Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin

Possui graduação em Ciências Biológicas com ênfase em Biologia Molecular, Celular e Funcional (2005), Mestrado em Ciências Biológicas: Bioquímica (2008) e Doutorado em Ciências Biológicas: Bioquímica (2012) pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Possui experiência em Bioinformática, Biologia de Sistemas e Evolução de Sistemas Bioquímicos. É Professor Associado do Departamento de Bioquímica da Universidade Federal do Rio Grande do Norte. Desenvolve suas atividades de pesquisa junto ao Bioinformatics Multidisciplinary Environment (BioME - IMD, UFRN). É o atual coordenador do Programa de Pós-graduação em Bioinformática da UFRN e membro permanente do Programa de Pós-graduação em Bioinformática da mesma Universidade. É membro da diretoria da Sociedade Brasileira de Genética e editor da área de bioinformática da Editora da Sociedade Brasileira de Bioinformática. É membro do conselho científico e tecnológico do Núcleo de Processamento de Alta Desempenho da UFRN. Seus projetos de pesquisa atuais envolvem a avaliação de redes biológicas, com ênfase em redes de interação proteína-proteína e redes regulatórias, evolução de sistemas bioquímicos e produção de ferramentas de bioinformática para análise de sistemas biológicos. Website: https://dalmolingroup.imd.ufrn.br/

Informações coletadas do Lattes em 26/08/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)

2008 - 2012

Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS DE BIOINFORMÁTICA PARA O ESTUDO EVOLUTIVO DE SISTEMAS BIOQUÍMICOS
, Ano de obtenção: 2012. José Cláudio Fonseca Moreira. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: evolution; sistem-biology; evolutionary-plasticity.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Evolução Bioquímica. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia de Sistemas.

Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)

2006 - 2008

Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: Aumento da Atividade da MMP-2 Induzido por Tratamento com Retinol e Ácido Retinóico em Células de Sertoli Cultivadas
, Ano de Obtenção: 2008.José Cláudio Fonseca Moreira.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Graduação interrompida em 2013 em Estatística

2012 - Atual

Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Ano de interrupção: 2013

Graduação em Ciências Biológicas

1997 - 2005

Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: Indução de Apoptose e Focos Proliferativos em Culturas de Células de Sertoli Tratadas com Retinol
Orientador: José Claudio Fonseca Moreira

Pós-doutorado

2012 - 2014

Pós-Doutorado. , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil. , Bolsista do(a): FUNDACAO DE AMPARO A PESQUISA DO ESTADO DO RIO GRANDE DO SUL, FAPERGS, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioinformática.

Formação complementar

2013 - 2013

RNA-Seq analysis using Bioconductor. (Carga horária: 60h). , Bioconductor, BIOCONDUCTOR, Estados Unidos.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Pouco.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia de Sistemas.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Evolução Bioquímica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Estresse oxidativo.

Organização de eventos

Dalmolin, R. J. S. . V Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática. 2022. (Congresso).

DALMOLIN, R ; SOUZA, S. J. ; COSTA, C. R. ; SOUZA, G. A. ; MOIOLI, R. C. ; MATOS, J. P. ; FERREIRA, B. S. . Natal Bioinformatics Forum. 2019. (Congresso).

DALMOLIN, R.J. . ICBP2017 - Systems Biology Satellite. 2017. (Congresso).

DALMOLIN RJS . I Simpósio Norte-Nordeste de BioInformática. 2016. (Congresso).

DALMOLIN RJS ; SOUZA, S. J. ; MATOS, J. P. . SB-Meeting 2016. 2016. (Congresso).

Participação em eventos

21º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X Meeting 2025. Prêmio Jovem Bioinformata. 2025. (Congresso).

4th Summer Retreat on Bioinformatics and Complex Networks.Tracing the Evolutionary Roots of Genetic Systems. 2025. (Encontro).

54° Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology (SBBq). Artificial Intelligence and Bioinformatics in the Study of Biochemical System Evolution. 2025. (Congresso).

11° Curso de Inverno do PBC.Enraizamento evolutivo de sistemas genéticos. 2024. (Simpósio).

69° Congresso Brasileiro de Genética. Regulatory lncRNAs in metastatic castration-resistant prostate cancer. 2024. (Congresso).

IV Simpósio CeGenBio.Palestra LncRNAs regulatórios em câncer de próstata resistente à castração. 2024. (Simpósio).

VI Sinpósio Norte-Nordeste de Bioinformática.Biologia de sistemas e bioinformática. 2023. (Simpósio).

X-Meeting 2023. System Biology Symposium. 2023. (Congresso).

XXIV Encontro de Genética do Nordeste. Bioinformática aplicada as ômicas. 2023. (Congresso).

3th International Meeting on Oncology Reserch. Regulatory network inference in solid pediatric tumors. 2022. (Congresso).

67th Brazilian Congress of Genetics. Bioinformatics and system biology approaches to understand distinct outcomes from genetic variation. 2022. (Congresso).

V Simpósio Norte-Nordeste de Campina Grande. Abordagens transcriptômicas em doenças complexas.. 2022. (Congresso).

XX Congress of the Brazilian Society for Cell Biology. The evolution of human synapses. 2021. (Congresso).

Genobio 20. Painel: Futuro da genômica e bioinformática. 2020. (Congresso).

III SIBI - International Symposium on Integrative Bioinformatics. Evolutionary analysis of the human neurotransmission network. 2019. (Congresso).

EnGene - XXII Encontro de Genética do Nordeste. Os avanços da bioinformática e da genética na atualidade. 2018. (Congresso).

III Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática.Análise evolutiva da rede humana de neurotransmissores.. 2018. (Simpósio).

SIBI 2018 - II Simposio Internacional en Bioinformática Integrativa.Reconstruction of Ewing Sarcoma regulatory network. 2018. (Seminário).

9th IUPAP International Conference on Biological Physics. Evolutionary rooting of biologycal systems. 2017. (Congresso).

62°Congresso Brasileiro de Genética 30° REGEM. Evolutionary rooting of biological systems. 2016. (Congresso).

I Ciclo de Palestras e Minicursos de Engenharia de Alimentos.Bioinformática em Processos Biotecnológicos. 2016. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: Pedro Marçal Barcelos

CABRAL-MARQUES, OTAVIO; RAMOS, R. N.; BARGUIL, P. P. F.;DALMOLIN, RODRIGO J. S.. Caracterização da rede regulatória e descoberta de genes prognósticos em gliomas. 2025. Dissertação (Mestrado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: DOUGLAS FELIPE DE LIMA SILVA

AGNEZ-LIMA, L. F.;Dalmolin, Rodrigo J.S.; VASCONCELOS, A. T. R.. Análise genômica de microrganismos degradadores de hidrocarbonetos do petróleo e seu potencial de atuação em hidrocarbonetos prioritários. 2023. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: EPITÁCIO DANTAS FARIAS FILHO

FERREIRA, B. S.; TERREMATTE, P. C. A.; PASCHOAL, A. R.;Dalmolin, R. J. S.. ASSINATURA TRANSCRICIONAL DE CARCINOMA RENAL DE CÉLULAS CLARAS BASEADA NO RNA ENDÓGENO COMPETIDOR. 2023. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: ARTHUR RIBEIRO DOS SANTOS

ARAUJO, G. S.; LOBATO, B. L. S.; LOPES, K. P.;Dalmolin, R. J. S.. ANÁLISE DE REDE DE CO-EXPRESSÃO DIFERENCIAL NO GIRO FUSIFORME DESTACA NOVAS INTERAÇÕES GENE-GENE NA DOENÇA DE ALZHEIMER. 2022. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Luzia Valberlígia Batista Gonçalves

PASQUALI, M. A. B.DALMOLIN, RODRIGO J S; GUSMAO, T. A. S.. Avaliação bioquímica dos níveis de vitamina A em indivíduos participantes do Programa Nacional de Suplementação de Vitamina A do Ministério da Saúde.. 2021. Dissertação (Mestrado em Recursos Naturais) - Universidade Federal de Campina Grande.

Aluno: Henrique Chapola

PORTELA, L. V. C.; SPILKI, F. R.;Dalmolin, R. J. S.; BARBE-TUANA, F. M.. ASSINATURA DA INFECÇÃO SEVERA COM SARS-COV-2 EM BIÓPSIAS PULMONARES E O SEU USO PARA O REPOSICIONAMENTO DE FÁRMACOS: Estudo comparativo de dados de amostras clínicas e de modelos pré-clínicos. 2021. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Lukas Iohan Carvalho

COSTA, M. R.;Dalmolin, R. J. S.; VELHO, T. A. F.; REIS, R. A. M.. Análises de redes modulares de co-expressão gênica revelam vias importantes na doença de Alzheimer e Paralisia Supranuclear Progressiva. 2021. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: SUELMA FERREIRA DO ORIENTE

Pasquali, Matheus A. Bittencourt; MATA, M. E. R. M. C.;Dalmolin, Rodrigo JS. CARACTERIZAÇÃO BIOQUÍMICA DO QUEIJO MINAS FRESCAL CAPRINO DO SEMIÁRIDO PARAIBANO. 2020. Dissertação (Mestrado em Recursos Naturais) - Universidade Federal de Campina Grande.

Aluno: DANILO LOPES MARTINS

SOUZA, J. E. S.; SANTOS, S. E. B.;Dalmolin, Rodrigo JS. ANÁLISE EXPLORATÓRIA DO TRANSCRIPTOMA DO ARAPAIMA GIGAS. 2020. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Aquiles Sales Craveiro Sarmento

CAMPOS, J. T. A. M.;DALMOLIN, R.J.; FAYH, A. P. T.; MONTENEGRO JUNIOR, R. M.; REZENDE, A.A.. ALTERAÇÕES NA HOMEOSTASE REDOX E DO RETÍCULO ENDOPLASMÁTICO: MECANISMOS ASSOCIADOS À LIPODISTROFIA GENERALIZADA CONGÊNITA DO TIPO 2. 2019. Dissertação (Mestrado em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Júlia Firme Freitas

AGNEZ-LIMA, L. F.; PORTO, A. L. F.;Dalmolin, Rodrigo JS. Caracterização da microbiota de uma amostra de petróleo do pré-sal.. 2019. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Thiago Dantas Soares

FIGUEROLA, W. B.;Dalmolin, Rodrigo JS; SIGNORETTI, A.. BIO-DIA: WEB-BASED TOOL FOR DATA AND ALGORITHMS INTEGRATION. 2019. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Gustavo Henrique Oliveira Cavalcante

DALMOLIN, RODRIGO J. S.; Lanza, DCF; COBUCCI, R. N. O.. Estudo da variabilidade genética do papilomavirus humano e determinação de alvos moleculares para detecção e tipagem. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: LUCAS FELIPE DA SILVA

SOUZA, J. E. S.; FIGUEROLA, W. B.;Dalmolin, R. J. S.. Integração de dados e desenvolvimento de métricas escalável para análise de fatores de transcrição.. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Mattheus Rodrigo Marzola Leite

CASTRO, Mauro Antônio AlvesDALMOLIN RJ; GUIZELINI, D.. REDER GALLERY: UM PORTAL PARA PUBLICAÇÕES DE ESTUDOS DE CASO. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Paraná.

