Hugo Henrique Slepicka

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Produções bibliográficas

• SLEPICKA, H. H. ; CANOVA, H. F. ; BENIZ, D. B. ; PITON, J. R. . Py4Syn : Python for synchrotrons. Journal of Synchrotron Radiation , v. 22, p. 22, 2015.

• CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA ; DE CARVALHO, LUCAS MIGUEL ; SLEPICKA, HUGO HENRIQUE ; VIDAL, RAMON OLIVEIRA ; PEREIRA, GONÇALO AMARANTE GUIMARÃES ; KOBARG, JÖRG ; VAZ MEIRELLES, GABRIELA . IIS - Integrated Interactome System: A Web-Based Platform for the Annotation, Analysis and Visualization of Protein-Metabolite-Gene-Drug Interactions by Integrating a Variety of Data Sources and Tools. Plos One , v. 9, p. e100385, 2014.

• SLEPICKA, H. H. ; BARBOSA, M. A. ; OMITTO, D. O. ; BONGERS, R. ; CARDOSO, M. B. ; POLLI, J. M. ; OLIVEIRA, D. C. ; MAURICIO, J. C. ; RODELLA, C. B. ; CANOVA, H. F. ; XAVIER, M. M. ; WESTFAHL JUNIOR, H. . LABWEB LNLS BEAMLINES REMOTE OPERATION SYSTEM. In: ICALEPCS2013 - 14th International Conference on Accelerator & Large Experimental Physics Control Systems, 2013, San Francisco-CA. 14th International Conference on Accelerator & Large Experimental Physics Control Systems, 2013. p. 638-641.

• ODOWD, F. P. ; SLEPICKA, H. H. ; GERALDES, R. R. ; ISAAC, A. C. . High resolution synchrotron X-ray radiography and tomography at the IMX beamline (LNLS). In: SBPMat, 2013, Campos do Jordão. Sociedade Brasileira de Pesquisas Materiais, 2013.

• CARAZZOLLE, M. F. ; CARVALHO, L. M. ; SLEPICKA, H. H. ; VIDAL, R. O. ; PEREIRA, G. A. G. ; KOBARG, J. ; MEIRELLES, G. V. . IIS as an integrative platform for the annotation, visualization and analysis of interaction networks between proteins, genes, metabolites and drugs in a Systems Biology perspective. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

• 2013 - Atual

  Biologia de Sistemas: modelagem dinâmica e estrutural de redes biológicas e descoberta de alvos e drogas, Descrição: Na última década, a pesquisa na área biológica ultrapassou a capacidade humana de analisar o imenso volume de dados acumulados, gerados a partir do desenvolvimento de tecnologias em larga escala, e das abordagens ômicas . Assim, o uso de programas computacionais para o armazenamento, busca, análise e integração dos dados é de fundamental importância. A Biologia de Sistemas é uma área multidisciplinar que visa integrar os dados relativos a genes e proteínas individuais e investigar o comportamento e relações entre os diversos elementos de um sistema biológico para explicar o seu funcionamento. Neste contexto, o câncer, uma patologia altamente heterogênea, envolvendo a desregulação de múltiplas vias interconectadas que encontram-se alteradas de uma forma complexa por diversas mutações gênicas em conjunto com o contexto ambiental, depende de uma caracterização multivariada e quantitativa, e de análises computacionais para a compreensão preditiva ou mecanicista da patologia. Este projeto tem como foco, portanto, o desenvolvimento de novos módulos (pipelines) dentro de uma plataforma integrativa, recentemente desenvolvida em nosso laboratório, para (i) o processamento e análise estatística de dados oriundos de transcritômica, proteômica e metabolômica, (ii) a construção de redes condicionais e estruturais a partir desses dados, e (iii) a modelagem destas redes de interação, de forma otimizada e automatizada, dentro de uma perspectiva de Biologia de Sistemas baseada em redes complexas no câncer. Serão desenvolvidos modelos dinâmicos in silico para a análise das redes de interação, em particular o interactoma das Neks (NIMA-related kinases) e o interactoma de carcinoma e melanoma, e a identificação e validação de alvos terapêuticos e possíveis inibidores (drogas) com potencial para testes pré-clínicos e clínicos, que possam ser utilizados em novas estratégias terapêuticas anti-câncer. Pretendemos ainda, a partir dessa proposta, implementar uma linha de pesquisa em Biologia de Sistemas, voltada para a análise integrativa de dados ômicos e estruturais em redes de interação, como ponto de partida para a investigação das propriedades emergentes dos sistemas biológicos, em seus diferentes níveis (células, tecidos e organismos), abrangendo diversos organismos, com foco nos estudos com genes/proteínas humanas relacionadas a câncer e descoberta de drogas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Hugo Henrique Slepicka - Integrante / Marcelo F Carazzolle - Integrante / Lucas Miguel Carvalho - Integrante / Jörg Kobarg - Integrante / Gabriela Vaz Meirelles - Coordenador / Adriana Franco Paes Leme - Integrante / Avi Ma Ayan - Integrante / Paulo Sérgio Lopes de Oliveira - Integrante / Guilherme Pimentel Telles - Integrante / Rosane Minghim - Integrante / Danielle Furtado dos Santos Dias - Integrante.