Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• REYES, DAFNE ALEJANDRA ; SARRÍA, VICTOR MANUEL SAURE ; SALAZAR-VIEDMA, MARCELA ; D?AFONSECA, VÍVIAN . Histone Methyltransferases Useful in Gastric Cancer Research. CANCER INFORMATICS , v. 20, p. 117693512110398, 2021.

• SALAZAR-VIEDMA, MARCELA ; VERGAÑO-SALAZAR, JUAN GABRIEL ; PASTENES, LUIS ; D?AFONSECA, VIVIAN . Simulation model for Hashimoto?s Autoimmune Thyroiditis disease. ENDOCRINOLOGY , v. 1, p. 1, 2021.

• OPAZO, M. ; Orellana, S.C. ; D?AFONSECA, VIVIAN . ASIGNATURA GENÉTICA DE LAS HISTONAS METILTRANSFERASAS Y SU IMPLICANCIA EN CÁNCER DE HÍGADO: UN ENFOQUE COMPUTACIONAL. JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS (ONLINE) , v. 32, p. 204-204, 2021.

• OPAZO, M. ; D'AFONSECA, V. ; Orellana, S.C. . ANOTACIÓN FUNCIONAL DE PROTEÍNAS HIPOTÉTICAS DENTRO DEL GENOMA DE Mycobacterium microti POR MEDIO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMÁTICAS. JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS (ONLINE) , v. 32, p. 109-109, 2021.

• VALENZUELA, F. B. ; ARENCIBIA, ARIEL D ; D'AFONSECA, V. . VALIDACIÓN DE GENES DE REFERENCIA A PARTIR DE UNA POBLACIÓN DE PLANTAS DE ARÁNDANO (Vaccinium corymbosum) REGENERADAS EN COLCHICINA. JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS (ONLINE) , v. 32, p. 186-186, 2021.

• SALAZAR-VIEDMA, MARCELA ; D'AFONSECA, V. ; REYES, D. A. . ANÁLISIS COMPUTACIONAL DE LAS ALTERACIONES GENÉTICAS DE GENES QUE CODIFICAN LAS HISTONAS METILTRANSFERASES EN CÁNCER DE ESTÓMAGO. JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS (ONLINE) , v. 32, p. 203-203, 2021.

• ANDLER, R. ; D'Afonseca, Vívian ; PINO, J. ; VALDES, C. ; SALAZAR-VIEDMA, MARCELA . Assessing the Biodegradation of Vulcanised Rubber Particles by Fungi Using Genetic, Molecular and Surface Analysis. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY , v. 9, p. 1-11, 2021.

• D'Afonseca, Vívian ; GÓNZALEZ, GLÓRIA ; SALAZAR, MARCELA ; ARENCIBIA, ARIEL D . Computational analyses on genetic alterations in the NSD genes family and the implications for colorectal cancer development. ECANCERMEDICALSCIENCE , v. 14, p. 1-14, 2020.

• D?AFONSECA, VÍVIAN ; ARENCIBIA, ARIEL D ; ECHEVERRÍA-VEGA, ALEX ; CERPA, LESLIE ; CAYÚN, JUAN P ; VARELA, NELSON M ; SALAZAR, MARCELA ; QUIÑONES, LUIS A . Identification of Altered Genes in Gallbladder Cancer as Potential Driver Mutations for Diagnostic and Prognostic Purposes: A Computational Approach. CANCER INFORMATICS , v. 19, p. 117693512092215, 2020.

• SAURE SARRÍA, VICTOR MANUEL ; ARENCIBIA, ARIEL D. ; D?AFONSECA, VÍVIAN . Xeloda Oral, Trastuzumab, and Pertuzumab Combined Drug Therapy Reduced Cervical Lymphadenopathy and Dermal Involvement in Patient With Recurrent Breast Cancer: Case Report. Journal of Investigative Medicine High Impact Case Reports , v. 8, p. 232470962094260, 2020.

• GONZÁLEZ, GLORIA ; AGUILERA, FELIPE ; D'Afonseca, Vívian . Transcriptome profiling of raspberry (Rubus idaeus Var. Amira) in response to infection by tomato ringspot virus (ToRSV). HELIYON , v. 6, p. e04518, 2020.

• ARENCIBIA, ARIEL D. ; D'Afonseca, Vívian ; CHAKRAVARTHI, MOHAN ; CASTIGLIONE, STEFANO . Learning from transgenics: Advanced gene editing technologies should also bridge the gap with traditional genetic selection. ELECTRONIC JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY , v. 41, p. 22-29, 2019.

• RABELLO, DORALINA DO AMARAL ; FERREIRA, VIVIAN D?AFONSECA DA SILVA ; BERZOTI-COELHO, MARIA GABRIELA ; BURIN, SANDRA MARA ; MAGRO, CÍNTIA LETICIA ; CACEMIRO, MAIRA DA COSTA ; SIMÕES, BELINDA PINTO ; SALDANHA-ARAUJO, FELIPE ; DE CASTRO, FABÍOLA ATTIÉ ; PITTELLA-SILVA, FABIO . MLL2/KMT2D and MLL3/KMT2C expression correlates with disease progression and response to imatinib mesylate in chronic myeloid leukemia. Cancer Cell International , v. 18, p. 1-10, 2018.

• RAMOS, DORALINA DO AMARAL RABELLO ; FERREIRA, VIVIAN D'AFONSECA DA SILVA ; BERZOTI-COELHO, MARIA GABRIELA ; BURIN, SANDRA MARA ; MAGRO, CÍNTIA LETICIA ; CACEMIRO, MAIRA DA COSTA ; SIMÕES, BELINDA PINTO ; SALDANHA-ARAUJO, FELIPE ; CASTRO, FABÍOLA ATTIÉ ; PITTELLA-SILVA, FÁBIO . Abstract 366: Association of and with chronic myeloid leukemia. CANCER RESEARCH , v. 78, p. 366-366, 2018.

• RAMOS, DORALINA DO AMARAL RABELLO ; RIBEIRO, BEATRIZ ITAI HAUPT ; CASTRO, TÉRCIA MARIA MENDES LOUSA DE ; FERREIRA, VÍVIAN D'AFONSECA DA SILVA ; TAKANO, GUSTAVO HENRIQUE SOARES ; DUARTE, ELIZA CARLA BARROSO ; CARNEIRO, FABIANA PIRANI ; SILVA, FÁBIO PITTELLA . Abstract 2398: Molecular analysis of histone methyltransferases SUV420H1 and SUV420H2 and their potential as prognostic markers in head and neck cancer. Cancer Research , v. 77, p. 2398-2398, 2017.

