Jose Roberto Ruggiero

Licenciado em Física pela Universidade Federal de São Carlos (1974), obteve os títulos de mestre e de doutor em Física pelo Instituto de Física Teórica da Unversidade Estadual Paulista em (1977) e (1985), respectivamente. Atualmente é professor adjunto da Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. A área de formação (mestrado e doutorado) foi a física básica com a quantização do campo eletromagnetico em cavidades, o problema de Casimir e os procedimentos de regularização analítica. Desde o início dos anos 90, contudo tem se dedicado à modelização de moléculas de interesse biológico, usando técnicas estatísticas para analisar cadeias de polissacarídeos, a dinâmica molecular de sacarídeos e peptídeos antimicrobianos pertencentes à família dos mastoparanos, nome genérico de peptideos extraídos do veneno de vespas e modelos mecânicos simples para estudar a dinâmica e a desnaturação térmica do ADN.

Informações coletadas do Lattes em 28/10/2019

Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Física

1978 - 1985

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Efeito de Casimir em Cavidades Esféricas
Orientador: Abraham Hirsz Zimerman
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Efeito Casimir; Quantização do Campo Eletromagnético; Cavidades Esféricas.Grande área: Ciências Exatas e da TerraSetores de atividade: Educação.

Mestrado em Física

1976 - 1977

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Aplicação da Regularização Analítica para as Forças de Casimir,Ano de Obtenção: 1977
Orientador: Abraham Hirsz Zimerman
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Quantização do Campo Eletromagnético; Efeito Casimir; Regularização Analítica.Grande área: Ciências Exatas e da TerraSetores de atividade: Educação.

Graduação em Licenciatura Em Física

1971 - 1974

Universidade Federal de São Carlos

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Pós-doutorado

2007

Livre-docência. , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil. , Título: Contribuições para a Modelagem de Moléculas Biológicas, Ano de obtenção: 2007., Palavras-chave: Simulação por Dinâmica Molecular; peptídeos antimicrobianos; mastoparanos; mistura TFE-água; localização de energia; breather.

1992 - 1994

Pós-Doutorado. , Universitá Degli Studi Di Trieste, UDSDT, Itália. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

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Idiomas

Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Italiano

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Física Clássica e Física Quântica; Mecânica e Campos.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

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Organização de eventos

Jose Roberto Ruggiero ; RUDGE, M. V. C. . O Papel do Coordenador de Curso de Graduação na Universidade Pública Brasileira. 2014. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; RUDGE, M. V. C. . Inovação na Gestão e Liderança. 2014. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; OLIVEIRA, M. T. V. A. . Movimento para a Saúde/2013. 2013. (Outro).

OLIVEIRA, M. T. V. A. ; Ruggiero, J.R. . Dia da Consciência Negra na UNESP. 2013. (Outro).

OLIVEIRA, M. T. V. A. ; Ruggiero, J.R. ; ORATI, P. L. ; POIATE, S. M. G. ; MENEZES, P. C. . Campanha "Novembro Azul" - Palestra. 2013. (Outro).

Ruggiero, José Roberto ; OLIVEIRA, M. T. V. A. ; IRIGOYEN, B. B. T. J. ; FINOCCHIO, A. M. N. . Palestra "Importância da Prevenção do Câncer de Mama". 2013. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; RUDGE, M. V. C. . O Papel dos ,Ddepartamentos e seus Gestores na Universidade Pública Brasileira. 2013. (Outro).

RUDGE, M. V. C. ; ITO, C. Y. K. ; SALGADO, A. M. P. ; CORTINA, A. ; TOVOLLI, E. M. G. ; Jose Roberto Ruggiero ; PINTO, J. P. A. ; SCHLUNZEN JUNIOR, K. ; BULL, L. T. ; LEITE, J. V. G. S. ; DOMINGUES, M. A. C. ; DELAMARO, M. ; TOMASINI, M. C. F. ; BUCCELLI, R. . Gestão Acadêmica. 2013. (Outro).

Ruggiero, José Roberto . 55o. Aniversário do IBILCE. 2012. (Outro).

Ruggiero, José Roberto . IV Encontro da Moderna Idade - IBILCE/UNESP. 2012. (Outro).

NEVES, A. C. D. ; da Silva, A.F. ; DRIGO FILHO, Elso ; Ruggiero, José Roberto ; Del Bianchi, V.L. ; Domingos, C.R.B. ; CORNELIO, M. L. ; Dall'aglio-Hattnher, M.M. . IV Encontro sobre Ciência, Popularização da Ciência e Alfabetização Científica. 2012. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; OLIVEIRA, M. T. V. A. . Movimento Saúde e Dia de Alerta sobre o Uso Excessivo de Álcool/2012. 2012. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; OLIVEIRA, M. T. V. A. . Dia da Consciência Negra na UNESP. 2012. (Outro).

Jose Roberto Ruggiero ; de Pinho S Z . Fórum de Articulação dos Cursos de Física. 2012. (Outro).

Ruggiero, José Roberto ; OLIVEIRA, M. T. V. A. ; NEVES, A. C. D. . Ciência na Praça. 2011. (Exposição).

OLIVEIRA, M. T. V. A. ; RUGGIERO, J. R. . Dia de Alerta sobre o Uso Excessivo de Álcool e Movimento Saúde. 2011. (Outro).

OLIVEIRA, M. T. V. A. ; Ruggiero, José Roberto . 8a. VestFair - Feira do Vestibular. 2011. (Outro).

RUGGIERO, J. R. ; DRIGO FILHO, Elso ; COLOMBO, Marcio Francisco ; LEITE, Vitor Barbanti Pereira . III Semana de Física Biológica. 2006. (Congresso).

DRIGO FILHO, Elso ; RUGGIERO, J. R. ; RUGGIERO NETO, João ; COLOMBO, Marcio Francisco . XXXVII Latin-American School of Physics. 2006. (Congresso).

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Participação em eventos

Diálogos Sobre a Universidade Pública. 2018. (Simpósio).

I Simpósio Abresc: Negócios, Educação e Cultura.Os desafios da getstão na educação em rede. 2018. (Simpósio).

De FAFI a IBILCE - a UNESP no Rio Preto Shopping. 2016. (Exposição).

XLIII Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology. 2014. (Congresso).

"Gestão Acadêmica" - Escola UNESP de Liderança e Gestão. 2013. (Oficina).

Escola UNESP de Liderança e Gestão. 2013. (Outra).

Palestra "Saúde Masculina: Prevenção do Câncer de Prósttata. 2013. (Outra).

V Encontro sobre Ciência, Popularização da Ciência - Alfabetização Científica. 2013. (Encontro).

V Fórum de Internacionalização da UNESP. 2013. (Outra).

3o. Ciclo de Debates do Plano de Desenvolvimento Institucional da UNESP. 2012. (Outra).

Curso de Expressão Verbal in Company - Reinaldo Polito - 16 horas. 2012. (Outra).

2o. Ciclo de Debates sobre a Universidade e os Índices Nacionais e Internacionais. 2011. (Outra).

III Encontro Sobre Ciência, Popularização da Ciência e Alfabetização Científica.Mesa de Abertura. 2011. (Encontro).

