Alexandre Mendes Fernandes

Pós-doutorado

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Produções bibliográficas

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• LEITE, F. ; FERNANDES, A. M. ; ASSIS, D. ; DIAS, R. L. . Efeito da umidade do solo e da cobertura vegetal na distribuição, abundância e nas características reprodutivas de Drosera Montana.. In: IX Semana de Iniciação Científica da UFMG., 2001, Belo Horizonte.

• PINHO, J. B. ; MORAIS, D. H. ; LOPES, L. E. ; FERNANDES, A. M. . Descrição de um ninho de Lepidocolaptes fuscus (Dendrocolaptidae) do nordeste de Minas Gerais, com dados sobre sua dieta e pterilose dos ninhegos.. In: Ornitologia Sem Fronteiras, incluindo os resumos do IX Congresso Brasileiro de Ornitologia., 2000, Curitiba, PR., 2000.

• FERNANDES, A. M. ; LOPES, L. E. ; MARINI, M. A. . Dieta de aves de Mata Atlântica no estado de Minas Gerais através da técnica do tártaro emético. In: Ornitologia sem Fronteiras, incluindo os resumos do IX Congresso Brasileiro de Ornitologia., 2000, Curitiba, PR.. Ornitologia sem Fronteiras, incluindo os resumos do IX Congresso Brasileiro de Ornitologia..

• LOPES, L. E. ; FERNANDES, A. M. ; MARINI, M. A. . Predação de ninhos artificiais no Cerrado: Comparação entre diferentes microhábitats.. In: XXIII Congresso Brasileiro de Zoologia., 1999, Cuiabá, MT., 1999.

• ASSIS, D. ; FERNANDES, A. M. ; LEITE, F. . Relação entre o perfil protéico e virulência em cepas de Entamoeba histolytica isoladas de pacientes apresentando diferentes quadros clínicos.. In: IX Congresso Brasileiro de Parasitologia, 1999.

