JOSE FERNANDO FONTANARI

Possui graduação em Bacharelado em Física pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (1985) e doutorado em Física pelo Instituto de Física de São Carlos da Universidade de São Paulo (1988). É Professor Titular da Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Física Estatística, com ênfase em aplicações em problemas biológicos e sócio-culturais atuando principalmente nos seguintes temas: evolução molecular, genética de populações, evolução cultural e aquisição da linguagem. Atualmente é membro do corpo editorial dos periódicos Physics of Life Reviews (Elsevier, IF: 13.783), Theory in Biosciences (Springer, IF: 1.552) e Mathematics (MDPI, IF:1.105).

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Física São Carlos

1985 - 1988

Universidade de São Paulo
Título: Processamento de Informações em Redes de Neurônios Síncronas
Orientador: Roland Köberle
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Redes Neurais; Vidros de Spin; memória associativa.Grande área: Ciências Exatas e da TerraSetores de atividade: Informática.

Graduação em Bacharelado Em Física

1981 - 1985

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

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Pós-doutorado

1994

Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: , Ano de obtenção: 1994.

1988 - 1989

Pós-Doutorado. , California Institute of Technology, CALTECH, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra

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Idiomas

Inglês

Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Fala RazoavelmenteEscreve Pouco.

Francês

Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Física Estatística e Termodinâmica.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Física Biológica.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Probabilidade e Estatística Aplicadas.

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Organização de eventos

PERLOVSKY, L. I. ; Fontanari, José F. ; CANGELOSI, A. ; LEVINE, D. ; KOZMA, R. . CCMB14 - Symposium Series on Computational Intelligence. 2014. (Congresso).

PERLOVSKY, L. I. ; COYLE, D. ; ANG, K. K. ; Fontanari, José F ; KOZMA, R. . CCMB 2013, IEEE Symposium on Computational Intelligence, Cognitive Algorithms, Mind, and Brain. 2013. (Congresso).

YANG, H. M. ; FONTANARI, J. F. . II Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics. 2007. (Congresso).

PERLOVSKY, L. I. ; FONTANARI, J. F. . IEEE 2005 Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems KIMAS'05. 2005. (Congresso).

FONTANARI, J. F. . XXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1999. (Congresso).

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Participação em eventos

Joint ICTP-SAIFR/ICTP-Trieste School on Mathematical Models of Evolution. 2019. (Simpósio).

The Mathematics of Games in the Applied Sciences.Population dynamics of overshoot and collapse. 2018. (Oficina).

Encontro Nacional de Física Estatística (ENFE 2017).Task-forces: what is the optimal organization?. 2017. (Encontro).

4°. Workshop de High Performance Computing.Effect of group organization on the performance of cooperative problem-solving systems. 2016. (Oficina).

Seventh Workshop Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences.When more of the same is better. 2016. (Oficina).

Models in Population Dynamics and Ecology 2015.Diffusion of innovations in Axelrod?s model of culture dissemination. 2015. (Oficina).

Non standard transport: from anomalous diffusion to reaction spreading in heterogeneous systems.Diffusion approximation and multi-level selection. 2015. (Oficina).

Simpósio de Evolução Cultural.Evolução Cultural e aquisição da linguagem. 2015. (Simpósio).

14th International Conference Computational and Mathematical Methods in Science and Engineering. Cooperative solution of cryptarithmetic problems. 2014. (Congresso).

7th Workshop on Thermodynamics, Disequilibrium and Evolution (TDE).Non-zero sum games in prebiotic evolution. 2014. (Oficina).

Fifth Workshop on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences.Hamilton's rule in Kimura's diffusion model of intergroup selection. 2014. (Oficina).

IEEE Symposium Series on Computational Intelligence (IEEE SSCI 2014).Solving a cryptarithmetic problem using a social learning heuristic. 2014. (Simpósio).

Models in Population Dynamics and Ecology MPDE14. Synergistic effects in the evolution of social behavior. 2014. (Congresso).

Fourth Workshop on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences.The diffusion  approximation for template coexistence in protocells. 2013. (Oficina).

Mathematical Congress of the Americas. A diffusion model of intergroup selection for the evolution of coexistence between distinct self-replicating molecules. 2013. (Congresso).

