Natalia Florencio Martins
A pesquisadora é Pós doutora pela Université Henri Poincaré (2000),possui doutorado em Bioquímica e Imunologia pela Universidade Federal de Minas Gerais (1998) , mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular) pela Universidade de Brasília (1993) e graduação em Ciencias Biologicas pela Universidade de Brasília (1989). Atualmente é pesquisadora da Embrapa Agroindústria Tropical, no Laboratório Multiusuário de Química de Produtos Naturais e trabalha, principalmente, no desenho racional de potenciais biodefensivos para o Agro Brasileiro. Realiza a busca de moléculas envolvidas nas interações planta-patógenos (fungos fitopatogênicos, nematóides e fungos patogênicos a humanos). Na sua pesquisa adquiriu experiência na área de genômica e patogenômica, com ênfase em bioinformática funcional e estrutural, atuando principalmente nos seguintes temas: bioinformática genômica, análise genômica, anotação e biotecnologia. Possui experiência na gestão de projetos em rede, organização de eventos, orientação de estudantes de graduação e pós graduação. Desde 2018 trabalha com nanotecnologia aplicada a proteção de plantas.
Informações coletadas do Lattes em 10/11/2024
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Bioquímica e Imunologia
1994 - 1998
Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Purificacao, caracterizacao e determinacao da estabilidade termodinamica de Tripsinogenio bovino e de formas ativas de tripsina
Orientador: Marcelo Matos Santoro
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Fisico-quimica de proteinas; tripsina; enzimologia; estabilidade termodinamica; tripsinogenio; dicroismo circular. Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.
Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)
1990 - 1993
Universidade de Brasília, UnB
Título: Purificacao e Caracterizacao de Aluminotioneina de sementes de plantas do cerrado, Ano de Obtenção: 1993
Orientador: Lauro Morhy
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: sementes; purificacao de proteinas; quimica de proteinas; metalotioneina.Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.
Pós-doutorado
2001
Pós-Doutorado. , Universidade de Brasília, UnB, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas
2022 - 2023
Pós-Doutorado. , INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE Clermont-Auvergne-Rhônes-Alpe, INRAe, França. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Agrárias
2013 - 2014
Pós-Doutorado. , Rothamsted Research, ROTHMSTED, Inglaterra.
2011 - 2012
Pós-Doutorado. , University of Nottingham, NOTTINGHAM, Inglaterra.
2009 - 2009
Pós-Doutorado. , Université Henri Poincaré, UHP, França. , Grande área: Ciências Biológicas
1999 - 2000
Pós-Doutorado. , Université Henri Poincaré, Nancy I, UHP, França. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Físico-Química / Especialidade: Química Teórica. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Enzimologia / Especialidade: Bioinformática e Modelagem Molecular de Enzimas.
Formação complementar
2016 - 2016
Análise de amplicons 16S rRNA e dados de shotgun metagenômico. (Carga horária: 40h). , Embrapa Informática Agropecuária, CNPTIA, Brasil.
2016 - 2016
Regulação Epigenética da expressão gênica. (Carga horária: 40h). , Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, CENARGEN, Brasil.
2010 - 2011
Bioitechnology. (Carga horária: 800h). , University of Nottingham, NOTTINGHAM, Inglaterra.
2009 - 2009
MBA em Gestão de Projetos. (Carga Horária: 400h). , Fundação Getúlio Vargas, FGV, Brasil. , Bolsista do(a): Embrapa, EMBRAPA, Brasil.
2008 - 2008
ISO 17025 - Auditor. (Carga horária: 40h). , Bureau Veritas do Brasil, BVQI, Brasil.
2007 - 2007
NBR ISO9001:2000. (Carga horária: 32h). , Instituto Brasileiro de Desenvolvimento Econômico e Social, IBDES, Brasil.
2006 - 2006
Formação de Auditores Internos da Qualidade. (Carga horária: 40h). , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Francês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Quimioinformática.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioinformática.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Modelagem Molecular de Proteinas.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Genômica.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Fisico Quimica de Proteinas.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bionformática Funcional.
Organização de eventos
MARTINS, N. F. ; TREPTOW, W. ; WALTER, Maria Emilia Machado Telles ; BRIGIDO, M. . Encontro da Rede Centro-Oeste de Pesquisa e Formação em Biologia Computacional. 2016. (Congresso).
MARTINS, N. F. ; MAIGRET, B. . I Workshop Franco-Brasileiro do Ciência sem Fronteira na Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. 2015. (Congresso).
Wagner Arbex ; marta F Martins ; MARTINS, N. F. . TAGC. 2013. (Congresso).
MARTINS, N. F. ; fabienne micheli ; Pierre Marracini . Encontro Brasil França de Bioinformática UESC - 2010. 2010. (Outro).
MARTINS, N. F. ; Diana Magalhães . I Workshop em Genômica Animal. 2009. (Congresso).
MARTINS, N. F. ; Diana Magalhães ; martha martins . Curso de Mapeamento de QTL. 2009. (Outro).
MARTINS, N. F. ; NHANI, A. ; Brammer S. ; CAETANO, Alexandre R ; Martins, A.M. ; Abadio AK . Curso Noções e Aplicações em Bioinformatica. 2008. (Outro).
Bazzan A ; Mark Craven ; MARTINS, N. F. . Third Brazilian Symposium on Bioinformatics. 2008. (Congresso).
MARTINS, N. F. ; WALTER, Maria Emilia Machado Telles ; guilherme telles . WOB 2004 - Workshop on Bioinformatics. 2004. (Congresso).
Participação em eventos
Reunião Técnica SENAI/EMBRAPA.De genomas ao desenho de drogas - Inovação em agroquímicos. 2016. (Simpósio).
BBSRC Fusarium - wheat research project.Gene Target selection in Fusarium graminearum genome. 2015. (Seminário).
I Workshop em Genômica Animal.Projeto componente 6 - Capacitação de Recursos Humanos. 2009. (Simpósio).
Congresso ABIPTI 2008. A Contribui;'ao da Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia à Capacitação e Formação profissional para implantação do sistema da qualidade. 2008. (Congresso).
Reunião do Comitê Técnico Interno - Relatórios Finais.Projetos Macroprogramas 2 e 3 , RElatórios Finais. 2008. (Encontro).
Workshop Brasil e Australia.Genomics & Computation Biology. 2008. (Simpósio).
Workshop Pb micose.VIRTUAL SCREENING OF Paracoccidioides brasiliensis GENOME ? A NEW DRUG DESIGN APPROACH. 2008. (Simpósio).
X International Congress on Paraccodidiomycosis. VIRTUAL SCREENING OF Paracoccidioides brasiliensis GENOME ? A NEW DRUG DESIGN APPROACH. 2008. (Congresso).
XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia. Calcium signalling pathway in M. graminicola genome. 2008. (Congresso).
Congresso Brasileiro de Melhoramento de Plantas. Congresso Brasileiro de Melhoramento de Plantas. 2005. (Congresso).
Curso internacional em Bioinformática.Bioinformática Genômica. 2004. (Oficina).
