Vinicius Provenzi Coltro

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Produções bibliográficas

• DE FRAGA, ALINE PADILHA ; GRÄF, TIAGO ; COLTRO, VINICIUS PROVENZI ; IKUTA, NILO ; FONSECA, ANDRÉ SALVADOR KAZANTZI ; MAJÓ, NATÀLIA ; LUNGE, VAGNER RICARDO . Phylodynamic analyses of Brazilian antigenic variants of infectious bursal disease virus. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION , v. 73, p. 159-166, 2019.

Projetos de pesquisa

• 2015 - 2016

  Análise de formas recombinantes de HIV-1 em indivíduos soropositivos da cidade de Joinville/SC, Descrição: O HIV-1 pode ser classificado em grupos, subtipos, sub-subtipos, bem como em formas recombinantes circulantes (CRFs). Tais CRFs são definidas como cepas virais causadoras de três ou mais infecções em indivíduos não relacionados epidemiologicamente. As CRFs são responsáveis por mais de 20% dos casos de HIV/aids em todo o mundo. Em um período de cerca de 8 anos o número de CRFs cresceu 4,5%, em compensação houve um acréscimo de 50% no número de infecções causadas por CRFs. Apesar disto, apenas a CRF_31BC foi identificada até hoje no sul do país. Com uma alta frequência de indivíduos infectados pelo HIV-1 e diferentes subtipos circulantes, este dado provavelmente é fruto de uma subestimativa, refletindo a falta de estudos e consequentemente mascarando o real patamar da epidemia de aids no sul do país. Estudos anteriores encontraram em Jiniville/SC um grupo de três sequências recombinantes com aproximadamente 1125 pb (correspondente ao fragmento que vai da posição 2265 a 3290 do genoma do HIV-1) e uma classificação filogenética incomum. A partir de um BLAST para cada uma destas três sequências, outras cinco foram retiradas dos bancos de dados, totalizando oito sequências isoladas de indivíduos brasileiros HIV-positivos coletadas entre 1992 e 2013. A análise de recombinação foi realizada no programa RDP3 utilizando-se os métodos de MaxChi, 3seq, Chimaera, BootScanning e RDP. Análises filogenéticas bayesianas foram realizadas empregando-se um modelo de relógio molecular relaxado associado ao modelo de substituição nucleotídica GTR+G4+I e ao modelo de coalescência bayesiano SkyLine. As análises de recombinação mostraram que estas oito sequências apresentam o mesmo padrão de recombinação. Este recombinante é composto por um fragmento central com aproximadamente 373 pb correspondente ao subtipo B ladeado por dois fragmentos pertencentes ao subtipo C. As análises filogenéticas realizadas para cada fragmento indicaram que ambos os parentais são brasileiros. Além disso, o fragmento correspondente ao subtipo B agrupou-se com uma sequência do Rio Grande do Sul, apontando a região sul como o local mais provável para a emergência deste recombinante. Ademais, análises filogenéticas mostram que este evento de recombinação ocorreu no Brasil em 1982 (95% HPD: 1979-1987), consistente com o tempo de co-circulação entre os subtipos B e C no sul do Brasil. Apesar das fortes evidencias da ocorrência deste recombinante apresentadas neste estudo, análises envolvendo sequências inteiras com este mesmo padrão filogenético são necessárias para a completa caracterização e determinação desta com uma nova CRF entre os subtipos B e C do HIV-1. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Vinicius Provenzi Coltro - Integrante / Aguinaldo Roberto Pinto - Coordenador / Tiago Gräf - Integrante.

• 2014 - 2015

  Análise da expressão de proteínas intracelulares pró e antivirais em parceiros soronegativos de casais HIV-sorodiscordantes da região da Grande Florianópolis, Descrição: A infecção pelo HIV é responsável por causar a síndrome da imunodeficiência adquirida (aids), importante causa de morte entre as doenças infecciosas. A transmissão ocorre principalmente por via sexual e a história natural desta infecção é complexa e variável, podendo apresentar diferentes padrões de progressão. Atualmente, existem muitos relatos de indivíduos que em algum momento foram expostos ao vírus e não se infectaram, sugerindo a existência de mecanismos de resistência natural ao HIV. Esses indivíduos podem ser representados pelo parceiro soronegativo de casais sorodiscordantes. Apesar de ainda não existir um consenso com relação a que fatores são determinantes para a diminuição da suscetibilidade a esse vírus, algumas proteínas intracelulares têm sido investigadas por influenciarem no processo de infecção do HIV. O presente projeto teve como objetivo avaliar a expressão das proteínas PSIP1 e CFLAR, com potencial atividade antiviral, em linfócitos T CD4+ e monócitos provenientes de membros de casais sorodiscordantes (pacientes HIV-positivo e parceiro exposto e não infectado) e indivíduos HIV-negativos doadores de plaquetas. A avaliação da expressão dessas proteínas foi realizada através da metodologia de Western blotting. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Vinicius Provenzi Coltro - Integrante / Aguinaldo Roberto Pinto - Coordenador.

• 2013 - 2014

  Análise da expressão gênica de APOBEC3G e BST-2 em casais HIV-soro discordantes da região metropolitana de Florianópolis/SC, Descrição: A infecção pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV) é responsável por causar a síndrome da imunodeficiência adquirida (AIDS) importante causa de morte entre as doenças infecciosas. A transmissão ocorre principalmente por via sexual e a história natural desta infecção é complexa e variável, podendo apresentar diferentes padrões de progressão da doença. Atualmente, existem muitos relatos de indivíduos que em algum momento foram expostos ao vírus, e não se infectaram, sugerindo a existência de mecanismos de resistência natural ao HIV. Esses indivíduos podem ser representados pelo parceiro soronegativo de casais sorodiscordantes. Apesar de ainda não existir um consenso com relação a que fatores são determinantes para a diminuição da suscetibilidade a esse vírus, algumas proteínas intracelulares têm sido estudadas por influenciarem no processo de infecção do HIV. O presente projeto teve como objetivo avaliar a expressão dos genes APOBEC3G e BST-2, que codificam proteínas intracelulares com potencial atividade antiviral, em linfócitos T CD4+ e monócitos provenientes de membros de casais sorodiscordantes (pacientes HIV-positivo e parceiro exposto e não infectado) e indivíduos HIV-negativos doadores de plaquetas. A avaliação de transcritos foi realizada através da metodologia de RT-qPCR. As análises estatísticas foram realizadas utilizando-se o teste t de Student para os dados que apresentaram distribuição normal e o teste de Mann-Whitney para os dados não paramétricos. (SPSS Statistics 17.0), considerando-se as diferenças significativas quando p<0,05. Os resultados obtidos sugerem não haver diferenças significativas na expressão dos genes APOBEC3G e BST-2 entre os indivíduos avaliados, porém sugerimos estudos com uma coorte maior de indivíduos devem ser realizados para confirmar estes achados. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Vinicius Provenzi Coltro - Integrante / Iris Mattos Santos - Integrante / Aguinaldo Roberto Pinto - Coordenador.