The Society for Mathematical Biology Annual Meeting and Conference 20 (SMB 2013). Effect of migration in a diffusion model for template coexistence in protocells. 2013. (Congresso).

BIOMAT 2012 International Symposium on Mathematical and Computational Biology.. ..Associative learning of a lexicon in a noisy cross-situational scenario. 2012. (Simpósio).

Models in Population Dynamics and Ecology MPDE12.Non-zero-sumness and the origin of complexity in prebiotic evolution. 2012. (Oficina).

Third Workshop on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Science.Analytical solution of the n-site approximation of the dynamics of the majority model for the spread of rumors in a chain. 2012. (Oficina).

BIOMAT 2011 International Symposium on Mathematical and Computational Biology.Genetic Redundancy and the origin of chromosomes. 2011. (Simpósio).

IEEE Symposium Series on Computational Intelligence SSCI2011.The performance of a linear learning algorithm for cross-situational vocabulary learning. 2011. (Simpósio).

Microbial and Viral Evolution.Remarks on cultural evolution. 2011. (Oficina).

The 2011 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN 2011). Emotions of Cognitive Dissonance. 2011. (Congresso).

2010 IEEE World Congress on Computational Intelligence. A Computational model of adults' performance in naming objecys using cross-situational learning. 2010. (Congresso).

BIOMAT 2010 International Symposium on Mathematical and Computational Biology.Cultural Evolution in a lattice: the majority-vote model as a frequency-dependent bias model of cultural transmission. 2010. (Simpósio).

Interdisciplinary Workshop on Society, Culture and Language.How NOT to influence people. 2010. (Oficina).

The 3rd Conference of Computational and Mathematical Population Dynamics. A model of frequency-dependent bias for the spread of opinions in a lattice. 2010. (Congresso).

2009 International Joint Conference on Neural Networks. A cross-situational algorithm for learning a lexicon using Neural Modeling Fields. 2009. (Congresso).

55 Congresso Brasileiro de Genética. Preservação da informação em modelos de empacotamento genético. 2009. (Congresso).

BIOMAT 2009 International Symposium on Mathematical amd Computational Biology.Effect of mass media on the cultural diversity of Axelrod model of social influence. 2009. (Simpósio).

XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Effect of mass media on the cultural diversity of Axelrod Model of social influence. 2009. (Congresso).

2008 IEEE World Congress on Computational Intelligence. Object perception in the Neural Modeling Fields framework. 2008. (Congresso).

BIOMAT 2008 International Symposium on Mathematical and Computational Biology.A population dynamics approach to language evolution. 2008. (Simpósio).

2007 IEEE International Conference on Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. How communication can improve differentiation in the Modeling Field Theory framework. 2007. (Congresso).

2007 International Joint Conference on Neural Networks. Language acquisition and category discrimination in the Modeling Field Theory Framework. 2007. (Congresso).

II Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics (CMPD2). Inverse density dependence in the evolution of communication. 2007. (Congresso).

Workshop on Genes, Infections and Epidemics.Preservation of information in gene package models. 2007. (Oficina).

2006 IEEE World Congress on Computational Intelligence and IEEE International Joint Conference on Neural Networks IJCNN'06. Meaning creation and communication in a community of agents. 2006. (Congresso).

6th International Conference on Language Evolution (EVOLANG6). Allee Effect on language evolution. 2006. (Congresso).

XXIV Encontro de Físicos do Norte e Nordeste. Jogos de adivinhação e a aquisição da linguagem. 2006. (Congresso).

1st Latin American School and Conference on: ?Statistical Physics and Applications". Theoretical Aspects of Population Genetics: Kimura's approach. 2005. (Congresso).

IEEE 2005 International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. Meaning Creation and Modeling Field Theory. 2005. (Congresso).

Workshop on Aspects of Self-Organization in Evolution.Muller's ratchet and host-parasite dynamics. 2005. (Oficina).

Workshop on Biomathematics.Zipf law, language and population genetics. 2004. (Oficina).

IEEE International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. Catalytic Reaction Sets, Decay, and the Preservation of Information. 2003. (Congresso).

