Raquel Lopes Costa

Doutora e mestre em modelagem computacional pelo Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Rio de Janeiro (CAPES 6). Possui graduação em ciências biológicas, nas modalidades de licenciatura e bacharelado, pela Universidade Federal de Ouro Preto - UFOP, Minas Gerais..

Informações coletadas do Lattes em 29/08/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Modelagem Computacional

2010 - 2014

Laboratório Nacional de Computação Científica
Título: GeNNet: Uma abordagem automatizada na análise, reconstrução e gerenciamento de redes de interações gênicas utilizando dados longitudinais de transcriptomas de hospedeiros do SIV
Orientador: em University of Manchester ( Jean-Marc Schwartz e David Robertson)
com Fabio Andre Machado Porto. Coorientador: Marcelo Ribeiro-Alves. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: workflow científico; banco de dados em grafos; redes de co-expressão gênica; biologia sistêmica; virus HIV e SIV; mineração de dados. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Banco de dados. Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Scientific workflow.

Mestrado em Modelagem Computacional

2008 - 2010

Laboratório Nacional de Computação Científica
Título: Filodinâmica e Evolução Molecular do Vírus da Dengue,Ano de Obtenção: 2010
Carlos Eduardo Guerra Schrago.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Evolucao Molecular; Virus da Dengue.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Evolucao Molecular. Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Banco de dados.

Especialização em Geotecnologias aplicadas à análise de bacias hidrográficas

2006 - 2007

Universidade Federal Fluminense
Título: Analise Multitemporal da Cobertura Vegetal no Baixo Curso do Rio Guapi-Macacu, RJ
Orientador: Angélica Carvalho Di Maio

Graduação em Ciências Biológicas Bacharelado

2003 - 2005

Universidade Federal de Ouro Preto
Título: Efeito de Borda em Aspectos Estruturais de Remanesentes de Floresta Estacional Semidecídua na Estacao Ecologica do Tripuí, Ouro Preto/ MG
Orientador: Marise Barreiro Horta
Bolsista do(a): Fundação Gorceix, FG, Brasil.

Graduação em Ciencias Biológicas Licenciatura Plena

1999 - 2003

Universidade Federal de Ouro Preto

Pós-doutorado

2016 - 2020

Pós-Doutorado. , Instituto Nacional de Câncer, INCA, Brasil. , Bolsista do(a): Ministerio da saúde, MS, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos / Especialidade: Virologia. , Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: biologia computacional.

2015 - 2016

Pós-Doutorado. , Instituto Militar de Engenharia, IME, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: biologia computacional.

2015 - 2015

Pós-Doutorado. , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Scientific workflow. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformatica.

Formação complementar

2017 - 2017

International course on theoretical and applied aspects of systems biology. (Carga horária: 40h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.

2017 - 2017

Escola Supercomputador SDUMONT. (Carga horária: 21h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2016 - 2016

Introduction to the Biology of Cancer. (Carga horária: 40h). , Johns Hopkins University, JHU, Estados Unidos.

2016 - 2016

Graph Analytics for Big Data. (Carga horária: 20h). , University of California San Francisco, UCSF, Estados Unidos.

2012 - 2012

Introdução a workflows científicos paralelos e distribuídos. (Carga horária: 4h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2012 - 2012

Redes complexas. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2011 - 2011

Ferramentas de bioinf. aplicadas à análise de sequências genômicas, metage. (Carga horária: 80h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Programação Java para iniciantes. (Carga horária: 56h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2007 - 2007

Modelagem de biodiversidade: distribuição geográfica potencial de espécies. (Carga horária: 38h). , Instituto de Pesquisas Ecológicas, IPÊ, Brasil.

2007 - 2007

Modelos de dinâmica hospedeiro-parasitóide. (Carga horária: 14h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2007 - 2007

Modelagem de sistemas ecológicos em tempo contínuo. (Carga horária: 14h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Big Data.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Sistêmica.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Workflow científico.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos/Especialidade: Evolucao Molecular.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Banco de dados.

Organização de eventos

LAENDER, A. ; PORTO, F. ; CASANOVA, M. A. ; Raquel L. Costa . 44th International Conference on Very Large Data Bases (VLDB). 2018. (Congresso).

PORTO, F. ; OGASAWARA, E. ; COSTA, RAQUEL L. ; CAVALCANTI, M. C. . XXX Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD). 2015. (Outro).

Judice, S ; KREMPSER, E. ; Costa, RL ; SIMAS, J. G. ; HIGASHI, S. ; Capriles, PVSZ . III Encontro Acadêmico de Modelagem Computacional (EAMC). 2010. (Outro).

Capriles, PVSZ ; Radtke, JJ ; Judice, S ; Trevizani, R ; Costa, RL . II Encontro Academico de Modelagem Computacional (EAMC). 2009. (Outro).

Participação em eventos

3rd ICGEB Workshop on HPV associated malignancies: biology, prevention and therapy.Identifying biomarkers in different stages of HNSC in HPV+/HPV- profiles. 2017. (Oficina).