• D'Afonseca, V ; Azevedo, Vasco ; Ali, ; Santos, Anderson ; Pinto, ; Magalhães, ; Faria, ; Barbosa, ; Guimarães, ; Eslabão, ; Almeida, ; Abreu, ; Neto, ; Carneiro, ; Cerdeira, Louise ; Ramos, Rommel ; Hirata-Jr, ; Mattos-Guaraldi, AL ; Trost, ; Tauch, ; Silva, ; Schneider, ; Miyoshi, . Reannotation of the Corynebacterium diphtheriae NCTC13129 genome as a new approach to studying gene targets connected to virulence and pathogenicity in diphtheria. Open Access Bioinformatics , v. 4, p. 1-13, 2012.

• Resende, B.C. ; Rebelato, A.B. ; D& ; Santos, A.R. ; Stutzman, T. ; AZEVEDO, V. ; MIYOSHI, A. ; Lopes, D.O. . DNA repair in Corynebacterium model. Gene (Amsterdam) , p. xxx, 2011.

• Barh, Debmalya ; Jain, Neha ; Tiwari, Sandeep ; D¿Afonseca, Vivian ; Li, Liwei ; Ali, Amjad ; Santos, Anderson Rodrigues ; Guimarães, Luís Carlos ; de Castro Soares, Siomar ; Miyoshi, Anderson ; Bhattacharjee, Atanu ; Misra, Amarendra Narayan ; Silva, Artur ; Kumar, Anil ; Azevedo, Vasco . A novel comparative genomics analysis for common drug and vaccine targets in Corynebacterium pseudotuberculosis and other CMN group of human pathogens. Chemical Biology & Drug Design (Print) , p. no-no, 2011.

• Ruiz, Jerônimo C. D& Silva, Artur Ali, Amjad Pinto, Anne C. Santos, Anderson R. Rocha, Aryanne A. M. C. Lopes, Débora O. Dorella, Fernanda A. Pacheco, Luis G. C. Costa, Marcília P. Turk, Meritxell Z. Seyffert, Núbia Moraes, Pablo M. R. O. Soares, Siomar C. Almeida, Sintia S. Castro, Thiago L. P. Abreu, Vinicius A. C. Trost, Eva Baumbach, Jan Tauch, Andreas Schneider, Maria Paula C. McCulloch, John Cerdeira, Louise T. Ramos, Rommel T. J. , et al. Zerlotini, Adhemar Dominitini, Anderson Resende, Daniela M. Coser, Elisângela M. Oliveira, Luciana M. Pedrosa, André L. Vieira, Carlos U. Guimarães, Cláudia T. Bartholomeu, Daniela C. Oliveira, Diana M. Santos, Fabrício R. Rabelo, Élida Mara Lobo, Francisco P. Franco, Glória R. Costa, Ana Flávia ; Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains. Plos One , v. 6, p. e18551, 2011.

• Moraes, Gleiciane ; Azevedo, Vasco ; Costa, Marcília ; Miyoshi, Anderson ; Silva, Artur ; Silva, Vivian ; Oliveira, Diana ; Teixeira, Maria Fátima ; Lameira, Jerônimo ; Alves, Cláudio Nahum . Homology modeling, molecular dynamics and QM/MM study of the regulatory protein PhoP from Corynebacterium pseudotuberculosis. Journal of Molecular Modeling , p. 1-8, 2011.

• Cerdeira, Louise Teixeira ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; de Almeida, Sintia Silva ; D´Afonseca, Vivian ; Schneider, Maria Paula Cruz ; Baumbach, Jan ; Tauch, Andreas ; McCulloch, John Anthony ; Azevedo, Vasco Ariston Carvalho ; Silva, Artur . Rapid hybrid de novo assembly of a microbial genome using only short reads: Corynebacterium pseudotuberculosis I19 as a case study. JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS , v. 86, p. 218-223, 2011.

• Stynen, A. P. R. Lage, A. P. Moore, R. J. REZENDE, A. M. de Resende, V. D. d. S. Ruy, P. d. C. DAHER, N. Resende, D. d. M. de Almeida, S. S. Soares, S. d. C. de Abreu, V. A. C. ROCHA, A. A. C. M. dos Santos, A. R. Barbosa, E. G. V. Costa, D. F. Dorella, F. A. MIYOSHI, A. de Lima, A. R. J. Campos, F. D. d. S. de Sa, P. G. Lopes, T. S. Rodrigues, R. M. A. Carneiro, A. R. LEAO, T. Cerdeira, L. T. , et al. Ramos, R. T. J. Silva, A. AZEVEDO, V. RUIZ, J. C. ; Complete Genome Sequence of Type Strain Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354T. Journal of Bacteriology (Print) , v. 193, p. 5871-5872, 2011.

• D'AFONSECA, V. ; Prosdocimi, Francisco ; Dorella, Fernanda A. ; Pacheco, Luis Gustavo C. ; Moraes, Pablo M. ; Pena, Izabela ; Ortega, Josè Miguel ; Teixeira, Santuza ; Oliveira, Sérgio Costa ; Coser, Elisângela Monteiro . Survey of genome organization and gene content of Corynebacterium pseudotuberculosis. MICROBIOLOGICAL RESEARCH , v. 165, p. 312-320, 2010.

• Silva, A. ; Schneider, M. P. C. ; Cerdeira, L. ; BARBOSA, M. S. ; Ramos, R. T. J. ; Carneiro, A. R. ; SANTOS, R. ; LIMA, M. ; D& ; Almeida, S. S. ; SANTOS, A. R. ; SOARES, S. C. ; PINTO, A. C. ; Ali, A. ; Dorella, F. A. ; ROCHA, F. ; de Abreu, V. A. C. ; Trost, E. ; Tauch, A. ; SHPIGEL, N. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis I19, a Strain Isolated from a Cow in Israel with Bovine Mastitis. JOURNAL OF BACTERIOLOGY , v. 193, p. 323-324, 2010.