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Participação em bancas

Aluno: Alex Kunze Susemihl

ALFONSO, N. F. C.; HENRIQUES, V. B.;Fontanari, José F. Aplicações de Mecânica Estatística à Psicologia Moral. 2010. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Felipe Lorenzen

MOUSSA, M. H. Y.; ALMEIDA, N. G.;FONTANARI, J. F.. Extensão dos Be-ables de Bell e competição Atenuação x Amplificação. 2009. Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Guilherme da Costa Pereira Innocentini

HORNOS, J. E. M.; BOSCO, F. A. R.;FONTANARI, J. F.. Modelamento Estocástico para a expressão genica. 2008. Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: David Dobrigkeit Chinellato

AGUIAR, M. A. M.; CERDEIRA, F.;FONTANARI, J. F.. Processos Dinâmicos em Redes Complexas. 2007. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fabio Schittler Neves

ERICHSEN JR, R.;FONTANARI, J. F.; VEIT, E. A.; THEUMANN, A. G. R.. Redes de Neurônios Não-Monótonas em Camadas. 2006. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Oscar Felipe Falcão Raposo

CAMPOS, P. R. A.;FONTANARI, J. F.; CORDEIRO, G. M.. Dependência da velocidade da Catraca de Muller com fluxo de mutações benéficas. 2006. Dissertação (Mestrado em Biometria e Estatística Aplicada) - Universidade Federal Rural de Pernambuco.

Aluno: Pedro Castro Menezes Xavier de Mello e Silva

FONTANARI, J. F.; GUSMAO, M. A. C.; GAY, M. B.; THEUMANN, A. G. R.. Modelo Esférico Quântico de Vidro de Spin na Aproximação de Recozimento. 2005. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Milton Taidi Sonoda

SONODA, M. T.;FONTANARI, J. F.; CASTRO, T. T.; THIEMANN, O. H.. Dinâmica e Genealogia de Modelos de Evolução. 2001. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Alexandre Colato

COLATO, A.; MIZRAHI, S. S.;FONTANARI, J. F.; MALTA, C. P.. Efeitos de difusão em dinâmica de populações em uma e duas dimensões. 2000. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal de São Carlos.

Aluno: Didier Augusto Vega Oliveros

RODRIGUES, FRANCISCO A.; TRAVIESO, G.; SILVA FILHO, A. C. R.; MELLO, M. A. R.;Fontanari, José F.. Dinâmicas de propagação de informações e rumores em redes sociais. 2017. Tese (Doutorado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Roberta Regina Delboni

YANG, H. M.; CALSAVARA, B. M. R.; BOLDRINI, J. L.;FONTANARI, J. F.; MANCERA, P. F. A.. Estudo de Estratégia de Contenção do Crescimento de Micro-organismos Patogênicos em Alimentos. 2015. Tese (Doutorado em Matemática Aplicada) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Hansenclever de França Bassani

CAVALCANTI, G. D. C.; VASCONCELOS, G. C.;FONTANARI, J. F.; BRAGA, A. P.; LIMA NETO, F. B.. Modelos Neurais Modulares para Aquisição de Linguagem Natural. 2014. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Rafael Sola de Paula de Angelo Calsaverini

PRADO, C. P. C.; PENNA, T. J. P.; IDIART, M. A. P.; VIEIRA, A. P.;FONTANARI, J. F.. Tópicos em mecânica estatística de sistemas complexos: Uma abordagem mecânico-estatística de dois tópicos de interesse em finanças, economia e sociologia. 2013. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Júlio César Mansur Filho

DICKMAN, R.; PIRES, A. S. T.; FERREIRA JUNIOR, S. C.; CASTRO, T. T.;FONTANARI, J. F.. Caminhantes aleatórios sonolentos: Análise exata em sistemas pequenos e simulações de Monte Carlo. 2012. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Elizabeth Machado Baptestini Andrade

AGUIAR, M. A. M.; TANASHIRO, M. N.; FREITAS, A. V. L.;Fontanari, José F; MARTINS, Marcelo Lobato. Especiação sem Barreiras e Padrões de diversidade. 2010. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Lauro Antonio Barbosa

