Dyoni Matias de Oliveira

Pós-doutorado

Formação complementar

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Produções bibliográficas

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• OLIVEIRA, D. M. ; FINGER-TEIXEIRA, A. ; ALMEIDA, R. F. ; SQUINA, F. M. ; FERRARESE-FILHO, O. ; dos SANTOS, W. D. . Ação sinérgica entre feruloil esterase e xilanase na digestibilidade do bagaço de cana-de-açúcar. In: I Semana da Bioquímica, 2012, Maringá. Anais da Semana da Bioquímica, 2012.

• OLIVEIRA, J. P. ; OLIVEIRA, D. M. ; ALMEIDA, R. F. ; SEGATO, F. ; SQUINA, F. M. ; DAMÁSIO, A. R. . Aspergillus nidulans como modelo para expressão heteróloga de celulases e hemicelulases. In: 22º Reunião Anual dos Usuários do Laboratório Naciolnal de Luz Síncrotron/CNPEM, 2012, Campinas. Anais do RAU, 2012. p. 247-247.

• MOTA, T. R. ; OLIVEIRA, D. M. ; INADA, P. . Reutilização da água dos aparelhos de ar condicionado em uma escola de ensino médio no município de Umuarama-PR. In: VII Encontro Internacional de Produção Científica, 2011. Anais Eletrônicos, 2011.

• OLIVEIRA, D. M. ; FINGER-TEIXEIRA, A. ; FERRO, A. P. ; dos SANTOS, W. D. ; FERRARESE-FILHO, O. . Seleção de inibidores químicos específicos da enzima Coniferaldeído Desidrogenase. In: VII Encontro Internacional de Produção Científica, 2011. Anais Eletrônicos, 2011.

• OLIVEIRA, D. M. ; MOTA, T. R. ; SOARES, A.A. ; PERALTA, R.M. ; GOMES-DA-COSTA, S.M. . Utilização de sucos vegetais para a produção de biomassa de cogumelos funcionais. In: XII Encontro Maringaense de Biologia ? XXV Semana da Biologia, 2010, Maringá. XII Encontro Maringaense de Biologia ? XXV Semana da Biologia, 2010.

• OLIVEIRA, D. M. . Depletion of lignin p-coumaroylation affects phenolic metabolism and lignin depolymerization efficiency in maize. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, D. M. . Os Três Mosqueteiros da Biologia de Sistemas para a Descoberta de Genes: Redes de Co-expressão, CRISPR/Cas9 e Metabolômica. 2023. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Oliveira, D.M. . Salt stress modulates the dynamics, structure and architecture of plant cell walls. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, D. M. ; MOTA, T. R. ; SINZKER, R. C. ; SALATTA, F. V. ; FERRARESE-FILHO, O. ; dos SANTOS, W. D. . Salt stress modulates the lignin metabolism and feruloylation in maize. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, D. M. ; OLIVEIRA, J. P. ; ALMEIDA, R. F. ; DIAS, B. A. ; DAMÁSIO, A. R. ; SQUINA, F. M. ; SEGATO, F. . Expressão heteróloga de hidrolases fúngicas com potencial biotecnológico na sacarificação de biomassa de cana-de-açúcar. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• OLIVEIRA, D. M. ; DIAS, B. A. ; MURAKAMI, M. T. ; SQUINA, F. M. ; SEGATO, F. . Caracterização Bioquímica de uma Endoglucanase (GH 12) de Aspergillus terreus. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• DIAS, B. A. ; SEGATO, F. ; SOUZA, T. A. C. B ; DAMÁSIO, A. R. ; ALMEIDA, R. F. ; CITADINI, A. P. S. ; OLIVEIRA, D. M. ; MURAKAMI, M. T. ; GOMES, E ; SQUINA, F. M. . Structural and functional analysis of a GH12 from Aspergillus terreus. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• OLIVEIRA, D. M. ; FINGER-TEIXEIRA, A. ; FERRO, A. P. ; dos SANTOS, W. D. ; FERRARESE-FILHO, O. . Seleção de inibidores químicos específicos da enzima Coniferaldeído Desidrogenase. 2011. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• ANTONIASSI, H ; MOTA, T. R. ; OLIVEIRA, D. M. ; INADA, P. . Utilização da água coletada das unidades condensadoras dos aparelhos de ar condicionado para finalidades diversas, em uma escola particular no município de Umuarama-Paraná. 2011. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2025 - Atual