I International Meeting in Oncology Research.Analysis of the cervical microbiome and potential biomarkers from postpartum HIV-positive women displaying cervical intraepithelial lesions. 2017. (Encontro).

I International Meeting in Oncology Research.Co-expression network interactions using multi-omic data in head-and-neck squamous cell cancer with HPV+ and HPV- profiles. 2017. (Encontro).

11th X-Meeting - International conference of the Brazilian association for bioinformatics and computational biology. 2015. (Encontro).

XXX Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2015. (Simpósio).

XLDB South America (satellite workshop). 2014. (Oficina).

11th Computational Methods in Systems Biology (CMSB). Organizing SIV Gene Network Modules using a Graph Database. 2013. (Congresso).

14th International Conference on Systems Biology (ICSB). Reconstruction of SIV regulatory pathways by inverse dynamic network inference. 2013. (Congresso).

13th International Conference on Systems Biology (ICSB). Development of a Computational Environmental for Modeling and Analysis of Genetic Regulatory Networks. 2012. (Congresso).

XXXII CSBC e VI Workshop e-Science. Ambiente Computacional para Modelagem e Análise de Redes de Regulação Gênica.. 2012. (Congresso).

7th X-Meeting - International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology.Population analysis of serotypes of dengue virus based on sequence variation. 2011. (Encontro).

IV Jornada de Modelagem Computacional.Filodinâmica e Evolução Molecular dos Sorotipos de Vírus da Dengue. 2011. (Outra).

6th X-Meeting - International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology.Naive Bayes Classifier Applied to DNA Barcoding. 2010. (Encontro).

6th X-Meeting - International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology.Comparative Evolutionary Analysis of the Dengue Virus Serotypes. 2010. (Encontro).

55 Congresso Brasileiro de Genetica. Estudo Comparativo da Dinamica Evolutiva dos Sorotipos de Virus da Dengue. 2009. (Congresso).

5th X-Meeting - International conference of the Brazilian association for bioinformatics and computational biology.Comparative evolutionary analysis of the dengue virus serotypes. 2009. (Encontro).

5th X-Meeting - International conference of the Brazilian association for bioinformatics and computational biology.DENV database for dengue virus. 2009. (Encontro).

3rd Meeting on Computational Modeling. 2008. (Encontro).

I Encontro Acadêmico de Modelagem Computacional do LNCC. 2008. (Encontro).

VIII Congresso de Ecologia do Brasil. Modelagem da distribuiçao potencial de Brachyteles arachnoides com base em variaveis climaticas. 2007. (Congresso).

VII Congresso de Ecologia do Brasil, Avanços nos estudos de ecossistemas terrestres, marinhos e de águas continentais. Efeito de borda em Aspectos Estruturais de remanescentes de Floresta Estacional Semidecidual na Estacao Ecologica do Tripui, Ouro Preto. 2005. (Congresso).

4 Encontro Nacional de Biologos.Corantes Naturais como Alternativa de Tingimento de Fibras de Sisal. 2002. (Encontro).

Participação em bancas

Aluno: Frederico Tosta de Oliveira

CAVALCANTI, M. C.; SALLES, R. M.; MATTOSO, M. L. Q.;Raquel L. Costa; GOLDSCHMIDT, R. R.; CRUZ, S. M. S.. Uma arquitetura para apoiar experimentos de detecção de Bootnets. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Engenharia de Defesa) - Instituto Militar de Engenharia.

Orientou

Felipe Alves de Oliveira

Mineração de regras de associação de multirrelação em datasets na web de dados; 2015; Dissertação (Mestrado em Sistemas e Computação) - Instituto Militar de Engenharia,; Coorientador: Raquel Lopes Costa;

Produções bibliográficas

  • GADELHA, LUIZ M. R. ; SIRACUSA, PEDRO C. ; DALCIN, EDUARDO COUTO ; SILVA, LUÍS ALEXANDRE ESTEVÃO ; AUGUSTO, DOUGLAS A. ; KREMPSER, EDUARDO ; AFFE, HELEN MICHELLE ; COSTA, RAQUEL LOPES ; MONDELLI, MARIA LUIZA ; MEIRELLES, PEDRO MILET ; THOMPSON, FABIANO ; CHAME, MARCIA ; ZIVIANI, ARTUR ; SIQUEIRA, MARINEZ FERREIRA . A survey of biodiversity informatics: Concepts, practices, and challenges. Wiley Interdisciplinary Reviews-Data Mining and Knowledge Discovery , v. 11, p. e1394, 2021.

  • DE OLIVEIRA, FELIPE ALVES ; VILLOTE, GUILHERME DOS SANTOS ; COSTA, RAQUEL LOPES ; GOLDSCHMIDT, RONALDO RIBEIRO ; CAVALCANTI, MARIA CLÁUDIA . Minerando Regras de Associação de Multirrelação na Web de Dados. iSys - Revista Brasileira de Sistemas de Informação , v. 13, p. 77-100, 2020.

