Danilo Oliveira Imparato

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Produções bibliográficas

• EICHEMBERGER RIUS, FLÁVIA ; SANTA CRUZ GUINDALINI, RODRIGO ; VIANA, DANILO ; SALOMÃO, JÚLIA ; GALLO, LAILA ; FREITAS, RENATA ; BERTOLACINI, CLÁUDIA ; TANIGUTI, LUCAS ; IMPARATO, DANILO ; ANTUNES, FLÁVIA ; SOUSA, GABRIEL ; ACHJIAN, RENAN ; FUKUYAMA, ERIC ; GREGÓRIO, CLEANDRA ; VENTURA, IURI ; GOMES, JULIANA ; TANIGUTI, NATHÁLIA ; MAISTRO, SIMONE ; KRIEGER, JOSÉ EDUARDO ; ZHENG, YONGLAN ; et.al . A Breast Cancer Polygenic Risk Score Validation in 15,490 Brazilians Using Exome Sequencing. Diagnostics , v. 15, p. 1098, 2025.

• MICHAELSEN, GUSTAVO LOVATTO ; DE SOUSA MONTEIRO, TAYRONE ; IMPARATO, DANILO OLIVEIRA ; DA COSTA, JOÃO VITOR ALMEIDA ; SILVA, DANIEL ROCHA ; DE SOUZA, IARA DANTAS ; DA RIBEIRO-DANTAS, MARCEL CÂMARA ; CABRAL-MARQUES, OTÁVIO ; SINIGAGLIA, MARIALVA ; DALMOLIN, RODRIGO JULIANI SIQUEIRA . Medulloblastoma?s master regulators and their association with patients? risk. Scientific Reports , v. 15, p. 1, 2025.

• IMPARATO, DANILO OLIVEIRA ; CAVALCANTE, JOÃO VITOR FERREIRA ; DALMOLIN, RODRIGO JULIANI SIQUEIRA . easylayout: an R package for interactive force-directed layouts within RStudio. arXiv , v. 1, p. 1, 2024.

• CAMPOS, LEONARDO R S ; TREFFLICH, SHEYLA ; MORAIS, DIEGO A A ; IMPARATO, DANILO O ; CHAGAS, VINICIUS S ; ALBANUS, RICARDO D?OLIVEIRA ; DALMOLIN, RODRIGO J S ; CASTRO, MAURO A A . Bridge: A New Algorithm for Rooting Orthologous Genes in Large-Scale Evolutionary Analyses. MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION , v. 41, p. 1, 2024.

• RIBEIRO-DANTAS, MARCEL DA CÂMARA ; OLIVEIRA IMPARATO, DANILO OLIVEIRA ; DALMOLIN, MATHEUS GIBEKE SIQUEIRA ; DE FARIAS, CAROLINE BRUNETTO ; BRUNETTO, ANDRÉ TESAINER ; DA CUNHA JAEGER, MARIANE ; ROESLER, RAFAEL ; SINIGAGLIA, MARIALVA ; SIQUEIRA DALMOLIN, RODRIGO JULIANI . Reverse Engineering of Ewing Sarcoma Regulatory Network Uncovers PAX7 and RUNX3 as Master Regulators Associated with Good Prognosis. Cancers , v. 13, p. 1860, 2021.

• OLIVEIRA, RAFFAEL AZEVEDO DE CARVALHO ; IMPARATO, DANILO OLIVEIRA ; FERNANDES, VÍTOR GABRIEL SALDANHA ; CAVALCANTE, JOÃO VITOR FERREIRA ; ALBANUS, RICARDO D?OLIVEIRA ; DALMOLIN, RODRIGO JULIANI SIQUEIRA . Reverse Engineering of the Pediatric Sepsis Regulatory Network and Identification of Master Regulators. Biomedicines , v. 9, p. 1297, 2021.

• VISCARDI, LUCAS HENRIQUES ; IMPARATO, DANILO OLIVEIRA ; BORTOLINI, MARIA CÁTIRA ; DALMOLIN, RODRIGO JULIANI SIQUEIRA . Ionotropic receptors as a driving force behind human synapse establishment. Molecular Biology and Evolution , v. 999, p. 999, 2020.

• OLIVEIRA, RAFFAEL AZEVEDO DE CARVALHO ; DE ANDRADE, ABRAÃO SILVEIRA ; IMPARATO, DANILO OLIVEIRA ; DE LIMA, JULIANA GABRIELA SILVA ; DE ALMEIDA, RICARDO VICTOR MACHADO ; LIMA, JOÃO PAULO MATOS SANTOS ; PASQUALI, MATHEUS AUGUSTO DE BITTENCOURT ; DALMOLIN, RODRIGO JULIANI SIQUEIRA . Analysis of Arabidopsis thaliana Redox Gene Network Indicates Evolutionary Expansion of Class III Peroxidase in Plants. Scientific Reports , v. 9, p. 15741, 2019.