  Explorando novos aspectos do metabolismo de lignina em gramíneas utilizando edição gênica e análises ômicas, Descrição: Biomassa lignocelulósica é uma alternativa sustentável e renovável aos derivados de petróleo, podendo ser processada em açúcares simples e compostos aromáticos que são transformados em bioetanol e outros bioprodutos. O polímero aromático lignina, presente nas paredes secundárias que compõem a biomassa lignocelulósica, representa um desafio para a conversão eficiente da biomassa. Por isso, o metabolismo da lignina tem sido intensamente estudado, gerando conhecimentos fundamentais para o desenvolvimento de estratégias de manipulação genética com o objetivo de produzir biomassa otimizada para a bioeconomia. Análises de co-expressão gênica em larga escala utilizando conjuntos de dados públicos de transcriptômica de milho resultaram resultaram na descoberta de famílias gênicas envolvidas no metabolismo de lignina. Essas famílias gênicas estão presentes em genomas de diversas gramíneas, mas não em eudicotiledôneas. Portanto, o objetivo principal deste projeto é aprofundar a compreensão de novos aspectos específicos do metabolismo da lignina em gramíneas, utilizando milho como planta-modelo. Proponho integrar edição gênica via multiplex CRISPR para editar múltiplos genes, seguida de fenotipagem multi-nível, incluindo análises metabolômicas, composição da parede celular e sacarificação da biomassa. Os resultados desse projeto contribuirão para o entendimento do metabolismo da lignina em gramíneas e poderão impulsionar o desenvolvimento de estratégias de engenharia genética para melhorar a processabilidade da biomassa vegetal, promovendo inovações na bioeconomia.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Dyoni Matias de Oliveira - Coordenador / MOTA, THATIANE R. - Integrante / Carlos Labate - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2020 - 2025

  Identification of new genes in phenolic metabolism via CRISPR/Cas9-mediated genome engineering and metabolite identification by state-of-the-art mass spectrometry-based techniques, Descrição: When improving plant cell walls, it all comes down to identifying the genes that are involved in the biosynthesis of the major cell wall polymers, and altering their expression levels in target crops such as poplar and maize. From co-expression data sets, we have identified a set of candidate genes that likely play an important role in phenolic biosynthesis. We have already demonstrated the role of some of these in lignin biosynthesis (Vanholme et al., 2012; 2013; Sundin et al., 2014). Our expertise in comparative metabolite profiling and mass spectrometry is a great asset to help elucidating their function. The potential for applications of these genes is investigated by analysing the biomass composition and saccharification potential of the corresponding mutants, and by translating this research to maize and poplar. Double mutants are made to test for additive or synergistic effects.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Dyoni Matias de Oliveira - Integrante / Thatiane Rodrigues Mota - Integrante / Wout Boerjan - Coordenador / Ruben Vanholme - Integrante.