  • COSTA, RAQUEL L. ; BORONI, MARIANA ; SOARES, MARCELO A. . Distinct co-expression networks using multi-omic data reveal novel interventional targets in HPV-positive and negative head-and-neck squamous cell cancer. Scientific Reports , v. 8, p. 15254, 2018.

  • COSTA, R.L. ; PREVEDELLO, J.A. ; DE SOUZA, B.G. ; CABRAL, D.C. . Forest transitions in tropical landscapes: A test in the Atlantic Forest biodiversity hotspot. APPLIED GEOGRAPHY , v. 82, p. 93-100, 2017.

  • COSTA, RAQUEL L. ; GADELHA, LUIZ ; RIBEIRO-ALVES, MARCELO ; PORTO, F?BIO . GeNNet: an integrated platform for unifying scientific workflows and graph databases for transcriptome data analysis. PeerJ , v. 5, p. e3509, 2017.

  • CURTY, GISLAINE ; COSTA, RAQUEL L. ; SIQUEIRA, JULIANA D. ; MEYRELLES, ANGELA I. ; MACHADO, ELIZABETH S. ; SOARES, ESMERALDA A. ; SOARES, MARCELO A. . Analysis of the cervical microbiome and potential biomarkers from postpartum HIV-positive women displaying cervical intraepithelial lesions. Scientific Reports , v. 7, p. 17364, 2017.

  • ALMEIDA, P. J. A. ; Costa, RL ; Maja Kajin ; PALMEIRA, C. F. ; Vieira, MV . A lógica por trás da seleção natural: teoria dos jogos e as Estratégias Evolutivamente Estáveis. BIOMATEMÁTICA (UNICAMP) , v. 26, p. 1-12, 2016.

  • Costa, RL ; Voloch, Carolina M. ; Schrago, Carlos G. . Comparative evolutionary epidemiology of dengue virus serotypes. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION , v. 12, p. 309-314, 2012.

  • DE OLIVEIRA, FELIPE ALVES ; COSTA, RAQUEL LOPES ; GOLDSCHMIDT, RONALDO R. ; CAVALCANTI, MARIA CLÁUDIA . Multirelation Association Rule Mining on Datasets of the Web of Data. In: the XV Brazilian Symposium, 2019, Aracaju. Proceedings of the XV Brazilian Symposium on Information Systems - SBSI'19, 2019. p. 1.

  • OLIVEIRA, F. A. ; Raquel L. Costa ; GOLDSCHMIDT, R. R. ; CAVALCANTI, M. C. . Mineração de Regras de Associação Multirrelação em Grafos: Direcionando o Processo de Busca. In: http://sbbd.org.br/2017/, 2017, Uberlândia. Proceedings [do] 32nd Brazilian Symposium on databases (SBBD), 2017.

  • OLIVEIRA, F. A. ; MARTINS, Y. C. ; ROCHA, D. S. B. ; SIQUEIRA, M. F. ; SILVA, L. A. E. ; Raquel L. Costa ; GOLDSCHMIDT, R. R. ; CAVALCANTI, M. C. . JabotG: Extending the Herbarium dataset frontiers. In: 11th Metadata and Semantics Research Conference (MTSR), 2017, Tallinn. Book of abstracts & Posteres, 2017. p. 45-53.

  • Raquel L. Costa ; Grelle, CEV . Modelagem da distribuição potencial de Brachyteles arachnoides com base em variáveis climáticas. In: VIII Congresso de Ecologia do Brasil, 2007. Anais do VIII Congresso de Ecologia do Brasil, 2007. p. 1-2.

  • Amaral, IB ; Vitarelli, SM ; Costa, RL ; Castro, PTC ; Ferreira, FA ; Messias, MCTB ; Drumond, MA . Corantes Naturais como Alternativa de Tingimento de Fibras de Sisal. In: IV Encontro Nacional de Biólogos; II Encontro de Biólogos do CRBio 4; I Encontro de Biologia de Ouro Preto, 2002, Ouro Preto. IV Encontro Nacional de Biólogos; II Encontro de Biólogos do CRBio 4; I Encontro de Biologia de Ouro Preto, 2002. v. IV.

  • FERREIRA, GISLAINE CURTY ; RL, COSTA ; JD, SIQUEIRA ; AI, MEYRELLES ; ES, MACHADO ; EA, SOARES ; AM, SOARES . P1.20Analysis of bacterial diversity in hiv/hpv coinfected patients with cervical intraepithelial lesions through next-generation sequencing. In: STI and HIV World Congress Abstracts, July 912 2017, Rio de Janeiro, Brazil, 2017, Rio de Janeiro. Systems Biology and Novel Technologies For Molecular Analysis and Diagnosis, 2017. p. A51.2.

  • Raquel L. Costa ; SCHWARTZ, J. ; ROBERTSON, D. L. ; PORTO, F. . Organizing SIV gene network modules into graph database. In: Computational Methods in Systems Biology (CMSB), 2013, Klosterneuburg. Proceedings of the International Conference on Computational Methods in Systems Biology. London: Springer, 2013. v. 8130. p. 208-281.

