Douglas Terra Machado

Professor substituto da disciplina Bioinformática na UFRJ, campus Duque de Caxias. Doutorando no Programa de Pós-Graduação em Genética da Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Possui mestrado em Modelagem Computacional pelo Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC) e bacharelado em Ciências Biológicas, ênfase em Biotecnologia, pela Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF). No seu trabalho de conclusão de curso desenvolvido no Núcleo de Diagnóstico e Investigação Molecular (NUDIM - Laboratório de Biotecnologia) desenvolveu projeto de Iniciação Científica na área de Epigenética Humana, onde definiu algoritmos de predição de genes sujeitos ao imprinting genômico e ao escape da inativação do cromossomo X por meio de análises computacionais integrativas e comparativas de bancos de dados de transcriptoma (RNA-seq), metiloma e epigenômica (estados da cromatina) em múltiplos tecidos e linhagens celulares. No mestrado trabalhou com o desenvolvimento de métodos computacionais para análise de expressão gênica diferencial utilizando modelos lineares generalizados e modelos lineares generalizados mistos. Possui conhecimento nas linguagens de programação C e R, e experiência nas áreas de Bioinformática, Biologia Computacional, Biologia Molecular e Epigenética Humana.

Informações coletadas do Lattes em 30/06/2023

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em andamento em Ciências Biológicas (Genética)

2022 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Prof. Dra. Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Mestrado em Modelagem Computacional

2019 - 2022

Laboratório Nacional de Computação Científica
Título: Inferência de Genes Diferencialmente Expressos Utilizando Modelos Lineares Generalizados Mistos, Ano de Obtenção: 2022
Prof. Dra. Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: dispersão dos genes; expressão gênica diferencial; efeitos aleatórios; modelo linear generalizado misto; pré-processamento.

Graduação em Ciências Biológicas

2015 - 2019

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro
Título: Integração computacional epigenômica na investigação de genes sujeitos à inativação do cromossomo X humano
Orientador: Enrique Medina-Acosta
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Formação complementar

2021 - 2021

Implementando modelos estatísticos de maneira eficiente com o TMB. (Carga horária: 2h). , Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.

2018 - 2018

Extensão universitária em Verão em Genética. (Carga horária: 80h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2018 - 2018

Células-tronco e terapia celular. (Carga horária: 8h). , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP USP, Brasil.

2018 - 2018

Epigenética e Reprodução. (Carga horária: 8h). , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP USP, Brasil.

2018 - 2018

Análise do ciclo celular, apoptose e quebras no DNA (detecção de gama-H2AX). (Carga horária: 8h). , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP USP, Brasil.

2017 - 2017

Estatística Aplicada no "R". (Carga horária: 16h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

2016 - 2016

Diagnóstico Molecular de Doenças Genéticas Humanas. (Carga horária: 12h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

2016 - 2016

Proteômica comparativa como ferramenta de estudos em sistemas biológicos. (Carga horária: 4h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

2016 - 2016

Entomologia Forense. (Carga horária: 4h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

2016 - 2016

Análises Clínicas. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

2016 - 2016

Biossegurança - Laboratórios de DST, AIDS e Hepatites Virais. (Carga horária: 15h). , Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.

2016 - 2016

Epigenetic Control of Gene Expression. (Carga horária: 49h). , The University of Melbourne, UNIMELB, Austrália.

2016 - 2016

Curso de Biotecnologia. (Carga horária: 20h). , Instituto Biomédico de Aprimoramento Profissional, IBAP, Brasil.

2015 - 2015

Técnicas de Reprodução Humana Assistida. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

2015 - 2015

Genética Forense. (Carga horária: 4h). , Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro, UENF, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Epigenética.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Organização de eventos

MACHADO, D. T. . XVI Encontro Acadêmico de Modelagem Computacional. 2023. (Outro).

MACHADO, D. T. . III Simpósio Internacional de Genética da PGGen. 2022. (Outro).

