Eiko Eurya Kuramae

I graduated in Agronomy at University of Sao Paulo State, Faculty of Agronomic Sciences (UNESP-FCA) in 1987, Brazil; MSc in Molecular Biology at Vrije Universiteit Brussel (VUB) in 1991, Belgium; PhD in Biological Sciences-Genetics at University of Sao Paulo State (UNESP in 1995, Brazil). At the moment I am Senior Scientist, Project Leader and Head of Tropical Microbial Ecology Unit (TropME) of the Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Wageningen, The Netherlands and Professor in Microbial Community Ecology & Environmental Genomics of Utrecht University, Utrecht, The Netherlands. My expertise are on ecological and environmental genomics, genomics, soil microbial ecology, molecular ecology, microbiology and bionformatics. My primary research interest is on understanding the patterns and mechanisms of interactions among soil-borne microbes and their environment, how these interactions shape the structure and affect the functioning of microbial communities and, consequently, of ecosystems. My major topics are microbial diversity loss, climate change, land use change and bio-informatics. Besides the coordination and execution of many Dutch and international fundamental research programs I am also strongly involved in the development of bio-based tools which can be used in soil health and environmental quality.

Informações coletadas do Lattes em 15/06/2023

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciencias Biologicas (Genetica)

1993 - 1995

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Caracterization patogenica, morfológica e molecular de Colletotrichum spp. agente causal da queda prematura de frutos jovens de citros
Orientador: Catalina Romero Lopes
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Colletotrichum Spp.; Rapd (Random Amplified Polymorphic Dna); Postbloom Fruit Drop Disease.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética. Setores de atividade: Educação Superior.

Mestrado em Molecular Biology

1989 - 1991

Vrije Universiteit Brussel
Título: Effect of maltose on microspore culture of wheat (Triticum aestivum L.), Ano de Obtenção: 1991
Orientador: Phillipe Lepoivre
Bolsista do(a): Association de Burse Belgique, ABOS, Bélgica. Palavras-chave: Anther Culture; Maltose; Triticum Aestivum.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia.

Pós-doutorado

1996 - 2000

Pós-Doutorado. , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Agrárias, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia.

Formação complementar

2010 - 2010

JGI Users Meeting 2010. (Carga horária: 48h). , Joint Genomics Institute, JGI, Estados Unidos.

2008 - 2008

Introduction to R for statistical analys. (Carga horária: 16h). , Wageningen University, WUR, Holanda.

2007 - 2007

ARB: a software environment for sequence data. (Carga horária: 24h). , Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), NIOO/KANW, Holanda.

2006 - 2006

Creating your Scientific Network. (Carga horária: 16h). , Wageningen University, WUR, Holanda.

2006 - 2006

Computational & Statistical Aspects of Microarrays. (Carga horária: 48h). , University of Milan, UM, Itália.

2005 - 2005

Agilent GeneSpring microarray sotware training. (Carga horária: 24h). , Centraalbureau voor Schimmelcultures, CBS/KNAW, Holanda.

2004 - 2004

Analysis of microbial and other genomes. (Carga horária: 8h). , Welcome Trust Sanger Institute, WTSI, Inglaterra.

2004 - 2004

Theoretical and practical microarray course. (Carga horária: 40h). , Utrecht University, UU, Holanda.

2004 - 2004

Agilent expression microarray. (Carga horária: 24h). , Centraalbureau voor Schimmelcultures, CBS/KNAW, Holanda.

2003 - 2003

Bioinformatic III course. (Carga horária: 40h). , Centre for Molecular and Biomolecular Informatics, CMBI, Holanda.

2003 - 2003

Bioinformatic Pattern Analysis course. (Carga horária: 40h). , Utrecht University, UU, Holanda.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Japonês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Pouco, Escreve Pouco.

Bandeira representando o idioma Holandês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Ecologia.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Microbiologia Agrícola.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: microbiologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Defesa Fitossanitária.

Organização de eventos

CANTARELLA, H. ; SILVEIRA, A. P. D. ; CIPRIANO, M. A. ; KURAMAE, EE . First Workshop on Linking Sustainability to Soil Microbiome. 2017. (Congresso).

KURAMAE, EE ; DUTILH, B.E. . Environmental Metagenomics Symposium. 2014. (Congresso).

KURAMAE, EE ; DUTILH, B.E. . Metagenomic Methods for Microbial Ecologists Course. 2014. (Congresso).

Kuramae, E. E. ; TSAI, S. M. ; JAN-BAKKER, E. . First Workshop on Meta-omics and Bioinformatics in Microbial Ecology. 2014. (Congresso).

Kuramae, E. E. ; GARCIA-ORENES, F. ; MORUGAN-CORONADO, A. ; MOCALI, S. ; SMALLA, K. . SSS3.2 Microorganisms and Soil restoration -European Geosciences Union General Assembly 2013. 2013. (Congresso).

CANTARELLA, H. ; GRAZIANO, P. ; KURAMAE, E. E. ; LAMPARELLI, R. . Workshop: upstream management: challenges for second generation sustainable production of bioproducts. 2013. (Congresso).

Participação em eventos

Rhizosphere 5. The rhizomicrobiome of Sorghum: impact on plant growth and stress tolerance. 2019. (Congresso).

Rhizosphere 5. Organic management strengthens interkingdom relationships in the soil and rhizosphere of barley. 2019. (Congresso).

1st annual meeting thematic Fapesp (8-10/08/2018)-Environmental effects of the pasture-sugarcane conversion and pasture intensificatio1. 2018. (Oficina).

21st World Congress of Soil Science -WCSS. The Power of the Soil on Microbiome Function and Interaction. 2018. (Congresso).

Holland Innovative Potato - HIP.Role and function of (soil) microorganisms. 2018. (Oficina).

WORKSHOP ON SOIL SUSTAINABILITY IN A BIO-BASED SOCIETY.Advances in linking soil-borne microbiome to sustainability. 2018. (Simpósio).

FEMS 2017-7th Congress of European Microbiologists. Endophytic Herbaspirilum sp. and Burkholderia tropica isolates promote Aluminium tolerance in sugarcane seedlings. 2017. (Congresso).

International course on Soil Microbial Ecology: an integrated and functional view for its application in agriculture..Soil Microbial Ecology International Course. 2017. (Seminário).

MiCROPe 2017. -. 2017. (Congresso).

NWO-FAPESP Workhop 'Biobased Economy'.Harnessing the rhizosphere microbiome to enhance plant productivity; Project: Microbial networks in control of greenhouse gases emissions in bio based agriculture - MiniBag. 2017. (Simpósio).

Soil Microbial Ecology International Course:an integrated and functional view for its application in agriculture..Impact of Land Use Change on Soil Microbiome. 2017. (Seminário).

16th International Symposium on Microbial Ecology-ISME.Effects of bacterial inoculation on sugarcane growth, physiology and assembly of rhizo and endosphere bacterial community. 2016. (Simpósio).

16th International Symposium on Microbial Ecology-ISME.Pseudomonas and lettuce interaction on the field and microbiome responses Lettuce and rhizosphere microbiome responses to growth promoters Pseudomonas species. 2016. (Simpósio).

3rd Thünen Symposium on Soil Metagenomics.Resilience in soil active microbial community treated with organic fertilizers and nitrification inhibitors. 2016. (Simpósio).

BioSB 2016.Exploring assemblies of plant root and plant nodule metagenomes for draft genomes and full length rRNA reads. 2016. (Seminário).

ECO-BIO 2016. Studies to improve biofuel sustainability: Targeting nitrogen bottlenecks. 2016. (Congresso).