  • Costa, RL . Big data, e-science & systems biology.. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Costa, RL . Redes de co-expressão gênica e oncoviroses. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • CURTY, G. ; Raquel L. Costa ; SIQUEIRA, J. ; MEYRELLES, A. ; MACHADO, E. ; SOARES, E. ; SOARES, M. A. . Analysis of the cervical microbiome and potential biomarkers from postpartum HIV-positive women displaying cervical intraepithelial lesions. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • Raquel L. Costa ; BORONI, M. ; SOARES, M. A. . Co-expression network interactions using multi-omic data in head-and-neck squamous cell cancer with HPV+ and HPV- profiles. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • Raquel L. Costa ; BORONI, M. ; SOARES, M. A. . Identifying biomarkers in different stages of HNSC in HPV+/HPV- profiles. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • Raquel L. Costa ; MARCHETTI, L. ; RIBEIRO-ALVES, M. ; WEBBER, A. ; PORTO, F. ; ROBERTSON, D. L. ; SCHWARTZ, J. . Reconstruction of SIV regulatory pathways by inverse dynamic network inference. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Raquel L. Costa ; RIBEIRO-ALVES, M. ; PORTO, F. . Ambiente computacional para modelagem de redes de regulação gênica. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Raquel L. Costa ; Schrago, CG . Population analysis of serotypes of dengue virus based on sequence variation. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Costa, RL . Filodinâmica e evolução molecular dos sorotipos de vírus da dengue. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Costa, RL ; BARRETO, A. D. M. S. . Naive Bayes Classifier Applied to DNA Barcoding. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Costa, RL ; Schrago, CG . Estudo Comparativo da Dinamica Evolutiva dos Sorotipos de Virus da Dengue. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Costa, RL ; Lara, PSC ; Trevizani, R . Denv Database for Dengue Virus. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Costa, RL ; Schrago, CG . Comparative Evolutionary Analysis of the Dengue Virus Serotypes. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Costa, RL ; Horta, MB . Efeito de Borda em Aspectos Estruturais de Remanescente de Floresta Estacional Semidecidual na Estacao Ecologica do Tripui, Ouro Preto/MG. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Amaral, IB ; Vitarelli, SM ; Costa, RL ; Castro, PTC ; Ferreira, FA ; Messias, MCTB ; Drumond, MA . Corantes Naturais como Alternativa de Tingimento de Fibras de Sisal. 2002. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • GADELHA, L. M. R. ; SIRACUSA, P. C. ; ZIVIANI, A. ; DALCIN, E. C. ; AFFE, H. M. ; SIQUEIRA, M. F. ; SILVA, L. A. E. ; AUGUSTO, D. A. ; KREMPSER, E. ; CHAME, M. ; COSTA, RAQUEL L. ; MEIRELLES, P. M. ; THOMPSON, F. . A Survey of e-Biodiversity: Concepts, Practices, and Challenges 2018 (Preprint).

Outras produções

OLIVEIRA, F. A. ; COSTA, R.L. ; GOLDSCHMIDT, R. R. ; CAVALCANTI, M. C. . MRAR+ (Algoritmo para mineração de regras de associação na Web de Dados). 2017.

GeNNet: an integrated platform for unifying scientific workflows and graph databases for transcriptome data analysis. 2016.

Raquel L. Costa . Introdução ao R nas ciências da vida. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Raquel L. Costa . Introdução ao Linux nas ciências da vida. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Raquel L. Costa ; GALL, G. . R em ambientes de High-Performance Computing (HPC). 2018. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

SOARES, E. ; SOARES, MARCELO A. ; SIQUEIRA, JULIANA D. ; COSTA, R.L. ; MISAEL, B. ; PRELLWITZ, I. ; REIS, L. ; CURTY, G. . Análise experimental e in-silico de viromas: da descoberta de novos vírus à montagem de genomas virais. 2018. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - X Curso de verão de pesquisa em oncologia).

Raquel L. Costa . Introdução ao Linux nas ciências da vida. 2018. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Curso).

Raquel L. Costa . Introdução ao R nas ciências da vida. 2018. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Curso).

Raquel L. Costa ; GALL, G. . R em ambientes de High-Performance Computing (HPC). 2018. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Curso).

Projetos de pesquisa

  • 2018 - 2020

    Plasmacitoma solitário: análise genética e parâmetros clínicos-terapêuticos de um centro brasileiro, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Fábio Leal - Coordenador / Eric Pena - Integrante / Carolina Furtado - Integrante / Lu Barreto - Integrante / JULIANA GRAVINA - Integrante.