MACHADO, D. T. . Curso Diagnóstico Molecular de Doenças Genéticas Humanas. 2018. (Outro).

MACHADO, D. T. . XVI Semana Acadêmica da Biologia. 2018. (Outro).

Participação em eventos

2nd Workshop on Data Science and Statistical Learning. 2021. (Oficina).

II SIBRAGEN - Simpósio Brasileiro de Genética. 2021. (Simpósio).

3a Semana da Engenharia Matemática e Matemática Aplicada da UFRJ. 2020. (Encontro).

Aquecimento do XL Congresso da Sociedade Brasileira de Computação - CSBC 2020. 2020. (Congresso).

Bioinformatics: from Algorithms to Applications - BiATA. 2020. (Outra).

I SIBRAGEN - Simpósio Brasileiro de Genética. 2020. (Simpósio).

X Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica. Integração epigenômica e transcriptômica de genes candidatos à inativação do cromossomo X em humanos. 2018. (Congresso).

XXIII Curso de Verão em Genética, FMRP USP.Evidência Epigenômica de Inativação do Cromossomo X Isoforma- e Tecido-Específica dos Genes UBA1 e ANOS1 em Humanos. 2018. (Outra).

GENÉTICA 2017 - Brazilian-International Congress of Genetics. The Human LOC389906 Non-Coding Pseudogene Escapes from X-Chromosome Inactivation in Somatic Tissues. 2017. (Congresso).

IX Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica. Análise transcriptômica da inativação do cromossomo X em série temporal de células únicas de embriões humanos. 2017. (Congresso).

XV Semana acadêmica da Biologia.Evidências de inativação do cromossomo X isoforma-específica para o gene UBA1 em tecidos humanos. 2017. (Encontro).

VIII Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica. Marcas de metilação de origem materna no gene WRB não controlam a expressão alélica imprintada de onze genes localizados no braço longo do cromossomo 21. 2016. (Congresso).

VIII Semana Acadêmica da UENF / XIV Semana Acadêmica de Biologia.Metilação global como ferramenta para determinação do estado de inativação do cromossomo X em humanos. 2016. (Encontro).

VII Semana Acadêmica da UENF / XIII Semana Acadêmica de Biologia.Critérios de seleção de experimentos de RNA-seq de repositórios públicos referentes ao atlas de tecidos primários humanos. 2015. (Encontro).

Participação em bancas

Aluno: Maria Alice de Azevedo Santos

L, J. Y.; Louvain de Souza, T.;MACHADO, D. T.. Relevância da Horta Comunitária na Educação Ambiental e a Implementação na Comunidade São João Batista em Duarte da Silveira/Petrópolis-RJ. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.

Aluno: Luiza Barroso Belém

F, B. S.; FERREIRA, C. S.;MACHADO, D. T.. Arborização Urbana: Estudos das Espécies Arbóreas em Áreas Urbanas do Município de Maricá/RJ. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.

Aluno: Swellen Dias Soares Guedes

Louvain de Souza, T.; GARCIA, A. B.;MACHADO, D. T.. Conhecimento Sobre os Cuidados Para Evitar e Erradicar o Vetor Aedes aegypti Entre os Discentes de Licenciatura. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.

Aluno: Pedro José Matuliones Escudero

G, A. O.; F, B. S.;MACHADO, D. T.. Revisão Bibliográfica Sobre Produtividade de Um Sistema de Cultivo de Vegetais e Sua Aplicação em Escolas Públicas. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.

