Jose Roberto Ruggiero

2007

Livre-docência. , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil. , Título: Contribuições para a Modelagem de Moléculas Biológicas, Ano de obtenção: 2007., Palavras-chave: Simulação por Dinâmica Molecular; peptídeos antimicrobianos; mastoparanos; mistura TFE-água; localização de energia; breather.

1992 - 1994

Pós-Doutorado. , Universitá Degli Studi Di Trieste, UDSDT, Itália. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Italiano

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Física Clássica e Física Quântica; Mecânica e Campos.

Jose Roberto Ruggiero ; RUDGE, M. V. C. . O Papel do Coordenador de Curso de Graduação na Universidade Pública Brasileira. 2014. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; RUDGE, M. V. C. . Inovação na Gestão e Liderança. 2014. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; OLIVEIRA, M. T. V. A. . Movimento para a Saúde/2013. 2013. (Outro).

OLIVEIRA, M. T. V. A. ; Ruggiero, J.R. . Dia da Consciência Negra na UNESP. 2013. (Outro).

OLIVEIRA, M. T. V. A. ; Ruggiero, J.R. ; ORATI, P. L. ; POIATE, S. M. G. ; MENEZES, P. C. . Campanha "Novembro Azul" - Palestra. 2013. (Outro).

Ruggiero, José Roberto ; OLIVEIRA, M. T. V. A. ; IRIGOYEN, B. B. T. J. ; FINOCCHIO, A. M. N. . Palestra "Importância da Prevenção do Câncer de Mama". 2013. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; RUDGE, M. V. C. . O Papel dos ,Ddepartamentos e seus Gestores na Universidade Pública Brasileira. 2013. (Outro).

RUDGE, M. V. C. ; ITO, C. Y. K. ; SALGADO, A. M. P. ; CORTINA, A. ; TOVOLLI, E. M. G. ; Jose Roberto Ruggiero ; PINTO, J. P. A. ; SCHLUNZEN JUNIOR, K. ; BULL, L. T. ; LEITE, J. V. G. S. ; DOMINGUES, M. A. C. ; DELAMARO, M. ; TOMASINI, M. C. F. ; BUCCELLI, R. . Gestão Acadêmica. 2013. (Outro).

Ruggiero, José Roberto . 55o. Aniversário do IBILCE. 2012. (Outro).

Ruggiero, José Roberto . IV Encontro da Moderna Idade - IBILCE/UNESP. 2012. (Outro).

NEVES, A. C. D. ; da Silva, A.F. ; DRIGO FILHO, Elso ; Ruggiero, José Roberto ; Del Bianchi, V.L. ; Domingos, C.R.B. ; CORNELIO, M. L. ; Dall'aglio-Hattnher, M.M. . IV Encontro sobre Ciência, Popularização da Ciência e Alfabetização Científica. 2012. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; OLIVEIRA, M. T. V. A. . Movimento Saúde e Dia de Alerta sobre o Uso Excessivo de Álcool/2012. 2012. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; OLIVEIRA, M. T. V. A. . Dia da Consciência Negra na UNESP. 2012. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; de Pinho S Z . Fórum de Articulação dos Cursos de Física. 2012. (Outro).

Ruggiero, José Roberto ; OLIVEIRA, M. T. V. A. ; NEVES, A. C. D. . Ciência na Praça. 2011. (Exposição).

OLIVEIRA, M. T. V. A. ; RUGGIERO, J. R. . Dia de Alerta sobre o Uso Excessivo de Álcool e Movimento Saúde. 2011. (Outro).

OLIVEIRA, M. T. V. A. ; Ruggiero, José Roberto . 8a. VestFair - Feira do Vestibular. 2011. (Outro).

RUGGIERO, J. R. ; DRIGO FILHO, Elso ; COLOMBO, Marcio Francisco ; LEITE, Vitor Barbanti Pereira . III Semana de Física Biológica. 2006. (Congresso).

DRIGO FILHO, Elso ; RUGGIERO, J. R. ; RUGGIERO NETO, João ; COLOMBO, Marcio Francisco . XXXVII Latin-American School of Physics. 2006. (Congresso).

XI Semana da Física.Mesa Redonda ?Origens da Física Biológica no IBILCE?. 2023. (Outra).

Diálogos Sobre a Universidade Pública. 2018. (Simpósio).

I Simpósio Abresc: Negócios, Educação e Cultura.Os desafios da getstão na educação em rede. 2018. (Simpósio).