Curso REgional de Bioinformática, Região Centro-oeste.Curso Regional em Bioinformática _ UFMS. 2004. (Outra).
Estudos de Prospecção em Biotecnologia.Estudos de Prospecção em Biotecnologia. 2004. (Simpósio).
International Meeting in Challenge Program in Bioinformatics.Challenge Program in Bioinformatics. 2004. (Encontro).
Oficina em Genes de REsistência.Genes de Resistência em Plantas - Características estruturais e funcionais. 2004. (Seminário).
Simposio Latino Americano de Ciencia de Alimentos.Simposio Latino Americano de Ciencia de Alimentos. 2003. (Simpósio).
Workshop em Bioinformática.Bioinformática Genômica- Apresentação do Sistema de Gerenciamento e Análise de sequencias genomicas. 2002. (Seminário).
Workshop in Bioinformatics. 2002. (Seminário).
Participação em bancas
Cleberson Fernandes;MARTINS, N. F.; Carla Celedonio. Avaliação de compostos bioativos com potencial atividade antiviral.. 2023. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia de Recursos Naturais) - Universidade Federal do Ceará.
AMORIM, S.; COSTA, F. F.;MARTINS, N. F.; POGUE, R. E.. analise do impacto estrutural de polimorfismos de base unica não-sinonimos presentes no gene da uroguanilina mediante simulações por dinânimca molecular de longa duração. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília.
Bazzan A;MARTINS, N. F.. Metodo de aprendizagem por refor;o no sistema BioAgents. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade de Brasília.
Torres F.A.; Ricardo Henrique Kruger;MARTINS, N. F.. Identificação e caracterização de amilase de biblioteca metagenômica de microbiota do solo do cerrado. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília.
MARTINS, N. F.; FRANCO, O.. A CAracteriza;'ao de genes e desenvolvimento de marcadores moleculares na interação entre Musa acuminata e Mycosphaerella fijiensis. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília.
MARTINS, N. F.; BRIGIDO, M.. Predição de Anotação Manual com Uso de Aprendizado por Reforço. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade de Brasília.
MARTINS, N. F.; FRANCO, O.; SANTANA, Jaime Martins. Modificações Conformacionais da Associação entre o SPCI e a alfa quimotripsina. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília.
MARTINS, N. F.PAPPAS JR, G.. Analise comparativa de algoritmos de agrupamentos de ESTs. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília.
MARTINS, N. F.; WALTER, Maria Emilia Machado Telles; DIAS, Zanoni. Um algoritmo para o problema da ordenação por transposições. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade de Brasília.
MARTINS, N. F.; MARANHÃO, A. Q.; PEREIRA, I. S.. Baptista. Caracterização do gene PBM32 específico da Fase Miceliana do Fungo P. brasiliensis. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília.
MARTINS, N. F.PAPPAS JR, G.; MARTINS, W.. BOOM - Blast Object Oriented Management: Uma solução Integrada para Gerenciamento dos REsultados do BLAST por meio de um paradigma orientado a objetos. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília.
MARTINS, N. F.; RICART, C. A. O.; MARCO, J. L.; F FILHO, E. X.. Franco. Caracterização e Purificação Parcial de uma xilanase de Trichoderma harzianum. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília.
Fernando Valicente; BRIGIDO, M.; Maria Cléria Valadares Inglis;MARTINS, N. F.. Genomica e diversidade genetica de populações de Chrysodeixix includens nucleopolyhedrovirus. 2016. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília.
Miller, R.N.;MARTINS, N. F.. Estudo do Transcritoma Global do Fungo Aspergillus terreus quando cultivado em residuos agroindustriais. 2016. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília.
MARTINS, N. F.. Estudo da interação Musa acuminata - Meloidogyne incognita. 2015. Tese (Doutorado em Fitopatologia) - Universidade de Brasília.
CAstro MS; RICART, C. A. O.; Lima, CMR;MARTINS, N. F.; WEIS, S. N.; PIRES JUNIOR, O. R.. Síntese Química e Avaliação das propriedades antibaterianas antiparasitárias de análogos de peptídeos antimicrobianos de anuros. 2015.
MARTINS, N. F.. Especiação, genomica e reprodução sexuada no complexo de especies do genero Paracoccidioides. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília.
Carrer, Helaine; Antonio de Goes; Carlos Takeshi Hotta;Takita, Marco AurélioMARTINS, N. F.. Estudo da mancha preta em citrus. 2009. Tese (Doutorado em Fisiologia e Bioquímica de Plantas) - USP- Escola Superior de Agricultura Luzi de Queiroz.
MARTINS, N. F.PAPPAS JR, G.; RICART, C. A.; BRIGIDO, M.. Interações entre alfa-amilases de insetos e inibidores de alfa amilases de sementes de feijão (Phaseolus vulgaris); aspectos molecular-estrutural. 2002. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília.
MARTINS, N. F.; SANTANA, Jaime Martins; TEIXEIRA, A.; LOZZI, Silene P; PIRES, L. L.. Proteínas Recombinantes da Saliva de Triatoma infestans. 2001. Tese (Doutorado em Patologia Molecular) - Universidade de Brasília.
MARTINS, N. F.; TEIXEIRA, A. R. L.; LOZZI, Silene P; PIRES, L. L.; AULT, M. S.. Caracterização MOlecular e funcional da Catepsina tipo -B de T. cruzi. 2001. Tese (Doutorado em Patologia Molecular) - Universidade de Brasília.
Freitas SM;MARTINS, N. F.. Modificações conformacionais da associação entre SPCI e alfa-quimotripsina. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília.
MARTINS, N. F.; Cleberson Fernandes; TILBURG, M. F. V.. ATIVIDADE ANTIVIRAL IN VITRO DE COMPOSTOS FENÓLICOS COMO POTENCIAL ALTERNATIVA PARA O CONTROLE DO SARS-CoV-2. 2024. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade Federal do Ceará.
OTÍLIA DEUSDÊNIA LOIOLA PESSOA; FRANCISCO ACÁCIO DE SOUSA; FABIANA RODRIGUES DA SILVA;MARTINS, N. F.. "Novos fungicidas derivados de produtos naturais". 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Química) - Universidade Federal do Ceará.
MILLER, Robert N GBERTIOLI, David JMARTINS, N. F.. GENE DISCOVERY AND FUNCTIONAL MARKER DEVELOPMENT IN THE MUSA ACUMINATA CALCUTTA 4 V MYCOSPHAERELLA FIJIENSIS PLANT PATHOGEN INTERACTION. 2008 - Universidade Católica de Brasília.
MARTINS, N. F.; ABREU NETO, J. R. M. V.; SÁ, N. M.; ICUMA, I. M.. Aedes aegypti o mosquito transmissor da Dengue. 2003 - Faculdade da Terra de Brasília.
MARTINS, N. F.; PAPPAS, M. R.; MONSORES, N.; CARLYLE, J.. Bioinformática - A pesquisa científica na era da informática. 2003 - Faculdade da Terra de Brasília.