Orientou

Solange da Rocha Paz Andrade

Criação Amadora e Comercial de Passeriformes Nativos: Comércio, Privação da Liberdade ou Preservação das Espécies?; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Douglas Terra Machado;

Krislayne Nunes da Costa

Desafios da Sepse como Agravo na Saúde Nacional: Uma Revisão Sistemática da Literatura Científica; 2021; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Douglas Terra Machado;

Vinício da Silva Cardoso

A Educação Ambiental e Sua Importância no Ambiente Escolar; 2020; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Douglas Terra Machado;

Caroline Costa Ferreira

Genética Forense em Crimes Sexuais: Determinação de Parâmetros Para Uma Revisão Sistematizada; 2020; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Douglas Terra Machado;

Produções bibliográficas

TERRA MACHADO, DOUGLAS ; BERNARDES BRUSTOLINI, OTÁVIO JOSÉ ; CÔRTES MARTINS, YASMMIN ; GRIVET MATTOSO MAIA, MARCO ANTONIO ; RIBEIRO DE VASCONCELOS, ANA TEREZA . Inference of differentially expressed genes using generalized linear mixed models in a pairwise fashion. PeerJ , v. 11, p. e15145, 2023.
LAMARCA, ALESSANDRA P. ; DE ALMEIDA, LUIZ G. P. ; DA SILVA FRANCISCO, RONALDO ; CAVALCANTE, LILIANE ; MACHADO, DOUGLAS TERRA ; BRUSTOLINI, OTÁVIO ; GERBER, ALEXANDRA L. ; GUIMARÃES, ANA PAULA DE C. ; POLICARPO, CINTIA ; OLIVEIRA, GLEIDSON DA SILVA DE ; BOULLOSA, LIDIA THEODORO ; SOUZA, ISABELLE VASCONCELLOS DE ; CARVALHO, ERIKA MARTINS DE ; RIBEIRO, MARIO SERGIO ; CARVALHO, SILVIA ; SILVA, FLÁVIO DIAS DA ; GARCIA, MARCIO HENRIQUE DE OLIVEIRA ; SOUZA, LEANDRO MAGALHÃES DE ; SILVA, CRISTIANE GOMES DA ; RIBEIRO, CAIO LUIZ PEREIRA ; CAVALCANTI, ANDRÉA CONY ; MELLO, CLAUDIA MARIA BRAGA DE ; TANURI, AMILCAR ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R. . Genomic Surveillance Tracks the First Community Outbreak of the SARS-CoV-2 Delta (B.1.617.2) Variant in Brazil. JOURNAL OF VIROLOGY , v. 96, p. 1-3, 2022.
FRANCISCO JUNIOR, RONALDO DA SILVA LAMARCA, ALESSANDRA P DE ALMEIDA, LUIZ G P CAVALCANTE, LILIANE MACHADO, DOUGLAS TERRA MARTINS, YASMMIN BRUSTOLINI, OTÁVIO GERBER, ALEXANDRA L GUIMARÃES, ANA PAULA DE C GONÇALVES, REINALDO BELLINI ALVES, CASSIA MARIANI, DIANA CRUZ, THAIS FELIX DE SOUZA, ISABELLE VASCONCELLOS DE CARVALHO, ERIKA MARTINS RIBEIRO, MARIO SERGIO CARVALHO, SILVIA DA SILVA, FLÁVIO DIAS GARCIA, MÁRCIO HENRIQUE DE OLIVEIRA DE SOUZA, LEANDRO MAGALHÃES DA SILVA, CRISTIANE GOMES RIBEIRO, CAIO LUIZ PEREIRA CAVALCANTI, ANDRÉA CONY DE MELLO, CLAUDIA MARIA BRAGA STRUCHINER, CLÁUDIO J. , et al. TANURI, AMILCAR DE VASCONCELOS, ANA TEREZA R ; Turnover of SARS-CoV-2 Lineages Shaped the Pandemic and Enabled the Emergence of New Variants in the State of Rio de Janeiro, Brazil. Viruses-Basel , v. 13, p. 2013, 2021.
DA SILVA FRANCISCO JUNIOR, RONALDO ; DOS SANTOS FERREIRA, CRISTINA ; SANTOS E SILVA, JUAN CARLO ; TERRA MACHADO, DOUGLAS ; CÔRTES MARTINS, YASMMIN ; RAMOS, VICTOR ; SIMÕES CARNIVALI, GUSTAVO ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Pervasive Inter-Individual Variation in Allele-Specific Expression in Monozygotic Twins. Frontiers in Genetics , v. 10, p. 1178, 2019.