SILVA, Jafferson Kamphorst Leal da; DICKMAN, R.; OLIVEIRA, P. M.;FONTANARI, J. F.; BARBOSA, P. L. M.. Leis de Escala Alométricas para as taxas metabólicas interespecíficas e para cadeias alimentares. 2007. Tese (Doutorado em Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Tiago de Paula Peixoto

PRADO, C. P. C.; ALFONSO, N. F. C.;FONTANARI, J. F.; MARTINS, J. S. S.; VASCONCELOS, G. L.. Criticalidade auto-organizada no modelo Olami-Feder-Christensen de terremotos: dinâmica de epicentros. 2007. Tese (Doutorado em doutorado em física IFUSP) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carlos Eduardo Fiore dos Santos

OLIVEIRA, M. J.; PRADO, C. P. C.; PLASCAK, J. A.; STILCK, J. F.;FONTANARI, J. F.. Sistemas fora do equilíbrio termodinâmico: Um estudo em diferentes abordagens. 2006. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Guilherme José de Moraes Garcia

FONTANARI, J. F.; BERNARDES, A. T.; CASTRO, T. T.; OLIVEIRA, A. G.; DICKMAN, R.. Tópicos em Biofísica: Alometria dos ossos; O modelo BS para a evolução das espécies; O fluxo de ar no nariz humano. 2005. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Silvio da Costa Ferreira Júnior

FONTANARI, J. F.; MARTINS, Marcelo Lobato; VILELA, Marcelo José; VASCONCELOS, Amílton César; COUTINHO, Sergio Galvão; SILVA, Jafferson Kamphorst Leal da. Modelos de Reação-Difusão para o Crescimento de Tumores. 2003. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Fernando Fagundes Ferreira

FERREIRA, F. F.;FONTANARI, J. F.KOBERLE, R.; ONODY, R. N.; OLIVEIRA, P. M.; MARCHETTI, D. H. U.. Análise estatística do problema da partição numérica. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Cláudia Pio Ferreira

FERREIRA, C. P.FONTANARI, J. F.; ONODY, R. N.; CALIRI, A.; BERNARDES, A. T.; OLIVEIRA, S. M.. Dinâmica de replicação na rede: aplicações em modelos de evolução pré-biótica e de formação de úlceras.. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paulo Roberto de Araújo Campos

CAMPOS, P. R. A.FONTANARI, J. F.; ALFONSO, N. F. C.; MENDES, T.; MIZRAHI, S. S.; CALIRI, A.. Modelos de integração de informação em evolução pré-biótica. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Nazareno Getter Ferreira de Medeiros

ONODY, R. N.; MEDEIROS, N. G. F.;FONTANARI, J. F.; GARRATT, R. C.; OLIVEIRA, S. M.; PRADO, C. P. C.. Modelos evolucionários de envelhecimento biológico. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Alexandre da Silva Rosas

ROSAS, A. S.; COUTINHO, S. G.; COUTINHO FILHO, M. D.; RAPOSO, E. C. P.; CONTINENTINO, M. A.;FONTANARI, J. F.. Modelo de Ising com campo aleatório: termodinâmica, propriedades críticas e estrutura local do parâmetro de ordem.. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Rogério A L

COSTA, R. A. L.;FONTANARI, J. F.. Costa. O problema de generalização em uma rede de Hopfield com exemplos ponderados. 2000. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

ALBUQUERQUE, E. L.; CANTO, F.; PEREIRA, D.; RIVELLES, V.;Fontanari, José F. Concurso para Professor Titular do IF/UFF. 2009. Universidade Federal Fluminense.

CALDEIRA, A. O.; ZANOTTO, E. D.; CERDEIRA, F.; OLIVEIRA JUNIOR, O. N.;Fontanari, José F. Concurso para Professor Titular IFSC-USP. 2009. Universidade de São Paulo.

FONTANARI, J. F.; STRUCHINER, C. J.; MASSAD, E.; BOLDRINI, J. L.; SOTOMAYOR, P. A. L.. Concurso Professor Titular em Biomatemática UNICAMP. 2005. Universidade Estadual de Campinas.

NASCIMENTO, R. V.;Fontanari, José F.; FOSSALUZA, V.; POLDI, K. C.; DUCATI, G. C.. Concurso para Professor Adjunto na área de Matemática Aplicada na UFABC. 2018. Universidade Federal do ABC.