MONSORES, N.;MARTINS, N. F.; Cunha IM. Estudo entomológico da fauna anofelina em cinco áreas de conservação ambiental, localizadas no perímetro urbano do DF. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Faculdade da Terra de Brasília.
Katia Brasil; Pujol J;MARTINS, N. F.. Comitê externo para seleção de bolsas PIBIC. 2010. Universidade Católica de Brasília.
MARTINS, N. F.SILVA, Felipe Rodrigues daSANTORO, Marcelo Matos; SANTOS, Aline; MOMBACH, Carlos. Comite de avaliação de projetos em Bioinformática. 2003. Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.
Orientou
PÓS-GENOMA DO PATÓGENO HUMANO Paracoccidioides brasiliensis: VARREDURA VIRTUAL DE NOVAS DROGAS ANTIFÚNGICAS; 2008; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Natalia Florencio Martins;
2023; Embrapa, ; Natalia Florencio Martins;
2015; Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, ; Natalia Florencio Martins;
2014; Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Natalia Florencio Martins;
2014; Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Natalia Florencio Martins;
"Novos fungicidas derivados de produtos naturais"; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Química) - Universidade Federal do Ceará; Orientador: Natalia Florencio Martins;
Metabolismo Energético, Obesidade e Leptina; 2004; 80 f; Trabalho de Conclusão de Curso - Faculdade da Terra de Brasília; Orientador: Natalia Florencio Martins;
Bioinformática; 2003; 80 f; Trabalho de Conclusão de Curso - Faculdade da Terra de Brasília; Orientador: Natalia Florencio Martins;
Estudos Moleculares em Delta endotoxinas; 2002; 150 f; Trabalho de Conclusão de Curso - União Educacional do Planalto Central; Orientador: Natalia Florencio Martins;
Rede Genômica Animal - capacitação; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Ciencias Biologicas) - Universidade Católica de Brasília; Orientador: Natalia Florencio Martins;
Otimização de informação em Bioinformatica; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia da Computação) - Centro Universitário de Brasília, Embrapa; Orientador: Natalia Florencio Martins;
Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Católica de Brasília, Embrapa; Orientador: Natalia Florencio Martins;
M; de Araújo); Estudos estruturais em Selenium Binding Protein; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Agronomia) - Embrapa, Embrapa; Orientador: Natalia Florencio Martins;
GEstão da informação via PLONE; 2009; Orientação de outra natureza; (Engenharia da Computação) - Centro Universitário de Brasília; Orientador: Natalia Florencio Martins;
Sequenciamento e caracterizacao de genes em Musa balbisiana; 2006; Orientação de outra natureza - Embrapa; Orientador: Natalia Florencio Martins;
Análise genômica de Musa acuminata; 2005; 0 f; Orientação de outra natureza - Sede; Orientador: Natalia Florencio Martins;
Produções bibliográficas
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GROSSI-DE-SA, MAÍRA ; PETITOT, ANNE-SOPHIE ; XAVIER, DEISY A. ; SÁ, MARIA EUGÊNIA L. ; MEZZALIRA, ITAMARA ; BENEVENTI, MAGDA A. ; MARTINS, NATALIA F. ; BAIMEY, HUGUES K. ; ALBUQUERQUE, ERIKA V. S. ; GROSSI-DE-SA, MARIA F. ; FERNANDEZ, DIANA . Rice susceptibility to root-knot nematodes is enhanced by the Meloidogyne incognita MSP18 effector gene. PLANTA , v. 19, p. 205, 2019.
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FARIAS, LUCIANA R. ; SCHIMMELPFENG, PEDRO H. C. ; TOGAWA, ROBERTO C. ; COSTA, MARCOS M. C. ; GRYNBERG, PRISCILA ; MARTINS, NATÁLIA F. ; BORGES, MIGUEL ; BLASSIOLI-MORAES, MARIA CAROLINA ; LAUMANN, RAUL A. ; BÁO, SÔNIA N. ; PAULA, DÉBORA P. . Transcriptome-Based Identification of Highly Similar Odorant-Binding Proteins among Neotropical Stink Bugs and Their Egg Parasitoid. Plos One , v. 10, p. e0132286, 2015.
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PASSOS, M. A. N. ; DE OLIVEIRA CRUZ, V. ; EMEDIATO, F. L. ; DE CAMARGO TEIXEIRA, C. ; SOUZA, M. T. ; MATSUMOTO, T. ; RENNO AZEVEDO, V. C. ; FERREIRA, C. F. ; AMORIM, E. P. ; DE ALENCAR FIGUEIREDO, L. F. ; MARTINS, N. F. ; CAVALCANTE, M. D. J. B. ; BAURENS, F.-C. ; DA SILVA, O. B. ; PAPPAS JUNIOR, G. J. ; PIGNOLET, L. ; ABADIE, C. ; CIAMPI, A. Y. ; PIFFANELLI, P. ; MILLER, R. N. G. . Development of expressed sequence tag and EST-SSR marker resources for Musa acuminata. AOB Plants , v. 2012, p. pls030, 2012.
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Outras produções
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PAPPAS JÚNIOR, Georgios J. ; COSTA, M. M. ; TOGAWA, Roberto C ; Martins, Natália Florêncio . SISGEN. 2004.
COUTINHO, M. V. ; Clarissa Silva Pires de Castro ; MARTINS, N. F. ; S. R. Paiva ; Braga A . Guia para Elaboração de Procedimentos Operacionais Padrão da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.. 2007.
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MARTINS, N. F. . Convenção Internacional de Roterdã. 2001.
MARTINS, N. F. . Convenção Internacional sobre a Proibição do Uso de Armas Químicas e Biológicas. 2001.
MARTINS, N. F. . Convenção Internacional de Estocolmo. 2001.
MARTINS, N. F. . Convenção Internacional sobre Enotrpecentes e substâncias Precursoras. 2001.
MARTINS, N. F. . Agro no Ponto. 2024. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
MARTINS, NATALIA FLORENCIO . Bioinformática e sua aplicação na agricultura. 2011. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).
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ARBEX, W. ; Martins, Natália Florêncio ; marta F Martins . ATGC - Talking about computating and genomics vol. I. 2014. (Editoração/Livro).