EU Plant Microbiome Workshop.PLANT MICROBIOME RESEARCH AND INNOVATION. 2016. (Oficina).

NAEM 2016.Linking Diversity to Function. 2016. (Simpósio).

Wageningen Plant Microbiome kick off Meeting.Microbiome assembly in Soil, Rhizosphere, Endosphere and Plant Nodules. 2016. (Oficina).

2nd BBEST - Brazilian Bioenergy Science and Technology ConferenceER. BIOEN and BE-Basic scientific integration program for control of greenhouse gases (GHG) emissions in bio-based agriculture. 2014. (Congresso).

Environmental Metagenomics Symposium. 2014. (Simpósio).

Especial Visiting Researcher - PVE.Exploring and Exploiting Soil-borne Microbial community, function and diversity. 2014. (Encontro).

First Workshop on Meta-omics and Bioinformatics in Microbial Ecology.Impact of Land Use Change on Soil Microbiome. 2014. (Oficina).

Metagenomic Methods for Microbial Ecologists.Next Generation Sequencing in Microbial Ecology. 2014. (Oficina).

Netherlands Bioinformatics Conference 2014.Impact of long-term inorganic fertilization on the bacterial community in grassland soils. 2014. (Simpósio).

VN-Basic.Soil Health & Quality monitoring for sustainable biomass production. 2014. (Seminário).

12th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology.Reduction in bacterial functioning mirrors reduction in total and functional diversity after a strong soil disturbance. 2013. (Simpósio).

2nd Thünen Symposium on Soil Metagenomics.Taxonomical and functional microbial community selection in soybean rhizosphere. 2013. (Simpósio).

3rd BE-Basic Symposium.Functional bio-indicators for soil quality monitoring for sustainable management of biomass production (BIOSQ). 2013. (Simpósio).

Formal kick-off meeting for VN-Basic, a science and innovation collaboration focussed on developments and implementation of Bio-Based economy.Soil Health & Quality monitoring for sustainable biomass production in Vietnam. 2013. (Seminário).

Netherlands Bioinformatics Conference 2013.Metagenomic analysis contrasting bacterial and functional diversity between soybean rhizosphere and bulk soil in Brazilian Amazon region. 2013. (Seminário).

Soil System Sciences Division of the European Geosciences Union. Taxonomical and functional microbial responses to agriculture management of Amazon forest soils. 2013. (Congresso).

Workshop: upstream management: challenges for second generation sustainable production of bioproducts.Soil organic matter in the biobased economy. 2013. (Seminário).

14th ISME International Symposium on Microbial Ecology.. Amazonian deforestation alters bacterial networks in soil. 2012. (Congresso).

28th New Phytologist Symposium: Functions and ecology of the plant microbiome.Insights into soil acidobacterial community based on Amazon soil characteristics. 2012. (Simpósio).

Be-Basic Fapesp workshop.Functional bio-indicators for soil quality monitoring for sustainable management of sugarcane biomass production (BIOSQ). 2012. (Seminário).

BE-Basic Symposium. 2012. (Simpósio).

Ergosymposium. 2012. (Simpósio).

Metagenomics Seminar.Impact of land use change on microbial community structure and function in bio-based economy. 2012. (Seminário).

Safety and environmental impact of chemicals and bio-based molecules and processes.Next generation arrays for sensing soil health status. 2012. (Simpósio).

Setting the agenda for VN-Basic, an international consortium on science and innovations in biobased economy EC.Exploiting Ecogenomics to Reveal Biological Indicators of Soil Quality. 2012. (Seminário).

26 Congresso Brasileiro de Microbiologia. Insights into soil acidobacterial community based on Amazon soil characteristics. 2011. (Congresso).

Eco-informatic: the silver bullet for ecology?. 2011. (Seminário).

Ecology of Soil Microorganisms: Microbes as Important Drivers of Soil Processes. Unraveling maize litter decomposi tion by 18S rRNA and metatranscriptomic analyses of soil-borne microorganisms. 2011. (Congresso).

Galaxy Community Conference. 2011. (Seminário).

NBIC Conference. 2011. (Simpósio).

13th ISME International Society for Microbial Ecology Conference. Metranscriptomic examination of eukaryotic genes involbed in maize litter decomposition. 2010. (Congresso).

6th Annual Meeting of the Ecogenomics Consortium.Activities of mycorrhizal fungi in soil systems. 2010. (Seminário).

Advances in Genomics Symposium. 2010. (Seminário).

International Symposium on Soil Metagenomic. Metranscriptomic examination of eukaryotic genes involved in maize litter degradation. 2010. (Congresso).

JGI Users Meeting 2010. 2010. (Seminário).

Microbes in Ecosystems. 2009. (Seminário).

NIOO Days. 2009. (Encontro).

TRACEAM summer school 2009. 2009. (Congresso).

12th ISME International Symposium on Microbial Ecology. . Influence of geographical distance, land usage and soil characteristics on soil-borne microbial communities as determined by integrated use of phylochips, community profiling, and Q-PCR. 2008. (Congresso).

Moleco mini-symposium: Highlights in Microbial Ecology.Genomic analysis of microbial community structure. 2008. (Simpósio).

NIOO Days.Phylochip and Q-PCR reveal prokaryotic succession in chalk grasslands after field abandonment. 2008. (Simpósio).

Soil & Water symposium.Phylochip and Q-PCR reveal prokaryotic succession in chalk grasslands after field abandonment. 2008. (Simpósio).

4rd Annual Meeting of the Ecogenomics Research Program.Genomic analysis of microbial community structure of Dutch soil samples with respect to specific vegetation regimes and soil type. 2007. (Seminário).

Fall Meeting of the Microbial Ecology ? NVvM.Phylogenetic microarray analysis of soil-borne bacterial communities across chronosequences of chalk grassland secondary succession. 2007. (Simpósio).

First Ecogenomics Microarray Meeting. 2007. (Seminário).

10th Yeast Anniversary. 2006. (Seminário).

8th European Congress on Fungal Genetics. Conflicting phylogenetic position of Schizosaccharomyces pombe. 2006. (Congresso).

BBC 2006. Bioinformatics for Food and Health. 2006. (Simpósio).

. ESF?EMBO symposium on Comparative Genomics of Eukaryotic Microorganisms.) Evolution of fungi: genomics and biodiversity. 2005. (Simpósio).

Microarray ? based applications in Ecogenomics.Comparative and functional genomics of yeasts. 2005. (Seminário).

Mini symposium on Fungal pathogenicity to plants and humans ? variation on a theme?.Gene content of pathogenic and non pathogenic Saccharomyces cerevisiae: clues to pathogenicity?. 2005. (Simpósio).

Sixth International Conference on Cryptococcus and cryptococcosis. 2005. (Congresso).

11th International Congress on Yeasts ? ICY 2004. Fungal Phylogenomics ? Linking evolution and function. 2004. (Congresso).

BioMaths Workshop Combining Classifiers for phenotypic and Genotipic Data of Microorganisms. 2004. (Seminário).

First European Workshop on Cryptococcus and Cryptococcosis.Cryptococcus neoformans and the tree of life. 2004. (Seminário).

Genomes 2004 ? The Sanger Institute Hinxton.Fungal Phylogenomics: Linking evolution and Function. 2004. (Seminário).

Medische Microbiologie.Microbiologie Genomic diversity of the Cryptococcus neoformans species complex. 2004. (Simpósio).

Workshop Research Schools ? Phylogenomics of Fungi.Fungal Phylogenomics, understanding the fungal way of Life. 2004. (Simpósio).