• FERNANDES, A. M. . Biogeografia e Conservação de Aves Neotropicais. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• MELO, A. V. ; ALVES, E. ; FERNANDES, ALEXANDRE M. . Histórico e dinâmica espaço-temporal de Triste-pia (Dolichonyx oryzivorus) no Brasil. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERNANDES, ALEXANDRE M. . Speciation of birds from savanna-like vegetation in South America: the case of a pair of nighthawk Nannochordeiles pusillus in and out of the Amazon. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERREIRA, M. E. A. ; FERNANDES, A. M. . Modelagem de distribuição geográfica de aves: investigando rotas de dispersão entre a floresta amazônica e Mata Atlântica In: Congresso de Iniciação Científica / Universidade Federal Rural de Pernambuco. 2021. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FREITAS, G. L. ; FERREIRA, M. E. A. ; FERNANDES, A. M. . Variação vocal e paleodistribuição de Atilla spadiceus (Tyrannidae): testando conexões históricas entre Amazônia e Mata Atlântica. 2021. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERNANDES, A. M. . Biogeography and Conservation of Neotropical Birds ? Discoveries, Distributions, and Differentiation. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• FERNANDES, A. M. . Biogeografia e Conservação de Aves Neotropicais. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• FERNANDES, ALEXANDRE M ; CONH-HAFT, M. ; ALEIXO, A. ; SILVEIRA, L. F. ; NASCIMENTO, N. ; OLSSON, U. . Speciation of birds from savanna-like vegetation in South America: the case of a pair of nighthawks Nannochordeiles pusillus (Aves: Caprimulgidae) in and out of the Amazon.. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• GOMES, R. C. F. S. ; FERNANDES, A. M. . Efeito da degradação ambiental no nível de hemoparasitismo em aves da Caatinga, Brasil. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• VERAS, A. P. B. B. ; FERNANDES, A. M. . Estudo etnoornitológico em comunidade quilombola do entorno da Serra do Giz, Afogados da Ingazeira, Pernambuco, Brasil. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• DA SILVA, ERASMO ANDRADE ; ARAUJO, H. F. P. ; FERNANDES, A. M. . Modelagem de distribuição e similaridade de nicho do complexo de espécies Thamnophilus punctatus (Aves, Thamnophilidae): uma linhagem de florestas secas dos neotrópicos. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERNANDES, A. M. ; ALEIXO, A. ; OLSSON, URBAN ; CONH-HAFT, M. . Nannochordeiles pusillus (Aves: Caprimulgidae): novos registros e informações sobre sua distribuição e história biogeográfica na Amazônia. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERNANDES, A. M. ; ALEIXO, ALEXANDRE ; SILVEIRA, L. F. ; ANTONELLI, ALEXANDRE . Origin and diversification of birds from dry forests in South America: the case of the Slaty- Antshrikes, Thamnophilus punctatus species complex (Thamnophilidae In: International Biogeography. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• FERNANDES, A. M. . Biogeografia e Conservação de Aves. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• VERAS, A. P. B. B. ; MORAES, L. L. ; FERNANDES, A. M. . Aspectos da etnoornitologia em comunidades tradicionais do nordeste: uma revisão de literatura. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• MOURA, C. ; ARAUJO, H. F. P. ; ALEIXO, A. ; DE FREITAS MARIANO, ERICH ; FERNANDES, A. M. ; Wink, Michael . The historical connection between Amazonia and Atlantic forest revealed by the phylogeographic patterns of Arremon taciturnus (Hermann, 1783) (Aves, Emberizidae). 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• FERNANDES, A. M. . Biogeografia e Conservação de Aves Neotropicais. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ARAUJO, T. C. ; PEREIRA, A. K. L. ; VERAS, A. P. B. B. ; FERNANDES, A. M. . Avifauna do parque estadual da mata da Pimenteira: riqueza, endemismo e conservação. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• FERNANDES, A. M. ; HOFMANN, T. ; OLSSON, URBAN ; BATISTA, ROMINA ; ALEIXO, ALEXANDRE ; ANTONELLI, A. . Historical Biogeography of Topaza hummingbirds. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• PEREIRA, A. K. L. ; ARAUJO, T. C. ; VERAS, A. P. B. B. ; CARVALHO, W. A. ; MOURA, L. E. S. ; FERNANDES, A. M. . XV JORNADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO DA UFRPE. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• THOM, GREGORY ; SOUZA-NEVES, T. ; SEQUEIRA, FERNANDO ; SARDELLI, CARLA H. ; SANTOS, MARCOS PÉRSIO ; ROCHA, TAINÁ C. ; RIBAS, CAMILA C. ; RÊGO, PÉRICLES SENA ; MARTINS, DENISE M. ; FERREIRA, MATEUS ; FERNANDES, A. M. ; DANTAS, SIDNEI M. ; BURLAMAQUI, TIBÉRIO CÉSAR TORTOLA ; BATISTA, ROMINA ; BANDEIRA, CINTHIA H. M. M. ; ARAÚJO-SILVA, LUCAS EDUARDO ; VALLINOTO, MARCELO ; ALEIXO, ALEXANDRE . Models of diversification and comparative phylogeography of Amazon birds. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MOURA, CARINA CARNEIRO DE MELO ; Wink, Michael ; FERNANDES, A. M. . Phylogeography of Polioptila dumicola (Masked gnatcatcher) and P. Plumbea (Tropical gnatcatcher) revealed paraphyly and a complex history. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• COLE, T. C. H. ; SIEBERT-COLE, E. ; CARVALHO, F. A. ; FERNANDES, A. M. ; LEANDRO, T. D. ; CAMELO, M. C. ; FARIAS, I. P. ; HINGST-ZAHER, E. . Phylogeny of Plants, Animals, and Languages - Educational Posters in Portuguese. Filogenia de Plantas, Animais e Línguas - Pôsteres Educativos em Português 2025 (Ensino).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2025 - Atual

  Purple Martins and Urban Green Spaces, Descrição: rotecting avian Brazilian migratory pathways and urban green areas with multinational partners. We strive to conserve areas threatened by human conflicts, urban structures and vegetation loss by monitoring and sampling Purple Martins roosts, conducting community engagement, proposing legal tools to preserve urban vegetation and deploying satellite telemetry to analyze spatial patterns of foraging and roosting, understanding local and long-distance movements.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Mendes Fernandes - Coordenador / Clarissa Santos - Integrante / Erika Hingst-Zaher - Integrante.

• 2024 - Atual

  Genoma de referência de Dendrocolaptes medius, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Mendes Fernandes - Coordenador / ALEIXO, ALEXANDRE - Integrante / Renata Rossato - Integrante.