• Trost, Eva ; Ott, Lisa ; Schneider, Jessica ; Schröder, Jasmin ; Jaenicke, Sebastian ; Goesmann, Alexander ; Husemann, Peter ; Stoye, Jens ; Dorella, Fernanda ; Rocha, Flavia ; de Castro Soares, Siomar ; D& ; Miyoshi, Anderson ; Ruiz, Jeronimo ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco ; Burkovski, Andreas ; Guiso, Nicole ; Join-Lambert, Olivier F ; Kayal, Samer ; Tauch, Andreas . The complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 isolated from a 12-year-old girl with necrotizing lymphadenitis reveals insights into gene-regulatory networks contributing to virulence. BMC GENOMICS , v. 11, p. 728, 2010.

• D¿Afonseca, V. ; Moraes, P.M. ; Dorella, F.A. ; PACHECO, L.G.C. ; MEYER, R. ; Portela, R.W. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . A description of genes of Corynebacterium pseudotuberculosis useful in diagnostics and vaccine applications. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , v. 7, p. 252-260, 2008.

• CAPANEMA, E.R. ; ALMEIDA, B. P. X. C. ; RUIZ, J. C. ; OLIVEIRA, G. C. ; MEYER, R. ; D'AFONSECA, V. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Brazilian Genome Sequencing Projects: State of the Art. Recent Patents in DNA and Gene Sequences , v. 2, p. 111-132, 2008.

• GÓNZALEZ, GLÓRIA ; Verdugo Diego ; Spinoza S ; D'AFONSECA, V. . Phytopathology Generalities in Genus Rubus: A Current Review. Rubus: an overview. 2ed.New York, USA: Nueva Science Publisher, 2020, v. 1, p. 1-152.

• CORTEZ, A. L. ; PAZ-Y-MINO, C. ; GUERRERO, S. ; GUEVARA-RAMIREZ, P. ; PEREZ-M3, G. ; REDAL, M. A. ; D´Afonseca, Vivian ; SALAZAR, M. ; QUINONES, L. A. . Capítulo 11 FARMACOGENÓMICA DEL CÁNCER: UN PASO MÁS HACIA LA MEDICINA DE PRECISIÓN EN AMÉRICA LATINA. Farmacogenómica y medicina personalizada en Latioamérica. 1ed.Chile: Editorial Académica Española, 2020, v. 1, p. 1-547.

• AZEVEDO, V. ; Silva, A ; Schneider, MP ; MIYOSHI, A. ; BOREM, A. ; D´Afonseca, Vivian ; ABREU, V. A. C. ; ALMEIDA, S.S. ; Cerdeira, L.T. ; Carneiro, A. R. ; Ramos, R.T.J. ; SANTOS, A. R. ; SOARES, S. C. . Submissão de um Genoma Procarioto ao NCBI: National Center for Biotechnology Information. In: Vasco Azevedo; Maria Paula Cruz Schneider; Artur Luis da Costa Silva; Anderson Miyoshi; Aluízio Borém. (Org.). Manual Prático-Teórico: Sequenciamento, montagem e anotação de genomas bacterianos. 1ed.Visconde do Rio Branco - MG: Editora Universidade Federal de Viçosa, 2011, v. 1, p. 1-160.

• D'Afonseca, V . Zoonosis: experta explica como es posible que un virus pase de un animal a una persona. Portal UCM, Chile, 07 set. 2021.

• D'Afonseca, Vívian . Zoonosis: experta explica como es posible que un virus pase de un animal a una persona. TV Maule, Chile, 07 set. 2021.

• D?AFONSECA, VIVIAN . Zoonosis: experta explica como es posible que un virus pase de un animal a una persona. TVN Chile, Chile, 07 set. 2021.

• GONZALEZ, G. ; Verdugo Diego ; Vasquez ; Fredes, Caludio ; D'AFONSECA, V. . UCM: Con muestreadores de aire podrán detectar virus respiratorios como el COVID-19. G9 Universidades Publicas no estatales, Chile, p. 1 - 1, 13 maio 2021.

• D'Afonseca, V . UCM: Con muestreadores de aire podrán detectar virus respiratorios como el COVID-19. G9 Universidades Publicas no estatales, Chile, 13 maio 2021.

• D'Afonseca, V . Simulacion computacional la clave para no frenar los experimentos en tiempos de pandemia. Portal UCM, Chile, 18 dez. 2020.

• D?AFONSECA, VIVIAN . Inclusión: La gran deuda en la legsitación chilena.. Diario El Heraldo, Chile, 17 jul. 2020.

• D?AFONSECA, VIVIAN . Inclusión: La gran deuda en la legsitación chilena.. Maule Noticias, Chile, 16 jul. 2020.

• D'AFONSECA, V. . Inclusión: La gran deuda en la legsitación chilena.. Portal UCM, Chile, p. 1 - 1, 15 jul. 2020.

• D'AFONSECA, V. . Equipo UCM está realizando exámenes para el diagnostico de covid-19. Revista Entérate, Chile, 10 jun. 2020.

• D?AFONSECA, VIVIAN . Estudiantes de canada realizaron pasantias internacionales en la UCM. Learn Chile, Chile, 19 maio 2020.

• D?AFONSECA, VIVIAN . UCM: Con muestreadores de aire podrán detectar virus respiratorios como el COVID-19. Litoral Press, Chile, 18 maio 2020.

• D'Afonseca, V . Docentes e investigadores UCM suman esfuerzoz para dar mayor cobertura al diagnostico de covid-19. Linares en Linea, Chile, 05 maio 2020.

• D'AFONSECA, V. . Docentes e investigadores UCM suman esfuerzoz para dar mayor cobertura al diagnostico de covid-19. El Diario Maule, Chile, 02 maio 2020.

• D?AFONSECA, VIVIAN . UCM: SUMAN ESFUERZOS PARA DAR MAYOR COBERTURA AL DIAGNÓSTICO DE COVID-19. Portal UCM, Chile, 30 abr. 2020.

• D'Afonseca, Vívian . UCM: SUMAN ESFUERZOS PARA DAR MAYOR COBERTURA AL DIAGNÓSTICO DE COVID-19. ATENTOS CHILE, Chile, 30 abr. 2020.

• D'Afonseca, V . A raíz de la Pandemia que estamos sufriendo, fiel a su espíritu de servicio, la UCM ha realizado acciones concretas que van en pos de ayudar a las personas. Revista Entérate, Chile, 30 abr. 2020.

• RUIZ, J. C. ; Silva, A ; D'AFONSECA, V. ; ALMEIDA, S.S. ; Cerdeira, L.T. ; PINTO, A. C. ; Resende, DM ; Ramos, R.T.J. ; Schneider, MP ; SOARES, S. C. ; SANTOS, A. R. ; Orellana, S.C. ; AZEVEDO, V. . Segunda Revolução Genômica: Uso de sequenciadores de nova geração. Microbiologia in Foco, XXV C. Bras. de Microbiologia, p. 09 - 15, 06 nov. 2009.

