Katia Silva Guimarães

Pós-doutorado

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Organização de eventos

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Orientou

Produções bibliográficas

• DO NASCIMENTO, FRANCISCO ; GUIMARAES, KATIA S. . Copy Number Variations Detection: Unravelling the Problem in Tangible Aspects. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics , v. 14, p. 1237-1250, 2017.

• DE CARVALHO, RANIERI V. ; LOPEZ-FERRER, DANIEL ; GUIMARÃES, KATIA S. ; LINS, ROBERTO D. . IMSPeptider, a computational peptide collision cross-section area calculator based on a novel molecular dynamics simulation protocol. Journal of Computational Chemistry , v. n/a, p. n/a-n/a, 2013.

• GUIMARÃES, K. S. ; PRZYTYCKA, T. M. . Interrogating domain-domain interactions with parsimony based approaches (HIGHLY-ACCESSED). BMC Bioinformatics , v. 9, p. 171, 2008.

• FONSECA, P. G. S. ; GUIMARÃES, K. S. ; SAGOT, M-F. . Efficient representation and P-value computation for higher-order Markov motifs. Bioinformatics (Oxford) , v. 24, p. i160-i166, 2008.

• ZOTENKO, E. ; GUIMARÃES, K. S. ; JOTHI, R. ; PRZYTYCKA, T. M. . Decomposition of Overlapping Protein Complexes: A Graph Theoretical Method for Analyzing Static and Dynamic Protein Associations (HIGHLY ACCESSED). Algorithms for Molecular Biology , v. 1, n.7, p. 7, 2006.

• GUIMARÃES, K. S. ; JOTHI, R. ; ZOTENKO, E. ; PRZYTYCKA, T. M. . Predicting domain-domain interactions using a parsimony approach (HIGHLY ACCESSED). Genome Biology , v. 7, p. R104, 2006.

• Silva, Walkiria Luckwu de Santana ; Cavalcanti, Andre Ricardo de Oliveira ; GUIMARÃES, K. S. ; Morais Jr., Marcos Antonio de . Identification in silico of putative damage responsive elements (DRE) in promoter regions of the yeast genome. Genetics and Molecular Biology , v. 28, n.4, p. 814-820, 2005.

• MELO, J. C. B. ; CAVALCANTI, G. D. C. ; GUIMARÃES, K. S. . Protein Secondary Structure Prediction: Efficient Neural Network and Feature Extraction Approaches. Electronics Letters , v. 40, n.21, p. 1358-1359, 2004.

• GASARCH, W. I. ; GUIMARÃES, K. S. . Binary Search and Recursive Graph Problems. Theoretical Computer Science , Amsterdam, v. 181, p. 119-139, 1997.

• DEHNE, F. ; GUIMARÃES, K. S. . Exact and Approximate Computational Geometry Solutions of an Unrestricted Stereo Matching Problem. Information Processing Letters , Amsterdam, v. 64, n.3, p. 107-114, 1997.

• GUIMARÃES, K. S. ; GASARCH, W. I. ; PURTILO, J. . Selection Problems via m-ary Queries. Computational Complexity , Basel, v. 2, p. 256-276, 1992.

• GUIMARÃES, K. S. ; PANCHENKO, A. (Org.) ; PRZYTYCKA, T. M. (Org.) . Advances in Bioinformatics and Computational Biology - 4th Brazilian Symposium on Bioinformatics, BSB 2009. Berlin, Germany: Springer, 2009. 169p .

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• GUIMARÃES, K. S. ; SAGOT, M-F. (Org.) . Algorithms and Computational Methods for Biochemical and Evolutionary Networks - CompBioNets 2004. 1st. ed. London: College Publications, 2004. v. 1. 140p .

• CARVALHO, M. H. ; CERIOLI, M. R. ; DAHAB, R. ; FEOFILOFF, P. ; FERNANDES, C. G. ; FERREIRA, C. E. ; GUIMARÃES, K. S. ; MIYAZAWA, F. K. ; PINA JR., J. C. ; WAKABAYASHI, Y. . Uma Introdução Sucinta a Algoritmos de Aproximação. 1. ed. Rio De Janeiro: IMPA, 2001. v. 01. 157p .

• ZIVIANI, N. (Org.) ; BAEZAYATES, R. (Org.) ; GUIMARÃES, K. S. (Org.) . Third South-American Workshop on String Processing. Ottawa, Canada: Carleton University Press, 1996. v. 1. 213p .

• Rosa, Rogério S. ; GUIMARÃES, KATIA S. . HybHap: A Fast and Accurate Hybrid Approach for Haplotype Inference on Large Datasets. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2013, v. , p. 24-35.

• Rosa, Rogério S. ; SANTOS, RAFAEL H. S. ; GUIMARÃES, KATIA S. . Associating Genotype Sequence Properties to Haplotype Inference Errors. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.Berlin: Springer Berlin Heidelberg, 2012, v. , p. 132-143.