ORTIZ, W. A.; CARDOSO, C. A.;FONTANARI, J. F.; SILVA, L. C.; ROVERSI, J. A.. Concurso para Professor Adjunto A-DE no DF-UFSCar. 2014. Universidade Federal de São Carlos.

BASSANEZI, R. C.;Fontanari, Jose Fernando; VARRIALE, M. C.. Concurso para Professor Adjunto no IM-UFRGS. 2013. Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

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Comissão julgadora das bancas

José Roberto Drugowich de Felício

DEFELICIO JRDKOBERLE, R.THEUMANN, W. K.. Processamento de Informações em redes de neurônios síncronas. 1988. Tese (Doutorado em Física Básica) - Universidade de São Paulo/São Carlos.

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Orientou

Jorge Augusto Salgado Salhani

Modelando brainstorming com sistemas quadro-negro; Início: 2019; Dissertação (Mestrado em Fisica (SC)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Larissa Fernandes Aquino

Comparacão entre algoritmos evolucionários e culturais; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Guilherme Martins Lopes

Dinâmica de populações de engenheiros de ecossistemas; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Sandro Martinelli Reia

Início: 2016; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Caroline Franco

A dinâmica espacial de engenheiros de ecossistemas; 2018; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Elias José Portes Biral

O limite termodinâmico do modelo de Axelrod unidimensional de duas características e dois estados; 2016; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Lucas Vieira Guerreiro Rodrigues Peres

A modelagem estocástica aplicada à manutenção da diversidade cultural; 2010; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Daniel Marques Gomes Silvestre

Cooperação e conflito em modelos de vesículas pré-bióticas; 2006; 0 f; Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Danielle Oliveira Costa Santos

Modelos de ecossistemas com interações não lineares; 2004; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Daniela Favarão Botelho

Dinâmica de Modelos de Genética de Populações com Recombinação; 2003; Dissertação - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Milton Taidi Sonoda

Dinâmica e genealogia de modelos de evolução; 2001; Dissertação - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Daniela Maria Lemos Barbato

O Efeito de Lesões Nas Capacidades de Memorização e Generalização de Um Perceptron; 1993; Dissertação (Mestrado em Física) - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Lucas Rodrigues Peres

Estudos no modelo de Axelrod de disseminação cultural: transição de fase e campo externo; 2014; Tese (Doutorado em Física São Carlos) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

[Nome removido após solicitação do usuário]

Ensaios analíticos e numéricos de processos estocásticos unidimensionais; 2009; Tese (Doutorado em Física São Carlos) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Fábio Campos Poderoso

Ecossistemas de Replicadores: uma abordagem via Mecânica Estatística de Sistemas Desordenados; 2007; Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Giovano de Oliveira Cardozo

Dinâmica de populações em autômatos celulares; 2006; Tese (Doutorado em Física São Carlos) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Leonardo Paulo Maia

Dinâmica Adaptativa, Genealogias e Testes Estatísticos de Neutralidade em Evolução Molecular; 2004; Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Alexandre Colato

Acúmulo de mutações em linhagens assexuadas: uma abordagem via experimentos computacionais; 2004; Tese (Doutorado em Física São Carlos) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Fernando Fagundes Ferreira

Análise Estatística do Problema da Partição Numérica; 2001; Tese (Doutorado em Física São Carlos) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Paulo Roberto de Araújo Campos

Modelos de integração de informação em evolução pré-biótica; 2001; Tese - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Cláudia Pio Ferreira

Dinâmica de replicação na rede: aplicações em modelos de evolução pré-biótica e de formação de úlceras; 2001; Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Viviane Moraes de Oliveira

Modelos de vidros de spin com interações de ordem alta; 2000; Tese - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Ana Tereza Costa Silva

Modelos de Seleção de Grupo em Evolução Pré-biótica; 2000; Tese - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

DOMINGOS ALVES

Análise Estatística da Teoria de Quase-Espécies de Evolução Molecular; 1999; Tese - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Daniela Maria Lemos Barbato

Estudo Analítico do Efeito da Diluição Em Perceptrons; 1998; Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Camilo Rodrigues Neto