• PINTO, A. C. ; D' Afonseca, V. ; SANTOS, A. R. ; ALMEIDA, S.S. ; SOARES, S. C. ; J. F., Cássio ; M., Aryane ; RUIZ, J. C. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Estudo da arquitetura genômica de duas linhagens do patógeno Corynebacterium pseudotuberculosis e seu estilo de vida. In: 56a Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Gyarujá - SP. Estudo da arquitetura genômica de duas linhagens do patógeno Corynebacterium pseudotuberculosis e seu estilo de vida, 2010.

• SOARES, S. C. ; ABREU, V. A. C. ; MCCULLOCH, J. ; D' Afonseca, V. ; Ramos, R. T. J. ; Ali, A. ; SANTOS, A. R. ; PINTO, A. C. ; ALMEIDA, S.S. ; Silva, A ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . PIPS: Pathogenicity Island Prediction Software. In: International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 2010, Ouro Preto. do 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 2010, 2010.

• ROCHA, A. A. C. M. ; ALMEIDA, S.S. ; SEYFFERT, N. ; PRUDENCIO, C. R. ; SANTOS, F. A. A. ; SOARES, S. C. ; D' Afonseca, V. ; RIBEIRO, D. ; FARIA, C. L. ; MIYOSHI, A. ; Goulart, L ; AZEVEDO, V. . Utilização de peptídeos sintéticos de C. pseudotuberculosis identificados por Phage Display como potenciais alvos vacinais na erradicação da Linfadenite Caseosa. In: 56 Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá - SP. Anais do 56 Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

• Cerdeira, L.T. ; Carneiro, A. R. ; Ramos, R.T.J. ; D' Afonseca, V. ; RUIZ, J. C. ; AZEVEDO, V. ; Schneider, M. P. C. ; Silva, A. . De novo assembly of Corynebacterium pseudotuberculosis genomes using short reads obtained from mate-paired libraries. In: Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB 2010), 2010, Boston. Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB 2010), 2010, Boston. Anais do Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB 2010), 2010, Boston. Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB 2010), 2010.

• ALMEIDA, S.S. ; SEYFFERT, N. ; SOARES, S. C. ; D' Afonseca, V. ; PINTO, A. C. ; SANTOS, A. R. ; RIBEIRO, D. ; M., Aryane ; Goulart, L ; Moore, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Identificação de desordem protéica no proteoma de Corynebacterium pseudotuberculosis usando dados de phage display. In: 56a Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá - SP. Identificação de desordem protéica no proteoma de Corynebacterium pseudotuberculosis usando dados de phage display, 2010.

• SOARES, S. C. ; D'AFONSECA, V. ; PINTO, A. C. ; ALMEIDA, S.S. ; Orellana, S.C. ; Silva, A ; OLIVEIRA, G. C. ; AZEVEDO, V. ; MIYOSHI, A. . Identificação, Caracterização e Comparação in silico das Ilhas de Patogenicidade (PAIs) de Corynebacterium pseudotuberculosis. In: 25º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009, Porto de Galinhas. Identificação, Caracterização e Comparação in silico das Ilhas de Patogenicidade (PAIs) de Corynebacterium pseudotuberculosis, 2009.

• SOARES, S. C. ; D'AFONSECA, V. ; ALMEIDA, S.S. ; PINTO, A. C. ; SANTOS, A. R. ; Ramos, R.T.J. ; Resende, DM ; Silva, A ; AZEVEDO, V. ; MIYOSHI, A. ; RUIZ, J. C. . Pathogenicity islands in bacteria: A next generation sequence approach overview of Corynebacterium genomes. In: Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática, 2009, Ouro Preto. Pathogenicity islands in bacteria: A next generation sequence approach overview of Corynebacterium genomes, 2009.

• D'AFONSECA, V. ; ALMEIDA, S.S. ; SOARES, S. C. ; PINTO, A. C. ; Ramos, R.T.J. ; Moore, R. ; Silva, A ; MIYOSHI, A. ; RUIZ, J. C. ; AZEVEDO, V. . Genômica comparativa entre diferentes linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis. In: 25º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009, Porto de Galinhas. Genômica comparativa entre diferentes linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis, 2009.

• D'AFONSECA, V. ; ALMEIDA, S.S. ; SOARES, S. C. ; PINTO, A. C. ; SANTOS, A. R. ; Resende, DM ; Ramos, R.T.J. ; Cerdeira, L.T. ; Silva, A ; MIYOSHI, A. ; RUIZ, J. C. ; AZEVEDO, V. . Comparative genomics between Corynebacterium pseudotuberculosis strains. In: Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática, 2009, Ouro Preto. Comparative genomics between Corynebacterium pseudotuberculosis strains, 2009.

• Ramos, R.T.J. ; Cerdeira, L.T. ; D'AFONSECA, V. ; ALMEIDA, S.S. ; Resende, DM ; PINTO, A. C. ; SOARES, S. C. ; SANTOS, A. R. ; Silva, R.R. ; Orellana, S.C. ; Schneider, MP ; Lameira, J. ; OLIVEIRA, G. C. ; Silva, A ; AZEVEDO, V. ; RUIZ, J. C. . A pipeline for bacterial genome sequencing assembly using short reads: Corynebacterium pseudotuberculosis as a model. In: Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática, 2009, Ouro Preto. A pipeline for bacterial genome sequencing assembly using short reads: Corynebacterium pseudotuberculosis as a model, 2009.

• Ramos, R.T.J. ; D'AFONSECA, V. ; Cerdeira, L.T. ; ALMEIDA, S.S. ; Resende, DM ; SOARES, S. C. ; Silva, R.R. ; OLIVEIRA, G. C. ; Schneider, MP ; AZEVEDO, V. ; Silva, A ; RUIZ, J. C. . SHORT READS AND BACTERIAL GENOME ASSEMBLY: A CORYNEBACTERIUM EXPERIENCE.. In: 5 International Conference of the Brasilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. SHORT READS AND BACTERIAL GENOME ASSEMBLY: A CORYNEBACTERIUM EXPERIENCE., 2009.