• 2022 - Atual

  Sistemática, Biogeografia e Conservação de vertebrados das áreas de altitude do Domínio das Caatingas no Nordeste brasileiro, Descrição: A região das caatingas é marcada por alta diversidade e taxas de endemismo em comparação com outras regiões semiáridas do mundo. Pesquisas ao longo das últimas décadas demonstraram o papel chave das áreas de altitude nos padrões de riqueza e diversidade deste bioma, as quais atualmente representam parte significativa das áreas prioritárias para a conservação da Caatinga, concentrando grande número de espécies endêmicas. Devido às chuvas orográficas, florestas mésicas ocorrem nas encostas e/ou nos topos dessas áreas que são popularmente conhecidas como brejos de altitude. Tais áreas abrigam espécies compartilhadas ou espécies irmãs com as grandes florestas tropicais vizinhas (Amazônica e Atlântica), testemunhando o passado dinâmico de expansão e contração desses biomas. Todavia, o número de espécies continua subestimado nessas regiões, bem como as principais ameaças à sua fauna e flora. Igualmente, os processos evolutivos responsáveis por essa grande diversidade e taxas de endemismo permanecem pouco conhecidos. O presente projeto objetiva, utilizando-se de dois grupos importantes e ameaçados de vertebrados: (1) descrever espécies crípticas previamente identificadas em estudos de filogeografia recentes; (2) avaliar a presença e a abundância de doenças emergentes (fungo quitrídio em anfíbios) e parasitas (malária aviária) nessas áreas; (3) testar hipóteses de diversificação das faunas de anfíbios e aves nas áreas de altitude do nordeste brasileiro usando técnicas de filogeografia multilocus e sequenciamento de nova geração. Nós faremos expedições a campo para complementar nossas amostras, identificaremos a presença de parasitos em aves e anfíbios e usaremos métodos de taxonomia integrativa para descrever espécies crípticas previamente identificadas em outros trabalhos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Alexandre Mendes Fernandes - Integrante / Henrique Batalha Filho - Integrante / Luís Fábio Silveira - Integrante / Geovana S Sandes - Integrante / Adrian Antonio Garda - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2023

  Origem e evolução da avifauna dos Brejos de Altitude do Nordeste: compreendendo as conexões passadas entre Mata Atlântica e Amazônia, Descrição: There are very few studies in northeastern Brazil, a region that is home to a variety of environments used to propose hypotheses and models of diversification, but have not had an empirical contribution to advance on these discussions, particularly with the contribution of molecular biology. In northeastern Brazil, forest refuges are result from processes of expansion and shrinkage of forests during climate fluctuations and were cited as the hypotheses to explain the occurrence of disjunct rainforest of the Amazon, in the coastal region, as well as forest enclaves of mountains located in the area of Caatinga, a semi-arid region. These enclaves, known as Brejos de Altitude occur between c. 500 and 1,100 meters above sea level, where orographic rains ensure higher levels of rainfall to 1200mm / year. Some authors suggest that the Brejos de Altitude were part of one of the corridors connecting the Atlantic Forest and Amazon during the warmer periods of the Plio-Pleistocene. However, phylogenetic and phylogeographic studies suggest that the connections between the Atlantic Forest and Amazon occurred in different geological periods from the Miocene, c. 26 Ma, which raises questions that support the Brejos de Altitude as an unique biogeographical entity. The difficulty to test these hypothesis is associated with the limited availability of material covering the entire distrution of the Brejos de Altitude and other related areas for use in molecular analyzes. Moreover, these environments are considered the most endangered in the Atlantic Forest and factors that generate these threats are still occuring today. Which may compromise the future existence of the organisms that can be used as evidence for the above studies.In recent years several studies have shown the importance of integrating phylogenetic information on conservation programs. For example, the combination of dated phylogenies with models of distribution of the organisms allow us to understand the effects of climate change in the past, and use them for planing the conservation in the face of current and future climate change. Studies of molecular phylogeny and distribution modeling have shown that different bird species respond differently against climate change. The information of how species have responded in the past against the intense climate change can be used to study the degree of susceptibility and response of biota to current and future climate change. This knowledge have a fundamental importance in the context of global warming already observed and expected for several regions of the planet. Therefore, is essential to the development of public policies to mitigate the effects of these changes on biodiversity.The aim of this study is to investigate different groups of birds to understand the current disjunct distribution (ie the Atlantic Forest, the Amazon and the Brejos de Altitude) is the result of a single large event of fragmentation / connection of tropical forests during the Pleistocene; different events of fragmentation in different periods of global cooling; or long-distance dispersal events.For this, ecological approaches (niche modeling) will be integrated with evolutionary approaches (historical scenarios testing diversification through Approximate Bayesian Computation and Theory of coalescence).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Mendes Fernandes - Coordenador / Michael Wink - Integrante / Luís Fábio Silveira - Integrante / Jason Weir - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2018

