Nereu Serafim Machado

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Projetos de pesquisa

• 2021 - 2023

  PERFIL DA MICROBIOTA INTESTINAL HUMANA DE PACIENTES COM COVID-19, Descrição: A doença de coronavírus 2019 ou Covid-19 é uma nova crise de saúde pública que ameaça a humanidade. A microbiota intestinal humana consiste em 1014 microrganismos residentes que incluem bactérias, archae, vírus e fungos. Principalmente, as bactérias intestinais em indivíduos saudáveis são dominadas por quatro filos Actinobacteria, Firmicutes, Proteobacteria e Bacteroidetes. A microbiota intestinal desempenha um papel fundamental na saúde por meio de suas ações protetoras, tróficas e metabólicas, incluindo várias funções fisiológicas do hospedeiro, digestão da dieta e imunidade contra patógenos. Esta pesquisa avaliou os efeitos da COVID-19 nas microbiotas intestinais de 6 pacientes; Paciente com sintomas leves (P1); paciente com sintomas graves (P2) Paciente sem COVID-19 (P3). As análises de Metabarcoding foram realizadas através da extração de DNA com o kit DNeasy PowerSoil (QIAGEN), seguida da amplificação do gene 16S RNAr e sequenciamento em Plataforma Illumina MiSeq. Para a análise funcional foi realizada utilizado as abundâncias da via MetaCyc que são as principais previsões de alto nível produzidas pelo PICRUSt2. A análise das principais vias metabólicas demostrou uma produção mais atenuada da L-isoleucina (PWY-5103) pelo paciente com sintomas graves da COVID19 (PAC3 36515,60 L) em relação aos demais pacientes analisados (PAC1 32393,99 e PAC3 32343,29). Já as vias Glutaryl-CoA degradation (PWY-3001) e D-galacturonate degradation I (GALACTUROCAT-PWY), responsáveis pela síntese do butirato, demonstraram valores baixos nas amostras do paciente com COVID19 grave (PAC2 22,05 L e 7385,05 L, respectivamente). Outros fatores predominantemente diminuídos nas amostras do paciente grave foram as vias relacionadas a PWY-1269 CMP-3-deoxy-D-manno-octulosonate biosynthesis I (PAC2 343,94 L) e PWY-7220 adenosine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis II (PAC2 21844,85 L), vias cuja subclasse corresponde a Sugar nucleotide biosynthesis. Além disso, a via PWY-4984 urea cycle (PAC2 23,73 L) cuja subclasse corresponde a Nitrogen compound metabolismo. Evidências da diminuição das vias de produção de ácidos graxos de cadeia curta associada a COVID19 em pacientes graves, além da diminuição dos níveis de butirato fecal e aumento dos níveis de citocinas pró-inflamatórias IL10 e quimiocina CXCL-10, destacam a importância dessas vias metabólicas na patogênese da COVID-19.O estudo das perturbações nas funções microbianas intestinais abre caminho para entender o papel do microbioma intestinal na progressão da doença no COVID-19.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Nereu Serafim Machado - Integrante / Michel Rodrigo Zambrano Passarini - Coordenador / Julia Ronzella Ottoni - Integrante.