Fábio Trigo Raya

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• DA SILVA, JEAN CONSTANTINO GOMES ; ARIAS, SANTIAGO ; PACHECO, JOSÉ GERALDO A. ; Raya, Fábio Trigo ; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães ; MOCKAITIS, GUSTAVO . Exploring the pyrolysis of Agave species as a novel bioenergy source: Thermo-kinetics, modeling, and product composition insights. JOURNAL OF ANALYTICAL AND APPLIED PYROLYSIS , v. 188, p. 107053, 2025.

• SARTORI, HEITOR LOPES ; DA SILVA, SÁVIO JUSTINO ; DA CRUZ, LARISSA PRADO ; LAIRA, MATHEUS DALLÓ ; Raya, Fábio Trigo ; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães ; RIBEIRO, RAFAEL VASCONCELOS . Blue light increases stomatal conductance and photosynthesis in an Agave hybrid. Theoretical and Experimental Plant Physiology , v. 37, p. 31-8, 2025.

• BARBOSA, LEONARDO O. ; CONCEIÇÃO, TAINÁ D. S. DA ; NEVES, ADRIANA DE O. ; ROCHA, WÉLICA Z. B. ; DAMASCENO, BEATRIZ S. ; FONSECA, PAULA L. C. ; RIBEIRO, PAULO R. ; TOME, LUIS M. R. ; BORTOLINI, DENER E. ; MARTINS, FABIANO M. ; Raya, Fábio T. ; GOES-NETO, ARISTÓTELES ; SOARES, ANA C. F. . Native and Non-Native Soil and Endophytic Trichoderma spp. from Semi-Arid Sisal Fields of Brazil Are Potential Biocontrol Agents for Sisal Bole Rot Disease. JOURNAL OF FUNGI , v. 10, p. 860, 2024.

• CARVALHO, LUCAS M. ; SILVA, NICHOLAS VINÍCIUS ; DE ABREU, LUÍS GUILHERME F. ; MARONE, MARINA PÜPKE ; CARDELLI, ALEXANDRA RUSSOLO ; Raya, Fabio Trigo ; ARAÚJO, GUIDO ; Carazzolle, Marcelo Falsarella ; GUIMARÃES PEREIRA, GONÇALO AMARANTE . Analysis of protein-protein interaction and weighted co-expression networks revealed key modules and genes in multiple organs of Agave sisalana. Frontiers in Chemical Engineering , v. 5, p. 1-15, 2023.

• Raya, Fabio Trigo ; DE CARVALHO, LUCAS MIGUEL ; JOSÉ, JULIANA ; DA CRUZ, LARISSA PRADO ; ALMEIDA, RAFAEL LEONARDO ; DELEVATTI, HELIUR ALVES DE ALMEIDA ; SILVEIRA, NEIDIQUELE MARIA ; DA SILVA, SIMONE FERREIRA ; PISSOLATO, MARIA DOLORES ; DE OLIVEIRA, ADRIELE BÁRBARA ; DOS REIS, WAGNER JOSÉ VILLELA ; DE ABREU, LUÍS GUILHERME FURLAN ; GUTIÉRREZ, JESÚS ; Carazzolle, Marcelo Falsarella ; Soares, Ana Cristina Fermino ; NIETO SOTELO, JORGE ; RIBEIRO, RAFAEL VASCONCELOS ; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães . Rescuing the Brazilian Agave breeding program: morphophysiological and molecular characterization of a new germplasm. Frontiers in Chemical Engineering , v. 5, p. 1-17, 2023.

• Raya, Fábio Trigo ; QUINTANILHA-PEIXOTO, GABRIEL ; DE OLIVEIRA, ADRIELE BARBARA ; MARONE, MARINA PÜPKE ; DOS REIS, WAGNER JOSÉ VILLELA ; MARQUES, JOÃO GABRIEL OLIVEIRA ; ALMEIDA, RAFAEL LEONARDO ; FALCÃO FILHO, CEZAR AUGUSTO TEIXEIRA ; COSTA, OLDAIR DEL?ARCO VINHAS ; RIBEIRO, RAFAEL VASCONCELOS ; Soares, Ana Cristina Fermino ; GOÉS-NETO, ARISTÓTELES ; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães . Molecular epidemiology of sisal bole rot disease suggests a potential phytosanitary crisis in Brazilian production areas. Frontiers in Chemical Engineering , v. 5, p. 1-14, 2023.

• MARONE, MARINA PÜPKE ; CAMPANARI, MARIA FERNANDA ZANELI ; Raya, Fabio Trigo ; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães ; Carazzolle, Marcelo Falsarella . Fungal communities represent the majority of root-specific transcripts in the transcriptomes of Agave plants grown in semiarid regions. PeerJ , v. 10, p. e13252, 2022.

