Alessandro de Mello Varani
Pesquisador (nível IIA) da Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Câmpus de Jaboticabal - UNESP - FCAV. Trabalho desenvolvendo diversas linhas de pesquisa nas áreas de (meta)-genômica e bioinformática de micro-organismos e plantas. Estudo o genoma de plantas carnívoras pertencentes a família das Lentibulariaceae, e também outras espécies de plantas de nossa biodiversidade, em particular Cupuaçu, Maracujá, e as plantas usadas no preparo da Ayahuasca, uma bebida enteógena produzida a partir da combinação da Banisteriopsis caapi com Psychotria viridis. No mundo procariótico, estudo o genoma de fitopatógenos, principalmente relacionado com o gênero Xanthomonas. Também estudo genomas de Cianobactérias e outras bactérias de interesse biomédico, ambiental e agronômico; assim como metagenômica aplicada a bactérias ambientais de interesse biotecnológico (consórcios bacterianos). Recentemente começei a trabalhar com genômica de bactérias ácido láticas relacionadas a produção de compostos probióticos e suas possíveis aplicações na Agropecuária. Tenho o interesse particular em estudar os mecanismos que regem a evolução e estrutura de genomas. Neste sentido, no decorrer de minha formação me especializei no papel que Elementos Transponíveis (TEs) podem desempenhar na evolução e estrutura genômica de bactérias (procariotos) e plantas. Para este fim, desenvolvi (e continuo desenvolvendo) diversas abordagens computacionais para prospectar, classificar, catalogar e analisar estes TEs, com base nos conhecimentos de seus mecanismos biológicos de mobilização revelados experimentalmente. Maiores informações na minha página pessoal: https://www.fcav.unesp.br/genomics
Informações coletadas do Lattes em 28/04/2026
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Biotecnologia
2004 - 2008
Universidade de São Paulo
Título: Análise in-silico de integrase no fitopatógeno Xylella fastidiosa: diversidade, sítios de integração e associação com bacteriófagos
Marie-Anne Van Sluys. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Xylella fastidiosa; Genômica; Integrases; Fagos; Bioinformática.Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genoma. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Molecular Computacional.
Especialização em Bioinformatica (Pos-graduacao Lato Senso)
2002 - 2002
Laboratório Nacional de Computação Científica
Título: Re-anotação Genomica da Archea-bactéria Pyrococcus horikohii OT3
Orientador: Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Aperfeiçoamento em Genomas de interesse agronômico e ambientais (AEG)
2002 - 2003
Universidade de São Paulo
Título: Genomas Ambientais e Agronômicos - AEG. Ano de finalização: 2003
Orientador: Marie Anne Van Sluys
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Pós-doutorado
2011 - 2013
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Genômica. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática.
2008 - 2011
Pós-Doutorado. , Centre National de la Recherche Scientifique, CNRS, França. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Genômica. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Formação complementar
2013 - 2013
Workshop on Bioinformatic tools for soil microbiol. (Carga horária: 8h). , Thünen Institute, TI, Alemanha.
2008 - 2008
The Third Workshop Comparative Microbial Genomics. (Carga horária: 45h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2007 - 2007
PAE - PROGRAMA DE APERFEIÇOAMENTO DE ENSINO. (Carga horária: 360h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2005 - 2005
Evolução de Proteínas por DNA Shuffling. (Carga horária: 4h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
2004 - 2004
Curso de Programação Em Perl Com Módulo Dbi. (Carga horária: 10h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2004 - 2004
Curso de Oratória. (Carga horária: 20h). , Lammas Consultoria, LAMMAS, Brasil.
2003 - 2003
Métodos de Análises Filogenéticas. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
2003 - 2003
Introdução a Biologia Computacional. (Carga horária: 56h). , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Usp, FMRP, Brasil.
2000 - 2000
Extensão universitária em Citologia Esfoliativa Cérvico Vaginal. (Carga horária: 600h). , Centro Universitário "Barão de Mauá", UNI-MAUÁ, Brasil.
1999 - 1999
Extensão universitária em Análises Ambientais. (Carga horária: 1270h). , Centro Universitário "Barão de Mauá", UNI-MAUÁ, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Genômica.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genoma/Especialidade: Genômica Comparativa.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Molecular Computacional.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Organização de eventos
Varani, A.M. ; RODRIGUES, J. D. B. . XVII Curso de Inverno de Genética. 2023. (Outro).
Varani, A.M. ; PINHEIRO, A. L. M. ; BATISTA, U. S. ; BIZARRIA JUNIOR, R. ; SANTOS, R. A. C. ; FERRAZ, R. S. ; MARTINS, P. M. ; GRAF-GRACHET, N. ; FARIA, L. Z. ; MALAQUIAS, J. B. ; FERREIRA, J. G. R. N. ; FRAJACOMO, H. C. ; CRESTANA, G. S. ; MARAGARIDO, G. A. ; WINCK, F. V. ; CORRER, F. H. ; THOMAZ, A. T. . IV WORKSHOP DE PYTHON PARA DADOS BIOLÓGICOS. 2021. (Outro).
PINHEIRO, D. G. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, A. M. . "III Curso de Verão em Bioinformática". 2018. (Outro).
PINHEIRO, D. G. ; MIRANDA, V. F. O. ; Varani, A.M. . I Curso de Verão em Bioinformática (Metagenômica: conceitos e aplicações). 2016. (Outro).
OLIVEIRA, R. A. ; FERRO, M. I. T. ; PENHA, H. A. ; MONTASSIER, H. J. ; SOUZA, J. A. M. ; VANTINI, J. S. ; CARDOZO, M. V. ; PENA, M. M. ; BORZI, M. M. ; COZENTINO, N. C. B. ; DUDA, R. M. ; CASTELLANE, T. C. L. ; MARIGUELA, V. C. ; CARVALHO, F. M. S. ; MOCHI, D. A. ; PINHEIRO, D. G. ; DAQUILA, E. M. T. ; GIMENEZ, D. J. ; PAVANI, C. D. ; VARANI, A. M. ; et.al . 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. 2016. (Congresso).
FERRO, J. A. ; TEZZA, R. I. D. ; FACINCANI, A. P. ; VARANI, A. M. ; BALBUENA, T. S. ; OLIVEIRA, M. T. . Seminários CREBIO 5° Ciclo. 2016. (Outro).
FERRO, J. A. ; TEZZA, R. D. ; FACINCANI, A. P. ; VARANI, A. M. ; BALBUENA, T. S. ; OLIVEIRA, M. T. . Seminários CREBIO 6° Ciclo. 2016. (Outro).
Varani, A.M. ; BALBUENA, T. S. ; OLIVEIRA, M. T. ; TEZZA, R. D. ; FERRO, J. A. . Seminários CREBIO ? 3° Ciclo. 2015. (Outro).
Varani, A.M. ; FERRO, J. A. ; BALBUENA, T. S. ; OLIVEIRA, M. T. ; TEZZA, R. I. D. ; FACINCANI, A. P. . Seminários CREBIO ? 4° Ciclo. 2015. (Outro).
VARANI, A. M. ; OLIVEIRA, M. T. ; BALBUENA, T. S. ; TEZZA, R. I. D. . Seminários CREBIO ? 1° Ciclo. 2014. (Outro).
BALBUENA, T. S. ; OLIVEIRA, M. T. ; VARANI, A. M. ; TEZZA, R. I. D. . Seminários CREBIO ? 2° Ciclo. 2014. (Outro).
MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; PINHEIRO, J. B. ; VIEIRA, M. L. C. ; Bandel G. ; VARANI, A. M. ; BRANDAO, M. . 28º ENCONTRO SOBRE TEMAS DE GENÉTICA E MELHORAMENTO. 2011. (Outro).
Participação em eventos
21º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X-Meeting 2025. Genomic Characterization of Paenibacillus sp. 210: A Multifunctional Microbial Resource for Sustainable Crop and Animal Production. 2025. (Congresso).
70º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA. CHROMOSOME-SCALE GENOMIC AND REGULATORY SIGNATURES OF WITCHES' BROOM DISEASE RESISTANCE IN CUPUASSU (Theobroma grandiflorum). 2025. (Congresso).
20º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X-Meeting 2024. Toward Complete Genome Assembly of the Hexaploid and Highly Heterozygous Entheogenic Plant Psychotria viridis Using PacBio HiFi and Hi-C Technologies. 2024. (Congresso).
69º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA. Exploring the Organellar Genomes of the Entheogenic Plant Mimosa tenuiflora: Phylogenetic Analysis and Genomic Landscape. 2024. (Congresso).
Genotropics Workshop 2024 - Colaborações igualitárias para o futuro da Genômica da Biodiversidade.Geração de dados genômicos no exterior. 2024. (Encontro).
Workshop de Atualização sobre HLB. 2024. (Simpósio).
XXVIII International Symposium on Genetics and Plant Breeding.Sequenciamento Genômico de Plantas Utilizando as Últimas Tecnologias: PacBio HiFi, ONT e Hi-C. 2024. (Simpósio).
GCCRC FROM GENE TO TRAIT 2023 - GENOMICS FOR CLIMATE CHANGE RESEARCH CENTER.Genomics of the Brazilian Biodiversity: The Cupuaçu (Theobroma grandiflorum) and Ayahuasca (Psychotria viridis and Banisteriopsis caapi) genomes project Towards phased chromosome-scale and high-quality annotated genomes. 2023. (Encontro).
I Curso de inverno em Biociências e Biotecnologia.Transposons e seu impacto na multirresistência. 2023. (Outra).
I Escola de Verão em Microbiologia Agropecuária.Prospecção de novos compostos probióticos e genômica de bactérias bacteriocinogênicas. 2023. (Encontro).
II Natal Bioinformatics Forum.Genomics of the Brazilian Biodiversity: The Cupuaçu and Ayahuasca genome projects.. 2023. (Encontro).