• Ramos, R.T.J. ; D'AFONSECA, V. ; ALMEIDA, S.S. ; Cerdeira, L.T. ; Resende, DM ; Orellana, S.C. ; Lameira, J. ; AZEVEDO, V. ; Silva, A ; RUIZ, J. C. . Sequenciamento dos genomas de linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis utilizando a plataforma SOLiD. In: 25º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009, Porto de Galinhas. Sequenciamento dos genomas de linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis utilizando a plataforma SOLiD, 2009.

• PINTO, A. C. ; Resende, DM ; SOARES, S. C. ; D'AFONSECA, V. ; ALMEIDA, S.S. ; Moore, R. ; Silva, A ; MIYOSHI, A. ; RUIZ, J. C. ; AZEVEDO, V. . ANALISE COMPARATIVA DOS PSEUDOGENES ENTRE DUAS LINHAGENS DE Corynebacterium pseudotuberculosis (C231 e 1002) E OUTRA ESPÉCIE Corynebacterium diphtheriae (NCTC 13129). In: 25º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009, Porto de Galinhas. ANALISE COMPARATIVA DOS PSEUDOGENES ENTRE DUAS LINHAGENS DE Corynebacterium pseudotuberculosis (C231 e 1002) E OUTRA ESPÉCIE Corynebacterium diphtheriae (NCTC 13129), 2009.

• D'AFONSECA, V. ; MORAIS, P. M. R. O. ; DORELLA, F. ; PACHECO, L.G.C. ; ALMEIDA, S.S. ; PINTO, A. C. ; SANTOS, A. R. ; CERQUEIRA, P.G. ; SEYFFERT, N. ; CASTRO, T. L. P. ; SOARES, S. C. ; PROSDOCIMI, F. ; PENA, I. ; ORTEGA, J. M. ; OLIVEIRA, S. C. ; OLIVEIRA, G. C. ; COSER, E. M. ; OLIVEIRA, L.M. ; MEYER, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Construção de uma biblioteca genômica de Corynebacterium pseudotuberculosis e sua caracterização através de Genome Sequence Survey (GSS). In: 26° Reunião de Genética de Microbiologia, 2008, Salvador - BA. Construção de uma biblioteca genômica de Corynebacterium pseudotuberculosis e sua caracterização através de Genome Sequence Survey (GSS), 2008.

• D'AFONSECA, V. ; MORAIS, P. M. R. O. ; DORELLA, F. ; PACHECO, L.G.C. ; ALMEIDA, S.S. ; PINTO, A. C. ; SANTOS, A. R. ; CERQUEIRA, P.G. ; SEYFFERT, N. ; CASTRO, T. L. P. ; SOARES, S. C. ; PROSDOCIMI, F. ; PENA, I. ; ORTEGA, J. M. ; OLIVEIRA, S. C. ; COSER, E. M. ; OLIVEIRA, G. C. ; MEYER, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Caracterização do conteúdo gênico e organização genômica de Corynebacterium pseudotuberculosis. In: 54° Congresso Brasileiro de Genética, 2008, Salvador - BA. racterização do conteúdo gênico e organização genômica de Corynebacterium pseudotuberculosis, 2008.

• DORELLA, F. ; CERQUEIRA, P.G. ; PACHECO, L.G.C. ; SEYFFERT, N. ; PINTO, A. C. ; D'AFONSECA, V. ; CASTRO, T. L. P. ; SOARES, S. C. ; OLIVEIRA, S. C. ; MEYER, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Analysis of the vaccine potencial of Corynebacterium pseudotuberculosis mutants obtained through random mutagenesis. In: 26° Reunião de Genética de Microbiologia, 2008, Salvador - BA. Analysis of the vaccine potencial of Corynebacterium pseudotuberculosis mutants obtained through random mutagenesis, 2008.

• PACHECO, L.G.C. ; CASTRO, T. L. P. ; SEYFFERT, N. ; DORELLA, F. ; PINTO, A. C. ; D'AFONSECA, V. ; SOARES, S. C. ; MORAIS, P. M. R. O. ; CERQUEIRA, P.G. ; S.M., Wanderson ; RIBEIRO, D. ; MEYER, R. ; OLIVEIRA, S. C. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Papel do fator sigma de Corynebacterium pseudtuberculosis na resistência ao estresse e na regulação de fatores associados à virulência.. In: 26° Reunião de Genética de Microbiologia, 2008, Salvador - BA. Papel do fator sigma de Corynebacterium pseudtuberculosis na resistência ao estresse e na regulação de fatores associados à virulência, 2008.

• S.M., Wanderson ; SEYFFERT, N. ; PACHECO, L.G.C. ; CASTRO, T. L. P. ; PINTO, A. C. ; D'AFONSECA, V. ; PORTELA, R. W. ; SOARES, S. C. ; MEYER, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Uso de phage display na seleção de peptídeos para o diagnóstico da linfadenite caseosa em pequenos ruminantes. In: 26° Reunião de Genética de Microbiologia, 2008, Salvador - BA. Uso de phage display na seleção de peptídeos para o diagnóstico da linfadenite caseosa em pequenos ruminantes, 2008.

• CERQUEIRA, P.G. ; PINTO, A. C. ; DORELLA, F. ; PACHECO, L.G.C. ; SOARES, S. C. ; CASTRO, T. L. P. ; D'AFONSECA, V. ; SEYFFERT, N. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Construção de uma biblioteca genômica de Corynebacterium pseudotuberculosis para a identificação de promotores através da expressão de GFP. In: 26º Reunião de Genética de Microbiologia, 2008, Salavdor. Construção de uma biblioteca genômica de Corynebacterium pseudotuberculosis para a identificação de promotores através da expressão de GFP, 2008.

• SEYFFERT, N. ; PACHECO, L.G.C. ; CASTRO, T. L. P. ; DORELLA, F. ; CERQUEIRA, P.G. ; PINTO, A. C. ; SOARES, S. C. ; D'AFONSECA, V. ; OLIVEIRA, S. C. ; MEYER, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Análise de imunoproteômica do secretoma de Corynebacterium pseudotuberculosis para fins diagnósticos. In: 26° Reunião de Genética de Microbiologia, 2008, Salvador - BA. Análise de imunoproteômica do secretoma de Corynebacterium pseudotuberculosis para fins diagnósticos, 2008.