DE SÁ MACHADO ARAÚJO, GRAZIELA ; DA SILVA FRANCISCO JUNIOR, RONALDO ; DOS SANTOS FERREIRA, CRISTINA ; MOZER RODRIGUES, PEDRO THYAGO ; TERRA MACHADO, DOUGLAS ; LOUVAIN DE SOUZA, THAIS ; TEIXEIRA DE SOUZA, JOZIMARA ; FIGUEIREDO OSORIO DA SILVA, CLEITON ; ALVES DA SILVA, ANTÔNIO FRANCISCO ; ANDRADE, CLAUDIA CAIXETA FRANCO ; DA SILVA, ALAN TARDIN ; RAMOS, VICTOR ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MACHADO, FILIPE BRUM ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Maternal 5mCpG Imprints at the PARD6G-AS1 and GCSAML Differentially Methylated Regions Are Decoupled From Parent-of-Origin Expression Effects in Multiple Human Tissues. Frontiers in Genetics , v. 9, p. 1-20, 2018.
ALVES DA SILVA, ANTÔNIO FRANCISCO ; MACHADO, FILIPE BRUM ; PAVARINO, ÉRIKA CRISTINA ; BISELLI-PÉRICO, JOICE MATOS ; ZAMPIERI, BRUNA LANCIA ; DA SILVA FRANCISCO JUNIOR, RONALDO ; MOZER RODRIGUES, PEDRO THYAGO ; TERRA MACHADO, DOUGLAS ; SANTOS-REBOUÇAS, CÍNTIA BARROS ; GOMES FERNANDES, MARIA ; CHUVA DE SOUSA LOPES, SUSANA MARINA ; LOPES RIOS, ÁLVARO FABRICIO ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Trisomy 21 Alters DNA Methylation in Parent-of-Origin-Dependent and -Independent Manners. Plos One , v. 11, p. e0154108, 2016.
SILVA, JUAN CARLO SANTOS E ; DOS SANTOS FERREIRA, CRISTINA ; DA SILVA FRANCISCO JUNIOR, RONALDO ; TERRA MACHADO, DOUGLAS ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Estudo de transcriptômica para a investigação de edição de RNA em gêmeos monozigóticos discordantes para a Síndrome de Down. In: XI Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica, 2019, Campos dos Goytacazes. XI Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica, 2019.
DOS SANTOS FERREIRA, CRISTINA ; SILVA, JUAN CARLO SANTOS E ; TERRA MACHADO, DOUGLAS ; VASCONCELOS, AMANDA PEREIRA ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . The epigenetic landscape of chromosome 21 in the context of Genomic Imprinting and Down Syndrome. In: Brazilian-International Congress of Genetics, 2019, Águas de Lindoia - SP. Brazilian-International Congress of Genetics, 2019.
SILVA, JUAN CARLO SANTOS E ; DOS SANTOS FERREIRA, CRISTINA ; DA SILVA FRANCISCO JUNIOR, RONALDO ; TERRA MACHADO, DOUGLAS ; VASCONCELOS, AMANDA PEREIRA ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Transcriptome investigation of RNA Editing in monozygotic twins discordant for Down Syndrome. In: Brazilian-International Congress of Genetics, 2019, Águas de Lindoia - SP. Brazilian-International Congress of Genetics, 2019.
DA SILVA, ALAN TARDIN ; DOS SANTOS FERREIRA, CRISTINA ; TERRA MACHADO, DOUGLAS ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . The CRNN tumor supressor and the DCD oncogene are novel candidate imprinted loci. In: Brazilian-International Congress of Genetics, 2019, Águas de Lindoia - SP. Brazilian-International Congress of Genetics, 2019.
MACHADO, D. T. ; FERREIRA, C. S. ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MACHADO, F. B. ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Integração genômica e transcriptônica de genes candidatos à inativação do cromossomo X em humanos. In: X Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica, 2018, Campos dos Goytacazes. X Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica, 2018.
MACHADO, D. T. ; SOUZA, J. T. ; Figueiredo Osorio da Silva, C. ; SILVA, J. C. S. E. ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MACHADO, F. B. ; Medina-Acosta, E. . Evidências epigenômica de inativação do cromossomo X isoforma e tecido específica dos genes UBA1 e ANOS1 em humanos. In: XXIII Curso de Verão em genética, 2018, Ribeirão Preto. XXIII Curso de Verão em genética, 2018.