X-Meeting / BSB 2023. Benchmarking and Improving Plant Genome Annotation Through an Combination of Bioinformatics Tools. 2023. (Congresso).
XVII Curso de Inverno em Genética.Organização. 2023. (Outra).
67th Brazilian Congress of Genetics. The chromosome-scale genome sequence of Theobroma grandiflorum for evolutionary, biotechnology, and horticulture research.. 2022. (Congresso).
Fórum de Internacionalização 2022 da Unesp. 2022. (Outra).
II Simpósio de Biologia Vegetal da Unicamp (II SBVU).O que aprendemos sequenciando dezenas de genomas de plantas carnívoras?. 2022. (Simpósio).
XVI Curso de Inverno em Genética - UNESP/FCAV.A importância da Genômica Comparativa. 2022. (Encontro).
1st Franco-Latinoamerican Workshop in Omics and Bioinformatics: Transposable Elements.TnCentral: a prokaryotic transposable element database and web portal for transposon analysis. 2021. (Simpósio).
66º Congresso Brasileiro de Genética. The Utricularia genomes are in a dynamic state of evolution. 2021. (Congresso).
IV Workshop Python para Dados Biológicos. 2021. (Seminário).
I Workshop on Genetics and Plant Breeding.PLANT GENOME SEQUENCING: NEW TECHNOLOGIES AND CHALLENGES (How to build a near complete plant genome?). 2021. (Simpósio).
VI Curso de Verão em Bioinformática.Montagem de Sequências Genômicas e Metagenômicas. 2019. (Outra).
"III Curso de Verão em Bioinformática".Montagem de Sequências Genômicas e Metagenômicas. 2018. (Outra).
2nd São Paulo XanthoMeeting 2018.The role of the murein lytic transglycosylases in Xanthomonas citri subsp. citri 306 virulence and fitness. 2018. (Encontro).
II Seminário sobre Métodos Analíticos Avançados em Microbiologia.Utilizando ferramentas genômicas e de bioinformática para a investigação da emergência da virulência em fitopatógenos. 2018. (Seminário).
III Simpósio de Microbiologia Agrícola.22 anos de sequenciamento genômico. Qual o futuro da genômica ?. 2017. (Simpósio).
1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. Relação entre bacteriófagos, transposons e plasmídeos com evolução genômica, emergência de virulência e patogenicidade em fitopatógenos de interesse agronômico?. 2016. (Congresso).
1st International Workshop on Cyanobacterial Natural Products. Assembling and annotating Cyanobacterial genomes: Tips and tricks. 2016. (Congresso).
62 Brazilian-International Congress of Genetics. UNRAVELING THE GENOME SEQUENCE OF THE UTRICULARIA RENIFORMIS A.ST.-HIL. (LENTIBULARIACEAE): INSIGHTS INTO THE EVOLUTION OF A TERRESTRIAL CARNIVOROUS PLANT.. 2016. (Congresso).
VIII Simpósio de Microbiologia.Bioinformática. 2016. (Simpósio).
XII Curso de Inverno de Genética.Montagem e Anotação de Genomas. 2016. (Encontro).
11th International Plant Molecular Biology Congress. The complete chloroplast genome of a brazilian carnivorous plant Utricularia reniformis (Lentibulariaceae). 2015. (Congresso).
Workshop de Bioernergia - UNESP. 2015. (Seminário).
Xanthomeeting.Mobile Genetics elements impact in Xanthomonas genomes. 2015. (Encontro).
X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics. The complete mitochondrial genome of a brazilian carnivorous plant Utricularia reniformis (Lentibulariaceae): Insights into the evolution of an organellar genome of a specialized plant.. 2015. (Congresso).
10 Edição do Fórum de Microbiologia Agropecuária.Genômica aplicada ao estudo de transpsons e vírus de bactérias de interesse agronômico. 2014. (Outra).
60º Congresso Nacional de Genética. Identification and Characterization of ISXax2, a Tn3-like transposable element potentially related with the virulence and pathogenicity of Xanthomonas citri subsp. citri. 2014. (Congresso).
Workshop Meta-Omics and Bioinformatics in Microbial Ecology.Exploring the bacteriual transposases diversity from metagenomic data with ISsaga. 2014. (Simpósio).
XIV Congresso Brasileiro de Biomedicina e II Congresso Internacional de Biomedicina. Bioinformática para Microbiologistas. 2014. (Congresso).
2nd Thünen Symposium on Soil Metagenomics.Exploring the prokaryotic insertion sequence abundance and diversity of brazilian sugar-cane cultivated soils. 2013. (Simpósio).
IX Curso de Inverno de Genética.Aplicações da Bioinformática na microbiologia. 2013. (Encontro).
V Simpósio de Microbiologia IBILCE/UNESP.Aplicações da Bioinformática na microbiologia. 2013. (Simpósio).
XII Congresso Brasileiro e I Internacional de Biomedicina. Bioinformática: atuação do profissional biomédico. 2012. (Congresso).
3 Workshop em Genética e Melhoramento de Plantas.Bioinformática & Genômica. 2011. (Encontro).
58º Congresso Brasileiro de Genética. Prophages of Xylella fastidiosa: an example of recombination and genome decay. 2011. (Congresso).
JOBIM. ISsaga: A platform for identification and semi-automatic annotation of prokaryotic insertion sequences. 2010. (Congresso).
GenoBIOTOUL.ISfinder and IS genomic Annotation. 2009. (Simpósio).
Quarto Congresso Alagoano de Biomedicina. Mini-Curso: Bioinformática. 2007. (Congresso).
Xylella fastidiosa international workshop.Xylella fastidiosa international workshop. 2007. (Simpósio).
In-Silico Analysis of Proteins. In-Silico Analysis of Proteins Celebrating the 20th anniversary of Swiss-Prot. 2006. (Congresso).
Symposium on Bioinformatics. 2006. (Simpósio).
Terceiro Congresso Alagoano de Biomedicina. Genômica / Mesa Redonda: Bioinformática. 2006. (Congresso).
1st Internacional Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, AB3C.. X-Meeting. 2005. (Congresso).
60º Congresso Nacional de Genética. Identification and Characterization of ISXax2, a Tn3-like transposable element potentially related with the virulence and pathogenicity of Xanthomonas citri subsp. citri. 2005. (Congresso).
Congresso Nacional de Genetica. 51 Congresso Nacional de Genética. 2005. (Congresso).
Segundo Congresso Alagoano de Biomedicina. O papel do biomédico na Bioinformática / Mini curso: Bioinformática. 2005. (Congresso).
49º Congresso Nacional de Genética. 49º Congresso Nacional de Genética. 2003. (Congresso).
ICOBICOBI. 1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. 2003. (Congresso).
Simpósio de Biomedicina e Fisioterapia. 2001. (Simpósio).
Curso de Especialização em Gasometria. 2000. (Seminário).
I Simpósio de Biologia Molecular. 2000. (Simpósio).
I Simpósio de Saúde Pública. 1999. (Simpósio).
Noções Teorico-Práticas em hematologia. 1998. (Seminário).
Semana da Saúde. 1998. (Encontro).
Simpósio de Biomedicina. 1997. (Simpósio).
VIII Encontro de Biomédicos. 1997. (Encontro).
Participação em bancas
MONTEIRO-VITORELLO, C. B.; CAMARGO, L. E. A.;Varani, A.M.. Genoma de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae: montagem, anotação e busca por efetores relacionados à bacteriose. 2025. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade de São Paulo.
VARANI, A. M.; ABREU, V. A. C.; ISEPPON, A. M. B.; SALES JUNIOR, C. S.. EDTA-GUI: expandindo a anotação de elementos transponíveis do pipeline EDTA para genomas de plantas com o modo AnnoTEP e o banco público AnnoTEP-DB. 2025. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.
MIRANDA, V. F. O.;Varani, A.M.; PINHEIRO, D. G.. Comparative analysis of the chloroplast genome of Pinguicula moranensis Kunth (Lentibulariaceae). 2024. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
FERRO, J. A.; JACIANI, FABRÍCIO JOSÉ;Varani, A.M.. ANÁLISE DA FORÇA DE EXPRESSÃO DE PROMOTORES PIP-BOX DE Xanthomonas citri subsp. citri. 2024. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VENANCIO, T. M.;VARANI, A. M.; CORREA, C. C. G.; PINTO, V. B.. O MICROBIOMA RESIDENTE DO MILHO E SEU POTENCIAL BIOTECNOLÓGICO. 2024. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SCORTECCI, KATIA CASTANHOVarani, A.M.; FERREIRA, L. C.. Análise comparativa dos efeitos da microgravidade, calor e hipóxia no padrão de expressão gênica das plantas: uma abordagem bioinformática. 2024. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.
Varani, A.M.; VAN SLUYS, M.A.; LINHARES, F. S.. Análise de Elementos Transponíveis em Cana-de-açúcar, explorando genomas em escala cromossômica. 2024. Dissertação (Mestrado em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura)) - Universidade de São Paulo.
SETUBAL, JOÃO CARLOS;Varani, A.M.; FERNANDES, A. B.. Investigation of cyanide degradation by bacterial species containing the cynD gene with computational and experimental approaches. 2024. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
STEFANI, L. M.;VARANI, A. M.; BAJAY, M. M.. Análise Metagenômica da Microbiota Intestinal de Galinhas Poedeiras sob Estresse Calórico Tratadas com Melhoradores de Desempenho. 2023. Dissertação (Mestrado em Zootecnia) - Universidade do Estado de Santa Catarina.
SILVA, A. M.; SOUZA, R. F.; FERREIRA, H.;Varani, A.M.. Recuperação e caracterização de genomas de bacteriófagos a partir de metagenomas de compostagem. 2023. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
VIEIRA, M. L. C.;DE SOUZA, ANETE PEREIRAVARANI, A. M.. Mitochondrial genome analysis in Passiflora. 2023. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade de São Paulo.