Third Cryptococcus Genome meeting. Fungal Phylogenomics. 2003. (Congresso).

II Workshop de Genética.II Workshop de Genética. 2002. (Simpósio).

Seventh International Mycological Congress. 2002. (Congresso).

The 7th International Mycological Congress. The 7th International Mycological Congress. 2002. (Congresso).

. ONIDO, Regional Biotechnology Forum: A Latin American Biotechnology Initiative.The Brazilian Genome Projects. 2001. (Seminário).

10th International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 10th International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 2001. (Congresso).

10th International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. Enzymes involved in detoxification of reactive oxygen species (ROS) in sugarcane. 2001. (Congresso).

International Consortium for Sugarcane Biotechnology (ICSB) Workshop. International Consortium for Sugarcane Biotechnology (ICSB) Workshop. 2001. (Congresso).

XXXIV Congresso Brasileiro de Fitopatologia e XI Congresso Latino-Americano De Fitopatologia. Análise de ESTs do genoma cana-de-açúcar da FAPESP induzidas por Acetobacter diazotrophicans e Herbaspirillum rubrisubalbican. 2001. (Congresso).

1st Asian Conference on Plant Pathology. PR-1 (pathogenesis-related protein) sequence of the sugarcane EST project (SUCEST). 2000. (Congresso).

46 Congresso Nacional de Genetica. Mecanisms de defesa contra patogenos: uma perspectiva genomica. 2000. (Congresso).

International Consortium for Sugarcane Biotechnology (ICSB) Workshop.Brazilian Sugarcane EST Genome Project - ESTs Involved in the Mechanism of Plant Defense against Pathogens. 2000. (Simpósio).

Seminar Brazil. 2000. (Seminário).

Third International Symposium on Rhizoctonia (IRS 2000). Nuclear and mitochondrial rDNA sequences analysis of multinucleate and binucleate isolates of bean, peanut and AG testers of R. solani and Rhizoctonia spp. Binucleate. 2000. (Congresso).

42 CONGRESSO BRASILEIRO DE GENETICA. 42 CONGRESSO BRASILEIRO DE GENETICA. 1999. (Congresso).

American Phytopathology Society/Canadian Phytopatology Society (APS/CPS) Meeting. Pathogenic, morphological and rDNA sequence studies of isolates of Colletotrichum spp. of postharvest fruits. 1999. (Congresso).

XXXII Congresso Brasileiro de Fitopatologia. Associação de Rhizoctonia solani GA 2.2 IIIB e GA1 IA a soja no Brasil. 1999. (Congresso).

Sixth International Mycological Congress?IMC6. Pathogenic, morphological and rDNA sequence studies of isolates of colletotrichum spp. of postharvest fruits. 1998. (Congresso).

48a. Reunião da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência.Restriction endonuclease analysis of DNA of Colletotrichum gloeosporioides causing postbloom fruit drop disease in citrus in Brazil. 1996. (Encontro).

4th European Fundation of Plant Pathology Symposium on Diagnosis and Identification of Plant Pathogen.. Assessment of Colletotrichum gloeosporoides isolates based on ribosomal DNA internal transcribed spacers. 1996. (Congresso).

Congresso Brasileiro de Genética. Molecular and pathogenic characterization of Xanthomonas campestris pv. phaseoli. 1996. (Congresso).

Semana de Citricultura.Morphological, pathogenic and molecular characterization of Colletotrichum of citrus, causal agent of postbloom fruit drop. 1996. (Encontro).

XIX Congresso Paulista de Fitopatologia. ?Caracterização do gene (Beta-tubulina de isolados de Colletotrichum gloeosporioides de citros resistentes ao benomyl, através de SSCP e RAPD. 1996. (Congresso).

I workshop em Mapeamento genômico de Plantas. 1995. (Simpósio).

XX Reunião Anual de Genética de Microrganismos.Studies on Colletotrichum gloeosporioides from Citrus by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers and Pathogenicity. 1995. (Encontro).

XXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia. Caracterização Morfológica, Patogênica e Molecular de Colletotrichum gloeosporioides, Agente Causal da Podridão Floral do Citros. 1995. (Congresso).

I Encontro Brasileiro de Biotecnologia Vegetal" (REDBIO). Effect of maltose in the culture medium on microspore development in anthers of wheat (Triticum aestivum L.) cv. Sabine. 1993. (Congresso).

Autumn Genetic Engineering Simposium. 1990. (Seminário).

Simposium of Genome Sequencing: novel techniques, strategies, sciences and social implications. 1990. (Seminário).

Primeiro Encontro sobre a Cultura do Limão na Região de Botucatu. 1987. (Encontro).

I Informatics Simposium. 1985. (Simpósio).

Primeiro Seminário de Política e Prática Profissional. 1985. (Seminário).

V Congresso da Sociedade Botânica de São Paulo. 1985. (Congresso).

I cicle of Seminar about Climatology. 1984. (Seminário).

Participação em bancas

Aluno: Maisa Ciampi

Kuramae EE; SOUZA, N. L.;LEMOS, E. G. M.. Evolução intraespecífica de Rhizoctonia solani AG-1 IA associada à soja e ao arroz no Brasil, baseada em polimorfismos no operon ITS-5.8S rDNA. 2004. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Naiara Sardinha Pinto

Kuramae, E. E.; LEITE, A.. Genoma Mitocondrial de Crinipellis perniciosa (Basidiomycota: Agaricales), agente etiológico da vassoura-de-bruxa.. 2002. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Patricia Pereira Coltri

Kuramae, E. E.; LEITE, A.. Expressao de genes potencialmente envolvidos com patogenicidade de Xylella fastidiosa em Escherichia coli. 2002. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Andreia Kazumi Nakatani

Kuramae, E. E.CAMARGO, L. E. A.; KIMATI, H.. Diversidade Genética de Xanthomonas campestris pv. passiflorae e sensibilidade a produtos químicos. 2001. Dissertação (Mestrado em Pós-Graduação em Agronomia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Edna Maria Zelandi

Kuramae, E. E.; LOPES, C. R.;MORI, E. S.; GIMENES, M. A.. Caracterização da variabilidade genética intraespecífica em Solanum lycocarpum ST. Hil (Solanaceae) e em Eugenia jambolana Lamarck (Myrtaceae) através de marcador molecular tipo RAPD. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Alexandre Luis Buzeto

Kuramae, E. E.; FENILLE, R. C.; MASUDA, Y.. Caracterização e patogenicidade de grupos de anastomose de Rhizoctonia spp. associados a hortaliças. 2001. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Proteção de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Paula Macedo Nóbile

Kuramae, E. E.; LOPES, C. R.; VALLS, J. F. M.. Marcadores moleculares no estudo das relações de afinidades e filogenéticas entre e dentro das espécies da seção Rhizomatosae, gênero Arachis. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Fanley Bertoti da Cunha

Kuramae, E. E.; LOPES, C. R.; VALLS, J. F. M.. Análise das relações genéticas entre a espécie alotetraplóide Arachis hypogaea (AABB) e espécies diplóides de possível genoma (BB) da seção arachis, gênero Arachis , pelo uso de marcadores moleculares. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Diana Edisa Garcia Hernandez

Bonte D; Elzenga T; Olff H; Kuiper o; van Elsas JD;KURAMAE, EE. Dynamics of the salt marsh biomes in response to inundation. 2022. Tese (Doutorado em Microbial Community Ecology) - University of Groningen.

