Processo de busca automática de sequência de adn/arn codificante baseado em padrões observados nas frequências de nucleotídeos na escala dos códons

  • Número do pedido da patente:
  • PI 1001614-7 A2
  • Data do depósito:
  • 18/05/2010
  • Data da publicação:
  • 09/10/2007
Inventores:
  • Classificação:
  • G06F 19/18
    Equipamentos ou m?todos de computação digital ou de processamento de dados, especialmente adaptados para aplica??es espec?ficas; / Bioinform?tica, i.e. m?todos ou sistemas para processamento de dados gen?ticos ou relacionados a prote?nas em biologia molecular computacional; / para prote?mica ou gen?mica funcional, p. ex. associa??es gen?tipo-fen?tipo, desequil?bio de liga??o, gen?tica de popula??es, identifica??o do local de liga??o, mutag?nese, anota??o do genoma ou gen?tipo, intera??es prote?na-prote?na ou intera??es prote?na-?cido nucleico;
    ;
    G06F 19/22
    Equipamentos ou m?todos de computação digital ou de processamento de dados, especialmente adaptados para aplica??es espec?ficas; / Bioinform?tica, i.e. m?todos ou sistemas para processamento de dados gen?ticos ou relacionados a prote?nas em biologia molecular computacional; / para compara??o de sequ?ncias envolvendo nucleot?deos ou amino ?cidos, p. ex. busca de homologia, motivo ou descoberta de SNP [Polimorfismo de um ?nico Nucleot?deo] ou alinhamento de sequ?ncia;
    ;

PROCESSO DE BUSCA AUTOMÁTICA DE SEQUÊNCIAS DE ADN/ARN CODIFICANTE BASEADO EM PADRÕES OBSERVADOS NAS FREQUÊNCIAS DE NUCLEOTÍDEOS NA ESCALA DOS CÓDONS , trata especialmente de um processo que, destina-se a detectar o maior nível do viés de purinas com uma função F comparando as três posições dos conjuntos de três nucleotídeos consecutivos e não sobrepostos duma seqúência de DNA nos seis quadros, em que F permite diagnosticar o caractere codificante ou não-codificante de tal sequência, determinar a fita codificante duma seqúência codíficante e detectar o quadro de leitura duma seqtlência codificante, Pelo fato do viés de purinas ser um padrão característico das sequências codificantes oriundos das propriedades fisico-químicas das proteínas, o novo processo apenas mencionado é universal não havendo necessidade de recorrer a alinhamento com sequências homólogas ou determinação preliminar da freqúência dos códons e pode ser usado para diagnóstico e busca automática de sequências codificantes em contexto de janela deslizante combinando a detecção do caracter codificante, da fita codificante e do quadro de leitura,

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