SILVA, J. C. S. E. ; FERREIRA, C. S. ; SIQUEIRA, M. S. ; MACHADO, D. T. ; da Silva Francisco Junior, R. ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; Medina-Acosta, E. . Análise transcriptômica e epigenômica computacional integrativa para identificação de retrogenes associados ao imprinting genômico. In: XXIII Curso de Verão em genética, 2018, Ribeirão Preto. XXIII Curso de Verão em genética, 2018.
MACHADO, D. T. ; Figueiredo Osorio da Silva, C. ; MACHADO, F. B. ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; Medina-Acosta, E. . Análise transcriptômica da inativação do cromossomo X em série temporal de células únicas de embriôes humanos. In: IX Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica, 2017, Campos dos Goytacazes. IX Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica, 2017.
MACHADO, D. T. ; SILVA, J. C. S. E. ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MACHADO, F. B. ; Medina-Acosta, E. . Evidências de inativação do cromossomo X isoforma-específica para o gene UBA1 em tecidos humanos. In: IX Semana Acadêmica da UENF / XV Semana Acadêmica da Biologia, 2017, Campos dos Goytacazes. IX Semana Acadêmica da UENF / XV Semana Acadêmica da Biologia, 2017.
MACHADO, D. T. ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MACHADO, F. B. ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . The human LOC389906 non-coding pseudogene escapes from X-chromosome inactivation in somatic tissues. In: Brazilian-international congress of genetics, 2017, Águas de Lindóia. Brazilian-international congress of genetics, 2017.
Figueiredo Osorio da Silva, C. ; da Silva Francisco Junior, R. ; SOUZA, J. T. ; FERREIRA, C. S. ; MACHADO, D. T. ; Medina-Acosta, E. . Perfis de expressão alélica-específica e de enriquecimento de marcas epigenéticas na averiguação de genes candidatos ao imprinting genômico. In: IX Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica, 2017, Campos dos Goytacazes. IX Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica, 2017.
MACHADO, D. T. ; MACHADO, FILIPE BRUM ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; LEONARDO, KATRINE DA SILVA ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Metilação global como ferramenta para determinação do estado de inativação do cromossomo X em humanos. In: VIII Semana Acadêmica da UENF / XIV Semana Acadêmica da Biologia, 2016, Campos dos Goytacazes. VIII Semana Acadêmica da UENF / XIV Semana Acadêmica da Biologia, 2016.
MACHADO, D. T. ; OLIVEIRA, ERICA DE SOUZA DE ; Medina-Acosta, E. . Consolidação in silico de um acervo de experimentos de RNAseq de tecidos humanos para o estudo de imprinting genômico. In: VIII Semana Acadêmica da UENF / XIV Semana Acadêmica da Biologia, 2016, Campos dos Goytacazes. VIII Semana Acadêmica da UENF / XIV Semana Acadêmica da Biologia, 2016.
Francisco Alves da Silva, A. ; MACHADO, F. B. ; da Silva Francisco Junior, R. ; MACHADO, D. T. ; DE SÁ MACHADO ARAÚJO, GRAZIELA ; SILVA, C. F. O. ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Allelic expression patterns of candidate imprinted genes on human chromosome 21. In: Brazilian-international congress of genetics, 2016, Caxambu. Brazilian-international congress of genetics, 2016.
