José Raniery Ferreira Junior
Engenheiro de software (implantação de inteligência artificial para imagens médicas) do Hospital Israelita Albert Einstein, fundador da healthtech brasileira Turier Tech e pesquisador colaborador do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (HCFMRP-USP). Possui doutorado em Bioengenharia (2019) pela Universidade de São Paulo (USP) com período sanduíche (2018) na Universidade de Harvard pelo Programa de Doutorado Sanduíche no Exterior (PDSE/CAPES), mestrado em Informática (2015) pela Universidade Federal de Alagoas (UFAL) e graduação em Ciência da Computação (2012) pela UFAL Arapiraca. Sua tese de doutorado foi premiada como a Tese Destaque USP (2020) na Área das Engenharias e recebeu Menção Honrosa no Concurso de Teses e Dissertações (2020) organizado pela Comissão Especial em Computação Aplicada à Saúde (CE-CAS) da Sociedade Brasileira de Computação (SBC). Tem interesse em Bioengenharia Computacional, especialmente no desenvolvimento de métodos computadorizados para inteligência artificial na saúde. Atua colaborativamente como revisor ad-hoc de +10 periódicos internacionais indexados, como IEEE Transactions on Medical Imaging, Scientific Reports, Plos One e Biomarker Research.
Informações coletadas do Lattes em 26/11/2024
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Bioengenharia
2015 - 2019
Universidade de São Paulo
Título: Arcabouço para Classificação, Recuperação por Conteúdo e Radiômica de Imagens Médicas: uma investigação de biomarcadores quantitativos para o câncer de pulmão
Orientador: em Harvard University ( Hiroyuki Yoshida)
com , Ano de obtenção: 2019. Paulo Mazzoncini de Azevedo Marques. Coorientador: Marcel Koenigkam Santos. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Mestrado em Informática
2013 - 2015
Universidade Federal de Alagoas
Título: Auxílio Computadorizado ao Diagnóstico do Câncer de Pulmão Otimizado por GPU
, Ano de Obtenção: 2015.Marcelo Costa Oliveira.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas, FAPEAL, Brasil.
Graduação em Ciência da Computação
2006 - 2012
Universidade Federal de Alagoas Campus Arapiraca
Título: CADEP: Ferramenta para Auxílio Computadorizado ao Diagnóstico do Enfisema Pulmonar
Orientador: Marcelo Costa Oliveira
Pós-doutorado
2019
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências da Saúde, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Inteligência Artificial. , Ano de interrupção: 2019
Formação complementar
2016 - 2016
R Basics - R Programming Language Introduction. (Carga horária: 3h). , Udemy, UDEMY, Estados Unidos.
2016 - 2016
Introduction to R. (Carga horária: 4h). , DataCamp, DATACAMP, Estados Unidos.
2014 - 2014
Aquisição, Processamento, Análise e Visualização d. (Carga horária: 4h). , XXIV Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, CBEB, Brasil.
2013 - 2013
Aplicações biomédicas em plataformas computacionai. (Carga horária: 60h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2011 - 2011
Metodologia para Desenvolvimento de Sistemas Micro. (Carga horária: 4h). , II Simpósio Interinstitucional de Computação do Vale do São Francisco, SICOMP, Brasil.
2010 - 2010
Visão Computacional com OpenCV. (Carga horária: 6h). , X Escola Regional de Computação Bahia-Alagoas-Sergipe, ERBASE, Brasil.
2010 - 2010
Reconhecimento de Padrões em Imagens Médicas. (Carga horária: 6h). , X Escola Regional de Computação Bahia-Alagoas-Sergipe, ERBASE, Brasil.
2008 - 2008
Grids Computacionais da Teoria à Prática. (Carga horária: 3h). , V Congresso Acadêmico da Universidade Federal de Alagoas, UFAL, Brasil.
2008 - 2008
Latex: O Editor de Textos de Uso Profissional e Ac. (Carga horária: 3h). , V Congresso Acadêmico da Universidade Federal de Alagoas, UFAL, Brasil.
2008 - 2008
Introdução ao Teste de Software com Junit e EMMA. (Carga horária: 4h). , XXVI Executiva Nacional dos Estudantes de Ciência da Computação, XXVI ENECOMP, Brasil.