SETUBAL, JOAO C.; GIRADELLO, R.;Varani, A.M.; ALVES, J. M. P.. Genomic Analysis of Bacterial Isolates from Guinea Pigs (Cavia porcellus) and Brown-Throated Sloths (Bradypus variegatus). 2023. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
SETUBAL, JOAO C.; FUJITA, A.; ALMEIDA JR, N.;Varani, A.M.. O genoma da alga vermelha Gracilaria domingensis (Rhodophyta, Gracilariales). 2022. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
Varani, Alessandro M.; FUJITA, A.; HOFFMANN, C.; SETUBAL, JOAO C.. Microbial composition of inoculum and mature compost in the São Paulo Zoo Composting process assessed through metagenomics. 2021. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
SETUBAL, JOAO C.; HOFFMANN, C.;Varani, A.M.; DIGIAMPIETRI, L. A.. MAGset:uma ferramenta para comparação de genomas recuperados de dados metagenômicos e sua aplicação para melhoria de suas montagens. 2021. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
PINHEIRO, DANIEL G.;Varani, A.M.; RIANO-PACHON, D. M.. Acesso ao microbioma de cana-de-açucar por análise de seu trancritoma e possíveis fatores modularores. 2020. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
M. VARANI, ALESSANDRO; MONTEIRO-VITORELLO, C. B.; SILVA, SAURA R.. Genomic identification of mate, ABC, and MFS transporters in Citrus sinensis and expression analysis of Citrus species interacting with Xanthomonas citri subsp. citri.. 2020. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.; FERNADEZ, J. H.; OLIVARES, F. L.; VENANCIO, T. M.. GENÔMICA COMPARATIVA E DIVERSIDADE DE OPERONS CONTENDO GENES nif EM BACTÉRIAS DIAZOTRÓFICAS. 2020. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
PASCHOAL, A. R.;Varani, A.M.Sluys, Marie-Anne Van. Bioinformática na investigação de RNAs não-codificantes e Elementos Transponíveis em Plantas.. 2019. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná.
VIEIRA, M. L. C.; SOUZA, V. C.; ZUCCHI, M. I.;VARANI, A. M.. Análise comparativa de regiões microssintênicas entre Passiflora edulis e as Malpighiales Populus trichocarpa e Manihot esculenta. 2019. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade de São Paulo.
BALBUENA, T. S.; PINTO, J. R. A. S.;Varani, A.M.. Modulação do estado redox em cloroplastos de Eucalyptus urophylla por estímulo de CO2. 2018. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.; FERREIRA, H.; PINHEIRO, D. G.. Caracterização de transglicosilases líticas de mureína em Xanthomonas citri subsp. citri 306 e estudo funcional das LTs mltB2.1 e mltB2.2 associadas ao elemento TnXax1. 2018. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
FIORE, M. F.; CAMARGO, L. E. A.; ANDREOTE, F. D.;VARANI, A. M.. Genômica comparativa de Microcystis aeruginosa (Cyanobacteria: Chroococcales) com ênfase em genes envolvidos com síntese de produtos naturais. 2017. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Microbiologia Agrícola)) - Universidade de São Paulo.
Varani, A.M.; PRYLO, V. S.; SOUZA, J. A. M.. Metagenômica e Bioinformática Aplicada à Bioernegia: Explorando um Consórcio Bacteriano Degradador da Biomasse. 2017. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
SOUZA, J. A. M.; POLIZELI, M. L. T. M.;VARANI, A. M.. Potencial Biotecnológico de um metagenoma de solo sob cultivo de cana-de-açucar com vistas na degradação da biomassa vegetal. 2016. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
MIRANDA, V. F. O.; PINHEIRO, F.;Varani, A.M.. Filogenia Molecular de Utricularia sect. Utricularia (Lentibulariaceae) inferida a partir de dois loci nucleares e um espaçador cloroplastidial. 2016. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.OLIVEIRA, M. T.; FRIGIREI, M. C.. Estudo do "mobile-metagenome" a partir de biblioteca metagenômica proveniente de solo com cultivo de cana-de-açúcar e solo de floresta. 2015. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.; PEREIRA, Rodrigo Matheus; BALBUENA, T. S.. Análise funcional e evolutiva de um consórcio bacteriano de solo e prospecção de genes envolvidos na descontrução da biomassa. 2014. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
ALVES, L. M. C.;Varani, A.M.; FURTADO, E. L.. Relações filogenéticas e diversidade de populações de Phyllosticta spp. de goiabeiras e de mangueiras em diferentes ambientes bioecológicos. 2014. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Produção Vegetal)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
MIRANDA, V. F. O.;VARANI, A. M.; BACCI JUNIOR, M.. Sistemática Molecular de Utricularia L. (Lentibulariaceae). 2014. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
ALMEIDA, A. M. F.; GATTAS, E. A. L.;Varani, A.M.. Estudo genômico e transcritômico de isolados selecionados de alto rendimentoi de dorna de fermentação alcoólica de Saccharomyces cerevisiae. 2014. Dissertação (Mestrado em Biociências e Biotecnologia Aplicadas à Farmácia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.; KISHI, L. T.; ALVES, L. M. C.. Diversidade de Bacillus thuringiensis e seus genes cry e vip em amostras metagenômicas de DNA extraído de solo com cultivo de cana-de-açucar e solo de floresta nativa em estações climáticas diferentes. 2014. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.; ZANELLI, C. F.; NUNES, F. M. F.. Clonagem de oxidoesqualeno ciclases de Maytenus ilicifolia Mart Ex Reissek (Celastraceae). 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.; FERRO, J. A.; BELASQUE JR, J.. Cancro Cítrico: Análise da interação Planta-Patógeno revelado pelo transcriptoma do patógeno e hospedeiro. 2013. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
RIANO-PACHON, D. M.; ISEPPON, A. M. B.;VARANI, A. M.HOTTA, CARLOS TAKESHI. Inference and analysis of gene coexpression networks in sugarcane and sorghum. 2025. Tese (Doutorado em Ciências (Biologia na Agricultura e no Ambiente)) - Universidade de São Paulo.
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ALVES, J. M. P.; LUDWIG, A.;Varani, A.M.; SABBAGA, M. C. Q. B. E.. Panorama geral do mobiloma e satelitoma na família Trypanosomatidae. 2025. Tese (Doutorado em Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro) - Universidade de São Paulo.
VALENTE, G. T.;VARANI, A. M.; BRANDAO, M.; LOPES, F. M.. RECONHECIMENTO DE PADRÕES EM MICROBIOMA E PREDIÇÃO DE VARIÁVEIS AMBIENTAIS CONTÍNUAS. 2025. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná.
SOUZA, R. F.; VIBRANOVSKI, M. D.; GALANTE, P. A. F.;VARANI, A. M.. Genômica comparativa do filo Espiroqueta. 2025. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.
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GOES NETO, A.; FRANCO, G. R.; CALIXTO, C. P. G.; ANDRADE, B. S.; ORELLANA, S. C.; DALMOLIN, R. J. S.;Varani, A.M.. Long non-coding RNA in thermophilic fungi. 2024. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
PINHEIRO, D. G.; RIGOBELO, E. C.; QUECINE, MARIA CAROLINA;VARANI, A. M.; FRACETTO, G. G. M.. CHARACTERISTIC GENOMIC TRAITS OF BACTERIAL GENERA ASSOCIATED WITH SUGARCANE. 2023. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
FIORI, M. F.; CRNKOVIC, C. M.;VARANI, A. M.; NORDI, C. S. F.. Biossíntese de metabólitos fotoprotetores em cianobactérias isoladas do Pantanal brasileiro. 2023. Tese (Doutorado em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura)) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, GUILHERME; ISEPPON, A. M. B.;VARANI, A. M.; SOARES, T. N.; FIGUEIRO, H. V.. Desenvolvimento e comparação de ferramentas e pipelines para análises ômicas nos estudos de conservação da diversidade vegetal. 2023. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
OLIVEIRA, M. T.; PINHEIRO, D. G.; CHIARATTI, M. R.; BICEGO, K. C.;Varani, A.M.. A oxidase alternativa causa alterações de massa corporal e metabolismo de lipídeos em Drosophila melanogaster. 2023. Tese (Doutorado em Biociências) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
DIAS, E. S.; SILVA, S. R.; SILVA, G. F.; MORAIS, DANIEL KUMAZAWA;VARANI, A. M.. Agaricus subrufescens: do cultivo ao genoma. 2023. Tese (Doutorado em Microbiologia Agrícola) - Universidade Federal de Lavras.
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MIRANDA, V. F. O.; ARANGUREN, Y.; MORAES, A. P.; PINHEIRO, D. G.;Varani, A.M.. ONTOGENIA E GENÉTICA DE FLORES CASMÓGAMAS E CLEISTÓGAMAS DE Utricularia triloba BENJ. (LENTIBULARIACEAE).. 2022. Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
KOIDE, T.; SETUBAL, JOAO C.;Varani, A.M.; SPIRA, B.. Investigação sistêmica da regulação de transcritos codificadores de transposases pela chaperona SmAP1 em Halobacterium salinarum. 2021. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
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Setubal, João C.; DIAS NETO, E.;VARANI, A. M.; HASHIMOTO, R. F.; ARAUJPO, W. L.. Classificação Taxonômica de Sequências obtidas com Meta-ômicas por meio de Integração de Dados. 2019. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
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VARANI, A. M.; BELASQUE JR, J.; JACIANI, F.; FERREIRA, RAFAEL MARINI; PINHEIRO, D. G.. GENES DO METABOLISMO DO NITROGÊNIO E SUAS IMPLICAÇÕES NA PATOGENICIDADE E VIRULÊNCIA DA Xanthomonas citri subsp. citri. 2018. Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
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CURY, S. S.;VARANI, A. M.; BARROS, R. R. M.. Estudos de genômica e transcriptômica comparativa de Leishmania major depletada de componentes básicos da telomerase. 2025. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
RIANO-PACHON, D. M.;Varani, A.M.; MORAES, L. A. B.. Genômica e metabolômica alvo de cianobactérias brasileiras da ordem Nostocales. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura)) - Universidade de São Paulo.