• REIS, CLOVIS F. ; DE SOUZA, IARA D. ; MORAIS, DIEGO A. A. ; OLIVEIRA, RAFFAEL A. C. ; IMPARATO, DANILO O. ; DE ALMEIDA, RITA M. C. ; DALMOLIN, RODRIGO J. S. . Systems Biology-Based Analysis Indicates Global Transcriptional Impairment in Lead-Treated Human Neural Progenitor Cells. Frontiers in Genetics , v. 10, p. 791, 2019.

• NOGUEIRA, VIVIANE BRITO ; IMPARATO, DANILO OLIVEIRA ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; DE SOUSA, MARIA BERNARDETE CORDEIRO . Sex-biased gene expression in the frontal cortex of common marmosets ( Callithrix jacchus ) and potential behavioral correlates. Brain and Behavior , v. 8, p. e01148, 2018.

• NOGUEIRA, VIVIANE BRITO ; IMPARATO, DANILO OLIVEIRA ; Souza, Sandro José de ; Sousa, Maria Bernardete Cordeiro de . CajaDB: A DATABASE OF COMMON MARMOSETS (Callithrix jacchus). In: Lais Daiene Cosmoski. (Org.). Difusão do Conhecimento Através das Diferentes Áreas da Medicina 3. 1ed.: Atena Editora, 2019, v. 3, p. 21-32.

• IMPARATO, DANILO OLIVEIRA ; CAVALCANTE, JOÃO VITOR FERREIRA ; DALMOLIN, RODRIGO JULIANI SIQUEIRA . Ever used Cytoscape? Try easylayout. In: X-Meeting / BSB 2023, 2023, Curitiba. X-Meeting presentations, 2023.

• IMPARATO, DANILO OLIVEIRA ; RIBEIRO-DANTAS, MARCEL DA CÂMARA ; DALMOLIN, RODRIGO JULIANI SIQUEIRA . Exploring the Expression of Ewing Sarcoma Master Regulators Yields Models That Tell Tumors Apart. In: GENÉTICA 2022 - 67 Brazilian Congress of Genetics, 2022, Natal. GENÉTICA 2022 - 67 Brazilian Congress of Genetics, 2022.

• IMPARATO, D. O. ; VISCARDI, L. H. ; BORTOLINI, M. C. ; DALMOLIN, R. J. S. . Evolution of the human neurotransmission network. In: Natal Bioinformatics Forum, 2019. Natal Bioinformatics Forum, 2019.

• REIS, C. F. ; SOUZA, I. D. ; MORAIS, D. A. A. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; IMPARATO, D. O. ; DALMOLIN, R. J. S. . Chumbo grosso - Transcriptogramer analisa o efeito progressivo da intoxicação por chumbo nos sistemas genéticos de células progenitoras neurais. In: III Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2018, Recife. Anais do III Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática, 2018. p. 13-13.

• IMPARATO, D. O. ; VISCARDI, L. H. ; BORTOLINI, M. C. ; DALMOLIN, R. J. S. . Evolução da Rede de Genes de Neurotransmissão em Humanos. In: III Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2018, Recife. III Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2018.

• VISCARDI, L. H. ; IMPARATO, D. O. ; BORTOLINI, M. C. ; DALMOLIN, R. J. S. . Eukaryotic Evolutionary Network of Neurotransmitters. In: ICPB2017 - Systems Biology Satellite, 2017. ICPB2017 - Systems Biology Satellite, 2017.

• VISCARDI, L. H. ; IMPARATO, D. O. ; BORTOLINI, M. C. ; DALMOLIN, R. J. S. . Análise Evolutiva da Rede de Neurotransmissores em Eucariotos. In: II Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2017. III Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2017.

• IMPARATO, D. O. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; ANDRADE, A. S. ; PASQUALI, M. A. B. ; DALMOLIN, R. J. S. . Power law correlation between gene connectivity and number of citations. In: 45a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2016, Natal. 45a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2016.

• ANDRADE, A. S. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; IMPARATO, D. O. ; PASQUALI, M. A. B. ; JERONIMO, S. M. B. ; DALMOLIN, R. J. S. . Macrophage antioxidant mechanisms modulation in Leishmanis infection. In: 45a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2016, Natal. 45a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2016.

• OLIVEIRA, R. A. C. ; IMPARATO, D. O. ; LIMA, J. G. S. ; PASQUALI, M. A. B. ; LIMA, J. P. M. S. ; DALMOLIN, R. J. S. . Antioxidant Gene Network of Arabidopsis thaliana and its response towards heat stress. In: 45a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2016, Natal. 45a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2016.

• OLIVEIRA, R. A. C. ; IMPARATO, D. O. ; LIMA, J. G. S. ; PASQUALI, M. A. B. ; LIMA, J. P. M. S. ; DALMOLIN, R. J. S. . A Systems Biology Approach to Characterize Arabidopsis thaliana antioxidant network. In: I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016, Natal. I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016.

• IMPARATO, D. O. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; ANDRADE, A. S. ; PASQUALI, M. A. B. ; DALMOLIN, R. J. S. . Gene citations and number of interactions follow a power law. In: I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016, Natal. I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016.