  • 2017 - 2020

    INCT em Ciência de Dados (INCT-CiD) - Processo CNPq no. 465.560/2014-8, Descrição: O Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Ciência de Dados (INCT-CiD), sob a coordenação de Artur Ziviani (LNCC/MCTIC) e vice-coordenação de Fabio Porto (LNCC/MCTIC), envolve as seguintes instituições: LNCC, CEFET-RJ, IME, UFC, UFJF, UFPR, UTFPR e o Centro de Inovação Sueco-Brasileiro (CISB). O INCT-CiD propõe-se a atuar no eixo ciência-indústria-governo por meio de ciência de dados através de três linhas de pesquisa principais: (i) gerência de dados; (ii) análise de dados; e (iii) análise de redes complexas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Fabio Porto - Integrante / Maria Cláudia Cavalcanti - Integrante / Ronaldo Moreira Salles - Integrante / Ronaldo Ribeiro Goldschmidt - Integrante / Artur Ziviani - Coordenador / Luiz Gadelha - Integrante / Eduardo Ogasawara - Integrante / Marcelo Dutra Fragoso - Integrante / Ricardo Lüders - Integrante.

  • 2016 - 2020

    Oncovirologia no Instituto Nacional de Câncer, Descrição: O grupo de Oncovirologia do Instituto Nacional de Câncer visa o estudo molecular, clínico e epidemiológico de oncovírus de relevância na predisposição e no desenvolvimento de malignidades humanas, como o câncer cervical (causado pelo papilomavírus humano, HPV), o hepatocarcinoma celular (causado pelos vírus das hepatites B e C, respectivamente o HBV e HCV), e o vírus da imunodeficiência humana (HIV), que predispõe sujeitos imunodeprimidos a múltiplas malignidades. O estudo das interações moleculares destes vírus com suas células hospedeiras, a epidemiologia destas oncoviroses no Brasil, e os aspectos moleculares da resistência destes aos diversos agentes antivirais trará conhecimento utilizável para o controle e a prevenção destas infecções e por conseguinte das malignidades a elas associadas, atendendo à missão institucional do Instituto Nacional de Câncer. O grupo de pesquisa participa do INCT PARA O CONTROLE DO CÂNCER (http://www1.inca.gov.br/conteudo_view.asp?id=2630). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Juliana Siqueira - Integrante / Esmeralda Soares - Integrante / Brunna Misael - Integrante / Isabel Prellwitz - Integrante / Marcelo Alves Soares - Coordenador / Fábio Leal - Integrante / Gisele Rodrigues de Oliveira - Integrante / Hector Nicolas Seuánez Abreu - Integrante / Miguel Angelo Martins Moreira - Integrante.

  • 2015 - 2019

    PubWin: Enfrentando Desafios para Publicar na Web de Dados, Descrição: O objetivo geral deste projeto e facilitar a publicação de dados e textos na Web de Dados, explicitando o significado pretendido e seguindo os princípios do Linked Data. Além da publicação de dados bem descritos e interligados, visamos ainda fornecer meios para que a modelagem dos dados possa ser feita de modo a facilitar a descoberta de conhecimento, como por exemplo, a predição de ligações entre pessoas em uma rede social ou a recomendação de produtos a partir da semelhança entre consumidores.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Maria Cláudia Cavalcanti - Coordenador / Ronaldo Ribeiro Goldschmidt - Integrante / Felipe Alves de Oliveira - Integrante / Kele Teixeira Belloze - Integrante / Julio Cesar Duarte - Integrante / Claudia Justel - Integrante / Marcus Albert Alves da Silva - Integrante / Raquel Lima Façanha - Integrante / SILAS FILHO - Integrante / Luis Alexandre Estevão - Integrante / Igor de Souza Costa - Integrante.

  • 2005 - 2007

    Capacidade perceptual de pequenos mamíferos em uma paisagem fragmentada da Mata Atlântica no Estado do Rio de Janeiro., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Carlos Eduardo de Viveiros Grelle - Integrante / Ana Claudia Delciellos - Integrante / German Forero Medina - Coordenador / Rui Cerqueira da Silva - Integrante / Marcus Vinícius Vieira - Integrante / Jayme Augusto Prevedello - Integrante., Financiador(es): Instituto BioAtlantica - Cooperação.

  • 2005 - 2007

    Monitoramento das Populacoes de Pequenos Mamiferos no Parque Nacional da Serra dos Orgãos (PARNASO), Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Carlos Eduardo de Viveiros Grelle - Integrante / Ana Claudia Delciellos - Integrante / Diogo Loretto - Integrante / Marcus Vinícius Vieira - Coordenador / Jayme Augusto Prevedello - Integrante.

  • 2005 - 2007

    Rede de Biodiversidade de Vertebrados Terrestres no Estado do Rio de Janeiro., Descrição: Este projeto tem como objetivo principal a caracterização da biodiversidade de mamíferos do Estado do Rio de Janeiro, através de uma rede cooperativa de instituições e pesquisadores, desenvolvendo e utilizando protocolos padronizados. São informações básicas para definição de políticas públicas que considerem conservação, utilização sustentável, potencial econômico e sua importância na Saúde Pública. Atividades desenvolvidas durante o projeto: (i) estruturação do banco de dados; (ii) informatização dos protocolos de coleta de espécimes; (iii) montagem da base de dados geográfica do Estado do Rio de Janeiro como suporte às coletas de espécimes e; (iv) criação de um sistema de informações geográficas com os dados de coleta. , Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (20) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Carlos Eduardo de Viveiros Grelle - Integrante / Ana Claudia Delciellos - Integrante / Diogo Loretto - Integrante / Rui Cerqueira da Silva - Coordenador / Marcus Vinícius Vieira - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Bolsa.