III Forum de Internacionalização da UNESP - Coloquío: Universidade sem Fronteiras. 2011. (Outra).

Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011.Estudo por Dinâmica Molecular do Anoplin em Solução Aquosa Contendo Micelas de SDS. 2011. (Simpósio).

Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011.Mesa Redonda: "Estado da Arte e Rumos da Pesquisa Interdisciplinar". 2011. (Simpósio).

XI Settimana Della Lingua Italiana nel Mondo: Buon compleanno Italia !. 2011. (Congresso).

XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Conformational analysis of isolated and in association protonectin and protonectin (1-6) peptides in water/TFE mixtures. 2010. (Congresso).

Mesa Redonda: Filosofísica ?Consciência Quântica e Vida Após a Morte".Filosofísica ?Consciência Quântica e Vida Após a Morte?. 2009. (Oficina).

VI Semana da Física Biológica.O Físico Biológico e o Mercado de Trabalho. 2009. (Outra).

XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Application of the replica exchange method in conformational analysis of the peptide protonectin in mixture TFE-water. 2009. (Congresso).

I Escola Brasileira de Bioinformática (EBB 2008). Structutural Features of Some Antimicrobial Peptides from Mastoparan Family: A Molecular Dynamics Study in Water-TFE Mixtures. 2008. (Congresso).

XXXI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. A comparative molecular dynamics study of the polybia-mp1 and mp-x peptides in mixtures of water-tfe: a possible explanation for the selectivity. 2008. (Congresso).

XXX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Conformational Features of Cepacian: The Exopolysaccharide Produced by Clinical Strains of Textit (Burkholderia Cepacia). 2007. (Encontro).

III Semana da Física Biológica.A história do Departamento de Física do IBILCE. 2006. (Seminário).

XVII Semana da Matemática.A Passagem da Física Clássica para a Quântica. 2005. (Seminário).

Curso de Extensão: Curso de Verão em Biofísica Molecular.Mini-Curso: Aspectos Conformacionais de Macromoléculas. 2003. (Outra).

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Participação em bancas

Aluno: Carlos Roberto de Souza Camilo

LINS NETO, R. D.;CHAHINE, JorgeRuggiero, J.R.. Estudo por dinâmica molecular da ação do colesterol sobre o acoplamento entre as faces de bicamadas fosfolipidicas. 2017. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Tabata Cruz Manoel

ARAUJO, A. S.; NAAL, R. M. Z. G.;Ruggiero, J.R.. Estudo de interações de complexos de inclusão flavonóide/ciclodextrina com modelos de membrana biológica por simulações de dinâmica molecular. 2016. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rafaela Magalhães Tavares

ARAUJO, A. S.;Ruggiero, J.R.; SLADE, N. B. L.. Estudo da interação de peptídeos antimicrobianos com modelo de membrana por simulações de Dinâmica Molecular.. 2015. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Tabata Cruz Manoel

ARAUJO, A. S.;Ruggiero, J.R.; NAAL, R. M. Z. G.. Estudos das interações de complexos de inclusão flavonoide/ciclodextrina com modelos de membrana biológica por simulações de Dinâmica Molecular.. 2015. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Daniel Lucas Zago Caetano

CARVALHO, S. J.; SOUZA, A. R.;Ruggiero, José Roberto. Estudo por simulação computacional da interação entre polianfóteros fracos e macroíons cilíndricos. 2013. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Haroldo de Lima Pimentel Cravo

Souza, F.P.; Toledo, K.A.;Ruggiero, José Roberto. Estudo da interação da proteína de fusão do vírus Sincicial Respír4atório Humano com Heparina Sulfatada e Flavonóides. 2012. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Diogo Stelle

SCOTT, Luiz Paulo Barbour;Ruggiero, José Roberto; KAMIENSKI, C.. Uso de Data Mining na Descoberta ou Identificação de Regras de Enovelamento baseada em Perfis de Hidrofobicidade. 2011. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Tamára Rodrigues Valder

RUGGIERO, J. R.; FREITAS, Luiz Carlos Gomide; PALMA, M. S.. Interação do Peptídeo MP-I com micela de SDS em Solução Aquosa: Um Estudo por Dinâmica Molecular. 2010. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: gisele baldissera

Ruggiero, José Roberto; PASCUTI, Pedro G;Cabrera, M P S. Análise Conformacional dos Peptídeos Protonectina (1-6), isolados e em associação, em Mistrura tfe-água. 2010. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Daniel Inoue Koga

CORNELIO, M. L.; SCOTT, Luiz Paulo Barbour;Ruggiero, José Roberto. Análise Vibracional do alfa-tocoferol. 2010. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Gabriel Gouvea Slade

Ruggiero, José Roberto; LEONEL, E. D.; TSUCHIDA, Masayoshi. Formação e Estabilidade de Breathers no Modelo de Peyrar-Bishop para o DNA. 2009. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Natália Favaro Ribeiro

DRIGO FILHO, Elso; GOLDMAN, C.;Ruggiero, José Roberto. Uso de uma rede unidimensional harmônica com o potencial de Rosen-Morse on site para modelar. 2009. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Franciele Polotto

DRIGO FILHO, Elso; ALVES, N. A.;Ruggiero, José Roberto. Soluções da Equação de Fokker-Planck para um Potencial Isoespectral ao Potencial de Morse. 2009. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Fernando César Lopes Filho

RUGGIERO, J. R.. Estudo por Dinâmica Molecular da Estabilidade de Dímeros do Peptídeo EMP-AF em Água e Mistura TFE-Água. 2007. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Denise Cavalcante de Melo

CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.; ARAUJO, A. S.. Estruturação do Mastoparano por Dinâmica Molecular em Misturas de TFE-Água. 2007. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Eduardo Lima de Oliveira

TSUCHIDA, Masayoshi; SOUZA JÚNIOR, Jessé Assunção Rebello de;RUGGIERO, J. R.. Análise Dinâmica de um Pêndulo Elástico com Excitação Vertical no Suporte. 2006. Dissertação (Mestrado em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Joaquim Manoel da Silva

RUGGIERO, J. R.; TSUCHIDA, Masayoshi;LUCA FILHO, Jayme Vicente de. Estudo da Dinâmica do Modelo de Bishop Peyrard não homogêneo para o DNA. 2006. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ricardo Alexandre dos Santos Silva

RUGGIERO, J. R.; FREITAS, Luiz Carlos Gomide; SILVA, Fernando Luis Barroso da. O efeito da solvatação na conformação de cadeias ácidas poligalacturônicas (PGA). 2003. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Gabriela Campos de Araujo

Souza, F.P.; Tiera, M.J.; SEIXAS, F. A. V.;SLADE, Gabriel GouvêaRuggiero, J.R.. Estudo estrutural da proteína SH do vírus sincicial respiratório humano (HRSV) utilizando dinâmica molecular e análise dinâmica do TRP41 da proteína M2 do vírus influenza A (IAV) por ressonância magnética nuclear do estado sólido. 2018. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Luiz Fernando Zonetti

ARAUJO, A. S.; Caruso, I.P.; CAFFARENA, E. R.; OLIVEIRA, R. J.;Ruggiero, J.R.. Estudo da interação entre o pepídeo de fusão da proteína E do vírus da dengue com modelos de membrana biológica por simulações de Dinâmica Molecular. 2018. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Vinícius Martins de Oliveira