• PACHECO, L.G.C. ; CASTRO, T. L. P. ; SEYFFERT, N. ; DORELLA, F. ; PINTO, A. C. ; D'AFONSECA, V. ; SOARES, S. C. ; MORAIS, P. M. R. O. ; CERQUEIRA, P.G. ; S.M., Wanderson ; RIBEIRO, D. ; MEYER, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Papel do fator sigma de Corynebacterium pseudotuberculosis na resistência ao estresse e na regulaçã de fatores associados à virulência. In: 54° Congresso Brasileiro de Genética, 2008, Salavdor - BA. Papel do fator sigma de Corynebacterium pseudotuberculosis na resistência ao estresse e na regulaçã de fatores associados à virulência, 2008.

• SEYFFERT, N. ; PACHECO, L.G.C. ; CASTRO, T. L. P. ; DORELLA, F. ; CERQUEIRA, P.G. ; PINTO, A. C. ; SOARES, S. C. ; MORAIS, P. M. R. O. ; D'AFONSECA, V. ; OLIVEIRA, S. C. ; MEYER, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Integração da genômica e proteômica de Corynebacterium pseudotuberculosis para o imunodiagnóstico da linfadenite caseosa. In: 54º Congresso Brasieliro de Genética, 2008, Salvador - BA. Integração da genômica e proteômica de Corynebacterium pseudotuberculosis para o imunodiagnóstico da linfadenite caseosa, 2008.

• CERQUEIRA, P.G. ; PINTO, A. C. ; DORELLA, F. ; PACHECO, L.G.C. ; SOARES, S. C. ; CASTRO, T. L. P. ; D'AFONSECA, V. ; SEYFFERT, N. ; MEYER, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Construção de uma biblioteca genômica de Corynebacterium pseudotuberculosis para a identificação de promotores através da expressão de GFP. In: 54° Congresso Brasileiro de Genética, 2008, Salvador - BA. Construção de uma biblioteca genômica de Corynebacterium pseudotuberculosis para a identificação de promotores através da expressão de GFP, 2008.

• SOARES, S. C. ; PINTO, A. C. ; DORELLA, F. ; CERQUEIRA, P.G. ; PACHECO, L.G.C. ; CASTRO, T. L. P. ; D'AFONSECA, V. ; SEYFFERT, N. ; MEYER, R. ; AZEVEDO, V. ; MIYOSHI, A. . Plasticidade genômica de Corynebacterium diphtheriae: implicações na virulência. In: 54º Cngresso Brasileiro de Genética, 2008, Salvador - BA. Plasticidade genômica de Corynebacterium diphtheriae: implicações na virulência, 2008.

• DORELLA, F. ; CERQUEIRA, P.G. ; PACHECO, L.G.C. ; SEYFFERT, N. ; PINTO, A. C. ; D'AFONSECA, V. ; CASTRO, T. L. P. ; SOARES, S. C. ; OLIVEIRA, S. C. ; MEYER, R. ; Moraes, Pablo ; AZEVEDO, V. . Analysis of the vaccine potential of Corynebacterium pseudotuberculosis mutants obtained through random mutagenesis. In: 54º Congresso Brasileiro de Genética, 2008, Salvador - BA. Analysis of the vaccine potential of Corynebacterium pseudotuberculosis mutants obtained through random, 2008.

• S.M., Wanderson ; SEYFFERT, N. ; PACHECO, L.G.C. ; CASTRO, T. L. P. ; DORELLA, F. ; CERQUEIRA, P.G. ; PINTO, A. C. ; D'AFONSECA, V. ; PORTELA, R. W. ; SOARES, S. C. ; MEYER, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Identificação de epítopos da superfície de fagos para o imunodiagnóstico da linfadente caseosa em caprinos. In: 54º Congresso Brasileiro de Genética, 2008, Salvador - BA. Identificação de epítopos da superfície de fagos para o imunodiagnóstico da linfadente caseosa em caprinos, 2008.

• SOARES, S. C. ; PINTO, A. C. ; DORELLA, F. ; CERQUEIRA, P.G. ; PACHECO, L.G.C. ; SEYFFERT, N. ; D'AFONSECA, V. ; CASTRO, T. L. P. ; AZEVEDO, V. ; MIYOSHI, A. . Análise das ilhas de patogenicidade de Corynebacterium diphtheriae por PCR2 (Plasticity of hromossome revealed by long range - Polymerase Chain Reaction). In: 26º Reunião de Genética de Microbiologia, 2008, Salvador - BA. Análise das ilhas de patogenicidade de Corynebacterium diphtheriae por PCR2 (Plasticity of hromossome revealed by long range - Polymerase Chain Reaction), 2008.

• D'AFONSECA, V. ; Moraes, Pablo ; PACHECO, L.G.C. ; DORELLA, F. ; CAPANEMA, E.R. ; PENA, I. ; PROSDOCIMI, F. ; ORTEGA, J. M. ; MEYER, R. ; OLIVEIRA, G. C. ; OLIVEIRA, S. C. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. . Partail-genome sequence through GSS analyses and comparative genomic og Corynebacterium pseudotuberculosis the ethiological agent of Caseous Limphadenitis Disease. In: 24 º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2007, Brasília. Partail-genome sequence through GSS analyses and comparative genomic og Corynebacterium pseudotuberculosis the ethiological agent of Caseous Limphadenitis Disease, 2007.

• SOARES, S. C. ; D'AFONSECA, V. ; DORELLA, F. ; CAPANEMA, E.R. ; AZEVEDO, V. ; MIYOSHI, A. . Análise de Plasticidade Genômica de linhagens de Corynebacterium diphtheriae através de PCR ( Plasticity of Cromossome Relealed by Long Range - Polymerase Chain Reaction). In: 24º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2007, Brasília. Análise de Plasticidade Genômica de linhagens de Corynebacterium diphtheriae através de PCR ( Plasticity of Cromossome Relealed by Long Range - Polymerase Chain Reaction), 2007.

• D'AFONSECA, V. ; LISBOA, E. D. ; REIS, M. ; RESENDE, V. P. ; SA, M. ; TINOCO, M. L. ; ROMANO, E. . Silencing of SERK gene using the technique of RNA interferance in tabacco. In: 34ª Reunião Anual de Bioquímica e Biologia Molecular, 2005, Águas de Lindóia - SP. Silencing of SERK gene using the technique of RNA interferance in tabacco, 2005.

• LISBOA, E. D. ; SA, M. ; D'AFONSECA, V. ; RESENDE, V. P. ; TINOCO, M. L. ; REIS, M. . Expression of antiquitin gene confers a salt tolerance in Arabidopsis thaliana. In: 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004, Florianópolis - SC. Expression of antiquitin gene confers a salt tolerance in Arabidopsis thaliana, 2004.