De FAFI a IBILCE - a UNESP no Rio Preto Shopping. 2016. (Exposição).

XLIII Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology. 2014. (Congresso).

"Gestão Acadêmica" - Escola UNESP de Liderança e Gestão. 2013. (Oficina).

Escola UNESP de Liderança e Gestão. 2013. (Outra).

Palestra "Saúde Masculina: Prevenção do Câncer de Prósttata. 2013. (Outra).

V Encontro sobre Ciência, Popularização da Ciência - Alfabetização Científica. 2013. (Encontro).

V Fórum de Internacionalização da UNESP. 2013. (Outra).

3o. Ciclo de Debates do Plano de Desenvolvimento Institucional da UNESP. 2012. (Outra).

Curso de Expressão Verbal in Company - Reinaldo Polito - 16 horas. 2012. (Outra).

2o. Ciclo de Debates sobre a Universidade e os Índices Nacionais e Internacionais. 2011. (Outra).

III Encontro Sobre Ciência, Popularização da Ciência e Alfabetização Científica.Mesa de Abertura. 2011. (Encontro).

III Forum de Internacionalização da UNESP - Coloquío: Universidade sem Fronteiras. 2011. (Outra).

Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011.Mesa Redonda: "Estado da Arte e Rumos da Pesquisa Interdisciplinar". 2011. (Simpósio).

Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011.Estudo por Dinâmica Molecular do Anoplin em Solução Aquosa Contendo Micelas de SDS. 2011. (Simpósio).

XI Settimana Della Lingua Italiana nel Mondo: Buon compleanno Italia !. 2011. (Congresso).

XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Conformational analysis of isolated and in association protonectin and protonectin (1-6) peptides in water/TFE mixtures. 2010. (Congresso).

Mesa Redonda: Filosofísica ?Consciência Quântica e Vida Após a Morte".Filosofísica ?Consciência Quântica e Vida Após a Morte?. 2009. (Oficina).

VI Semana da Física Biológica.O Físico Biológico e o Mercado de Trabalho. 2009. (Outra).

XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Application of the replica exchange method in conformational analysis of the peptide protonectin in mixture TFE-water. 2009. (Congresso).

I Escola Brasileira de Bioinformática (EBB 2008). Structutural Features of Some Antimicrobial Peptides from Mastoparan Family: A Molecular Dynamics Study in Water-TFE Mixtures. 2008. (Congresso).

XXXI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. A comparative molecular dynamics study of the polybia-mp1 and mp-x peptides in mixtures of water-tfe: a possible explanation for the selectivity. 2008. (Congresso).

XXX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Conformational Features of Cepacian: The Exopolysaccharide Produced by Clinical Strains of Textit (Burkholderia Cepacia). 2007. (Encontro).

III Semana da Física Biológica.A história do Departamento de Física do IBILCE. 2006. (Seminário).

XVII Semana da Matemática.A Passagem da Física Clássica para a Quântica. 2005. (Seminário).

Curso de Extensão: Curso de Verão em Biofísica Molecular.Mini-Curso: Aspectos Conformacionais de Macromoléculas. 2003. (Outra).

CARVALHO, S. J.;RUGGIERO, J. R.; SLADE, N. B. L.. Efeitos da Regulação de Carga na Interação entre Macroíons e Superfícies Carregadas. 2022.

LINS NETO, R. D.;CHAHINE, JorgeRuggiero, J.R.. Estudo por dinâmica molecular da ação do colesterol sobre o acoplamento entre as faces de bicamadas fosfolipidicas. 2017. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

ARAUJO, A. S.; NAAL, R. M. Z. G.;Ruggiero, J.R.. Estudo de interações de complexos de inclusão flavonóide/ciclodextrina com modelos de membrana biológica por simulações de dinâmica molecular. 2016. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

ARAUJO, A. S.;Ruggiero, J.R.; SLADE, N. B. L.. Estudo da interação de peptídeos antimicrobianos com modelo de membrana por simulações de Dinâmica Molecular.. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

ARAUJO, A. S.;Ruggiero, J.R.; NAAL, R. M. Z. G.. Estudos das interações de complexos de inclusão flavonoide/ciclodextrina com modelos de membrana biológica por simulações de Dinâmica Molecular.. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CARVALHO, S. J.; SOUZA, A. R.;Ruggiero, José Roberto. Estudo por simulação computacional da interação entre polianfóteros fracos e macroíons cilíndricos. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Souza, F.P.; Toledo, K.A.;Ruggiero, José Roberto. Estudo da interação da proteína de fusão do vírus Sincicial Respír4atório Humano com Heparina Sulfatada e Flavonóides. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