da Silva Francisco Junior, R. ; SOUZA, J. T. ; Figueiredo Osorio da Silva, C. ; TERRA MACHADO, DOUGLAS ; MACHADO, F. B. ; Medina-Acosta, E. . A histone H3K27ac enrichment signature at the differentially methylated region of the human GRB10 imprinted gene is associated with the isoform- and brain-specific monoallelic expression. In: Brazilian-international congress of genetics, 2016, Caxambu. Brazilian-international congress of genetics, 2016.
MACHADO, D. T. ; Thyago Mozer Rodrigues, P. ; da Silva Francisco Junior, R. ; Figueiredo Osorio da Silva, C. ; Medina-Acosta, E. . Critérios de seleção de experimentos de RNA-Seq de repositórios públicos referentes ao atlas de tecidos primários humanos. In: VII Semana Acadêmica da UENF / XIII Semana Acadêmica da Biologia, 2015, Campos dos Goytacazes. VII Semana Acadêmica da UENF / XIII Semana Acadêmica da Biologia, 2015.
SILVA, ALAN TARDIN DA ; MACHADO, D. T. ; Medina-Acosta, E. . Perda e ganho de imprinting genômico em tecidos primários de câncer em humanos. In: XVI Mostra de Pós-graduação, 2015, Campos dos Goytacazes. XVI Mostra de Pós-graduação, 2015.
MACHADO, D. T. . Ômicas e suas aplicações. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
MACHADO, D. T. ; SOUZA, J. T. ; SILVA, C. F. O. ; SILVA, J. C. S. E. ; GARCIA, A. B. ; MACHADO, F. B. ; Medina-Acosta, E. . Evidência Epigenômica de Inativação do Cromossomo X Isoforma- e Tecido-Específica dos Genes UBA1 e ANOS1 em Humanos. 2018. (Apresentação de Trabalho/Outra).
MACHADO, D. T. ; SILVA, C. F. O. ; MACHADO, F. B. ; GARCIA, A. B. ; Medina-Acosta, E. . Análise transcriptômica da inativação do cromossomo X em série temporal de células únicas de embriões humanos. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
TERRA MACHADO, DOUGLAS ; SILVA, JUAN CARLO SANTOS E ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MACHADO, FILIPE BRUM ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Evidências de inativação do cromossomo X isoforma-específica para o gene UBA1 em tecidos humanos. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).
TERRA MACHADO, DOUGLAS ; ALVES DA SILVA, ANTÔNIO FRANCISCO ; MACHADO, FILIPE BRUM ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Marcas de metilação de origem materna no gene WRB não controlam a expressão alélica imprintada de onze genes localizados no braço longo do cromossomo 21. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
TERRA MACHADO, DOUGLAS ; MACHADO, FILIPE BRUM ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; LEONARDO, KATRINE DA SILVA ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Metilação global como ferramenta para determinação do estado de inativação do cromossomo X em humanos. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).
TERRA MACHADO, DOUGLAS ; OLIVEIRA, ERICA DE SOUZA DE ; SILVA, ALAN TARDIN DA ; SILVA, C. F. O. ; LEONARDO, KATRINE DA SILVA ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Consolidação in silico de um acervo de experimentos de RNAseq de tecidos humanos para o estudo de imprinting genômico. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).
TERRA MACHADO, DOUGLAS ; MOZER RODRIGUES, PEDRO THYAGO ; DA SILVA FRANCISCO JUNIOR, RONALDO ; SILVA, C. F. O. ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Critérios de seleção de experimentos de RNA-seq de repositórios públicos referentes ao atlas de tecidos primários humanos. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Outras produções

