Diego César Batista Mariano

Residente pós-doutoral no Laboratório de Bioinformática e Sistemas da UFMG. Editor-in-chief na Revista BIOINFO e Guest Associate Editor na Frontiers in Bioinformatics. Vice-coordenador da rede bioinfo.com. Revisor em diversos periódicos internacionais, como PlosOne, NAR Genomics and Bioinformatics, Bioinformatics (Oxford), dentre outros. Mestre e doutor pelo Programa de Pós-graduação em Bioinformática da UFMG. Mestre em Ciência da Computação também pela UFMG. Vencedor do prêmio UFMG de teses e do Prêmio Nacional de Teses da AB3C em 2020. Tem experiência no desenvolvimento de aplicações web, inteligência artificial, visualização de dados e manipulação de bases de dados biológicas.

Informações coletadas do Lattes em 08/06/2026

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioinformática

2015 - 2019

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Uso de assinaturas estruturais para proposta de mutações em enzimas β-glicosidase usadas na produção de biocombustíveis
Raquel Cardoso de Melo Minardi. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Bioinformática; Visualização de dados biológicos; biocombustíveis.

Mestrado em Ciências da Computação

2023 - 2024

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: SIGNA: uma biblioteca open-source para manipulação de assinaturas estruturais de biomoléculas baseadas em grafos, Ano de Obtenção: 2024
Raquel Cardoso de Melo Minardi.

Mestrado em Bioinformática

2013 - 2015

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: SIMBA: uma ferramenta Web para gerenciamento de montagens de genomas bacterianos
, Ano de Obtenção: 2015.Vasco Ariston de Carvalho Azevedo.Coorientador: Rommel Thiago Jucá Ramos. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Bioinformática; Genômica; Sistemas Web; Montagem.

Graduação em Sistemas de Informação

2009 - 2012

FACULDADE ANHANGUERA DE BELO HORIZONTE
Título: Comparando o desempenho de bancos de dados Nosql e relacionais manipulando dados biológicos
Orientador: Sandro Renato Dias
Bolsista do(a): Programa Universidade para Todos, PROUNI, Brasil.

Curso técnico/profissionalizante em Data Science

2018 - 2019

Harvard University (HarvardX)

Curso técnico/profissionalizante em Aprendizagem Industrial Gráfica

2010 - 2010

SENAI - Departamento Regional de Minas Gerais

Curso técnico/profissionalizante em Redes computacionais

2008 - 2010

Serviço Nacional de Aprendizagem Comercial - SENAC Minas
Bolsista do(a): Secretaria de Estado de Educação de Minas Gerais, SEEMG, Brasil.

Pós-doutorado

2025

Pós-Doutorado. , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: INTELIGÊNCIA ARTIFICIAL.

2020 - 2024

Pós-Doutorado. , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.

2019 - 2020

Formação complementar

2020 - 2020

Focus on Peer Review. (Carga horária: 4h). , Nature Research, NATURE, Inglaterra.

2019 - 2019

Data Science: Linear Regression. (Carga horária: 16h). , Harvard University (HarvardX), HARVARDX, Estados Unidos.

2019 - 2019

Data Science: Productivity Tools. (Carga horária: 16h). , Harvard University (HarvardX), HARVARDX, Estados Unidos.

2019 - 2019

Data Science: Wrangling. (Carga horária: 16h). , Harvard University (HarvardX), HARVARDX, Estados Unidos.

2019 - 2019

Data Science: Inference and Modeling. (Carga horária: 16h). , Harvard University (HarvardX), HARVARDX, Estados Unidos.

2019 - 2019

Data Science: Machine Learning. (Carga horária: 16h). , Harvard University (HarvardX), HARVARDX, Estados Unidos.

2019 - 2019

Data Science: Probability. (Carga horária: 16h). , Harvard University (HarvardX), HARVARDX, Estados Unidos.

2019 - 2019

Data Science: Capstone. (Carga horária: 40h). , Harvard University (HarvardX), HARVARDX, Estados Unidos.

2018 - 2018

Data Science: Visualization. (Carga horária: 16h). , Harvard University (HarvardX), HARVARDX, Estados Unidos.

2018 - 2018

Data Science: R Basics. (Carga horária: 16h). , Harvard University (HarvardX), HARVARDX, Estados Unidos.

2018 - 2018

Intro to Python for Data Science. (Carga horária: 4h). , DataCamp, DATACAMP, Estados Unidos.

2018 - 2018

Using Python for Research. (Carga horária: 4h). , DataCamp, DATACAMP, Estados Unidos.

2017 - 2017

Extensão universitária em Laboratório de Criação de Materiais Didáticos para EaD. (Carga horária: 60h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2017 - 2017

Módulo teórico do Curso de Verão de Engenharia de Máquinas Biológicas. (Carga horária: 12h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2017 - 2017

Introdução a Modelagem Matemática. (Carga horária: 15h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2014 - 2017

Extensão universitária em Língua Inglesa. (Carga horária: 420h). , Centro Acadêmico de Ciências Sociais (FAFICH, UFMG), CACS, Brasil.

2016 - 2016

Extensão universitária em Língua Francesa. (Carga horária: 60h). , Centro Acadêmico de Ciências Sociais (FAFICH, UFMG), CACS, Brasil.

2015 - 2015

Extensão universitária em Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos. (Carga horária: 16h). , Universidade Federal do Rio Grande, FURG, Brasil.

2014 - 2014

Extensão universitária em PATRIC: estudo de sistemas patogênicos. (Carga horária: 15h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2014 - 2014

Extensão universitária em Anotação avançada de sequências com EGene2. (Carga horária: 15h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2013 - 2013

Extensão universitária em Lengua Española. (Carga horária: 30h). , Universidad de Salamanca, USAL, Espanha.

2013 - 2013

Extensão universitária em Conversación y Redacción. (Carga horária: 15h). , Universidad de Salamanca, USAL, Espanha.

2013 - 2013

Bioinformática Estrutural e Análises de Proteoma. (Carga horária: 90h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2012 - 2012

Dell layered security solutions. , Dell Training Centre, DELL, Brasil.

2012 - 2012

Uso do Google para visualizar dados geográficos. (Carga horária: 4h). , Universidade Federal de Lavras, UFLA, Brasil.

2012 - 2012

Cloud computing. , Dell Training Centre, DELL, Brasil.

2008 - 2008

Extensão universitária em Infra-estrutura de TI (S2B Microsoft). (Carga horária: 84h). , Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, PUC Minas, Brasil.

2005 - 2006

Hardware - Montagem e Manutenção de computadores. (Carga horária: 72h). , Microlins, MICROLINS, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Francês

Lê Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Programação para Web.

Organização de eventos

SILVA, A. L. ; ABREU, A. P. ; MARIANO, D. C. B. ; SILVA, F. F. ; LAGE, F. S. D. ; QUINTANILHA, G. ; HILARIO, H. O. ; QUEIROZ, L. R. ; TOLEDO, N. E. ; TAVARES, R. ; KATO, R. B. ; SANTOS, R. G. ; SOARES, S. ; GOES, W. ; NOGUEIRA, W. G. . IV Curso de Verão em Bioinformática da UFMG. 2020. (Outro).

MARIANO, D. C. B. . Infratec - Feira de Tecnologia do Senac Minas. 2010. (Festival).

Participação em eventos

13th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C),. A new method based on structural signatures to propose mutations for enzymes beta-glucosidase used in biofuel production. 2017. (Congresso).

2nd Brazilian Student Council Symposium.A new method based on structural signatures to propose mutations for enzymes beta-glucosidase used in biofuel production. 2017. (Simpósio).

III Curso de Verão de Engenharia de Máquinas Biológicas. 2017. (Seminário).

I Semana de Engenharia, Tecnologia e Computação.Programação web com PHP. 2016. (Seminário).

RSG Brazil - 1st Student Council Symposium. 2016. (Simpósio).

X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C. Structural pattern detection for engineering more efficient enzymes for second-generation biofuel production. 2016. (Congresso).

X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinormatics. Data visualization for sequence comparison. 2015. (Congresso).

InWeb - CETIC Workshop sobre Visualização de Dados e Informações.Uso da visualização de dados como elemento transformador na etapa de scaffolding dos processos de montagem de genomas procariotos através do software KION.. 2014. (Oficina).

ISCB - Latin American X-Meeting on Bioinformatics with BSB & SoiBio. SIMBA: A Web Tool for Complete Assembly of Bacterial Genomes. 2014. (Congresso).

Latin American Council Symposium.SIMBA: a simple way to make complete assemblies of bacterial genomes. 2014. (Simpósio).

Terceira Escola de Verão em Computação do Departamento de Ciência da Computação da Universidade Federal de Minas Gerais,. 2014. (Oficina).

59º Congresso Brasileiro de Genética. Phylogenetic inference of bacterial evolutionary relationship from the analysis of genomic signature using singular value decomposition (SVD). 2013. (Congresso).

Microbiota: the bacteria that govern us. 2013. (Simpósio).

Programa TOP Espanha 2013 Santander Universidades. 2013. (Outra).

X-meeting BSB 2013. 2013. (Simpósio).

Feira do empreendedor SEBRAE. 2012. (Outra).

XII Congresso de Iniciação Científica da FACECA. Sistema para formatação e gerenciamento de referências bibliográficas. 2012. (Congresso).

XXI Congresso de Pós-graduação da UFLA. Comparando o desempenho de bancos de dados Nosql e relacionais manipulando dados biológicos. 2012. (Congresso).

Infratec - Feira de tecnologia do Senac Minas.Redes Wireless. 2010. (Outra).

Microsoft TechNet. 2010. (Encontro).

INFORUSO. 2009. (Outra).

OBMEP - Olimpíada brasileira de matemática. 2006. (Olimpíada).

OBA - Olimpíada Brasileira de Astronomia. 2004. (Olimpíada).