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;Ruggiero, J.R.CHAHINE, Jorge. Efeito das interações eletrostáticas e de pH no enovelamento e estabilidade de proteínas. 2016. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Flávio Almeida Curvelo dos Anjos

Ruggiero, José Roberto; PAIVA, P. B.; FALCÃO, Paula Regina Kuser; SCOTT, L. P. B.; Souza, F.P.. Predição de Sítios de Ligação para Cisplatina e transplatina baseada em ligações de hidrogênio. 2015. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: gisele baldissera

RUGGIERO, J. R.; CALIRI, Antonio; SCOTT, Luiz Paulo Barbour; COSTA, S. T. B.; OLIVEIRA, L. C.. Estudo das Interações de Peptídeos Antimicrobianos e Sistemas Miméticos de Membrana por Dinâmica Molecular. 2014. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Eric Allison Philot

SCOTT, Luiz Paulo Barbour; CORDEIRO, R. M.; NASCIMENTO, A. S.;Jose Roberto Ruggiero; SILVA, Fernando Luis Barroso da. Caracterização das interações moleculares entre Tioredoxinas e inibidores/moduladores alostéricos. 2014. Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Diogo Ricardo da Costa

LEONEL, E. D.; SARTORELLI, J. C.;RUGGIERO, J. R.; BEIMS, M. W.; RECH, P. C.. Transporte, escape de partículas e propriedades dinâmicas de mapeamento não lineares. 2014. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Gabriel Gouvea Slade

Ruggiero, J.R.; WEBER, G.; CALIRI, Antonio; LEONEL, E. D.;CHAHINE, Jorge. Modelos Mecânicos para o Estudo da Dinâmica do DNA. 2013. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Fernando César Lopes Filho

Ruggiero, José Roberto; ARAUJO, A. S.; PASCUTI, Pedro G; Pires, J.M.; COSTA, S. T. B.. Simulações por Dinâmica Molecular fine-ecoarse-grained das interações intermoleculares entre peptídeos antimicrobianos da família Mastoparano e membranas modelo. 2012. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ronaldo Junio de Oliveira

LEITE, Vitor Barbanti Pereira; ARAUJO, A. F. P.; ALVES, N. A.; SCOTT, Luiz Paulo Barbour;Ruggiero, José Roberto. Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteína. 2011. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rafael Bertolini Frigori

ALVES, N. A.; OLIVEIRA, M. J.;CHAHINE, Jorge; SILVA, Fernando Luis Barroso da;Ruggiero, José Roberto. Simulações Microcanônicas de Proteínas. 2010. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

Aluno: Sidney Jurado de Carvalho

SILVA, Fernando Luis Barroso da; Silva, M A;RUGGIERO, J. R.; Tiera, M.J.; Dardenne, L.E.. Estudo dos Aspectos Eletrostáticos da Interação entre Polieletrólitos e Macroíons.. 2008. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carlos Emidio Sampaio Nogueira

RUGGIERO, J. R.; CAFFARENA, E. R.; FREITAS, Luiz Carlos Gomide; ARAUJO, A. S.;CHAHINE, Jorge. Estudo Conformacional do Cepacian - um Exopolissacarídeo da Burkholderia cepacia. 2007. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Sabrina Thais Broggio Costa

RUGGIERO, J. R.. Estudos Conformacionais por Dinâmica Molecular de Peptídeos Antimicrobianos da Família dos Mastoparnos em Misturas de TFE-Água. 2006. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Nelson José de Freitas

AZEVEDO JR, Walter Filgueira de; OLIVEIRA, Paulo Sergio Lopes de; FALCÃO, Paula Regina Kuser;CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.. Bioinformática estrutural aplicada ao estudo de proteínas alvo do genoma do Mycobacterium tuberculosis. 2005. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: André Farias de Moura

RUGGIERO, J. R.. Estudo do Sistema Micelar de Octanoato de Sódio por Simulação Computacional. 2004. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de São Carlos.

Aluno: Cristina Saldanha Pereira

RUGGIERO, J. R.; FREITAS, Luiz Carlos Gomide; SERVÚLO FILHO, Ademar; CHAIMOVICH, Hernan. Estudo de Estruturas, Interações e Reconhecimento Molecular em Carboidratos utilizando Simulação Computacional. 2004. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de São Carlos.

Aluno: Roosevelt Alves da Silva

CALIRI, Antonio;CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.. Enovalemaneto determinístico de macromoléculas. 2002 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Mirian Elisa Rodrigues Guerra

ARAUJO, A. S.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira;Ruggiero, J.R.. Estudo do modo de ação independente de receptores do endocanabinoide anandamida por dinâmica molecular. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Daniel Lucas Zago Caetano

CARVALHO, S. J.;CHAHINE, JorgeRuggiero, J.R.. Estudo das interações eletrostáticas em superficies e macromoleculas por meio de simulações Monte Carlo. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Gabriela Campos de Araujo

Souza, F.P.;Ruggiero, J.R.; OLIVEIRA, R. J.. Estudos Biofísicos e de interação com a quercetina das proteínas SH do vírus sincicial respiratório humano (HRSV) e M2 do vírus da Influenza A (IAV). 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Flávio Almeida Curvelo dos Anjos

Jose Roberto Ruggiero; MANACERO JUNIOR, A.;CHAHINE, Jorge. Predição de Sítios de Ligação para Cisplatina e transplatina baseada em ligações de hidrogênio. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Gabruel Gouvea Slade

Ruggiero, José RobertoCHAHINE, Jorge; FOSSEY, Marcelo Andrés. Modelos Mecânicos Simples para o Estudo da Dinâmica do DNA. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Diego Oliveira Nolasco da Silva

CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.; CARVALHO, S. J.. Estudos Estruturais por Dinâmica Molecular do Peptídeo Polybia-MPI via réplica exchange. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ronaldo Junio de Oliveira

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;DRIGO FILHO, ElsoRuggiero, José Roberto. Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Lessandra Eller

SILVA, M. A. A.;Ruggiero, José Roberto; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Simulação do Enovelamento de Modelo Proteíco Utilizando o Método de Crescimento de Cadeias. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Renato Tadeu Gaspar

FEITOSA, Eloi da Silva;RUGGIERO, J. R.; FOSSEY, Marcelo Andrés. Simulação de Dinâmica Molecular de poly(etileno glicol) em água. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Luciana Claudia de Paula

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;DRIGO FILHO, ElsoRUGGIERO, J. R.. Dinâmica de modelos minimalistas de solvente em reações de transferência de elétrons: aplicação à experimentos de única molécula. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Alexandre César Dourado Neves

COLOMBO, Marcio Francisco;RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge. Efeito de Volume Excluso no Enovelamento de Proteínas. 2003. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carlos Roberto de Souza Camilo

ARAUJO, A. S.;Ruggiero, J.R.; OLIVEIRA, L. C.. Estudo por dinamica molecular dos efeitos da concentração de colesterol em bicamadas POPC. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rafaela Magalhães Tavares

ARAUJO, A. S.;Ruggiero, J.R.Cabrera, M P S. Estudo da interação de peptídeos antimicrobianos com modelos de membrana por simulações de dinâmica molecular.. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Luan Celso Marques