Aluno: Thaís de Almeida Ratis Ramos

ESTEVES, G. H.; ORTEGA, J. M.;DALMOLIN RJ; REGO, T. G.; COUTINHO, V. R. H. M.. Desenvolvimento e uso do CORAZON: ferramenta para normalização e agrupamento de dados de expressão gênica. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Aranthya Hevelly de Lima Costa

FULCO, U. L.;DALMOLIN, R.J.; FREIRE, V. N.. ANÁLISE ENERGÉTICA DA INTERAÇÃO DO ESTRADIOL E DIETILESTILBESTROL COM O ERα.. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira

DALMOLIN, R.J.; SCORTECCI, K. C.;PASQUALI, M. A. B.. ANÁLISE EVOLUTIVA DO SISTEMA ANTIOXIDANTE DE Arabidopsis thaliana. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Marthin Silveira Borba

ALMENIDA, R. C.;DALMOLIN, R.J.; RAITTZ, R. T.. ANÁLISE DA EXPRESSÃO GÊNICA EM UM MODELO DE REDE DE ESTABILIDADE GENÔMICA EM CANCÊR COLORRETAL. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Paraná.

Aluno: NATÁLIA CABRAL SOUZA

ZANOTTO FILHO, A.; MATOS, J. P.;Dalmolin, R. J. S.. Propriedades anti-inlamatórias e antioxidantes de extratos aquosos de folhas de Tunera bubulata e Anacardium occidentale. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Iara Dantas de Souza

Dalmolin, Rodrigo JS; MATOS, J. P.; AMARAL, V. S.;CASTRO, Mauro Antônio Alves. MAPA METABÓLICO DA INTOXICAÇÃO POR CHUMBO. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: André Luis Fonseca Faustino

DALMOLIN RJS. INTEGRAÇÃO DE DADOS GENOMICOS NA IDENTIFICAÇÃO DE VIAS TUMORIGÊNICAS: UMA PERSPECTIVA DE BIOLOGIA DE SISTEMAS ANDRE. 2016. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: SHÊNIA SANTOS MONTEIRO

PASQUALI, M. A. B.; SILVA, V. F.; SOUZA, T. A. S.;Dalmolin, R. J. S.; GASPAROTTO, J.. USO DE PLANTA SUBUTILIZADA PARA PROMOVER INOVAÇÃO COM POTENCIAL PARA DESENVOLVIMENTO SOCIAL E ECONÔMICO DE REGIÕES SEMIÁRIDAS. 2025. Tese (Doutorado em Recursos Naturais) - Universidade Federal de Campina Grande.

Aluno: Laís Reis das Mercês

Ribeiro-dos-Santos, AKC; VIDAL, A. F.; BERG, V. V. D.; SOUZA, G. B. S.;DALMOLIN, RODRIGO J. S.. ANÁLISE INTEGRATIVA DOS RNAS CIRCULARES: PERFIS DE EXPRESSÃO E REDES REGULADORAS EM MIELOMA MÚLTIPLO E FUSÕES GÊNICAS. 2025. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: LUKAS IOHAN DA CRUZ CARVALHO

HEDIN-PEREIRA, C.; COSTA, M. R.; LOURENCO, M. V. C.;DALMOLIN RJS; VELHO, T. A. F.. EVALUATION OF A NEW NEURONAL INDUCTION PROTOCOL USING SINGLE-CELL RNA-SEQUENCING AND MACHINE LEARNING. 2024. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Júlia Firme Freitas

AGNEZ-LIMA, L. F.; Lanza, DCF; RAMOS, P. I.; ABRAHAO, J. S.;DALMOLIN, RODRIGO J S. Virosfera e bacteriosfera de águas residuais da cidade de Natal - RN. 2024. Tese (Doutorado em RENORBIO) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Roger Gomes da Silva

GOES NETO, A.; FRANCO, G. R.; CALIXTO, C. P. G.; ANDRADE, B. S.; ORELLANA, S. C.;DALMOLIN, RODRIGO J. S.; VARANI, A. M.. Long non-coding RNA in thermophilic fungi. 2024. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: PAULO EDUARDO TOSCANO SOARES

Lanza, DCF; ORTEGA, J. M.; FARIAS, S. T.; SAKAMOTO, T.;DALMOLIN, RODRIGO J S. Aplicação do sequenciamento de leituras curtas no estudo da variabilidade genômica de organismos relevantes para a carcinicultura. 2023. Tese (Doutorado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Dhiego Souto Andrade

COSTA, C. R.;DALMOLIN, RODRIGO J S; EFRONI, S.; FIGUEROLA, W. B.; MOIOLI, R. C.. TOWARDS ENHANCED PREDICTABILITY IN IMMUNOTHERAPY FOR CANCER THROUGH MACHINE LEARNING: A ROADMAP FOR BUILDING PREDICTIVE MODELS FROM THE T CELL RECEPTOR REPERTOIRE FEATURE ANALYSIS. 2023. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: ELISSON NOGUEIRA LOPES

GIOVANETTI, M.; ALCANTARA, L. C. J.; FRANCO, GLÓRIA REGINA; FERNANDES, G. R.; BARRETO, F. K.;Dalmolin, Rodrigo J.S.. Investigação genômica em infecções virais usando como modelo o Coronavírus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave. 2022. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Thaís de Almeida Ratis Ramos

Dalmolin, R. J. S.; ARAUJO, G. S.; MALHEIROS, Y.; REGO, T. G.; COUTINHO, V. R. H. M.. Caracterização computacional de RNAs não codificantes longos a nível unicelular associados com o desenvolvimento do tecido cardíaco e com doenças cardiovasculares. 2022. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: CARLOS ALBERTO XAVIER GONÇALVES

Dalmolin, Rodrigo JS; ORTEGA, JOSÉ MIGUEL; MINARDI, R. C. M.; BLEICHER, L.; FERNANDES, G. R.; BEM, L. E. V.. Ferramentas para determinação de origem e evolução de processos biológicos. 2021. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: WYDEMBERG JOSÉ DE ARAÚJO

AGNEZ-LIMA, L. F.; Lanza, DCF;Dalmolin, Rodrigo JS; VAINSTEIN, M. H.; VASCONCELOS, A. T. R.. IMPLICAÇÕES DO MEIO DE CULTIVO E DO SUBSTRATO HIDROFÓBICO NA OBTENÇÃO CONSÓRCIOS MICROBIANOS PRODUTORES DE BIOSSURFACTANTES E BIODEGRADADORES DE HIDROCARBONETOS RECALCITRANTES. 2021. Tese (Doutorado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Diego Marques Coelho

COSTA, M. R.;Dalmolin, R. J. S.; VELHO, T. A. F.; COSTA, M. V.; GARCEZ, P. P.. Do tecido à célula-única: como o uso de diferentes técnicas auxiliam na identificação de marcadores de eventos biológicos?. 2021. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Sheyla Trefflich

CASTRO, M. A.; ORTEGA, JOSÉ MIGUEL; FRANCO, G. R.;Dalmolin, R. J. S.; GRADIA, D. F.; VICENTE, F. F. R.. ORIGEM EVOLUTIVA DE UNIDADES REGULATÓRIAS DE EUCARIOTOS: QUEM SURGIU PRIMEIRO, REGULADORES OU REGULADOS?. 2021. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Ana Claudia Costa da Silva

COSTA, C. R.; MOHAN, M. V. G.; COPELLI, M.; VASCONCELOS, N. A. P.;Dalmolin, R. J. S.; RIBEIRO, S. T. G.. Investigação in silico do mecanismo de reorganização sináptica do sono. Um algoritmo para maximizar a capacidade computacional de redes neurais esparsas. 2021. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Katyanna Sales Bezerra

GALVAO, D. S.; ALBUQUERQUE, E. L.;Dalmolin, Rodrigo JS; FREIRE, V. N.; FULCO, U. L.. ESTUDO BIOQUÍMICO QUÂNTICO DE INTERAÇÕES ENTRE O RECEPTOR ANDROGÊNCO, RNAr E MCL-1 E LIGANTES. 2020. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Leandro Lopes de Magalháes

Ribeiro-dos-Santos, AKC;Dalmolin, Rodrigo JS; DEMACHKI, S.; SANTOS, S. E. B.; CARRARO, D. M.. RNAS CIRCULARES COMO UMA NOVA CLASSE DE REGULADORES DA EXPRESSÃO GÊNICA: UM ESTUDO SOBRE O CÂNCER DE MAMA. 2020. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Marco Antônio De Bastiani

DALMOLIN, R.J.Mombach, J. C. M.; FIGUEIRO, F.; LENZ, G.. IDENTIFICAÇÃO DE REGULADORES MESTRES EM ADENOCARCINOMA DE PULMÃO E SUA UTILIZAÇÃO PARA A PROSPECÇÃO DE COMPOSTOS ANTITUMORAIS. 2019. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: VANDECLECIO LIRA DA SILVA

SOUZA, S. J.;Dalmolin, Rodrigo JS; LAJUS, T. B. P.; Ribeiro-dos-Santos, AKC; SANTOS, S. E. B.. Bioinformática aplicada para identificação de genes de câncer/testículo e sua associação com prognóstico em uma análise pan-câncer.. 2019. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Raulzito Fernandes Moreira

MATOS, J. P.; CAVADA, B. S.; DOURADO JUNIOR, M. E.; SOUZA, S. J.;DALMOLIN, R.J.. Identificação de genes e vias moduladas na Síndrome de Guillian-Barré em bibliotecas transcriptômicas. 2018. Tese (Doutorado em Biotecnologia de Recursos Naturais) - Universidade Federal do Ceará.