MARTINS, N. F. ; BRIGIDO, M. ; SILVA, F. R. ; COSTA, M. M. ; Wagner Arbex . Introducao a bioinformatica. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
Projetos de pesquisa
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2019 - 2023
Desenvolvimento de bioprodutos fitoquímicos e bioinsumos para biofertilização de meloeiro, cafeeiro e tomateiro, Descrição: Nas últimas décadas, a Revolução Verde promoveu um aumento substancial na produção de alimentos e rações com base no uso indiscriminado de insumos agroquímicos. Ao longo do tempo, os sistemas de cultivo foram se aperfeiçoando e hoje o aumento de produção por unidade de área, ou seja, sem a necessidade de abrir novas áreas, é um dos grandes ganhos da agricultura brasileira. Esse avanço foi acompanhado pelo aumento do uso de fertilizantes e agroquímicos, em face do aumento das demandas nutricionais das culturas e dos ataques de pragas e doenças, respectivamente. Porém, atualmente, a despeito dos avanços na área de fitotecnia e melhoramento de plantas que têm possibilitado a obtenção de cultivares com maior produção, altos teores de proteínas e vitaminas, maior resistência à doenças, pragas e estresse hídrico dentre outras características desejáveis, o uso excessivo e, na maioria das vezes, empírico de fertilizantes e agroquímicos tem conduzido a desequilíbrios com reflexos diretos no ressurgimento e aumento de resistências das pragas, nas anomalias genéticas em plantas e animais, na presença de resíduos tóxicos nos alimentos e impactos prejudiciais ao meio ambiente. Estes estresses de caráter abiótico e biótico figuram como desafios a serem enfrentados pela pesquisa na busca de tecnologias, produtos e processos com foco numa agricultura mais sustentável do ponto de vista: 1. econômico - ganhos de produtividade e aumento da lucratividade; 2. social - produtos com melhor qualidade nutracêutica, não causa contaminação do aplicador e com maior segurança, e; 3. ambiental - produtos baseados em tecnologia verde, que não gera resíduos e compatíveis com a fauna e flora. Biopesticida é uma importante classe de controladores de pragas que inclui princípios ativos naturais de animais, plantas, fungos e bactérias. Esses agentes ganharam grande interesse recentemente, porque são ambientalmente seguros, específicos para alvos, biodegradáveis e adequados para os programas de manejo integrado de pragas (MIP). A nanotecnologia é uma das áreas mais promissoras para o desenvolvimento de novos produtos de aplicação agrícola. Refere-se ao desenho, produção, caracterização e aplicação de materiais, estruturas, ferramentas e sistemas por controle de tamanho e forma em escala nanométrica (<100nm) (Poddar, et al., 2018). O grande desafio atual é o desenvolvimento de uma agricultura sustentável, em que um novo padrão de produção que não agride o meio ambiente é priorizado, com aumento da produção agrícola (Vishwakarma, et al., 2018). Assim, a nanotecnologia pode ajudar a resolver os problemas decorrentes do uso de pesticidas químicos tradicionais, por exemplo, com o desenvolvimento de formulações em escala nano com agentes bioativos, os chamados nanobiopesticidas. Há apenas 15 anos foram descobertas nanopartículas derivadas de carbono, os nanopartícula carbonada (CDs) (SCRIVENS, et al. 2004). Os CDs são uma nova classe de materiais à base de carbono como semi-esféricos cujas nanopartículas são menores do que 10 nm (Wang, Youfu; Hu, Aiguo (2014). Desde a sua primeira descoberta em 2004 (SCRIVENS, et al. 2004), as pesquisas e aplicações vêm revelando as vantagens dessas nanopartículas, tais como: luminescência, fotoestabilidade, tamanho em nanoescala, solubilidade em água, baixa toxicidade, biocompatibilidade, inércia química e baixo custo (Gao, et al., 2013).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (2) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Natalia F Martins - Integrante / Erika V S A - Integrante / Rodrigues, Marcelo O. - Integrante / josimar ribeiro do couto - Integrante.
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2018 - 2021
Bayer Grants4Targets, Descrição: Seleção de alvos proteicos de Hemileya vastatrix para o desenvolvimento de inibidores inovadores visando o controle da ferrugem do cafe.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Diana Fernandes - Integrante.
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2017 - 2020
Bioinformática aplicada à desafios prioritários da agropecuária brasileira, Descrição: A rápida evolução das tecnologias de sequenciamento, conhecidas como Sequenciamento de Nova Geração (NGS), revolucionou diversas áreas da biologia básica e aplicada. A queda progressiva dos custos de sequenciamento levou a um incremento significativo tanto em quantidade quanto em diversidade de genomas sequenciados. As NGSs também são amplamente aplicadas na geração de dados transcritômicos, metagenômicos e mais recentemente, na geração de dados de micro-RNAs (pequenos RNAs não codantes), metilação de DNA e degradomas (RNAs mensageiros degradados pela ação de micro-RNAs). De posse desses dados, as tarefas atribuídas às equipes de bioinformática são inúmeras: i) montagem e anotação de genomas, metagenomas e transcritomas; ii) análise da expressão diferencial de transcritos e de micro-RNAs; iii) identificação, anotação e busca por alvos de silenciamento por micro-RNAs, iv) estudos dos genomas estruturais, em especial, pela busca por moléculas que podem ser alvos de drogas para controle de pragas e doenças; v) integração dos resultados das análises de dados visando a compreensão dos fenômenos sob à luz da biologia.A equipe do Laboratório de Bioinformática da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia é constantemente procurada por diversas equipes da mesma e de unidades e instituições diferentes em busca de parcerias para o estabelecimento do desenho experimental e análise de dados das mais diversas categorias. Para cada conjunto de dados, a equipe precisa avaliar as melhores estratégias e abordagens para produzir os resultados necessários para o andamento dos projetos. O acúmulo de conhecimento adquirido em razão de tantos projetos em colaboração torna a equipe de bioinformática especialista em análise de dados (em especial dados provenientes de tecnologias de larga escala). No entanto, a nossa capacidade de absorção de projetos em colaboração é limitada em função dos aspectos pessoal e estrutural. Com a infraestrutura construída ao longo destes anos, temos a capacidade operacional suficiente, porém limitada, para atender os diversos projetos. Além disso, com a nossa estrutura atual, análises corriqueiras eventualmente demoram semanas ou meses para serem concluídas, pois os dados são processados de forma fragmentada (vários discos e em vários diretórios) sendo que o ideal seria termos um espaço contínuo para analisar os dados de um projeto em um só local, economizando em muito o tempo de processamento. Adicionalmente, o poder computacional dos computadores pessoais, sejam desktops ou laptops, aumentou consideravelmente ao longo nos últimos anos. Isso significa que uma grande variedade de análises em menor escala pode ser efetuada localmente. No entanto, geralmente, os interessados em tais análises não possuem conhecimento de ferramentas ou como elas funcionam para obter os resultados esperados.Uma estratégia que poderia contribuir para que diferentes grupos de pesquisa se beneficiem das análises bioinformáticas que realizamos é desenvolver e publicar metodologias e tutoriais para que os próprios usuários consigam realizar análises computacionalmente mais simples adquirindo mais independência e agilidade na obtenção dos resultados.Essa proposta tem como principal objetivo desenvolver e disponibilizar metodologias de análises de dados biológicos. Especificamente, propomos desenvolver e disponibilizar metodologias, scripts técnico-científicos, tutoriais de análises de dados nos mais diversos âmbitos da bioinformática, softwares e bases de dados para a comunidade científica e público interessado. Espera-se, com este projeto, que o Laboratório de Bioinformática da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia torne-se um provedor de ferramentas e guias para análises de dados biológicos em pequena e larga escala para a comunidade científica e público interessado através da publicação de metodologias de análise aplicados aos dados de p. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Integrante / Roberto C Togawa - Integrante / Priscila Grynberg - Coordenador., Financiador(es): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
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2015 - 2019
Desenvolvimento de ativos biotecnológicos alternativos ao controle massivo e aplicados ao diagnóstico de nematoides-da-galha patogênicos de grandes culturas, Descrição: Seleção de sequências-alvo por análise de polimorfismo em proteínas efetoras de virulência de Meloidogyne spp.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Integrante / Bernard Maigret - Integrante / Diana Fernandes - Integrante / Freire, Érika - Coordenador / GROSSI-DE-SA, MARIA FÁTIMA - Integrante / Emmanuel Bresso - Integrante / Isabela tristan lourenco - Integrante / Ettiene Danchin - Integrante.