• ANDRADE, A. S. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; IMPARATO, D. O. ; PASQUALI, M. A. B. ; JERONIMO, S. M. B. ; DALMOLIN, R. J. S. . Macrophage redox metabolism activation during Leishmania infection. In: I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016, Natal. I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática, 2016.

• IMPARATO, D. O. ; OLIVEIRA, R. A. C. ; ANDRADE, A. S. ; PASQUALI, M. A. B. ; DALMOLIN, R. J. S. . Power law correlation between gene connectivity and number of citations. In: SB-Meeting 2016, 2016, Natal. SB-Meeting 2016, 2016.

• IMPARATO, D. O. ; VISCARDI, L. H. ; BORTOLINI, M. C. ; DALMOLIN, R. J. S. . Evolution of the Human Neurotransmission Network. 2019. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• CAMPOS, I. B. ; IMPARATO, D. O. ; ARAUJO, J. F. . Sistema de Detecção de Atenção Baseado na Variabilidade da Frequência Cardíaca. 2018. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

• IMPARATO, D. O. ; VISCARDI, L. H. ; BORTOLINI, M. C. ; DALMOLIN, R. J. S. . Evolução da Rede de Genes de Neurotransmissão em Humanos. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• VISCARDI, L. H. ; IMPARATO, D. O. ; BORTOLINI, M. C. ; DALMOLIN, R. J. S. . Análise Evolutiva da Rede de Neurotransmissores em Eucariotos. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• IMPARATO, D. O. ; DALMOLIN, R. J. S. . Gene citations and number of interactions follow a power law. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• IMPARATO, D. O. ; DALMOLIN, R. J. S. . Power law correlation between gene connectivity and number of citations. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• IMPARATO, D. O. ; MORAIS, C. M. G. R. . O olho, o telescópio e a observação do céu. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

• 2016 - Atual

  Construção e validação do mapa metabólico da intoxicação por chumbo, Descrição: O chumbo é um dos metais pesados mais estudados atualmente por estar envolvido em casos de intoxicação ocupacional em indivíduos que trabalham em indústrias ou realizam atividades que manipulam este metal. Muitos efeitos do chumbo no organismo já foram reportados na literatura, observando-se ter um caráter sistêmico, especialmente neurológico. Embora haja indícios de como ele afeta a homeostase em nível celular, a descrição das rotas metabólicas afetadas na intoxicação por chumbo ainda não está completamente estabelecida. A fim de esclarecer os efeitos da intoxicação por chumbo, objetiva-se construir um mapa metabólico das rotas celulares e bioquímicas alteradas pela presença deste metal. Para isso, utilizaremos ferramentas de bioinformática, baseadas em textmining, a fim de obtermos informações sobre as interações do chumbo com biomoléculas. O mapa metabólico será posteriormente validado utilizando-se dados experimentais obtidos de repositórios públicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Danilo Oliveira Imparato - Integrante / RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN - Coordenador / IARA DANTAS DE SOUZA - Integrante / ABRAÃO SILVEIRA DE ANDRADE - Integrante.

• 2015 - 2016

  CONTRUÇÃO DE REDE TRANSCRICIONAL PARA A IDENTIFICAÇÃO DA REGULADORES MESTRES DE SESPSE HUMANA UTILIZANDO DADOS TRANSCRICIONAIS DE REPOSITÓRIOS PÚBLICOS, Descrição: A sepse é uma síndrome complexa, disparada pela infecção microbiana e induzida pela ativação sistêmica de múltiplas vias de resposta inflamatória, resultando na disfunção aguda de alguns órgãos e culminando em falência múltipla (Rinaldi et al., 2009). Levando em conta as características complexas da progressão da doença, a avaliação sistêmica da atividade transcricional destes pacientes pode auxiliar na compreensão da fisiopatologia da doença. A construção das redes regulatórias específicas à doença possibilitará a identificação dos principais fatores de transcrição envolvidos na progressão do quadro patológico. A aplicação dessa metodologia poderá auxiliar não só na compreensão da sepse como também na indicação de possíveis estratégias de intervenção. A avaliação da sepse sob uma óptica de biologia de sistemas pode contribuir na compreensão da doença por trazer uma visão de quais os sistemas celulares estão sendo modulados no processo de progressão da resposta fisiológica do paciente, ao invés da identificação de quais genes estão sendo mais ou menos transcritos. Embora aparentemente sutil, a diferença entre estas duas abordagens reflete diretamente no entendimento organizacional da resposta do paciente frente à patologia. Da mesma forma, a reconstrução da rede regulatória da doença possibilitará a eleição de qual fator de transcrição está envolvido na modulação dos sistemas celulares responsivos à sepse. Assim, não só teremos uma maior compreensão dos sistemas celulares envolvidos na fisiopatologia da sepse, como também poderemos abordar a regulação destes sistemas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Danilo Oliveira Imparato - Integrante / RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN - Coordenador / MATHEUS AUGUSTO DE BITTENCOURT PASQUALI - Integrante / NATÁLIA CABRAL SOUZA - Integrante / RAFFAEL AZEVEDO DE CARVALHO OLIVEIRA - Integrante.

Prêmios