Orientou

Luana Luiza Bastos

RNApedia: Uma base de dados de interações proteína-RNA; Início: 2024; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Coorientador);

Frederico Chaves Carvalho

EvoPepFold: A Hybrid Evolutionary and Structural Pipeline for AI-Guided Peptide Inhibitor Design Using AlphaFold and Rosetta; Início: 2021; Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Coorientador);

Alessandra Cioletti

CSONAX: Uma Nova Representação Vetorial para Moléculas e sua Aplicação na Identificação de Moduladores Epigenéticos associados ao TEA; 2026; Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, ; Coorientador: Diego César Batista Mariano;

Naiara Pantuza

Modelos e algoritmos para proposta de mutações em proteínas: β-glicosidases como estudo de caso; 2017; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, ; Coorientador: Diego César Batista Mariano;

Pedro Magalhães Martins

Propedia: uma base de dados de complexos proteína-peptídeo não redundante baseada em agrupamentos híbridos; 2020; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, ; Coorientador: Diego César Batista Mariano;

Thiago Da Silva Correia

Classificação de famílias de proteínas usando decomposição em valores singulares: enzima beta-glicosidase como estudo de caso; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Matemática Computacional) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Diego César Batista Mariano;

Produções bibliográficas

SANTOS, LUCAS MORAES DOS ; MOURA JUNIOR, ADENILSON ARCANJO DE ; Bastos, Luana Luiza ; MARIANO, DIEGO ; ABURJAILE, FLAVIA FIGUEIRA ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO . Editorial BIOINFO #06 - Bioinformática 2035: Desafios e Formação de Talentos para a Próxima Década. BIOINFO , v. 6, p. 00, 2026.
RAMOS, LAÍS GOMES ; de Abreu, Ana Paula ; SANTOS, ANA LUIZA DE CASTRO ; PAULARIE, MARIA ALICE ; ARAUJO, SHEILA CRUZ ; MARIANO, DIEGO ; Carvalho, Frederico Chaves ; GUIMARÃES, LAYS CORDEIRO ; FRANÇA DE LIMA, LEONARDO HENRIQUE ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO ; LULA, IVANA ; JORIO, ADO ; GUIMARÃES, PEDRO PIRES GOULART . Structural and Dynamic Investigation of Wnt Inhibitor Complexes with Sulfobutyl Ether-β-Cyclodextrin Using Experimental and Computational Approaches. JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE , v. 1, p. 145692, 2026.
Puça, Maria Carolina ; MARIANO, DIEGO ; SALAZAR, YANKA ; CARDOSO DE MELO-MINARDI, RAQUEL ; NOBREGA DE SOUSA, TAIS . Haplo2D6: A Web-Based Tool for Automated Haplotype and Phenotype Inference. Bioinformatics Advances , v. vbag13, p. vbag136, 2026.
COSTA, HELENA LOTT ; MARIANO, DIEGO ; LEMOS, RAFAEL PEREIRA ; COUTINHO, TARCÍSIO JOSÉ DOMINGOS ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO . The code of life: a pilot bioinformatics curriculum for Brazilian high schools. Frontiers In Education , v. 11, p. 1666709, 2026.
LEMOS, RAFAEL PEREIRA ; MARIANO, DIEGO ; SILVEIRA, SABRINA DE AZEVEDO ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. . COCαDA - a fast and scalable algorithm for interatomic contact detection in proteins using Cα distance matrices. Frontiers In Bioinformatics , v. 5, p. 1630078, 2025.
MARIANO, DIEGO . A Machine Learning Approach for the Prediction of Thermostable β-Glucosidases. Applied Sciences-Basel , v. 15, p. 4839, 2025.
MARIANO, DIEGO . Editorial BIOINFO #05: perspectivas sobre o uso de inteligência artificial na escrita acadêmica. BIOINFO , v. 5, p. 00, 2025.
CHAVES CARVALHO, FREDERICO ; MARIANO, DIEGO ; BASTOS, LUANA ; de Abreu, Ana Paula ; LEMOS, RAFAEL PEREIRA ; ARAÚJO, SHEILA CRUZ ; DOS SANTOS, LUCAS MORAES ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO . A hybrid evolutionary and structural method for AI-guided peptide inhibitor design using AlphaFold and Rosetta. Scientific Reports , v. 15, p. 44519, 2025.
de Abreu, Ana Paula ; Carvalho, Frederico Chaves ; MARIANO, DIEGO ; Bastos, Luana Luiza ; SILVA, JULIANA RODRIGUES PEREIRA ; DE OLIVEIRA, LEANDRO MORAIS ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. ; SABINO, ADRIANO DE PAULA . An Approach for Engineering Peptides for Competitive Inhibition of the SARS-COV-2 Spike Protein. MOLECULES , v. 29, p. 1577, 2024.
MARIANO, DIEGO ; Carvalho, Frederico Chaves ; Bastos, Luana Luiza ; SANTOS, L. M. ; Paixão, Vívian ; de MELO-MINARDI, R. C. . Bioinformatics and Computational Biology Research at the Computer Science Department at UFMG. Journal of Information and Data Management - JIDM , v. 15, p. 1, 2024.
Bastos, Luana Luiza ; MARIANO, DIEGO ; LEMOS, RAFAEL PEREIRA ; Bialves, Tatiane Senna ; OLIVEIRA, CARLO JOSE FREIRE ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. . The Role of Structural Bioinformatics in Understanding Tumor Necrosis Factor α-Interacting Protein Mechanisms in Chronic Inflammatory Diseases: A Review. Immuno , v. 4, p. 14-42, 2024.
Bialves, Tatiane Senna ; Bastos, Luana Luiza ; PARRA, JOHN ALEXANDERS AMAYA ; MOYSÉS, MAURÍCIO NOGUEIRA ; MARQUES, EDLEUSA ; DE CASTRO PIMENTA, ADRIANO MONTEIRO ; QUINTELA, FERNANDO MARQUES ; MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; Carvalho, Frederico Chaves ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. ; BOYLE, ROBERT TEW . Interaction of DisBa01 peptide from Bothrops alternatus venom with BRAF melanoma receptors: Modeling and molecular docking. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 274, p. 133283, 2024.
da Silva, Alessandra Lima ; MARIANO, DIEGO . Editorial - BIOINFO #04. BIOINFO , v. 4, p. 00, 2024.
ROCHA, RAFAEL EDUARDO OLIVEIRA ; MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; ALMEIDA, TIAGO SILVA ; CORRÊACOSTA, LEON SULFIERRY ; FISCHER, PEDRO HENRIQUE CAMARGO ; Santos, Lucianna Helene ; CAFFARENA, ERNESTO RAUL ; DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE ; LAMP, LEONIDA M. ; FERNANDEZ'QUINTERO, MONICA LISA ; LIEDL, KLAUS ROMAN ; DE MELO'MINARDI, RAQUEL CARDOSO ; DE LIMA, LEONARDO HENRIQUE FRANÇA . Thermostabilizing mechanisms of canonical single amino acid substitutions at a GH1 β-glucosidase probed by multiple MD and computational approaches. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS , v. 91, p. 218-236, 2023.
MARTINS, PEDRO ; MARIANO, DIEGO ; Carvalho, Frederico Chaves ; Bastos, Luana Luiza ; MORAES, LUCAS ; PAIXÃO, VIVIAN ; CARDOSO DE MELO-MINARDI, RAQUEL . Propedia v2.3: A novel representation approach for the peptide-protein interaction database using graph-based structural signatures. Frontiers in Bioinformatics , v. 3, p. 2023.1103103, 2023.
MARIANO, DIEGO ; DA FONSECA JÚNIOR, NELI JOSÉ ; Santos, Lucianna Helene ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO . Editorial: Bioinformatics in the age of data science: algorithms, methods, and tools applied from Omics to structural data. Frontiers in Bioinformatics , v. 3, p. 2023.1246859, 2023.
MARIANO, DIEGO . Editorial - BIOINFO #03. BIOINFO , v. 3, p. 00, 2023.
SANTOS, L. M. ; MARIANO, DIEGO ; de MELO-MINARDI, R. C. . O impacto da Inteligência artificial nas ciências da vida através da Bioinformática. Revista da UFMG , v. 30, p. e47996, 2023.
MARIANO, DIEGO ; Santos, Lucianna Helene ; MELEIRO, LUANA PARRAS ; DE LIMA, LEONARDO HENRIQUE FRANÇA ; MARINS, LUIS FERNANDO ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO . Using Computers to Improve Biofuel Production. Frontiers for Young Minds , v. 10, p. 20020333, 2022.
dos Santos, Vitor Pimentel ; RODRIGUES, ANDRÉ ; DUTRA, GABRIEL ; BASTOS, LUANA ; MARIANO, DIEGO ; MENDONÇA, JOSÉ GUTEMBERGUE ; LOBO, YAN JERÔNIMO GOMES ; MENDES, EDUARDO ; MAIA, GIOVANA ; MACHADO, KARINA DOS SANTOS ; WERHLI, ADRIANO VELASQUE ; ROCHA, GERD ; DE LIMA, LEONARDO HENRIQUE FRANÇA ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL . E-Volve: understanding the impact of mutations in SARS-CoV-2 variants spike protein on antibodies and ACE2 affinity through patterns of chemical interactions at protein interfaces. PeerJ , v. 10, p. e13099, 2022.
RODRIGUES, DANIEL RIBEIRO ; MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; SANTOS, LUCIANNA HELENE SILVA ; TAGLIATI, CARLOS ALBERTO . ToxAnalyzer: A user-friendly web tool for interactive data analysis and visualization of chemical compounds from the Comparative Toxicogenomics Database (CTD)-. Computational Toxicology , v. 19, p. 100170, 2021.
da Silva, Alessandra Lima ; ABREU, ANA PAULA DE ; MARIANO, DIEGO ; Caixeta, Felipe ; Santos, Fenícia Brito ; LAGE, FERNANDA STUSSI D. ; Quintanilha-Peixoto, Gabriel ; HILÁRIO, HERON. O. ; XAVIER, JOICYMARA. S. ; QUEIROZ, LUCIO. R. ; DE TOLEDO, NAYARA EVELIN ; TAVARES, RAPHAEL ; Kato, Rodrigo Bentes ; DOS SANTOS, ROSELANE GONÇALVES ; SOARES, STELLAMARIS ; GOES, WANESSA. M. ; NOGUEIRA, WYLERSON. G. ; BATISTA, THIAGO. M. ; ORTEGA, JOSÉ MIGUEL ; DE CARVALHO, VASCO ARISTON AZEVEDO ; et.al . From In-Person to the Online World: Insights Into Organizing Events in Bioinformatics. Frontiers In Bioinformatics , v. 1, p. 34, 2021.
BATISSOCO, ANA CARLA ; PEDROSO-CAMPOS, VINICIUS ; PARDONO, ELIETE ; SAMPAIO-SILVA, JULIANA ; SONODA, CINDY YUKIMI ; VIEIRA-SILVA, GLEICIELE ALICE ; DA SILVA DE OLIVEIRA LONGATI, ESTEFANY UCHOA ; MARIANO, DIEGO ; HOSHINO, ANA CRISTINA HIROMI ; TSUJI, ROBINSON KOJI ; JESUS-SANTOS, RAFAELA ; ABATH-NETO, OSÓRIO ; BENTO, RICARDO FERREIRA ; OITICICA, JEANNE ; LEZIROVITZ, KARINA . Molecular and genetic characterization of a large Brazilian cohort presenting hearing loss. Human Genetics , v. 1, p. 1, 2021.
MARIANO, DIEGO . Augmented reality applied to visualization of biological data. Academia Letters , v. 1, p. 3251, 2021.
