustez genética, independentes da comparação entre espécies, utilizando o método criado por Plotkin et al. (2004) chamado de "volatilidade", utilizando-se de simulações desenvolvidas em linguagem PERL para evolução de sequências codificadoras sob ação da seleção negativa e positiva comparadas com a evolução por neutralidade, busca de ação da seleção natural em genomas bacterianos (Bacillus subtilis, Escherichia coli e Mycoplasma tuberculosis) que diferem quando a velocidade de replicação, e em grupos dentro da família gênica trans-sialidase de Trypanosoma cruzi que apresentam diferenças de diversidade e localização genômica. As análises em sequências reais poderão evidenciar que o método de volatilidade é capaz de identificar organizações genômicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Alessandra Lima da Silva - Integrante / Anderson Coqueiro Santos - Integrante / Daniela Costa Silva - Integrante / Daniel Silva Ferraz - Integrante / Leandro Martins de Freitas - Coordenador., Número de produções C, T & A: 2

Prêmios