• Rosa, Rogério S. ; GUIMARÃES, KATIA S. . Insights on Haplotype Inference on Large Genotype Datasets. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer Berlin Heidelberg, 2010, v. , p. 47-58.

• GUIMARÃES, K. S. ; PRZYTYCKA, T. M. . Domain-domain and Protein-protein Interaction. In: Anna R. Panchenko; Teresa M. Przytycka. (Org.). Protein-protein interactions and networks: Identification, Analysis and Prediction. : Springer_verlag, 2008, v. , p. 83-99.

• Zotenko, Elena ; GUIMARÃES, KATIA S. ; Jothi, Raja ; Przytycka, Teresa M. . Decomposition of Overlapping Protein Complexes: A Graph Theoretical Method for Analyzing Static and Dynamic Protein Associations. Systems Biology and Regulatory Genomics. 1ed.: Springer Berlin Heidelberg, 2007, v. , p. 23-38.

• GUIMARÃES, K. S. ; MELO, J. C. B. . Uma Introdução à Análise de Seqüências e Estruturas Biológicas. In: Juan Manuel Adán Coello; Sandra C. P. Ferraz Fabbri. (Org.). Jornadas de Atualização em Informática - JAI 2003. : , 2003, v. , p. 01-44.

• GUIMARÃES, K. S. . Algoritmos de Aproximação para Problemas de Otimização. In: Hermano Perrelli de Moura. (Org.). Jornadas de Atualização em Informática - JAI'98. Belo Horizonte: , 1998, v. , p. 1-45.

• Rosa, Rogério S. ; GUIMARÃES, K. S. . Accurate Prediction of Haplotype Inference Errors by Feature Extraction. In: 13o. Int. Symp. on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA), 2017, Honolulu, USA. Proceedings of the 13o. Int. Symp. on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA). Cham: Springer, 2017. p. 302-313.

• ARAUJO, F. R. B. ; GUIMARAES, K. S. . A novel Approach Based on Relevance Learning Vector Quantization Applied to the Inference of High Order SNPs Interections. In: IEEE ICTAI 2017 - 29th IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, 2017, Boston, USA. Annals of the 29th IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, 2017.

• ARAUJO, FLAVIA ROBERTA BARBOSA DE ; GUIMARAES, KATIA SILVA . Inference of High-Order Epistatic Interactions Using Generalized Relevance Learning Vector Quantization with Parametric Adjustment. In: 2016 IEEE 28th International Conference on Tools with Artificial Intelligence (ICTAI), 2016, San Jose. 2016 IEEE 28th International Conference on Tools with Artificial Intelligence (ICTAI), 2016. p. 648.

• ROSA, ROGERIO S. ; SANTOS, RAFAEL H. S. ; BRITO, ADAMO Y. ; GUIMARAES, KATIA S. . Insights on prediction of patients' response to anti-HIV therapies through machine learning. In: 2014 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN), 2014, Beijing. 2014 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN). p. 3697-3704.

• ROSA, ROGERIO S. ; SANTOS, RAFAEL H. S. ; GUIMARAES, KATIA S. . Accurate prediction of error in Haplotype Inference methods through neural networks. In: 2012 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN 2012 Brisbane), 2012, Brisbane. The 2012 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN). p. 1.

• Lessa, F. ; Martins Neto, D. ; Guimarães, Katia Silva ; Brígido, M.M. ; WALTER, M. E. M. T. . Regene: Automatic Construction of a Multiple Component Dirichlet Mixture Priors Covariance Model to Identify Non-coding RNA. In: ISBRA 2011, 2011, Changsha, China. Lecture Notes in Computer Science. Berlin, Germany: Springer, 2011. v. 6674. p. 380-391.

• DE ARAUJO, F. R. B. ; GUSMAO, E. G. ; GUIMARAES, K. S. . A Case-Control Study of Non-parametric Approaches for Detecting SNP-SNP Interactions. In: 2011 30th International Conference of the Chilean Computer Science Society (SCCC 2011), 2011, Curico. 2011 30th International Conference of the Chilean Computer Science Society, 2011. p. 19.

• MONTEIRO, CARLA CLAUDIA DA ROCHA REGO ; GUIMARAES, KATIA SILVA . Logistic Biclustering Models for Protein Network Inference. In: 2009 Ninth IEEE International Conference on Bioinformatics and BioEngineering (BIBE), 2009, Taichung. 2009 Ninth IEEE International Conference on Bioinformatics and BioEngineering, 2009. p. 221.

• SANTOS, G. B. ; GUIMARÃES, K. S. . A Simpler Bayesian Network Model for Genetic Regulatory Network. In: IEEE Intern. Joint Conf. on Neural Networks (IJCNN), 2005, Montreal. Proceedings of the IEEE IJCNN 2005, 2005.