  Distribuição, origem e diversificação da avifauna endêmica da Caatinga, Descrição: A Caatinga representa a mais isolada, diferenciada, e fito-geograficamente distinta região semi-árida do Neotrópico. Por muitos anos, este bioma foi considerado como uma região pouco diversa, com baixo grau de endemismo, e pouca identidade biogeográfica. No entanto, estudos recentes apontam uma elevada taxa de endemismo para diferentes grupos de vertebrados, incluindo aves. Do ponto de vista biogeográfico, a Caatinga faz parte do Bioma das florestas secas (Seasonally Dry Tropical Forests) que se distribui de forma descontínua por toda a região Neotropical em regiões com baixa precipitação anual e estações secas prolongadas. A vegetação deste bioma possui características fisiológicas xerofíticas para responder ao estresse hídrico. Do ponto de vista evolutivo, as florestas secas neotropicais contêm plantas endêmicas que pertencem a clados monofiléticos antigos, sugerindo uma longa historia de isolamento e adaptação. A fauna da Caatinga, no entanto, tem sido tradicionalmente vista como formada por elementos de ambientes mésicos (provenientes de florestas úmidas), sem aparentes adaptações à seca. Estudos recentes com mamíferos, no entanto, têm desafiado esta visão, sugerindo que a mastofauna da Caatinga inclui linhagens antigas originadas em áreas abertas. O financiamento solicitado nesta proposta tem como objetivo estudar as origens biogeográficas e históricas da avifauna endêmica da Caatinga. Propomos a utilização de uma abordagem filogenética e de genética de populações, associada com modelos explícitos de distribuição geográfica, para estimar padrões de endemismo, riqueza de espécies, e diversidade filogenética na Caatinga. Para alcançar os nosso objetivos iremos produzir filogenias calibradas para todos os 51 táxons de aves (33 espécies e 18 subespécies) endêmicos Caatinga. Especificamente, pretendemos: 1) Determinar a origem biogeográfica de todos os táxons de aves endêmicos da Caatinga, determinando se os seus ancestrais eram animais de ambientes florestais úmidos (mésicos) ou de áreas ambientes mais secos (xéricos); 2) Descrever os padrões de distribuição das aves endêmicas da Caatinga, avaliando se algumas regiões geográficas dentro da Caatinga possuem uma maior quantidade de espécies exclusivas do que outras; 3) Testar modelos temporais e hipóteses de diversificação das aves endêmicas da Caatinga; e 4) Testar a hipótese de conservatismo de nicho (seleção fenotípica) em treze pares de táxon com padrões de distribuição alopatrica (na Caatinga e no Chaco). Nesta proposta propomos usar métodos de sequenciamento de segunda geração (Next-generation sequencing, NGS) para realizar inferências da estrutura populacional, relações filogenéticas, processos históricos entre populações/espécies irmãs na Caatinga e o Chaco, e para testar hipóteses de conservatismo de nicho (variação fenotípica em relação à variação genotípica). Este estudo irá representar o primeiro trabalho de filogeografia comparada com aves em toda a Caatinga, uma região que tem sido altamente negligenciada do ponto de vista histórico-evolutivo. Nossa proposta de obter filogenias para todos os clados com táxons endêmicos é inédita para a região, e representará um importante avanço para responder e gerar perguntas evolutivas sobre as origens da biota da Caatinga. Além de utilizar métodos tradicionais de seqüenciamento, iremos obter dados genéticos de última geração, capazes de fornecer dados genômicos (de centenas de loci independentes). Esta ambiciosa proposta tem também como um dos seus objetivos principais fortalecer a coleção de aves da Universidade Federal de Pernambuco, a maior coleção ornitológica sediada na região nordeste do Brasil, ampliando o seu acervo de Recursos Genéticos (tecidos), e abrindo novas linhas de investigação em um ambiente altamente negligenciado como a Caatinga, estabelecendo uma rede de colaborações estaduais, nacionais e internacionais. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Mendes Fernandes - Integrante / LUCIANO N. NAKA - Coordenador / Fábio Sarubbi Raposo do Amaral - Integrante / Gustavo Adolfo Bravo - Integrante / Gustavo Sebastian Cabanne - Integrante / Manuella Andrade de Souza - Integrante / Daniele Mariz - Integrante.