Aluno: Daniele Maria Lopes Pinheiro

DALMOLIN, R.J.; UCHOA, A.; AGNEZ-LIMA, L. F.; CLEMENTE, T. K. S. L.; SANTOS, A. Q.. EFEITO DO ANTIOXIDANTE RESVERATROL FRENTE À RESPOSTA INFLAMATÓRIA NO MODELO CELULAR U937. 2018. Tese (Doutorado em Ciencias da Saúde) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Joice de Faria Poloni

DALMOLIN, R.J.; LOPEZ, P. L. C.;MOREIRA, Jose Claudio Fonseca; BONATTO, D.. ESTUDO DE VARIANTES TRANSCRICIONAIS NO CÂNCER COLORRETAL E NA METÁSTASE HEPÁTICA. 2018. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Amanda Ferreira Vidal

DALMOLIN, R.J.; Ribeiro-dos-Santos, AKC; ASSUMPCAO, P. P.; SCHNEIDER, I.; MODEIRA, F. O.. RNA CIRCULAR NO CÂNCER GÁSTRICO: UMA CLASSE EMERGENTE DE BIOMARCADOR. 2017. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Angélica Maria de Souza Leal

AGNEZ-LIMA, L. F.;DALMOLIN RJS; COSTA, M. R.; VESSONI, A. T.; MACHADO, C. R.. O papel da via de reparo por excisão de nucleotídeos na resposta ao estresse oxidativo e o estudo de alterações neuronais in vitro associados à Síndrome de Cockayne.. 2016. Tese (Doutorado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Amanda Larissa Marques de Medeiros

DALMOLIN RJS; SCORTECCI, K. C.; PRAXEDES, S. C.; CALSA JUNIOR, T.; GRANGEIRO, T. B.. CARACTERIZAÇÃO DE GENES DE REPARO DE DNA EM CANA-DE-AÇÚCAR. 2015. Tese (Doutorado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Fernando Yuri Nery do Vale

BARGUIL, P. P. F.;DALMOLIN, RODRIGO J S; CARVALHO, R. F.. INTEGRATIVE SYSTEMS ANALYSIS OF NEURO-IMMUNE SIGNATURE LINKED TO HTLV-1 INFECTION.. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Fitopatologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Mikaelly Batista da Silva

PASQUALI, M. A. B.DALMOLIN, RODRIGO J S. OBTENÇÃO E CARACTERIZAÇÃO BIOQUÍMICA DO EXTRATO DE PALMA FORRAGEIRA E AVALIAÇÃO DA MICROBIOTA DA COCHONILHA-DE- ESCAMA DURANTE INTERAÇÃO PLANTA-INSETO.. 2024. Exame de qualificação (Doutorando em Recursos Naturais) - Universidade Federal de Campina Grande.

Aluno: Júlia Firme Freitas

Lanza, DCF;DALMOLIN RJS; MACHADO, P. R. L.. Metagenoma e metatranscriptoma de patógenos presentes em amostra de água residual da cidade de Natal - RN. 2023. Exame de qualificação (Doutorando em RENORBIO) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Jenielly de Noronha Ferreira de Castro

SOUSA JUNIOR, F. C.;Dalmolin, R. J. S.; PORTO, A. L. F.. POTENCIAL BIOTECNOLÓGICO DE BACTÉRIAS ISOLADAS A PARTIR DE CONSÓRCIOS PROVENIENTES DE ÁGUA DE PRODUÇÃO EM RESERVATÓRIOS DE PETRÓLEO NO BRASIL. 2021. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Andre Mauricio Ribeiro-dos-Santos

Dalmolin, R. J. S.; SOUZA, J. E. S.; MATOS, J. P.. EXOMAS DE POPULAÇÕES NATIVO AMERICANAS DA AMAZÔNIA E SUAS IMPLICAÇÕES PARA A SAÚDE HUMANA. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Daniele Maria Lopes Pinheiro

SOUTO, J. T.; BORTOLIN, R. H.;DALMOLIN RS. O resveratrol regula a resposta inflamatória atravéz da remodelação da cromatina. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Saúde) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Jorge dos Santos Oliveira

UCHOA, A.; LAJUS, T. B. P.;Dalmolin, Rodrigo JS. Prospecção de genes aplicados à biodegradação de hidrocarbonetos e produção de surfactantes utilizando abordagens computacionais. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em RENORBIO) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Amanda Ferreira Vidal

DALMOLIN RJS; Ribeiro-dos-Santos, AKC; ASSUMPCAO, P. P.; SANTOS, S. E. B.. RNA circular no câncer gástrico: uma classe emergente de biomarcador.. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Rômulo S

DALMOLIN RJ; Lanza, DCF; MATOS, J. P.. Cavalcante. An unusual antithrombotic heparan sulfate from pacific white shrimp Litopenaeus vannamei. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: ACARIZIA EDUARDO DA SILVA

DALMOLIN RJS; SOUZA, S. J.; LAJUS, T. B. P.. O papel da proteína de ligação ao RNA Musashi-1 na radioresistência e sobrevivência de células de glioblastoma. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Matheus Becker Freitas

DALMOLIN RJBattastini, Ana Maria Oliveira. Importância da proteína colfilina-1 na resistência à cisplatina em câncer de pulmão de não-pequenas células. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Leticia Scussel Bergamin

DALMOLIN RJ. EFEITO DO CO-TRATAMENTO COM CUMARINA E TEMOZOLOMIDA EM LINHAGEM DE GLIOMA HUMANO. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Roseane Galdioli Nava

NAKAYA, HELDER; BARGUIL, P. P. F.;Dalmolin, R. J. S.. Efeitos dos Antidepressivos nas Redes de Citocinas em Leucócitos Periféricos no Transtorno Depressivo Maior (TDM). 2025. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: ARTHUR RIBEIRO DOS SANTOS

LOBATO, B. L. S.;Dalmolin, R. J. S.. IDENTIFICAÇÃO, ANOTAÇÃO E SUMARIZAÇÃO DE MÓDULOS DE GENES DIFERENCIALMENTE CO-EXPRESSOS NO PROCESSO DE NEURODEGENERAÇÃO. 2021. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: VLADIMIR VIEIRA DO NASCIMENTO

Dalmolin, Rodrigo J.S.; SOUZA, J. E. S.; VOIGT, E. L.. ESTUDO DA INFLUÊNCIA DO VOO COM O FOGUETE VSB-30 NO TRANSCRIPTOMA DE PLANTAS DE Saccharum spp. (CANA-DE-AÇÚCAR). 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: WYDEMBERG JOSÉ DE ARAÚJO

Lanza, DCF; THEODORO, R. C.;DALMOLIN, R.J.. AVALIAÇÃO DA COMUNIDADE MICROBIANA DE RESERVATÓRIO DE PETRÓLEO. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Viviane Brito Nogueira

SOUZA, A. A.;Dalmolin, R. J. S.; SOUSA, M. B. C.. Sex-biased gene expression in the frontal cortex of common marmosets (Callithrix jacchus) and prospective behavioral correlates. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Ciencias da Saúde) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Iara Dantas de Souza

Dalmolin, Rodrigo JS; MATOS, J. P.. MAPA METABÓLICO DA INTOXICAÇÃO POR CHUMBO. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Jonalson Nogueira Araújo

DALMOLIN, R; SOUZA, G. P. V. A.; QUEIROZ, A. F. S.. Investigação de novos alvos para aplicação da lectina do tipo ConM purificada das sementes da leguminosa Canavalia maritima.. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: João Paulo de Freitas Nunes

Dalmolin, R. J. S.; Antunes, E; Capistrano, L. Evolução e especialização funcional da acil-CoA oxidase 4 em viridiplantae. 2015.

Aluno: André Luis Fonseca Faustino

DALMOLIN RJS; AGNEZ-LIMA, L. F.; SOUZA, S. J.. Integração de dacos genômicos na identificação de vias tumorigênicas: uma perspectiva de biologia de sistemas. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Bruno Cesar Feltes

DALMOLIN RJS. Comparação transcriptomica entre duas raças de gado leiteiro para o estudo de biomarcadores de qualidade do leite. 2015.

Aluno: Márcia Danielle

DALMOLIN R; Chavante, S; MATOS, J. P.. A. Dantas. Comparing four genomes of Infectious Myonecrosis Virus: polymorphic sites, hypervariable regions and protein conserved domains. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: MARCEL DA CÂMARA RIBEIRO DANTAS

MARTINS, A. M.;DALMOLIN RS. Mineração de dados biológicos para compreensão da sistemática do câncer. 2017. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em ESPECIALIZAÇÃO EM BIG DATA) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: MARIA LUIZA DOS SANTOS

SALHA, D. R. A. M.;DALMOLIN, RODRIGO J. S.; JERONIMO, S. M. B.; TEIXEIRA, D. G.. VARIAÇÃO DO CONTEÚDO GENÔMICO EM LEISHMANIA INFANTUM. 2025. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Enfermagem) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: LUKAS IOHAN DA CRUZ CARVALHO

DALMOLIN, R.J.; COSTA, M. R.; LEAO, E. K. S.. EFEITOS DA ADMINISTRAÇÃO SISTÊMICA DE PILOCARPINA SOBRE A EXPRESSÃO GÊNICA NO HIPOCAMPO DE CAMUNDONGOS ADULTOS. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Juliana Medeiros de Oliveira

DALMOLIN, RODRIGO J. S.PASQUALI, M. A. B.; SALHA, D. R. A. M.. Status Redox de Macrofagos infectados com Leishmania infantum. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira

DALMOLIN RJS; de Araujo JMG; Lanza, DCF. IDENTIFICAÇÃO DE VARIAÇÕES EM SEQUÊNCIAS DE ÁCIDOS NUCLEICOS UTILIZANDO CURVAS DE DESNATURAÇÃO DE RNA SIMPLES FITA: UMA ABORDAGEM IN SILICO. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Monique Siebra Krug

DALMOLIN RJ; BONATTO, D.;de Almeida, Rita MC. Análise da Difusão Celular em Linhagens com Potencial Metastático. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Marco Antônio De Bastiani

Dalmolin, Rodrigo J.S.; BONATTO, D.. Assinatura Gênica de Resistência à Cisplatina Envolve a Rede de Cofilina-1 em Câncer de Pulmão de Não-Pequenas Células. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Marcus Fabiano de Almeida Mendes

Dalmolin, R. J. S.de Almeida, R. M. C.. Cliques consensuais em redes de co-espressão gênica em estudos de transcriptoma relacionados ao diabetes do tipo 2. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

RUSSO, C. A. M.; GALANTE, P. A. F.; SILVA, I. T.; MINARDI, R. C. M.;DALMOLIN, RODRIGO. CONCURSO PÚBLICO DE PROVAS E TÍTULOS PARA PROVIMENTO DE VAGAS DE TECNOLOGISTA DA CARREIRA DE DESENVOLVIMENTO TECNOLÓGICO ? CARGO TECNOLOGISTA (Pleno 2-1). 2024. Laboratório Nacional de Computação Científica.