Propriedades de Recuperação de Memórias Em Redes Neurais Atratoras; 1997; Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Paulo Freitas Gomes

2018; Universidade de São Paulo,; Jose Fernando Fontanari;

Paulo Fernando Coimbra Tilles

2015; Instituto de Física de São Carlos, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Jose Fernando Fontanari;

Lauro Antonio Barbosa

2008; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Jose Fernando Fontanari;

Alexandre Rosas

2002; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Jose Fernando Fontanari;

Willem Hordijk

2002; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Jose Fernando Fontanari;

Davi Arrais Nobre

A sabedoria das massas: o efeito da distribuição das estimativas individuais; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

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Foi orientado por

Walter Karl Theumann

Transições de Fase em Titanato de Estrôncio; 1984; Iniciação Científica; (Graduando em Bachalerado em Fisica) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Walter Karl Theumann;

Roland Koberle

Processamento de Informacoes Em Redes de Neuronios Sincronos; 1986; Tese - Universidade de São Paulo,; Orientador: Roland Koberle;

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Produções bibliográficas

  • CAMPOS, PAULO R A ; Fontanari, José F . Predictability of imitative learning trajectories. JOURNAL OF STATISTICAL MECHANICS-THEORY AND EXPERIMENT , v. 2019, p. 013501, 2019.

  • GOMES, PAULO F. ; REIA, SANDRO M. ; RODRIGUES, FRANCISCO A. ; Fontanari, José F. . Mobility helps problem-solving systems to avoid groupthink. PHYSICAL REVIEW E , v. 99, p. 032301, 2019.

  • M LOPES, GUILHERME ; F FONTANARI, JOSÉ . Influence of technological progress and renewability on the sustainability of ecosystem engineers populations. MATHEMATICAL BIOSCIENCES AND ENGINEERING (ONLINE) , v. 16, p. 3450-3464, 2019.

  • REIA, SANDRO M. ; GOMES, PAULO F. ; Fontanari, José F. . Individual decision making in task-oriented groups. EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL. B, CONDENSED MATTER AND COMPLEX SYSTEMS (INTERNET) , v. 92, p. 109, 2019.

  • REIA, SANDRO M. ; GOMES, PAULO F. ; Fontanari, José F. . Policies for allocation of information in task-oriented groups: elitism and egalitarianism outperform welfarism. EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL. B, CONDENSED MATTER AND COMPLEX SYSTEMS (INTERNET) , v. 92, p. 205, 2019.

  • Fontanari, José . The Collapse of Ecosystem Engineer Populations. Mathematics , v. 6, p. 9, 2018.

  • Fontanari, José F. . Reputation blackboard systems. Cognitive Systems Research , v. 50, p. 29-35, 2018.

  • Fontanari, José F. . Awareness improves problem-solving performance. Cognitive Systems Research , v. 45, p. 52-58, 2017.

  • FRANCO, CAROLINE ; Fontanari, José F. . The spatial dynamics of ecosystem engineers. MATHEMATICAL BIOSCIENCES , v. 292, p. 76-85, 2017.

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  • FONTANARI, J. F. . Inverse density dependence in the evolution of communication. In: II Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics (CMPD2), 2007, Campinas. Abstract Book. Campinas: CMPD2 - Organização, 2007.

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  • FERREIRA, C. P. ; FONTANARI, J. F. . Uso de automatos celulares no estudo de competição entre replicadores.. In: X Congresso Latino Americano de Biomatemática, 2001, Campinas. X Congresso Latino Americano de Biomatemática - Resumos. Campinas, SP, Brasil, 2001. p. 4.

  • ALVES, D. ; CAMPOS, P. R. A. ; FONTANARI, J. F. . Modelo de seleção de grupo em evolução pré-biótica.. In: XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2001, São Lourenço, MG. XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 2001. p. 81.

  • FERREIRA, C. P. ; FONTANARI, J. F. ; SANTOS, R. M. Z. . Transições de fase num modelo de formação de úlceras.. In: XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2001, São Lourenço, MG. XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 2001. p. 82.

  • V M de Oliveira ; FONTANARI, J. F. . Modelo de replicadores com diluição.. In: XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2001, São Lourenço, MG. XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 2001. p. 87.