CARVALHO, S. J.; CAETANO, D. L. Z.;Ruggiero, J.R.; OLIVEIRA, L. C.. Defesa de Trabalho de Conclusão de Curso intitulado "Estudo do potencial elétrico de macromoléculas em solução". 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carlos Roberto de Souza Camilo

Jose Roberto Ruggiero; CARVALHO, S. J.; OLIVEIRA, L. C.. Simulações por Dinâmica Molecular de Bicamadas Fosfolipídicas: Efeitos da Concentração de Lipídios Carregados em Bicamadas Mistas. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carolina Penhavel de Souza

Ruggiero, José RobertoCHAHINE, Jorge; CARVALHO, S. J.. Estudo Conformacional por Dinãmica Molecular do Peptídeo Anoplin com Micela de SDS em Solução Aquosa. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Vinicius Ladeia Semenzim

NERY, J. G.;Ruggiero, José Roberto; OYAMA, R. S. K.. Síntese e Caracterização de Partículas Derivadas de Poli(Alcool) Vinilico) (PVA) para Embolização e Quimioembolização. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rodrigo Mirarchi Vieira

AGOSTINHO NETO, Augusto;Ruggiero, José Roberto; CARVALHO, S. J.. Introdução ao Estudo Básico de Reações de Transferência de Elétrons e Descrição do Modelo de Marcus. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Diogo Lino de Souza

Ruggiero, José RobertoCHAHINE, Jorge; ARAUJO, A. S.. Estudo da Estabilidade do Peptídeo EMP-AF-MH2 sob Troca da Glicina 9 por uma Serina e Influência do Tratamento das Interações de Longo Alcance na Estrutura Secundária do Peptídeo Mutado. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Adriano Cesar Pires Matrangolo

Ruggiero, José RobertoDRIGO FILHO, Elso; CORNELIO, M. L.. Estudo da Localização de Anderson em Redes Harmônicas com Defeito. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Antonio Bento de Oliveira Junior

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;CHAHINE, JorgeRuggiero, José Roberto. Modelo Computacional Minimalista em Enovelamento de Proteínas: Visualização do Funil de Enovelamento de Proteína. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Vinícius Andrea

DRIGO FILHO, ElsoRuggiero, José Roberto; SALEHYAN, P.. Supersimetria Aplicada à Mecânica Quântica: Solucções Exatas para Potenciais Quânticos dos Tipos Polinomiais, Não-Polinomiais e Mistos. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Daniel Lucas Zago Caetano

CARVALHO, S. J.;Ruggiero, José Roberto; AGOSTINHO NETO, Augusto. Estudo por Simulação Computacional da Dupla Camada Elétrica Cilíndrica: Efeito da Distribuição de Carga da Macromolécula e da Valência dos Íons. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Leandro Sunao Miady

SANTOS, L. F.;RUGGIERO NETO, JoãoRuggiero, José Roberto. Formação de Lipossomas sob Influência de Campo Elétrico Externo Alternado. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Débora Tavares de Lima

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge. Estudo de Proteínas de Rápido Enovelamento com Modelos Baseados em Estrutura. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Vinicius de Godoi Contessoto

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;CHAHINE, JorgeRuggiero, José Roberto. Estudos de Proteínas de Rápido Enovelamento com Modelos Baseados em Estruturas. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carolina Menezes Silvério

SANTOS, L. F.;Ruggiero, José Roberto; CARVALHO, S. J.. Modelagem Teórica da Injeção e Transporte de Cargas em Semiconditores Optoeletrônicos Poliméricos. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Juliana Sartori Pinto

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;CHAHINE, JorgeRuggiero, José Roberto. Estudo de Modos Normais de Proteínas através do Método de Normal Mode Analysis (NMA). 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Daniel Inoue Koga

RUGGIERO, J. R.; AGOSTINHO NETO, Augusto;DRIGO FILHO, Elso. Posibilidade da Existência de Ondas não Lineares na Cadeia de DNA: Caso Estacionário. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Eric Allison Philot

RUGGIERO, J. R.RUGGIERO NETO, JoãoCHAHINE, Jorge. Estudo Conformacional do Cepacian. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rafael Musa Lyrio do Valle

DRIGO FILHO, ElsoRUGGIERO, J. R.; COSTA, J. C. F.. Sistemas Massa-Mola Complexos. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Thais Azevedo Enoki

RUGGIERO NETO, JoãoRUGGIERO, J. R.; FOSSEY, Marcelo Andrés. Contribuição Eletrostática na Interação de Peptídeos Líticos com Membranas Modelo. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Jacyana Saraiva Marthes Fonseca

FOSSEY, Marcelo Andrés;RUGGIERO, J. R.DRIGO FILHO, Elso. Estudo da Competicação entre Ca+2 e Íons Monovalentes na Interação com Ácidos Nucléicos utilizando a Teoria de Poisson Boltzmann e o Modelo de Condensação de Contraíons. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Leonilson Kiyoshi Sato de Herval

DRIGO FILHO, ElsoRuggiero, José Roberto; RANGA, A. S.. Soluções Exatas para Potenciais Quânticos Singulares. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rafael Giordano Viegas

DRIGO FILHO, ElsoRuggiero, José Roberto; COSTA, J. C. F.. Mecânica Quântica Supersimétrica com Condição de Contorno. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Karina Heloisa Paulino

RUGGIERO, J. R.; SANTOS, L. F.; PAULA, L. C.. Poços Quânticos. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: gisele baldissera

RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge; COSTA, S. T. B.. Estudo Conformacional por Dinâmica Molecular do EMP-AF: Efeitos de Troca do Resíduo Gly9 por outro Resíduo Hidrofóbico na Estrutura Helicoidal Anfipática. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Denise de Arruda

RUGGIERO, J. R.DRIGO FILHO, ElsoCHAHINE, Jorge. Estudo da Condutividade Térmica em uma Rede Homogênea de Osciladores Harmônicos. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Tamára Rodrigues Valder

RUGGIERO, J. R.; COSTA, S. T. B.; ABREGO, J. R. B.. Estudos Conformacionais por Dinâmica Molecular do Peptídeo Antimicrobiano Eumenine Mastoparan-AF com Resíduos de Aminoácidos Polares trocados em Mistura de TFE-Água. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: João Cesar Boreggio de Araujo

DRIGO FILHO, ElsoRUGGIERO, J. R.; AGOSTINHO NETO, Augusto. O Formalismo Supersimétrico e suas Aplicações em Mecânica Quântica. 2006. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Diogo Martins Gonçalves de Morais

AGOSTINHO NETO, Augusto;RUGGIERO, J. R.DRIGO FILHO, Elso. Interações eletrostáticas de aglomerados moleculares em eletrólitos. 2005. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: André Luiz Martins

CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.; AGOSTINHO NETO, Augusto. Uso da rede elástica na predição de estruturas protéicas. 2005. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Joaquim Manoel da Silva

RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Estudo da dinâmica do modelo de Peyrard-Bishop não homogêneo para DNA. 2005. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Leandro Cristante de Oliveira

RUGGIERO, J. R.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira; AGOSTINHO NETO, Augusto. Aspectos Topológicos de Proteínas otimamente desenhadas em rede cúbica. 2004. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Lessandra Eller