• QUINTANILHA-PEIXOTO, GABRIEL ; MARONE, MARINA PÜPKE ; Raya, Fábio Trigo ; JOSÉ, JULIANA ; OLIVEIRA, ADRIELE ; FONSECA, PAULA LUIZE CAMARGOS ; TOMÉ, LUIZ MARCELO RIBEIRO ; BORTOLINI, DENER EDUARDO ; KATO, RODRIGO BENTES ; ARAÚJO, DANIEL S. ; DE-PAULA, RUTH B. ; CUESTA-ASTROZ, YESID ; DUARTE, ELIZABETH A.A. ; BADOTTI, FERNANDA ; DE CARVALHO AZEVEDO, VASCO ARISTON ; BRENIG, BERTRAM ; Soares, Ana Cristina Fermino ; Carazzolle, Marcelo Falsarella ; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães ; AGUIAR, ERIC ROBERTO GUIMARÃES ROCHA ; et.al . Phylogenomics and gene selection in Aspergillus welwitschiae: Possible implications in the pathogenicity in Agave sisalana. GENOMICS , v. 114, p. 110517, 2022.

• Raya, Fabio Trigo ; Marone, Marina Pupke ; CARVALHO, LUCAS MIGUEL ; RABELO, SARITA CANDIDA ; DE PAULA, MAIKI SOARES ; CAMPANARI, MARIA FERNANDA ZANELI ; FRESCHI, LUCIANO ; MAYER, JULIANA LISCHKA SAMPAIO ; SILVA, ODILON RENY RIBEIRO FERREIRA ; MIECZKOWSKI, PIOTR ; Carazzolle, Marcelo Falsarella ; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães . Extreme physiology: Biomass and transcriptional profiling of three abandoned Agave cultivars. INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS , v. 172, p. 114043, 2021.

• QUINTANILHA-PEIXOTO, GABRIEL ; FONSECA, PAULA LUIZE CAMARGOS ; Raya, Fábio Trigo ; Marone, Marina Pupke ; BORTOLINI, DENER EDUARDO ; MIECZKOWSKI, PIOTR ; OLMO, ROENICK PROVETI ; Carazzolle, Marcelo Falsarella ; VOIGT, CHRISTIAN A. ; Soares, Ana Cristina Fermino ; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES ; AGUIAR, ERIC ROBERTO GUIMARÃES ROCHA . The Sisal Virome: Uncovering the Viral Diversity of Agave Varieties Reveals New and Organ-Specific Viruses. Microorganisms , v. 9, p. 1704, 2021.

• RAYA, F. T. ; FURLAN, L. G. ; MARONE, M. P. ; SALVADOR, M. A. ; BRESSIANI, J. A. ; LABORDE, J. I. R. ; PEREIRA, G. A. G. . New Feedstocks for Bioethanol Production: Energy Cane and Agave. In: Soccol, C.R.; Amarante Guimarães Pereira, G.; Dussap, CG.; Porto de Souza Vandenberghe, L.. (Org.). Liquid Biofuels: Bioethanol. Biofuel and Biorefinery Technologies. 1ed.Cham.: Springer, 2022, v. 12, p. 431-455.

• Marone, Marina Pupke ; Raya, Fábio Trigo ; Magalhães, Ênio da Cunha Dias ; Soares, Ana Cristina Fermino ; Carazzolle, Marcelo Falsarella ; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães . SISAL: DE UM PASSADO RÚSTICO PARA UM FUTURO BRILHANTE. O semiárido Brasileiro e suas Especificidades 2. 1ed.: Atena Editora, 2020, v. , p. 40-57.

• RAYA, F. T. . Agave: o Brasil na vanguarda da revolução energética. Revista Opiniões, p. 32 - 35, 01 ago. 2024.

• QUINTANILHA-PEIXOTO, GABRIEL ; MARONE, MARINA PÜPKE ; TORRES, R. O. ; Fábio Trigo Raya ; FONSECA, P. L. C. ; JOSÉ, JULIANA ; AGUIAR, ERIC ROBERTO GUIMARÃES ROCHA ; GOES-NETO, A. . Aspectos genômicos de Aspergillus welwitschiae (Ascomycota, Trichocomaceae), principal patógeno do sisal (Agave spp.). In: X CONGRESSO BRASILEIRO DE MICOLOGIA, 2024, Belo Horizonte. ANAIS DO X CONGRESSO BRASILEIRO DE MICOLOGIA, 2024.