MACHADO, D. T. ; A, A. A. S. . Programação em R para Bioinformática. 2022. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MACHADO, D. T. . Introdução à programação em R para manipulação e visualização de dados. 2022. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

2017 - Atual

Diagnóstico molecular das síndromes de Turner e Klinefelter utilizando SD-QF-PCR acoplado ao estado de metilação do gene humano VAMP7, Descrição: A síndrome de Turner é frequentemente diagnosticada na infância ou adolescência e os sintomas raramente são visíveis antes desse tempo. O diagnóstico atualmente recomendado é análise do cariótipo, no entanto este pode acusar resultados pertinentes quanto à síndrome. Objetivo: Acoplar a amplificação de uma região com duplicação segmentar no braço curto do cromossomo X com um par de autossomos e o estado de metilação do gene humano VAMP7 para diagnóstico molecular de pacientes acometidos para as síndromes de Klinefelter e Turner, sendo esta última nas suas variadas formas (X0; isocromossomo Xq e mosaico).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Douglas Terra Machado - Coordenador / Enrique Medina-Acosta - Integrante / Filipe Brum Machado - Integrante.
2016 - Atual

Análise de marcas genéticas e epigenéticas para determinação do estado de inativação do cromossomo X humano, Descrição: A inativação do cromossomo X é o mecanismo epigenético de silenciamento aleatório transcricional de um cromossomo X em cada célula diploide de fêmeas eutérias. Em humanos, a inativação ocorre durante o desenvolvimento embrionário entre os estádios de 8 e 16 células, com a manutenção do X inativo em tecidos adultos. Cerda de 10 a 15% dos genes escapam do silenciamento e são expressos bialelicamente em cada célula. Objetivo: Determinar o estado de escape versus não escape dos genes do cromossomo X humano utilizando bancos integrados de transcriptoma em células únicas (scRNA-Seq) de tecidos fetais e adultos; metilomas de tecidos femininos e averiguação do estado da cromatina com dados secundários públicos de imunoprecipitação da cromatina (ChIP-Seq).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Douglas Terra Machado - Integrante / MACHADO, FILIPE BRUM - Integrante / MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE - Coordenador.
2015 - Atual

Recombinação meiótica parental e imprinting genômico na trissomia 21, Descrição: Projeto em rede interna e externa, bi-institucional. Objetivos: Avaliar possíveis associações entre o padrão de recombinação no cromossomo 21 em portadores de trissomia livre e o risco de não disjunção; Avaliar experimentalmente a ocorrência de imprinting em genes candidatos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Douglas Terra Machado - Integrante / Filipe Brum Machado - Integrante / Cleiton Figueiredo Osorio da Silva - Integrante / MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE - Coordenador / Jozimara Teixeira de Souza - Integrante / Ana Beatriz Garcia - Integrante / Cristina dos Santos Ferreira - Integrante.
2015 - Atual

FAPERJ APQ1 Processo no. E26/010.001036/2015 - Identificação de novas regiões diferencialmente metiladas no DNA envolvidas no controle do imprinting genômico em humanos, Descrição: Objetivo Geral: Identificar e validar novas DMRs no genoma humano, envolvidas no controle do imprinting genômico e os respectivos genes sob controle. Meta: Gerar conhecimento por meio da pesquisa básica para o melhor entendimento do funcionamento do epigenoma humano, contribuindo para futuras associações fenotípicas na saúde e na doença... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Douglas Terra Machado - Integrante / Enrique Medina-Acosta - Coordenador / Claudia Caixeta Franco Andrade - Integrante / Graziela de Sá Machado Araújo - Integrante / Filipe Brum Machado - Integrante / Antônio Francisco Alves da Silva - Integrante / Ronaldo da Silva Francisco Junior - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro / Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro - Bolsa.

Prêmios

2019

Menção honrosa na área de Bioinformática com o trabalho: The epigenetic landscape of chromosome 21 in the context of Genomic Imprinting and Down Syndrome, Sociedade Brasileira de Genética.