PASQUALI, G.; GUIMARAES, A. C. R.;DALMOLIN, RODRIGO J. S.. CONCURSO PÚBLICO Nº 08, DE 06 DE SETEMBRO DE 2024 - Estratégias Computacionais aplicadas à Biologia Molecular. 2024. Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Antunes, E;DALMOLIN, R.J.; KLAMT, F.. Professor Adjunto do Departamento de Bioquímica da UFRN. 2018. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

DALMOLIN RJ; BARRERA, J.; VENANCIO NETO, A. J.. CONCURSO PÚBLICO DE PROVAS E TÍTULOS PARA O CARGO DE PROFESSOR DO MAGISTÉRIO SUPERIOR NA CLASSE ?A? - Área Bioinformática. 2015. Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

SCHRANK, A.; CORREIA, M. T. S.; FERREIRA, H. B.; BAILAO, E. F. L. C.; BALTAZAR, L. M.; BAILAO, A. M.; NIMRICHTER, L.;DALMOLIN, RODRIGO J. S.; MACHADO, R. L. D.. Prêmio Capes de Teses - CBI - 2025. 2025. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.

DALMOLIN, RODRIGO J. S.. Prêmio Jovem Bioinformata. 2025. Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.

SANTOS, S. E. B.;DALMOLIN, RODRIGO J S; FONTES, E.; PASSOS-BUENO, M. R. S. E.; MOURA NETO, R.. Prêmio Jovem Geneticista. 2024. Sociedade Brasileira de Genética.

DALMOLIN RJS; DORN, M.. Salão de Iniciação Científica. 2013. Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

DALMOLIN RJS. 12ª Mostratec: Mostra de Ensino, Pesquisa e Extensão. 2011. Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Rio Grande do Sul.

Orientou

Caio Gabriel Tavares Ferreira

Analise metagenîmica de ecossitemas brasileiros; Início: 2025; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);

Gleison Medeiros de Azevedo

RECONSTRUÇÃO DO CENÁRIO EVOLUTIVO DE GENES ENVOLVIDOS NO MOMENTO INICIAL DA CASCATA METASTÁTICA; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);

ODILON JULIO DOS SANTOS

Construção de redes regulatórias a partir de dados transcricionais de células únicas; Início: 2023; Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Coorientador);

Fábio Henrique Ferreira Silva

Identificação de rede de interação protei-proteína tecido-específica; Início: 2023; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);

Romério de Oliveira Lima Filho

Análise das alterações nos perfis transcricionais no Transtorno do Espectro Alcoólico Fetal; Início: 2025; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

ARTHUR RIBEIRO DOS SANTOS

ANÁLISES DE CO-EXPRESSÃO DIFERENCIAL: UM ESTUDO DE BENCHMARKING COMPUTACIONAL; Início: 2024; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Alexandre Henrique Carvalho Marques

MODELAGEM DE SISTEMAS COMPLEXOS PARA ANÁLISE DE VIAS NEUROIMUNOLÓGICAS DO TRANSTORNO DEPRESSIVO MAIOR; Início: 2024; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

JOAO VITOR FERREIRA CAVALCANTE

Relação entre microbiota intestinal e doenças neuropsiquiátricas; Início: 2024; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Epitácio Dantas de Farias Filho

Construção de redes regulatórias em cancer renal; Início: 2023; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);

BIANCA CRISTIANE FERREIRA SANTIAGO

Relação entre microbiota e doenças neuropsiquiátricas; ; Início: 2023; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);

Gustavo Lovatto Michaelsen

Perfil transcricional de células únicas em cânceres pediátricos; Início: 2023; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Instituto do Câncer Infantil; (Orientador);

TIBÉRIO AZEVEDO PEREIRA

Início: 2024; Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior;

DOUGLAS NUNES DA SILVA

Análise Transcricional do Carcinoma de Células Claras do Ovário; Início: 2025; Iniciação científica (Graduando em Tecnologia da Informação) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

JOÃO VITOR ALMEIDA DA COSTA

ASSINATURA TRANSCRICIONAL DO CÂNCER COLORRETAL METASTÁTICO; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; (Orientador);

BRUNO WILLIAM FERNANDES SILVA

Análise evolutiva revela múltiplos eventos de diversificação em vias metabólicas imunes; 2025; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Julia Apolonio de Amorim

Explorando a genética do transtorno depressivo maior: análise multi-ômica revela novos marcadores e genes efetores; 2025; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Danilo Oliveira Imparato

Easylayout: pacote R integrado a IDE para dispor grafos usando simulações de força; 2024; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

JOAO VITOR FERREIRA CAVALCANTE

O Ecossistema Computacional da Metagenômica: Fluxos de Trabalho e Reprodutibilidade; 2024; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

BIANCA CRISTIANE FERREIRA SANTIAGO

ANÁLISES METAGENÔMICAS REVELAM A INFLUÊNCIA DAS CAMADAS DEPROFUNDIDADE NA BIODIVERSIDADE MARINHA EM REGIÕES TROPICAIS E SUBTROPICAIS; 2022; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Tayrone de Sousa Monteiro

Engenharia reversa de redes regulatórias do meduloblastoma e inferência de reguladores mestres; 2021; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Igor Augusto Brandão

Abordagens da biologia de sistemas na investigação dos pontos de articulação nas rotas metabólicas do KEGG; ; 2020; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

DIEGO ARTHUR DE AZEVEDO MORAIS

Construção de pacote estatístico em R para análise transcricional; 2018; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

MARCEL DA CÂMARA RIBEIRO DANTAS

Construção de rede regulatória em sarcoma de ewing; 2018; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

NATÁLIA CABRAL SOUZA

Propriedades anti-inlamatórias e antioxidantes de extratos aquosos de folhas de Tunera bubulata e Anacardium occidentale; 2017; Dissertação (Mestrado em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Iara Dantas de Souza

Construção do mapa metabólico da intoxicação por chumbo; ; 2017; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira

ANÁLISE EVOLUTIVA DO SISTEMA ANTIOXIDANTE DE Arabidopsis thaliana; 2017; Dissertação (Mestrado em Bioquimica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Ricardo D'Oliveira Albanus

Busca de novos fármacos no tratamento de neuroblastoma utilizando ferramentas de Biologia de Sistemas; 2014; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

LEONARDO RENE DOS SANTOS CAMPOS

Inferência em Larga Escala de Raízes Evolutivas de Genes Ortólogos com o Algoritmo Bridge; 2024; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Rafaella Sousa Ferraz

Análise de RNAs não codificantes no desenvolvimento de metástase de tumores sólidos; 2024; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

DIEGO ARTHUR DE AZEVEDO MORAIS

Medusa: um fluxo de trabalho para classificação taxonômica e anotação funcional de metagenomas; ; 2022; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Iara Dantas de Souza

Análise das alterações transcricionais sexo-específicas do transtorno depressivo maior; 2022; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira

Engenharia reversa da rede regulatória da sepse pediátrica e identificação de reguladores mestres; 2021; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

NATÁLIA CABRAL SOUZA

PROPRIEDADES ANTI-INFLAMATÓRIAS E ANTIOXIDANTES DE BLENDS DO SUCO DE Malpighia emarginata D; C; (ACEROLA) E INFUSÃO DE Camellia sinensis L; (CHÁ VERDE); 2021; Tese (Doutorado em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

CLOVIS FERREIRA DOS REIS

ANÁLISE BASEADA EM BIOLOGIA DE SISTEMAS DE DADOS TRANSCRICIONAIS DE CÉLULAS PROGENITORAS NEURAIS HUMANAS TRATADAS COM CHUMBO; 2019; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, ; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Iara Dantas de Suza

2024; Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

NATÁLIA CABRAL SOUZA

Investigação de propriedades bioativas do extrato de A; occidentale; 2017; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Analises Clinics) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

DAVI RODRIGUES DE OLIVEIRA

Bioinformatics analysis with study datasets on familial hypercholesterolemia: A complementary and comparative approach; 2025; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Gleison Medeiros de Azevedo

RECONSTRUÇÃO DO CENÁRIO EVOLUTIVO DE GENES ENVOLVIDOS NO MOMENTO INICIAL DA CASCATA METASTÁTICA; 2024; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Iara Dantas de Souza

Modelos lineares generalizados para análise de expressão gênica diferencial: biomarcadores sexo-específicos no Transtorno Depressivo Maior; 2023; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Estatística) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

VITOR GABRIEL SALDANHA FERNANDES

Análise em nível de gene e transcrito revelam alterações sexo-específicas no córtex pré-frontal no transtorno depressivo maior; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Fábio Henrique Ferreira Silva

BIÓPSIA LÍQUIDA COMO FERRAMENTA DE DIAGNÓSTICO DO CÂNCER: UMA REVISÃO DA LITERATURA; 2020; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Danilo Oliveira Imparato

RECEPTORES IONOTRÓPICOS COMO FORÇA MOTRIZ DA ORIGEM DAS SINAPSES; 2020; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, proreitoria de pesquisa ufrn; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

PATRÍCIA TAINÁ BARBOSA CUNHA

ANÁLISE EVOLUTIVA DA REDE DE INTERAÇÃO DOS TRANSTORNOS MENTAIS E COMPORTAMENTAIS ASSOCIADA AO SISTEMA BIOLÓGICO DE NEUROTRANSMISSÃO; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

ALICE BARROS CÂMARA

ESTUDOS DAS RELAÇÕES ENTRE A DEFICIÊNCIA DA VITAMINA D E A DOENÇA ALZHEIMER; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Brenda Angélica Cardoso Barbosa

O PROTOZOÁRIO LEISHMANIA E SUAS PRINCIPAIS INTERAÇÕES COM OS MACRÓFAGOS; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Juliana Medeiros de Oliveira

Status Redox de Macrófagos infectados com Leishmania infantum; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Gleison Medeiros de Azevedo

Reconstrução de rede regulatória de meduloblastoma; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