• 2019 - 2020

  Impact of salt stress in the composition of polysaccharides and architecture of maize cell walls, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (4) . , Integrantes: Dyoni Matias de Oliveira - Coordenador / Thatiane Rodrigues Mota - Integrante / Leonardo D. Gomez - Integrante / Simon J. McQueen-Mason - Integrante., Financiador(es): University of York - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

• 2016 - 2020

  Efeitos do estresse salino no metabolismo da parede celular de milho, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Dyoni Matias de Oliveira - Coordenador / Thatiane Rodrigues Mota - Integrante / Osvaldo Ferrarese-Filho - Integrante / Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Renata C. Sinzker - Integrante / Fábio Vieira Salatta - Integrante., Número de produções C, T & A: 5

• 2013 - 2014

  Expressão heteróloga de hidrolase e sacarificação da biomassade cana-de-açúcar, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Dyoni Matias de Oliveira - Coordenador / Aline Finger Teixeira - Integrante / Osvaldo Ferrarese-Filho - Integrante / Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Cristiane Bortolato da Silva - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2012 - 2013

  Determinação da atividade enzimática e prospecção de inibidores químicos da Ácido Cafeico 3-O-metiltransferase (COMT) em milho e cana-de-açúcar, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Dyoni Matias de Oliveira - Integrante / Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Angela Valderrama Parizotto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2012 - 2012

  Expressão heteróloga de hidrolase fúngica com potencial biotecnológico na sacarificação de biomassa de cana-de-açúcar, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Dyoni Matias de Oliveira - Integrante / Fernando Segato - Coordenador., Número de produções C, T & A: 1

• 2011 - 2013

  Prospecção de inibidores enzimáticos da via de fenilpropanóides visando a redução da recalcitrância da biomassa lignocelulósica para a produção de etanol celulósico, Descrição: No Brasil, estudos recentes indicam o uso do bagaço da cana-de-açúcar como fonte de biomassa para a produção de etanol celulósico. Todavia, um dos problemas existentes é a recalcitrância desta biomassa, que contém apreciável quantidade de lignina. Neste sentido, possíveis modificações na estrutura e nos conteúdos de lignina e de ácidos hidroxicinâmicos podem aumentar a digestibilidade da biomassa lignocelulósica. Usando aleloquímicos e inibidores das enzimas da via dos fenilpropanoides, nosso laboratório tem obtido resultados que fortalecem esta hipótese. Embora apresentem resultados promissores, alguns compostos disponíveis agem nas primeiras enzimas da via mteabólica, tendo provavelmente sua eficácia limitada pelos efeitos adversos impostos à ela. Neste projeto, propomos a prospecção de compostos capazes de tornar a biomassa mais acessível à hidrólise. Para isso, o desenvolvimento do projeto terá como lastro três fases: in silico, in vitro e in vivo. Primeiramente, recorremos às ferramentas da bioinformática para realizarmos a varredura virtual dos putativos inibidores enzimáticos a partir da estrutura tridimensional de enzimas da via de fenilpropanóides. A sequência dos genes das enzimas, descritas na literatura, serão utilizadas diretamente ou empregadas para identificar as sequências ortologas das plantas de cana-de-açúcar e de milho nos bancos de dados MaizeGDB, SUCEST. A sequência dos genes das enzimas-chave, serão traduzidas e depois confirmadas por BLAST contra as seqüências depositadas no servidor Uniprot. As estruturas 3D serão obtidas por modelagem por homologia utilizando como molde as estruturas 3D de proteínas das mesmas famílias depositadas no Protein Data Bank. A modelagem será realizada por meio do software Modeller com protocolo otimizado por Simulate Annealing. Os modelos gerados terão sua qualidade estereoquimica avaliada por meio do programa Procheck e os contatos intramoleculares determinados com os programas Contact e Act. A varred. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Dyoni Matias de Oliveira - Integrante / Aline Finger Teixeira - Integrante / Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Wanderley Dantas dos Santos - Integrante / Ana Paula Ferro - Integrante / Maria de Lourdes Lúcio Ferrarese - Integrante / Victor Hugo Salvador - Integrante / Angela Valderrama Parizotto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2012

  Estabelecimento de um protocolo para determinação da atividade da Coniferaldeído Desidrogenase em diferentes plantas de interesse econômico, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Dyoni Matias de Oliveira - Integrante / Aline Finger Teixeira - Integrante / Osvaldo Ferrarese-Filho - Coordenador / Wanderley Dantas dos Santos - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

Prêmios