• SANTOS, G. B. ; GUIMARÃES, K. S. . Analyzing the Effect of Prior Knowledge in Genetic Regulatory Network Inference. In: Pattern Recognition and Machine Intelligence (PREMI), 2005, Kolkata. Lecture Notes in Computer Science, 2005. v. 3776. p. 611-616.

• GUIMARÃES, K. S. ; MELO, J. C. B. ; CAVALCANTI, G. D. C. . Combining few Neural Networks for Effective Secondary Structure Prediction. In: Third IEEE Symposium on Bioinformatics and Bioengineering, 2003, Bethesda, MD, USA. Bioinformatics and Bioengineering (BIBE 2003), 3rd IEEE International Symposium on. Bethesda, MD, USA: IEEE Computer Society Press, 2003. p. 415-420.

• MELO, J. C. B. ; CAVALCANTI, G. D. C. ; GUIMARÃES, K. S. . Protein Secondary Structure Prediction with ICA Feature Extraction. In: 2003 IEEE Internl. Workshop on Neural Networks and Signal Processing - NNSP 2003, 2003, Toulouse, France. Neural Networks and Signal Processing, IEEE International Conference on, 2003. p. 13-22.

• SANTOS, G. B. ; GUIMARÃES, K. S. . HMM's para Identificação de Regiões Promotoras de Genes de Reparação. In: IV Encontro Nacional de Inteligência Artificial - ENIA, 2003, Campinas. Anais do IV Encontro Nacional de Inteligência Artificial, 2003.

• BAPTISTA, E. S. ; GUIMARÃES, K. S. . Uma Abordagem Alternativa para Seqüenciamento por Hibridização. In: XXIII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2003, Campinas. Anais do XXX SEMISH, 2003, 2003.

• MELO, J. C. B. ; CAVALCANTI, G. D. C. ; GUIMARÃES, K. S. . PCA Feature Extraction for Protein Structure Prediction. In: IJCNN - Intern. Joint Confer. on Neural Networks, 2003. Proc. of the 2003 International Joint Conference on Neural Networks, 2003.

• MYERS, E. W. ; OLIVA, P. B. ; GUIMARÃES, K. S. . Reporting Exact and Approximate Regular Expression Matches. In: Combinatorial Pattern Matching - CPM'98, 1998, Piscataway, NJ, USA. Lecture Notes in Computer Science. Berlin: Springer-Verlag, 1998. v. 1448. p. 91-103.

• GUIMARÃES, K. S. ; SALGADO, L. R. B. . On the Approximability of the Maximum Weighted Balance Problem. In: CLEI'97, 1997, Valparaíso. Proc. do CLEI'97, 1997. p. 211-220.

• GUIMARÃES, K. S. ; MELO, J. C. B. . String Alignment and Approximate Matching. In: Third South-American Workshop on String Processing, 1996, Recife. Informatics Series. Ottawa, Canada: Carleton University Press, 1996. v. 4. p. 85-100.

• DEHNE, F. ; GUIMARÃES, K. S. . Exact and Approximate Computational Geometry Solutions of an Unrestricted Point Set Stereo Matching Problem. In: 5th Italian Conference on Theoretical Computer Science, 1995, Ravello. 5th Italian Conference on Theoretical Computer Science. London: World Scientific, 1995. p. 192-200.

• SOUTO, M. C. P. ; GUIMARÃES, K. S. ; LUDERMIR, T. . Learning and Generalization in Pyramidal Architectures. In: II Simp. Brasileiro de Automação Inteligente, 1995, Curitiba. Proc. do II Simp. Brasileiro de Automação Inteligente. Curitiba, 1995. p. 225-230.

• SOUTO, M. C. P. ; GUIMARÃES, K. S. ; LUDERMIR, T. . On the Intractability of Loading Pyramidal Architectures. In: IV IEE Internl. Conference on Artificial Neural Networks, 1995, Cambridge. Proc. IV IEE Internl. Conference on Artificial Neural Networks. Cambridge: IEE, 1995. v. #409. p. 189-194.

• GASARCH, W. I. ; GUIMARÃES, K. S. . Unbounded Search and Recursive Graph Problems. In: Latin American Theoretical INformatics, 1995, Valparaíso. Lecture Notes in Computer Science. Berlin: Springer-Verlag, 1995. v. 911. p. 323-331.

• SOUTO, M. C. P. ; GUIMARÃES, K. S. ; LUDERMIR, T. . Issues on the Complexity of Training Weightless Neural Networks. In: I Brazilian Congress on Neural Networks, 1994. I Brazilian Congress on Neural Networks, 1994.

• GASARCH, W. I. ; GUIMARÃES, K. S. . On the Number of Components of a Recursive Graph. In: Latin American Theoretical INformaticcs - LATIN'92, 1992, São Paulo. Lecture Notes in Computer Science. Berlin: Springer-Verlag, 1992. v. 583. p. 177-190.