2005 - 2008
Mastering English Course. (Carga horária: 240h). , Centro de Cultura Anglo Americana, CCAA, Brasil.
2001 - 2005
Video English Course. (Carga horária: 540h). , Centro de Cultura Anglo Americana, CCAA, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências da Saúde / Área: Medicina / Subárea: Radiologia Médica.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Inteligência Artificial.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Engenharia de Software.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Processamento Gráfico (Graphics).
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia/Especialidade: Processamento de Sinais Biológicos.
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia Computacional.
Organização de eventos
FERREIRA JUNIOR, J. R. . Semana Nacional de Ciência e Tecnologia de São Carlos (SNCT 2016). 2016. (Outro).
FERREIRA JUNIOR, J. R. ; OLIVEIRA, E. A. S. . X Olimpíada Brasileira de Informática (OBI). 2008. .
Participação em eventos
21º Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde. 2021. (Simpósio).
SPIE Medical Imaging 2021 Digital Forum. 2021. (Congresso).
42nd Annual International Conferences of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. 2020. (Congresso).
XX Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde. 2020. (Simpósio).
Workshop on Scientific Computing, Data Visualization & Analytics in Medicine in the Big Data Era. 2019. (Simpósio).
32nd International Congress and Exhibition on Computer-Assisted Radiology and Surgery (CARS). 2018. (Congresso).
XV Congresso Brasileiro de Informática em Saúde (CBIS 2016). Radiômica de Imagens Médicas. 2016. (Congresso).
28th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (IEEE CBMS 2015). 2015. (Simpósio).
XI Workshop de Visão Computacional. 2015. (Simpósio).
27th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS). 2014. (Simpósio).
I Simpósio Alagoano de Big Data (SIBDATA).Uso de GPU no Processamento de Big Data. 2014. (Simpósio).
XXIV Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica (CBEB). 2014. (Congresso).
The Third International Conference on Computational Science, Engineering and Information Technology (CCSEIT). 2013. (Outra).
II Congresso de Ciência da Computação de Arapiraca (ARACOMP). 2011. (Congresso).
II Simpósio Interinstitucional de Computação do Vale do São Francisco (SICOMP). 2011. (Simpósio).
III Encontro de Iniciação Científica do Instituto Federal de Alagoas. 2010. (Encontro).
II Semana de Matemática da Universidade Federal de Alagoas.Aplicação dos Padrões de Textura de Primeira e Segunda Ordem no Auxílio Computadorizado ao Diagnóstico. 2010. (Encontro).
X Escola Regional de Computação Bahia-Alagoas-Sergipe (ERBASE). 2010. (Encontro).
Encontro Empresarial As Estratégias das Pessoas Positivas no Mundo Corporativo: Um Poderoso Diferencial Competitivo. 2009. (Encontro).
I Congresso de Ciência da Computação em Arapiraca (ARACOMP). 2009. (Congresso).
II Encontro de Iniciação Científica do Instituto Federal de Alagoas. 2009. (Encontro).
VI Congresso Acadêmico da Universidade Federal de Alagoas. 2009. (Congresso).
I Encontro de Iniciação Científica do Instituto Federal de Alagoas. 2008. (Encontro).
V Congresso Acadêmico da Universidade Federal de Alagoas. 2008. (Congresso).
VIII Escola Regional de Computação Bahia-Alagoas-Sergipe (ERBASE). 2008. (Encontro).
XXVI Executiva Nacional dos Estudantes de Ciência da Computação (ENECOMP). 2008. (Congresso).
Participação em bancas
OLIVEIRA, M. C.FERREIRA JUNIOR, J. R.; VIEIRA, T. M. A.; VIEIRA, T. F.. DX-VT - Rede híbrida entre Redes Neurais Deformáveis e Vision Transformer para detecção de nódulos pulmonares. 2023. Exame de qualificação (Mestrando em Informática) - Universidade Federal de Alagoas.
AZEVEDO-MARQUES, P. M.FERREIRA JUNIOR, J. R.NOGUEIRA-BARBOSA, M. H.. Avaliação computadorizada de sacroiliíte em imagens de ressonância magnética. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informática Biomédica) - Universidade de São Paulo.