• D?AFONSECA, VIVIAN ; VASQUEZ, T. I. A. ; SALAZAR-VIEDMA, MARCELA . GENETIC ALTERATIONS OF GENES ENCODING HISTONE METHYLTRANSFERASES AND THEIR ROLE IN LIVER CANCER: A COMPUTATIONAL APPROACH. 2021. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• D'AFONSECA, V. . Minería de datos biológicos con aplicación en el área microbiológica.. 2020. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• D' Afonseca, V. ; AZEVEDO, V. ; ALMEIDA, B. P. X. C. ; CARNEIRO, A. ; Cerdeira, L.T. ; PINTO, A. C. ; Ramos, R.T.J. ; SANTOS, A. R. ; SOARES, S. C. ; Schneider, MP . Anotação Funcional de um genoma bacteriano. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• D' Afonseca, V. ; ALMEIDA, S.S. ; AZEVEDO, V. ; CARNEIRO, A. ; Cerdeira, L.T. ; MIYOSHI, A. ; PINTO, A. C. ; Ramos, R.T.J. ; SANTOS, A. R. ; SOARES, S. C. ; Schneider, MP . Aula Prática: Submissão de genomas a banco de dados. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• D' Afonseca, V. ; A., Amjad ; ALMEIDA, S.S. ; AZEVEDO, V. ; CARNEIRO, A. ; Cerdeira, L.T. ; MIYOSHI, A. ; PINTO, A. C. ; Ramos, R.T.J. ; SANTOS, A. R. ; Schneider, MP ; Silva, A . Aula Prática: Anotação funcional de Genomas bacterianos. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• D'AFONSECA, V. ; Schneider, MP ; RUIZ, J. C. ; Silva, A ; AZEVEDO, V. . Parceria UFMG-UFPA: Estudos Pangenômicos de diferentes linhagens do patógeno Corynebacterium pseudotuberculosis utilizando a plataforma SOLiD. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• D'AFONSECA, V. ; ALMEIDA, S.S. ; SOARES, S. C. ; PINTO, A. C. ; Ramos, R.T.J. ; Moore, R. ; MIYOSHI, A. ; RUIZ, J. C. ; Silva, A ; AZEVEDO, V. . Genômica comparativa entre diferentes linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• D'AFONSECA, V. . Anotação Funcional de Genomas bacterianos. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2020 - 2020

  Diagnostico de Covid-19 mediante RT-qPCR, Descrição: Trabajo de investigación, colaboración Hospital Regional de Talca - Universidad Católica del Maule para diagnostico de la enfermedad covid-19 mediante RT-qPCR en la población del Maule.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Coordenador / ARENCIBIA, ARIEL D. - Integrante / Maria Tereza Quezada Muñoz - Integrante / Ramon de Castro Perez - Integrante / Ingrid Carcacho - Integrante / Maria Jaqueline Romero - Integrante / Fernando Delgado - Integrante / Nataly Munoz - Integrante.

• 2020 - Atual

  FIC-R Maule Monitoreo Covid19, Descrição: Monitoreamento de Covid-19 no ar. Aprovado em 2020. Sou pesquisadora associada com o papel de padronizar a extração de RNA de coronavírus provenientes de filtros de ar. Padronizar a detecção de coronavírus extraídos de filtros de ar usando qPCR.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / Gloria Gonzalez - Coordenador / diego verdugo - Integrante.

• 2020 - Atual

  Producao de proteinas de fungos con potencial para a degradacao de plásticos., Descrição: Projeto de Iniciação FONDECYT: Produção de enzimas degradadoras de plásticos a partir de fungos. O objetivo é investigar a capacidade de degradação de certas enzimas na degradação de polímeros, como o poliestireno. Sou um colaborador e meu papel é detectar a expressão dessas enzimas usando qPCR.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Coordenador / Rodrigo Andler - Integrante.

• 2018 - 2020

  Mejoramiento Genético de Arándano por medio de generación de poliploidia., Descrição: Mejoramiento Genético de Arándano por medio de generación de poliploidia y investigación de como la poliploidia influye en fenotipos importantes en la producción de arándano. El análisis se hará por medio de qPCR y investigación de los genes más diferencialmente expresos y involucrados en características que incrementen la producción del fruto.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / Ariel Arencíbia - Coordenador.

• 2018 - 2020

  Diagnóstico molecular de linhagens de Mycobacterium tuberculosis y Papiloma virus homano por meio da técnica de PCR., Descrição: Diagnóstico molecular de linhagens de Mycobacterium tuberculosis y Papiloma virus homano por meio da técnica de PCR em amostras clínicas de pacientes do Hospital Regional de Talca, Chile.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (7) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / Gloria Gonzalez - Integrante / Ariel Arencíbia - Coordenador.

• 2018 - Atual

  Prospeccao in silico de proteinas histonas metiltransferases en diversos tipos de canceres., Descrição: Prospeccao in silico de proteinas histonas metiltransferases en diversos tipos de canceres. Projeto independente, sem financiamento. Avaliar o papel de certas histonas metiltransferases em cancer gastrico, cancer colorrectal, cancer de figado, entre outros.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Coordenador.

• 2015 - 2016

  Análise genômica e funcional de metiltransferases proteicas em carcinomas de mama e determinação de seu potencial como marcadores diagnósticos e prognósticos., Descrição: A presente proposta atende as exigências do Programa Nacional de Pós-Doutorado da CAPES - PNPD/2011. O objetivo principal é investigar o papel das metiltransferases proteicas na carcinogênese da mama e estabelecer o perfil de expressão de todos os prováveis genes codificadores dessas enzimas utilizando-se linhagens obtidas de pacientes brasileiros.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / Fábio Pitella Silva - Coordenador / Marie Togashi - Integrante / Andréa Barretto Motoyama - Integrante / Rosângela Vieira de Andrade - Integrante / João Nunes de Matos Neto - Integrante / Doralina do Amaral Rabello Ramos - Integrante.

• 2013 - 2015

  Produção de Interferon-beta recombinante por sistemas de expressão baseados em vetores virais em plantas, Descrição: Expressão do biofármaco interferon beta em plantas não geneticamente modificadas através de sistemas de expressão baseados em vetores virais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (4) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / Eduardo Romano de Campos Pinto - Integrante / Fátima Grossi de Sá - Integrante / Gustavo Ramos de Oliveira - Coordenador / Juan Gabriel Arrieta Sosa - Integrante.