• SOUZA, J. R. ; Fábio Trigo Raya ; ORIANI, A. . Desenvolvimento da parede da antera e dos grãos de pólen em Agave (Asparagaceae). In: Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP, 2024, Piracicaba. Anais do 32º Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP, 2024.

• VENSKE, A. L. ; CARAZZOLLE, M. F. ; SILVA, J. J. B. ; Raya, Fabio Trigo ; PEREIRA, G. A. G. . COMPARATIVE TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS OF RNA-SEQ EXPLORING EVOLUTIONARY CO-EXPRESSION NETWORKS IN AGAVE SISALANA. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, A. B. ; Fábio Trigo Raya . BREEDING AGAVE FOR BIOENERGY: IDENTIFICATION OF GENETIC AND MORPHOPHYSIOLOGICAL MARKERS FOR EARLY SELECTION OF NEW CULTIVARS. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• LINHARES, J. G. H. P. ; Raya, Fábio Trigo . BREAKING THE PRODUCTIVITY - RESILIENCE PARADIGM: GENOME MINING OF EXCEPTIONAL AGAVE SPECIES FOR CLIMATE RESILIENCE. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SAIA, T. F. F. ; Fábio Trigo Raya ; SILVA, P. K. ; CABRAL, C. G. ; THEODORO, E. B. ; SILVA, NICHOLAS VINÍCIUS ; SOARES, A. C. F. ; PEREIRA, G. A. G. . A NEW IN VITRO ASSAY FOR EVALUATING ASPERGILLUS WELWITSCHIAE PATHOGENICITY IN AGAVE. 2025. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Fábio Trigo Raya . Agave, a nova biomassa para a Era das mudanças climáticas. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Fábio Trigo Raya . Agave the new biomass for the climate change era. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Fábio Trigo Raya . Agave?s Potential as an Agricultural Alternative. 2024. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CELIO, J. A. ; MARONE, MARINA PÜPKE ; Fábio Trigo Raya ; CARAZZOLLE, M. F. ; PEREIRA, G. A. G. . Caracterização morfológica e molecular de um novo banco de germoplasma de Agave na Unicamp. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DOS REIS, WAGNER JOSÉ VILLELA ; Fábio Trigo Raya ; RIBEIRO, RAFAEL VASCONCELOS ; PEREIRA, G. A. G. . First field trial of Agave for biofuels in the Brazilian semiarid.. 2024. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Fábio Trigo Raya . Tudo é uma questão de tempo: Passado, presente e futuro do Agave. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Fábio Trigo Raya ; CARVALHO, L. M. ; JOSÉ, JULIANA ; ALMEIDA, RAFAEL LEONARDO ; DELEVATTI, HELIUR ALVES DE ALMEIDA ; SILVEIRA, N. M. ; DA SILVA, SIMONE FERREIRA ; PISSOLATO, MARIA DOLORES ; OLIVEIRA, A. B. ; CARAZZOLLE, M. F. ; RIBEIRO, RAFAEL VASCONCELOS ; PEREIRA, G. A. G. . RESCUING THE BRAZILIAN AGAVE BREEDING PROGRAM: PHYSIOLOGICAL AND MOLECULAR CHARACTERIZATION OF A NEW GERMPLASM. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Fábio Trigo Raya . Da sala de aula ao Mercado: a experiencia da ECRA Biotec. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, A. B. ; Fábio Trigo Raya ; MARONE, M. P. ; PEREIRA, G. A. G. . Eco-epidemiologia molecular da podridão vermelha do sisal no Estado da Bahia: análise de dispersão. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Fábio Trigo Raya . Novo Sertão: como a biotecnologia pode alavancar o semiárido brasileiro. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Fábio Trigo Raya ; CARVALHO, L. M. ; MIECZKOWSKI, P. ; CARAZZOLLE, M. F. ; PEREIRA, G. A. G. . Drought drives temporal energy partitioning towards stress response and photosystem preparation in Agave sisalana. 2021. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MARONE, M. P. ; CAMPANARI, MARIA FERNANDA ZANELI ; Fábio Trigo Raya ; PEREIRA, G. A. G. ; Carazzolle, Marcelo Falsarella . Agave multiomics: assessing the genetics of high productivity biomass plants that thrive in semiarid regions. 2021. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Fábio Trigo Raya . Novo Sertão: como a biotecnologia pode alavancar o semiárido brasileiro. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Fábio Trigo Raya ; CARVALHO, L. M. ; FRESCHI, LUCIANO ; MIECZKOWSKI, P. ; PEREIRA, G. A. G. . Drought drives temporal energy partitioning towards stress response and photosystem preparation in Agave sisalana. 2020. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• Fábio Trigo Raya ; CARVALHO, L. M. ; FRESCHI, LUCIANO ; MIECZKOWSKI, P. ; PEREIRA, G. A. G. . Molecular temporal profile of Agave sisalana and its modulation under drought stress. 2020. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAYA, F. T. . Da sala de aula ao mercado: a Experiência da Ecra Biotec. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAYA, F. T. . Unearthing Agave secrets: Lessons and opportunities for climate change and biorenewables production in the semiarid. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• MARONE, M. P. ; RAYA, F. T. ; CARVALHO, L. M. ; PAULA, M. S. ; SILVA, O. R. R. F. ; MIECZKOWSKI, P. ; PEREIRA, G. A. G. ; CARAZZOLLE, M. F. . Transcriptomic atlas of three Agave genotypes: a potential crop for bioenergy production. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAYA, F. T. ; PEREIRA, G. A. G. . Sisal: a biomassa do semi-arido. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• OLIVEIRA, D. ; MISTURA, T. F. ; PRETO, I. D. ; RAYA, F. T. ; ALMEIDA, J. M. B. ; URASHIMA, A. S. . SELEÇÃO DE PRIMERS PARA DETECÇÃO DE Leifsonia xyli subsp. xyli, CAUSADOR DO RAQUITISMO-DAS-SOQUEIRAS DA CANA-DE-AÇÚCAR. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAYA, F. T. ; MARCON, J. ; AZEVEDO, J. L. . ISOLAMENTO E TRANFERÊNCIA RECÍPROCA DE FUNGOS ENDOFÍTICOS DE Saccharum sp. E Glycine Max. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• RAYA, F. T. ; FAVARO, L. C. L. ; MARCON, J. ; AZEVEDO, J. L. . Transformação genética do fungo endofítico Acremonium sp. por Agrobacterium tumefaciens.. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• INOCENCIO, G. M. ; RAYA, F. T. ; MARCON, J. ; PIZZIRANI-KLEINER, A.A. . Isolamento e Caracterização de bactérias quitinolíticas do mangue do Estado de São Paulo. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2024 - Atual