Varani, A.M.; MIRANDA, VITOR F. O.; PINTO, D. S.. unção e Diversificação dos Genes COBRA-LIKE (COBLs) em Espécies Amazônicas de Malvaceae: Um Estudo Comparativo em Theobroma grandiflorum, T cacao e Herrania umbratica. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
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DUARTE, J. M. B.; MIRANDA, V. F. O.; FRANCISCO, M. R.;VARANI, A. M.; SANTOS, A. F.. FILOGEOGRAFIA DA ESPÉCIE Subulo gouazoubira (MAMMALIA; CERVIDAE) NA CAATINGA. 2023. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Melhoramento Animal) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
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FERRO, JESUS A.Varani, A.M.; TANAKA, F. A. O.; FERREIRA, RAFAEL MARINI; JACIANI, F.. Anatomia e ultraestrutura da interação patógeno-hospedeiro de diferentes estirpes de Xanthomonas causadoras de doenças e suas características relacionadas a virulência. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Alessandro de Melo Varani; FERREIRA, RAFAEL MARINI; PINHEIRO, D. G.. Genes reguladores do metabolismo de nitorgênio (ntrB e ntrC) e suas implicações na patogenicidade e virulência de Xanthomonas citri subsp. citri. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
KOIDE, T.;VARANI, A. M.; GALHARDO, R. S.. RNAs não codificantes derivados de sequências de inserção na arqueia halófila Halobacterium salinarum NRC-1. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
AVILA, F. A.;MONTASSIER, HELIO J.; CARDOZO, M. V.; BURGER, K. P.;VARANI, A. M.. Coagulase negative Staphylococcus spp. characterized using common phenotypic and genotypic tests may be misidentified. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
LEMOS, E. G. M.; PIZAURO JUNIOR, J. M.;Varani, A.M.ALVES, L. M. CARARETO; BALBUENA, T. S.. A Solvent and Halo-Stable Aminopepetidase from Mesorhizobium sp. discovered by genomic data mining with potential biotechnological application. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
DE MIRANDA, VITOR FERNANDES O.DESIDERIO, J. A.LEMOS, M. V. F.Varani, A.M.; GALDIANO JUNIOR, R. F.. Development of microsatellite markers for the carnivorous plant Genlisea aurea (Lentibulariaceae) using illumina paired-end genomic sequences. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.; PINHEIRO, D. G.; SARAN, L. M.; BALBUENA, T. S.; POLLO, A. S.. Unravelling the microbiome from a vegetable garden soil and freshwater used for irrigation garden after ten years fertilization with an unusual organic compound. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
MONTASSIER, HELIO J.; PENHA FILHO, R. A. C.;VARANI, A. M.. Análise da evolução de variantes do cronavírus aviário após infecção e persistência em matrizes de produção. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Medicina Veterinária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
FERRO, JESUS A.Varani, A.M.; CARVALHO, F. M. S.; FACINCANI, A. P.; VANTINI, J. S.. Análise do transcriptoma da interação entre plantas cítricas e Xanthomonas axonopodis pv. aurantifolii. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
MONTEIRO-VITORELLO, C. B.; Setubal, João C.;Varani, A.M.. Maximização de entropia aplicada à genomas bacterianos e o estudo de duas estirpes brasileiras de importância econômica do gênero Bradyrhizobium: proteínas hipotéticas e elementos transponíveis. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
ALMEIDA, A. M. F.; OLIVEIRA, R. M. Z.;Varani, A.M.. Análise do transcriptoma, secretoma e metaboloma do biofilme de histoplasma capsulatum em células hospeiras para seleção de alvos terapêuticos. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Biociências e Biotecnologia Aplicadas à Farmácia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.; OTTOBONI, L. M. M.; MERZEL, V. M.. Caracterização da microbiota associada a corais escleractíneos do litoral do Estado de São Paulo por sequenciamento de segunda geração. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
DUARTE, J. M. B.; MIRANDA, V. F. O.;Varani, A.M.; REY, F. S. B.;LEMOS, M. V. F.. Filogenia e Taxonomia dos Veados Cinza (Mazama gouazoubira e M. nemorivaga. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Melhoramento Animal) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
LIRA, S. P.; MARGARIDO, G. R. A.;Varani, A.M.. Distribuição de Agrupamentos Gênicos de sintetases de pepetídeos não ribossomais do genoma de Fischerella sp. CENA 161. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Agronomia (Microbiologia Agrícola)) - Universidade de São Paulo.
PILARSKI, F.; SOUZA, J. A. M.; HASHIMOTO, D. T.;VARANI, A. M.DESIDERIO, J. A.. Incidência e resistência a antimicrobianos de patógenos bacterianos em peixes no Brasil edentificados por PCR de Colonia e Sequenciamento Genético. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.; ANDREOTE, F. D.; SILVA, F. R.. Caracterização de agrupamentos gênicos envolvidos no metabolismo secundário da cianobactéria Nostoc sp CENA67. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura)) - Universidade de São Paulo.
MONTASSIER, H. J.;Varani, A.M.; PINTO, A. A.; PAULILLO, A. C.;LEMOS, M. V. F.. Sequenciamento completo do genoma de uma estirpe patogênica do vírus da doença de Newcastle Isolada no Brasil. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.SCHNEIDER, M. P. C.; XAVIER, L. P.; SILVA, A. L. C.. Reconstrução e Modelagem de Vias Metabólicas em Escala Genômica da Bactéria Psicotrófica Exiguobacterium antarticum Linhagem B7. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.
MARQUES, M. V.;Varani, A.M.; GALHARDO, R. S.. Retrotransposons das famílias Opie, Hopscotch e Maggy: desvendando as interações com o genoma de cana-de-açucar. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
Varani, A.M.; GALHARDO, R. S.; ALVES, J. M. P.. Matéria escura microbiológica no complexo Acinetobacter calcoaceticus-baumannii: explorando novas toxinas, antitoxinas e outros genes de função desconhecida em um patógeno emergente. 2024. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.
SILVA, A. M.;VARANI, A. M.; SPIRA, B.. Recuperação e caracterização de genomas de bacteriofagos isolados a partir de metagenomas de compostagem. 2022. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
DUARTE, J. M. B.;Varani, A.M.; CAPARROZ, R.. PROSPECÇÃO DE REGIÕES INFORMATIVAS PARA ANÁLISES GENÉTICAS POPULACIONAIS DE Mazama gouazoubira (Fisher, 1814). 2021. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Melhoramento Animal) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
FERRO, J. A.;Varani, A.M.; WULFF, N. A.. EARLY POPULATION DYNAMICS OF ?Candidatus Liberibacter asiaticus? IN SUSCEPTIBLE AND RESISTANT GENOTYPES AFTER INOCULATION WITH INFECTED DIAPHORINA citri FEEDING ON YOUNG SHOOTS. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
FERRO, JESUS A.Varani, A.M.; MARINI, R.. Identificação e análise de genes potencialmente envolvidos na patogenicidade de Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolli Tipo C. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
FIGUEIRA, A. V. O.;Varani, A.M.; TEIXEIRA, P. J. P. L.. Identificação e análise de co-expressão in-silico de proteínas associadas a transcrição e enzimas associadas ao metabolismo de carboidratos em cana-de-açucar (Sccharum spp.) cultivar SP80-3280. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura)) - Universidade de São Paulo.