MARTINS, PEDRO M. ; SANTOS, LUCIANNA H. ; MARIANO, DIEGO ; QUEIROZ, FELIPPE C. ; BASTOS, LUANA L. ; GOMES, ISABELA DE S. ; FISCHER, PEDRO H. C. ; ROCHA, RAFAEL E. O. ; SILVEIRA, SABRINA A. ; DE LIMA, LEONARDO H. F. ; DE MAGALHÃES, MARIANA T. Q. ; OLIVEIRA, MARIA G. A. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. . Propedia: a database for protein-peptide identification based on a hybrid clustering algorithm. BMC BIOINFORMATICS , v. 22, p. 1, 2021.
PIMENTEL, VITOR ; MARIANO, DIEGO ; CANTÃO, LETÍCIA XAVIER SILVA ; Bastos, Luana Luiza ; FISCHER, PEDRO ; DE LIMA, LEONARDO HENRIQUE FRANCA ; FASSIO, ALEXANDRE VICTOR ; MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO DE . VTR: A Web Tool for Identifying Analogous Contacts on Protein Structures and Their Complexes. Frontiers in Bioinformatics , v. 1, p. 730350, 2021.
DE LIMA, LEONARDO HENRIQUE FRANCA ; FERNANDEZ-QUINTÉRO, MONICA ; ROCHA, RAFAEL EDUARDO OLIVEIRA ; MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO ; LIEDL, KLAUS ROMAN . Conformational flexibility correlates with glucose tolerance for point mutations in β-glucosidases - A computational study. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics , v. 1, p. 1-20, 2020.
MARIANO, DIEGO ; PANTUZA, NAIARA ; SANTOS, LUCIANNA H. ; ROCHA, RAFAEL E. O. ; DE LIMA, LEONARDO H. F. ; BLEICHER, LUCAS ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO . Glutantβase: a database for improving the rational design of glucose-tolerant β-glucosidases. BMC Molecular and Cell Biology , v. 21, p. 50, 2020.
BARROSO, JOSÉ RENATO M. S. ; MARIANO, DIEGO ; DIAS, SANDRO R. ; ROCHA, RAFAEL E. O. ; SANTOS, LUCIANNA H. ; NAGEM, RONALDO A. P. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. . Proteus: An algorithm for proposing stabilizing mutation pairs based on interactions observed in known protein 3D structures. BMC BIOINFORMATICS , v. 21, p. 275, 2020.
VIEIRA LEITE, CARMELINA FIGUEIREDO ; SILVA SANTOS, LUCIANNA HELENE ; LEIJÔTO, LARISSA FERNANDES ; BATISTA MARIANO, DIEGO CÉSAR ; OLIVEIRA ROCHA, RAFAEL EDUARDO ; DOS SANTOS, MARCOS AUGUSTO . Milk-Way algorithm for ligand-based virtual screening: CDK2 case study. TRENDS IN DEVELOPMENTAL BIOLOGY , v. 13, p. 1, 2020.
MARIANO, DIEGO ; SANTOS, LUCIANNA ; MACHADO, KARINA ; WERHLI, ADRIANO ; DE LIMA, LEONARDO ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL . A Computational Method to Propose Mutations in Enzymes Based on Structural Signature Variation (SSV). INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 20, p. 333, 2019.
MARIANO, DIEGO ; MARTINS, PEDRO ; HELENE SANTOS, LUCIANNA ; DE MELO-'MINARDI, RAQUEL CARDOSO . Introducing Programming Skills for Life Science Students. BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY EDUCATION , v. 1, p. 21230, 2019.
COSTA, LEON SULFIERRY CORRÊA ; MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; ROCHA, RAFAEL EDUARDO OLIVEIRA ; KRAML, JOHANNES ; SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE DA ; LIEDL, KLAUS ROMAN ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO ; LIMA, LEONARDO HENRIQUE FRANCA DE . Molecular Dynamics Gives New Insights into the Glucose Tolerance and Inhibition Mechanisms on β-Glucosidases. MOLECULES , v. 24, p. 3215, 2019.
GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO ; IBRAIM, IZABELA COIMBRA ; ALVES, JORIANNE T.C. ; DE SÁ, PABLO GOMES ; DE OLIVEIRA SILVA, YURI RAFAEL ; SANTANA, MARIANA PASSOS ; SILVA, WANDERSON MARQUES ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; MARIANO, DIEGO C.B. ; DE PAULA CASTRO, THIAGO LUIZ ; BARBOSA, SILVANIRA ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; CARVALHO, ALEX F. ; PEREIRA, FELIPE L. ; LEAL, CARLOS A.G. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C.P. ; AZEVEDO, VASCO ; SILVA, ARTUR ; FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO . Transcriptome analysis of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar Equi in two conditions of the environmental stress. GENE , v. 8, p. 1, 2018.
SILVA, MARCOS F.M. ; MARTINS, PEDRO M. ; MARIANO, DIEGO C.B. ; SANTOSA, LUCIANNA HELENE ; PASTORINI, ISABELA ; PANTUZA, NAIARA ; NOBRE, CRISTIANE N. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. . Proteingo: motivation, user experience, and learning of molecular interactions in biological complexes. ENTERTAINMENT COMPUTING , v. 1, p. 001, 2018.
HURTADO, RAQUEL ENMA ; ABURJAILE, FLAVIA ; MARIANO, DIEGO ; CANÁRIO, MARCUS VINICIUS ; BENEVIDES, LEANDRO ; FERNANDEZ, DANIEL ANTONIO ; ALLASI, NATALY OLIVIA ; RIMAC, ROCIO ; JUSCAMAYTA, JULIO EDUARDO ; MAXIMILIANO, JORGE ENRIQUE ; ROSADIO, RAUL HECTOR ; AZEVEDO, VASCO ; MATURRANO, LENIN . Draft Genome Sequence of a Virulent Strain of Pasteurella Multocida Isolated From Alpaca. JOURNAL OF GENOMICS , v. 5, p. 68-70, 2017.
MARIANO, D.C.B. ; LEITE, C. ; SANTOS, L.H.S. ; MARINS, L.F. ; MACHADO, K.S. ; WERHLI, A.V. ; LIMA, L.H.F. ; DE MELO-MINARDI, R.C. . Characterization of glucose-tolerant β-glucosidases used in biofuel production under the bioinformatics perspective: a systematic review. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , v. 16, p. 1-19, 2017.
GUIMARÃES, LUIS C. ; VIANA, MARCUS V. C. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; VERAS, ADOONEY A. O. ; SÁ, PABLO H. C. ; ROCHA, FLÁVIA S. ; VILAS BOAS, PRISCILLA C. B. ; SOARES, SIOMAR C. ; BARBOSA, MARIA S. ; GUISO, NICOLE ; BADELL, EDGAR ; CARNEIRO, ADRIANA R. ; AZEVEDO, VASCO ; RAMOS, ROMMEL T. J. ; SILVA, ARTUR . Draft Genome Sequence of Toxigenic Corynebacterium ulcerans Strain 04-7514, Isolated from a Dog in France. Genome Announcements , v. 4, p. e00172-16, 2016.
GUIMARÃES, LUIS C. ; VIANA, MARCUS V. C. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; VERAS, ADOONEY A. O. ; SÁ, PABLO H. C. ; ROCHA, FLÁVIA S. ; VILAS BOAS, PRISCILLA C. B. ; SOARES, SIOMAR C. ; BARBOSA, MARIA S. ; GUISO, NICOLE ; BADELL, EDGAR ; CARNEIRO, ADRIANA R. ; AZEVEDO, VASCO ; RAMOS, ROMMEL T. J. ; SILVA, ARTUR . Draft Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans Strain 04-3911, Isolated from Humans. Genome Announcements , v. 4, p. e00171-16, 2016.
ALMEIDA, SINTIA ; TIWARI, SANDEEP ; MARIANO, DIEGO ; SOUZA, FLÁVIA ; JAMAL, SYED BABAR ; COIMBRA, NILSON ; RAITTZ, ROBERTO TADEU ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; CARVALHO, ALEX FIORINE DE ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES ; BARH, DEBMALYA ; GHOSH, PREETAM ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; MOURA-COSTA, LÍLIA FERREIRA ; PORTELA, RICARDO WAGNER ; MEYER, ROBERTO ; SILVA, ARTUR ; AZEVEDO, VASCO ; et.al . The genome anatomy of Corynebacterium pseudotuberculosis VD57 a highly virulent strain causing Caseous lymphadenitis. Standards in Genomic Sciences , v. 11, p. 29, 2016.
MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; SOUSA, THIAGO DE JESUS ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; ABURJAILE, FLÁVIA ; BARH, DEBMALYA ; ROCHA, FLÁVIA ; PINTO, ANNE CYBELLE ; HASSAN, SYED SHAH ; SARAIVA, TESSÁLIA DINIZ LUERCE ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; DE CARVALHO, ALEX FIORINI ; LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA ; SILVA, ARTUR ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCÁ ; AZEVEDO, VASCO ARISTON CARVALHO . Whole-genome optical mapping reveals a mis-assembly between two rRNA operons of Corynebacterium pseudotuberculosis strain 1002. BMC Genomics , v. 17, p. 315, 2016.
DE AGUIAR, EDGAR LACERDA ; MARIANO, D. C. B. ; VIANA, MARCUS VINÍCIUS CANÁRIO ; BENEVIDES, LEANDRO DE JESUS ; DE SOUZA ROCHA, FLÁVIA ; DE CASTRO OLIVEIRA, LETÍCIA ; PEREIRA, F. L. ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES ; DE CARVALHO, ALEX FIORINI ; SANTOS, GABRIELA SILVA ; MATTOS-GUARALDI, ANA LUIZA ; NAGAO, PRESCILLA EMY ; DE CASTRO SOARES, SIOMAR ; HASSAN, SYED SHAH ; PINTO, ANNE CYBELE ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA ; AZEVEDO, VASCO . Complete genome sequence of Streptococcus agalactiae strain GBS85147 serotype of type Ia isolated from human oropharynx. Standards in Genomic Sciences , v. 11, p. 1, 2016.
GUIMARÃES, LUIS C. ; VIANA, MARCUS V. C. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; SÁ, PABLO H. C. ; ROCHA, FLÁVIA S. ; VILAS BOAS, PRISCILLA C. B. ; SOARES, SIOMAR C. ; BARBOSA, MARIA S. ; GUISO, NICOLE ; BADELL, EDGAR ; AZEVEDO, VASCO ; RAMOS, ROMMEL T. J. ; SILVA, ARTUR . Draft Genome Sequence of Toxigenic Strain 03-8664 Isolated from a Human Throat. Genome Announcements , v. 4, p. e00719-16, 2016.
TIWARI, SANDEEP ; JAMAL, SYED BABAR ; OLIVEIRA, LETICIA CASTRO ; CLERMONT, DOMINIQUE ; BIZET, CHANTAL ; MARIANO, DIEGO ; DE CARVALHO, PAULO VINICIUS SANCHES DALTRO ; SOUZA, FLAVIA ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; DE CASTRO SOARES, SIOMAR ; GUIMARÃES, LUIS C. ; DORELLA, FERNANDA ; CARVALHO, ALEX ; LEAL, CARLOS ; BARH, DEBMALYA ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; HASSAN, SYED SHAH ; AZEVEDO, VASCO ; SILVA, ARTUR . Whole-Genome Sequence of Strain CIP 106629 Isolated from a Dog with Bilateral Otitis from the United Kingdom. Genome Announcements , v. 4, p. e00683-16, 2016.
ALMEIDA, SINTIA ; LOUREIRO, DAN ; PORTELA, RICARDO W. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; SOUSA, THIAGO J. ; PEREIRA, FELIPE L. ; DORELLA, FERNANDA A. ; CARVALHO, ALEX F. ; MOURA-COSTA, LILIA F. ; LEAL, CARLOS A. G. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. ; MEYER, ROBERTO ; AZEVEDO, VASCO . Complete Genome Sequence of the Attenuated Strain T1. Genome Announcements , v. 4, p. e00947-16, 2016.