Aluno: Maarten Punt

ABEE, T.; WINDE, J. H.; ACKERVEKEN, A. V. D.; KOWALCHUK, G.;KURAMAE, EE. Heterogeneity of food spoilage fungi. 2022. Tese (Doutorado em Ecology & Biodiversity) - Utrecht University.

Aluno: Mei Li

Salles J.F.;KURAMAE, EE; WOSTEN, H. A. B.; ACKERVEKEN, A. V. D.; Friman V.. The antagonists and helpers of plant pathogens: unraveling interactions that determine pathogen success. 2021. Tese (Doutorado em Ecology & Biodiversity) - Utrecht University.

Aluno: Dajana Radujkovi

KURAMAE, EE; Lebeer S.; VENTERINK, H. O.; TEMMERMAN, S.. Unravelling the role of soil properties as predictors of local- and global-scale grassland productivity and soil microbial community composition patterns. 2020. Tese (Doutorado em Biology) - University of Antwerp.

Aluno: Afnan Khalil Ahmad Suleiman

KURAMAE, EE; ROESCH, LFW; MEOLO, V. M. M.; ANTONIOLLI, ZAIDA I.; AITA, C.. Impacto provocado pela adição de resíduos na comunidade microbiana do solo e na emissão de N2O. 2016. Tese (Doutorado em Ciência do Solo) - Universidade Federal de Santa Maria.

Aluno: Matheus Aparecido Pereira Cipriano

Kuramae, E. E.; SILVEIRA, A. P. D.; PATRICIO, F. R. A.; DESTEFANO, S. A. L.; PURQUERIO, L. F. V.. Utilização de rizobactérias promotoras do crescimento de plantas na produção de alface e crisântemo. 2013. Tese (Doutorado em Agricultura Tropical e Subtropical) - Instituto Agronômico de Campinas.

Aluno: Marie Duhamel

W. van der Putten; BOUWMEESTER, H. J.;Kuramae, E. E.; ELLERS, J.. Maintaining cooperation and diversity in the mycorrhizal symbiosis. 2013. Tese (Doutorado em Ecology) - Free University Amsterdam (VU).

Aluno: Ben Nota

Kuramae, E. E.; COLBOURNE, J.; VEN, K. V. D.; RUTGERS, M.; BROUWER, B.. Ecotoxicogenomics of springtails - Microarray analysis of Folsomia candida exposed to stressful soil conditions. 2010. Tese (Doutorado em Sense) - Free University Amsterdam (VU).

Aluno: Lur Epelde Sierra

KOWALCHUK, G. A.;KURAMAE, E. E.; GARCIA, M. J. S.; CRESPO, C. G.. Evaluation of the efficiency of metal phytoremediation processes with microbiological indicators of soil health. 2009. Tese (Doutorado em Biology) - Faculdad Medicina y Odontologia.

Aluno: Andréia K

Kuramae EE; SOUZA, N. L.;CAMARGO, L. E. A.; FURTADO, E. L.; MINHONI, M. T. A.. Nakatani. Genética de Rhizoctonia spp. e análise de sequencias multilocos. 2006. Tese (Doutorado em Plant Pathology) - Faculdade de Ciências AgronÃmicas FCA/UNESP-Botucatu.

Aluno: Maurício Conrado Meyer

Kuramae, E. E.; SOUZA, N. L.; YORINORI, J. T.; TOLEDO, J. F. F.; MIRANDA, M. A. C.. Caracterização de Rhizoctonia solani Kühn, agente causal da mela da soja [Gycine max (L.) Merril], seleção de genótipo e controle químico. 2002. Tese (Doutorado em Agronomia (Proteção de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Janaína Marianno de Marque

Kuramae, E. E.; SOUZA, N. L.; KOBORI, R. F.; MASSOLA JUNIOR, N. S.; MASUDA, Y.. Fisiologia, patogenicidade, sensibilidade a fungicidas e caracterização molecular de Phytophthora capsici Leonian obtido de pimentão (Capsicum annuum L.). 2002. Tese (Doutorado em Agronomia (Proteção de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Valdenice Moreira Novelli

Kuramae, E. E.MACHADO, M. A.; LOPES, C. R.; GIMENES, M. A.; PATERNIANI, M. E. A. G. Z.. Variabilidade genética da laranja doce (Citrus sinensis L. Osbeck) avaliada por maracadores moleculares. 2002. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Roseli Chela Fenille

Kuramae, E. E.; SOUZA, N. L.; FURTADO, E. L.;CAMARGO, L. E. A.; YORINORI, J. T.. Caracterização citomorfológica , cultura, molecular e patogênica de Rhizoctonia solani Kühn associado à soja no Brasil. 2001. Tese (Doutorado em Agronomia (Proteção de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Marcelo Dib Bechara

Kuramae, E. E.; LOPES, C. R.; VALLS, J. F. M.; GIMENES, M. A.. Relações filogenéticas no gênero Arachis, utilizando espaçadores transcritos internos (ITS) de rDNA nuclear. 2001. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Luciane Prioli Ciapina

Kuramae, E. E.LEMOS, E. G. M.OLIVEIRA, M. C.; CERESINI, P. C.; SENA, J. A. D.; ALVES, L. M. C.. Sequências repetitivas e sequeciamento do espaço intergênico dos genes 16S-23S rDNA acessando a diversidade genética em Xylella fastidiosaa. 2001. Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista.

Aluno: Silvana Maria Paes Cangiani Pigatto

Kuramae, E. E.; LOPES, C. R.;MORI, E. S.MARINO, C. L.; FERREIRA, M.. Variabilidade Genética de quatro gerações de Eucalyptus urophylla S.T. blake avaliada por meio do marcador molecular RAPD e caracterização botânica e silvicultural. 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Elaine Sandra Nicolini Nabuco de Araújo

Kuramae, E. E.; LOPES, C. R.; FERREIRA, M.; GIMENES, M. A.; AMARAL, W. A. N.. Relações filogenéticas entre espécies dos gêneros Corymbia e Eucalyptus inferidas com base no polimorfismo detectado nas regiões ITS ("Internal Transcribed Spacers") do DNA ribossômico nuclear. 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Maria Júlia Corazza Nunes

Kuramae, E. E.; LOPES, C. R.; TARGON, M. L. N.; MULLER, G. W.;MACHADO, M. A.. Caracterização molecular de variedades de pomelo (Citrus paradisi Macf.) e de complexos de isolados do vírus da tristeza dos citrus associados. 1999. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: William Mário de Carvalho Nunes

Kuramae, E. E.; FURTADO, E. L.; SOUZA, N. L.; LEITE JUNIOR, R. P.;MACHADO, M. A.. Epidemiologia da clorose variegada dos citros (CVC) avaliada por sintomas e diagnóstico serológico e molecular de Xylella fastidiosa. 1999. Tese (Doutorado em Agronomia (Proteção de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carlos Alberto Rodrigues da Silva

Kuramae, E. E.; VELINI, E. D.;MARTINS, D.; RODELLA, R. A.; DURIGAN, J. C.; CHRISTOFFOLETI, P. J.. Identificação e avaliação da competitividade de biotipos de tiririca (Cyperus rotundus L.) pela eletroforese isoenzimática. 1998. Tese (Doutorado em Agronomia (Proteção de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Afnan Khalil Ahmad Suleiman

Kuramae EEANTONIOLLI, ZAIDA INÊS; AITA, C.; ROESCH, LUIZ FERNANDO WÜRDIG; JACQUES, RODRIGO JOSEMAR SEMINOTI. Dinamica da Comunidade Microbiana so Solo em Resposta a Aplicacao de Dicianodiamida no Solo. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência do Solo) - Universidade Federal de Santa Maria.