  Anatomia e desenvolvimento floral em monocotiledôneas, Descrição: Neste projeto serão realizados estudos de anatomia e desenvolvimento floral em espécies-chave de Allium (Amaryllidaceae) e de Eriocaulaceae; bem como estudos de embriologia (esporogênese e gametogênese) em Agave (Asparagaceae), visando visando contribuir para melhor compreensão de aspectos reprodutivos, ecológicos e evolutivos desses grupos (Auxílio PRPI-USP Processo 22109345012).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Coordenador / Aline Oriani - Integrante / Jéssica dos Reis de Souza - Integrante / Giovana Martorini Rodrigues - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2024 - Atual

  Contribuições à embriologia de Agave (Asparagaceae), Descrição: O gênero Agave pertence à família Asparagaceae e compreende cerca de 290 espécies, majoritariamente nativas de regiões áridas e semiáridas. Muitas espécies são cultivadas como ornamentais ou como fonte de matérias-primas diversas, apresentando alta capacidade de propagação vegetativa pela formação de bulbilhos. Os poucos estudos embriológicos com espécies do gênero mostram variação interespecífica com relação a alguns caracteres, como o tipo de desenvolvimento do saco embrionário, e apontam a má formação do saco embrionário como uma das causas da baixa formação de sementes. Neste projeto, será estudado o desenvolvimento da antera e do óvulo de espécies de Agave, buscando ampliar o conhecimento sobre o ciclo reprodutivo no gênero e identificar se há erros na esporogênese que expliquem a baixa fertilidade e o alto investimento na formação de bulbilhos. Para tanto, serão realizadas secções anatômicas seriadas em flores em distintas fases de desenvolvimento. As secções serão realizadas em micrótomo rotativo, a partir de material incluído em historresina, e posteriormente serão coradas e montadas em lâminas com Entellan. Os resultados serão analisados sob microscopia de luz e documentados com fotomicrografias obtidas com capturador de imagens acoplado ao microscópio. Os dados a serem obtidos serão fundamentais para embasar estudos de biologia reprodutiva, propagação via sementes e melhoramento genético, dada a importância econômica que as espécies a serem estudadas apresentam.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Coordenador / Aline Oriani - Integrante / Jéssica dos Reis de Souza - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2024 - Atual