SCOTT, Luiz Paulo Barbour;Ruggiero, José Roberto; KAMIENSKI, C.. Uso de Data Mining na Descoberta ou Identificação de Regras de Enovelamento baseada em Perfis de Hidrofobicidade. 2011. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

RUGGIERO, J. R.; FREITAS, Luiz Carlos Gomide; PALMA, M. S.. Interação do Peptídeo MP-I com micela de SDS em Solução Aquosa: Um Estudo por Dinâmica Molecular. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ruggiero, José Roberto; PASCUTI, Pedro G;Cabrera, M P S. Análise Conformacional dos Peptídeos Protonectina (1-6), isolados e em associação, em Mistrura tfe-água. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CORNELIO, M. L.; SCOTT, Luiz Paulo Barbour;Ruggiero, José Roberto. Análise Vibracional do alfa-tocoferol. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

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CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.; ARAUJO, A. S.. Estruturação do Mastoparano por Dinâmica Molecular em Misturas de TFE-Água. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

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RUGGIERO, J. R.; FREITAS, Luiz Carlos Gomide; SILVA, Fernando Luis Barroso da. O efeito da solvatação na conformação de cadeias ácidas poligalacturônicas (PGA). 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DRIGO FILHO, ElsoRUGGIERO, J. R.; BATAGIN NETO, A.; RICOTTA, R. M.; SCHMIDTT, F. D. M.. Estudo de potenciais harmônicos biestáveis para a descrição de fenômenos de transferência eletrônica. 2024 - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

ARCISIO-MIRANDA, M.; OLIVEIRA, R. J.; PASCUTI, Pedro G; ARAUJO, A. S.;Ruggiero, J.R.. Investigação do modo de ação independente de receptores do endocanabinóide anandamida por dinâmica molecular. 2019. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Souza, F.P.; Tiera, M.J.; SEIXAS, F. A. V.;SLADE, Gabriel GouvêaRuggiero, J.R.. Estudo estrutural da proteína SH do vírus sincicial respiratório humano (HRSV) utilizando dinâmica molecular e análise dinâmica do TRP41 da proteína M2 do vírus influenza A (IAV) por ressonância magnética nuclear do estado sólido. 2018. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

ARAUJO, A. S.; Caruso, I.P.; CAFFARENA, E. R.; OLIVEIRA, R. J.;Ruggiero, J.R.. Estudo da interação entre o pepídeo de fusão da proteína E do vírus da dengue com modelos de membrana biológica por simulações de Dinâmica Molecular. 2018. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

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LEONEL, E. D.; SARTORELLI, J. C.;RUGGIERO, J. R.; BEIMS, M. W.; RECH, P. C.. Transporte, escape de partículas e propriedades dinâmicas de mapeamento não lineares. 2014. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Ruggiero, J.R.; WEBER, G.; CALIRI, Antonio; LEONEL, E. D.;CHAHINE, Jorge. Modelos Mecânicos para o Estudo da Dinâmica do DNA. 2013. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ruggiero, José Roberto; ARAUJO, A. S.; PASCUTI, Pedro G; Pires, J.M.; COSTA, S. T. B.. Simulações por Dinâmica Molecular fine-ecoarse-grained das interações intermoleculares entre peptídeos antimicrobianos da família Mastoparano e membranas modelo. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

LEITE, Vitor Barbanti Pereira; ARAUJO, A. F. P.; ALVES, N. A.; SCOTT, Luiz Paulo Barbour;Ruggiero, José Roberto. Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteína. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

ALVES, N. A.; OLIVEIRA, M. J.;CHAHINE, Jorge; SILVA, Fernando Luis Barroso da;Ruggiero, José Roberto. Simulações Microcanônicas de Proteínas. 2010. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

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RUGGIERO, J. R.; CAFFARENA, E. R.; FREITAS, Luiz Carlos Gomide; ARAUJO, A. S.;CHAHINE, Jorge. Estudo Conformacional do Cepacian - um Exopolissacarídeo da Burkholderia cepacia. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.. Estudos Conformacionais por Dinâmica Molecular de Peptídeos Antimicrobianos da Família dos Mastoparnos em Misturas de TFE-Água. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

AZEVEDO JR, Walter Filgueira de; OLIVEIRA, Paulo Sergio Lopes de; FALCÃO, Paula Regina Kuser;CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.. Bioinformática estrutural aplicada ao estudo de proteínas alvo do genoma do Mycobacterium tuberculosis. 2005. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.. Estudo do Sistema Micelar de Octanoato de Sódio por Simulação Computacional. 2004. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de São Carlos.