• Araújo, FRB ; GUIMARÃES, K. S. . Computational Tools for SNP Interactions - How Good Are They?. In: IEEE 11th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering - BIBE, 2011, Taichung, Taiwan. Proc. of the IEEE 11th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering, 2011. p. 295-298.

• SANTOS, G. B. ; FALCAO, T. P. R. ; GUIMARÃES, K. S. . An HMM-based Protein Family Classifier. In: ERMAC 2002 - Encontro Regional de Matemática Aplicada e Computacional, 2002, Natal, RN. Anais do ERMAC 2002. São José dos Campos, SP: Sociedade Brasileira de Matemática Aplicada e Computacional, 2002. p. 51-53.

• GUIMARÃES, K. S. ; MELO, J. C. B. ; CAVALCANTI, G. D. C. . Simple and Efficient Secondary Structure Prediction. In: European Conference on Computational Biology (ECCB), 2002, Saarbrücken, Germany. Proceedings of the European Conference on Computational Biology (ECCB 2002). Oxford, UK: Oxford University Press, 2002. p. 75-76.

• Araújo, FRB ; GUIMARAES, K. S. . A Novel Approach Based on Relevance Learning Vector Quantization Applied to the Inference of High-Order SNPs Interactions. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• GUIMARÃES, K. S. . Integrating data for gene network inference ? Insights and Challenges. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2014 - Atual

  Identificação de Genes e mutações associadas a doenças neuro-degenerativas, Descrição: Estudos têm revelado vários SNPs (single nucleotide polymorphisms) em genes associados com doenças e foi demonstrado que interações SNP-SNP estão fortemente relacionadas com a propensão a várias doenças. Este projeto visa a análise de dados genótipos de pacientes casos e controles, usando análises estatísticas e métodos de aprendizagem de máquina, com o objetivo de identificar SNPs e genes potencialmente relacionados com a propensão a doenças neuro-degenerativas, como o Mal de Parkinson e Alzheimer´s. Neste projeto, estaremos usando dados coletados e mantidos pelos Programas Alzheimer?s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) (http://www.adni-info.org/Home.aspx) e Parkinson?s Progression Markers Iniciative (PPMI) (http://www.ppmi-info.org/about-ppmi/.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador / Flávia Roberta Barbosa de Araújo - Integrante / Rebecca Cristina Linhares de Carvalho - Integrante / Israel Batista Freitas da Silva - Integrante., Número de orientações: 1

• 2014 - Atual

  Análise de Métodos de Inferência usando Dados Biológicos, Descrição: A análise de dados biológicos apresenta um enorme desafio, devido ao tamanho dos conjuntos de dados envolvidos e à natureza intrinsecamente complexa dos problemas estudados. O objetivo deste projeto é analisar as potencialidades e falhas de métodos de inferência computacional em dados biológicos de diferentes tipos. Serão objeto de estudo diferentes problemas, tais como: (1) Inferência de Haplótipos a partir de dados genótipos coletados do HapMap Project, (2) Predição de resposta de pacientes a tratamento anti-HIV, baseado em dados coletados do HIV Resistance Drug Databas, como medidas de CD4+ e carga viral, e também sequências de RNA de transcriptases reversas e proteases do vírus, e (3) Inferência de mutações do tipo Copy Number Variations (CNVs), que são fortemente associadas a suscetibilidade e resistência a doenças.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador / Rogério S. Rosa - Integrante / Rafael Henrique da Silva Santos - Integrante / Francisco Nascimento Junior - Integrante / Lucas Menezes Veras - Integrante., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 2