AZEVEDO-MARQUES, P. M.FERREIRA JUNIOR, J. R.NOGUEIRA-BARBOSA, M. H.. Caracterização de nódulos pulmonares a partir de atributos de forma em imagens 3D de tomografia computadorizada. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informática Biomédica) - Universidade de São Paulo.
Orientou
Caracterização de nódulos pulmonares a partir de atributos de forma em imagens 3D de tomografia computadorizada; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Informática Biomédica) - Universidade de São Paulo; Orientador: José Raniery Ferreira Junior;
Avaliação computadorizada de sacroiliíte em imagens de ressonância magnética; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Informática Biomédica) - Universidade de São Paulo; Orientador: José Raniery Ferreira Junior;
Estágio Curricular Supervisionado I; 2010; Orientação de outra natureza; (Técnico em Informática) - Escola Estadual de Educação Básica e Profissional José Aprígio Vilela; Orientador: José Raniery Ferreira Junior;
Estágio Curricular Supervisionado I; 2010; Orientação de outra natureza; (Técnico em Informática) - Escola Estadual de Educação Básica e Profissional José Aprígio Vilela; Orientador: José Raniery Ferreira Junior;
Estágio Curricular Supervisionado I; 2010; Orientação de outra natureza; (Técnico em Informática) - Escola Estadual de Educação Básica e Profissional José Aprígio Vilela; Orientador: José Raniery Ferreira Junior;
Estágio Curricular Supervisionado I; 2010; Orientação de outra natureza; (Técnico em Informática) - Escola Estadual de Educação Básica e Profissional José Aprígio Vilela; Orientador: José Raniery Ferreira Junior;
Estágio Curricular Supervisionado I; 2010; Orientação de outra natureza; (Técnico em Informática) - Escola Estadual de Educação Básica e Profissional José Aprígio Vilela; Orientador: José Raniery Ferreira Junior;
Estágio Curricular Supervisionado I; 2010; Orientação de outra natureza; (Técnico em Informática) - Escola Estadual de Educação Básica e Profissional José Aprígio Vilela; Orientador: José Raniery Ferreira Junior;
Produções bibliográficas
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Outras produções
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FERREIRA JUNIOR, J. R. ; TIENGO, W. C. . Sistema de Contagem Automatizada de Veículos Urbanos Através de Videomonitoramento. 2013.
FERREIRA JUNIOR, J. R. . Sistema para Clínica Odontológica. 2012.
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FERREIRA JUNIOR, J. R. . Revisão de trabalho para a Fourth International Conference on Computational Science and Engineering (CSE). 2016.
FERREIRA JUNIOR, J. R. . Revisão de trabalho para o II Workshop de Inovação, Pesquisa, Ensino e Extensão (WIPEX). 2016.
FERREIRA JUNIOR, J. R. . Revisão de trabalho para a Sixth International Conference on Computer Science and Information Technology (CCSIT). 2015.
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FERREIRA JUNIOR, J. R. . Revisão de trabalho para a Third International Conference on Advanced Information Technologies and Applications (ICAITA). 2014.
FERREIRA JUNIOR, J. R. . Revisão de trabalho para a Fourth International Conference on Computer Science and Information Technology (CCSIT). 2013.
FERREIRA JUNIOR, J. R. . Revisão de trabalho para a Second International Conference on Signal, Image Processing and Pattern Recognition (SIPP). 2013.
AZEVEDO-MARQUES, P. M. ; SANTOS, M. K. ; FERREIRA JUNIOR, J. R. . Professores e aluno da FMRP recebem Diploma de Premiação do Prêmio Tese Destaque USP de 2020. 2022. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
FERREIRA JUNIOR, J. R. . De Arapiraca a Harvard: a inspiradora história de um aluno de computação. 2020. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
FERREIRA JUNIOR, J. R. ; AZEVEDO-MARQUES, P. M. ; KOENIGKAM-SANTOS, M. . Bioengenharia: Tese recebe menção honrosa no Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde. 2020. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
AZEVEDO-MARQUES, P. M. ; FERREIRA JUNIOR, J. R. ; LIMA, L. L. . Ferramentas de inteligência artificial para processamento de sinais e análise de imagens médicas. 2021. .