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2015 - 2019
BBSRC Embrapa - Using HIGS and si-RNA technologies to explore and control Fusarium Head Scab disease in wheat fields - BB/N004493/1, Descrição: he full proposal needs to be more precisely targeted and individual roles within the team more clearly defined. Additionally, it was noted that the pump-priming proposal referred to additional UK collaborators who were not included as Co-Investigators on the application. In the full proposal, the Principal Investigator should ensure that the core members of the UK team who will deliver the project are should be included as Co- investigators/Researcher Co-Investigators as appropriate, and that all named applicants are eligible. The Embrapa team should consider a replacement in terms of leadership for the next step (full proposal) as the PI is currently in charge of administrative duties in Embrapa ? head of R & D. It is strongly recommended that the current PI becomes a Co-I for the full proposal and new PI is identified, with a strong background in plant pathology as well as molecular biology.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Integrante / Kim E. Hammond-Kosack - Coordenador / Mauricio Fernandes - Integrante / Elene Yamasaki - Integrante.
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2015 - 2018
Estratégias Biotecnológicas - Desenho Racional de inibidores para o controle de nematóides em plantas, Descrição: Devido à importância do estudo do controle dos RKN, os grupos de pesquisa franceses e brasileiro vêm investigando genes de plantas resistentes e genes-alvo do patógeno em diversos projetos de pesquisa em conjunto. Projetos e bolsas financiados pelo 2 CAPES-COFECUB, 1 Embrapa MP2, CNPQ Ciência Sem Fronteiras ? 3 bolsas PVE, 3 Capes-Agropolis, 1 CNPq-IRD Cooperação Internacional Acordos Bilaterais. Orientações em parceria renderam resultados integrantes de 4 teses de doutorado e 8 artigos científicos foram publicados em conjunto. Por uma proposta integrativa de diferentes abordagens biotecnológicas, nosso projeto pretende reunir e gerar dados para a utilização de genes do patógeno e/ou do hospedeiro visando o controle de RKN. As atividades estão divididas em: 1. Plano Gerencial; 2. Caracterização de moléculas para RNAi que induzem o silenciamento de genes essenciais que fazem parte dos processos de vida de RKN; 3. Silenciamento in planta de genes candidatos a efetores do parasitismo de nematoides da galha; 4. Expressão in planta de genes candidatos do hospedeiro para defesa contra RKN; 5. Varredura Virtual de proteínas para o desenvolvimento de novos agentes de controle para nematoide da galha; 6. Integração de dados transcritômicos de interações incompatíveis em plantas resistentes aos RKN.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Bernard Maigret - Integrante / Roberto C Togawa - Integrante / Erika V S A - Integrante / Diana Fernandes - Integrante / Emmanuel Bresso - Integrante / Daisy Amora - Integrante.
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2014 - 2019
Análises transcriptômicas da broca do café (Hypothe nemus hampei) visando a validação de alvos por RNA interferente, Descrição: Este projeto propõe a obtenção do transcritoma da broca do café utilizando amostras de RNAs de todas as fases de desenvolvimento do inseto. A partir deste banco de dados serão selecionadas sequencias alvo-específicas para RNAi, as quaisapós a validação funcional, por bioensaios, serão disponibilizadas para aplicação na produção de plantastransgênicas resistentes à broca do café.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Integrante / Freire, Érika - Integrante / Roberto Togawa - Integrante / SILVA, MARIA CRISTINA MATTAR - Coordenador / leonardo pepino - Integrante.
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2014 - 2019
Estratégias biotecnológicas para o controle de nematoides da galha parasitas de plantas, Descrição: Caracterizar e avaliar genes-alvo candidatos selecionados para geração de ativos com aplicação no controle específico e durável de fitonematoides formadores de galha (RKN). Para atingir tal objetivo, pretende-se: implementar metodologias de análise ampla e interativa de dados, selecionar novos genes candidatos, caracterizar alvos de proteínas potenciais do sistema hospedeira-RKN gerar ativos para inovação de tecnologias integradas no controle de RKN promover a formação acadêmica de pesquisadores nas áreas de pesquisa da Biologia Avançada.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Integrante / Diana Fernandes - Integrante / Freire, Érika - Coordenador / GROSSI-DE-SA, MARIA FÁTIMA - Integrante / janice Engler - Integrante / Priscila Grynberg - Integrante.
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2013 - 2017
Rede nacional para o desenvolvimento e adaptação de estratégias genômicas inovadoras aplicadas ao melhoramento, conservação e produção animal, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Alexandre Rodrigues Caetano em 06/02/2017., Descrição: A Rede Genômica Animal (RGA) vem trabalhando desde 2008 para internalizar e desenvolver ferramentas de análise de dados, assim como gerar e analisar dados genômicos para uma série de projetos incorporados ao Projeto em Rede. O projeto em rede teve seu encerramento em dezembro de 2012, com grande sucesso em obter resultados e alcançar as metas propostas. Além disso, uma série de novos projetos foi aprovada no período, em associação com o projeto em rede, fazendo com que a RGA atingisse um papel de destaque na Embrapa nas atividades de análise de dados genômicos para prospecção de genes de interesse. Novas tendências tecnológicas e metodológicas surgiram no período, com a evolução das tecnologias de sequenciamento de nova geração (NexGenSeq) e o franco desenvolvimento de métodos de avaliação e seleção genômica, respectivamente. Nesse contexto, estamos propondo um novo projeto em rede, o qual visa: (a) fomentar a incorporação e desenvolvimento de novas ferramentas e métodos de análise de dados genômicos com foco na incorporação da Seleção Genômica nos programas de avaliação e melhoramento animal nos quais a Embrapa atua; (b) gerar e analisar dados para novos projetos da Embrapa ainda não incorporados à Rede que visam prospectar genes de interesse em espécies de produção; (c) gerar informações genômicas básicas para desenvolvimento de ferramentas de manejo genético para espécies em fase de domesticação e prémelhoramento (peixes nativos); (d) prospectar espécies e moléculas na microbiota associada com diferentes processos fisiológicos de animais de produção através de análises metagenômicas; (e) assim como manter a estrutura e os processos implementados durante o primeiro projeto em rede.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Integrante / Alexandre R Caetano - Coordenador / Wagner Arbex - Integrante / Marta Fonseca Martins - Integrante.