Projetos de desenvolvimento

  • 2014 - 2015

    CICN: Centro de Inovação em Computação em Nuvem, Descrição: Objetivo geral: desenvolver e implementar subprojetos tecnológicos científicos diversos no segmento das TICs, mediante a realização conjunta de atividades de pesquisa, desenvolvimento, absorção e transferência de tecnologias de Computação em Nuvem. Como parte das diretrizes comuns a esses subprojetos, estabelece-se também os objetivos de promover o intercâmbio cultural, de profissionais e entidades acadêmicas na área de Computação em Nuvem e de subsidiar o estabelecimento de parcerias entre órgãos do Governo Federal, Empresas Públicas, Sociedades de Economia Mista, Universidades e Unidades de Pesquisa. Objetivos específicos: definir uma arquitetura de referência para a nuvem computacional para governo eletrônico; estudar os aspectos relacionados à implantação de soluções (aplicações e serviços) de software de governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, com vistas a diminuir os custos associados ao seu ciclo de vida, aumentar a eficiência e os graus de utilidade e valor agregado; estudar a implantação de soluções de infraestrutura (software básico e middleware) para governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, que sejam interoperáveis e baseadas nos conceitos de segurança, economia verde, inteligência, distribuição, paralelismo, orientação a serviços, alto desempenho e virtualização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Coordenador / Fabio Porto - Integrante / Antonio Tadeu Azevedo Gomes - Integrante / Artur Ziviani - Integrante / Bruno Schulze - Integrante / Klaus Wehmuth - Integrante.

  • 2014 - 2015

    CICN: Centro de Inovação em Computação em Nuvem, Descrição: Objetivo geral: desenvolver e implementar subprojetos tecnológicos científicos diversos no segmento das TICs, mediante a realização conjunta de atividades de pesquisa, desenvolvimento, absorção e transferência de tecnologias de Computação em Nuvem. Como parte das diretrizes comuns a esses subprojetos, estabelece-se também os objetivos de promover o intercâmbio cultural, de profissionais e entidades acadêmicas na área de Computação em Nuvem e de subsidiar o estabelecimento de parcerias entre órgãos do Governo Federal, Empresas Públicas, Sociedades de Economia Mista, Universidades e Unidades de Pesquisa. Objetivos específicos: definir uma arquitetura de referência para a nuvem computacional para governo eletrônico; estudar os aspectos relacionados à implantação de soluções (aplicações e serviços) de software de governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, com vistas a diminuir os custos associados ao seu ciclo de vida, aumentar a eficiência e os graus de utilidade e valor agregado; estudar a implantação de soluções de infraestrutura (software básico e middleware) para governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, que sejam interoperáveis e baseadas nos conceitos de segurança, economia verde, inteligência, distribuição, paralelismo, orientação a serviços, alto desempenho e virtualização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Fabio Porto - Integrante / Antonio Tadeu Azevedo Gomes - Coordenador / Artur Ziviani - Integrante / Bruno Schulze - Integrante / Klaus Wehmuth - Integrante.

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    CICN: Centro de Inovação em Computação em Nuvem, Descrição: Objetivo geral: desenvolver e implementar subprojetos tecnológicos científicos diversos no segmento das TICs, mediante a realização conjunta de atividades de pesquisa, desenvolvimento, absorção e transferência de tecnologias de Computação em Nuvem. Como parte das diretrizes comuns a esses subprojetos, estabelece-se também os objetivos de promover o intercâmbio cultural, de profissionais e entidades acadêmicas na área de Computação em Nuvem e de subsidiar o estabelecimento de parcerias entre órgãos do Governo Federal, Empresas Públicas, Sociedades de Economia Mista, Universidades e Unidades de Pesquisa. Objetivos específicos: definir uma arquitetura de referência para a nuvem computacional para governo eletrônico; estudar os aspectos relacionados à implantação de soluções (aplicações e serviços) de software de governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, com vistas a diminuir os custos associados ao seu ciclo de vida, aumentar a eficiência e os graus de utilidade e valor agregado; estudar a implantação de soluções de infraestrutura (software básico e middleware) para governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, que sejam interoperáveis e baseadas nos conceitos de segurança, economia verde, inteligência, distribuição, paralelismo, orientação a serviços, alto desempenho e virtualização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Fabio Porto - Integrante / Antonio Tadeu Azevedo Gomes - Coordenador / Artur Ziviani - Integrante / Bruno Schulze - Integrante / Klaus Wehmuth - Integrante.