Ferreira Junior, José Raniery . Precision Radiomic Biomarkers: a brief introduction, some technical development, and several clinical applications. 2021. .
FERREIRA JUNIOR, J. R. . Introdução à Edição de Textos e Slides em LaTeX. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
Projetos de pesquisa
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2021 - 2021
Desenvolvimento de marcadores radiográficos quantitativos para medicina de precisão de síndromes respiratórias agudas, Descrição: A pandemia do novo coronavírus SARS-CoV-2 já teve a confirmação de milhões de casos em todo o mundo, sendo responsável por milhares de mortes. Os pacientes diagnosticados com síndromes respiratórias agudas graves (SARS) são submetidos rotineiramente a exames de imagens médicas, especialmente a radiografia de tórax (CXR), para avaliar a progressão da doença, como a COVID-19. Entretanto, as características radiográficas das SARS são muito similares, complicando as tomadas de decisões clínicas. A radiômica por sua vez pode auxiliar a avaliação radiológica das SARS por meio da associação de características quantitativas das imagens com os desfechos da doença, como etiologia, severidade, resposta ao tratamento, entre outros. Logo, esse projeto propõe investigar biomarcadores e modelos radiômicos baseados em CXR para auxiliar o diagnóstico, prognóstico e decisões clínicas das SARS. Serão utilizados diferentes coortes de pacientes acometidos de SARS para o desenvolvimento e validação dos métodos investigados. Imagens de CXR dos pacientes serão automaticamente processadas e terão as lesões pulmonares segmentadas por algoritmos já desenvolvidos. Os pacientes serão caracterizados massivamente por características quantitativas das CXRs segmentadas, incluindo histograma de nível de cinza, matrizes de textura e transformadas no domínio da frequência da imagem. Análises estatísticas multivariadas e técnicas estado-da-arte de inteligência artificial serão utilizadas na modelagem preditiva para aumentar a performance radiômica. O desempenho preditivo será avaliado por curvas ROC, medidas de sensibilidade e especificidade e curvas Kaplan-Meier de probabilidade de ocorrência de um evento. As métricas de desempenho serão testadas estatisticamente por métodos como Mann-Whitney para os biomarcadores diagnósticos, log-rank para os índices prognósticos e DeLong para os modelos preditivos. Dessa forma, os potenciais marcadores e modelos radiômicos poderão desempenhar papel fundamental no suporte às decisões clínicas de síndromes respiratórias agudas. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Marco Antonio Gutierrez - Coordenador.
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2020 - 2023
Ferramentas computacionais para diagnóstico, detecção e prognóstico de COVID-19: análise e desenvolvimento de métodos utilizando redes convolucionais profundas com dados de tomografia computadorizada e raios X, Descrição: O projeto consiste no desenvolvimento de métodos e ferramentas computacionais, utilizando imagens de tomografia computadorizada e raios X, para identificar, classificar e caracterizar acometimentos do pulmão. Os métodos visam apoiar médicos na tomada de decisão e definição da conduta em casos confirmados de COVID-19. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Paulo Mazzoncini de Azevedo-Marques - Integrante / Agma Juci Machado Traina - Integrante / Caetano Traina Junior - Integrante / Marco Antonio Gutierrez - Integrante / Koenigkam-Santos, Marcel - Integrante / Diego Armando Cardona Cardenas - Integrante / Leticia Rittner - Coordenador / Roberto de Alencar Lotufo - Integrante / Éderson Antonio Gomes Dorileo - Integrante / Simone Appenzeller - Integrante / Sergio San Juan Dertkigil - Integrante.