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2012 - 2017
Desenvolvimento e engenharia de moléculas para controle de fitonematoides, Descrição: Fitonematoides dos gêneros Heterodera, Globodera (nematoides formadores de cisto) e Meloidogyne (nematoides formadores de galha) são responsáveis por perdas na agricultura mundial de US$ 125 bilhões anualmente. Práticas culturais e manejo integrado têm tido sucesso limitado e alto custo, sendo o cultivo de variedades resistentes a nematoides mais eficaz e menos oneroso. Em um primeiro projeto (Análise da expressão de genes envolvidos na fitopatogenicidade de nematoides Meloidogyne spp visando o desenvolvimento de estratégias de controle 2001-2003) foram identificadas estratégias e genes visando resistência a fitonematoides. Após, os projetos Validação de genes e moléculas para o controle da Meloidoginose (CNPq: 484512/2007-2) 2007-2009 e Validação de moléculas para o controle de Meloidogyne spp. 2009-2011, validaram genes e estratégias moleculares. Essa proposta visa aprofundar a validação e a aplicação das biomoléculas no controle de fitonematoides. Os estudos anteriores permitiram: 1 - Estabelecer um sistema de silenciamento gênico para controle de fitonematoides nematoides em plantas modelo de fumo, assim como plantas de soja. 2 - Identificar genes essenciais de M. incognita envolvidos com processos de digestão, parasitismo, reprodução entre outros, cujo silenciamento mostrou redução deste fitonematoide. 3 - Identificar, caracterizar e purificar metabólitos secundários com alta atividade nematicida e nematostática. 4 - Identificar genes de genótipos de soja e de algodão potencialmente envolvidos na resistência a M. incognita. Considerando os resultados anteriores, é imprescindível avançar esses estudos, visando o controle eficaz destes fitonematoides. O atual projeto está estruturado em rede com a participação de duas unidades da Embrapa (Recursos Genéticos e Biotecnologia; Cerrados) e universidades reconhecidas (Universidade de Brasília, Universidade Católica de Brasília, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Universidade Federal do Rio Grande do Sul e Universidade Federal do Ceará), além da parceria internacional com os grupos franceses no IRD/Montpellier e INRA/Antibes. Essa rede vem demonstrando excelente funcionamento nas projetos anteriores, além do alto grau de comprometimento, observado pelos resultados obtidos, artigos e capítulos de livro publicados, dissertações e teses defendidas e desenvolvimento de patentes. As metas para a continuidade do projeto serão: 1 - Atráves de retrocuzamento das plantas de fumo expressando dsRNA, piramidar os genes-alvo de silenciamento gênico visando intensificar o efeito deletério sobre os fitonematoides. 2 - Caracterizar e avaliar eventos transgênicos para dois diferentes genes (superoxido dismutase e ?dirigent-like protein?), que mostraram forte potencial efeito sobre o controle dos fitonematoides. 3 - Baseado nos metabolitos secundários identificados como nematicidas, estudar as vias metabólicas em soja visando estudos de engenharia metabólica (ou seja expressão/produção de metabolticos nematicidas). 4 - Baseado em estudos transcriptomicos atuais envolvendo a interação planta-patógeno, onde foram identificadas proteínas hubs envolvidas na interação, e em estudos realizados por nós envolvendo genótipos de soja resistentes aos nematoides (M. incognita, M. javanica e Heterodera glycinis), realizar estudos do interactoma soja-Meloidogyne e arroz-Meloidogyne. 5 - Caracterizar a expressão dirigida por modulos dos promotores UceS8.3 de soja e UceA1.7 de algodão, identificados e patenteados pelo grupo, em raízes inoculadas com M. incognita. 6 - Validar outros genes letais de Meloidogyne em raízes de soja GM. Esses novos genes foram identificados, baseado em estudo comparativo de moléculas alvo para os fitonematóides e apresentam enorme potencial para o controle dos mesmos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Integrante / Rodrigo R Fragoso - Integrante / Erika V S A - Integrante / FERNANDEZ, DIANA - Integrante / GROSSI-DE-SA, MARIA FÁTIMA - Coordenador.
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2012 - 2015
Protein Interaction mapping between root node nematode and virus effectors with regulatory proteins of rice and soybean plants, Descrição: Scientific Background and Objectives The main hypothesis of this project is that the plant immune system has some proteins that interact with the phytopathogens effectors in to elicit compatible responses through other downstream proteins. The objective of this proposal is to determine the target proteins of pathogenic nematode and virus effectors in two host plants (rice and soybean). The pathogens studied secrete a diverse set of proteins in plant cells to suppress host responses and facilitate infection. Recent data in the model plant A. thaliana demonstrated that a limited number of host proteins are targeted by pathogen effectors, and these targets are highly connected proteins in the cellular network. In this proposal, we will focus on - Identification of host interactors of a set of nematode and viral effector (proteins; - Identification of common plant targets of nematode and virus effectors. Description of Project/Methodology The proposed project involves a French (IRD) and one Brazilian (UCB-Embrapa-Cenargen) teams internationally recognized in the field of molecular analysis of plant-pathogen interactions and an African institute (Université Polytechnique de Bobo Dioulasso) devoted to rice and nematode research. The proposed program will associate the These experiments will lead to the possible demonstration of the involvement of plant candidate genes as targets of effectors. Expected Results The proposed research will provide a significant contribution to understanding how pathogen effectors promote disease. Also, this proposal will provide insights into key molecular processes regulating susceptibility to economically important pathogens. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Integrante / Rodrigo R Fragoso - Coordenador / Diana Fernandes - Integrante / Freire, Érika - Integrante / GROSSI-DE-SA, MARIA FÁTIMA - Integrante.
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2011 - 2015
Rede de Seqüenciamento de Genomas para Desenvolvimento de Tecnologias Inovadoras para a Pecuária Brasileira, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Alexandre Rodrigues Caetano em 06/02/2017., Descrição: Nos últimos anos, grandes avanços foram realizados em pesquisas genômicas em bovinos, tais como a geração de mapas genéticos com microssatélites e genes, mapas RH, estudos comparativos de genomas e mapas físicos, culminando recentemente com a publicação da seqüência anotada do genoma de uma vaca da raça Hereford, e com a disponibilização de chips de genotipagem de marcadores SNP contendo mais de 50 mil marcadores. Estes estudos foram realizados principalmente a partir de material genético de animais de raças européias, pertencentes ao grupo Bos taurus taurus. Apesar de essas informações constituírem ferramentas úteis para estudos genéticos e genômicos do genoma bovino em geral, o desenvolvimento de ferramentas específicas para o estudo de raças zebuínas (Bos taurus indicus) é necessário, pois este grupo constitui a maior parte da base genética do rebanho brasileiro. As novas tecnologias de seqüenciamento de DNA trouxeram grandes avanços para a genômica, baixando custos e aumentando a velocidade de geração de informações em ordens de grandeza, e também tornando possível a realização de experimentos sem grandes investimentos em equipamentos, já que a geração dos dados pode ser adquirida através da prestação de serviços de empresas especializadas. Com a execução da presente proposta iremos utilizar duas diferentes tecnologias de seqüenciamento de nova geração (Illumina/Solexa e Pacific Biosciences SMRT) para gerar uma montagem referência do genoma zebuíno (Nelore). Adicionalmente, mais quatro animais da raça Nelore, representantes de diferentes linhagens genéticas da raça, serão seqüenciados com a tecnologia Illumina e terão seus genomas montados. Análises comparativas serão feitas entre as seqüências geradas e as seqüências referência taurina e zebuína para identificação de regiões que divergiram durante a evolução dos dois grupos, e que são possivelmente responsáveis por controlar características de importância para a pecuária nacional. Adicionalmente, as seqüências.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado profissional: (3) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Integrante / Alexandre R Caetano - Coordenador.