  Desenvolvimento do agave pulquero para promoção da segurança alimentar no semiárido brasileiro, Descrição: O aguamiel é a seiva do Agave, enquanto o pulque é a bebida resultante da fermentação do aguamiel. Essas bebidas, possuem características nutricionais, compostos bioativos e propriedades medicinais. Atualmente, o potencial dos agaves é explorado mais intensamente, devido às suas características fisiológicas, morfológicas e moleculares, que os tornam cultiváveis nas regiões semiáridas. Com o aumento de 7,6 na Insegurança Alimentar entre 2020 e 2021/2022, somado ao potencial impacto das mudanças climáticas, torna-se essencial buscar iniciativas que contribuam para a segurança alimentar. Os agaves surgem como peças fundamentais nesse contexto, utilizando-os para a obtenção de aguamiel e pulque, bebidas pouco conhecidas no Brasil, mas que há anos são fontes de nutrientes e saúde nas civilizações mesoamericanas. Nesse cenário, é crucial produzir e divulgar conhecimento científico adaptado ao contexto brasileiro, superando a barreira do idioma predominante (inglês ou espanhol). Portanto, o desenvolvimento de materiais em português sobre a obtenção e produção dessas bebidas, acessíveis à população, torna-se fundamental para promover a segurança alimentar no semiárido brasileiro. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Integrante / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Ana Paola Lopez Tarqui - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2023 - Atual

  Trichoderma spp. no controle da podridão vermelha do sisal: eficiência e mecanismos de ação, Descrição: Avaliar os mecanismos de biocontrole, de respostas de defesa de plantas de sisalinduzidas por Trichoderma spp., a sobrevivência do Trichoderma no solo e o biocontroleda podridão vermelha no sisal.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Integrante / Ana Cristina Fermino Soares - Coordenador / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante / Aristóteles Góes-Neto - Integrante / MAYER, JULIANA LISCHKA SAMPAIO - Integrante / CONCEIÇÃO, TAINÁ D. S. DA - Integrante / NEVES, ADRIANA DE O. - Integrante / Denilson dos Santos Santana - Integrante / Claudia Regina Araújo - Integrante / SIBELE DE OLIVEIRA TOZETTO - Integrante / Marcos Vinicius Silva de Andrade - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1

• 2022 - Atual

  BRAVE - Programa Brasileiro para o Desenvolvimento do Agave (Brazilian Development Agave): Biologia das Plantas, Conversões Tecnológicas e Interação Sócio-Ambiental, Descrição: O objetivo desse projeto é desenvolver uma nova cadeia agroindustrial baseada em espécies de Agave, que são plantas capazes de viver e atingir altas produtividades em regiões de semiárido como o Sertão Brasileiro. De forma simplificada, seria a conversão do Agave no equivalente a uma Cana do Sertão, com o desenvolvimento de uma cadeia de valor correspondente e ampliada. Assim, o foco será gerar as bases científicas e técnicas para o uso dessas plantas como fonte de biomassa de alta produtividade e baixo custo, tanto para novas biorrefinarias como para a ampliação da oferta de matéria prima para usinas de cana já existentes, com captura líquida de carbono e desenvolvimento socioambiental. Para conseguir isso, o projeto será articulado em 10 linhas de pesquisa, que interagirão fortemente entre si. São elas: (1) Recursos genéticos e caracterização da biomassa; (2) Fisiologia e fitotecnia; (3) Solos e captura de carbono; (4) Análises multi-ômicas e desenvolvimento de marcadores moleculares; (5) Engenharia genética de Agave; (6) Cultura de tecido e propagação de mudas; (7) Metagenômica, microbiota e indução de crescimento; (8) Fermentação direta; (9) Conversões da biomassa e (10) Análise do ciclo de vida e integração com o meio ambiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (3) . , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Integrante / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / RABELO, SARITA CANDIDA - Integrante / RIBEIRO, RAFAEL VASCONCELOS - Integrante / Gustavo Mockaitis - Integrante / Joaquim Eugênio Abel Seabra - Integrante / Carine Tondo Alves - Integrante / Maurício Roberto Cherubin - Integrante / Tiago Osório Ferreira - Integrante / Carlos Eduardo Pellegrino Cerri - Integrante., Financiador(es): Fundação de Desenvolvimento da UNICAMP - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 8 / Número de orientações: 6