MARIANO, DIEGO C. B. ; PEREIRA, FELIPE L. ; AGUIAR, EDGAR L. ; OLIVEIRA, LETÍCIA C. ; BENEVIDES, LEANDRO ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; FOLADOR, EDSON L. ; SOUSA, THIAGO J. ; GHOSH, PREETAM ; BARH, DEBMALYA ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; SILVA, ARTUR ; RAMOS, ROMMEL T. J. ; AZEVEDO, VASCO A. C. . SIMBA: a web tool for managing bacterial genome assembly generated by Ion PGM sequencing technology. BMC Bioinformatics , v. 17, p. 65-72, 2016.
BENEVIDES, LEANDRO DE JESUS ; VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; ROCHA, FLÁVIA DE SOUZA ; BAGANO, PRISCILLA CAROLINNE ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES ; CARVALHO, ALEX FIORINI ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; CARNEIRO, ADRIANA ; RAMOS, ROMMEL ; BADELL-OCANDO, EDGAR ; GUISO, NICOLE ; SILVA, ARTUR ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; AZEVEDO, VASCO ; GUIMARÃES, LUIS CARLOS . Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans Strain FRC11. Genome Announcements , v. 3, p. e00112-15, 2015.
ABREU, VINICIUS A. C. ; ALMEIDA, SINTIA ; TIWARI, SANDEEP ; HASSAN, SYED SHAH ; MARIANO, DIEGO ; SILVA, ARTUR ; BAUMBACH, JAN ; AZEVEDO, VASCO ; RÖTTGER, RICHARD . CMRegNet-An interspecies reference database for corynebacterial and mycobacterial regulatory networks. BMC Genomics , v. 16, p. 452, 2015.
MARIANO, DIEGO CB ; PEREIRA, FELIPE L ; GHOSH, PREETAM ; BARH, DEBMALYA ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CP ; SILVA, ARTUR ; RAMOS, ROMMEL TJ ; AZEVEDO, VASCO AC . MapRepeat: an approach for effective assembly of repetitive regions in prokaryotic genomes. BIOINFORMATION (ONLINE) (CHENNAI) , v. 11, p. 276-279, 2015.
SOUSA, THIAGO JESUS ; MARIANO, DIEGO ; PARISE, DOGLAS ; PARISE, MARIANA ; VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; GUIMARÃES, LUIS CARLOS ; BENEVIDES, LEANDRO JESUS ; ROCHA, FLÁVIA ; BAGANO, PRISCILLA ; RAMOS, ROMMEL ; SILVA, ARTUR ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; ALMEIDA, SINTIA ; AZEVEDO, VASCO . Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 12C. Genome Announcements , v. 3, p. e00759-15, 2015.
OLIVEIRA, L. C. ; SARAIVA, T. D. L. ; SOARES, S. C. ; RAMOS, R. T. J. ; SA, P. H. C. G. ; CARNEIRO, A. R. ; MIRANDA, F. ; FREIRE, M. ; RENAN, W. ; JUNIOR, A. F. O. ; SANTOS, A. R. ; PINTO, A. C. ; SOUZA, B. M. ; CASTRO, C. P. ; DINIZ, C. A. A. ; ROCHA, C. S. ; MARIANO, D. C. B. ; DE AGUIAR, E. L. ; FOLADOR, E. L. ; BARBOSA, E. G. V. ; et.al . Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118, a GABA-Producing Strain. Genome Announcements , v. 2, p. e00980-14-e00980-14, 2014.
VIANA, M. V. C. ; DE JESUS BENEVIDES, L. ; BATISTA MARIANO, D. C. ; DE SOUZA ROCHA, F. ; BAGANO VILAS BOAS, P. C. ; FOLADOR, E. L. ; PEREIRA, F. L. ; ALVES DORELLA, F. ; GOMES LEAL, C. A. ; FIORINI DE CARVALHO, A. ; SILVA, A. ; DE CASTRO SOARES, S. ; PEREIRA FIGUEIREDO, H. C. ; AZEVEDO, V. ; GUIMARAES, L. C. . Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans Strain 210932. Genome Announcements , v. 2, p. e01233-14-e01233-14, 2014.
SILVA, A. C. B. ; VALGAS, B. O. ; MARIANO, D. C. B. ; DIAS, S. R. . Just-in-Biblio: website para formatação de referências bibliográficas usando PHP e MySQL. Anais do Seminário de Produção Acadêmica da Anhanguera , v. 3, p. 1, 2012.
MARIANO, D. C. B. ; AGUIAR, E. L. ; DIAS, S. R. . Comparando o desempenho de Bancos de Dados NoSQL e Relacionais manipulando dados biológicos. Anais do Seminário de Produção Acadêmica da Anhanguera , v. 3, p. 1, 2012.
MARIANO, DIEGO ; Cioletti, Alessandra (Org.) ; Silva, Alessandra Lima da (Org.) ; Gonçalves, Ariany Rosa (Org.) ; Fam, Bibiana (Org.) ; Santos, Lucianna Helene (Org.) ; Sousa, Marcos Antonio Nobrega de (Org.) ; Lima, Mira Raya Paula de (Org.) ; ROCHA, RAFAEL EDUARDO OLIVEIRA (Org.) ; Costa, Savio (Org.) ; ARAÚJO, SHEILA CRUZ (Org.) ; Bialves, Tatiane Senna (Org.) ; SOUSA, THIAGO JESUS (Org.) ; ABURJAILE, FLAVIA FIGUEIRA (Org.) ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO (Org.) . BIOINFO #06: Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 6. ed. Lagoa Santa: Alfahelix, 2026. v. 6. 186p .
MARIANO, DIEGO . Python para Bioinformática: Fundamentos de Programação para Bioinformática e Biologia Computacional. 1. ed. São Paulo: Novatec, 2025. 576p .
MARIANO, DIEGO . Desenvolvimento de APIs. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Projeto de Aplicações Web. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Programação para Back-End: Livro do Professor. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Projeto de Aplicações Web: Livro do Professor. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Programação para front-end: Livro do Professor. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Fundamentos de UI e UX. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Fundamentos de UI e UX: Livro do Professor. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Lógica de Programação: Livro do Professor. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Programação para front-end. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Lógica de Programação. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Programação para Back-End. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
MARIANO, DIEGO . Desenvolvimento de APIs: Livro do Professor. 1. ed. Belo Horizonte: PONTO EDU, 2025.
Silva, Aline de Paula Dias da (Org.) ; Bulla, Ana Carolina Silva (Org.) ; Puelles, Angie Atoche (Org.) ; Santos, Bruna Espiño dos (Org.) ; Teixeira, Filipe Augusto (Org.) ; Bastos, Luana Luiza (Org.) ; Pirovani, Milenna Machado (Org.) ; MORAES, LUCAS (Org.) ; ARAUJO, SHEILA CRUZ (Org.) ; Cioletti, Alessandra (Org.) ; Lima, Alessandra (Org.) ; MARIANO, DIEGO (Org.) . BIOINFO #05: Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 5. ed. Alfahelix, 2025. 265p .
PAIXAO, V. M. ; SANTOS, L. M. ; Bastos, Luana Luiza ; LEMOS, R. P. ; SILVA, J. ; ABREU, A. P. ; PUELLES, A. A. ; OLIVEIRA, L. M. ; ANDRADE, L. M. ; MELO, S. ; PEIXOTO, L. P. A. ; CAVALIERI, M. F. ; SOUZA, A. F. M. ; MARIANO, DIEGO ; SILVA, A. L. ; CHAVES, F. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO . Bioinformática com Jupyter Notebook. 1. ed. Lagoa Santa: Alfahelix, 2023. v. 2. 106p .
PAIXAO, V. M. ; Puelles, Angie Atoche ; ABREU, A. P. ; Bastos, Luana Luiza ; SANTOS, L. M. ; Carvalho, Frederico Chaves ; MARIANO, DIEGO ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO . LBS Tech - Desenvolvimento web. 1. ed. Lagoa Santa: ALFAHELIX, 2023. v. 1. 84p .
MARIANO, DIEGO ; SILVA, A. P. D. (Org.) ; CREMONESI, A. S. (Org.) ; BULLA, A. C. S. (Org.) ; ABREU, A. P. (Org.) ; GONCALVES, A. R. (Org.) ; PINHEIRO, B. R. M. (Org.) ; FAM, B. (Org.) ; SANTOS, B. E. (Org.) ; CAPELINI, C. (Org.) ; RODRIGUES, D. L. N. (Org.) ; TEIXEIRA, F. A. (Org.) ; CANSANCAO, I. F. (Org.) ; MAMEDE, I. (Org.) ; BASTOS, L. L. (Org.) ; SANTOS, L. H. (Org.) ; SOUSA, M. A. N. (Org.) ; LIMA, M. R. P. (Org.) ; LEMOS, R. P. (Org.) ; COSTA, S. (Org.) ; et.al (Org.) . BIOINFO #03 - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 1. ed. Lagoa Santa: Alfahelix, 2023. v. 3. 300p .
Bastos, Luana Luiza (Org.) ; Puelles, Angie Atoche (Org.) ; Paixão, Vívian (Org.) ; Fiorini, Giovanna (Org.) ; Utsch, Eduardo (Org.) ; Nogueira, Wylerson Guimarães (Org.) ; Bialves, Tatiane Senna (Org.) ; Santos, Lucianna Helene (Org.) ; Bulla, Ana Carolina Silva (Org.) ; Sanches, Flavia (Org.) ; Brandão, Débora Soares (Org.) ; Cansanção, Isaac Farias (Org.) ; Costa, Sávio (Org.) ; Carvalho, Frederico Chaves (Org.) ; MARIANO, DIEGO (Org.) . BIOINFO #02 - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 2. ed. Lagoa Santa: Alfahelix, 2022. v. 2. 176p .
MARIANO, DIEGO ; SANTOS, LUCIANNA . Manual de Escrita Científica: Teoria e Prática Aplicadas à Bioinformática. 1. ed. Alfahelix, 2021. 119p .
MARIANO, DIEGO ; Dezordi, Filipe Zimmer (Org.) ; MARTINS, PEDRO (Org.) ; Xavier, Joicymara (Org.) ; SOUSA, THIAGO DE JESUS (Org.) ; Lima, Leonardo (Org.) ; Santos, Lucianna Helene (Org.) . BIOINFO - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 1. ed. Lagoa Santa: Alfahelix, 2021. v. 1.
MARIANO, DIEGO ; PRADO, E. F. ; GOIS, M. M. ; BRANCO, R. L. . Desenvolvimento Web. 1. ed. Belo Horizonte: Editora e Distribuidora Educacional S.A., 2021. v. 1.
LACERDA, P. S. P. ; PEREIRA, M. A. ; LENZ, M. L. ; SILVA, M. S. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; ALVES, N. S. R. ; MAITINO NETO, R. . PROGRAMAÇÃO EM BIG DATA COM R. 1. ed. Porto Alegre: SAGAH, 2021. 286p .
LACERDA, P. S. P. ; SOARES, J. A. ; LENZ, M. L. ; WANDERLEY, A. R. M. C. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; HORTA, G. L. E. ; SANTOS, R. C. R. ; CORREA, S. C. S. ; MACHADO, V. A. . Projeto de Redes de Computadores. 1. ed. Porto Alegre: SAGAH, 2021. 262p .
Sousa, Thiago ; da Silva, Alessandra Lima ; MARIANO, DIEGO . WordPress sem fronteiras: do básico à construção de sites completos. 1. ed. Lagoa Santa: Alfahelix, 2020. 136p .
MARIANO, DIEGO ; VOGEL, A. . Infraestrutura de TI. 1. ed. Porto Alegre: Sagah, 2020.
MARIANO, DIEGO ; PAZ, F. J. . Data Mining. 1. ed. Porto Alegre: Sagah, 2020.
MARTINS, J. S. ; REIS, A. N. ; MARIANO, DIEGO . Processamento de linguagem natural. 1. ed. Porto Alegre: Sagah, 2020.
SOARES, J. A. ; LENZ, M. L. ; SILVA, F. R. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; ALEIXO JUNIOR, J. F. M. ; PICHETTI, R. F. ; ALBUQUERQUE, R. . Redes de alta disponibilidade. 1. ed. Porto Alegre: SAGAH, 2020. v. 1. 293p .
FREITAS, P. H. C. ; MARIANO, DIEGO . Programa back end III. 1. ed. Porto Alegre: Sagah, 2019.
MARIANO, DIEGO ; de MELO-MINARDI, R. C. . Introdução à Programação Web para Bioinformática: HTML, CSS, PHP & JavaScript. 1. ed. North Charleston, SC (EUA): CreateSpace Independent Publishing Platform, 2017. v. 3. 403p .
MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; de MELO-MINARDI, R. C. . Introdução à Programação para Bioinformática com Perl. 1. ed. North Charleston, SC (EUA): CreateSpace Independent Publishing Platform, 2016. v. 2. 200p .
MARIANO, DIEGO CB ; RAMOS, ROMMEL TJ ; AZEVEDO, V. A. C. . Montagem e finalização de genomas procariotos com mapeamento óptico. 1. ed. Saarbrücken, Alemanha: Novas Edições Acadêmicas, 2016. v. 1. 76p .
MARIANO, D. C. B. ; BARROSO, J. R. P. M. ; CORREIA, T. S. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Introdução à Programação para Bioinformática com Biopython. 3. ed. North Charleston, SC (EUA): CreateSpace Independent Publishing Platform, 2015. v. 1. 230p .
BASTOS, ANA LUÍSA ARAÚJO ; LEMOS, RAFAEL PEREIRA ; MARIANO, DIEGO ; Yamada, Camila A. O. ; Pirovani, Milenna M. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO . Towards Fast Binding Affinity Scoring in Protein¿Protein Complexes via Interatomic Contacts and Linear Regression. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer Nature Switzerland, 2026, v. , p. 181-191.
MARIANO, DIEGO ; Puça, Maria Carolina ; Salazar, Yanka E. A. R. ; Pereira Lemos, Rafael ; Maia, Giovana C. F. ; SANTOS, LUCAS MORAES DOS ; Sousa, Tais Nobrega de ; MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO DE . Using Machine Learning and Graph-Based Signatures to Evaluate Normal and Decreased Function CYP2D6 Haplotypes. Lecture Notes in Computer Science. 01ed.Switzerland: Springer Nature Switzerland, 2026, v. 16037, p. 90-105.
Moreira, Eduardo U.M. ; MARIANO, DIEGO C.B. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. . Computational analysis of mutations in SARS-CoV-2 variants spike protein and protein interactions. Features, Transmission, Detection, and Case Studies in COVID-19. 1ed.: Elsevier, 2024, v. , p. 123-139.
SILVA, A. L. ; MARIANO, DIEGO ; PARISE, M. ; PUELLES, A. L. A. ; BIALVES, T. S. ; BASTOS, L. L. ; SANTOS, L. ; LEMOS, R. P. ; de MELO-MINARDI, R. C. . A Concise Overview of Bioinformatics. Advances in Bioinformatics and Biomedical Engineering. 1ed.: IGI Global, 2024, v. , p. 1-22.
OLIVEIRA, L. M. ; BASTOS, L. L. ; PAIXAO, V. M. ; GONTIJO, L. A. ; BIALVES, T. S. ; MARIANO, DIEGO ; de MELO-MINARDI, R. C. . Structural Bioinformatics. Advances in Bioinformatics and Biomedical Engineering. 1ed.: IGI Global, 2024, v. , p. 169-208.
MARIANO, DIEGO ; SANTOS, L. M. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Computational Modeling and Machine Learning in Bioinformatics. Advances in Bioinformatics and Biomedical Engineering. 1ed.: IGI Global, 2024, v. , p. 107-136.
SANTOS, L. M. ; MARIANO, DIEGO ; BASTOS, L. L. ; CIOLETTI, A. G. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL CARDOSO . Peptide-Protein Interface Classification Using Convolutional Neural Networks. In: Marcelo S. Reis; Raquel C. de Melo-Minardi. (Org.). Lecture Notes in Computer Science. 1ed.Baar, Switzerland: Springer Cham, 2023, v. 13954, p. 112-122.
CARVALHO, F. ; MARIANO, DIEGO ; BOMFIM, M. ; FIORINI, G. ; BASTOS, L. ; ABREU, A. P. ; PAIXAO, V. ; SANTOS, L. ; SILVA, J. ; PUELLES, A. ; SILVA, A. ; DE MELO-MINARDI, R. C. . Using Natural Language Processing for Context Identification in COVID-19 Literature. In: Marcelo S. Reis; Raquel C. de Melo-Minardi. (Org.). Lecture Notes in Computer Science. 1ed.Baar, Switzerland: Springer Cham, 2023, v. 13954, p. 70-81.
MARIANO, DIEGO . AlphaFold e a busca pelo Santo Graal da Biologia Molecular. BIOINFO #02 - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 2ed.Lagoa Santa: Alfahelix, 2022, v. 2, p. 162-167.
MARIANO, DIEGO . Editorial ¿ BIOINFO #01. BIOINFO - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 1ed.: Alfahelix, 2021, v. 1, p. 1-.
MARIANO, DIEGO . Tipos de cobertura em sequenciamento genômico. BIOINFO - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 1ed.: Alfahelix, 2021, v. 1, p. 5-.
dos Santos, Vitor Pimentel ; MARTINS, PEDRO ; MARIANO, DIEGO . Alinhamentos estruturais: métodos de sobreposição de proteínas e outras moléculas. BIOINFO - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 1ed.: Alfahelix, 2021, v. 1, p. 7-.
MARIANO, DIEGO ; Silva, Bruno . Dinâmica molecular: como mostrar um filme completo em uma folha de papel?. BIOINFO - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 1ed.: Alfahelix, 2021, v. 1, p. 11-.
MARIANO, DIEGO . Métricas de avaliação em machine learning: acurácia, sensibilidade, precisão, especificidade e F-score. BIOINFO - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 1ed.: Alfahelix, 2021, v. 1, p. 15-.
MARIANO, DIEGO . Biopython: uma breve introdução à manipulação de dados biológicos em Python usando Colab. BIOINFO - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 1ed.: Alfahelix, 2021, v. 1, p. 17-.
MARIANO, DIEGO ; Nogueira, Wylerson G. ; Goes, Wanessa M. ; dos Santos, Roselane G. ; Kato, Rodrigo Bentes ; Toledo, Nayara ; Queiroz, Lucio R. ; Hilário, Heron O. ; Quintanilha-Peixoto, Gabriel ; Lage, Fernanda S. D. ; Santos, Fenícia Brito ; Caixeta, Felipe ; de Abreu, Ana Paula ; da Silva, Alessandra Lima ; Xavier, Joicymara S. . Uma estratégia para engajamento de participantes de eventos online. BIOINFO - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 1ed.: Alfahelix, 2021, v. 1, p. 19-.
MARIANO, DIEGO ; Ferreira, Mívian ; Sousa, Bruno L. ; SANTOS, LUCIANNA H. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. . A Brief History of Bioinformatics Told by Data Visualization. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2020, v. , p. 235-246.
OLIVEIRA JUNIOR, A. F. ; BENEVIDES, LEANDRO DE JESUS ; MARIANO, D. C. B. ; AGUIAR, E. L. ; SOUSA, T. J. ; SILVA, A. ; AZEVEDO, V. A. C. . Bioinformatics. In: Zahoorullah S MD. (Org.). A Textbook of Biotechnology. 1ed.: SMGroup, 2015, v. , p. 15-32.
DOS SANTOS, LUCAS MORAES ; MARIANO, DIEGO ; DE MELO MINARDI, RAQUEL CARDOSO . ViPeC: Vision transformer-based approach for Peptide-protein interface Classification. In: 2024 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB), 2024, Natal. 2024 IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (CIBCB), 2024. p. 1.
LEMOS, RAFAEL P. ; MARIANO, DIEGO ; SILVEIRA, SABRINA A. ; MELO-MINARDI, RAQUEL C. DE . COCαDA - Large-Scale Protein Interatomic Contact Cutoff Optimization by Cα Distance Matrices. In: Simpósio Brasileiro de Bioinformática, 2024, Brasil. Anais do XVII Simpósio Brasileiro de Bioinformática (BSB 2024), 2024. p. 59.
Bastos, Luana Luiza ; LEMOS, RAFAEL P. ; MARIANO, DIEGO ; MELO-MINARDI, RAQUEL C. DE . A strategy for refining the calculation of contacts in protein-RNA complexes. In: Simpósio Brasileiro de Bioinformática, 2024, Brasil. Anais do XVII Simpósio Brasileiro de Bioinformática (BSB 2024). p. 241.
Moreira, Eduardo U.M. ; OLIVEIRA, L. M. ; ARAUJO, S. ; LEMOS, R. P. ; BASTOS, A. L. ; LIMA, A. ; MARIANO, D. C. B. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Predicting Mutation-Driven Changes in the SARS-CoV-2 Spike Protein Using B1 Structural Signatures and Neural Networks.. In: BSB - Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2024, Vitória. Lecture Notes in Computer Science., 2024.
COSTA, H. L. ; FIORINI, G. ; CHAVES, L. ; MARIANO, D. C. B. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Teaching bioinformatics programming in high school: a case report. In: BSB - Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2024, Vitória. Lecture Notes in Computer Science., 2024.
CIOLETTI, A. ; LEMOS, R. P. ; SANTOS, L. ; MARIANO, D. C. B. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Using graph-based structural signatures and machine learning algorithms for molecular docking assessment of histone deacetylases and small ligands. In: BSB - Brazilian Symposium on Bioinformatics., 2024, Vitória. Lecture Notes in Computer Science., 2024.
MARIANO, D. C. B. ; SILVA, A. C. B. ; VALGAS, B. O. ; DIAS, S. R. . Sistema para formatação e gerenciamento de referências bibliográficas. In: XII Congresso de Iniciação Científica da FACECA, 2012, Varginha. XII CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2012. v. 1.
MARIANO, D. C. B. ; DIAS, S. R. ; AGUIAR, E. L. . Comparando o desempenho de bancos de dados Nosql e relacionais manipulando dados biológicos. In: 12º Congresso de Iniciação Científica CONIC-SEMESP, 2012, São Paulo. 12º Congresso de Iniciação Científica CONIC-SEMESP, 2012.
RODRIGUES, D. R. ; MARIANO, DIEGO ; SANTOS, L.H.S. ; TAGLIATI, C. A. . ToxAnalyzer: A tool for Comparative Toxicogenomics Database (CTD)? data analysis and visualization. In: X-meeting eXperience 2020, 2020, Online. Proceedings X-Meeting 2020, 2020.
MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; de MELO-MINARDI, R. C. . A new method based on structural signatures to propose mutations for enzymes beta-glucosidase used in biofuel production. In: 13th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2017, São Pedro. Anais X-Meeting 2017, 2017.
MARIANO, D. C. B. ; CORREIA, T. S. ; BARROSO, J. R. P. M. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Structural pattern detection for engineering more efficient enzymes for second-generation biofuel production. In: X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C, 2016, Belo Horizonte. Anais X-Meeting 2016, 2016.
SOUSA, THIAGO JESUS ; PARISE, DOGLAS ; PEREIRA, FELIPE L ; PEREIRA FIGUEIREDO, H. C. ; COSTA, D. A. ; AZEVEDO, V. ; SILVA, A. ; RAMOS, R. T. J. ; MARIANO, D. C. B. . Detection and correction mis-assemblies in genome of Corynebacterium pseudotuberculosis. In: X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C, 2016, Belo Horizonte. Anais X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C, 2016.