RUGGIERO, J. R.; FREITAS, Luiz Carlos Gomide; SERVÚLO FILHO, Ademar; CHAIMOVICH, Hernan. Estudo de Estruturas, Interações e Reconhecimento Molecular em Carboidratos utilizando Simulação Computacional. 2004. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de São Carlos.

CALIRI, Antonio;CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.. Enovalemaneto determinístico de macromoléculas. 2002 - Universidade de São Paulo.

FELICIANO, G. T.;RUGGIERO, J. R.; GUIDO, R. V. C.. Algoritmos Genéticos Aplicados ao Planejamento Racional Termodinâmico de Anticorpos Miméticos baseados no domínio GB1 da Proteína G Estreptocócica: um estudo de simulação atomística e validação experimental. 2023 - Instituto de Química.

Souza, F.P.; SCOTT, A. L.;RUGGIERO, J. R.. Computational study on the allosteric mechanism of Leishmania major IF4E-1 by 4E - interacting protein - 1: Unravelling the determinants of m7 GIP cap recognition.. 2021. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

ARAUJO, A. S.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira;Ruggiero, J.R.. Estudo do modo de ação independente de receptores do endocanabinoide anandamida por dinâmica molecular. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CARVALHO, S. J.;CHAHINE, JorgeRuggiero, J.R.. Estudo das interações eletrostáticas em superficies e macromoleculas por meio de simulações Monte Carlo. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Souza, F.P.;Ruggiero, J.R.; OLIVEIRA, R. J.. Estudos Biofísicos e de interação com a quercetina das proteínas SH do vírus sincicial respiratório humano (HRSV) e M2 do vírus da Influenza A (IAV). 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Jose Roberto Ruggiero; MANACERO JUNIOR, A.;CHAHINE, Jorge. Predição de Sítios de Ligação para Cisplatina e transplatina baseada em ligações de hidrogênio. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ruggiero, José RobertoCHAHINE, Jorge; FOSSEY, Marcelo Andrés. Modelos Mecânicos Simples para o Estudo da Dinâmica do DNA. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.; CARVALHO, S. J.. Estudos Estruturais por Dinâmica Molecular do Peptídeo Polybia-MPI via réplica exchange. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

SILVA, M. A. A.;Ruggiero, José Roberto; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Simulação do Enovelamento de Modelo Proteíco Utilizando o Método de Crescimento de Cadeias. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;DRIGO FILHO, ElsoRuggiero, José Roberto. Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

FEITOSA, Eloi da Silva;RUGGIERO, J. R.; FOSSEY, Marcelo Andrés. Simulação de Dinâmica Molecular de poly(etileno glicol) em água. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;DRIGO FILHO, ElsoRUGGIERO, J. R.. Dinâmica de modelos minimalistas de solvente em reações de transferência de elétrons: aplicação à experimentos de única molécula. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

COLOMBO, Marcio Francisco;RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge. Efeito de Volume Excluso no Enovelamento de Proteínas. 2003. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

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ARAUJO, A. S.;Ruggiero, J.R.Cabrera, M P S. Estudo da interação de peptídeos antimicrobianos com modelos de membrana por simulações de dinâmica molecular.. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

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Jose Roberto Ruggiero; CARVALHO, S. J.; OLIVEIRA, L. C.. Simulações por Dinâmica Molecular de Bicamadas Fosfolipídicas: Efeitos da Concentração de Lipídios Carregados em Bicamadas Mistas. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ruggiero, José RobertoCHAHINE, Jorge; CARVALHO, S. J.. Estudo Conformacional por Dinãmica Molecular do Peptídeo Anoplin com Micela de SDS em Solução Aquosa. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

NERY, J. G.;Ruggiero, José Roberto; OYAMA, R. S. K.. Síntese e Caracterização de Partículas Derivadas de Poli(Alcool) Vinilico) (PVA) para Embolização e Quimioembolização. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