JACINTA FERNANDA NOVAIS CEZAR

Reimplementação e Avaliação de Pipeline para Análise Metagenômica: Desenvolvimento do EURYALE; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

VITOR GABRIEL SALDANHA FERNANDES

ANÁLISE DE METAGENÔMICA NA INVESTIGAÇÃO DO PAPEL DA COMPOSIÇÃO DA MICROBIOTA INTESTINAL DO ESPECTRO ALTISTA; 2024; Iniciação Científica; (Graduando em Medicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Dante Amstalden Von Zuben

Análise sistêmica de alterações transcricionais em pacientes com depreção; ; 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Danilo Oliveira Imparato

Identificação de reguladores mestres e prospecção de possíveis biomarcadores de Meduloblastoma; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, proreitoria de pesquisa ufrn; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

VITOR GABRIEL SALDANHA FERNANDES

Identificação de genes essenciais a partir de exomas humanos; ; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, proreitoria de pesquisa ufrn; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

JOAO VITOR FERREIRA CAVALCANTE

Identificação de transcritos em MDD; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Hanna Nascimento Medeiros

Investigação dos grupos de ortólogos envolvidos com a interação parasita-hospedeiro em endoparasitoses; ; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin;

Produções bibliográficas

FONSECA, DENNYSON LEANDRO M. ; JÄPEL, MAJ ; GYAMFI, MICHAEL ADU ; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO ; BAIOCHI, GABRIELA CRISPIM ; OSTRINSKI, YURI ; HALPERT, GILAD ; LAVI, YAEL BUBLIL ; VOJDANI, ELROY ; SILVA-SOUSA, THAYNA ; USUDA, JÚLIA NAKANISHI ; E SILVA, JUAN CARLO SANTOS ; FREIRE, PAULA P. ; NÓBILE, ADRIEL LEAL ; ADRI, ANNY SILVA ; BARCELOS, PEDRO MARÇAL ; CORRÊA, YOHAN LUCAS GONÇALVES ; DO VALE, FERNANDO YURI NERY ; LOPES, LETÍCIA OLIVEIRA ; DALMOLIN RJS ; et.al . Dysregulated autoantibodies targeting AGTR1 are associated with the accumulation of COVID-19 symptoms. Npj Systems Biology And Applications , v. 11, p. 7, 2025.
BARCELOS, PEDRO MARÇAL ; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO ; NÓBILE, ADRIEL LEAL ; USUDA, JÚLIA NAKANISHI ; ADRI, ANNY SILVA ; DE ALBURQUERQUE, DÉBORA GOMES ; CÔRREA, YOHAN LUCAS GONÇALVES ; DO VALE, FERNANDO YURI NERY ; BAHIA, IAN ANTUNES FERREIRA ; NAVA, ROSEANE GALDIOLI ; BORONI, MARIANA ; MARQUES, ALEXANDRE H. C. ; DALMOLIN, RODRIGO ; SCHIMKE, LENA F. ; CABRAL-MIRANDA, GUSTAVO ; NAKAYA, HELDER I. ; DIAS, HAROLDO DUTRA ; FONSECA, DENNYSON LEANDRO M. ; CABRAL-MARQUES, OTAVIO . Gene regulatory networks analysis for the discovery of prognostic genes in gliomas. Scientific Reports , v. 15, p. 1, 2025.
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SILVEIRA, ANNA CLARA AZEVEDO ; DE SOUZA, IARA DANTAS ; CAVALCANTE, JOÃO VITOR FERREIRA ; TEIXEIRA, THAISE LARA ; ORIKAZA, CRISTINA MARY ; DALMOLIN, RODRIGO JULIANI SIQUEIRA ; DA SILVEIRA, JOSÉ FRANCO ; DA SILVA, CLAUDIO VIEIRA . P21 Ablation Unveils Strain-Specific Transcriptional Reprogramming in Amastigotes. International Journal of Microbiology , v. 2025, p. 1-12, 2025.
CABRAL-MARQUES, OTAVIO ; SCHIMKE, LENA F. ; MOLL, GUIDO ; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO ; NÓBILE, ADRIEL LEAL ; ADRI, ANNY SILVA ; DO VALE, FERNANDO YURI NERY ; USUDA, JÚLIA NAKANISHI ; CORRÊA, YOHAN LUCAS GONÇALVES ; ALBUQUERQUE, DÉBORA ; NAVA, ROSEANE GALDIOLI ; SANTOS, RONALDY SANTANA ; DIAS, HAROLDO DUTRA ; SILVA, HÉLIO FERNANDES ; MARCONI, PEDRO BATISTA ; CATAR, RUSAN ; ADU-GYAMFI, MICHAEL ; WANG, PINCHAO ; KHAN, TAJ ALI ; DALMOLIN RJS ; et.al . Advancing research on regulatory autoantibodies targeting GPCRs: Insights from the 5th international symposium. AUTOIMMUNITY REVIEWS , v. 00, p. 103855, 2025.
CAMPOS, LEONARDO RS ; TREFFLICH, SHEYLA ; MORAIS, DIEGO AA ; IMPARATO, DANILO O ; CHAGAS, VINICIUS S ; ALBANUS, RICARDO D?OLIVEIRA ; Dalmolin, Rodrigo JS ; Castro, Mauro AA . : A New Algorithm for Rooting Orthologous Genes in Large-Scale Evolutionary Analysis. MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION , v. x, p. x-x, 2024.
RODRIGUES, KAROLINE DOS SANTOS ; CAETANO, DANIEL STURZA LUCAS ; CAVALCANTE, JOÃO VITOR ; DALMOLIN, RODRIGO ; ZIEGELMANN, PATRÍCIA K. ; ANDRADES, MICHAEL . What Powers Trastuzumab's Cardiotoxicity? Decoding Mitochondrial-Related Gene Expression Through Integrative Review and Meta-Analysis in Cardiomyocytes. OMICS: A Journal of Integrative Biology , v. xxx, p. xxx-xxx, 2024.
MICHAELSEN, GUSTAVO LOVATTO ; DA SILVA, LÍVIA DOS REIS EDINGER ; DE LIMA, DOUGLAS SILVA ; JAEGER, MARIANE DA CUNHA ; BRUNETTO, ANDRÉ TESAINER ; DALMOLIN, RODRIGO JULIANI SIQUEIRA ; SINIGAGLIA, MARIALVA . A Prognostic Methylation-Driven Two-Gene Signature in Medulloblastoma. Journal of Molecular Neuroscience , v. 74, p. 47, 2024.
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DALMOLIN RJS ; Castro, Mauro A. A. ; Rybarczyk Filho, José L ; Souza, Luis HT ; BRUNNET, LEONARDO G. ; DE ALMEIDA, RITA M. C. ; Moreira, José Cláudio Fonseca . BUSCA DE PADRÕES TRANSCRICIONAIS COMO BIOMARCADORES TUMORAIS. In: III Mostra da Bioquímica, 2011, Porto Alegre. III Mostra da Bioquímica LIVRO DE RESUMOS, 2011. p. 25-25.
Souza, Luis HT ; DALMOLIN RJS ; CASTRO, Mauro Antônio Alves ; Rybarczyk Filho, José L ; de Almeida, Rita MC ; Moreira, José C. F. . ESTUDO DA PLASTICIDADE EVOLUTIVA ATRAVÉS DA DISTRIBUIÇÃO DE GRUPOS ORTÓLOGOS. In: III Mostra da Bioquímica, 2011, Porto Alegre. III Mostra da Bioquímica LIVRO DE RESUMOS, 2011. p. 62-62.
Albanus, RD'O ; Rybarczyk Filho, José L ; DALMOLIN RJ ; Moreira, José C. F. . ESTUDO DA EVOLUÇÃO DOS RECEPTORES QUÍMICOS NOS ORGANISMOS MUS MUSCULUS, HOMO SAPIENS E RATTUS NORVEGICUS ATRAVÉS DE FERRAMENTAS DE BIOLOGIA DE SISTEMAS. In: III Mostra da Bioquímica, 2011, Porto Alegre. III Mostra da Bioquímica LIVRO DE RESUMOS, 2011. p. 73-73.
DALMOLIN RJS ; Castro, M. A. A. ; Rybarczyk Filho, José L ; de Souza, Luís Henrique T. ; de Almeida, Rita MC ; Moreira, José C. F. . EVOLUTIONARY PLASTICITY INDEX: A STRAIGHTFORWARD METHOD TO EVALUATE EVOLUTIONARY PLASTICITY BASED ON ORTHOLOGS DISTRIBUTION. In: 6th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. X-meeting, 2010, Ouro Preto. X-Meeting Abstract Book 2010, 2010.
Rybarczyk Filho, José L ; Benetti, F ; DALMOLIN RJS ; Moreira, José C. F. ; Brunnet, L. G. ; de Almeida, Rita MC . GENE EXPRESSION ANALYSIS OF AN ORDERED NETWORK: A SEARCH FOR TUMORAL PATTERNS. In: 6th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. X-meeting, 2010, Ouro Preto. X-Meeting Abstract Book 2010, 2010.
DALMOLIN RJS ; CASTRO, Mauro Antônio Alves ; Gelain, Daniel, P. ; KLAMT, F ; MOREIRA, Jose Claudio Fonseca . TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS REVEALS PH-RESPONSIVE ANTIOXIDANT GENE NETWORKS. In: 5th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. X-meeting, 2009, Angra dos Reis. X-Meeting Abstract Book 2009, 2009.
Rybarczyk Filho, José L ; CASTRO, Mauro Antônio Alves ; DALMOLIN RJS ; MOREIRA, Jose Claudio Fonseca ; BRUNNET, L. ; de Almeida, Rita MC . EXPRESSION ANALYSIS ON INTERACTOME OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE. In: 5th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. X-meeting, 2009, Angra dos Reis. X-Meeting Abstract Book 2009, 2009.
DUARTE, R. F. ; DALMOLIN RJS ; ZANOTTO FILHO, A. ; PASQUALI, M. A. B. ; MOREIRA, J. C. F. . MODULAÇÃO DA ATIVIDADE DA MMP-2 EM CÉLULAS DE SERTOLI TRATADAS COM. In: XIX Salão de Iniciação Científica e XVI Feira de Iniciação Científica. UFRGS, 2007, Porto Alegre. XIX Salão de Iniciação Científica e XVI Feira de Iniciação Científica. UFRGS, 2007. p. 375-375.
ROCHA, R. F. ; ZANOTTO FILHO, A. ; GELAIN, D. P. ; PASQUALI, M. A. B. ; DALMOLIN RJS ; MOREIRA, J. C. F. . A ATIVAÇÃO DE ERK1/2 MEDIADA PELAS ESPÉCIES REATIVAS DE OXIGÊNIO. In: XIX Salão de Iniciação Científica e XVI Feira de Iniciação Científica. UFRGS, 2007, Porto Alegre. XIX Salão de Iniciação Científica e XVI Feira de Iniciação Científica. UFRGS, 2007. p. 375-375.
DUARTE, R. F. ; OLIVEIRA, R. B. ; DALMOLIN RJS ; PASQUALI, M. A. B. ; ZANOTTO FILHO, A. ; GELAIN, D. P. ; klamt, f ; GOTTFRIED, C. ; MOREIRA, J. C. F. . Oxidative damage induced by retinol treatment on cultured Sertoli cells are dependent architecture. In: V Meeting of SFRBM- South Amerivan Group, 2007, Montevideo. V Meeting of SFRBM- South Amerivan Group, 2007. p. 15-15.
DALMOLIN RJS ; ZANOTTO FILHO, A. ; DUARTE, R. F. ; PASQUALI, M. A. B. ; Oliveira, R B ; MOREIRA, J. C. F. . Retinol and retinoic acid increase mmp-2 activity by ROS production in cultured Sertoli cells. In: V Meeting of SFRBM- South Amerivan Group, 2007, Montevideo. V Meeting of SFRBM- South Amerivan Group, 2007. p. 43-43.
ZANOTTO FILHO, A. ; GELAIN, D. P. ; PASQUALI, M. A. B. ; Oliveira, R B ; DALMOLIN RJS ; ROCHA, R. F. ; OLIVEIRA, R. B. ; MOREIRA, J. C. F. . Retinol induced apoptosis in Sertoli cell is dependent on ROS-mediated ERK 1/2 and AP1 activation. In: V Meeting of SFRBM- South Amerivan Group, 2007, Montevideo. V Meeting of SFRBM- South Amerivan Group, 2007. p. 44-44.
DALMOLIN RJS ; klamt, f ; MOREIRA, J. C. F. . Indução de apoptose em Células de Sertoli tratadas com retinol. In: XIII Salão de Iniciação CientÍfica da UFRGS, 2002, Porto Alegre. XIII Salão de Iniciação CientÍfica da UFRGS, 2002. v. 13. p. 341-341.
dalpizzol, f ; klamt, f ; DALMOLIN RJS ; BERNARD E A ; BONATTO, F. ; MOREIRA, J. C. F. . Mitogenic signaling mediated by oxidants in retinol treated Sertoli Cells. In: XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2001, Caxambú. XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2001.
DALMOLIN RJS ; klamt, f ; dalpizzol, f ; MOREIRA, J. C. F. . Retinol induced apoptosis mediated by free radicals in cultured Sertoli Cells. In: XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2001, Caxambú. XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2001. v. 30.
POMPERMAYER, C.M. ; CAREGNATO, F. F. ; SILVA, E. G. ; klamt, f ; dalpizzol, f ; FROTA JR, M. L. C. ; ANDRADES, M. E. ; DALMOLIN RJS ; MOREIRA, J. C. F. . Retinol-induced oxidative in cytolic proteins of Sertoli Cells. In: XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2001, Caxambú. XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2001. v. 30.
ANDRADES, M. E. ; SILVA, E. G. ; CAREGNATO, F. F. ; FROTA JR, M. L. C. ; DALMOLIN RJS ; klamt, f ; dalpizzol, f ; BENFATO, M. S. ; SOARES, G. L. G. ; MOREIRA, J. C. F. . Avaliação das propriedades antioxidantes de extratos vegetais de plantas nativas brasileiras. In: XII Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2000, Porto Alegre. XII Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2000. v. 12. p. 265-265.
CAREGNATO, F. F. ; SILVA, E. G. ; ANDRADES, M. E. ; FROTA JR, M. L. C. ; DALMOLIN RJS ; klamt, f ; dalpizzol, f ; MOREIRA, J. C. F. ; BENFATO, M. S. . Danos Oxidativos em proteínas de fração citosólica induzido por vitamina A. In: XII Salão de Iniciação Científica da UFRGS., 2000, Porto Alegre. XII Salão de Iniciação Científica da UFRGS., 2000. v. 12. p. 264-264.
DALMOLIN RJS ; dalpizzol, f ; klamt, f ; BENFATO, M. S. ; MOREIRA, J. C. F. . DNA damage, morphologic modifications and proliferative induction in retinol treated Sertoli Cells. In: XXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular., 2000, Caxambú. XXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular., 2000. p. 81-81.
DALMOLIN RJS ; klamt, f ; dalpizzol, f ; MOREIRA, J. C. F. ; BENFATO, M. S. . Indução de focos proliferativos e aumento da atividade ornitina decarboxilase em Céluals de Sertoli tratadas com retinol.. In: XII Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2000, Porto Alegre. XII Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2000. v. 12. p. 245-245.
FROTA JR, M. L. C. ; MORAES, L. F. ; SILVA, E. G. ; DALMOLIN RJS ; MARCON, A. E. ; dalpizzol, f ; klamt, f ; MOREIRA, J. C. F. ; BENFATO, M. S. . Iron metabolism-related oxidative stress in retinol treated Sertoli Cells. In: XXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2000, Caxambú. XXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2000. v. 29. p. 179-179.
DALMOLIN RJS ; klamt, f ; dalpizzol, f ; MOREIRA, J. C. F. ; BENFATO, M. S. . Modificações Morfológicas e Apoptose Induzida por Retinol em Células de Sertoli.. In: XI Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 1999, Porto Alegre. XI Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 1999. v. 11. p. 264-264.
DALMOLIN, R.J. . Evolutionary rooting of biologycal systems. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
DALMOLIN, R.J. . Evolutionary rooting of biologycal systems. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DALMOLIN RJ . Raiz evolutiva de grupos de ortólogos. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
DALMOLIN RJS . Redes regulatórias na interpretação de dados transcricionais. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DALMOLIN RJS ; Castro, M. A. A. . Geneplast: an R package for evolutionary rooting and plasticity inference based on orthologous groups distribution.. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
DALMOLIN RJ . Construção de redes regulatórias em câncer. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DALMOLIN R . Geneplast: pacote em R para determinação de plasticidade evolutiva e enraizamento evolutivo de um grupo de ortólogos. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DALMOLIN RJS . Tendências Contemporâneas de Pesquisas em Ciências Biológicas. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
DALMOLIN RJS . Biologia de Sistemas. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
DALMOLIN RJS . Biologia Evolutiva e Câncer. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DALMOLIN RJS ; CASTRO, Mauro Antônio Alves ; GELAIN, Daniel P ; KLAMT, F ; MOREIRA, Jose Claudio Fonseca . Transcriptomic analysis reveals pH-responsive antioxidant gene networks. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DALMOLIN RJS . Bioquímica Evolutiva. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DALMOLIN RJS . Origem Evolutiva da Rede Gênica Humana de Apoptose e Estabilidade Genômica. 2008. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
DALMOLIN RJS . Rede humana de genes antioxidantes. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DALMOLIN RJS . Cursos Pré-Vestibular Populares. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DALMOLIN RJS . Aspectos Oxidativos na Diferenciação e Proliferação Celular. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
DALMOLIN RJS . . Indução de Apoptose e Focos Proliferativos em Culturas de Células de Sertoli Tratadas com Retinol 2003 (Trabalho de Conclusão de Curso).