• 2014 - Atual

  Algoritmos e estruturas de dados cache-oblivious e aplicações à biologia computacional, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Paulo Gustavo Soares da Fonseca em 15/03/2017., Descrição: O desenvolvimento recente de novas tecnologias de alto desempenho para o sequenciamento de DNA (next-generation sequencing-NGS) trouxe novamente à tona problemas relacionados ao processamento de sequências biológicas que, ainda que não completamente resolvidos, vinham sendo satisfatoriamente tratados ao longo dos anos precedentes. Estas dificuldades decorrem do grande volume de dados produzidos, bem como de características específicas das sequências obtidas, nomeadamente quanto ao tamanho dos fragmentos e à taxa e tipo de erros de sequenciamento. Dentre esses problemas de processamento de sequências, destacam-se o problema do mapeamento (alinhamento local aproximado) de fragmentos a uma sequência usada como referência e o problema da montagem (ou reconstrução) de uma sequência original a partir de fragmentos parcialmente sobrepostos. Ambos os problemas utilizam estruturas de dados dedicadas, respectivamente índices completos e grafos de subsequências, cuja construção e representação são muito exigentes do ponto de vista de tempo e, notadamente, de espaço, a ponto de limitarem a aplicação prática dessas técnicas a ambientes computacionais de grande capacidade ou a projetos de menor porte. Por outro lado, também recentemente tem emergido uma categoria de algoritmos e estruturas de dados, denominados cache-oblivious, que se caracterizam por apresentarem um comportamento ótimo quanto à utilização da organização hierárquica da memória dos computadores eletrônicos modernos. Com efeito, na maioria das arquiteturas, a memória é organizada em diferentes níveis, de acordo com a "proximidade" à CPU. Quanto mais próxima à CPU, maior a velocidade da memória, porém menor a sua capacidade. Durante a computação, a CPU usa diretamente os dados da sua memória interna, constituída essencialmente pela memória cache, além dos registradores do processador. Quando uma informação necessária não está disponível neste nível (cache miss), ela precisa ser recuperada da memória no nível inferior, chamada memória principal (RAM). Se, por sua vez, uma porção necessária dos dados não está presente na memória principal, ela deve ser recuperada da memória secundária (e.g. disco magnético), e assim sucessivamente. Os algoritmos cache-oblivious garantem um número ótimo de cache-misses e, portanto, minimizam as transferências entre níveis adjacentes de memória sob algumas condições razoáveis, sem no entanto exigir o conhecimento prévio nem a parametrização em função das características físicas específicas da(s) memória(s). O objetivo deste projeto é desenvolver versões cache-oblivious para algoritmos e estruturas de dados aplicados a problemas de processamento de cadeias de caracteres em geral e, em particular, aos problemas de alinhamento e montagem de fragmentos de sequências biológicas. Especificamente, serão investigadas versões cache-eficientes de índices completos para o casamento aproximado de padrões e de grafos de fragmentos para montagem de sequências. Espera-se assim mitigar algumas das dificuldades incorridas pela utilização das tecnologias de sequenciamento de DNA de alto desempenho, aumentando a eficiência desses métodos e ampliando a possibilidade prática da sua aplicação.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / Paulo Gustavo Soares da Fonseca - Coordenador.

• 2010 - 2012

  Algoritmos e Métodos Computacionais Eficientes para a Inferência e Análise de Dados Biológicos, Descrição: Dado o conhecimento de que proteínas sofrem mutações, por pressões de tempo e de condições, e não funcionam isoladamente, mas interagindo com outras proteínas, um dos principais desafios na área de Biologia Molecular é compreender os mecanismos de evolução e de interação entre proteínas. São estes mecanismos que regulam a ação das proteínas, e permitem a interferência no processo, por exemplo, através de drogas e fármacos. Em contraposição às técnicas experimentais tradicionais, voltadas para grupos de proteínas ou funções mais específicos, as técnicas modernas de experimentos em larga escala têm um alcance amplo em quantidade e em funcionalidade dos elementos envolvidos, os quais podem ser genes, proteínas, peptídeos ou metabólitos em geral. Tais experimentos geram dados de mutação, de interação e de regulação altamente relevantes, no entanto, sujeitos a grande imprecisão. Além dos reconhecidamente altos índices de falsos negativos e positivos, devidos a limitações técnicas inerentes aos experimentos laboratoriais, há também a ausência de dados e um forte componente de bias, decorrente de caminhos e funções mais conhecidos e estudados. Muitas abordagens computacionais para determinação de interação, regulação e funcionalidade de proteínas têm sido propostos. Em função da já mencionada incompletude e incorreção dos dados, os métodos publicados nos últimos cinco anos tendem a integrar dados de diferentes tipos e fontes, com o propósito de aumentar a cobertura e a precisão dos resultados. Grande progresso vem sendo alcançado, mas é inegável a necessidade de métodos computacionais de melhor qualidade para inferência de interações entre proteínas. Outro problema de inferência envolvendo dados biológicos de uma natureza totalmente diferente é o problema da Inferência de Haplótipos a partir de Dados Genótipos. A recombinação troca trechos de DNA entre cromossomos homólogos, de tal forma que as células haplóides originadas a partir do processo de meiose dão origem, na fecu. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador / Teresa M. Przytycka - Integrante / Anna Panchenko - Integrante / Flávia Roberta Barbosa de Araújo - Integrante / Rogério S. Rosa - Integrante / Rafael Henrique da Silva Santos - Integrante / Ranieri Valença de Carvalho - Integrante., Número de orientações: 1

• 2009 - 2013

  Interações entre Polimorfismos e sua relação com doenças, Descrição: Estudos têm revelado vários SNPs (single nucleotide polymorphisms) em genes associados com doenças, como o câncer, e interações SNP-SNP parecem ser muito mais informativas no que concerne o risco de câncer. O objetivo deste projeto é estudar as possíveis associações entre a ocorrência de SNPs e a ocorrência de doenças.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador / Flávia Roberta Barbosa de Araújo - Integrante.