SOUZA, J. A. M.;Varani, A.M.LEMOS, M. V. F.. CARACTERIZAÇÃO INTEGRAL DO GENE 16S rRNA DE BACTÉRIAS NÃO ESPORULANTES E SUA AÇÃO CONTRA Anticarsia gemmatalis. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
PINHEIRO, DANIEL G.; CONSTANCIO, MILENA T.L.;Varani, Alessandro M.. AMPLICON-BASED PROFILING REVEALS COMPOSITIONAL, STRUCTURAL AND FUNCTIONAL CHANGES IN THE MICROBIOME ASSOCIATED WITH SUGARCANE UNDER DIFFERENT FARMING SYSTEMS. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
ANDRE, M. R.; BARROS-BATTESTI, D. M.;VARANI, A. M.. Ocorrência e Caracterização Molecular de hemoplasmas em bovinos de corte no pantanal brasileiro, área endêmica para tripanossomíase bovina na américa do sul. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
PINHEIRO, D. G.;Varani, A.M.; ALVES, L. M. C.. Acessando o potencial metabólico diferencial da microbiota da rizosfera de cana-de-açucar sob cultivo orgânico. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
CARARETO ALVES, LUCIA MARIA;Varani, A.M.; PEPE, E. S. G.. Consórcio Bacteriano desconstrutor de lignocelulose: Promessa para o futuro da na produção de etanol. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Setubal, João C.; HOFFMANN, C.;VARANI, A. M.. Resolução em cepas de genomas recuperados de dados metagenômicos. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
DUARTE, J. M. B.; MIRANDA, V. F. O.;VARANI, A. M.. Prospecção de regiões informativas para análises genéticas populacionais de Mazama gouazoubira (Fisher, 1814). 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Melhoramento Animal) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
ANDRE, M. R.; DUARTE, J. M. B.;VARANI, A. M.. Genetic diversity of Hepatozoon spp. in rodents from Brazil. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Medicina Veterinária (Patologia Animal) [Jaboticabal]) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.; BALBUENA, T. S.; SANTOS, L. F. J.. O potencial papel do sistema de dois componentes PhoR/PhoB na expressão de genes do sistema de secreção tipo III em Xanthomonas citri subsp. citri. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
ANDRE, M. R.; DUARTE, J. M. B.;Varani, A.M.. Occurence and Molecular Characterization of Bartonella sp. In wild rodents in dfferent brazilian biomes. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
MIRANDA, V. F. O.;VARANI, A. M.OLIVEIRA, M. T.. Filogenia Molecular de Utricularia sect. Utricularia (Lentibulariaceae) inferida a partir de dois loci nucleares e um plastidial, com considerações sobre especiação hibridogênica em plantas. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.; KISHI, L. T.; LEMOS, MANOEL VICTOR FRANCO. Análise de um consórcio bacteriano cultivado no bagaço de cana-de-açucar com potencial de degradação de biomassa. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
FERRO, J. A.;Varani, A.M.; JACIANI, F.. Análise transcricional de Xanthomonas citri subsp. citri em condições infectantes em Pêra Rio e Lima Ácida "Galego" revla diferentes padrões de expressão gênica envolvidos na resposta ao estresse oxidativo. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.; ALVES, L. M. C.; PINHEIRO, D. G.. Estudo do "mobile-metagenome" A partir de bibbliotecas metagenômicas proveniente de solo com cultivo de cana-de-açucar e solo de floresta. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
FERRO, J. A.; CARVALHO, F. M. S.;Varani, A.M.. Mutagênese Sítio-dirigida da ORF XAC0024 de Xanthomonas citri subsp. citri e suas implicações no desenvolvimento do cancro cítrico. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.DESIDERIO, J. A.; MIRANDA, V. F. O.. Revelando o DNA Barcoding de Plantas Carnívoras do Gênero Utricularia L. (Lentibulariaceae). 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.; FERRO, J. A.; ALVES, L. M. C.. Comparação do perfil transcircional por RNA-Seq de Laranja Doce "Hamlin" e Tangerina "Satsuma" em resposta a Xanthomonas citri subsp. citri. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.; FERRO, J. A.; CARVALHO, F. M. S.. Expressão gênica diferencial de laranja doce pêra rio (Citrus sinensis L. Osb) e limão galego (Citrus aurantifolium) em resposta à infecção pro Xanthomonas citri subsp. citri por RNA-Seq. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.; PINTO, L. R.; FERRO, M. I. T.. Identificação de genes candidatos para resistência ao mosaico da cana-de-açucar a partir da técnica de cDNA-AFLP. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.; ALVES, L. M. C.; SARAN, L. M.. Estudo Comparativo Da População Bacteriana de Água e Sedimento em Viveiro de Psicultura. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Varani, A.M.; SILVA, S. R.; PINHEIRO, D. G.. ANÁLISE GENÔMICA COMPARATIVA DE TRANSPORTADORES ABC ENTRE CLONES DE Theobroma grandiflorum E Theobroma cacao. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia Agronômica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
FERRO, J. A.;VARANI, A. M.; PINHEIRO, D. G.. Caracterização Genômica e Potencial Antimicrobiano de Bacteriocinas em Ligilactobacillus salivarius: Uma Análise Pangenômica e Estrutural. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
PINHEIRO, D. G.; CARARETO-ALVES, L.;Varani, A.M.. PROSPECÇÃO IN SILICO DE GENES ENVOLVIDOS NA DEGRADAÇÃO DE HIDROCARBONETOS POLICÍCLICOS AROMÁTICOS. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
OLIVEIRA, M. T.VARANI, A. M.; MIRANDA, VITOR F. O.. Enzimas alternativas e a evolução da cadeia respiratória mitocondrial em tunicados do gênero Ciona. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.FERRO, JESUS A.; PINHEIRO, DANIEL G.. Estudo da expressão espacial e temporal de genes flagelares de Xanthomonas citri subsp. citri em diferentes genótipos de Citrus sp. através da abordagem de RNA-Seq. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.; FERRO, J. A.. Análise da expressão gênica de um provável fator de transcrição de Xanthomonas citri subsp. citri relacionado com patogenicidade. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
VARANI, A. M.; LEMOS, MANOEL VICTOR FRANCO. Genômica de Xanthomonadales. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
RUSSO, C. A. M.; DURHAM, A. M.;Varani, A.M.; PASSETI, F.; FRANCO, G. R.. Concurso público de provas e títulos para provimento de vagas da carreira de pesquisa em ciência e tecnologia ? cargo de pesquisador ? Laboratório Nacional de Computação Científica. 2024. Laboratório Nacional de Computação Científica.
FERRO, J. A.; ALMEIDA JR, N. F.; PROSDOCIMI, F.;VARANI, A. M.. Membro Suplente para Concurso Público de provas e títulos para contratação de 1 emprego público de Professor Assistente Doutor, em RDIDP, sob o regime jurídico da CLT. 2013. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Orientou
a definir; Início: 2026; Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Identificação de Assinaturas Genômicas e Pangenômicas Associadas ao Potencial Probiótico em Animais de Produção por Abordagens Integradas de Genômica Comparativa e Aprendizado de Máquina; Início: 2026; Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Isolamento e identificação de bactérias com potencial probiótico, e suas bacteriocinas, do trato intestinal de suínos; Início: 2025; Tese (Doutorado em TECNOLOGIA BIOQUÍMICO-FARMACÊUTICA) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);
Análise Metagenômica da Microbiota Intestinal em Aves Comerciais: Explorando Potencial Probiótico, Genes de Multiresistência e Transferência Genética Horizontal; Início: 2023; Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);
ANÁLISE GENÔMICA IN SILICO DE BACTERIOCINAS DE TIPO PEDIOCINA POR Pediococcus pentosaceus; Início: 2020; Tese (Doutorado em TECNOLOGIA BIOQUÍMICO-FARMACÊUTICA) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);
Início: 2024; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;
Início: 2024; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;
Genética de Genes de Resistência a Antibióticos em Arqueias e Bactérias: Uma Abordagem Genômica; Início: 2025; Iniciação científica (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);
EDTA-GUI: expandindo a anotação de elementos transponíveis do pipeline EDTA para genomas de plantas com o modo AnnoTEP e o banco público AnnoTEP-DB; 2023; Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Alessandro de Mello Varani;
Mapeamento do Potencial Probiótico e para Degradação de Polissacarídeos Vegetais em Isolados da Microbiota de Animais de Produção; 2023; Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
USO DE GENÔMICA COMPARATIVA E ENSAIOS FILOGENÉTICOS PARA ANÁLISE DE LINHAGENS DE Staphylococcus aureus EM BOVINOS E HUMANOS EM BUSCA DE PADRÕES DE VIRULÊNCIA ESPECÍFICOS E MARCADORES DA MASTITE; 2019; Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Alessandro de Mello Varani;
Genomic identification of mate, ABC, and MFS transporters in Citrus sinensis and expression analysis of Citrus species interacting with Xanthomonas citri subsp; citri; 2018; Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
O papel do sistema de dois componentes na regulação do sistema de secreção tipo III em Xanthomonas citri; 2017; Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Caracterização de transglicosilases líticas de mureína associadas ao elemento TnXax1 em Xanthomonas citri subsp; citri 306 sugerem relação com o fitness e atraso no desenvolvimento do cancro cítrico; ; 2015; Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Metagenômica e Bioinformática Aplicada à Bioernegia: Explorando um Consórcio Bacteriano Degradador da Biomassa; 2014; Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Prospecção in-silico de genes cry de Bacillus thuringiensis a partir de bibblioteca metagenômica proveniente de solo com cultivo de cana-de-açucar e solo de floresta; 2013; Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, ; Coorientador: Alessandro de Mello Varani;
Estudo do Mobile Metagenome de solos cultivados com cana de açúcar; 2013; Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
DNA "BARCODING" EM Utricularia (Lentibulariaceae); 2013; Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Alessandro de Mello Varani;
Análise funcional e evolutiva de um consórcio bacteriano de solo e prospecção de genes envolvidos na descontrução da biomassa; 2012; Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Alessandro de Mello Varani;
Développement d'outils pour l'exploitation de la base de données ISfinder sur les séqueces d'insertion bactériennes; 2010; Dissertação (Mestrado em Bioinformatique - Master II Pro) - Université Toulouse III Paul Sabatier, Centre National de la Recherche Scientifique; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
GENÔMICA COMPARATIVA ENTRE Espécies de Theobroma COM ENFOQUE EM GENES RELACIONADOS NAS QUALIDADES DOS FRUTOS; 2021; Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Estudo genômico, evolutivo e funcional de transglicosilases líticas de mureína em Xanthomonas; 2018; Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Metagenômica aplicada ao estudo do potencial metabólico de um consórcio bacteriano degradador de lignocelulose cultivado e enriquecido in vitro; 2017; Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Estudo do gene mlt e mltB na patogenicidade de Xanthomonas citri; 2014; Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Alessandro de Mello Varani;
Sistemática de Utricularia L; (Lentibulariaceae): a abordagem de supermatrizes para resoluções filogenéticas; 2014; Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Alessandro de Mello Varani;
GENES DO METABOLISMO DO NITROGÊNIO E SUAS IMPLICAÇÕES NA PATOGENICIDADE E VIRULÊNCIA DA Xanthomonas citri subsp; citri; 2014; Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Diversidade de microrganismos e prospecção gênica em águas residuais de áreas de mineração; ; 2013; Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Alessandro de Mello Varani;
2023; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Alessandro de Mello Varani;
2023; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Alessandro de Mello Varani;
2021; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Alessandro de Mello Varani;
2018; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Alessandro de Mello Varani;
2018; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Alessandro de Mello Varani;
2018; Universidade Estadual Paulista Julio De Mesquita F, ; Alessandro de Mello Varani;
2017; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Alessandro de Mello Varani;
2016; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Alessandro de Mello Varani;
2014; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Alessandro de Mello Varani;
; Caracterização Genômica e Potencial Antimicrobiano de Bacteriocinas em Ligilactobacillus salivarius: Uma Análise Pangenômica e Estrutural; ; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
ANÁLISE GENÔMICA COMPARATIVA DE TRANSPORTADORES ABC ENTRE CLONES DE Theobroma grandiflorum E Theobroma cacao; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Agronomia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Estudo da expressão espacial e temporal de genes flagelares de Xanthomonas citri subsp; citri em diferentes genótipos de Citrus sp; através da abordagem de RNA-Seq; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Genômica de Xanthomonadales; 2013; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Estudo de genômica comparativa de genes codificadores de bacteriocina em Ligilactobacillus salivarius; 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
ANÁLISE GENÔMICA COMPARATIVA DE TRANSPORTADORES ABC ENTRE CLONES DE Theobroma grandiflorum E Theobroma cacao; 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Agronomia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Estudo de genes relacionados ao flagelo de Xanthomonas citri através da análise por RNAseq; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Produção e análise in planta de uma biblioteca de mutantes de Xanthomonas fuscans subsp; aurantifolii tipo C (XauC); 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Pesquisa (PROPe) - UNESP; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Desvendando os mecanismos moleculares do agente etiológico do cancro cítrico: Investigação de genes relacionados a interação planta-patógeno entre Citrus aurantifolia (Lima Ácida Galego) e Xanthomonas fuscans subsp; aurantifolii Tipo C (XauC); 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Identificação de genes relacionados a patogenicidade e virulência em Xanthomonas fuscans subsp; aurantifolii Tipo C (XauC) através da análise in-vivo de mutantes em folhas de Citrus limonia Osbeck (Limoeiro-Cravo); 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Bioinformatica Aplicada a Montagem do Genoma de Utricularia reniformis; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Pesquisa (PROPe) - UNESP; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Investigação sobre a diversidade e quantidade de transposons do tipo IS em genomas de bactérias e arqueias; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Desenvolvimento do Banco de Dados TnCentral v2; 0; 2023; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Alessandro de Mello Varani;
Produções bibliográficas
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FROTA, ELIONIO GALVÃO ; KUNIYOSHI, TAÍS MAYUMI ; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; AZEVEDO, PAMELA OLIVEIRA DE SOUZA DE ; DE OLIVEIRA, TACIANA FREIRE ; CASSIANO, LUARA LUCENA ; PESSOA, AMANDA ROMANA SANTOS ; SANCA, FERNANDO MOISES MAMANI ; ALMEIDA, JOÃO VICTOR DOS ANJOS ; DIAS, MERIELLEN ; DA SILVA, BRUNA SOUZA ; VERÍSSIMO, NATHALIA VIEIRA PORPHIRIO ; GIERUS, MARTIN ; LEBLANC, JEAN GUY ; Varani, Alessandro de Mello ; TACHIBANA, LEONARDO ; OLIVEIRA, RICARDO PINHEIRO DE SOUZA . Exploring the Probiotic and Antimicrobial Potential of Pediococcus Pentosaceus Isolates from Fish: Genomic and Functional Perspectives. Probiotics and Antimicrobial Proteins , v. 1, p. 1-1, 2026.