  • FERREIRA, C. P. ; FONTANARI, J. F. . Formação de estruturas espaciais em modelos de evolução pré-biótica.. In: XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2000, São Lourenço. XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - R\ESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 2000. p. 136.

  • FERREIRA, F. F. ; FONTANARI, J. F. . Problema da seqüência binária de mais baixa auto-correlação,. In: XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2000, São Lourenço, MG. XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física. p. 135.

  • V M de Oliveira ; FONTANARI, J. F. . Modelos de replicadores com interações de multi-espécies.. In: XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2000, São Lourenço, MG. XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 2000. p. 135.

  • ALVES, D. ; FONTANARI, J. F. . Resultados do modelo de amostragens para quase-espécies virais. In: XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1999, São Lourenço, MG, Brasil. XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1999. p. 122.

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  • FONTANARI, J. F. ; KOBERLE, R. . Reprodutibilidade e variabilidade em trens de pulsos neurais.. In: XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1999, São Lourenço, MG, Brasil. XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1999. p. 121.

  • SILVA, A. T. C. ; FONTANARI, J. F. . Modelo de tempo discreto para a dinâmica de sistemas parasita-hospedeiro.. In: XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1999, São Louren,co, MG, Brasil. XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1999. p. 144.

  • CAMPOS, P. R. A. ; FONTANARI, J. F. . Teoria de Escala de Tamanho Finito Para O Modelo das Quase-Espécies. In: XXI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 1998. Livro de resumos do XXI ENFMC. Caxambú, MG - Brasil. p. 92-92.

  • SILVA, A. T. C. ; FONTANARI, J. F. . Modelo Estocástico Para A Evolução do Altruismo. In: XXI ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1998. XXI ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. CAXAMBÚ, MG - BRASIL. p. 115-115.

  • BARBATO, D. M. L. ; FONTANARI, J. F. . Dilution In A Boolean Neural Network. In: XIX ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA, 1996. XIX ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA - RESUMOS. ÁGUAS DE LINDÓIA, MG - BRASIL. p. 512-512.

  • ALVES, D. ; FONTANARI, J. F. . Population Genetics Approach To Molecular Evolution. In: XIX ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA, 1996. XIX ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA - RESUMOS. ÁGUAS DE LINDÓIA, MG - BRASIL. p. 520-520.

  • FONTANARI, J. F. ; RODRIGUES NETO, C. . Categorization on pseudo-inverse neural networks.. In: XIX ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1996, Águas de Lindóia, SP, Brasil. XIX ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1996. p. 515.

  • FONTANARI, J. F. . Learning From Examples In Neural Networks. In: XVII ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA, 1994. XVII ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA - RESUMOS. CAXAMBÚ, MG - BRASIL. p. 98-98.

  • ERICHSEN JR, R. ; THEUMANN, W. K. ; FONTANARI, J. F. . Recuperação de memória em uma rede de neurônios com padrões correlacionados.. In: XII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1989, Caxambú, MG, Brasil. XII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1989. p. 81-81.

  • REIA, SANDRO M. ; AMADO, ANDRÉ C. ; Fontanari, José F. . Agent-based models of collective intelligence. Physics of Life Reviews , 2019.