CHAHINE, JorgeRUGGIERO, J. R.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. O Uso do Método de crescimento de cadeias no estudo do enovelamento de proteínas. 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carlos Emidio Sampaio Nogueira

RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Estudo Estrutural por Dinâmica Molecular do Exopolissacarídeo da Burkholderia Cepacia: Cepacian. 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ricardo Alexandre dos Santos Silva

RUGGIERO, J. R.; AGOSTINHO NETO, Augusto;CHAHINE, Jorge. O efeito da solvatação na conformação de cadeias ácidas poligalacturônicas (PGA). 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Sidney Jurado de Carvalho

SILVA, Fernando Luis Barroso da;RUGGIERO, J. R.; AGOSTINHO NETO, Augusto. Estudo metodológico dos aspectos eletrostáticos da interação ligante-biomolécula. 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ricardo Hildebrand Theodoro da Silva

LEITE, Vitor Barbanti Pereira;RUGGIERO, J. R.RUGGIERO NETO, João. Comportamento termodinâmico e a cinética de mutações de proteínas otimamente desenhadas em modelos de rede. 2002. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Angelo Pulici

DRIGO FILHO, ElsoRUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge. Tunelamento quântico em potencial bi-estável. 2002. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Sabrina Thais Broggio

RUGGIERO, J. R.CHAHINE, Jorge; AZEVEDO JR, Walter Filgueira de. Análise Conformacional de Peptídeos usando o Recozimento Simulado Generalizado (GSA). 2002. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CARVALHO, S. J.; ABREGO, J. R. B.;Ruggiero, J.R.. Concurso público de provas e títulos para contratação de Professor Substituto. 2016. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ruggiero, José Roberto; ABREGO, J. R. B.; FEITOSA, Eloi da Silva. Comissão Julgadora do Concurso Público para contratação emergencial de Professor Substituto. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RUGGIERO, J. R.; COSTA FILHO, Antonio José da; RAMOS, Carlos Henrique Inácio. Concurso Público de Provas e Títulos para preenchimento de uma função de Professor Assistente. 2004. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Godoy, M.F.; Godoy, J.M.P.; Romano, B.W.; Pinto, F.J.R.;Ruggiero, José Roberto. A Psicossomática Psicanalítica. 2008. Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto.

RUGGIERO, J. R.; CALIRI, Antonio; TABAK, M.; SOUZA, A. R.. Concurso Público de Títulos e Provas para obtenção do Título de Livre-Docente. 2008. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto/USP.

CORNELIO, M. L.;Ruggiero, José RobertoCHAHINE, Jorge. Comissão Examinadora de Exame de Qualificação de Mestrado. 2010. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

BRUNI, A. T.;Ruggiero, José RobertoDRIGO FILHO, Elso. Comissão Examinadora do Exame de Qualificação de Mestrado. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DRIGO FILHO, ElsoCHAHINE, JorgeRuggiero, José Roberto. Comissão Examinadora de Exame de Qualificação de Mestrado. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

SCOTT, Luiz Paulo Barbour;Ruggiero, José Roberto. Membro da Comissão Examinadora do Exame de Qualificação de Angélica Nakagawa Lima. 2009. Universidade Federal do ABC.

DRIGO FILHO, Elso; WEBER, G.;Ruggiero, José Roberto. Comissão Examinadora de Exame de Qualificação de Mestrado. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

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Orientou

Carlos Roberto de Souza Camilo

Estudo da partição de moléculas de curcumina em bicamadas compostas de POPC e Colesterol; Início: 2017; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Mirian Elisa Rodrigues Guerra

Estudos computacionais de macromoleculas de interesse biológico; ; Início: 2016; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Carlos Roberto de Souza Camilo

Estudo por dinâmica molecular dos efeitos da concentração de colesterol sobre o acoplamento entre as faces de bicamadas fosfolipídicas; 2017; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Mirian Elisa Rodrigues Guerra

Prospecção de caracteristicas estruturais de peptideos com ação leishmanicida: projeto para sintese; 2014; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Tamára Rodrigues Valder

Interação do Peptídeo MP-I com micela de SDS em Solução Aquosa: Um Estudo por Dinâmica Molecular; 2010; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

gisele baldissera

Aplicação do Métdo de Troca de Replicas na Análise Conformacional dos Peptídeos Protonectina e Protonectina(1-6), Isolados e em Associação, em Misturas TFE-Água; ; 2010; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Gabriel Gouvea Slade

Formação e Estabilidade de Breathers no Modelo de Peyrar-Bishop para o DNA; 2009; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Fernando César Lopes Filho

Estudo por Dinâmica Molecular da Estabilidade de Dímeros do Peptídeo EMP-AF em Água e Mistura TFE-Água; 2007; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Joaquim Manoel da Silva

Estudo da Dinâmica do Modelo de Bishop Peyrard não Homogêneo para o DNA; 2006; 0 f; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Sergio E Ferreira

Modelo Dinâmico para o DNA; 2003; 0 f; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Ricardo Alexandre dos Santos Silva

O efeito da solvatação na conformação de cadeias ácidas poligalacturônicas (PGA); 2003; 0 f; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Murilo Táparo

Estudo por dinamica molecular de: mono, di e trissacarídeo de ácido alfa-D-galacturönico; 1998; 0 f; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Flávio Almeida Curvelo dos Anjos

Predição de Sítios de Ligação para Cisplatina e transplatina baseada em ligações de hidrogênio; 2015; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

gisele baldissera

Estudo das Interações de Peptídeos Antimicrobianos e Sistemas Miméticos de Membrana por Dinâmica Molecular; 2014; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Gabriel Gouvea Slade

Modelos Mecânicos para o Estudo da Dinâmica do DNA; 2013; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Fernando César Lopes Filho

Simulações por Dinâmica Molecular fine-ecoarse-grained das interações intermoleculares entre peptídeos antimicrobianos da família Mastoparano e membranas modelo; 2012; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Hernan Oscar Cortez Gutierrez

Modelo Dinãmico e Estatístico Aplicado a Transição de Fase; 2009; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Ricardo Alexandre dos Santos Silva

Modelo Vibro-rotacional para a molécula do DNA; 2008; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Fernando César Lopes Filho

Análise Atomística das Interações entre Peptídeos Antimicrobianos e Membranas Lipídicas; 2008; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Carlos Emidio Sampaio Nogueira

Estudo Conformacional do Cepacian - um Exopolissacarídeo da Burkholderia Cepacia; 2007; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Sabrina Thais Broggio Costa

Estudos Conformacionais por Dinâmica Molecular de Peptídeos Antimicrobianos da Família dos Mastoparnos em Misturas de TFE-Água; 2006; 0 f; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Luiz Paulo Barbour Scott

Investigação da Utilização de Algoritmos Genéticos e Redes Neurais Artificiais na Predição de Estruturas Protéicas; 2003; 0 f; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Paulo Sérgio Augusto Pilz

Modelo estatístico para a molécula do DNA; 2003; 0 f; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jose Roberto Ruggiero;

Elso Drigo Filho

Estudo de alguns aspectos do ácido desoxirribonucleico (DNA) e mecanica quantica supersimétrica; 1992; 0 f; Tese (Doutorado em Física) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Carlos Roberto de Souza Camilo