AGOSTINHO NETO, Augusto;Ruggiero, José Roberto; CARVALHO, S. J.. Introdução ao Estudo Básico de Reações de Transferência de Elétrons e Descrição do Modelo de Marcus. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ruggiero, José RobertoCHAHINE, Jorge; ARAUJO, A. S.. Estudo da Estabilidade do Peptídeo EMP-AF-MH2 sob Troca da Glicina 9 por uma Serina e Influência do Tratamento das Interações de Longo Alcance na Estrutura Secundária do Peptídeo Mutado. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;CHAHINE, JorgeRuggiero, José Roberto. Modelo Computacional Minimalista em Enovelamento de Proteínas: Visualização do Funil de Enovelamento de Proteína. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DRIGO FILHO, ElsoRuggiero, José Roberto; SALEHYAN, P.. Supersimetria Aplicada à Mecânica Quântica: Solucções Exatas para Potenciais Quânticos dos Tipos Polinomiais, Não-Polinomiais e Mistos. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CARVALHO, S. J.;Ruggiero, José Roberto; AGOSTINHO NETO, Augusto. Estudo por Simulação Computacional da Dupla Camada Elétrica Cilíndrica: Efeito da Distribuição de Carga da Macromolécula e da Valência dos Íons. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

SANTOS, L. F.;RUGGIERO NETO, JoãoRuggiero, José Roberto. Formação de Lipossomas sob Influência de Campo Elétrico Externo Alternado. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ruggiero, José RobertoDRIGO FILHO, Elso; CORNELIO, M. L.. Estudo da Localização de Anderson em Redes Harmônicas com Defeito. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge. Estudo de Proteínas de Rápido Enovelamento com Modelos Baseados em Estrutura. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;CHAHINE, JorgeRuggiero, José Roberto. Estudos de Proteínas de Rápido Enovelamento com Modelos Baseados em Estruturas. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

SANTOS, L. F.;Ruggiero, José Roberto; CARVALHO, S. J.. Modelagem Teórica da Injeção e Transporte de Cargas em Semiconditores Optoeletrônicos Poliméricos. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;CHAHINE, JorgeRuggiero, José Roberto. Estudo de Modos Normais de Proteínas através do Método de Normal Mode Analysis (NMA). 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.; AGOSTINHO NETO, Augusto;DRIGO FILHO, Elso. Posibilidade da Existência de Ondas não Lineares na Cadeia de DNA: Caso Estacionário. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.RUGGIERO NETO, JoãoCHAHINE, Jorge. Estudo Conformacional do Cepacian. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DRIGO FILHO, ElsoRUGGIERO, J. R.; COSTA, J. C. F.. Sistemas Massa-Mola Complexos. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO NETO, JoãoRUGGIERO, J. R.; FOSSEY, Marcelo Andrés. Contribuição Eletrostática na Interação de Peptídeos Líticos com Membranas Modelo. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

FOSSEY, Marcelo Andrés;RUGGIERO, J. R.DRIGO FILHO, Elso. Estudo da Competicação entre Ca+2 e Íons Monovalentes na Interação com Ácidos Nucléicos utilizando a Teoria de Poisson Boltzmann e o Modelo de Condensação de Contraíons. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DRIGO FILHO, ElsoRuggiero, José Roberto; RANGA, A. S.. Soluções Exatas para Potenciais Quânticos Singulares. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DRIGO FILHO, ElsoRuggiero, José Roberto; COSTA, J. C. F.. Mecânica Quântica Supersimétrica com Condição de Contorno. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.; SANTOS, L. F.; PAULA, L. C.. Poços Quânticos. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge; COSTA, S. T. B.. Estudo Conformacional por Dinâmica Molecular do EMP-AF: Efeitos de Troca do Resíduo Gly9 por outro Resíduo Hidrofóbico na Estrutura Helicoidal Anfipática. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.DRIGO FILHO, ElsoCHAHINE, Jorge. Estudo da Condutividade Térmica em uma Rede Homogênea de Osciladores Harmônicos. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.; COSTA, S. T. B.; ABREGO, J. R. B.. Estudos Conformacionais por Dinâmica Molecular do Peptídeo Antimicrobiano Eumenine Mastoparan-AF com Resíduos de Aminoácidos Polares trocados em Mistura de TFE-Água. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DRIGO FILHO, ElsoRUGGIERO, J. R.; AGOSTINHO NETO, Augusto. O Formalismo Supersimétrico e suas Aplicações em Mecânica Quântica. 2006. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