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DOS ANJOS ALMEIDA, JOÃO VICTOR ; DE MEDEIROS OLIVEIRA, MAURO ; KUNIYOSHI, TAÍS MAYUMI ; MAMANI SANCA, FERNANDO MOISÉS ; NÓBREGA MENDONÇA, CARLOS MIGUEL ; CABRERA MATAJIRA, CARLOS EMÍLIO ; LOUVISI, ANA LUIZA ; DE SOUZA OLIVEIRA, RICARDO PINHEIRO ; de Mello Varani, Alessandro . Genome-Resolved in Silico Analysis of Poultry and Swine Lactobacillales Provides a Data-Driven Framework for Elucidating Metabolic Complementary interactions in Multi-Strain Probiotics. Probiotics and Antimicrobial Proteins , v. 1, p. 1, 2025.
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VARANI, A. M. . Genomics of the Brazilian Biodiversity. 2023. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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Varani, A.M. . Bioinformática Aplicada ao estudo de genomas: Revelando os mistérios do mundo das bactérias e plantas. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Varani, A.M. . Genômica de Sequencias de Inserção (ISs). 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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VARANI, A. M. ; MARINI, R. . ISXax2: Um transposons do tipo Tn3 relacionados com a patogenicidade e virulência de Xanthomonas citri. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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VARANI, A. M. . Introdução a bioinformática e Biologia computacional. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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VARANI, A. M. . Genômica. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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VARANI, A. M. ; MIRANDA, P. ; Filho, B . Mesa Redonda: Bioinformática. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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VARANI, A. M. . O Biomédico na Bioinformática. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Outras produções
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2026.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2026.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2026.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2026.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio CNPq. 2025.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio CAPES. 2025.
Varani, A. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2025.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio CNPq. 2024.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2024.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2024.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2024.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2024.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2023.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2023.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2023.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio - CNPq. 2023.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2023.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2023.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2023.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2023.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2023.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2023.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2023.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2023.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio - FAPESP. 2023.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio - FAPESP. 2023.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - CNPq. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - CNPq. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - CNPq. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio de pesquisa regular - FAPESP. 2021.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - CNPq. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de projeto PDJ - CNPq. 2021.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de projeto PD - FAPESP. 2021.
Varani, A.M. . Parecer para a Czech Science Foundation - Junior Star Grant. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto/auxílio - FAPESP. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de projeto Temático - FAPESP. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio de pesquisa regular - FAPESP. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio de pesquisa regular - FAPESP. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2020.
Varani, Alessandro M. . Parecer de projeto/auxílio de pesquisa regular - FAPESP. 2020.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2019.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto final IC PIBIC. 2019.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto final IC PIBIC. 2019.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto de doutorado - FAPESP. 2019.
Varani, A.M. . Parecer para bolsa de doutorado sanduiche no exterior - CNPq. 2019.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto de pós-doutorado - FAPESP. 2019.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2019.
Varani, A.M. . Parecer de projeto de pós-doutorado Jr - CNPq. 2019.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto de IC - FAPESP. 2019.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto de PQ - CNPq. 2019.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio de pesquisa regular - FAPESP. 2019.
Varani, A.M. . Parecer de projeto Doutorado - FAPESP. 2019.
Varani, A.M. . Parecer de projeto/auxílio de pesquisa regular - FAPESP. 2019.
Varani, A.M. . Parecer para bolsa de doutorado sanduiche no exterior - CNPq. 2018.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de mestrado - FAPESP. 2018.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2018.
Varani, A. . Parecer para o programa de Inovação Tecnológica / PIPE - Programa FAPESP Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas. 2018.
de Mello Varani A. . Parecer Chamada MCTIC/CNPqNº 28/2018 - Universal/FaixaA. 2018.
VARANI, A. M. . Parecer Chamada MCTIC/CNPqNº 28/2018 - Universal/FaixaC. 2018.
VARANI, A. M. . Parecer Chamada MCTIC/CNPqNº 28/2018 - Universal/Faixa B. 2018.
VARANI, A. M. . Parecer Chamada MCTIC/CNPq Nº 28/2018 - Universal/Faixa C. 2018.
VARANI, A. M. . Parecer bolsa de produtividade pesquisa CNP1. 2018.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2018.
VARANI, A. M. . Parecer de acompanhamento de projeto de IC- FAPESP. 2018.
VARANI, A. M. . Parecer de projeto final IC PIBIC. 2018.
Varani, A.M. . Parecer para bolsa de pós-doutorado no exterior - CNPq. 2017.
Varani, A.M. . Parecer para bolsa de doutorado sanduiche no exterior - CNPq. 2017.
Varani, A.M. . Parecer para a chamada Chamada CNPq/MCTIC/CBAB Nº 07/2017 Centro Brasileiro-Argentino de Biotecnologia - Cursos de Cooperação Internacional em Biotecnologia. 2017.
Varani, A.M. . Parecer de projeto de iniciação científica - FAPESP. 2017.
Varani, A.M. . Parecer de reconsideração de projeto de iniciação científica - FAPESP. 2017.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2017.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2017.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de mestrado - FAPESP. 2017.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2017.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2017.
Varani, A.M. . Parecer de reconsideração de projeto de mestrado - FAPESP. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de projeto de doutorado - FAPESP. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de reconsideração de projeto de doutorado - FAPESP. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de renovação de bolsa de projeto de doutorado - FAPESP. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de renovação de bolsa de projeto de doutorado - FAPESP. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de projeto de pós-doutorado - FAPESP. 2015.
Varani, A.M. . Parecer de projeto de doutorado - FAPESP. 2015.
Varani, A.M. . Parecer de projeto de mestrado - FAPESP. 2015.
Varani, A.M. . Parecer de projeto de doutorado - FAPESP. 2015.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2015.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2015.
Varani, A.M. . Parecer de reconsideração de projeto de doutorado - FAPESP. 2014.
Varani, A.M. . Parecer de acompanhamento de projeto de doutorado - FAPESP. 2014.
Varani, A.M. . Parecer de projeto de doutorado - FAPESP. 2013.
Varani, A.M. . Parecer de projeto de doutorado - FAPESP. 2013.
VARANI, A. M. ; ALVARENGA, D. O. . recogniZing gEnomic seqUences in metagenomic aSSemblies (ZEUSS). 2017.
VARANI, A. M. ; ALVARENGA, D. O. . Mobile Genetic Elements Coordinates Extractor (MoGECE). 2016.
VARANI, A. M. . AgroBacsMGEsDB - Studying the impact and other MGEs in Plant-Associated Bacteria. 2012.
VARANI, A. M. ; Siguier P ; Gourbeyre E. ; Chandler M . ISsaga (Insertion Sequence Semi-automatic genomic Annotation). 2010.
VARANI, A. M. . Xylella Phage Navigator Comparative. 2007.
VARANI, A. M. . Xylella Phage-Navigator. 2005.