• 2020 - 2023

  Estruturação de uma nova cadeia produtiva de biogás baseada em Agave, Descrição: A Bahia é o maior produtor de fibra de sisal do mundo, uma fibra extraída da espécie Agave sisalana. A produção da Bahia é de cerca de 20.400 toneladas, que corresponde a 58 da produção mundial. Entretanto, de uma planta de Agave, a fibra representa apenas 4 do peso da folha, restando o bagaço úmido, um material riquíssimo em matéria orgânica e diversas moléculas com potencial para a química fina, que é abandonado no campo, o que acaba por se constituir em um problema por ser foco de pragas e doenças, inclusive para o ser humano. A cana de açúcar experimentou situação parecida na década de 70, quando o Brasil iniciou o Pró-álcool. Nesse setor a solução encontrada foi a conversão desse material em energia elétrica a partir da queima em caldeiras. Hoje em dia é produzido cerca de 27,1 TWh anualmente desse material, sendo a segunda maior fonte de energia elétrica renovável no país. No caso do Sisal, entretanto, a situação é diferente. Trata-se de agricultura familiar, com nível de organização muito baixo e pouca capacidade de investimento. Assim, uma possibilidade para geração de energia a partir do bagaço do sisal está na geração de biogás. Dito isso, o objetivo do presente projeto é caracterizar do ponto de vista genético, fenotípico e químico diferentes acessos de Agave plantados na região produtora de sisal no semiárido da Bahia, além de plantas importadas com alta produtividade, avaliando o potencial de produção de biogás de alguns acessos, considerando a planta inteira e o bagaço deixado no campo pelo sistema produtivo de fibra de sisal atualmente aplicado na Bahia.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Integrante / Ana Cristina Fermino Soares - Integrante / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Aristóteles Góes-Neto - Integrante / Marina Pulke Marone - Integrante / Marcelo Falsarella Carazzolle - Integrante / RABELO, SARITA CANDIDA - Integrante / CAMPANARI, MARIA FERNANDA ZANELI - Integrante / Gustavo Mockaitis - Integrante / Maria Angelica Pereira de Carvalho Costa - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

• 2020 - 2021

  CONSTRUÇÃO E FENOTIPAGEM DE UM NOVO BANCO DE GERMOPLASMA DE AGAVE PARA A PRODUÇÃO DE BIOCOMBUSTÍVEIS E RENOVÁVEIS NO SEMIÁRIDO, Descrição: Descrição: O Brasil é o maior produtor de fibra de agave do mundo, respondendo por 58 da produção e 70 da exportação global. Em 2019, o Laboratório de Genômica e bioEnergia, em parceria com a UFRB e a EMBRAPA, iniciou a criação de um novo banco de germoplasma para a cultura. A equipe coletou materiais por todo território baiano e concentrou demais as plantas existentes no país, tanto aquelas presentes em instituições como a EMBRAPA e o IAC, como aquelas que foram se diversificando a partir dos plantios comerciais. Contudo, o país não detém as cultivares para a produção de etanol. Neste sentido, propomos adquirir o material estrangeiro desenvolvido para este fim e caracterizar os acessos coletados. O objetivo do projeto é estabelecer um novo banco de germoplasma de Agave voltado para a produção de biocombustíveis e renováveis em Campinas-SP, com réplicas em Monteiro-PB e Valente-BA, e comparar as cultivares importadas com os acessos coletados no Brasil.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Integrante / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Marina Pulke Marone - Integrante / Isabella Aparecida de Araujo Andreotti - Integrante., Financiador(es): Universidade Estadual de Campinas - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

• 2017 - 2022

  Nexus: Integração Caatinga Sisal, Descrição: O projeto propõe desenhos e/ou redesenhos de Sistemas Produtivos Eficientes e Sustentáveis para o sisal integrado à Caatinga, com faixas de diversidade vegetal, com o manejo do banco de sementes nativas e com a introdução de espécies vegetais da Caatinga selecionadas pelo potencial medicinal, melífero e frutífero, com técnicas de conservação de solo e água, acrescentando-se a apicultura aos sistemas produtivos, mediante a instalação de pasto apícola e colônias de abelhas estudadas para esse agroecossistemas. Também se propõe o desenho de um agroecossistema para o sisal com faixas de adubos verdes adaptados ao bioma Caatinga e o estudo de fixação biológica de nitrogênio no sentido de incrementar o aporte de nitrogênio e de biomassa no solo, por meio da inoculação e incorporação ao solo de leguminosas e com o estudo de seleção de estirpes eficientes de bactérias fixadoras de nitrogênio em associação com leguminosas da Caatinga. Ao diversificar o sistema de produção, com o uso da biodiversidade local, espera-se que ocorra a retomada da paisagem local, na qual a Caatinga se faz presente e possui espécies únicas, com potencial tanto para bioativos (plantas com potencial medicinal e perspectiva econômica), como para implantação de pasto apícola para exploração melífera e disseminação das espécies da Caatinga. Adicionalmente serão realizada a coleta de plantas de sisal em diferentes municípios produtores, no sentido de implantar um banco de germoplasma de sisal, para ampliação do banco da Embrapa-Algodão, com maior variabilidade genética,para estudos de genômica e fisiologia da planta. Será feita a genotipagem da população do banco de germoplasma de sisal com marcadores moleculares relevantes para o estudo de genes funcionais e a seleção de plantas mais adaptadas à região, permitindo avanços nos estudos com o sisal no Bioma Caatinga.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Integrante / Ana Cristina Fermino Soares - Coordenador / Franceli da Silva - Integrante / Tarcisio Marcos de Souza Gondim - Integrante / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante / Cintia Armond - Integrante / Júlio César Azevedo Nóbrega - Integrante / Rafaela Simão Abrahão Nóbrega - Integrante / Marcos Roberto da Silva - Integrante / José Fernandes de Melo Filho - Integrante / Carlos Alfredo Lopes de Carvalho - Integrante / Elizabeth Amélia Alves Duarte - Integrante / Thiago Alves Santos - Integrante / José Ricardo Gonçalves Magalhães - Integrante / Ariston de Lima Cardoso - Integrante / Angélica Maria Lucchese - Integrante / Cássio van den Berg - Integrante / Afonso Peche Filho - Integrante / Aristóteles Góes-Neto - Integrante / Dener Eduardo Bortolini - Integrante / Odilon Reny Ribeiro F. da Silva - Integrante / José da Cunha Medeiros - Integrante / Paulo Ivan Fernandes Júnior - Integrante / Caline Gomes Ferraz - Integrante / Fabricio Mendes Miranda - Integrante / Alcione Bernardi - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2017 - 2017