VIANA, MARCUS V. C. ; PARISE, DOGLAS ; SOUSA, THIAGO J. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; MARIANO, D. C. B. ; ROCHA, FLÁVIA ; BAGANO, PRISCILLA ; GUIMARÃES, LUIS C. ; FIGUEIREDO, H. ; AZEVEDO, V. . Genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis 32. In: Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambu-MG. Anais Brazilian-International Congress of Genetics, 2016.
SILVA, M. F. M. ; MARTINS, P. M. ; MARIANO, D. C. B. ; PASTORINI, I. ; PANTUZA, N. ; de MELO-MINARDI, R. C. . An approach for constructing a database of manually curated contacts in proteins. In: X-meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C, 2016, Belo Horizonte. Anais X-meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C, 2016.
MARIANO, D. C. B. ; BARROSO, J. R. P. M. ; CORREIA, T. S. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Data visualization for sequence comparison. In: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo. Anais do X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015.
BARROSO, J. R. P. M. ; MARIANO, D. C. B. ; CORREIA, T. S. ; RODRIGUES, L. M. ; FASSIO, A. V. ; MARTINS, P. M. ; LEITE, C. ; SOUSA, T. J. ; POVOA, F. ; FERREIRA, R. S. ; BLEICHER, L. ; de MELO-MINARDI, R. C. . POTTER: a web tool for protein point mutation modelling and analysis. In: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo. Anais do X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015.
CORREIA, T. S. ; BARROSO, J. R. P. M. ; MARIANO, D. C. B. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Detecting β-glucosidases with high catalytic efficiency for cellulose degradation using singular value decomposition. In: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo. Anais do X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015.
MARIANO, D. C. B. ; PEREIRA, F. L. ; AGUIAR, E. L. ; OLIVEIRA, L. C. ; BENEVIDES, L. ; GUIMARÃES, LUIS CARLOS ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; SOUSA, T. J. ; GHOSH, PREETAM ; BARH, DEBMALYA ; FIGUEIREDO, H. C. P. ; SILVA, A. ; RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. A. C. . SIMBA: a web tool for managing bacterial genome assembly. In: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo. Anais do X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015.
SOUSA, T. J. ; MARIANO, D. C. B. ; ABURJAILE, F. F. ; ROCHA, F. ; PEREIRA, F. L. ; FIGUEIREDO, H. ; SILVA, A. ; RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. A. C. . Optical mapping to detect misassemblies in genome of Corynebacterium pseudotuberculosis strain 1002. In: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo. Anais do X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015.
CORREIA, T. S. ; MARIANO, D. C. B. ; BARROSO, J. R. P. M. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Classificação de famílias de proteínas usando decomposição em valores singulares: enzima β-glicosidase como estudo de caso. In: XXIV Semana de iniciação científica / PRPQ / UFMG, 2015, Belo Horizonte. Anais da XXIV Semana de iniciação científica / PRPQ / UFMG, 2015.
VIANA, M. V. C. ; BENEVIDES, L. ; MARIANO, D. C. B. ; ROCHA, F. ; FOLADOR, E. L. ; PEREIRA, F. L. ; DORELLA, F. ; LEAL, C. ; CARVALHO, A. ; SILVA, A. ; SOARES, S. C. ; FIGUEIREDO, H. ; AZEVEDO, V. A. C. ; GUIMARAES, L. C. . Complete Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans strain 210932. In: ISCB - Latin American X-Meeting on Bioinformatics with BSB & SoiBio, 2014, Belo Horizonte. ISCB - LA / X-Meeting / BSB / SoiBio, 2014.
MARIANO, D. C. B. ; OLIVEIRA, L. C. ; FOLADOR, E. L. ; AGUIAR, E. L. ; BENEVIDES, L. ; PEREIRA, F. L. ; RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. A. C. . SIMBA: A Web Tool for Complete Assembly of Bacterial Genomes. In: ISCB - Latin American X-Meeting on Bioinformatics with BSB & SoiBio, 2014, Belo Horizonte. ISCB - LA / X-Meeting / BSB / SoiBio, 2014.
MARIANO, D. C. B. ; OLIVEIRA, L. C. ; FOLADOR, E. L. ; AGUIAR, E. L. ; BENEVIDES, L. ; PEREIRA, F. L. ; VIANA, M. V. C. ; SOUSA, T. J. ; RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. A. C. . SIMBA: A Simple Way to Make Complete Assemblies of Bacterial Genomes. In: First ISCB Latin American Student Council Symposium, 2014, Belo Horizonte. Program Booklet - ISCB LA Student Council Symposium, 2014. p. 24-25.
AGUIAR, E. L. ; MARIANO, D. C. B. ; OLIVEIRA, L. C. ; AMORIM, L. G. ; OLIVEIRA JUNIOR, A. F. ; ROCHA, F. ; PEREIRA, F. L. ; SOARES, S. C. ; DORELLA, F. ; LEAL, C. ; FIGUEIREDO, H. ; AZEVEDO, V. A. C. . The complete genome sequence of Streptococcus agalactiae strain GBS85147. In: First ISCB Latin American Student Council Symposium, 2014, Belo Horizonte. Program Booklet - ISCB LA Student Council Symposium, 2014. p. 24-25.
BENEVIDES, L. ; VIANA, M. V. C. ; MARIANO, D. C. B. ; ROCHA, F. ; FOLADOR, E. L. ; PEREIRA, F. L. ; DORELLA, F. A. ; CARVALHO, A. ; LEAL, C. ; SILVA, A. ; SOARES, S. C. ; FIGUEIREDO, H. ; AZEVEDO, V. A. C. ; GUIMARAES, L. C. . Complete Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans strain 210931. In: ISCB - Latin American X-Meeting on Bioinformatics with BSB & SoiBio, 2014, Belo Horizonte. ISCB - Latin American X-Meeting on Bioinformatics with BSB & SoiBio, 2014.
AGUIAR, E. L. ; MARIANO, D. C. B. ; OLIVEIRA, L. C. ; AMORIM, L. G. ; OLIVEIRA JUNIOR, A. F. ; ROCHA, F. ; PEREIRA, F. L. ; SOARES, S. C. ; DORELLA, F. A. ; LEAL, C. ; FIGUEIREDO, H. C. P. ; AZEVEDO, V. A. C. . The complete genome sequence of Streptococcus agalactiae strain GBS85147. In: ISCB - Latin American X-Meeting on Bioinformatics with BSB & SoiBio, 2014, Belo Horizonte. ISCB - LA / X-Meeting / BSB / SoiBio, 2014.
MARIANO, D. C. B. ; AGUIAR, E. L. ; SOUSA, T. J. ; RODRIGUES, L. M. ; MELO-MINARDI, R. C. ; AZEVEDO, V. A. C. . Uso da visualização de dados como elemento transformador na etapa de scaffolding dos processos de montagem de genomas procariotos através do software KION. In: InWeb - CETIC Workshop sobre Visualização de Dados e Informações, 2014, Belo Horizonte. InWeb - CETIC Workshop sobre Visualização de Dados e Informações, 2014.
AGUIAR, E. L. ; FASSIO, A. V. ; MARIANO, D. C. B. ; MARTINS, P. M. ; MELO-MINARDI, R. C. ; AZEVEDO, V. A. C. . EC Number Viewer: um Website para visualização de evoluções na classificação de EC Numbers. In: InWeb - CETIC Workshop sobre Visualização de Dados e Informações, 2014, Belo Horizonte. InWeb - CETIC Workshop sobre Visualização de Dados e Informações, 2014.
OLIVEIRA, L. C. ; AMORIM, L. G. ; MARIANO, D. C. B. ; SANTOS, M. A. ; SOARES, S. C. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. A. C. . Phylogenetic Inference Of Bacterial Evolutionary Relationship From The Analysis Of Genomic Signature Using Singular Value Decomposition (SVD). In: 59º Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindóia. Anais do 59º Congresso Brasileiro de Genética, 2013.
AMORIM, L. G. ; MARIANO, D. C. B. ; OLIVEIRA, L. C. ; SANTOS, M. A. ; SOARES, S. C. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. A. C. . Análise de bactérias baseada na decomposição por valores singulares de frequências de padrões de assinatura genômica. In: 27º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013, Natal. Anais do 27º Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013.
MARIANO, D. C. B. ; OLIVEIRA, L. C. ; AMORIM, L. G. ; SANTOS, M. A. ; SOARES, S. C. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, V. A. C. . A New Approach For Classification And Phylogenetic Analysis Of Bacteria Using Singular Value Decomposition (SVD). In: X-meeting BSB 2013, 2013, Recife. Anais do X-meeting BSB 2013, 2013.
ABREU, V. A. C. ; ALMEIDA, S. S. ; MARIANO, D. C. B. ; OLIVEIRA, L. C. ; AMORIM, L. G. ; DINIZ, C. A. A. ; AGUIAR, E. L. ; SOARES, S. C. ; HASSAN, S. ; BAUMBACH, J. ; AZEVEDO, V. A. C. . CMRegNet: A database of transcriptional regulatory network. In: X-meeting BSB 2013, 2013, Recife. Anais X-meeting BSB 2013, 2013.
MARIANO, D. C. B. ; DIAS, S. R. ; AGUIAR, E. L. . Comparing the performance of databases relational and NoSQL for manipulating biological data. In: X-meeting 2012 - 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012, Campinas. AbstractBook - X-meeting 2012, 2012.
MARIANO, D. C. B. ; DIAS, S. R. ; AGUIAR, E. L. . Comparando o desempenho de bancos de dados Nosql e relacionais manipulando dados biológicos. In: XXI Congresso de Pós-graduação da UFLA, 2012, Lavras. Anais - XXI Congresso, 2012.
MARIANO, DIEGO . Aprendizado de máquina na Bioinformática. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
MARIANO, DIEGO . Using structural signatures to propose mutations in ß-glucosidase enzymes used in the production of biofuels. 2020. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
BATISTA MARIANO, D. C. ; MARTINS, P. M. ; FASSIO, A. V. ; de MELO-MINARDI, R. C. . A new method based on structural signatures to propose mutations for enzymes β-glucosidase used in biofuel production. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA . Programação web com PHP. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
MARIANO, D. C. B. ; BARROSO, J. R. P. M. ; CORREIA, T. S. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Data visualization for sequence comparison. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
MARIANO, D. C. B. ; RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. A. C. . SIMBA: A Web Tool for Complete Assembly of Bacterial Genomes. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções

dos Santos, Vitor Pimentel ; MARIANO, DIEGO C. B. ; de MELO-MINARDI, R. C. . VTR. 2021.

MARTINS, P. M. ; SANTOS, L. H. S. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Propedia. 2021.

MARTINS, P. M. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; PASTORINI, I. ; PANTUZA, N. ; SILVA, M. F. M. ; de MELO-MINARDI, R. C. . Proteingo. 2016.

MARIANO, D. C. B. ; PEREIRA, F. L. ; RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. A. C. . SIMBA. 2014.

MARIANO, D. C. B. ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. A. C. . Dinnotator. 2014.

MARIANO, D. C. B. ; AGUIAR, E. L. ; SOUSA, T. J. ; RODRIGUES, L. M. ; MELO-MINARDI, R. C. ; AZEVEDO, V. A. C. . Kion. 2014.

MARIANO, DIEGO ; LEITE, C. ; SANTOS, L. H. S. ; ROCHA, R. E. O. ; de MELO-MINARDI, R. C. . A guide to performing systematic literature reviews in bioinformatics. 2017.

MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA . Doutorando da Bioinformática é coautor de artigo vencedor de competição da Wikipedia. 2018. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA . Equipe brasileira vence competição mundial de Biologia Computacional. 2018. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

MARIANO, DIEGO C. B. . Revista BIOINFO. 2021; Tema: Bioinformática. (Site).

MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; MARTINS, P. M. . LBS. 2017. (Site).

MARIANO, D. C. B. . BIOINFO #02 - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 2022. (Editoração/Livro).

MARIANO, DIEGO ; ZIMMER, F. ; Xavier, Joicymara S. ; SOUSA, T. J. ; MARTINS, PEDRO M. ; Lima, Leonardo ; SANTOS, LUCIANNA . BIOINFO - Revista Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 2021. (Editoração/Livro).

BATISTA MARIANO, D. C. . Introdução à Criação de Sites Dinâmicos com PHP. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO . Introdução à Linguagem HTML. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO C. B. . Introdução ao Framework Bootstrap. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO . Introdução ao jQuery. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO . Introdução à linguagem JavaScript. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO C. B. . Introdução à linguagem CSS. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, D.C.B. . Introdução ao PHP orientado a objetos. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO . Curso de programação com Perl. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, D.C.B. . Introdução à Linguagem Python. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO . Boas práticas em PHP. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, D. C. B. . Introdução a banco de dados com MySQL & PHPMyAdmin. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA . Introdução à programação de computadores. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO . Introduction to HTML Language. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO . BLAST: Ferramenta de Alinhamentos Locais de Sequências. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

BATISTA MARIANO, D. C. . Modelagem de proteínas por homologia. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO CB . Data Science: Visualização de Dados com Python. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO CB . Terminal Linux. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, DIEGO CB . Introdução ao Sistema Operacional Linux. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

OLIVEIRA JUNIOR, A. F. ; MARIANO, D. C. B. ; AMORIM, L. G. ; OLIVEIRA, L. C. . Interação entre Microorganismos - Planta & Métodos Moleculares Aplicados (monitoria). 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MARIANO, D. C. B. . Hardware - Montagem e manutenção de computadores. 2011. .

Projetos de pesquisa

2016 - Atual

ThAMES: Modelos, algoritmos e visualizações para o estudo de redes biológicas multivariadas dinâmicas, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Raquel Cardoso de Melo Minardi em 26/02/2019., Descrição: Bioinformática é uma área essencialmente interdisciplinar e agregadora de conhecimentos da Ciência da Computação, e de diversas áreas na solução de problemas biológicos. Sob a perspectiva de Computação, existem ainda grandes demandas de novos modelos que possibilitem a geração de conhecimento útil para catalizar descobertas e invenções com potencial biotecnológico. Nossa atuação em Bioinformática consiste em trabalhar em diversos cenários biológicos que tratam de problemas em aberto na biologia ou com especial interesse biotecnológico. No presente projeto, temos um grande problema a ser estudado e uma interessante aplicação em um cenário de alta relevância biotecnológica: a engenharia de enzimas do tipo Beta-Glicosidades envolvidas na produção de biocombustíveis de segunda geração. Alguns problemas tem impedido a produção custo-eficiente desses biocombustíveis. Dentre eles, destaca-se a inibição da enzima Beta-Glicosidase por Glicose. Do ponto de vista de Bioinformática, esse projeto consiste então no estudo do impacto de mutações em proteínas para sua engenharia visando resolver o problema acima descrito. É importante destacar que a construção de enzimas mutantes com a eficiência necessária para os requisitos levantados anteriormente é um problema de grande complexidade, uma vez que uma proteína tem centenas de aminoácidos e para cada aminoácido há dezenove mutações possíveis. Dessa forma, fica evidente a necessidade de novos modelos, algoritmos e ferramentas que sejam capazes propor soluções para o problema descrito. A abordagem que aqui propomos consiste na modelagem dessas proteínas como grafos nos quais um nó pode ser um aminoácido (centenas) ou um átomo (milhares) e as arestas descrevem interações químicas entre eles. Essa seria uma rede multivariada e dinâmica, a qual pretendemos analisar através de modelos, algoritmos e visualizações que serão propostas nesse projeto e que podem ser amplamente utilizadas em outros cenários de aplicação. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (7) / Doutorado: (6) . , Integrantes: Diego César Batista Mariano - Integrante / Raquel Cardoso de Melo Minardi - Coordenador.
2014 - 2015