Aluno: Acacio A

Kuramae, E. E.; VEEN, J. A. V.; TSAI, S. M.; BARRETO, C. C.. Navarrete. Diversidade de Acidobacteria e Verrucomicrobia em solos sob diferentes usos na fronteira de expansão agrícola no sudeste da Amazônia. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Sciences) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura CENA/USP.

Aluno: Marcos Renato Rodrigues Araújo

Kuramae, E. E.; LEITE, A.. Desenvolvimento de um sistema de anotação sob demanda para organismos eucariotos inferiores. 2002. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Dario Abel Palmieri

Kuramae, E. E.; LOPES, C. R.; GIMENES, M. A.; RAINHO, C. A.. Sorteio de ponto específico. 2001. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Jomar Patrício Monteiro

Kuramae, E. E.; LOPES, C. R.; GIMENES, M. A.. Soretio de ponto específico. 2001. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Janaína Marianno Marque

Kuramae, E. E.; SOUZA, N. L.; FURTADO, E. L.. Sorteio de ponto específico. 2000. Exame de qualificação (Doutorando em Agronomia (Proteção de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Fanley Bertoti da Cunha

Kuramae, E. E.; LOPES, C. R.; GIMENES, M. A.; NAKAMOTO, W.. Sorteio de ponto específico. 2000. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: André Luiz Raposo Barrosa

KURAMAE, EE; MORAES, F. H. R.; C. Gehring. Life inside a nodule: Metagenomics unravel complex bacterial communities inhabiting the nodules of legume plants and the effects of seawater intrusion. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Agroecologia) - Universidade Estadual do Maranhão.

Aluno: Otávio Henrique Bezerra Pinto

KURAMAE, EE; BARRETO, C. C.; DIAS, S. C.. Regulacao Genica de Celulases e Hemicelulases do Isolado AB23 Pertencente ao Filo Acidobacteria. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília.

Orientou

Afnan Khalil Ahmad Suleiman

MICROBIAL COMMUNITY DYNAMICS IN RESPONSE TO DICYANDIAMIDE APPLICATION IN SOIL; Início: 2015; Tese (Doutorado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Johnny Soares

N2O Emissions from fertilizers applied to sugarcane; Início: 2014; Tese (Doutorado em Agricultura Tropical e Subtropical) - Instituto Agronômico de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Noriko Cassman

Denitrifier dynamics during vinasse fertilization in sugarcane soil; Início: 2014; Tese (Doutorado em Natural Sciences) - Leiden University, NWO; (Orientador);

Manoeli Lupatini

Soil microbiome dynamics at different land use systems; Início: 2013; Tese (Doutorado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Thiago Schlemper

Effect of soil borne microbial diversity on the symbiosis between Sorghum bicolor L; Moench and Arbuscular Mycorrhizal Fungi - AMF; Início: 2012; Tese (Doutorado em Natural Sciences) - Leiden University, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

LEONARDO B

Pitombo; Greenhouse gas emissions (N2O, CO2 and CH4) from soil with sugarcane production and impact on microbial community structure and function; Início: 2012; Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Recursos Naturais) - Universidade Federal de São Carlos, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Yan Yan

The interaction between plant defense and microbes; Início: 2012; Tese (Doutorado em Natural Sciences) - Leiden University, Leiden University; (Coorientador);

Marcelo Zerillo

Início: 2015; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW);

Matheus Cipriano

Início: 2014; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior;

Adriano Lucheta

Soil microbiome core for soil ecosystem functioning; Início: 2014; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior;

Mauricio Dimitrov

Harnessing the rhizosphere microbiome to enhance plant productivity; Início: 2014; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), NWO;

Anna Kielak

Metagenomic tools for intelligent gene mining; Início: 2012; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), NWO/Be-Basic;

Callum Clark

Linkage between nitrous oxide emissions and nitrogen cycling gene abundances from microalgae fertilisation; 2017; Dissertação (Mestrado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW),; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Chidinma Oguejiofor Uba

Optimization of cell growth and EPS production of phylum Acidobacteria; 2017; Dissertação (Mestrado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW),; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Federico A

O; Silva Gutierrez; PLANT GROWTH PROMOTING BACTERIA AND STRIGOLACTONE INTERACTIONS; 2016; Dissertação (Mestrado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW),; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Rebeca Arias

Pathogen identification in Blackwater; 2016; Dissertação (Mestrado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW),; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

Leonardo Machado Pitombo

EMISSÕES DE N2O A PARTIR DE SOLOS SOB CULTIVO DE CANA-DE-AÇÚCAR: EFEITO DA PALHA E VINHAÇA; 2015; Dissertação (Mestrado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

Manon Neilen

Examining bacterial and fungal plant organic matter decomposition via integrated pyrosequencing-based approaches ERGO; 2013; Dissertação (Mestrado em Microbial Ecology) - Utrecht University, NWO; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Denise Nakada Ozaki

Análise de variabilidade genética entre isolados de Fusarium oxysporum f; sp; cubense e Fusarium spp; isolado de solo, através de marcadores moleculares; 2002; Dissertação (Mestrado em Agronomia (Proteção de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Alexandre Luiz Buzeto

Caracterização de Rhizoctonia sp; de hortaliças; 2001; Dissertação (Mestrado em Agronomia (Proteção de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Ricardo da Silva Ferrari

Controle de Rhizoctonia solani por Rhizoctonia spp; binucleada; 2001; Dissertação (Mestrado em Agronomia (Proteção de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Natalia Aparecida Rodrigues

Susceptibilidade de Frutos Pos-Colheita A Colletotrichum Acutatum Simonds - Co-Orientacao; 1998; Dissertação (Mestrado em Fitopatologia) - Faculdade de Ciências AgronÃmicas FCA/UNESP-Botucatu, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Ohana Yonara de Assis Costa

Ecological functions and environmental fate of exopolymers of Acidobacteria; 2020; Tese (Doutorado em Natural Science) - Leiden University,; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Thiago Roberto Schlemper

The rhizomicrobiome of Sorghum impact on plant growth and stress tolerance; 2019; Tese (Doutorado em Natural Science) - Leiden University, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Noriko A

Cassman; Nitrogenfertilization and the microbiome; 2019; Tese (Doutorado em Natural Science) - Leiden University,; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Késia Silva Lourenço

Linking soil microbial community dynamics to N2O emission after bioenergy residue amendments; 2019; Tese (Doutorado em Natural Science) - Leiden University, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Anthony Diego Muller Barboza

Microbiome Core for Soil Ecosystem Functioning -Bolsa sandwich CAPES NUFFIC; 2017; Tese (Doutorado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

Ronildson Lima Luz

'Impacts of land use on aboveground biomass, soil quality and microbial community composition and function in Maranhão State, eastern periphery of Amazonia; 2016; Tese (Doutorado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

Yan Yan

Assemblage and Functioning of Bacterial Communities in Soil and Rhizosphere; 2016; Tese (Doutorado em Natural Science) - Leiden University,; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Manoeli Lupatini

Microbial Communitie in Pampa soils;impact of land-use changes, soil type and climate conditions; 2015; Tese (Doutorado em Natural Science) - Leiden University,; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Afnan Suleiman

TEMPORAL VARIABILITY OF SOIL MICROBIAL COMMUNITIES AFTER APPLICATION OF DICYANDIAMIDE-TREATED SWINE SLURRY AND MINERAL FERTILIZERS; 2015; Tese (Doutorado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

Johnny R

Soares; Nitrous oxide emission related to ammonia-oxidizing bacteria and mitigation options from N fertilization in a tropical soil; 2015; Tese (Doutorado em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