Outras produções

CAMPOS, L. R. S. ; CASTRO, Mauro Antônio Alves ; DALMOLIN, RODRIGO J. S. . geneplast.data. 2024.

MORAIS, D. A. A. ; DALMOLIN, RODRIGO J. S. . EURYALE: A versatile Nextflow pipeline for taxonomic classification and functional annotation of metagenomics data. 2024.

MORAIS, D. A. A. ; Dalmolin, R. J. S. ; CAVALCANTE, JOÃO VITOR . MEDUSA: A Pipeline for Sensitive Taxonomic Classification and Flexible Functional Annotation of Metagenomic Shotgun Sequences. 2022.

DALMOLIN RJS . transcriptogramer. 2017.

DALMOLIN RJS ; Castro, M. A. A. . geneplast. 2016.

Castro, M. A. A. ; RYBARCZYK FILHO, J. L. ; DALMOLIN RJ ; MOREIRA, J. C. F. ; Mombach, J. C. M. ; de Almeida, R. M. C. . ViaComplex. 2009.

de Almeida, Rita MC ; Rybarczyk Filho, José L ; BRUNNET, L. ; Castro, Mauro AA ; DALMOLIN RJ ; MOREIRA, J. C. F. ; BONATTO, D. . Método, Sistema e Aparato de Análise de Dados de Expressão Gênica (Transcriptograma).. 2012.

DALMOLIN, R.J. . Introdução ao R para Bioinformática. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

DALMOLIN, R.J. . Uso de Pacotes R para Biologia de Sistemas ? avançado. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SOUZA, S. J. ; SOUZA, J. E. S. ; COSTA, C. R. ; DALMOLIN, R.J. . Introdução à Bioinformática. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Dalmolin, R. J. S. ; Castro, M. A. A. . Uso de pacotes de R para biologia de sistemas.. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

DALMOLIN, R . Introsução à Bioinformática. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

DALMOLIN, R . Bioquímica Evolutiva (Jornada Acadêmica do Curso de Biologia da ULBRA Gravataí). 2008. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

DALMOLIN, R . Cursos Pré-Vestibular Populares (III Jornada Acadêmica de Biologia). 2007. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

DALMOLIN, R . Radicais Livres: Verdades, Falácias, Angustias e Expectativas. 2006. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

DALMOLIN, R . Jornada Acadêmica de Biologia. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Projetos de pesquisa

2024 - Atual

Caracterização sistêmica sexo- e tecido-específica do transcriptoma de Rattus norvegicus, Descrição: O rato é um modelo murino amplamente utilizado na pesquisa. No entanto, seu transcriptoma de referência possui uma anotação precária, limitando o amplo entendimento de eventos regulatórios multi-sistêmicos. Esta proposta visa reconstruir esse transcriptoma por meio de long-read RNA-seq e expandir sua análise funcional utilizando abordagens da biologia de sistemas. Assim, complexos eventos regulatórios, evolutivamente relacionados aos encontrados em humanos, poderão ser elucidados ou desvendados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Coordenador / THAIS GAUDENCIO DO REGO - Integrante / VINICIUS RAMOS HENRIQUES MARACAJA COUTINHO - Integrante / João Vitor F. Cavalcante - Integrante / FERRAZ, RAFAELLA SOUSA - Integrante / MICHAELSEN, GUSTAVO LOVATTO - Integrante / Tibério Azevedo Pereira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2022 - Atual