Simulação por Dinâmica Molecular de Bicamadas Fosfolipídicas: Efeitos da Concentração de Lipídios Carregados em Bicamadas; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Carolina Penhavel de Souza

Estudo Conformacional por Dinãmica Molecular do Peptídeo Anoplin com Micela de SDS em Solução Aquosa; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Diogo Lino de Souza

Estudo da Estabilidade do Peptídeo EMP-AF-NH2 sob troca da Glicina 9 por uma Serina e Influência do Tratamento das Interações de Longo Alcance na Estrutura Secundária do Peptídeo Mutado; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Adriano Cesar Pires Matrangolo

Estudo da Localização de Anderson em Redes Harmônicas com Defeito; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

gisele baldissera

Estudo Conformacional por Dinâmica Molecular do EMP-AF: Efeitos de Troca do Resíduo Gly9 por outro Resíduo Hidrofóbico na Estrutura Helicoidal Anfipática; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Denise de Arruda

Estudo da Condutividade Térmica em uma Rede Homogênea de Osciladores Harmônicos; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Tamára Rodrigues Valder

Estudos Conformacionais por Dinâmica Molecular do Peptídeo Antimicrobiano Eumenine Mastoparan-AF com Resíduos de Aminoácidos Polares trocados em Mistura de TFE-Água; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Gabriel Gouvea Slade

Análise Numérica das Condições para Localização de Energia no Modelo de Peyrard-Bishop para o DNA com Sequência Aleatória; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Daniel Inoue Koga

Possibilidade da Existência de Ondas não Lineares na Cadeia de DNA: Caso Estacionário; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Eric Allison Philot

Estudo Conformacional do Cepacian; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Etore Marcari Junior

Paralelização de um Código para geração de estatísticas conformacionais de cadeias polissacarídicas - Fase 2; 1999; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Fernando Antonio Mac Cracken Cezar

Paralelização de um código para Geração de Estatísticas Conformacionais de Cadeias Polissacarídicas; 1998; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Luiz Paulo Barbour Scott

Simulação e animação gráfica de um polímero em uma rede bidimensional e tridimensional usando o método de Monte Carlo; 1991; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Oswaldo Lázaro Mendes

Simulação e animação gráfica de um polímero em uma rede bidimensional e tridimensional usando o método de Monte Carlos; 1991; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Carlos Roberto Camilo

Estudo Conformacional por Dinâmica Molecular de Peptídeos Antimicrobianos da Família dos Mastoparanos em Ambientes Diversos que Mimetizem Membranas Biológicas; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Física Biológica) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Universidade Estadual Paulsita; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Carolina Penhavel de Souza

Estudo Conformacional por Dinâmica Molecular de Peptídeos Antimicrobianos da Família dos Mastoparanos em AM,bientes Diversos que Mimetizam membranas Biológicas; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulsita; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Gabriel Gouvea Slade

Estudo do Movimento de um Par de Pêndulos Acoplados por uma Mola Helicoidal; 2006; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulsita; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Marines Pellinzzon

Estudo do Movimento de um Par de Pêndulos Acoplados por uma Mola Helicoidal; 2006; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulsita; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Marines Pellinzzon

Estudo da dinâmica de sistemas não lineares: o comportamento caótico do pêndulo físico forçado; 2005; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Unesp; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Lucas Gregório Sena Fujykawa

Preservação das fontes da educação brasileira: a estruturação do arquivo histórico da FAFI/São José do Rio Preto; 2004; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Joaquim Manoel da Silva

Dinâmica da Cadeia de Osciladores Harmônicos; 2003; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Unesp; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Julian Gobi

Introdução ao uso de um pacote de simulação computacional por dinamica molecular; 1995; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciëncias da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Joao Carlos Moreira

Aplicação do método de Runge-Kutta ao movimento de osciladores acoplados sujeitos ao potencial elástico (linear) e de Morse (não linear); 1994; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Marco Antônio Leonel Caetano

Perturbações em Órbitas de Satélites; 1988; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

João Marcos Costa Monteiro

BAAE I "Estudo do Potencial de Lennard-Jones"; 2016; Orientação de outra natureza; (Física) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Natália Ferreira Moraes

A Música e a Comunidade; 2012; Orientação de outra natureza; (Letras - Espanhol) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, PROEX/UNESP; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Débora Heloisa da Silva

A Música e a Comunidade; 2011; Orientação de outra natureza; (Matemática) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Débora Heloisa da Silva

A Música e a Comunidade; 2010; Orientação de outra natureza; (Licenciatura Em Letras) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Franciele Sampaio dos Santos Safra

Introdução ao Estudo de Sistemas Não Lineares; 2009; Orientação de outra natureza; (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Adauto Donizetti de Paula

Estudo de uma cadeia de osciladores harmônicos com uma impureza na massa; 2009; Orientação de outra natureza; (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Edílson Zibiani

Estudo de Equações Não Lineares em Sistemas Simples; 2009; Orientação de outra natureza; (Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Erick Zibiani

Estudo de Sistemas Caóticos: O Mapa Logístico e o Mapa de Lorenz; 2009; Orientação de outra natureza; (Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Ana Paula Soficier

A Música e a Comunidade; 2009; Orientação de outra natureza; (Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Graduação; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Paulo Henrique Graciano

A Música e a Comunidade; 2008; Orientação de outra natureza; (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, PROEX/UNESP; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Antoniana Gardinalli

A Música e a Comunidade; 2008; Orientação de outra natureza; (Licenciatura Em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, PROEX/UNESP; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Eric Allison Philot

Estudo do Tratamento Estatístico de Cadeias Poliméricas; 2006; Orientação de outra natureza; (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

Vanessa Cristina Pavezi

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Vanessa Cristina Pavezi

Preservação de fontes de educação brasileira: a estruturação do arquivo histórico da FAFI/São José do Rio Preto; 2003; 0 f; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Bolsa de Assistência Ao Estudante; Orientador: Jose Roberto Ruggiero;

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Outras produções

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Ruggiero, J.R. . Parecer em Projeto de Pesquisa para a CNPq. 2016.

Ruggiero, J.R. . Projeto de Pesquisa de pós­Doutorado para a FAPESP. 2015.

Jose Roberto Ruggiero . Parece emitido em projeto de pesquisa. 2014.

RUGGIERO, J. R. . Parecer emitido em 03 (três) Projetos de Extensão Universitária. 2014.

RUGGIERO, J. R. . Parece emitido em 5 (cinco) projetos de pesquisa. 2013.

RUGGIERO, J. R. . Parece emitido em projeto de pesquisa. 2013.

RUGGIERO, J. R. . Parecer emitido em resumos de trabalhos de evento científico. 2013.

RUGGIERO, J. R. . Parecer em Solicitação de Bolsa de Iniciação Científica. 2013.

Ruggiero, José Roberto . Parecer em Trabalho completo a ser apresentado no XXI CIC/2009. 2009.

RUGGIERO, J. R. . Parecer em projeto de pesquisa -. 2005.

RUGGIERO, J. R. . Parecer em projeto de pesquisa referente à solicitação de bolsa do Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica - PIBIC/CNPq. 2004.