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2007 - 2009
Resistance gene discovery in the Musa acuminata and Mycosphaerella fijiensis plant pathogen interaction, Descrição: Principal phytosanitary problems facing cultivation in the country are caused by fungi, bacteria, virus, nematodes and insect phytopathogens and pests, with the majority of commercial varieties lacking resistance. Principal fungal pathogens include Fusarium oxysporum f.sp. cubense, which is responsible for Panama Disease, Mycosphaerella musicola, which causes Yellow Sigatoka, and M. fijiensis, which causes Black Sigatoka (or Black Leaf Streak Disease). The principal bacterial pathogen Ralstonia solanacearum, race 2, also causes considerable losses via bacterial wilt. Diseases caused by nematode damage are usually attributed to Radopholus similis and Cosmopolites sordidus. Of all the diseases occurring in Musa production in Brazil, greatest impact is likely to be attributed to the fungal pathogen M. fijiensis, causal organism of BLSD. This pathogen, which results in disease symptoms of premature fruit ripening, necrotic leaf surfaces lesions, leaf area decomposition and yield losses of up to 100% on susceptible varieties from Cavendish (Musa cv. AAA) and Prata (Musa cv. AAB) groups, was reported for the first time in Brazil in the Amazon region in 1998. Subsequently, the pathogen spread over seven states in the north of the country, and has also been reported in São Paulo, Minas Gerais, Paraná and Santa Catarina, and now threatens the Brazilian northeast states. Cavendish production in Brazil is thus threatened, becoming completely dependent upon the use of protectant fungicides. Considering that over 50 applications of protectant fungicide can be necessary to control the disease in susceptible areas, together with the high cost incurred (with estimates of chemical inputs accounting for up to 27 percent of production costs), production of susceptible varieties can become unviable for the majority of smallholder producers. In addition, high reliance upon fungicide based control requires integrated strategies for fungicide resistance avoidance in the pathogen. As resis. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Robert N G Miller - Integrante / David J Bertioli - Integrante / Ana Ciampi - Integrante / Alberto vilarinhos - Integrante / Paula Kuser-Falcão - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro / Universidade Católica de Brasília - Outra.
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2006 - 2009
Mygene - Mycosphaerella graminicola e Mycosphaerella fijiensis, Descrição: Anotação de vias de sinalização de sinal e prospecção de genes relacionados a patogenicidade em genomas de M. graminicola e M. fijiensis. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador.
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2004 - 2006
MusaGeneBR Identificação e caracterização funcional de genes de resistência a estresses bióticos e seqüência promotora de expressão gênica em banana (Musa spp.)., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Roberto C Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / Manoel Teixeira Souza Jr - Coordenador / Candice M R Santos - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 13
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2003 - 2006
Melhoramento Genético de Bananeira para Resistência a Doenças. Projeto nº 0202412 do Macroprograma 2 da Embrapa., Descrição: O Projeto visa estudar a herança da resistência à Sigatoka, mediante a avaliação de populações diplóides segregantes, isolar genes de resistência, construir mapas genômicos, obter novos genótipos de bananeira por hibridação e outros métodos não convencionais, bem como avaliar os caracteres agronômicos e organolépticos e de resistência às sigatokas de novos híbridos de bananeira em diferentes locais e a variabilidade genética de Mycosphaerella no Brasil.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / Manoel Teixeira Souza Jr - Integrante / CAndice Romero dos Santos - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3
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2003 - 2005
Plano de Ação 4 no Projeto Melhoramento Genético de Bananeira para Resistência a Doenças. Projeto nº 0202412 do Macroprograma 2 da Embrapa., Descrição: A bananeira é cultivada de Norte a Sul do País e praticamente, toda fruta produzida é comercializada no mercado interno. A maioria dos bananicultores é composta por pequenos produtores, que utilizam a banana como fonte de renda em seu orçamento. As principais cultivares utilizadas são suscetíveis a pragas e doenças, pouco produtivas e apresentam porte alto. O Projeto visa estudar a herança da resistência à Sigatoka, mediante a avaliação de populações diplóides segregantes, isolar genes de resistência, construir mapas genômicos, obter novos genótipos de bananeira por hibridação e outros métodos não convencionais, bem como avaliar os caracteres agronômicos e organolépticos e de resistência às sigatokas de novos híbridos de bananeira em diferentes locais e a variabilidade genética de Mycosphaerella no Brasil. Serão obtidas populações segregantes a partir de cruzamentos de genótipos diplóides (AA) contrastantes para resistência à Sigatoka. Progenies destas populações serão inoculadas com os agentes causais das sigatokas selecionando-se aquelas que apresentarem segregação mendeliana esperada, as quais serão utilizadas para o estudo de marcadores moleculares e construção de mapas. Utilizando a técnica de DD-RT-PCR genes de resistência às sigatokas negra e amarela serão identificados e isolados por meio de extração de RNA de bananeiras resistentes e suscetíveis, e mediante análise de ESTs e RGAs de um genótipo resistente. Novos genótipos com diferentes níveis de plóidia serão obtidos por hibridação, mutação, transgenia, fertilização in vitro, hibridação somática e duplicação do número de cromossomos. Para seleção de híbridos diplóides resultantes do melhoramento por hibridação, empregar-se-á a técnica do índice de seleção. Genótipos promissores serão submetidos a avaliações fisico-químicas e organolépticas. Os pré-selecionadas e com potencial de recomendação, serão avaliados em diferentes agroecossistemas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Manoel Teixeira Souza Jr - Integrante / Candice M R Santos - Integrante / Pietro Piffanelli - Integrante., Número de produções C, T & A: 3
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2002 - 2006
Musa genome frame-map construction and connection with the rice sequence, Descrição: O programa internacional para o melhoramento de Musa (PROMUSA), que é ligado à rede internacional para o melhoramento de banana e plátano (INIBAP), é um mecanismo de colaboração e troca de informações entre pesquisadores envolvidos no melhoramento genético de Musa e o programa Challange Program Generation pretendem caracterizar com a colaboração da Embrapa, todos os genes envolvidos em tolerancia a seca em individuos caracterizados fenotipicamente. Serão sequenciadas as bibliotecas de cDNA dessas plantas e analisadas por ferramentas de bioinformática.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Manoel Teixeira Souza Jr - Integrante / Candice M R Santos - Integrante., Financiador(es): Centro Internacional de Mejoramiento de Maiz Y Trigo - Auxílio financeiro.