Biologia de sistemas aplicada à Transcriptômica, Descrição: A biologia de sistemas é uma abordagem integrativa que visa compreender a complexidade biológica ao analisar como componentes moleculares interagem em redes dinâmicas. A transcriptômica, que estuda o conjunto completo de RNA transcrito em uma célula ou tecido em um determinado momento, fornece uma visão detalhada da regulação gênica em resposta a estímulos ambientais ou condições patológicas. O presente projeto busca usar técnicas de biologia de sistemas para entender redes transcricionais, como redes regulatórias, redes de co-expressão, ou mesmo a influência de informações transcricionais em redes PPI.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Coordenador / IARA DANTAS DE SOUZA - Integrante / RIBEIRO-DANTAS, MARCEL DA CÂMARA - Integrante / João Vitor F. Cavalcante - Integrante / FERRAZ, RAFAELLA SOUSA - Integrante / MICHAELSEN, GUSTAVO LOVATTO - Integrante / JOÃO VITOR ALMEIDA DA COSTA - Integrante / JACINTA FERNANDA NOVAIS CEZAR - Integrante / Tibério Azevedo Pereira - Integrante / Alexandre Henrique Carvalho Marques - Integrante / Fábio Henrique Ferreira Silva - Integrante / Odilon Júlio dos Santos - Integrante / EPITÁCIO DANTAS DE FARIAS FILHO - Integrante.
2020 - 2024

Análise da resposta transcricional a infecções respiratórias virais de características epidêmicas, Descrição: De 1918 até 2020 o mundo passou por quatro pandemias causadas pelo vírus influenza (H1N1 em 1918, H2N2 em 1957-1958, H3N2 em 1968, e H1N1 pdm09 em 2009), bem como por três variações de coronavírus altamente patogênicas (SARS-CoV em 2002, MERS-CoV em 2012, e o agente etiológico da doença Covid-19, o SARS-CoV-2 de 2019). Como ainda não existem tratamentos antivirais para o recente SARS-CoV-2, nem vacinas, dados transcricionais podem ser explorados para facilitar o entendimento das ações tomadas pelas células do hospedeiro em resposta à infecção deste vírus. A análise deste tipo de resposta pode ser utilizada para guiar os esforços no desenvolvimento de tratamentos terapêuticos. Além de dados de transcricionais, metatranscriptomas também podem ser utilizados para entender o impacto que a doença associada ao vírus causa na microbiota pulmonar do hospedeiro. Diante do exposto, o objetivo deste projeto é realizar a análise de dados transcricionais relacionados ao SARS-CoV-2, bem como de variantes do coronavírus (SARS-CoV e MERS-CoV).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Coordenador / Danilo Oliveira Imparato - Integrante / IARA DANTAS DE SOUZA - Integrante / DIEGO ARTHUR DE AZEVEDO MORAIS - Integrante.
2019 - 2024

Análise de perfis funcionais genômicos na investigação de vias metabólicas, Descrição: A anotação funcional adequada de amostras oriundas de experimentos de sequenciamento de macromoléculas como DNA, RNA e proteínas permanece uma tarefa desafiadora, apesar do avanço das tecnologias de sequenciamento e das ferramentas computacionais empregadas no processamento e análise dos dados ômicos. Obter informações acuradas sobre as vias metabólicas que estão presentes em uma amostra a partir dos dados brutos extraídos do sequenciador é um processo que ainda demanda bastante tempo e esforço, principalmente quando trabalhamos com organismos pouco estudados. Este projeto objetiva estabelecer metodologias para facilitar a anotação funcional de dados ômicos, mapeando diretamente sequências brutas para proteínas de vias metabólicas do KEGG (https://genome.jp/kegg/) e para redes de interações proteína-proteína do STRING (https://string-db.org/). As informações mapeadas para o STRING podem, então, ser investigadas pela presença de clusters funcionais com o pacote da linguagem R Transcriptogramer (http://bioconductor.org/packages/transcriptogramer). Outro objetivo é a criação de uma visualização das vias do KEGG destacando as proteínas existentes na amostra estudada, permitindo uma melhor compreensão dos mecanismos nela presentes. Essa visualização também permitirá a identificação de alvos para novas buscas nas sequências brutas a fim de preencher ausências em vias do KEGG. Por fim, os fragmentos não mapeados após o processo ainda poderão ser apontados como potenciais novidades genéticas para estudos posteriores.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Coordenador / DIEGO ARTHUR DE AZEVEDO MORAIS - Integrante / LEONARDO RENE DOS SANTOS CAMPOS - Integrante / IGOR BRANDÃO - Integrante.
2016 - Atual

Abordagem sistêmica a dados metagenômicos, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Coordenador / Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira - Integrante / Danilo Oliveira Imparato - Integrante / CLOVIS FERREIRA DOS REIS - Integrante / IARA DANTAS DE SOUZA - Integrante / João Vitor F. Cavalcante - Integrante / SANTIAGO, BIANCA C. F. - Integrante / JOÃO VITOR ALMEIDA DA COSTA - Integrante / JACINTA FERNANDA NOVAIS CEZAR - Integrante / Tibério Azevedo Pereira - Integrante / Alexandre Henrique Carvalho Marques - Integrante.
2015 - 2020

INVESTIGAÇÃO DO FATOR TRANSCRIOCIONAL MAX (MYC ASSOCIATED FACTOR X) COMO REGULADOR MESTRE DE NEUROBLASTOMA, Descrição: O neuroblastoma é uma importante neoplasia pediátrica, considerada um dos mais prevalentes tumores sólidos infantis em nível nacional e mundial. Embora a tipificação molecular dos casos mais graves da doença, caracterizada principalmente pela amplificação do gene MYCN, esteja bem estabelecida, há uma lacuna em relação ao prognóstico em pacientes onde não há amplificação de MYCN. Resultados prévios do nosso grupo de pesquisa indicam que o fator de transcrição MAX (MYC ASSOCIATED FACTOR X), o qual atua como dímero de MYCN, pode ter um importante papel na biologia do neuroblastoma. O presente projeto visa investigar o papel do fator de transcrição MAX na biologia do neuroblastoma, utilizando como modelo a linhagem celular derivada de neuroblastoma SHSY-5Y, linhagem esta que não apresenta amplificação de MYCN. Pretendemos avaliar as variações do imunoconteúdo de MAX, MYC e MED durante o processo de diferenciação neuronal da célula SHSY-5Y induzido por ácido retinóico. Da mesma forma, pretendemos avaliar os efeitos do silenciamento do gene MAX, tanto no processo de diferenciação, quanto na flutuação do imnunoconteúdo dos outros fatores de transcrição da rede MYC/MED. A partir da execução do presente projeto, pretendemos contribuir para o entendimento e consequente caracterização molecular das formas de neuroblastoma que não apresentam amplificação de MYC.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Coordenador / Castro, M. A. A. - Integrante / Pasquali, Matheus A. Bittencourt - Integrante / ALBANUS, RICARDO D'OLIVEIRA - Integrante / Raffael Azevedo de Carvalho Oliveira - Integrante / Hanna Nascimento Medeiros - Integrante / Natalia Cabral Souza - Integrante / Danilo Oliveira Imparato - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2014 - Atual

Desenvolvimento de ferramenta computacional para a integração de dados de evolução molecular e informações funcionais de redes biológicas, Descrição: Os estudos evolutivos acerca de sistemas gênicos podem contribuir para a compreensão de fenômenos fisiológicos e patológicos nos quais tais sistemas estejam envolvidos. A despeito da crescente quantidade de dados gerados por técnicas de alto processamento e da crescente quantidade de genomas sequenciados disponíveis, há uma lacuna referente a ferramentas computacionais capazes de integrar informações acerca da história evolutiva de sistemas bioquímicos inteiros. O presente Projeto de Atuação Profissional tem por objetivo o desenvolvimento de um pacote computacional em linguagem R voltado para a determinação da raiz evolutiva e plasticidade evolutiva de sistemas gênicos. Para tal, será proposto um algoritmo capaz de identificar a raiz evolutiva de um gene a partir da distribuição de seus ortólogos em uma árvore filogenética. Além disso, o pacote compreenderá funções para montagem e visualização de redes biológicas, que serão disponibilizadas de forma integrada com as informações evolutivas. A construção metodológica do pacote será baseada em investigações prévias, bem como na integração de funcionalidades presentes em outros pacotes computacionais disponíveis. O desenvolvimento do presente projeto poderá envolver alunos de graduação e pós-graduação. Além da confecção de artigos científicos, o presente projeto prevê a distribuição do pacote no repositório Bioconductor.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (5) . , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Coordenador / Mauro Antônio Alves Castro - Integrante / Danilo Oliveira Imparato - Integrante / IARA DANTAS DE SOUZA - Integrante / João Vitor F. Cavalcante - Integrante / JOÃO VITOR ALMEIDA DA COSTA - Integrante / JACINTA FERNANDA NOVAIS CEZAR - Integrante / Tibério Azevedo Pereira - Integrante / Fábio Henrique Ferreira Silva - Integrante / Bruno William Fernandes Silva - Integrante / Gleison Mederios de Azevedo - Integrante.
2012 - 2024

VALIDAÇÃO DE FERRAMENTAS DE BIOINFORMÁTICA PARA CARACTERIZAÇÃO FUNCIONAL DE REDES DE BIOMARCADORES EM NEOPLASIAS SÓLIDAS, Descrição: Dada ausência de biomarcadores de estadiamento para a vasta maioria das neoplasias sólidas, o objetivo geral deste projeto é identificar redes de biomarcadores tumorais para uso em estudos de associação genômica visando diagnóstico, prognóstico e auxilio na decisão terapêutica. Para tanto, temos como meta principal a VALIDAÇÃO DE FERRAMENTAS DE BIOINFORMÁTICA PARA CARACTERIZAÇÃO FUNCIONAL DE REDES DE BIOMARCADORES EM NEOPLASIAS SÓLIDAS. Para isso serão utilizadas as ferramentas de bioinformática previamente desenvolvidas pelo nosso grupo, as quais serão aprimoradas para lidar computacionalmente com grandes redes de interações protéicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Integrante / Mauro Antônio Alves Castro - Integrante / Daniel P Gelain - Integrante / Jose Claudio Fonseca Moreira - Coordenador.
2008 - 2012

DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS DE BIOINFORMÁTICA PARA O ESTUDO EVOLUTIVO DE SISTEMAS BIOQUÍMICOS, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Jose Claudio Fonseca Moreira em 20/11/2013., Descrição: O crescente corpo de informações gerado pelo desenvolvimento de técnicas de alto-desempenho, como sequenciamento de DNA em larga escala, técnicas de microarranjo de DNA, hibridização de proteínas, etc., tem evidenciado uma intrincada relação entre os diversos personagens que compõe os sistemas biológicos. Alguns dos sistemas bioquímicos presentes em organismos modernos surgiram a bilhões de anos e estavam presentes em organismos primitivos, ao passo que determinados sistemas são mais recentes e específicos de alguns grupos taxonômicos. O entendimento das relações entre os diferentes personagens dos sistemas biológicos apresenta-se como fundamental para a compreensão da vida e a avaliação dos aspectos evolutivos que permearam a constituição dos sistemas bioquímicos e suas intrincadas inter-relações pode auxiliar sobremaneira no estudo da biologia. Diversas teorias encontram-se bem estabelecidas no estudo evolutivo em nível de espécies e populações. Da mesma maneira, há um extenso acervo bibliográfico acerca da evolução de genes individuais. Entretanto, o surgimento, estabelecimento e evolução dos sistemas bioquímicos permanecem escassamente estudados. Na presente tese, nos partimos da análise de dois sistemas bioquímicos, o sistema de apoptose e o sistema de estabilidade genômica, os quais são bastante associados em mamíferos. A pesar da íntima relação entre esses sistemas, eles foram originados em momentos diferentes da evolução. Nós buscamos reconstruir o cenário evolutivo que uniu os sistemas de apoptose e estabilidade genômica, onde encontramos uma relação direta entre ancestralidade, essencialidade e clusterização. Os resultados também sugerem uma relação inversa entre essas três características e plasticidade. A análise de plasticidade efetuada na rede de apoptose e estabilidade genômica foi ampliada para 4850 famílias de proteínas em 55 eucariotos, apresentando basicamente os mesmos resultados, indicando um mecanismo geral de evolução do genoma. Subsequentemente, propusemos um modelo de crescimento do genoma onde a novidade genética surge por duplicação de genes muito conectados e pouco clusterizados. A rede artificial obtida mimetiza diversos aspectos topológicos das redes biológicas conhecidas. Os resultados analisados em conjunto sugerem um mecanismo geral de evolução do genoma, onde a novidade genética surge na porção mais plástica do genoma, basicamente por duplicação gênica. Essa duplicação ocorre prioritariamente nos hubs intermodulares.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Integrante / José Cláudio Fonseca Moreira - Coordenador / José L. Rybarczyk Filho - Integrante / de Souza, Luís Henrique T. - Integrante / de Almeida, Rita MC - Integrante / Mauro Antônio Alves Castro - Integrante.
2006 - 2008

Aumento da Atividade da MMP-2 Induzido por Tratamento com Retinol e Ácido Retinóico em Células de Sertoli Cultivadas, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Jose Claudio Fonseca Moreira em 20/11/2013., Descrição: Espécies reativas de oxigênio (ERO) têm sido descritas como potenciais causadoras de doenças como aterosclerose, artrite e câncer. Falhas na regulação das metaloproteinases de matriz (MMP), uma família de proteases que degradam matriz extracelular, parecem estar intimamente relacionadas com essas mesmas doenças. Além disso, autores sugerem uma relação entre a atividade das MMPs e ERO. Em trabalhos anteriores, nosso grupo de pesquisa demonstrou que o tratamento com retinol 7 μM foi capaz de induzir mudanças no metabolismo de células de Sertoli cultivadas, como o aumento da atividade de enzimas antioxidantes, aumento do dano oxidativo a biomoléculas, ativação de ERK1/2 MAPK, alteração do ciclo celular e transformação pré-neoplásica, ligando o tratamento com retinol ao estresse oxidativo. No presente trabalho, nós utilizamos a técnica de zimografia para verificar a atividade da MMP-2 em células de Sertoli tratadas com retinol e ácido retinóico. Nós encontramos que tanto o tratamento por 24 horas com retinol 7 μM, quanto o tratamento por 24 horas com ácido retinóico 1 nM, aumentaram a atividade da MMP-2 em células de Sertoli cultivadas. O co-tratamento com diferentes antioxidantes reverteu o aumento da atividade da MMP-2 induzido por retinol, mas não por ácido retinóico. Além disso, o tratamento com retinol, mas não com ácido retinóico, foi capaz de aumentar a produção de ERO quantificada pela oxidação de DCFH-DA. Nós encontramos também que tanto o tratamento com retinol quanto com ácido retinóico foram capazes de aumentar a fosforilação de ERK1/2. Entretanto, somente o aumento da atividade da MMP-2 induzido por tratamento com retinol foi inibido por co-tratamento com UO126, um potente inibidor de fosforização de ERK1/2. Nossos resultados sugerem que o aumento da atividade da MMP-2 induzido por retinol, mas não por ácido retinóico, está relacionado com a fosforilação de ERK1/2 e com a geração de ERO.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Integrante / José Cláudio Fonseca Moreira - Coordenador / OLIVEIRA, Ramatis Birnfeld de - Integrante / Roxane Freire Duarte - Integrante / Zanotto-Filho, Alfeu - Integrante / Pasquali, Matheus A. Bittencourt - Integrante.
1999 - 2001

Indução de apoptose e focos proliferativos em culturas de Células de Sertoli tratadas com retinol, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Jose Claudio Fonseca Moreira em 20/11/2013., Descrição: A vitamina A (retinol) é fundamental para diversas funções fisiológicas como visão, reprodução, proliferação e diferenciação. Entretanto, trabalhos de nosso grupo de pesquisa demonstraram uma relação entre tratamentos com retinol e a produção de radicais livres. Os radicais livres são moléculas altamente reativas, muitas vezes produzidas naturalmente durante o metabolismo. Porém, podem causar oxidação de biomoléculas como lipídios, proteínas e ácidos nucleicos. Nosso grupo de pesquisa tem evidenciado danos oxidativos em culturas de células de Sertoli tratadas com retinol em doses iguais ou superioras a 7µM. O presente projeto teve como objetivo averiguar a indução de apoptose e de focos proliferativos em cultuaras de células de Sertoli tratadas com retinol. Nossos resultados evidenciaram que o tratamento com retinol foi capaz de induzir as células à apoptose, bem como à formação de focos proliferativos. O fato da indução à apoptose ter sido inibida quando as células eram co-tratadas com antioxidante, nos leva a inferir que os processos aqui envolvidos foram mediados por estresse oxidativo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin - Integrante / DALPIZZOL, Felipe - Integrante / José Cláudio Fonseca Moreira - Coordenador / Mara da Silveira Benfato - Integrante / Fábio Klamt - Integrante.

Prêmios

2012

Professor Paraninfo, Curso de Biotecnologia do IFRS, 2012/02..

2011

Destaque III MOSTRA DA BIOQUÍMICA, Departamento de Bioquímica Prof. Tuiskon Dick, ICBS/UFRGS.

2010

Best Poster Award - 6th X-Meeting, Associação Brasileira de bioinformática e Biologia Computacional AB3C.

2007

Travel award - V Meeting of SFRBM, Society for Free Radical Biology and Medicine.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Instituto Metrópole Digital, Bioinformatics Multidisciplinary Invironment - BioME. , Rua do Horto, Lagoa Nova, 59076550 - Natal, RN - Brasil, Telefone: (84) 33422216, URL da Homepage:

Experiência profissional

2014 - Atual

Universidade Federal do Rio Grande do Norte

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

09/2016
Direção e administração, Centro Multiusuário de Bioinformática.,Cargo ou função, Vice-coordenador.
04/2016
Pesquisa e desenvolvimento, Centro Multiusuário de Bioinformática.,Linhas de pesquisa

2013 - 2014

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Colaborador, Regime: Dedicação exclusiva.

2005 - 2007

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Substituto de Ensino Superior, Carga horária: 20

Outras informações:
Professor Substituto de Ensino Superior junto ao Departamento de Produção de Matéria Prima da Faculdade de Farmácia, ministrando a disciplina FAR 1007- Tecnologia Bioquímica.

1999 - 2001

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Vínculo: Aluno de iniciação científica, Enquadramento Funcional: Aluno de iniciação científica, Carga horária: 20

2011 - 2012

Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Rio Grande do Sul

Vínculo: Professor Substituto, Enquadramento Funcional: Professor Substituto, Carga horária: 40

2002 - 2007

Centro de Educação e Cultura Pré-Vestibular Popular Resgate

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor voluntário, Carga horária: 3

Outras informações:
Professor voluntário do Pré-Vestibular Popular Resgate, voltado para público de baixa renda, oferecido pela Organização Não-Governamental sem fins lucrativos, voltada para a democratização do acesso ao Ensino Superior.

2004 - 2006

Centro de Educação e Cultura Pré-Vestibular Popular Resgate

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Presidente, Carga horária: 20

Outras informações:
Presidente da Organização Não-Governamental sem fins lucrativos, voltada para a democratização do acesso ao Ensino Superior. Diretor do Pré-Vestibular oferecido pela Instituição.

2002 - 2004

Centro de Educação e Cultura Pré-Vestibular Popular Resgate

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Vice Presidente, Carga horária: 10

Outras informações:
Fundador e Vice-Presidente da Organização Não-Governamental sem fins lucrativos, voltada para a democratização do acesso ao Ensino Superior.

2002 - 2004

Prefeitura Municipal de Porto Alegre

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 30

Outras informações:
Estagiário do Núcleo de Controle de Roedores e Vetores de Equipe de Zoonoses da Coordenadoria Geral de Vigilância Sanitária - Secretaria Municipal de Saúde

2001 - 2002

Instituti Brasil-África

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor Voluntário, Carga horária: 2

Outras informações:
Professor voluntário do curso pré-vestibular popular Superão, voltado para alunos de baixa renda.

Propriedade Intelectual

Patentes (1)

Tipo	Título	Data depósito
INVENTOR	Método, sistema e aparato de análise de dados de expressão gênica (transcriptograma).	14/12/2011