Sandra R

Magro; Soil bacterial communities at the roadside; 2012; Tese (Doutorado em Ecology) - Universidad Complutense de Madrid,; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

LUCAS W

Mendes; Amazon forest conversion: impacts on soil-borne microbial diversity and functions; 2011; Tese (Doutorado em Sciences) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura CENA/USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

Maryeimy V

Lopez; Biodiversity and functional activity of microorganisms in mangroves from State of Sao Paulo; 2010; Tese (Doutorado em Agricultural Microbiology) - Luiz de Queiroz College of Agriculture, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

Acacio A

Navarrete; Monitoring the microbial diversity and functional activities in response to land-use changes and deforestation under soybean and sugarcane cultivations; 2009; Tese (Doutorado em Sciences) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura CENA/USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

Remy Hillekens

Effects of genetically modified crops on beneficial soil fungi: Community structure and function of fungal decomposers; 2007; Tese (Doutorado em Ecology) - Free University Amsterdam (VU), NWO; Coorientador: Eiko Eurya Kuramae;

Roseli Chella Fenille

Caracterizacao e Patogenicidade de Grupos de Anastomose de Rhizoctonia Solani Kühn Associados À Cultura da Soja - Co-Orientacao; 2000; Tese (Doutorado em Plant Pathology) - Faculdade de Ciências AgronÃmicas FCA/UNESP-Botucatu,; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Ana Paula Erbetta Sueitt

2017; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Eiko Eurya Kuramae;

Caroline Borges Bevilacqua

2017; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Eiko Eurya Kuramae;

Gisele Rodrigues

2016; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Eiko Eurya Kuramae;

Adriano Reis Lucheta

2015; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Eiko Eurya Kuramae;

Marcelo Zerillo

2015; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Eiko Eurya Kuramae;

Matheus Aparecido Pereira Cipriano

2015; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW),; Eiko Eurya Kuramae;

Acacio A

Navarrete; Taxonomical and functional microbial bio-indicators in soil under sugarcane biomass production; 2013; Centro de Energia Nuclear na Agricultura CENA/USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Eiko Eurya Kuramae;

Yao Pan

Quantitative Array System for Soil Health; 2011; Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), NWO; Eiko Eurya Kuramae;

Stan Derksen

PGPR in Sorghum: Complementary mechanisms revealed by genomics and metagenomics; 2018; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Bioinformatics) - Stichting Hogeschool van Arnhem en Nijmegen; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Claudia Colzi

Physiology of Acidobacteria; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Microbial Ecology) - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), ERASMUS; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Danile Dias Rosa

Caracterização citomorforlógica, molecular e patogênica de isolados de Rhizoctonia solani na cultura da batata (Solanum tuberosum L; ); 2001; Iniciação Científica; (Graduando em Agronomia-Botucatu) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Denise Nakada Ozaki

Técnicas moleculares aplicadas nos Projetos Genoma AEG; 2001; Iniciação Científica; (Graduando em Agronomia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Angelo Aparecida Sussel

2; Angelo A; B; Sussel, Roseli C; Fenille, Nilton L; De Souza e Eiko E; Kuramae; Caracterização de Rhizoctonia solani agente de tombamento em mudas de café (coffea arabica); 2000; Iniciação Científica; (Graduando em Agronomia-Botucatu) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Regiane Delgaro

Genoma cana de açúcar SUCEST-FAPESP; 1999; Iniciação Científica - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Maísa Boff Ciampi

Genoma AEG - FAPESP; 1999; Iniciação Científica - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Ricardo da Silva Ferrari

Isolamento de DNA plasmidial de Rhizoctonia solani de feijoeiro; 1998; Iniciação Científica; (Graduando em Agronomia-Botucatu) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

Noriko Cassman

Soil-borne Microbe Metagenomics; 2013; Orientação de outra natureza - Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW); Orientador: Eiko Eurya Kuramae;

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  • Kuramae, E. E. . Soil organic matter in the biobased economy. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Kuramae, E. E. . Soil Health & Quality monitoring for sustainable biomass production in Vietnam. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • Kuramae, E. E. . Microbial Ecology in omics era. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções

Kuramae, E. E. . 2000 genes do projeto genoma FAPESP AEG. 2001.

Kuramae, E. E. ; SILVEIRA, A. P. D. ; CANTARELLA, H. ; KIELAK, ANNA ; KEIJZER, R. ; CIPRIANO, M. A. . Practical Course of soil nucleic acids isolation for Microbial Ecology studies. 2013. .

Kuramae, E. E. . Bioinformatics in Microbial Ecology. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Kuramae, E. E. ; KURAMAE-IZIOKA, E. E. ; Isolamento e Sequenciamento de Dna Plasmidial de Rhizoctoni Solani de Feijoeiro e Amendoinzeiro do Estado de Sao Paulo. 1998 (PROJETO FAPESP) .

Kuramae, E. E. ; MARINGONI, A. C. . Projeto Genoma - Fapesp - Xylella Fastidiosa. 1998 (COORDENADORA DE UM DOS 30 LABORATÓRIOS DE SEQUENCIAMENTO DO PROJETO GENOMA -FAPESP) .

Kuramae, E. E. ; KURAMAE-IZIOKA, E. E. ; MACHADO, M. A. . Isolamento e Clonagem de Mrna Diferencial Em Laranja Doce (Citrus Sinensis Osb. Cv. Pera) e Tangor Murcott (Citrus Sinensis Osb. X C. Reticulata Blanco) Infectados Por Xylella Fastidiosa. 1997 (BOLSA RECEM DOUTOR-CNPQ) .

Kuramae, E. E. ; KURAMAE-IZIOKA, E. E. ; Caracterização de Rhizoctonia Solani e Rhizoctonia Spp. de Feijoeiro e Amendoinzeiro do Estado de Sao Paulo Através de Marcadores Moleculares e Dsrna. 1996 (PROJETO JOVEM PESQUISADOR P/ CENTROS EMERGENTES-FAPESP) .

Kuramae, E. E. ; KURAMAE-IZIOKA, E. E. ; Genetic Characterization Of Colletotrichum Gloeosporioides Isolates From Brazil Citrus By Restriction Analysis Of Pcr-Amplified Ribosomal Dna. 1996 (PREMIO JOVEM GENETICISTA 1996) .

Projetos de pesquisa

  • 2018 - Atual

    Soil microbial farming to increase plant productivity: reducing nutrient inputs to increase plant-microbe interactions and managing soil microbial diversity, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Adriana Parada Dias da Silveira - Integrante / Jos Raaijmakers - Integrante / Bas Dutilh - Integrante / Harro Bouwmeester - Integrante.

  • 2017 - Atual

    Environmental effects of the pasture-sugarcane conversion and pasture intensification, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Integrante / Janaina Braga do Carmo - Integrante / Luiz Antonio Martinelli - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2017 - Atual

    Biochar to improve the quality of soils contaminated with heavy metals, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Adriana Parada Dias da Silveira - Integrante / Cleide Aparecida Abreu - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2017 - Atual

    Phosphorus use efficiency in Eucalyptus and the physiological and genetic mechanisms involved, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (3) / Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (3) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Paulo Mazzafera - Integrante / Sara Adrián L. Andrade - Integrante / Camila Caldana - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2016 - Atual

    RSM Systems Biology for Sorghum: engineering soil and plant microbiomes for enhanced crop productivity in Africa, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Integrante / Jos Raaijmakers - Coordenador / DE BOER, WIETSE - Integrante / Harro Bouwmeester - Integrante / Pedro Crous - Integrante / Siobhan Brady - Integrante.