AGOSTINHO NETO, Augusto;RUGGIERO, J. R.DRIGO FILHO, Elso. Interações eletrostáticas de aglomerados moleculares em eletrólitos. 2005. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.; AGOSTINHO NETO, Augusto. Uso da rede elástica na predição de estruturas protéicas. 2005. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Estudo da dinâmica do modelo de Peyrard-Bishop não homogêneo para DNA. 2005. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira; AGOSTINHO NETO, Augusto. Aspectos Topológicos de Proteínas otimamente desenhadas em rede cúbica. 2004. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. O Uso do Método de crescimento de cadeias no estudo do enovelamento de proteínas. 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Estudo Estrutural por Dinâmica Molecular do Exopolissacarídeo da Burkholderia Cepacia: Cepacian. 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.; AGOSTINHO NETO, Augusto;CHAHINE, Jorge. O efeito da solvatação na conformação de cadeias ácidas poligalacturônicas (PGA). 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

SILVA, Fernando Luis Barroso da;RUGGIERO, J. R.; AGOSTINHO NETO, Augusto. Estudo metodológico dos aspectos eletrostáticos da interação ligante-biomolécula. 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;RUGGIERO, J. R.RUGGIERO NETO, João. Comportamento termodinâmico e a cinética de mutações de proteínas otimamente desenhadas em modelos de rede. 2002. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DRIGO FILHO, ElsoRUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge. Tunelamento quântico em potencial bi-estável. 2002. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge; AZEVEDO JR, Walter Filgueira de. Análise Conformacional de Peptídeos usando o Recozimento Simulado Generalizado (GSA). 2002. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.; NERY, J. G.; CARVALHO, S. J.. Concurso Público para Contratação de Professor Substituto. 2023. Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

RUGGIERO, J. R.; ROCHA, M. S.; ITRI, R.. Concurso Público para Contratação de Professor Assistente Doutor. 2023. Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas.

Ruggiero, J.R.; COSTA FILHO, Antonio José da; SALINAS, R. K.. Concurso Público para Contratação de Professor Assistente Doutor. 2022. Universidade Estadual Paulista - Câmpus de Sao Jose do Rio Preto.

Ruggiero, J.R.; NERY, J. G.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Concurso Público para Contratação de Professor Substituto. 2021. Universidade Estadual Paulista - Câmpus de Sao Jose do Rio Preto.

CARVALHO, S. J.; ABREGO, J. R. B.;Ruggiero, J.R.. Concurso público de provas e títulos para contratação de Professor Substituto. 2016. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ruggiero, José Roberto; ABREGO, J. R. B.; FEITOSA, Eloi da Silva. Comissão Julgadora do Concurso Público para contratação emergencial de Professor Substituto. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.; COSTA FILHO, Antonio José da; RAMOS, Carlos Henrique Inácio. Concurso Público de Provas e Títulos para preenchimento de uma função de Professor Assistente. 2004. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Godoy, M.F.; Godoy, J.M.P.; Romano, B.W.; Pinto, F.J.R.;Ruggiero, José Roberto. A Psicossomática Psicanalítica. 2008. Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto.

RUGGIERO, J. R.; CALIRI, Antonio; TABAK, M.; SOUZA, A. R.. Concurso Público de Títulos e Provas para obtenção do Título de Livre-Docente. 2008. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto/USP.

CARVALHO, S. J.;DRIGO FILHO, ElsoRuggiero, J.R.. Comissão Examinadora de Exame de Qualificação para Mestrado. 2022. Universidade Estadual Paulista - Câmpus de Sao Jose do Rio Preto.

DRIGO FILHO, ElsoCHAHINE, JorgeRuggiero, J.R.. Comissão Examinadora de Exame de Qualificação - tese de Doutorado. 2022. Universidade Estadual Paulista - Câmpus de Sao Jose do Rio Preto.

OLIVEIRA, L. C.; XIMENES, V. F.;Ruggiero, J.R.. Comissão Examinadora de Exame de Qualificação - Tese de Doutorado. 2022. Universidade Estadual Paulista - Câmpus de Sao Jose do Rio Preto.

Souza, F.P.; SCOTT, A. L.;Ruggiero, J.R.. Comissão Examinadora de Exame de Qualificação - Tese de Doutorado. 2021. Universidade Estadual Paulista - Câmpus de Sao Jose do Rio Preto.

CORNELIO, M. L.;Ruggiero, José RobertoCHAHINE, Jorge. Comissão Examinadora de Exame de Qualificação de Mestrado. 2010. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

BRUNI, A. T.;Ruggiero, José RobertoDRIGO FILHO, Elso. Comissão Examinadora do Exame de Qualificação de Mestrado. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DRIGO FILHO, ElsoCHAHINE, JorgeRuggiero, José Roberto. Comissão Examinadora de Exame de Qualificação de Mestrado. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DRIGO FILHO, Elso; WEBER, G.;Ruggiero, José Roberto. Comissão Examinadora de Exame de Qualificação de Mestrado. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

SCOTT, Luiz Paulo Barbour;Ruggiero, José Roberto. Membro da Comissão Examinadora do Exame de Qualificação de Angélica Nakagawa Lima. 2009. Universidade Federal do ABC.