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2020 - 2023
Analisando Dados Complexos Vinculados a COVID-19 para Apoio à Tomada de Decisão e Prognóstico, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Agma Juci Machado Traina em 08/07/2020., Descrição: Este projeto de pesquisa suplementar visa propor, explorar e desenvolver novos métodos e algoritmos a serem usados em processos de tomada de decisão para diagnóstico médico e prognóstico de pacientes no contexto da COVID-19. Estes métodos e algoritmos serão instanciados em sistemas e aplicativos que serão disponibilizados à comunidade científica para apoiar de modo rápido e preciso tal processo de tomada de decisão. Os desafios a serem sobrepujados começam na montagem de bases de dados e imagens provenientes de plataformas distintas e muitas vezes incompletas, e à aplicação da técnica de radiômica sobre imagens de Raio-X (RX) e tomografia computadorizada (TC), com a premissa de que características quantitativas e qualitativas massivas sobre imagens de RX podem trazer a informação necessária ao diagnóstico de COVID-19, do mesmo modo que a TC fornece. A vantagem dessa abordagem que será investigada é o custo menor e a maior disponibilidade de RX, permitindo que mais pacientes sejam beneficiados pelos resultados dessa proposta. Além de disponibilizar material curado e consistente para pesquisas e avanços na área de COVID-19. Além disso, bases de dados e imagens consistentes para pesquisa serão disponibilizadas para a comunidade da área.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Paulo Mazzoncini de Azevedo Marques - Integrante / Marcel Koenigkam Santos - Integrante / Agma Juci Machado Traina - Coordenador / Caetano Traina Junior - Integrante / Marco Antonio Gutierrez - Integrante / Diego Armando Cardona Cardenas - Integrante / Elaine Parros Machado de Sousa - Integrante / José Fernando Rodrigues Júnior - Integrante / Leticia Rittner - Integrante / Roberto de Alencar Lotufo - Integrante / Robson Leonardo Ferreira Cordeiro - Integrante.
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2019 - 2022
Perfil omics das áreas centrolobular com ativa organização miofibroblástica como potencial biomarcador diagnóstico da pneumonia intersticial broncocêntrica, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Alexandre Todorovic Fabro em 18/09/2022., Descrição: As doenças pulmonares intersticiais (DPIs) representam um espectro amplo e diverso de transtornos que causam graus variáveis de inflamação intersticial e fibrose, que podem, em última análise, promover um remodelamento dramático da arquitetura do parênquima pulmonar subjacente. A classificação de DPI pode ser um problema desafiador e, embora as discussões multidisciplinares (MDD) por clínicos, radiologistas e patologistas tenham melhorado a concordância e a confiança diagnóstica, muitos casos permanecem difíceis de serem classificados. Pneumonite intersticial bronquiolocêntrica (BIP) é uma doença pulmonar intersticial crônica caracterizada por quantidades variáveis de inflamação e fibrose com acentuação em torno das vias aéreas (centrada nas vias aéreas), quantidades variáveis de metaplasia peribronquiolar e um pequeno componente de pneumonia organizante. Suas possíveis etiologias incluem tabagismo, aspiração broncopulmonar crônica, manifestação pulmonar de doença vascular sistêmica autoimunes / colágeno subjacente, pneumonite por hipersensibilidade, toxicidade por drogas, algumas exposições a poeira, doença idiopática, entre outras condições. Esta doença está associada à alta morbidade e mortalidade e o diagnóstico precoce e preciso é fundamental para melhorar os resultados do tratamento. Este projeto estudará o perfil molecular de áreas centrolobulares miofibroblásticas organizantes ativas, onde o mecanismo específico de remodelação pulmonar está presente e validar biomarcadores diagnósticos translacionais. As vias moleculares dessas áreas de lesão revelarão mecanismos fisiopatológicos detalhados das doenças pulmonares intersticiais de maneira relacionada à etiologia. O biomarcador de diagnóstico molecular desempenhará um papel vital no apoio ao diagnóstico e etiologia específicos da DPI pulmonar bronquiolocêntrica, o que será de suma importância no tratamento e na evolção dos pacientes. Novas estratégias terapêuticas e novas drogas podem ser desenvolvidas com melhor custo-benefício e com melhor eficácia terapêutica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Paulo Mazzoncini de Azevedo-Marques - Integrante / Marcel Koenigkam Santos - Integrante / A T FABRO - Coordenador / Agma Juci Machado Traina - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2018 - Atual