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    CICN: Centro de Inovação em Computação em Nuvem, Descrição: Objetivo geral: desenvolver e implementar subprojetos tecnológicos científicos diversos no segmento das TICs, mediante a realização conjunta de atividades de pesquisa, desenvolvimento, absorção e transferência de tecnologias de Computação em Nuvem. Como parte das diretrizes comuns a esses subprojetos, estabelece-se também os objetivos de promover o intercâmbio cultural, de profissionais e entidades acadêmicas na área de Computação em Nuvem e de subsidiar o estabelecimento de parcerias entre órgãos do Governo Federal, Empresas Públicas, Sociedades de Economia Mista, Universidades e Unidades de Pesquisa. Objetivos específicos: definir uma arquitetura de referência para a nuvem computacional para governo eletrônico; estudar os aspectos relacionados à implantação de soluções (aplicações e serviços) de software de governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, com vistas a diminuir os custos associados ao seu ciclo de vida, aumentar a eficiência e os graus de utilidade e valor agregado; estudar a implantação de soluções de infraestrutura (software básico e middleware) para governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, que sejam interoperáveis e baseadas nos conceitos de segurança, economia verde, inteligência, distribuição, paralelismo, orientação a serviços, alto desempenho e virtualização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Fabio Porto - Integrante / Antonio Tadeu Azevedo Gomes - Coordenador / Artur Ziviani - Integrante / Bruno Schulze - Integrante / Klaus Wehmuth - Integrante.

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    CICN: Centro de Inovação em Computação em Nuvem, Descrição: Objetivo geral: desenvolver e implementar subprojetos tecnológicos científicos diversos no segmento das TICs, mediante a realização conjunta de atividades de pesquisa, desenvolvimento, absorção e transferência de tecnologias de Computação em Nuvem. Como parte das diretrizes comuns a esses subprojetos, estabelece-se também os objetivos de promover o intercâmbio cultural, de profissionais e entidades acadêmicas na área de Computação em Nuvem e de subsidiar o estabelecimento de parcerias entre órgãos do Governo Federal, Empresas Públicas, Sociedades de Economia Mista, Universidades e Unidades de Pesquisa. Objetivos específicos: definir uma arquitetura de referência para a nuvem computacional para governo eletrônico; estudar os aspectos relacionados à implantação de soluções (aplicações e serviços) de software de governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, com vistas a diminuir os custos associados ao seu ciclo de vida, aumentar a eficiência e os graus de utilidade e valor agregado; estudar a implantação de soluções de infraestrutura (software básico e middleware) para governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, que sejam interoperáveis e baseadas nos conceitos de segurança, economia verde, inteligência, distribuição, paralelismo, orientação a serviços, alto desempenho e virtualização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Fabio Porto - Integrante / Antonio Tadeu Azevedo Gomes - Coordenador / Artur Ziviani - Integrante / Bruno Schulze - Integrante / Klaus Wehmuth - Integrante.

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    CICN: Centro de Inovação em Computação em Nuvem, Descrição: Objetivo geral: desenvolver e implementar subprojetos tecnológicos científicos diversos no segmento das TICs, mediante a realização conjunta de atividades de pesquisa, desenvolvimento, absorção e transferência de tecnologias de Computação em Nuvem. Como parte das diretrizes comuns a esses subprojetos, estabelece-se também os objetivos de promover o intercâmbio cultural, de profissionais e entidades acadêmicas na área de Computação em Nuvem e de subsidiar o estabelecimento de parcerias entre órgãos do Governo Federal, Empresas Públicas, Sociedades de Economia Mista, Universidades e Unidades de Pesquisa. Objetivos específicos: definir uma arquitetura de referência para a nuvem computacional para governo eletrônico; estudar os aspectos relacionados à implantação de soluções (aplicações e serviços) de software de governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, com vistas a diminuir os custos associados ao seu ciclo de vida, aumentar a eficiência e os graus de utilidade e valor agregado; estudar a implantação de soluções de infraestrutura (software básico e middleware) para governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, que sejam interoperáveis e baseadas nos conceitos de segurança, economia verde, inteligência, distribuição, paralelismo, orientação a serviços, alto desempenho e virtualização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Fabio Porto - Integrante / Antonio Tadeu Azevedo Gomes - Coordenador / Artur Ziviani - Integrante / Bruno Schulze - Integrante / Klaus Wehmuth - Integrante.

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    CICN: Centro de Inovação em Computação em Nuvem, Descrição: Objetivo geral: desenvolver e implementar subprojetos tecnológicos científicos diversos no segmento das TICs, mediante a realização conjunta de atividades de pesquisa, desenvolvimento, absorção e transferência de tecnologias de Computação em Nuvem. Como parte das diretrizes comuns a esses subprojetos, estabelece-se também os objetivos de promover o intercâmbio cultural, de profissionais e entidades acadêmicas na área de Computação em Nuvem e de subsidiar o estabelecimento de parcerias entre órgãos do Governo Federal, Empresas Públicas, Sociedades de Economia Mista, Universidades e Unidades de Pesquisa. Objetivos específicos: definir uma arquitetura de referência para a nuvem computacional para governo eletrônico; estudar os aspectos relacionados à implantação de soluções (aplicações e serviços) de software de governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, com vistas a diminuir os custos associados ao seu ciclo de vida, aumentar a eficiência e os graus de utilidade e valor agregado; estudar a implantação de soluções de infraestrutura (software básico e middleware) para governo eletrônico em nuvem, preferencialmente open source, que sejam interoperáveis e baseadas nos conceitos de segurança, economia verde, inteligência, distribuição, paralelismo, orientação a serviços, alto desempenho e virtualização.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Raquel Lopes Costa - Integrante / Fabio Porto - Integrante / Antonio Tadeu Azevedo Gomes - Coordenador / Artur Ziviani - Integrante / Bruno Schulze - Integrante / Klaus Wehmuth - Integrante.