• 2014 - Atual

  Compreendendo a origem da diversidade de aves da Caatinga e sua relação com outros biomas Neotropicias para subsidiar ações de conservação, Descrição: A região Neotropical abriga mais espécies do que qualquer outra região tropical. Durante várias décadas, os pesquisadores têm procurado principais explicações para essa riqueza de espécies e muitos modelos de diversificação foram propostos. No entanto, tornou-se evidente que a alta biodiversidade Neotropical não é o resultado de um único evento histórico ou processo de diversificação. Diferentes regiões e biomas têm histórias, padrões de riqueza de espécies e taxas de diversifição muito diferentes. As causas subjacentes de tais diferenças são complexas, mas podem estar relacionadas a história geológica, taxas de dispersão entre os biomas seguido por diversificação in situ e interações ecológicas. Assim para que se tenha uma melhor compreensão da região Neotropical é importante que seja feita uma análise ambrangente estudando diferentes biomas e ambientes. Portanto esta proposta tem como finalidade fazer um avanço fundamental no conhecimento dos processos que determinaram os padrões de diversidade na região Neotropical para uma melhor compreensão do tempo evolutivo e taxas de especiação analisando linhagens de aves em diferentes biomas. Pretende-se fazer uma avaliação em grande escala da importância relativa de fatores ambientais na diversificação das aves neotropicais utilizando sequenciamento e modelagem de nicho.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Mendes Fernandes - Coordenador / Alexandre Aleixo - Integrante / Michael Wink - Integrante / Alexandre Antonelli - Integrante / Luciano Naka - Integrante / Carina Moura - Integrante.

• 2012 - Atual

  Filogeografia comparativa de aves das vegetações abertas da América do Sul com ênfase nas campinas da Amazônia, Descrição: A floresta Amazônica é cercada por duas grandes áreas de vegetação aberta, a Gran Sabana na região das Guianas e o cerrado do Planalto Central do Brasil. Entre essas duas regiões existe grande similaridade na composição de espécies. Acredita-se que essa similaridade taxonômica se deve a mudanças climáticas do Pleistoceno, assumindo-se que a floresta amazônica se retraiu e fragmentou, facilitando o intercâmbio biótico durante períodos glaciais. Atualmente manchas de áreas abertas estão presentes também no interior da floresta amazônica (campinas e campinaranas), no litoral Atlântico e na base dos Andes. Não se sabe ainda se as espécies da Gran Sabana e do cerrado estão isoladas ou conectadas geneticamente. São propostos três corredores de dispersão entre essas duas grandes regiões: 1) corredor oeste (base dos Andes); 2) corredor central (campinas e campinaranas); 3) corredor leste (restingas do Atlântico). Neste contexto as campinas e campinaranas são áreas de interesse especial a serem estudadas devido a sua distribuição insular, alto endemismo de espécies e por serem o habitat menos estudado na Amazônia. Este projeto tem como objetivo estudar as relações filogenéticas entre espécies e populações de aves presentes nas áreas de vegetação aberta na Amazônia (campinas amazônicas) e nas regiões adjacentes: o cerrado do Planalto Central do Brasil, a Gran Sabana na região das Guianas, as restingas do litoral Atlântico e a base dos Andes. Utilizando sequencias geradas a partir de sequenciamento de nova geração e sanger, iremos testar: 1) qual a principal rota de dispersão cerrado ↔ Guiana; 2) se existe fluxo gênico entre as campinas Amazônicas; 3) até que ponto a floresta ombrófila Amazônica funciona como barreira; 4) influências dos rios como barreira geográfica. Assim esperamos contribuir ao entendimento de padrões e processos biogeográficos de aves em vegetações abertas na América do Sul.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Mendes Fernandes - Coordenador / Alexandre Aleixo - Integrante / Alexandre Antonelli - Integrante.

• 2004 - 2005

  PROBIO - Projeto de Conservação e utilização Sustentável da diversidade Biológica, Inventário Faunístico da área do Rio Madeira, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Mendes Fernandes - Integrante / Mario Conh-Haft - Coordenador.

• 2003 - 2004

  Tropical Ecossistem Assessiment and Monitoring (TEAM), Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Mendes Fernandes - Integrante / Mario Conh-Haft - Coordenador.

• 2000 - 2002

  Efeito da fragmentação de florestas na estrutura populacional, na condição corporal e na variabilidade genética de aves do sudeste do Brasil, Descrição: Bolsista de iniciação científica (CNPq). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Mendes Fernandes - Integrante / Miguel Angelo Marini - Coordenador.

Prêmios