Plataforma Nacional de Armazenamento e Inteligência Artificial em Imagens Médicas para Pesquisa, Inovação e Suporte à Decisão Clínica, Descrição: Imagens médicas são fontes relevantes para a análise e diagnóstico de doenças, e, com o avanço da tecnologia para sua aquisição e armazenamento, elas se tornaram um importante instrumento na gestão da saúde. No entanto, por falta de um protocolo padrão na coleta destes exames, assim como estrutura para armazenamento e acesso de seus dados, boa parte das instituições de saúde especialmente no SUS - tende a deletar, com o tempo, os exames realizados. Além disso, no Brasil há uma escassez de médicos especialistas (ex. radiologistas e dermatologistas), principalmente em regiões mais precárias, aumentando o tempo de espera até o diagnóstico. Neste contexto, avanços no campo da Inteligência Artificial apresentam-se como promissoras ferramentas aliadas à tomada de decisão diagnóstica. O projeto Banco de Imagens surgiu para endereçar essa problemática. A iniciativa consiste no desenvolvimento de um banco de dados universal para armazenamento e gestão de exames de imagem realizados no SUS, em qualquer lugar do país. A plataforma foi elaborada para poder ser acessada por qualquer computador ou aparelho celular. Assim, poderá ser facilmente inserida na rotina de trabalho dos profissionais de saúde. A expectativa é que profissionais e pacientes tenham acesso aos exames com a mesma qualidade em todas as regiões do país, permitindo melhor acompanhamento de patologias e da avaliação de resposta ao tratamento. Além disso, a plataforma proverá o uso de soluções baseadas em Inteligência Artificial para suporte à decisão diagnóstica. Estas ferramentas de auxílio ao diagnóstico prometem aumentar a acurácia dos diagnósticos, assim como melhorar o processo de triagem e de detecção precoce de patologias. Além da maior eficiência e efetividade diagnóstica, espera-se a redução de custos para o SUS, assim como menores impactos ambientais por meio da diminuição de exames desnecessários. Os dados populacionais gerados, em real-time, poderão auxiliar o Ministério da Saúde a conceber políticas estratégicas de saúde pública baseadas em dados concretos e atualizados. Além disso, a plataforma de banco de imagens constitui um ambiente favorável à pesquisa e inovação, permitindo que pesquisadores, startups e demais interessados possam se conectar à base, propiciando o desenvolvimento de novos projetos que favoreçam o SUS.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Pedro Vieira Santana Netto - Coordenador / Daniel Tornieri - Integrante.
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2017 - 2024
Mining, Indexing and Visualizing Big Data in Clinical Decision Support Systems (MIVisBD), Descrição: Today, almost every human activity generates and/or demands to store and process massive, diverse and complex data, either in scientific, academic, enterprise and even leisure pursuits - the scenario being called as the big data era''. Health-related activities are in the core of those activities, as they produce big data as well as they can take advantage of the technological storm, improving the behavior of everyone whose decision is increasingly guided by the information extracted from all these big data. In a clinical environment, the Electronic Health Records (EHR) forms a proper anchor to develop information extraction strategies. In this proposal, we aim at integrating novel database support, image processing and visual analytics methods to leverage the large number of EHR and repositories of clinical data to gather valuable and significant information for decision-making. The size and complexity of EHR databases offer great challenges when they need to be processed in terms both of applying analysis techniques and to support the development of subsequent applications for practical tools. However, it also embodies a cornucopia of opportunities to create algorithms and methods able to display smart and relevant information related to either a particular patient or groups of patients and to boost the EHR into a more effective platform to support the healthcare professionals, coping medical applications and strategic government decisions with the demands and benefits of big data. In this project we will develop methods and algorithms that will ultimately be materialized as a modular platform to be made available to the community.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Paulo Mazzoncini de Azevedo-Marques - Integrante / Agma Juci Machado Traina - Coordenador / Caetano Traina Junior - Integrante / Marco Antonio Gutierrez - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2017 - 2019