DE SOUZA OLIVEIRA, RICARDO PINHEIRO ; TACHIBANA, L. ; VARANI, A. M. ; OLIVEIRA, M. M. ; MATAJIRA, C. E. C. ; FROTA, ELIONIO GALVÃO ; AZEVEDO, PAMELA O.S. ; KUNIYOSHI, TAÍS MAYUMI ; DIAS, D. C. . Tecnologia de obtenção de formulação simbiótica encapsulada em pó como aditivo para alimentação de organismos aquático (peixes de cultivo). 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista Phytopathology. 2026.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Scientific Data. 2026.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Nature Microbiology. 2026.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo enviado para a revista Mobile DNA. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista iMeta. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo enviado para a revista Phytopathology. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo enviado para a revista Scientific Reports. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista Brazilian Journal of Microbiology. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo enviado para a revista Molecular Plant Pathology. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista Annals of Botany. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista PNAS. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista Molecular Plant Pathology. 2025.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista Annals of Botany. 2025.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Nucleic Acids Research. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Nature Microbiology. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Scientific Reports. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Mobile DNA. 2024.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Nucleic Acids Research. 2024.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista Nucleic Acids Research. 2023.
Varani, A. . Parecer de artigo submetido para a revista Communications Biology. 2023.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Frontiers in Bioinformatics. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido a NAR Genomics and Bioinformatics. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido a Plant Science. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Genomics. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Critical Reviews in Microbiology. 2022.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Mitochondrial DNA Part B: Resources. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Mitochondrial DNA Part B: Resources. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista G3: Genes Genomes Genetics. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Horticulture Research. 2021.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido a Genetics and Molecular Biology (GMB). 2021.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido a Mobile DNA. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido a Genomics. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido a Frontiers in Microbiology. 2021.
Varani, A.M. . Parecer de artigo revista Microbial Genomics. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de artigo revista Scientific Reports. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de artigo revista Brazilian Journal of Microbiology. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido a revista Mobile DNA. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de artigo revista Brazilian Journal of Botany. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista BMC Research Note. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Plants. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Nucleic Acids Research. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista BMC Genomics. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de artigo enviado para a revista Plants. 2020.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Genomics. 2020.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista PeerJ. 2019.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Frontiers in Genetics. 2019.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista PeerJ. 2019.
VARANI, A. M. . Pareceres para 8a Edição do Prêmio Tese Destaque USP. 2019.
Varani, A.M. . Pareceres para 7e Edição do Prêmio Tese Destaque USP. 2018.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Frontiers in Microbiology. 2018.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Frontiers in Genetics. 2018.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Frontiers in Genetics. 2018.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista PeerJ. 2018.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Scientific Reports. 2018.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Brazilian Journal of Microbiology. 2018.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista Brazilian Journal of Microbiology. 2018.
VARANI, A. M. . Parecer de artigo submetido para a revista Brazilian Journal of Microbiology. 2018.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Scientific Reports. 2017.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Molecular Plant Pathology. 2017.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Bioinformatics. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista BMC ioinformatics. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Critical Reviews in Microbiology. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista BMC Genomics. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Molecular Ecology. 2016.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Bioinformatics. 2015.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista BMC Microbiology. 2015.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Plant Pathology. 2015.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Brasileira de Fruticultura. 2014.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. 2014.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista PLOS ONE. 2012.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Comparative and Functional Genomics. 2012.
Varani, A.M. . Parecer de artigo submetido para a revista Nucleic Acids Research. 2011.
MIRANDA, VITOR F. O. ; SILVA, S. R. ; VARANI, A. M. . Carnivoria em miniatura. 2018. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
VARANI, A. M. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; SILVA, S. R. ; TUNES, S. . Colonização pela água. 2018. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
COMUNICACOES, 4. T. ; SILVA, S. R. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, A. M. . Estudo da origem de plantas carnívoras é destaque pela Fapesp.. 2018. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
COMUNICACOES, 4. T. ; SILVA, S. R. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, A. M. . Aluna do IB apresenta 1º genoma mitocondrial em planta do Brasil. 2017. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
MOON, P. ; SILVA, S. R. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, A. M. . Planta carnívora tem genoma mitocondrial sequenciado.. 2017. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
MIRANDA, VITOR F. O. ; SILVA, S. R. ; VARANI, A. M. . Publicado primeiro genoma mitocondrial de planta brasileira.. 2017. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
VARANI, A. M. . Página de Nosso Grupo de Pesquisa. 2025; Tema: Página de Nosso Grupo de Pesquisa. (Site).
Varani, A.M. . A importância de se entender as diferenças entre correlação e causalidade: Correlação não implica causalidade e o rigor do processo científico.. 2025; Tema: A importância de se entender as diferenças entre correlação e causalidade: Correlação não implica causalidade e o rigor do processo científico.. (Site).
VARANI, A. M. . Desvendando os Segredos do Cupuaçu: Um Avanço Genético para a Biodiversidade Brasileira. 2025; Tema: Desvendando os Segredos do Cupuaçu: Um Avanço Genético para a Biodiversidade Brasileira. (Site).
VARANI, A. M. . Micro-organismos que Protegem o Cupuaçu: Um Novo Entendimento e Possível Estratégia Contra a Vassoura-de-Bruxa ?. 2025; Tema: Micro-organismos que Protegem o Cupuaçu: Um Novo Entendimento e Possível Estratégia Contra a Vassoura-de-Bruxa ?. (Site).
VARANI, A. M. . Bactérias Multirresistentes e ?Genes Saltadores?: Um casamento potencialmente perigoso para a Saúde Pública, Veterinária e Meio ambiente. 2025; Tema: Bactérias Multirresistentes e ?Genes Saltadores?: Um casamento potencialmente perigoso para a Saúde Pública, Veterinária e Meio ambiente. (Site).
VARANI, A. M. . A importância dos Consórcios Bacterianos para a Agroindústria: Aprendendo como as bactérias funcionam na natureza para podermos futuramente aplicar estes conhecimentos.. 2025; Tema: A importância dos Consórcios Bacterianos para a Agroindústria: Aprendendo como as bactérias funcionam na natureza para podermos futuramente aplicar estes conhecimentos.. (Site).
VARANI, A. M. . CitrusKB - Um banco de dados Biológico para o Estudo do Cancro Cítrico. 2025; Tema: CitrusKB - Um banco de dados Biológico para o Estudo do Cancro Cítrico. (Site).
VARANI, A. M. . A Dança dos Genes e a Crescente Ameaça da Resistência aos Antibióticos. 2025; Tema: A Dança dos Genes e a Crescente Ameaça da Resistência aos Antibióticos. (Site).
VARANI, A. M. . Como a Lagarta-do-Cartucho Pode Resistir às Toxinas de Plantas Transgênicas: Um Estudo Revelador. 2025; Tema: Como a Lagarta-do-Cartucho Pode Resistir às Toxinas de Plantas Transgênicas: Um Estudo Revelador. (Site).
VARANI, A. M. . Uma ?ménage à cinq? e a corrida armamentista entre as plantas e seus patógenos. 2025; Tema: Uma ?ménage à cinq? e a corrida armamentista entre as plantas e seus patógenos. (Site).
VARANI, A. M. ; Nakaya I.H. ; DARINI, A. L. C. . Bioinformática para Microbiologistas. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
VARANI, A. M. ; MENEGHINE, A. K. ; LIMA, M. T. ; ALVES, L. M. C. ; SACCO, L. P. . Extração de DNA e testes Bioquímicos de bactérias. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
VARANI, A. M. . Biologia Computacional Aplicada ao Estudo de Elementos Genéticos Móveis em Genomas de Procariotos. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
Varani, A.M. ; Chandler M ; Siguier P . Manual de Anotação de Elementos do tipo IS em genomas bacterianos. 2010. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Manual de Anotação Genômica).
VARANI, A. M. ; Filho, B . Bioinformática. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
VARANI, A. M. . Bioinformática Aplicada a Análise de Seqüências Biológicas. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
VARANI, A. M. . Genomas Ambientais e Agronômicos - AEG. 2003. (Relatório de pesquisa).
VARANI, A. M. . New-insight after Pyrococcus horikoshii OT3 Genome reanotation. 2002. (Relatório de pesquisa).
Projetos de pesquisa
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2021 - Atual
O genoma das plantas sagradas utilizadas no preparo da Ayahuasca (Psychotria viridis e Banisteropsis caapi), Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Francisco Prosdocimi - Integrante / Vitor Fernandes Oliveira de Miranda - Integrante / Saura Rodrigues da Silva - Integrante / Ana Paula de Moraes - Integrante / Simone Silva dos Santos Lopes - Integrante / José Beethoven Figueiredo Barbosa - Integrante / Danilo Ribeiro de Oliveira - Integrante / Maria Alice Correa - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Bolsa.
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2020 - Atual
Genoma e transcriptoma do Theobroma grandiflorum (cupuaçu): uma abordagem comparativa, evolutiva e funcional., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Jesus Ap. ferro - Integrante / Vitor Fernandes Oliveira de Miranda - Integrante / Saura Rodrigues da Silva - Integrante / Vinicius A. C. Abreu - Integrante / DOMINGUES, DOUGLAS S. - Integrante / Rafael Moyses - Integrante., Financiador(es): FUNDACAO AMAZONIA DE AMPARO A ESTUDOS E PESQUISAS - FAPESPA - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2019 - Atual
Bioprospecção de bactérias probióticas bacteriocinogênicas: da otimização do cultivo à aplicação em sistemas de produção animal, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (6) . , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / PINHEIRO DE SOUZA OLIVEIRA, RICARDO - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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2018 - Atual
ISfinder_Tn - A Platform for Identification and Analysis of the Prokaryotic Mobilome, Descrição: TnCentral is a Web-resource for prokaryotic transposons, their passenger genes, and their host organisms. It provides a variety of Search functions, BLAST functions for TnCentral and other related databases and a summary page with detailed annotation and a descriptive graphic for each transposon. It also makes available stand-alone scripts for identifying different transposons in genomic sequence data.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / Chandler, Michael - Coordenador / ALVARENGA, D. O. - Integrante / Karen Ross - Integrante / Cathy H. Wu - Integrante / Leslie Arminski - Integrante / Hongzhan Huang - Integrante / Jian Zhang - Integrante., Financiador(es): U.S. Department of Defense - Auxílio financeiro.