• 2004 - 2005

  Algorithms and Combinatorics for Computational Molecular Biology e Combinatória para Problemas de Biologia Molecular, Descrição: Coordenação brasileira do Projeto de Cooperação internacional financiado pela CAPES/COFECUB. O projeto tem dois objetivos principais. O primeiro diz respeito ao problema de inferência de estruturas macromoleculares 3D, a partir de dados biológicos (essencialmente seqüências genômicas e objetos, como por exemplo, elementos repetitivos - os motifs, que podem representar um sinal de regulação gênica, os rearranjos genômicos, e suas relações (por exemplo, entre elementos da estrutura 3D de uma proteína), ou a evolução da espécie ou das famílias de genes. Um segundo objetivo trata de uma análise teórica de problemas combinatórios para modelagem para problemas como o de rearranjo de genomas e de inferência de haplotypes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador / Jeane Cecília Bezerra de Melo - Integrante / Eugene W Myers - Integrante / Marie-France Sagot - Integrante / Paulo Gustavo Soares da Fonseca - Integrante / João Meidanis - Integrante / Maria Emília M. Telles Walter - Integrante / Zanoni Dias - Integrante / Maxime Crochemore - Integrante / Guillaume Fertin - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação / COFECUB - Cooperação., Número de produções C, T & A: 4

• 2001 - 2003

  DNA PROSPECT (Coordenação) - financiado pelo CNPq, processo no. 52.1075/01-7., Descrição: Este projeto focou no desenvolvimento de técnicas para exploração de seqüências de DNA. Visou metodologias de seqüenciamento, identificação de sítios de regulação e inferência de estrutura de proteínas, e levou à publicação de vários artigos nacionais e internacionais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 1997 - 2003

  Complexity of Discrete Structures, Descrição: Combinatorial optimization, polyhedral methods, graph algorithms, computational biology, combinatorics on words, matroids, complexity theory, probabilistic methods, Ramsey theory, extremal problems for graphs and hypergraphs, computational geometry.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / Cristina Gomes Fernandes - Integrante / Carlos Eduardo Ferreira - Integrante / Yoshiko Wakabayashi - Integrante / João Meidanis - Integrante / Yoshiharu Kahayakawa - Coordenador / Sostenes Lins - Integrante / Claudio Leonardo Lucchesi - Integrante / Celina M. H. Figueiredo - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

Projetos de desenvolvimento

• 2001 - 2004

  PROGENE - Programa Genoma Nordeste (Coordenação Geral e Coordenação de Bio-informática) - Financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP., Descrição: Teve um financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP, e cujo objetivo era primordialmente alavançar a pesquisa em Bio-informática na Região Nordeste. Este projeto teve a coordenação de DNA por Paulo Andrade (Depto. Genética / UFPE) e a participação de um grande número de pesquisadores de toda a região Nordeste.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2003

  BIpósG - Aplicações de Bio-informática com Alta Demanda por CPU´s em Era Pós-genoma, Descrição: Criação de um ambiente de Analise de sequencias biologicas, predição de estruturas e acoplamento de proteinas, desenvolvimento do STING DB.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / NESIC, Goran - Coordenador / Ana Teresa Vasconcelos - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2002

  SUCEST - Sugar Cane EST, coordenado por Paulo Arruda (UNICAMP, Campinas, SP), e financiado por uma cooperação FAPESP/FACEPE., Situação: Desativado; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / João Meidanis - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Cooperação.

• 2000 - 2001

  BioLab - Laboratório de Pesquisa em Bio-Informática da UFPE (Coordenação), Descrição: Este projeto focou no estabelecimento de um laboratório de serviços e pesquisa em Bio-informática, tendo levado ao desenvolvimento de vários serviços via internet (http://biolab.cin.ufpe.br/services.htm) e ferramentas para análise e processamento de cadeias (http://biolab.cin.ufpe.br/tools/).. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa.

• 2001 - 2004

  PROGENE - Programa Genoma Nordeste (Coordenação Geral e Coordenação de Bio-informática) - Financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP., Descrição: Teve um financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP, e cujo objetivo era primordialmente alavançar a pesquisa em Bio-informática na Região Nordeste. Este projeto teve a coordenação de DNA por Paulo Andrade (Depto. Genética / UFPE) e a participação de um grande número de pesquisadores de toda a região Nordeste.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2003

  BIpósG - Aplicações de Bio-informática com Alta Demanda por CPU´s em Era Pós-genoma, Descrição: Criação de um ambiente de Analise de sequencias biologicas, predição de estruturas e acoplamento de proteinas, desenvolvimento do STING DB.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / NESIC, Goran - Coordenador / Ana Teresa Vasconcelos - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2002

  SUCEST - Sugar Cane EST, coordenado por Paulo Arruda (UNICAMP, Campinas, SP), e financiado por uma cooperação FAPESP/FACEPE., Situação: Desativado; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / João Meidanis - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Cooperação.