Biologia Computacional-REDE DE COOPERAÇÃO ACADÊMICA PARA O ESTUDO E DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS PARA A GENÔMICA ESTRUTURAL E FUNCIONAL, Descrição: Descrição: Fortalecer e ampliar o intercâmbio acadêmico entre os programas inter-unidades de Pós-Graduação em Bioinformática da UFMG (CAPES 6) e da USP (5), o de Biotecnologia da UFPA (CAPES 5) e o de Bioinformática da UFPR (CAPES 3) com a criação de uma rede voltada a aumentar a formação de recursos humanos em Biologia Computacional, em resposta à presente chamada... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (7) Doutorado: (6) . , Integrantes: Diego César Batista Mariano - Integrante / Edgar Lacerda de Aguiar - Integrante / SIOMAR C. SOARES - Integrante / VASCO A. C. AZEVEDO - Coordenador / Vinícius A. C. Abreu - Integrante / Carlos A. A. Diniz - Integrante / SS Hassan - Integrante / Alberto Fernandes de Oliveira Junior - Integrante / TIWARI, S. - Integrante / Edson Luiz Folador - Integrante / Jose Miguel Ortega - Integrante / Lucas Bleicher - Integrante / Sintia Silva de Almeida - Integrante / Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Integrante / Leticia de Oliveria Castro - Integrante / Lucas Amorim Gonçalves - Integrante / Raoni Almeida de Souza - Integrante / Benjamin Viart - Integrante / Camila Franco Batista de Oliveira - Integrante / Andrea Silveira Vilela - Integrante.
2014 - Atual

Bioinformática Estrutural de Proteínas: modelos, algoritmos e aplicações biotecnológicas, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Raquel Cardoso de Melo Minardi em 29/06/2016., Descrição: Este projeto propõe-se enfrentar dois desafios biotecnológicos de grande relevância nacional. O primeiro envolve a ricina, uma potente fitotoxina encontrada na mamoneira. Co-produtos da produção do óleo de mamona podem conter quantidades letais de ricina. Além do risco de intoxicação animal e humana do bagaço, isso tem dificultado sua reutilização e reciclagem, em especial no semiárido nordestino. A ricina preocupa também pelo seu potencial uso como arma química. Portanto, há forte apelo para se encontrar meios efetivos de neutralizar, inibir e/ou detectar a ricina. O segundo envolve a modelagem de celulases multifuncionais, capazes de degradar eficientemente a lignocelulose, composto base para a produção de biocombustíveis de segunda geração, os quais têm por princípio a utilização de subprodutos de plantas que não podem ser usados na alimentação humana. Ambos desafios exigem uma abordagem multidisciplinar sinérgica entre a modelarem teórica in silico e experimental in vitro. Objetivos: 1) Prever in silico e validar in vitro ligantes de ricina 2) Simular in silico e caracterizar in vitro efeitos causados por intervenções estratégicas em beta-glicosidases modificadas. 3) Projetar, implementar e validar modelos, algoritmos e ferramentas de Quimioinformática e Bioinformática Estrutural de Proteínas que permitam dar suporte aos objetivos biotecnológicos previamente descritos. Espera-se que este projeto possa revelar novas plataformas químicas para o desenvolvimento de inibidores, kits de detecção, biossensores, neutralizadores (substratos suicidas) e outros produtos de inovação biotecnológica baseados na ricina, com potencial para alavancar o agronegócio da mamona e a indústria nacional de fármacos. Espera-se também a modelagem de celulases multifuncionais, capazes especialmente de orientar a manipulação genética de algas produtoras de $\beta$-glicosidases, com características catalíticas eficientes e de tolerância à inibição por glicose e celobiose, permitindo seu uso industrial na produção de etanol de segunda geração. Espera-se, em fim, que esses desafios possam inspirar novas metodologias matemáticas, computacionais, químicas e bioquímicas integradas, de modo a gerar artefatos biotecnológicos inovadores, bem como contribuir para a formação de profissionais com perfil multidisciplinar altamente qualificados. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (6) . , Integrantes: Diego César Batista Mariano - Integrante / Raquel Cardoso de Melo Minardi - Coordenador.
2011 - 2012

Comparando o desempenho de Bancos de Dados NoSQL e Relacionais manipulando dados biológicos, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Sandro Renato Dias em 19/08/2013., Descrição: Apresentar o uso de bancos de dados relacionais e não relacionais do tipo NoSQL para controlar e manipular grandes quantidades de dados, comparando o desempenho de um SGBD (Sistema de Gerenciamento de Bancos de Dados) não relacional, o MongoDB, com um SGBD relacional, o MySQL. Tem como objetivo verificar as vantagens e as desvantagens do uso de bancos de dados não relacionais em comparação aos bancos de dados relacionais, utilizando a base de dados biológicos PDB (Protein Data Bank) para testes de leitura de arquivos em disco e gravação de seu conteúdo nos SGBDs. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Diego César Batista Mariano - Coordenador / Sandro Renato Dias - Integrante / Edgar Lacerda de Aguiar - Integrante., Número de produções C, T & A: 3

Prêmios

2025

Qiagen Digital Insights Excellence Award - Honorable Mention - "Education and outreach", X-Meeting 2025 - 21º Congresso Brasileiro de Bioinformática".

2025

Honorable Mention, XVIII Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB).

2022

Prêmio de start-up que mais evoluiu - SimplificaSVS, INOVA LABS | SVS | Fiocruz.

2022

Prêmio de Inovação e Dados - SimplificaSUS, Ministério da Saúde | Campus Party.

2020

ISCB Wikipedia Competition Winner - Article: "Structural Bioinformatics", ISCB.

2020

Honorable Mention Award - Categoria: "Database and Software Development", X-meeting eXperience.

2020

Prêmio UFMG de teses pelo PPG em Bioinformática em 2019, UFMG.

2020

Melhor tese no Brasil na área de Bioinformática em 2019, AB3C.

2018

ISCB Wikipedia Competition Winner - Article: "Biostatistics", ISCB.

2017

Best Paper Award - "Oral presentation", 2nd Brazilian Student Council Symposium.

2016

Best Poster Award - "Proteins and Proteomics", X-meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C.

2016

Best Poster Award - "Software Development and Databases", X-meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C.

2014

Best Poster Award - "People's choice", ISCB - Latin America X-Meeting on Bioinformatics with BSB and SoiBio 2014.

2013

Prêmio Anhanguera de Mérito Científico e Acadêmico - Categoria: Programa de Iniciação Científica - Ciências Exatas, da Terra e Engenharias, Anhanguera Educacional.

2006

Menção honrosa - "Olimpíada Brasileira de Matemática", Instituto Nacional de Matemática Pura e Aplicada - IMPA.

2004

Medalha de bronze - "Olimpíada Brasileira de Astronomia", Agência Espacial Brasileira.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade Federal de Minas Gerais, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. , Laboratório de Bioinformática e Sistemas (DCC/UFMG - SALA 4340). Avenida Presidente Antônio Carlos, 6627 - Instituto de Ciências Exatas, Pampulha, 31270010 - Belo Horizonte, MG - Brasil, Telefone: (31) 34095810, URL da Homepage:

Experiência profissional

2019 - Atual

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio pós-doutoral, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2015 - 2019

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2013 - 2015

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

03/2022
Extensão universitária , Instituto de Ciências Exatas.Atividade de extensão realizada, Editor da Revista BIOINFO.
08/2018
Ensino, Ciências da Computação, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Ambientes em Computação (estágio a docência)
02/2024 - 07/2024
Ensino, Ciências da Computação, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Ambientes em Computação
08/2023 - 12/2023
Ensino, Ciências da Computação, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Visualização de dados (estágio à docência)
03/2018 - 07/2018
Ensino, Bioinformática, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Tópicos em Bioinformática II: Introdução à Programação Python Aplicada à Bioinformática
08/2013 - 11/2013
Ensino, Bioinformática, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Introdução à Linguagem de Programação Perl (estágio à docência)

2012 - 2013

Evolua Comunicação

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Analista desenvolvedor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2011 - 2012

Serviço Nacional de Aprendizagem Comercial - SENAC Minas

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 15

Outras informações:
Professor do curso de Hardware - Manutenção de computadores

2011 - 2012

Prefeitura Municipal de Lagoa Santa

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Técnico em informática, Carga horária: 30

2011 - 2012

FACULDADE ANHANGUERA DE BELO HORIZONTE

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação científica, Carga horária: 6

2013 - 2013

Universidad de Salamanca

Vínculo: Estudante de Intercâmbio, Enquadramento Funcional: Estudante de Intercâmbio, Regime: Dedicação exclusiva.

2020 - 2021

SAGAH - Soluções Educacionais Integradas

Vínculo: Professor conteudista, Enquadramento Funcional: Professor conteudista (PJ/MEI)

Atividades

01/2020
Ensino, Tecnologia da informação (EAD), Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Data Mining, Infraestrutura de TI, Processamento de Linguagem Natural, Programação Back-end III

2021 - 2021

Anhanguera Educacional

Vínculo: Professor conteudista, Enquadramento Funcional: Professor conteudista (PJ/MEI)

Atividades

01/2021
Ensino, Tecnologia da informação (EAD), Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Desenvolvimento web, Estrutura de dados

2023 - 2024

Ministério Agricultura e Pecuária

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor web, Carga horária: 20

Outras informações:
Projeto em parceria entre MAPA, UFV e UFMG

2021 - 2023

Fundação de Desenvolvimento da Pesquisa

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor web - UFMG/MPMG, Carga horária: 20

Outras informações:
Projeto 28295 - PROGRAMA DE CAPACIDADES ANALÍTICAS - Ministério Público do Estado de Minas Gerais e Universidade Federal de Minas Gerais

2023 - 2024

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor web (MEI)

Outras informações:
Desenvolvedor web autônomo - Projeto Haplo2D6