Interdisciplinary study for Radiomics application to lung cancer diagnosis and prognosis, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Paulo Mazzoncini de Azevedo Marques em 21/06/2017., Descrição: (JOINT USP-HU RESEARCH) Lung cancer is the most common cause of cancer-related deaths, with a 5-year overall survival rate of only 15%. The prognosis of lung cancer is still poor and varies markedly according to the tumor staging at diagnosis. Tumor stage at presentation, as designated by the tumor-node-metastasis (TNM) system, is the most important prognostic factor and may determine therapy. However, recent studies showed that clinical decision making may be influenced by other tumor aspects, such as, the histological subtype of the lesion. Moreover, some works showed that computed tomography (CT) image features also may influence the prognosis and response to therapy. However, those features are typically described semi-quantitatively or subjectively, qualitatively (heterogeneity, spiculation, attenuation and so on). Radiomics is an emerging field that converts imaging data into a high dimensional feature space using a large number of extracted data-characterization algorithms. The rationale of radiomics is that we could obtain a more comprehensive characterization of the underlying tumor phenotypes by extracting a large number of imaging features, which may ultimately correlate with clinical outcomes. Deep learning (DL) is making major advances in pattern recognition and machine intelligence problems. DL methods allow a machine to be fed with raw data and to automatically discover the representations needed for classification. The essence of deep learning is to compute hierarchical features of the observational data, where the higher-level features are defined from lower-level ones. One of the most used DL methods are the convolutional neural networks (CNN), due to their capacity of process data that come in the form of multiple arrays, such as images. Based on what was previously presented, the main goal of this proposal is to start an international interdisciplinary collaboration focused on investigating the potential of deep learning-based radiomics analysis to improve malignant pulmonary tumor diagnosis, lung cancer patient's prognosis, and treatment decision making. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Paulo Mazzoncini de Azevedo-Marques - Coordenador / Marcel Koenigkam Santos - Integrante / Alexandre Todorovic Fabro - Integrante / Ralf Reulke - Integrante / Dominik Rueß - Integrante / Niklas Deckers - Integrante / Victor Francisco - Integrante., Financiador(es): Universidade de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2013 - 2015
Auxílio Computadorizado ao Diagnóstico do Câncer de Pulmão Otimizado por GPU, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Marcelo Costa Oliveira em 27/01/2015., Descrição: O objetivo principal deste projeto é desenvolver um algoritmo computacional para auxiliar especialistas em classificar nódulos pulmonares utilizando Recuperação de Imagens Baseada em Conteúdo através de Análise de Textura 3D, Análise de Nitidez de Borda 3D e otimização de tempo de processamento usando GPU. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Marcelo Costa Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
Projetos de desenvolvimento
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
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2012 - 2013
Sistema de Videomonitoramento de Vias Urbanas, Descrição: Ferramenta para auxiliar no gerenciamento do tráfego urbano através da contagem automatizada dos veículos. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: José Raniery Ferreira Junior - Integrante / Willy Carvalho Tiengo - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Bolsa.
Prêmios
2020
Menção Honrosa ao melhor artigo da Trilha Principal do XX Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde, Sociedade Brasileira de Computação.
2020
Menção Honrosa à melhor tese de doutorado apresentada no XX Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde, Sociedade Brasileira de Computação.
2020
Prêmio Tese Destaque USP, Universidade de São Paulo.
2019
3º lugar no Desafio de Aplicações Bio-Tech (BMEBioBrazil - 2019), ACSUP, IEEE LA BME, SBEB.
2010
Excelência Acadêmica, Categoria Pesquisa, VII Congresso Acadêmico da Universidade Federal de Alagoas.
2009
Excelência Acadêmica, Categoria Extensão, VI Congresso Acadêmico da Universidade Federal de Alagoas.
Histórico profissional
Endereço profissional
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Hospital Israelita Albert Einstein, Departamento de Imagem. , Av. Albert Einstein, 627, Morumbi, 05652900 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 21511233, URL da Homepage:
Experiência profissional
2022 - Atual
Hospital Israelita Albert EinsteinVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Engenheiro de Dados, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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11/2022
Outras atividades técnico-científicas , Departamento de Imagem, Departamento de Imagem.,Atividade realizada, Engenharia de Software.
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11/2022
Outras atividades técnico-científicas , Departamento de Imagem, Departamento de Imagem.,Atividade realizada, Implantação de Inteligência Artificial.