Lima, D.M.F. ; Cartezanni, G. ; Ruggiero, J.R. . Os desafios da gestão na educação em rede. 2018. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

RUGGIERO, J. R. . A Física aos Saltos: a Passagem da Física Clássica para a Física Moderna. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

RUGGIERO, J. R. ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri . Mente e Matéria: Um Passeio pelo Real. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

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Projetos de pesquisa

  • 2006 - Atual

    Título: Análise da dinâmica de estruturas secundárias de peptídeos em ambientes diversos e os mecanismos de interação com bicamadas lípidicas, Descrição: Mastoparano é a denominação genérica para a família de tetra-decapeptídeos extraídos do veneno de vespas. Eles cumprem várias funções biológicas como atividade antimicrobiana, atividade hemolítica, degranulação de mastócitos, alguns são citotóxicos e/ ou neurotóxicos, entre outros efeitos. Fatores como a sequência primária, a distribuição de grupos carregados, a hidrofobicidade, a amidação do N-terminal e a estrutura secundária determinam a eficiência dos peptídeos em suas funções biológicas. Por outro lado estes peptídeos não têm preferencia por uma estrutura secundária em solução aquosa. O objetrivo deste projeto é compreender a interação destes peptídeos e os condicionantes para sua estruturação em sistemas que mimetizem o ambiente da membrana celular, tais como: misturas TFE-água, micelas de SDS e bicamadas lípidicas. Espera-se, com as informações obtidas, propor o redesenho de peptídeos tornando-os mais específicos e eficientes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Jose Roberto Ruggiero - Coordenador / Jorge Chahine - Integrante / F A M Cezar - Integrante / Sabrina Thais Broggio Costa - Integrante / Támara R. Valder - Integrante / Gisele Baldissera - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 2

  • 2005 - 2008

    Título:Estudo conformacional de carboidratos: dinâmica molecular de um sacarídeo da parede celular da bactéria "Burkolderia Cepacia", Descrição: Burkolderia Cepacia é uma bactéria comum encontrada no solo e que não causa maiores problemas para a maioria dos humanos. Porém, desde a década de 80, ela vem sendo largamente estudada como um fator muito importante na mortalidade de pacientes com fibrose cística. A análise do muco desses pacientes têm revelado a presença de um polissacarídeo da parede extra-celular dessa bactéria e conjectura-se sobre o seu papel no funcionamento do sistema. Os estudos conformacionais sobre esses sacarídeos somente agora começam a aparecer. Nosso objetivo nesse projeto é estudar por dinâmica molecular as conformações e propriedades dinâmicas do sacarídeo e oligômeros. Os dados da análise química revelam o monômero como sendo constituído de 3 resíduo de glicopiranose com ligação glicosídica tipo (1-3)-(1-4) e (1-3), porém devido a ramificações o monômero tem sete unidades piranosídicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Jose Roberto Ruggiero - Coordenador / R Urbani - Integrante / Carlos Emídio Sampaio Nogueira - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 1

  • 2005 - Atual

    Título: Estudo de modelos mecânicos para a dinâmica e a desnaturação térmica do ADN, Descrição: Modelos simples para descrever a desnaturação térmica do DNA têm sido alvo de estudos de minha colaboração com o Prof. Drigo Filho desde a sua tese de doutoramento em 1992. Os resultados usando técnicas da mecânica estatística integradas ao formalismo do operador integral de transferência a modelos vibracionais e um modelo vibro-rotacional foram temas de publicações no contexto da desnaturação térmica do ADN. Do ponto de vista dinâmico nosso interesse se concentra nos processos de localização de energia na cadeia e seus possíveis efeitos na replicação e transcrição gênica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Jose Roberto Ruggiero - Integrante / Elso Drigo Filho - Coordenador / Ricardo Alexandre dos Santos Silva - Integrante / Joaquim Manoel da Silva - Integrante / Antonio Ponno - Integrante / Jayme Vicente de Luca Filho - Integrante / Gabriel Gouvêa Slade - Integrante / Hernán Cortez Gutierrez - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 4

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física. , Rua Cristovão Colombo, 2265, Jardim Nazareth, 15054000 - Sao Jose do Rio Preto, SP - Brasil, Telefone: (17) 3221224, Ramal: 2239, Fax: (17) 17, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 1978 - Atual

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 09/2018

      Direção e administração, Universidade Estadual Paulista, .,Cargo ou função, Assessor Especial de Planejamento da Pró-Reitoria de Olanejamento Estratégico e Gestão - UNESP/Reitoria.

    • 09/2018

      Direção e administração, Universidade Estadual Paulista, .,Cargo ou função, Coordenador da Coordenadoria de Orçamento, Finanças e Contabilidade - COFC/PROPEG/UNESP.

    • 01/2017

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Membro da Comissão Diretiva da Estação Ecológica do Noroeste Paulista.

    • 01/2017

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Universidade Estadual Paulista, .,Cargo ou função, Membro do Conselho Fiscal da FUNDUNESP - Fundação para o Desenvolvimento da UNESP.

    • 01/2017

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Universidade Estadual Paulista, .,Cargo ou função, Membro do Conselho Curador da Fundação Instituto de Física Teórica.

    • 01/1994

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Linhas de pesquisa

    • 01/2017 - 09/2018

      Direção e administração, Universidade Estadual Paulista, .,Cargo ou função, Assessor Chefe sa APLO - Reitoria Unesp.

    • 10/2015 - 02/2017

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Membro Titular do Conselho do Departamento de Física.

    • 08/2014 - 02/2017

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Universidade Estadual Paulista, .,Cargo ou função, Presidente do Grupo de Trabalho: Gestão Orçamentária e Financeira da UNESP, criada e composta no CO.

    • 06/2013 - 01/2017

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Universidade Estadual Paulista, .,Cargo ou função, Membro da Comissão Gestora da Escola UNESP de Liderença e Gestão da UNESP.

    • 01/2015

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Presidente da Comissão Diretiva da Estação Ecologica do Noroeste Paulista.

    • 08/2016 - 12/2016

      Ensino, Física, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física II - 100 horas

    • 03/2016 - 08/2016

      Ensino, Bacharelado em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física III - 101 horas

    • 08/2015 - 12/2015

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física II - 90 horas

    • 06/2014 - 05/2015

      Direção e administração, Universidade Estadual Paulista, .,Cargo ou função, Vice-Presidente do CADE (Conselho de Administração e Desenvolvimento).

    • 05/2013 - 05/2015

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Universidade Estadual Paulista, .,Cargo ou função, Membro titular do Conselho de Administração e Desenvolvimento da UNESP - CADE.

    • 06/2011 - 05/2015

      Direção e administração, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Diretor de Unidade.

    • 05/2011 - 05/2015

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Presidente da Congregação.

    • 05/2011 - 05/2015

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Universidade Estadual Paulista, .,Cargo ou função, Membro Titular do Conselho Universitário, como Diretor.

    • 01/2013 - 12/2013

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Atividade de extensão realizada, Projeto Coral IBILCE.

    • 01/2012 - 12/2012

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Atividade de extensão realizada, Projeto de Extensão Universitária "A Música e a Comunidade".