Estudo por dinâmica molecular dos efeitos da concentração de colesterol sobre o acoplamento entre as faces de bicamadas fosfolipídicas; 2017; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Prospecção de caracteristicas estruturais de peptideos com ação leishmanicida: projeto para sintese; 2014; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Interação do Peptídeo MP-I com micela de SDS em Solução Aquosa: Um Estudo por Dinâmica Molecular; 2010; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Aplicação do Métdo de Troca de Replicas na Análise Conformacional dos Peptídeos Protonectina e Protonectina(1-6), Isolados e em Associação, em Misturas TFE-Água; ; 2010; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Formação e Estabilidade de Breathers no Modelo de Peyrar-Bishop para o DNA; 2009; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo por Dinâmica Molecular da Estabilidade de Dímeros do Peptídeo EMP-AF em Água e Mistura TFE-Água; 2007; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo da Dinâmica do Modelo de Bishop Peyrard não Homogêneo para o DNA; 2006; 0 f; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Modelo Dinâmico para o DNA; 2003; 0 f; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

O efeito da solvatação na conformação de cadeias ácidas poligalacturônicas (PGA); 2003; 0 f; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo por dinamica molecular de: mono, di e trissacarídeo de ácido alfa-D-galacturönico; 1998; 0 f; Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo da partição de moléculas de curcumina em bicamadas compostas de POPC e Colesterol; 2022; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Investigação do modo de ação independente de receptores do endocanabinóide anandamida por dinâmica molecular; 2019; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudos computacionais de macromoleculas de interesse biológico; ; 2017; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Predição de Sítios de Ligação para Cisplatina e transplatina baseada em ligações de hidrogênio; 2015; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo das Interações de Peptídeos Antimicrobianos e Sistemas Miméticos de Membrana por Dinâmica Molecular; 2014; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Modelos Mecânicos para o Estudo da Dinâmica do DNA; 2013; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Simulações por Dinâmica Molecular fine-ecoarse-grained das interações intermoleculares entre peptídeos antimicrobianos da família Mastoparano e membranas modelo; 2012; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Modelo Dinãmico e Estatístico Aplicado a Transição de Fase; 2009; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Modelo Vibro-rotacional para a molécula do DNA; 2008; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Análise Atomística das Interações entre Peptídeos Antimicrobianos e Membranas Lipídicas; 2008; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo Conformacional do Cepacian - um Exopolissacarídeo da Burkholderia Cepacia; 2007; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudos Conformacionais por Dinâmica Molecular de Peptídeos Antimicrobianos da Família dos Mastoparnos em Misturas de TFE-Água; 2006; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Investigação da Utilização de Algoritmos Genéticos e Redes Neurais Artificiais na Predição de Estruturas Protéicas; 2003; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, ; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Modelo estatístico para a molécula do DNA; 2003; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo de alguns aspectos do ácido desoxirribonucleico (DNA) e mecanica quantica supersimétrica; 1992; 0 f; Tese (Doutorado em Física) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Simulação por Dinâmica Molecular de Bicamadas Fosfolipídicas: Efeitos da Concentração de Lipídios Carregados em Bicamadas; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo Conformacional por Dinãmica Molecular do Peptídeo Anoplin com Micela de SDS em Solução Aquosa; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo da Estabilidade do Peptídeo EMP-AF-NH2 sob troca da Glicina 9 por uma Serina e Influência do Tratamento das Interações de Longo Alcance na Estrutura Secundária do Peptídeo Mutado; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo da Localização de Anderson em Redes Harmônicas com Defeito; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo Conformacional por Dinâmica Molecular do EMP-AF: Efeitos de Troca do Resíduo Gly9 por outro Resíduo Hidrofóbico na Estrutura Helicoidal Anfipática; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo da Condutividade Térmica em uma Rede Homogênea de Osciladores Harmônicos; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudos Conformacionais por Dinâmica Molecular do Peptídeo Antimicrobiano Eumenine Mastoparan-AF com Resíduos de Aminoácidos Polares trocados em Mistura de TFE-Água; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Análise Numérica das Condições para Localização de Energia no Modelo de Peyrard-Bishop para o DNA com Sequência Aleatória; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Possibilidade da Existência de Ondas não Lineares na Cadeia de DNA: Caso Estacionário; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo Conformacional do Cepacian; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Paralelização de um Código para geração de estatísticas conformacionais de cadeias polissacarídicas - Fase 2; 1999; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Paralelização de um código para Geração de Estatísticas Conformacionais de Cadeias Polissacarídicas; 1998; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Simulação e animação gráfica de um polímero em uma rede bidimensional e tridimensional usando o método de Monte Carlo; 1991; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Simulação e animação gráfica de um polímero em uma rede bidimensional e tridimensional usando o método de Monte Carlos; 1991; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo Conformacional por Dinâmica Molecular de Peptídeos Antimicrobianos da Família dos Mastoparanos em Ambientes Diversos que Mimetizem Membranas Biológicas; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Física Biológica) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Universidade Estadual Paulsita; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo Conformacional por Dinâmica Molecular de Peptídeos Antimicrobianos da Família dos Mastoparanos em AM,bientes Diversos que Mimetizam membranas Biológicas; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulsita; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo do Movimento de um Par de Pêndulos Acoplados por uma Mola Helicoidal; 2006; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulsita; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo do Movimento de um Par de Pêndulos Acoplados por uma Mola Helicoidal; 2006; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulsita; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo da dinâmica de sistemas não lineares: o comportamento caótico do pêndulo físico forçado; 2005; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Unesp; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Preservação das fontes da educação brasileira: a estruturação do arquivo histórico da FAFI/São José do Rio Preto; 2004; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Dinâmica da Cadeia de Osciladores Harmônicos; 2003; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Unesp; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Introdução ao uso de um pacote de simulação computacional por dinamica molecular; 1995; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Aplicação do método de Runge-Kutta ao movimento de osciladores acoplados sujeitos ao potencial elástico (linear) e de Morse (não linear); 1994; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Perturbações em Órbitas de Satélites; 1988; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