  • 2015 - Atual

    Unravelling the mechanisms underlying health and productivity promoting agricultural practices by fine-mapping rhizosphere communities, Descrição: Plants select, foster and attract parts of the soil living community. Plants select soil micro-biota involved in nutrient uptake, and organismal groups that mediate both specific and general disease suppressiveness. This selection of rhizosphere communities is plant-species specific (Turner et al. 2013, Mendes, Kuramae et al. 2014). The fostering of a subset of the soil living community is observed in strongly increased densities of specific organismal groups. This not only holds for bacteria, archaea and fungi, but also for protozoa, bacteri and fungivorous nematodes. In addition, plant roots attract pathogens such as bacteria, oomycetes, fungi and nematodes. The notion of crop-specific rhizosphere microbiomes evokes the question whether easily transferable, common soil management measures that are reported to be beneficial for sustainable crop production such as reduced tillage and the addition of multiple levels and kinds of organic matter and/or composts, can be understood and fully exploited in future-proof arable crop production. This proposal includes a detailed characterisation of the rhizosphere community at taxonomical and functional levels under field conditions for two dicots and three monocots: potato and pea (legume), and leek, barley and maize. We will focus on the quantitatively most relevant functional groups in the 1st and 2nd trophic layer of the soil food web: bacteria, fungi, protozoa, and bacteri-, fungivorous and plant parasitic nematodes. With these biological insights, we will monitor and try to understand mechanistically the effects of easily transferable soil management practices. These insights will allow us to formulate solid crop-specific advice for the optimal and durable management and exploitation of soil life.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / SULEIMAN, AFNAN K. A. - Integrante / Johannes Helder - Integrante / Paula Harkes - Integrante.

  • 2015 - Atual

    Deciphering the gene machinery involved in the synthesis of Acidobacterial biopolymers and their biochemical characterization, Descrição: Acidobacteria is an abundant and ubiquitous bacterial phyla in soil, that shows no or mild growth in laboratory conditions. Based on genome sequences we estimated that Acidobacteria contains more genes related to carbohydrate metabolism than most (95%) of other bacterial genomes, and therefore Acidobacteria may play an active role in carbon cycling. Under certain stimulus Acidobacteria produces high amount of extracellular polymeric substances (EPS) and polyhydroxyalkanoates (PHA) with potential biotechnological and bioremediation applications. We are currently analyzing the genome/transcriptome/proteome of three Acidobacterial isolates and characterizing their byproducts by chemical and physical analyses.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / KIELAK, ANNA M. - Integrante / Marcelo M. Zerillo - Integrante / Ohana Y. A. Costa - Integrante.

  • 2015 - Atual

    Diversidade microbiana de solos de áreas preservadas de diferentes Biomas no Maranhão, Descrição: Aprovado no Edital n° 40 / 2014 FAPEMA - Apoio a Projetos de Pesquisa ? UNIVERSAL. Faixa A. Processo 00378/15. Os estudos atuais de indicadores de qualidade ambiental tornaram-se necessários para promover os serviços ecossistêmicos e a aplicabilidade de métodos de avaliação de áreas preservadas. Os bioindicadores microbianos são considerados um dos mais importantes, pois estão diretamente envolvidos no ciclo da matéria. Portanto, objetiva-se avaliar a diversidade microbiana de 80 amostras de solos, obtidas de 40 áreas preservadas de diferentes biomas, utilizando sequenciamento de última geração, MiSeq, 16SrRNA (bactérias/arqueias) e ITS (fungos). Parte destas amostras já foram coletadas, e grande parte analisadas, na UFMA. Nas análises multivariadas, serão utilizados os resultados físico-químicos e a possível presença de contaminantes, de forma a se caracterizar a abundância, a diversidade e composição funcional da microbiota. Algumas áreas selecionadas (aprox. 33%) serão revisitadas, com a finalidade de acréscimo de dados importantes para os aspectos ecológicos, ex. vegetação adjacente, densidade e a camada de serapilheira. Tudo isto criará uma oportunidade única de conhecer a diversidade microbiana de solos diferentes biomas, com excepcional abrangência biológica e geográfica, e as múltiplas interações entre os microrganismos e as condições físico-químicas do solo, e com os fatores edafo-climáticos locais... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Christoph Gehring - Integrante / Flávio Henrique Reis Moraes - Integrante / Márcio Fernandes Alves Leite - Integrante.

  • 2015 - Atual

    Identificação de microrganismos endofíticos (fungos e bactérias) de raízes da palmeira babaçu (Attalea speciosa Mart.), Descrição: Projeto de pesquisa integrado aos macroprojetos do PPG em agroecologia da UEMA: Microbiota associada à palmeira babaçu (Attalea speciosa Mart.) e seus impactos na qualidade físico-química e nas comunidades microbiológicas dos solos arredores, financiado por intermédio do Universal da FAPEMA (APP-Universal-00727/13) e do projeto ?Impacts of land use and of the babassu palm on microbial community structure and function and on soil quality in Maranhão State, eastern periphery of Amazonia?, do programa PVE (Pesquisador Visitante Especial) da CAPES Edital N 71/2013 (A080/2013). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (2) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Integrante / Christoph Gehring - Coordenador / Flávio Henrique Reis Moraes - Integrante / Márcio Fernandes Alves Leite - Integrante.

  • 2014 - Atual

    Unraveling the sources and sinks of nitrous oxide (N2O) in sustainable bio-based agriculture, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Janaina Braga do Carmo - Integrante.

  • 2013 - Atual

    Production of bio-fertilizer organo-mineral bioactive phophate, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Integrante / Henrique Coutinho Junqueira Franco - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    Microbial Networks in control of greenhouse gases emissions in Bio-based agriculture ? MiniBag, Descrição: NWO/FAPESP. Bilateral research programme between the Netherlands and the State of Sao Paulo in Brazil on "Biobased Economy". , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Heitor Cantarella - Integrante / Janaína Braga do Carmo - Integrante / Mattias de Hollander - Integrante / Johannes Van Veen - Integrante / Raffaella Rossetto - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Netherlands Organisation for Scientific Research - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    Impacts of land use and of the Babassu palm on microbial community composition and function and on sol quality in Maranhão State, earsten periphery of Amazonia, Descrição: Special Visiting Researcher-CNPq/CAPES-Sciences Without Borders Program. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Integrante / Fabricio de Oliveira Reis - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    Soil health and quality monitoring for sustainable biomass production in Vietnam (coordinator), Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Johannes A. van Veen - Integrante / Le Mai Huong - Integrante., Financiador(es): Vietnamese Academy for Science and Technology-VAST - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    Harnessing the rhizosphere microbiome to enhance plant productivity, Descrição: Bilateral research programme between the Netherlands (NWO) and Brazil (CNPq) on "Biobased Economy". , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Janaina Braga do Carmo - Integrante / Heitor Cantarella - Integrante / DE HOLLANDER, M. - Integrante / VAN VEEN, JOHANNES - Integrante / Adriana Parada Dias da Silveira - Integrante / Raffaella Rossetto - Integrante / Jos Raaijmakers - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Netherlands Organisation for Scientific Research - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    Greenhouse gas emissions (N2O, CO2 and CH4) from soil with sugarcane production and impact on microbial community structure and function (Coordinator), Descrição: Sugarcane crops in Brazil grow with less nitrogen fertilizers than other biofuel crops, resulting into lower levels of nitrous oxide, a potent greenhouse gas. However, there is lack of real measurements of GHG emissions associated with the production ethanol. In addition, there is a lack of knowledge of the main players of fundamental biogeochemical processes, the soil biota, which can control fluxes of GHG.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Janaina Braga do Carmo - Integrante / Marcelo M. Zerillo - Integrante / Johnny R. Soares - Integrante / Leonardo M. Pitombo - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    Functional bio-indicatiors for soil quality monitoring for sustainable management of sugarcane biomass production (BIOSQ) (Coordinator), Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Johannes A. van Veen - Integrante / Siu Mui Tsai - Integrante / Heitor Cantarella - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2011 - Atual

    Next Generation Array Systems for sensing soil Health Status (coordinator), Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Johannes A. van Veen - Integrante / George A. Kowalchuk - Integrante., Financiador(es): NWO/Be-Basic - Auxílio financeiro.