2022 - 2023
Turier TechVínculo: Societário, Enquadramento Funcional: Diretor Executivo, Carga horária: 40
2022 - 2022
Centro de Inovação EdgeVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Engenheiro de Software, Carga horária: 36
2021 - 2021
Fundação Faculdade de MedicinaVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Pesquisa, Carga horária: 10
Atividades
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06/2021 - 12/2021
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto do Coração.,Linhas de pesquisa
2021 - 2021
HI TechnologiesVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador Sênior, Carga horária: 40
Atividades
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04/2021 - 10/2021
Pesquisa e desenvolvimento, Divisão P&D de Inteligência Artificial.,Linhas de pesquisa
2019 - 2021
Fundação Zerbini - Instituto do CoraçãoVínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador Sênior, Carga horária: 40
2017 - 2018
Harvard UniversityVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Non-Employee PhD Student, Carga horária: 40
Outras informações:
Visiting PhD student do 3D Imaging Research Lab do Departamento de Radiologia do Massachusetts General Hospital (MGH), Harvard Medical School (HMS) com bolsa do Programa de Doutorado Sanduíche no Exterior (PDSE/CAPES).
2019 - 2019
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Carga horária: 40
Outras informações:
Pesquisador do Centro de Ciências das Imagens e Física Médica (CCIFM) da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP).
2015 - 2019
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno de doutorado, Carga horária: 40
Outras informações:
Realiza pesquisa no Centro de Ciências das Imagens e Física Médica (CCIFM) da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP).
2016 - 2016
Universidade de São PauloVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 6
Outras informações:
Professor colaborador do curso de graduação Interunidades em Informática Biomédica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP) e da Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP).
Atividades
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06/2015 - 06/2019
Pesquisa e desenvolvimento, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.,Linhas de pesquisa
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01/2016 - 06/2016
Ensino, Informática Biomédica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Treinamento em Serviço em Informática Biomédica (IBM1007), Diagnóstico por Imagem e Radioterapia para Informática Biomédica (IBM1099)
2012 - 2013
ZUQ - Transporte InteligenteVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor de Sistemas, Carga horária: 40
Outras informações:
Bolsista de projeto de desenvolvimento tecnológico.
2010 - 2011
Escola Estadual de Educação Básica e Profissional José Aprígio VilelaVínculo: Servidor Contratado, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 20
Outras informações:
Orientador de Estágio Curricular Supervisionado e professor do curso Técnico em Informática.
Atividades
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08/2010 - 12/2011
Ensino,,Disciplinas ministradas, Algoritmos e Estrutura de Dados, Engenharia de Software I e II, Oficina I - Especificação de Sistemas, Oficina II - Projetos de Sistemas da WEB, Programação de Sistemas, Programação de Sistemas Avançado, Programação de Sistemas para Internet
2013 - 2015
Universidade Federal de AlagoasVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno de mestrado, Carga horária: 40
Outras informações:
Realizou pesquisa no Laboratório de Telemedicina e Informática Médica (LaTIM) do Centro de Apoio à Pesquisa do Hospital Universitário Prof. Alberto Antunes (HUPAA).
2013 - 2014
Universidade Federal de AlagoasVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Estagiário em docência, Carga horária: 2
Outras informações:
Realizou estágio docência no curso de Ciência da Computação do Campus Arapiraca.
2010 - 2010
Universidade Federal de AlagoasVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 20
Outras informações:
Realizou monitoria nas disciplinas Engenharia de Software I e II do curso de Ciência da Computação do Campus Arapiraca.
2008 - 2009
Universidade Federal de AlagoasVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno de graduação, Carga horária: 20
Outras informações:
Realizou pesquisa no Laboratório de Informática Médica e Bioinformática (LIMB) do Campus Arapiraca.
Atividades
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04/2013 - 05/2015
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Computação.,Linhas de pesquisa
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11/2013 - 03/2014
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Banco de Dados II
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07/2008 - 12/2009
Pesquisa e desenvolvimento, Campus Arapiraca.,Linhas de pesquisa
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de José Raniery Ferreira Junior e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todas as movimentações desse processo e sempre que o processo aparecer em publicações dos Diários Oficiais e nos Tribunais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Confirma a exclusão?