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2002 - 2005
Modelagem Molecular de Proteínas de interesse biotecnológico, Descrição: Modelagem Molecular de Proteínas de interesse biotecnológico e em cooperação com instituições de pesquisa e ensino. Aplicação da metodologia de Modelagem Molecular por Homologia, threading e ab inition para a compreensão de relações estruturais e funcionais em proteínas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Bernard Maigret - Integrante / Jaime Martins Santana - Integrante / Antonio R L Teixeira - Integrante / Aline Rossi - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração., Número de produções C, T & A: 18
Projetos de desenvolvimento
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2008 - 2010
Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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2001 - 2005
Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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2008 - 2010
Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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2001 - 2005
Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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2008 - 2010
Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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2001 - 2005
Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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2008 - 2010
Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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2001 - 2005
Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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2001 - 2005
Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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2008 - 2010
Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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2001 - 2005
Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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2008 - 2010
Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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2001 - 2005
Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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2008 - 2010
Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
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2001 - 2005
Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação., Número de produções C, T & A: 13 / Número de orientações: 1
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2008 - 2010
Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
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2001 - 2005
Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração., Número de produções C, T & A: 14
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2008 - 2010
Desenvolvimento e/ou incorporação de ferramentas de bioinformática para armazenamento, processamento e visualização de dados genômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto C Togawa - Integrante / Alexandre R Caetano - Integrante.
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2002 - 2004
BIOFOCO, Descrição: BIOFOCO ? Rede de Pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste, pelo qual estão reunidas a Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia, a Universidade Católica de Brasília (UCB), a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (UFMS), desenvolve diversos projetos genoma de alcance nacional ou regional, tais como os genomas do eucalipto (genolyptus,), café, banana (promusa) e do fungo Paracoccidioides brasiliensis.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Georgios Pappas Jr - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Marcelo Macedo Brigido - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
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2001 - 2005
Análise da Estrutura Primária do Genoma de Musa acuminata (A), financiado pelo CNPq, e apropriado no Macroprograma 3 da Embrapa em 2003., Descrição: Diversas linhas de pesquisa foram selecionadas e priorizadas para se chegar a este objetivo maior, cabendo destacar o genoma estrutural, o genoma funcional, o mapeamento físico, o mapeamento genético, a avaliação de populações segregantes, a geração e avaliação de mutantes e a transgenia. A ação se dará em forma complementar e sinergística, onde laboratórios dos diversos países constituintes da Musagene irão dividir tarefas e compartilhar knowhow e informações sob a coordenação do PROMUSA. O objetivo geral do presente projeto é viabilizar a participação brasileira no Musagene. Este projeto permitirá, mediante cooperação técnico-científica estabelecida entre a Embrapa Cenargen, a UCB e o CIRAD-Fhlor, o estabelecimento de ações de pesquisa em genômica comparativa e funcional de Musa acuminata. Estas ações de pesquisa permitirão decifrar e disponibilizar, dentro das regras de cooperação estabelecidas pelo Musagene, seqüências de nucleotídeos presentes em quatro clones de BAC. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Natalia Florencio Martins - Coordenador / Roberto Coiti Togawa - Integrante / Felipe Rodrigues da Silva - Integrante / MAnoel Teixeira de Souza Junior - Integrante., Financiador(es): La Recherche Agronomique pour le Développement - Cooperação / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Remuneração / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 14
Prêmios
2011
Destaque da Unidade, Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia.
2010
Premiação por equipes - Projeto Rede Genomica Animal - categoria captação de recursos, Embrapa.
2008
Premiação Individual da Unidade, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
2008
Premiação Nacional Embrapa -Parceria - Projeto: Rede Genômica Animal, Embrapa - Premiação por Equipe.
2008
Premio de Reconhecimento Nacional, Embrapa.
2007
Premiação Nacional Embrapa -Qualidade técnica - Projeto: Análise genômica: genes envolvidos com a resistência a Meloidogyne spp., Embrapa., Embrapa, premiacao por equipe.
2006
Premiação Embrapa - Projeto:Transcriptoma de Musa, Embrapa.
2004
Premio por resultado de trabalho em equipe, Embrapa - Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Histórico profissional
Endereço profissional
-
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Agroindustria Tropical. , Rua Doutora Sara Mesquita, Pici, 60511110 - Fortaleza, CE - Brasil - Caixa-postal: 02372, Telefone: (61) 34483253, Ramal: 1, URL da Homepage:
Experiência profissional
2013 - 2014
Rothamsted ResearchVínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: pesquisador visitante, Regime: Dedicação exclusiva.
2006 - 2009
Empresa Brasileira de Pesquisa AgropecuáriaVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40
2001 - Atual
Empresa Brasileira de Pesquisa AgropecuáriaVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador III, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Pesquisador em bioinformática Genômica e Bioinformática estrutural
Atividades
-
01/2004
Pesquisa e desenvolvimento, Centro Nacional de Pesquisa de Recursos Genéticos e Biotecnologia, Laboratório de Bioinformática.,Linhas de pesquisa
-
11/2001
Pesquisa e desenvolvimento, Centro Nacional de Pesquisa de Recursos Genéticos e Biotecnologia, Laboratório de Bioinformática.,Linhas de pesquisa
-
07/2003 - 12/2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro Nacional de Pesquisa de Recursos Genéticos e Biotecnologia.,Cargo ou função, Secretária executiva da Comissão de Propriedade Intelectual.
-
07/2003 - 07/2003
Treinamentos ministrados , Centro Nacional de Pesquisa de Recursos Genéticos e Biotecnologia, Laboratório de Bioinformática.,Treinamentos ministrados, Workshop BIOFOCO em Bioinformática
2001 - 2001
Universidade de Brasília, UnBVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40
1999 - 2000
Universidade de Brasília, UnBVínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Pesquisador associado, Carga horária: 40
1998 - 1999
Universidade de Brasília, UnBVínculo: Professor Substituto, Enquadramento Funcional: Professor substituto, Carga horária: 40
Atividades
-
07/2000 - 10/2001
Pesquisa e desenvolvimento, Faculdade de Ciências da Saúde, Departamento de Patologia.,Linhas de pesquisa
-
08/2000 - 12/2000
Ensino, Ciencias Biologicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Fisiologia, Elementos de Fisiologia, Fisiologia 1, Fisiologia 2
1999 - 2000
Labóratório de Análises clínicas Hermes PardiniVínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Pesquisador associado, Carga horária: 40
1993 - 1994
Labóratório de Análises clínicas Hermes PardiniVínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Responsavel tecnica pelo setor HPLC, Carga horária: 44
Atividades
-
03/1993 - 08/1994
Serviços técnicos especializados , Laboratório de Cromatografia.,Serviço realizado, cromatografias de alta pressão.
2001 - 2005
Faculdade da Terra de BrasíliaVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 16
1991 - 1993
Inspetoria São João BoscoVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 20
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