  Análise Transcriptômica de Agave spp., Descrição: Recentemente, as espécies de Agave apareceram como candidatos para a produção de bioenergia por conta de sua alta produtividade em áreas de baixa pluviosidade, tolerância a seca e baixos teores de lignina. Embora a produção comercial de Agave spp. para bioenergia ainda não tenha sido demonstrada, diversas espécies são cultivadas comercialmente tanto para produção de fibras quanto para bebidas alcoólicas. Entre os Agaves cultivados para obtenção de fibras, a espécie mais utilizada é Agave sisalana (Sisal). Atualmente, o Brasil é o principal produtor e exportador mundial da fibra de sisal, respondendo por 58 da produção e 70 da exportação global. A agaveicultura brasileira ocupa uma extensa área de solos pobres em nutrientes na região semiárida do Nordeste, onde, muitas vezes, é a única alternativa de cultivo com resultados econômicos satisfatórios. Este sucesso deve-se principalmente ao Metabolismo ácido crassuláceo (CAM), o mecanismo fotossintético mais eficiente em uso de água. Para explorar o potencial de espécies CAM como matéria-prima para a produção de biocombustíveis, é necessário um entendimento em nível de sistemas que abranja desde os mecanismos de controle metabólico e molecular até o desempenho agronômico de CAM em ecossistemas marginais. A analise compreensiva de transcriptômica, proteômica e metabolômica de espécies CAM de alta performance é um passo importante para maximizar o potencial dessas plantas como insumos para biocombustíveis através de seleção e melhoramento. Portanto, este projeto propõe identificar genes ou rotas diferencialmente expressos relacionados à resistência à seca e formação de biomassa através de análises transcriptômicas de Agave.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Integrante / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador / Piotr Mieczkowski - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2016 - 2018

  Expressão gênica de Agave spp. para bioenergia: explorando o potencial de plantas CAM., Descrição: Diferentes espécies de Agave são cultivadas comercialmente para a produção de fibras ou de bebidas alcoólicas. Entre as Agaves cultivadas para obtenção de fibras, a espécie mais utilizada é a Agave sisalana (Sisal). Atualmente, o Brasil é o principal exportador mundial da fibra do sisal com 70 e também o principal produtor com 58 da produção mundial. O sisal é a principal fonte de extração de fibras duras vegetais do mundo. A agaveicultura brasileira ocupa uma extensa área de solos pobres em nutrientes na região semiárida do Nordeste, regiões onde, muitas vezes, é a única alternativa de cultivo com resultados econômicos satisfatórios. Este sucesso deve-se principalmente ao Metabolismo ácido crassuláceo (CAM), um mecanismo fotossintético mais eficiente em uso de água. Nos últimos anos tem se observado queda na produção desta cultura devido a dois grandes fatores: (i) rendimento baixo do material colhido, apenas 4 da folha é convertida em fibra comercial, e (ii) maior competitividades das fibras sintéticas. Este senário aliado às adaptações ao ambiente destas plantas e as novas tecnologias para produção de etanol, permitem uma oportunidade singular para a produção de energia renovável em áreas marginais. Além disso, projeções sobre o aquecimento global sugerem aumento gradual na severidade e frequência de condições climáticas extremas, como secas e altas temperaturas. Agaves aparecem como um possível modelo pra se criar soluções agronômicas associadas às mudanças climáticas. Neste contexto, o presente projeto propõe obter o transcriptoma de 3 espécies de Agave e seus perfis glicômicos para se entender os mecanismos de regulação de CAM e produção de biomassa.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Integrante / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 3