• 2000 - 2001

  BioLab - Laboratório de Pesquisa em Bio-Informática da UFPE (Coordenação), Descrição: Este projeto focou no estabelecimento de um laboratório de serviços e pesquisa em Bio-informática, tendo levado ao desenvolvimento de vários serviços via internet (http://biolab.cin.ufpe.br/services.htm) e ferramentas para análise e processamento de cadeias (http://biolab.cin.ufpe.br/tools/).. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa.

• 2001 - 2004

  PROGENE - Programa Genoma Nordeste (Coordenação Geral e Coordenação de Bio-informática) - Financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP., Descrição: Teve um financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP, e cujo objetivo era primordialmente alavançar a pesquisa em Bio-informática na Região Nordeste. Este projeto teve a coordenação de DNA por Paulo Andrade (Depto. Genética / UFPE) e a participação de um grande número de pesquisadores de toda a região Nordeste.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2003

  BIpósG - Aplicações de Bio-informática com Alta Demanda por CPU´s em Era Pós-genoma, Descrição: Criação de um ambiente de Analise de sequencias biologicas, predição de estruturas e acoplamento de proteinas, desenvolvimento do STING DB.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / NESIC, Goran - Coordenador / Ana Teresa Vasconcelos - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2002

  SUCEST - Sugar Cane EST, coordenado por Paulo Arruda (UNICAMP, Campinas, SP), e financiado por uma cooperação FAPESP/FACEPE., Situação: Desativado; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / João Meidanis - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Cooperação.

• 2000 - 2001

  BioLab - Laboratório de Pesquisa em Bio-Informática da UFPE (Coordenação), Descrição: Este projeto focou no estabelecimento de um laboratório de serviços e pesquisa em Bio-informática, tendo levado ao desenvolvimento de vários serviços via internet (http://biolab.cin.ufpe.br/services.htm) e ferramentas para análise e processamento de cadeias (http://biolab.cin.ufpe.br/tools/).. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa.

• 2001 - 2004

  PROGENE - Programa Genoma Nordeste (Coordenação Geral e Coordenação de Bio-informática) - Financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP., Descrição: Teve um financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP, e cujo objetivo era primordialmente alavançar a pesquisa em Bio-informática na Região Nordeste. Este projeto teve a coordenação de DNA por Paulo Andrade (Depto. Genética / UFPE) e a participação de um grande número de pesquisadores de toda a região Nordeste.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2003

  BIpósG - Aplicações de Bio-informática com Alta Demanda por CPU´s em Era Pós-genoma, Descrição: Criação de um ambiente de Analise de sequencias biologicas, predição de estruturas e acoplamento de proteinas, desenvolvimento do STING DB.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / NESIC, Goran - Coordenador / Ana Teresa Vasconcelos - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2002

  SUCEST - Sugar Cane EST, coordenado por Paulo Arruda (UNICAMP, Campinas, SP), e financiado por uma cooperação FAPESP/FACEPE., Situação: Desativado; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / João Meidanis - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Cooperação / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação.

• 2000 - 2001

  BioLab - Laboratório de Pesquisa em Bio-Informática da UFPE (Coordenação), Descrição: Este projeto focou no estabelecimento de um laboratório de serviços e pesquisa em Bio-informática, tendo levado ao desenvolvimento de vários serviços via internet (http://biolab.cin.ufpe.br/services.htm) e ferramentas para análise e processamento de cadeias (http://biolab.cin.ufpe.br/tools/).. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2004

  PROGENE - Programa Genoma Nordeste (Coordenação Geral e Coordenação de Bio-informática) - Financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP., Descrição: Teve um financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP, e cujo objetivo era primordialmente alavançar a pesquisa em Bio-informática na Região Nordeste. Este projeto teve a coordenação de DNA por Paulo Andrade (Depto. Genética / UFPE) e a participação de um grande número de pesquisadores de toda a região Nordeste.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2003

  BIpósG - Aplicações de Bio-informática com Alta Demanda por CPU´s em Era Pós-genoma, Descrição: Criação de um ambiente de Analise de sequencias biologicas, predição de estruturas e acoplamento de proteinas, desenvolvimento do STING DB.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / NESIC, Goran - Coordenador / Ana Teresa Vasconcelos - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2002

  SUCEST - Sugar Cane EST, coordenado por Paulo Arruda (UNICAMP, Campinas, SP), e financiado por uma cooperação FAPESP/FACEPE., Situação: Desativado; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / João Meidanis - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Cooperação / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação.