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2015 - 2017
Produção e análise in planta de uma biblioteca de mutantes de Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii tipo C (XauC), Descrição: O citros é uma cultura de reconhecida importância sendo inexistentes variedades melhoradas resistentes às suas pragas, a qual se destaca o cancro cítrico. Uma das bactérias causadoras desta doença é a X. f. subsp. aurantifolii tipo C (XauC). Esta bactéria restringe a sua patogenicidade à Citrus aurantifolia, e apresenta uma reação de hipersensibilidade (HR) nos demais citros. Esta resposta é responsável pela contenção do patógeno no sítio inicial de infecção, conferindo, dessa maneira, resistência ao patógeno. Este tipo de resposta é determinado por pares de genes complementares denominados de gene de resistência (R), presente no hospedeiro, e de gene de avirulência (avr), presente no patógeno. Se o gene avr de XauC for identificado, seria possível descobrir, nos citros que resistem à doença, a proteína produto do gene R (gene de resistência). Esse conhecimento poderá levar ao desenvolvimento de um método efetivo de controle do cancro cítrico causado pela XauC.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Jesus Ap. ferro - Integrante / Helen Alves Penha - Integrante.
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2014 - 2022
Genômica e transcriptoma de Utricularia reniformis (Lentibulariaceae): uma abordagem funcional e evolutiva, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Vitor Fernandes Oliveira de Miranda - Integrante / Michelle Mendonça Pena - Integrante / Saura Rodrigues da Silva - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2014 - 2020
Biodiversity of cyanobacteria and their bioactive compounds from under-explored Brazilian habitats, Descrição: Cyanobacteria are interesting ancient diverse organisms with a great future in biotechnology. They produce a large number of biomedically interesting bioactive compounds as well as have good prospects in bioenergy field. In this project, we will investigate molecular and cultivable cyanobacterial biodiversity from diverse habitats in Brazil. We will isolate strains to form a biobank and utilize cyanobacterial strains to screen and identify new bioactive compounds, their biosynthetic genes and enzymes. The Brazilian and Finnish teams have complementary expertise and will join forces to reveal cyanobacterial, bioactive compound and biosynthetic gene diversity in the state of São Paulo. The outcomes of the project will be taxonomically new cyanobacteria, information on the biodiversity of cyanobacteria from diverse environments, novel bioactive compounds for drug leads and cell reagents, new biosynthetic pathways and novel enzymes, database products of LC-MS fragmentation patters of the compounds, which can be used to exclude the known compounds and focus novelty in the future research. The biobank of cyanobacteria is a natural resource which could be utilized for the benefit of the country for years to come. One of the major ecosystem services provided by the cyanobacteria is the production of new bioactive compounds, drug leads for combatting serious human diseases. We will map the environments likely to yield to highest diversity of cyanobacteria and their metabolites for benefit of future targeted searches for novel natural products.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / Marli de Fatima Fiori - Coordenador / Augusto Etchegaray - Integrante / David P. Fewer - Integrante / Jouni Jokela - Integrante / Kaarina Sivonen - Integrante / Ernani Pinto - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Academy of Finland - Auxílio financeiro.
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2014 - 2020
Estudos de patogenicidade e diversidade genômica e funcional de Xanthomonas citri, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Joao Carlos Setubal em 10/02/2014., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / Setubal, João C. - Coordenador / Jesus Aparecido Ferro - Integrante / Luciano Antonio Digiampietri - Integrante / José Belasque Junior - Integrante / Fabricio Jaciani - Integrante / Leandro Moreira - Integrante / Nalvo Almeida Jr - Integrante / Marcelo Laia - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
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2013 - 2022
Metagenômica e Bioinformática Aplicada à Bioernegia: Explorando um Consórcio Bacteriano Degradador da Biomassa, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Lucia Maria Carareto Alves - Integrante / Milena Tavares de Lima - Integrante / Aylan Kener Meneghine - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
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2013 - 2016
ADUBO ORGÂNICO: INFLUÊNCIA AMBIENTAL E USO BIOTECNOLÓGICO, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado profissional: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / Lucia Maria Carareto Alves - Coordenador / Luciana Maria Saran - Integrante / Eliana G. M. Lemos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2012 - 2014
Genômica de cana de açúcar: elemetos de transposição contribuintes para diversidade gênica, genética e genômica, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / Cláudia Barros MonteiroVitorello - Integrante / MarieAnne Van Sluys - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
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2011 - 2013
Desvendando o papel de bacteriófagos em genomas de interesse agronomico, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Cláudia Barros MonteiroVitorello - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
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2008 - 2016
ISfinder, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / Michael Chandler - Coordenador / Patricia Siguier - Integrante / Edith Gourbeyre - Integrante.
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2008 - 2012
ISsaga (Insertion Sequence semi-automatic genomic annotation), Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Michael Chandler - Integrante / Patricia Siguier - Integrante / Edith Gourbeyre - Integrante / Vincent Chaneau - Integrante.
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2004 - 2008
Elementos de transposição e seu impacto no genoma (GaTE), Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / MarieAnne Van Sluys - Coordenador / Marcelo Marques Zerillo - Integrante / Douglas Silva Domingues - Integrante / Nilo Saccaro - Integrante / Erika Maria Jesus - Integrante / e demais colaboradores - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Histórico profissional
Endereço profissional
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Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal, Departamento de Tecnologia. , Via de Acesso Prof.Paulo Donato Castellane s/n, Vila Industrial, 14884000 - Jaboticabal, SP - Brasil, Telefone: (16) 32097407, URL da Homepage:
Experiência profissional
2018 - 2020
GEORGETOWN UNIVERSITY MEDICAL CENTERVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador associado, Carga horária: 2
Outras informações:
Desenvolvimento da plataforma TnCentral: https://tncentral.proteininformationresource.org/
2025 - Atual
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita FilhoVínculo: Servidor público, Enquadramento Funcional: Pesquisador IIA, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2022 - 2025
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita FilhoVínculo: Servidor público, Enquadramento Funcional: Pesquisador II, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2013 - 2022
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita FilhoVínculo: Servidor público, Enquadramento Funcional: Pesquisador III, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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06/2021
Direção e administração, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal.Cargo ou função, Vice-Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas.
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09/2020
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal.Cargo ou função, Representante Docente (Pós-Graduação) - Comitê Local de Internacionalização - CLI.
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01/2020
Ensino, Abi - Ciências Biológicas, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Genômica Funcional: Genômica, Transcriptômica, Proteômica e Metabolômica
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01/2018
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal.Cargo ou função, Comissão Local de Informática.
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01/2016
Ensino, Biociências e Biotecnologia Aplicadas à Farmácia, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Bioinformática Aplicada I: Montagem e Anotação de Genomas, Bioinformática: Ferramentas Computacionais e Bancos de Dados Aplicadas a Estudos Genômicos
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04/2013
Ensino, Pós Graduação em Microbiologia Agropecuária, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Bioinformática Aplicada I: Montagem e Anotação de Genomas, Bioinformática: Ferramentas Computacionais e Bancos de Dados Aplicadas a Estudos Genômicos, Tópicos Especiais: Análise do perfil de 16S rDNA a partir de dados de plataformas NGS, Tópicos Especiais: Mecanismos da transposição em Procariotos: Aspectos Moleculares, Bioquímicos e Aplicações em Biologia Computacional
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02/2013
Pesquisa e desenvolvimento, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal, Departamento de Tecnologia.Linhas de pesquisa
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02/2013
Ensino, Pós Graduação Agronomia (Genética e Melhoramento), Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Bioinformática Aplicada I: Montagem e Anotação de Genomas, Bioinformática: Ferramentas Computacionais e Bancos de Dados Aplicadas a Estudos Genômicos, Tópicos Especiais: Bioinformática aplicada ao estudo de genomas de plantas, Tópicos Especiais: Mecanismos da transposição em Procariotos: Aspectos Moleculares, Bioquímicos e Aplicações em Biologia Computacional
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04/2017 - 05/2021
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal.Cargo ou função, Membro do conselho do programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas.
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04/2017 - 05/2020
Direção e administração, Universidade Estadual Paulista.Cargo ou função, Representante dos pesquisadores na Câmara Central de Pesquisa (CCPe) - suplente.
2009 - 2011
Centre National de la Recherche ScientifiqueVínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisador / Chercheur, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Pesquisador contratado do C.N.R.S (Contrato por tempo determinado - CDD)
2008 - 2009
Centre National de la Recherche ScientifiqueVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado - CAPES, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2011 - 2013
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista do programa PRODOC CAPES, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Disciplinas Ministrada
2008 - 2010
Universidade de São PauloVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador/Colaborador
2002 - 2008
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorando em Biotecnologa (ICB/IB/IPT - USP), Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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10/2002 - 08/2008
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.Linhas de pesquisa
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10/2002 - 03/2004
Serviços técnicos especializados , Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.Serviço realizado, Bioinformática do Projetos Genomas FAPESP/AEG.
2002 - 2002
Laboratório Nacional de Computação CientíficaVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno de Pós-Graduação - Bioinformática, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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03/2002 - 07/2002
Outras atividades técnico-científicas , Laboratório de Bioinfromática, Laboratório de Bioinfromática.Atividade realizada, Aluno de Pós-graduação.
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de Alessandro de Mello Varani e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
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Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todas as movimentações desse processo e sempre que o processo aparecer em publicações dos Diários Oficiais e nos Tribunais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Confirma a exclusão?