  • 2011 - Atual

    Metagenomic tools for intelligent gene mining (coordinator), Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Johannes A. van Veen - Integrante / George A. Kowalchuk - Integrante., Financiador(es): NWO/Be-Basic - Auxílio financeiro.

  • 2010 - 2012

    Examining bacterial and fungal plant organic matter decomposition via integrated pyrosequencing-based approaches ERGO, Descrição: Both fungi and bacteria can be important in organic matter degradation in soils. This project seeks to utilize emerging pyrosequencing and stable isotope probing (SIP) technologies to allow for an in-depth and simultaneous examination of fungal and bacterial species and genes involved in organic matter degradation.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / George A. Kowalchuk - Integrante / Heike Schmitt - Integrante., Financiador(es): Netherlands Organisation for Scientific Research - Auxílio financeiro.

  • 2010 - Atual

    Development of a High-Throughput soil health array system, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Johannes A. van Veen - Integrante / George A. Kowalchuk - Integrante / Yao Pan - Integrante., Financiador(es): Netherlands Organisation for Scientific Research - Auxílio financeiro.

  • 2009 - Atual

    Monitoring the microbial diversity and functional activities in response to land-use changes and deforestation under soybean and sugarcane cultivations, Descrição: This study aims to determine the abundance of Acidobacteria and investigate the size, structure and composition of communities of Verrucomicrobia in different niches of the soil in southeast Brazilian Amazon converted to crop production.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Coordenador / Johannes A. van Veen - Integrante / Siu Mui Tsai - Integrante / Acacio A Navarrte - Integrante / Lucas W. Mendes - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

  • 2007 - 2011

    Genomic analysis of microbial community structure & Functional analysis of nutrient cycling, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eiko Eurya Kuramae - Integrante / Johannes A. van Veen - Coordenador / George A. Kowalchuk - Integrante., Financiador(es): Netherlands Organisation for Scientific Research - Auxílio financeiro.

Prêmios

2018

International Visiting Professor at The Northeast Institute of Geography and Agroecology (IGA), Changchun, China., Chinese Academy of Sciences (CAS).

2016

Prêmio Tese Destaque USP 2016 GRANDE ÁREA ? CIÊNCIAS AGRÁRIAS -Co-promoter, Energia Nuclear na Agricultura (CENA).

2016

Prize CAPES (Coordination for the Improvement of Higher Education Personnel) Honor Award 2015 PhD thesis - Co-Promoter, CAPES.

2014

Special Visiting Professor - PVE - Ciencias sem Fronteiras, Universidade Catolica de Brasilia.

2014

Prize CAPES Best PhD thesis in agro sciences defended in 2013-Co-Promoter, CAPES.

2013

Special Visiting Professor - PVE - Ciencias sem Fronteiras, Universidade Universidade Estadual do Maranhao.

2005

Premio Summa Phytopathologica. Best published article, Summa Phytopathologica.

2000

Honra ao Mérito de Ciência e Tecnologia - Genoma Xylella fastidiosa, Governo do Estado de São Paulo.

2000

Honra ao Mérito - Genoma Xylella fastidiosa, Universidade Estadual Paulista "Júlio Mesquita Filho" - UNESP.

1996

Prêmio Jovem Geneticista 1996, Sociedade Brasileira de Genética/SBG.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW), Department of Microbial Ecology. , Droevendaalsesteeg 10, Wageningen, 6700 - Wageningen, - Holanda - Caixa-postal: 50, Telefone: (031) 77473400, Ramal: 3502, URL da Homepage:

Experiência profissional

2017 - Atual

Centro de Energia Nuclear na Agricultura CENA/USP

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2017 - Atual

Instituto Agrnômico de Campinas

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2017 - Atual

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2015 - Atual

Universidade Ceuma

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2015 - Atual

Universidade Estadual do Maranhão

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2012 - Atual

Netherlands Institute of Ecology

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Senior Scientist, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Soil-borne microbes perform essential services to the sustainable function of all ecosystems, such as the cycling of nutrients and primary production. In order to understand these systems and to solve the major problems that are associated with human impact on their functioning, comprehensive knowledge of the microbiology of these systems is required. My primary focus is on understanding the patterns and mechanisms of interactions among microbes and their environment, how these interactions shape the structure and affect the functioning of microbial communities and, consequently, of ecosystems. My major topics are: Microbial diversity loss - Loss of soil-borne microbial diversity vs. plant production (plant biomass quality and secondary metabolites); Climate Change - The aims are to decipher the processes underlying the enormous microbial diversity and to elucidate its functional relevance and to improve our knowledge on the microbial production and removal of greenhouse gases N2O, CO2 , CH4; Land use changes- based on our knowledge of the behavior of bacterial and fungal communities under different soil conditions, we develop (1) microbial bio-indicators to predict the consequences of changes in land use due to abandoning of agricultural land, deforestation or changes in arable cropping regimes, (2) bio-indicators genes in key functions (nitrification, nitrogen fixation, denitrification), recalcitrant organic matter decomposition most indicative of specific soil status, in particular in soils with crops for biofuel; Development of sustainable biomass production systems. Sustainable biomass production for the bio-based economy requires fundamental knowledge on the impact of these systems on the microbial communities of the soils under production; Bioinformatics - develop tools to integrate genomics, post-genomics and environmental/soil physicochemical data into soil microbial ecology.

Atividades

  • 01/2012

    Pesquisa e desenvolvimento, Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW).,Linhas de pesquisa

  • 10/2011 - 10/2011

    Ensino, Master Class Soil Microbial Ecology, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bio-informatics in microbial ecology (T/P), Microbial phygenetics (T), Moleculra Microbial Ecology

2009 - 2012

Free University Amsterdam (VU)

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Research Scientist, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Research, Supervise PhD, MSc and undergraduate students, Teach Microbial Ecology

Atividades

  • 01/2009 - 12/2011

    Pesquisa e desenvolvimento, Free University Amsterdam (VU).,Linhas de pesquisa

  • 05/2010 - 05/2010

    Ensino, Soil Microbial Ecology, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Micro-arrays; Normal Operating Range

  • 10/2008 - 10/2008

    Ensino, Soil Microbial Ecology, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Ecogenomics Microarrays, Microbial ecogenomics II: Microarrays, Microbial phylogenetics (T/P)

2007 - 2008

Netherlands Institute of Ecology (NIOO/KNAW)

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Research Scientist, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Supervise PhD and MSc students, Research, Teach Microbial Ecology

2002 - 2007

Centraalbureau voor Schimmelcultures

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Research Scientist, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Research, Supervise PhD, MSc and undergraduate students

2020 - Atual

Utrecht University

Vínculo: Civil servant, Enquadramento Funcional: Full Professor

Outras informações:
Chair in Microbial Community Ecology & Environmental Genomics