2018

1 Lugar - Prêmio Eucleia Primo Betioli Contel de melhor trabalho apresentado na modalidade oral, XXIII Curso de Verão em Genética, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - FMRP USP.

2018

Menção honrosa com o trabalho: Análise transcriptômica e epigenômica computacional integrativa para identificação de retrogenes associados ao imprinting genômico, USP.

2017

2 Lugar - Apresentação em painel, trabalho: "Análise transcriptômica da inativação do cromossomo X em série temporal de células únicas de embriões humanos", IX Congresso Fluminense de Iniciação Científica e Tecnológica.

2017

2 Lugar - Apresentação oral, trabalho: "Evidências de inativação do cromossomo X isoforma-específica para o gene UBA1 em tecidos humanos", XV Semana acadêmica da Biologia, UENF.

2016

2 Lugar - Apresentação em painel, trabalho: "Metilação global como ferramenta para determinação do estado de inativação do cromossomo X em humanos", VIII Semana acadêmica da UENF / XIV Semana de Biologia da UENF.

2016

Menção honrosa com o trabalho: "Consolidação in silico de um acervo de experimentos de RNAseq de tecidos humanos para o estudo de imprinting genômico", VIII Semana acadêmica da UENF / XIV Semana de Biologia da UENF.

2016

Prêmio Painel Iniciação Científica de Melhor Trabalho na Área de Genética Humana, Sociedade Brasileira de Genética.

Histórico profissional

Endereço profissional

Laboratório Nacional de Computação Científica. , Avenida Getúlio Vargas - até 1155 - lado ímpar, Quitandinha, 25651075 - Petrópolis, RJ - Brasil, Telefone: (24) 22336009

Experiência profissional

2020 - Atual

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mediador à distância em Redação Científica, Carga horária: 20

Outras informações:
Atuante em Trabalho de Conclusão de Curso.

2016 - 2019

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro

Vínculo: Bolsista CNPq, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

2017 - 2017

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro

Vínculo: Voluntário, Enquadramento Funcional: Monitor Voluntário de Biologia Molecular, Carga horária: 10

Outras informações:
Monitor da disciplina de Biologia Molecular para o curso de graduação em Ciências Biológicas (Licenciatura) da Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.

2017 - 2017

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro

Vínculo: Monitor Voluntário, Enquadramento Funcional: Monitor Voluntário de Genética Básica, Carga horária: 10

Outras informações:
Monitor da disciplina de Genética Básica para os cursos de graduação em Ciências Biológicas e Medicina Veterinária da Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.

2015 - 2016

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Apoio Acadêmico, Carga horária: 12

Atividades

05/2015
Pesquisa e desenvolvimento, Centro de Biociências e Biotecnologia.,Linhas de pesquisa

2018 - 2018

Universidade de São Paulo

Vínculo: Aluno visitante, Enquadramento Funcional: Estágio voluntário, Carga horária: 40

Outras informações:
Estágio realizado no Laboratório de Citogenética e Mutagênese. Durante esse período acompanhou o desenvolvimento de diferentes métodos no laboratório pelo grupo de pós-graduandos, tais como: aberrações cromossômicas e ensaio do cometa para análise de danos no DNA e cinética de reparo em células mononucleares do sangue periférico, cultura e manutenção de células tumorais, ensaio de viabilidade celular (XTT), extração de ácidos nucleicos e preparação de amostras (proteína e RNA) para PCR em tempo real e Western blot, montagem e análise de dados de PCR em tempo real sob orientação da Prof. Elza Tiemi Sakamoto Hojo, Ph.D.

2019 - 2022

Laboratório Nacional de Computação Científica

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Pós-Graduação, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2023 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor substituto, Carga horária: 20

Outras informações:
Professor substituto da disciplina Bioinformática no curso de Ciências Biológicas, ênfase em Biotecnologia e ênfase em Biofísica.

2022 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Pós-Graduação, Regime: Dedicação exclusiva.