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Prêmios

2019

Melhores artigos Técnicos do SBSI, Sociedade Brasileira de Computação.

2017

Bolsa para participação e apresentação de trabalho no 3rd ICGEB Workshop on Human Papillomavirus and associated malignancies: biology, prevention and therapy. Local: São Paulo, ICGEB.

2013

Bolsa para participação e apresentação de trabalho no 11th Computational Methods in Systems Biology (CMSB). Local: Klosterneuburg, Áustria., IST Áustria.

2012

Bolsa de estudos para realização de doutorado sanduíche do Programa Ciência sem Fronteiras. Local: Universidade de Manchester, Inglaterra, CNPq.

Histórico profissional

Experiência profissional

2016 - 2020

Instituto Nacional de Câncer

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisadora bolsista pós-doutorado, Carga horária: 40

2015 - 2016

Instituto Militar de Engenharia

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisadora bolsista pós-doutorado, Carga horária: 40

2015 - 2016

Instituto Militar de Engenharia

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professora, Carga horária: 20

Outras informações:
Colaboradora nas disciplinas: Banco de Dados (código SC015.102) e Tópicos especiais em Banco de dados (código SC310.301)

2016 - 2016

Laboratório Nacional de Computação Científica

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professora, Carga horária: 20

Outras informações:
Colaboradora na disciplina de Banco de Dados (código GA009).

2014 - 2015

Laboratório Nacional de Computação Científica

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisadora, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Pesquisadora no projeto "CICN - Centro de Inovação em Computação em Nuvem" (Descrição em projetos de desenvolvimento).

2014 - 2015

Laboratório Nacional de Computação Científica

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisadora bolsista pós-doutorado, Carga horária: 40

2010 - 2014

Laboratório Nacional de Computação Científica

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista doutorado, Carga horária: 40

2008 - 2010

Laboratório Nacional de Computação Científica

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista mestrado, Carga horária: 40

2015 - 2015

Instituto Nacional de Traumatologia e Ortopedia

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisadora colaboradora, Carga horária: 20

Outras informações:
Colaboradora dos projetos relacionados aos dados de processamento de sinais biológicos como EMG e EEG. Montagem de um workflow científico de análise dos dados resultantes desses sensores. Projeto final intitulado: "Análise da Acuidade Proprioceptiva em Diferentes Posições da Articulação do Joelho".

2006 - 2007

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Bolsista de apoio técnico APQ-4, FAPERJ, Carga horária: 40

Outras informações:
Coordenadora do banco de dados do projeto 'Rede de Vertebrados Terrestres no Estado do Rio de Janeiro'. Descrição em projetos de pesquisa.

2005 - 2006

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisadora e colaboradora, Carga horária: 20

Outras informações:
Pesquisadora e colaboradora em projetos de pesquisa no laboratório de vertebrados da UFRJ. Dentre os principais projetos estão: (i) "Monitoramento das populações de pequenos mamíferos no parque nacional da Serra dos Órgãos (PARNASO)"; (ii) "Capacidade perceptual de pequenos mamíferos em uma paisagem fragmentada"; (iii) "Rede de biodiversidade de vertebrados terrestres do Estado do Rio de Janeiro". A descrição dos projetos encontra-se em projetos de pesquisa.

2003 - 2004

Universidade Federal de Ouro Preto

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 20

Outras informações:
Estagiária no projeto "Coordenadorias das promotorias ambientais do rio São Francisco" financiado pela Fundação Gorceix, Ouro Preto, MG.

2002 - 2004

Universidade Federal de Ouro Preto

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 12

Outras informações:
Participação da equipe de pesquisadores do projeto: "Melhores condições de trabalho e produtividade para maior sustentabilidade econômica: formação gerencial de trabalhadores organizados em cooperativas e associações". Participou do subprojeto: "Alternativas para o uso de corantes naturais no artesanato de sisal no distrito de Cachoeira do Brumado, Mariana/MG".

2004 - 2004

Escolas Estaduais do Estado de Minas Gerais

Vínculo: Professora da rede estadual, Enquadramento Funcional: Professora da rede estadual de ensino de MG, Carga horária: 20

Outras informações:
Professora substituta da rede de ensino estadual do Estado de Minas Gerais. Escolas: (i) Escola Estadual Horácio Andrade; (ii) Escola Estadual Padre Afonso de Lemos; (iii) Escola Estadual Santa Rita