• 2010 - 2011

  Caracterização do sistema de reparo uvrABCD no gênero Corynebacterium, Descrição: Caracterização do sistema de reparo uvrABCD no gênero Corynebacterium. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / Anderson Miyoshi - Integrante / Vasco Azevedo - Integrante / Débora de Oliveira Lopes - Coordenador / Bruno Carvalho Rezende - Integrante.

• 2010 - 2010

  Anotação funcional do genoma do patógeno Campylobacter fetus subsp. venerialis, Descrição: Anotação funcional do genoma do patógeno Campylobacter fetus subsp. venerialis.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / Vasco Azevedo - Integrante / Siomar de Castro Soares - Integrante / jerônimo Conceição Ruiz - Integrante / Anne Cybele Pinto - Integrante / Síntia Silva de Almeida - Integrante / Anderson Rodrigues Santos - Integrante / Artur Silva - Integrante / Rommel Thiago Jucá Ramos - Integrante / Robert Moore - Integrante / Ana Paula Stynen - Integrante / Andrey Pereira Lage - Coordenador / Aryane Magalhães - Integrante / Amjad Ali - Integrante.

• 2009 - 2009

  Identificação, Caracterização e análises filogenéticas in silico do operon phoPR entre as actinobactérias., Descrição: Projeto de pesquisa: Identificação, Caracterização e análises filogenéticas in silico do operon phoPR entre as actinobactérias. Projeto desenvolvido no laboratório de Genética Celular e Molecular da Universidade Federal de Minas Gerais. O projeto visa a identificação e caracterização in silico do operon phoPR presente em Corynebacterium pseudotuberculosis e demais espécies do grupo CMN; inferência filogenética e análises da presença ou ausência do mesmo entre membros do grupo das actinobactérias.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / Anderson Miyoshi - Integrante / Vasco Azevedo - Integrante / Anne Cybele Pinto - Integrante / Marcília Costa - Coordenador.

• 2009 - 2009

  Análise da performance de algoritmos vinculados ao tratamento de pequenas leituras genômicas oriundas de tecnologias de sequenciamento de nova geração - next generation., Descrição: Projeto de pesquisa: Análise da performance de algoritmos vinculados ao tratamento de pequenas leituras genômicas oriundas de tecnologias de sequenciamento de nova geração - next generation. O projeto visa a implementação de um pipeline adequado que realize análises e montagem de genomas bacterianos sequenciados com tecnologias de próxima geração (principalmente o SOLiD) e a realização da montagem e anotação de genomas de forma 'ab initio'. Projeto realizado em parceria com o Laboratório de Polimorfismo de DNA da UNiversidade Federal do Pará. Coordenadores do projeto: Prof. Dr. Jerônimo Conceição Ruiz, Prof. Dr.Artur Silva e Prof. Dr.Vasco Azevedo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / Vasco Azevedo - Integrante / jerônimo Conceição Ruiz - Coordenador / Artur Silva - Integrante / Paula Schneider - Integrante / Louise Teixeira Cerdeira - Integrante / Rommel Thiago Jucá Ramos - Integrante / Sara Cuadros Orellana - Integrante.

• 2008 - 2011

  Estudos pangenômicos e de genômica comparativa entre diferentes linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis para a erradicação da linfadenite caseosa, Descrição: Projeto de Pesquisa: Desenvolvimento da tese intitulada: 'Estudos pangenômicos e de genômica comparativa entre diferentes linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis para a erradicação da linfadenite caseosa'. O projeto de doutorado conta com a parceria entre duas instituições: Universidade Federal de Minas Gerais, Universidade Federal do Pará e Instituto de Pesquisa Renée Rachou - FIOCRUZ. Os dados gerados para o projeto são oriundos de sequenciadores next-generation SOLiD e as análises de genômica comparativa e pangenômica das diferentes linhagens do patógeno citado acima, serão realizadas em duas etapas: 1) validação dos dados gerados pelas novas tecnologias de sequenciamento SOLiD em uma abordagem de montagem de genomas 'ab initio'; implementação de um pipeline adequado que realize a análise ab initio de montagem e; 2) Genômica comparativa e pangenômica;. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (6) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Coordenador / Anderson Miyoshi - Integrante / Vasco Azevedo - Integrante / Siomar de Castro Soares - Integrante / Pablo Matias Ribeiro de Oliveira Morais - Integrante / Anne Cybele Pinto - Integrante / Síntia Silva de Almeida - Integrante / Anderson Rodrigues Santos - Integrante / Artur Silva - Integrante / Louise Teixeira Cerdeira - Integrante / Rommel Thiago Jucá Ramos - Integrante / Robert Moore - Integrante.

• 2008 - 2009

  Sequenciamento do genoma da bactéria Desulfovibrio gigas utilizando Solexa, Descrição: Projeto de pesquisa: Sequenciamento do genoma da bactéria Desulfovibrio gigas. O projeto é uma colaboração com o grupo de pesquisa da Profa. Dra. Claudina Pousada do Instituto de Tecnologia Química e Biológica, da Universidade Nova de Lisboa - Portugal. Como objetivos da parceria, o desenvolvimento de um pipeline adequado no tratamento e utilização de programas que realizam análises de dados genômicos bacterianos oriundos de tecnologias de sequenciamento 'next-generation' e utilização de pequenas leituras para montagem e anotação do genoma de D. gigas. O coordenador no Brasil do projeto é o Prof. Dr. Jeronimo Ruiz.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / jerônimo Conceição Ruiz - Integrante / Fábio Silva - Integrante / Claudina Pousada - Coordenador.

• 2003 - 2006

  Silenciamento do gene SERK (Somatic Embryogenesis Recepetor Kinase) utilizando RNAi e análises de efeitos de silenciamento gênico em Tobacco xanthi, Descrição: Projeto de pesquisa: Silenciamento do gene SERK (Somatic Embryogenesis Recepetor Kinase) utilizando RNAi e análises de efeitos de silenciamento gênico em Tobacco xanthi. O projeto visa o silenciamento do gene responsável pela enbriogênese na planta citada, utilizando a técnica de RNAi para minimizar os impactos da transgenia na natureza.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vívian D'Afonseca da Silva Ferreira - Integrante / Eduardo Romano - Coordenador / Elifas Davi Lisboa - Integrante / Maíra Sá - Integrante / Vinícius Procópio de Resende - Integrante / Maria Laine Tinoco - Integrante / Marcelo Reis - Integrante.