BAAE I "Estudo do Potencial de Lennard-Jones"; 2016; Orientação de outra natureza; (Física) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

A Música e a Comunidade; 2012; Orientação de outra natureza; (Letras - Espanhol) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, PROEX/UNESP; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

A Música e a Comunidade; 2011; Orientação de outra natureza; (Matemática) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

A Música e a Comunidade; 2010; Orientação de outra natureza; (Licenciatura Em Letras) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Introdução ao Estudo de Sistemas Não Lineares; 2009; Orientação de outra natureza; (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo de uma cadeia de osciladores harmônicos com uma impureza na massa; 2009; Orientação de outra natureza; (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo de Equações Não Lineares em Sistemas Simples; 2009; Orientação de outra natureza; (Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo de Sistemas Caóticos: O Mapa Logístico e o Mapa de Lorenz; 2009; Orientação de outra natureza; (Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

A Música e a Comunidade; 2009; Orientação de outra natureza; (Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

A Música e a Comunidade; 2008; Orientação de outra natureza; (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, PROEX/UNESP; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

A Música e a Comunidade; 2008; Orientação de outra natureza; (Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, PROEX/UNESP; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Estudo do Tratamento Estatístico de Cadeias Poliméricas; 2006; Orientação de outra natureza; (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Preservação de fontes de educação brasileira: a estruturação do arquivo histórico da FAFI/São José do Rio Preto; 2004; 0 f; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Bolsa de Assistência Ao Estudante; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Preservação de fontes de educação brasileira: a estruturação do arquivo histórico da FAFI/São José do Rio Preto; 2003; 0 f; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Bolsa de Assistência Ao Estudante; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Ruggiero, J.R. . Arbitragem Revista Ecletica Quimica Journal. 2019.

Ruggiero, J.R. . Parecer em Relatório de Projeto de Pesquisa para a Fapesp. 2018.

Ruggiero, J.R. . Parecer em Projeto de Pesquisa para a FAPESP. 2016.

Ruggiero, J.R. . Parecer em Projeto de Pesquisa para a CNPq. 2016.

Ruggiero, J.R. . Projeto de Pesquisa de pós­Doutorado para a FAPESP. 2015.

Jose Roberto Ruggiero . Parece emitido em projeto de pesquisa. 2014.

RUGGIERO, J. R. . Parecer emitido em 03 (três) Projetos de Extensão Universitária. 2014.

RUGGIERO, J. R. . Parece emitido em 5 (cinco) projetos de pesquisa. 2013.

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