Projetos de desenvolvimento

• 2020 - 2021

  Ecramaster - Escalonamento de transcriptase reversa nacional, Descrição: Descrição: A enzima transcriptase reversa é usada no ensaio diagnóstico padrão ouro da OMS para COVID-19 por RT-PCR. No começo da pandemia houve escassez do produto resultando em atrasos de entrega e alto custo para os laboratórios. Dessa forma foi validado, otimizado e escalonado o processo de produção da enzima, o que gerou uma aceleração do desenvolvimento industrial da empresa e a colocação do produto no mercado de uma maneira mais ágil. Conjunta SENAI EMBRAPII ABDI incluida na Rede Vírus MCTIC.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Integrante / Robson Tramontina - Integrante / Tiago Rodrigues e Silva - Coordenador / KAMILA DE SOUSA GOMES - Integrante / Elisângela de Souza Miranda Muynarsk - Integrante / Daniel Moreira Neris - Integrante., Financiador(es): Associação Brasileira de Pesquisa e Inovação Industrial - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

• 2020 - 2020

  Desenvolvimento de um kit de PCR com hot-start, 100 nacional para acelerar a pesquisa científica, Descrição: A pesquisa ciêntífica no âmbito dos diagósticos moleculares desenvolvida nos laboratórios do Ministérios da Saúde (Instituto Evandro Chagas, Lacen, Fundação Oswaldo Cruz entre outros), laboratórios privados, bem como em todos os centros de pesquisa e universidades, é intrínsicamente dependente da disponibilidade de enzimas de DNA polimerase. A DNA polimerase, permite a replicação in vitro da molécula de DNA e depende de condições adequadas de atuação. A temperatura é um fator que influencia a atividade desta enzima, sendo que esta consegue polimerisar a elevadas temperaturas, mas também a temperaturas mais baixas (abaixo de 50 C). Esse motivo potenciou o desenvolvimento de DNA polimerases hot start, cujo sítio ativo fica inibido à temperatura ambiente por ação de moléculas adicionais como anticorpos, aptâmeros, nano partículas, entre outros. Quando submetidas à temperatura ótima de PCR, o elemento inibitório é removido e a sua atuação procede naturalmente. Quando esta enzima é importada o seu preço é altamente inflacionado e os tempos de entrega demorados, o que limita consequentemente, o desenvolvimento de novos produtos e o avanço da pesquisa. Isto é extremamente grave no contexto brasileiro quando nos referimos ao desenvolvimento de kits para detecção precoce de doenças como zika ou dengue. O projeto apresentado pela empresa ECRA BIOTEC SERVIÇOS E PESQUISAS LTDA (de agora em diante designada ECRABIOTEC), se propõe a desenvolver um kit de DNA polimerase high fidelity com hot start, fundamental para realização de ensaios de detecção das doenças anteriormente mencionadas ou em pesquisa científica nas mais variadas áreas. O produto é 100 nacional, o que irá ter uma influência positiva no preço final, bem como na diminuição do tempo de entrega podendo assim acelerar a pesquisa nacional. O projeto aqui exposto apresenta alguns resultados preliminares obtidos pelos esforços conjuntos dos colaboradores participantes neste projeto. A equipe associada desenvolveu até ao momento da submissão ao PIPE fase 1, uma enzima DNA polimerase high fidelity, que foi distribuída a 10 pesquisadores de universidades públicas e centros de pesquisa, que relataram resultados positivos após a utilização da enzima. O interesse demonstrado pelos pesquisadores levou a equipe a se propor a testar a viabilidade técnica de desenvolver uma versão dessa enzima, com hot start. Irão ser testadas duas alternativas de hot start, sendo que uma usa aptâmeros (oligonucleotidos que se unem à DNA polimerase inibindo-a de forma reversível) e a outra que usa binding proteins, que também inibem a atividade da DNA polimerase de forma reversível. Pretende-se posteriormente, levar para a fase 2 do PIPE, aquela que apresentar melhor viabilidade técnico-econômica. Os esforços da equipe atraíram a atenção de empresários do sector, que contam com mais de 3 anos de expertise em representação comercial técnica de produtos para a indústria farmacêutica como drug delivery systems e de cadeia fria como data loggers. A parceria levou à criação da ECRABIOTEC. A submissão deste projeto PIPE, tem como objetivo alavancar uma nova empresa na área da biotecnologia, potenciando o rápido desenvolvimento dos kits de DNA polimerase e acelerando a pesquisa nacional.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Fábio Trigo Raya - Integrante / Robson Tramontina - Integrante / Bruna Tatsue Grichoswski Nakagawa - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

Prêmios