    • 07/2011 - 07/2011

      Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto.,Atividade realizada, Reunião Técnica - Universidade de Lyon, Lyon - França.

    • 03/2011 - 07/2011

      Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Forças Intermoleculares - 180 horas

    • 02/2011 - 07/2011

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Eletromagnetismo - 90 horas

    • 06/2010 - 05/2011

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Representante docente junto ao Conselho do Programa de Pós-Graduação Biofísica Molecular.

    • 02/2010 - 05/2011

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Representante docente junto ao Conselho Universitário - CO.

    • 02/2010 - 05/2011

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Represente docente junto ao CADE.

    • 10/2009 - 05/2011

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Membro titular do Conselho do Departamento de Física.

    • 01/2011 - 02/2011

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Atividade de extensão realizada, Curs ministrado "Física Moderna" - 6 horas dentro do Curso de Extensão Universitária "Curso de Verão em Biofísica Molecular".

    • 08/2010 - 12/2010

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Métodos Computacionais I - 90 horas

    • 01/2010 - 12/2010

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Atividade de extensão realizada, Coordenação do Projeto de Extensão Universitária "A Música e a Comunidade".

    • 02/2010 - 07/2010

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Trabalho de Conclusão de Curso - 60 horas, Eletromagnetismo - 90 horas

    • 08/2009 - 12/2009

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Eletromagnetismo - 90 horas, Métodos Computacionais I - 60 horas, Trabalho de Conclusão de Curso - 20 horas

    • 01/2009 - 12/2009

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Atividade de extensão realizada, Coordenação do Projeto de Extensão Universitária "A Música e a Comunidade".

    • 06/2008 - 10/2009

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Membro do Conselho do Departamento de Física.

    • 03/2009 - 07/2009

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Trabalho de Conclusão de Curso - 20 horas, Eletromagnetismo - 90 horas

    • 08/2008 - 12/2008

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Complementos de Eletromagnetismo (Optativa ) - 60 horas, Métodos Computacionais I - 60 horas

    • 01/2008 - 12/2008

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Atividade de extensão realizada, Coordenação do Projeto de Extensão Universitária "A Música e a Comunidade".

    • 03/2008 - 07/2008

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Eletromagnetismo - 90 horas

    • 03/2007 - 01/2008

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Eletromagnetismo - 90 horas - 1o. semestre, Métodos Computacionais I - 60 horas - 2o. semestre, Trabalho de Conclusão de Curso (Supervisor) - 1o. e 2o. semestre

    • 08/2007 - 12/2007

      Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Forças Intermoleculares

    • 10/2005 - 10/2007

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Cargo ou função, Membro de conselho de unidade - Conselho Departamental.

    • 03/2007 - 08/2007

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral e Experimental II - 60 horas - 1o. semestre

    • 08/2003 - 08/2007

      Direção e administração, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Cargo ou função, Coordenador do Curso de Graduação Bacharelado em Física Biológica.

    • 07/2006 - 12/2006

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física III - 60 horas - 2o. semetre - 11 alunos, Métodos Computacionais I - 60 horas- 2o. semestre - 40 alunos

    • 07/2006 - 12/2006

      Ensino, Bacharelado Em Química Ambiental, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física II - 2o. semestre - 60 horas - 14 alunos

    • 03/2006 - 12/2006

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral e Experimental II - 120 horas - Anual - 54 alunos

    • 03/2006 - 12/2006

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Atividade de extensão realizada, A Música e a Comunidade (Projeto em colaboração com a regente do coral do IBILCE/UNESP).

    • 03/2006 - 07/2006

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física III - 60 horas

    • 03/2006 - 07/2006

      Ensino, Bacharelado Em Química Ambiental, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física II - 1o. semestre - 60 horas - 51 alunos

    • 03/2005 - 12/2005

      Ensino, Bacharelado Em Ciëncias da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física I - 60 horas

    • 03/2005 - 12/2005

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Métodos Computacionais I - 60 horas - 1o. semestre

    • 03/2005 - 12/2005

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Métodos Computacionais I - 60 horas - 2o. semestre

    • 02/2005 - 12/2005

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Atividade de extensão realizada, A Música e a Comunidade (Projeto em colaboração com a regente do coral do IBILCE/UNESP).

    • 08/2003 - 12/2005

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Cargo ou função, Membro de colegiado superior - Congregação.

    • 08/2005 - 11/2005

      Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Forças Intermoleculares - 2o. semestre - 180 h-a

    • 01/2005

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Cargo ou função, Consultor Ad-hoc - CNPq.

    • 08/2004 - 12/2004

      Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física III - 60 horas - 2o. semestre

    • 04/2004 - 12/2004

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Atividade de extensão realizada, Desenvolvimento de um protótipo do banco de dados para o arquivo virtual do arquivo histórico da FAFI/São José do Rio Preto.

    • 02/2004 - 12/2004

      Ensino, Bacharelado Em Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral e Experimental II - 120 horas - Anual

    • 02/2004 - 12/2004

      Ensino, Bacharelado Em Química Ambiental, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física I - 60 horas - 1o. semestre

    • 02/2004 - 12/2004

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Atividade de extensão realizada, A Música e a Comunidade (Projeto em colaboração com a regente do coral do IBILCE/UNESP).

    • 01/2004

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Cargo ou função, Consultor Ad-hoc - CNPq.

    • 06/2003 - 12/2003

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Atividade de extensão realizada, Levantamento, localização e classificação da documentação existente no IBILCE/UNESP sobre a Faculdade de Filosofia de São José do Rio Preto, FAFI.

    • 02/2003 - 12/2003

      Ensino, Bacharelado Em Química Ambiental, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física I - 60 horas - 2o. semestre

    • 02/2003 - 12/2003

      Ensino, Bacharelado Em Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral e Experimental II - 120 horas - anual

    • 03/2002 - 12/2002

      Ensino, Licenciatura Em Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral e Experimental I

    • 03/2002 - 12/2002

      Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Forças Intermoleculares - 180 h-a - 1o. semestre

    • 02/2002 - 12/2002

      Ensino, Licenciatura Em Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral e Experimental I

    • 08/1978 - 12/2001

      Ensino, Licenciatura Em Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral e Experimental I, Física Geral e Experimental II, Física Geral II, Física Geral III, Física Geral I, Biofísica

    • 03/2001 - 07/2001

      Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Forças Intermoleculares - 180 h-a - 1o. semestre

    • 03/1995 - 12/2000

      Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Tópicos Especiais: Forças Intermoleculares, Biofísico-Química de Macromoléculas, Tópicos Especiais: Métodos Teóricos e Computacionais

    • 03/1999 - 11/2000

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Atividade de extensão realizada, Física no ensino médio: conceitos, para professores do ensino médio da rede pública.

    • 01/1997 - 07/2000

      Direção e administração, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Cargo ou função, Coordenador de curso de Pós-Graduação.

    • 03/1986 - 04/1990

      Direção e administração, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Cargo ou função, Chefe de Departamento.

    • 07/1985 - 07/1985

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Atividade de extensão realizada, Curso sobre revisão e atualização dos professores de física, para professores III da rede oficial de ensino de 2o. grau.

    • 01/1982 - 01/1982

      Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Atividade de extensão realizada, Curso de Difusão Cultural e Científica para alunos do 1o. grau.