• 2000 - 2001

  BioLab - Laboratório de Pesquisa em Bio-Informática da UFPE (Coordenação), Descrição: Este projeto focou no estabelecimento de um laboratório de serviços e pesquisa em Bio-informática, tendo levado ao desenvolvimento de vários serviços via internet (http://biolab.cin.ufpe.br/services.htm) e ferramentas para análise e processamento de cadeias (http://biolab.cin.ufpe.br/tools/).. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2004

  PROGENE - Programa Genoma Nordeste (Coordenação Geral e Coordenação de Bio-informática) - Financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP., Descrição: Teve um financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP, e cujo objetivo era primordialmente alavançar a pesquisa em Bio-informática na Região Nordeste. Este projeto teve a coordenação de DNA por Paulo Andrade (Depto. Genética / UFPE) e a participação de um grande número de pesquisadores de toda a região Nordeste.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2003

  BIpósG - Aplicações de Bio-informática com Alta Demanda por CPU´s em Era Pós-genoma, Descrição: Criação de um ambiente de Analise de sequencias biologicas, predição de estruturas e acoplamento de proteinas, desenvolvimento do STING DB.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / NESIC, Goran - Coordenador / Ana Teresa Vasconcelos - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2002

  SUCEST - Sugar Cane EST, coordenado por Paulo Arruda (UNICAMP, Campinas, SP), e financiado por uma cooperação FAPESP/FACEPE., Situação: Desativado; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / João Meidanis - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Cooperação.

• 2000 - 2001

  BioLab - Laboratório de Pesquisa em Bio-Informática da UFPE (Coordenação), Descrição: Este projeto focou no estabelecimento de um laboratório de serviços e pesquisa em Bio-informática, tendo levado ao desenvolvimento de vários serviços via internet (http://biolab.cin.ufpe.br/services.htm) e ferramentas para análise e processamento de cadeias (http://biolab.cin.ufpe.br/tools/).. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2004

  PROGENE - Programa Genoma Nordeste (Coordenação Geral e Coordenação de Bio-informática) - Financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP., Descrição: Teve um financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP, e cujo objetivo era primordialmente alavançar a pesquisa em Bio-informática na Região Nordeste. Este projeto teve a coordenação de DNA por Paulo Andrade (Depto. Genética / UFPE) e a participação de um grande número de pesquisadores de toda a região Nordeste.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2003

  BIpósG - Aplicações de Bio-informática com Alta Demanda por CPU´s em Era Pós-genoma, Descrição: Criação de um ambiente de Analise de sequencias biologicas, predição de estruturas e acoplamento de proteinas, desenvolvimento do STING DB.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / NESIC, Goran - Coordenador / Ana Teresa Vasconcelos - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2002

  SUCEST - Sugar Cane EST, coordenado por Paulo Arruda (UNICAMP, Campinas, SP), e financiado por uma cooperação FAPESP/FACEPE., Situação: Desativado; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / João Meidanis - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Cooperação / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação.

• 2000 - 2001

  BioLab - Laboratório de Pesquisa em Bio-Informática da UFPE (Coordenação), Descrição: Este projeto focou no estabelecimento de um laboratório de serviços e pesquisa em Bio-informática, tendo levado ao desenvolvimento de vários serviços via internet (http://biolab.cin.ufpe.br/services.htm) e ferramentas para análise e processamento de cadeias (http://biolab.cin.ufpe.br/tools/).. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2004

  PROGENE - Programa Genoma Nordeste (Coordenação Geral e Coordenação de Bio-informática) - Financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP., Descrição: Teve um financiamento de R$1.455.000,00 pelo CNPq/FINEP, e cujo objetivo era primordialmente alavançar a pesquisa em Bio-informática na Região Nordeste. Este projeto teve a coordenação de DNA por Paulo Andrade (Depto. Genética / UFPE) e a participação de um grande número de pesquisadores de toda a região Nordeste.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2003

  BIpósG - Aplicações de Bio-informática com Alta Demanda por CPU´s em Era Pós-genoma, Descrição: Criação de um ambiente de Analise de sequencias biologicas, predição de estruturas e acoplamento de proteinas, desenvolvimento do STING DB.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / NESIC, Goran - Coordenador / Ana Teresa Vasconcelos - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

• 2000 - 2002

  SUCEST - Sugar Cane EST, coordenado por Paulo Arruda (UNICAMP, Campinas, SP), e financiado por uma cooperação FAPESP/FACEPE., Situação: Desativado; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Integrante / João Meidanis - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Cooperação / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação.

• 2000 - 2001

  BioLab - Laboratório de Pesquisa em Bio-Informática da UFPE (Coordenação), Descrição: Este projeto focou no estabelecimento de um laboratório de serviços e pesquisa em Bio-informática, tendo levado ao desenvolvimento de vários serviços via internet (http://biolab.cin.ufpe.br/services.htm) e ferramentas para análise e processamento de cadeias (http://biolab.cin.ufpe.br/tools/).. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Katia Silva Guimarães - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa.

Prêmios