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Projetos de pesquisa

  • 2014 - Atual

    Estudos no modelo de Axelrod: transição de fase de não-equilíbrio, difusão de inovações, e computação coletiva, Descrição: A característica que popularizou o modelo de Axelrod de disseminação cultural é a existência de configurações absorventes que exibem diversos domínios culturais, a despeito da regra de interação local entre os agentes que promove a similaridade entre eles. Nesse modelo, os agentes estão fixos em sítios de uma rede quadrada com conexões entre primeiros vizinhos somente e são representados por listas de F características culturais com cada característica podendo adotar um certo número q de traços culturais ou opiniões distintas. Dependendo dos valores desses parâmetros o estado estacionário do modelo exibe coexistência cultural ou não, sendo esses regimes separados por uma transição de fase de não equilíbrio no espaço (q,F). Um ingrediente essencial do modelo é o fato da probabilidade de interação entre dois vizinhos crescer linearmente com sua superposição cultural: agentes similares interagem mais frequentemente e agentes sem nenhuma característica cultural em comum simplesmente não interagem. Nosso primeiro objetivo é caracterizar completamente a natureza da transição de fase de não-equilíbrio do modelo de Axelrod usando escala de tamanho finito, lembrando que o modelo exibe um número infinito de estados absorventes no limite termodinâmico e que, ao contrário do processo de contato, a dinâmica sempre é atraída para um desses estados. Nosso segundo objetivo é investigar o processo clássico de difusão de inovações usando uma variante do modelo de Axelrod que inclui um campo externo local que fará o papel do agente de inovação. Nesse linha, vamos estudar também o efeito da difusão ou expansão demográfica, ou seja, não apenas as idéias propagam-se de agente a agente, mas os agentes também podem se mover pela rede. Finalmente, nosso terceiro objetivo é explorar a idéia da sociedade como um ?cérebro coletivo mais eficiente que indivíduos isolados na execução de tarefas complexas. Nesse caso, o conjunto de características culturais de um agente é interpretado como uma solução tentativa de algum problema de otimização. Enfim, a idéia é utilizar um modelo de agentes na rede relativamente simples para entender com clareza tópicos fundamentais como o processo de disseminação de inovações e o potencial da computação social. Particularmente interessante é a compreensão do papel da transição de fase de não-equilíbrio nesses dois processos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador / Lucas Rodrigues Peres - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

  • 2011 - Atual

    Coexistência e altruismo através da seleção de grupo, Descrição: A explicação da coexistência entre espécies, indivíduos ou replicadores distintos permanece um desafio para as abordagens convencionais da teoria evolutiva onde a competição é considerada o ingrediente essencial. A abordagem da seleção de grupo permite uma explicação satisfatória ao introduzir um segundo nível de seleção ? a competição entre grupos. No contexto da evolução pré-biótica, que é o nosso foco principal neste projeto, essa competição não é controversa, já que os grupos seriam as protocélulas ou células primitivas. Por outro lado, no contexto de espécies a noção de seleção de grupo, usualmente empregada para explicar o comportamento altruista, é bastante criticada. A formulação matemática do problema da seleção em dois níveis, ou mesmo de populações estruturadas, é muito desafiadora. Procuramos tratar esse problema usando a aproximação difusiva da genética de populações (essencialmente reduzindo o processo estocástico a equações do tipo Focker-Planck) e extrair informações analíticas sobre os diferentes regimes estacionários, dando ênfase a caracterização do fenômenos críticos associados às mudanças desses regimes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador / SERVA, M. - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

  • 2009 - Atual

    Aquisição de vocabulário pelo aprendizado observacional, Descrição: O processo de aquisição de um vocabulário através do aprendizado observacional (cross-situational learning) é baseado na ideia intuitiva de que o significado de uma palavra pode ser inferido pela análise das repetidas situações em que aquela palavra é utilizada, isto é, pela busca de um elemento comum nessas situações. Assim, trata-se de uma aplicação direta da filosofia do associacionismo de Locke ao problema da aquisição do vocabulário. Consideramos modelos simplificados de aprendizado em que há uma correspondência biunívoca entre o conjunto de palavras e o conjunto de objetos a serem nomeados. O problema do aprendizado desse mapeamento palavra-objeto é descrito como um processo estocástico e estudado usando técnicas tradicionais dessa área (em particular, cadeias de Markov e simulações de Monte Carlo). A introdução de ruído no processo de aprendizado, modelando palavras fora do contexto, resulta em um fenômeno limiar ou crítico que separa regimes onde o aprendizado é possível ou não. A comparação com experimentos onde adultos tentam aprender o mapeamento (artificial) entre palavras e objetos indica que o esquecimento e o erro de discriminação (essencialmente, a lei de Weber que descreve como humanos diferenciam quantidades) desempenham um papel importante na forma com que humanos inferem o mapeamento palavra-objeto.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador / Leonid I. Perlovsky - Integrante / Angelo Cangelosi - Integrante / Tilles, Paulo F C - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Southern Office of Aerospace Research and Development - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 5

  • 2008 - Atual

    Comportamento crítico e quebra de ergodicidade em modelos de comportamento social, Descrição: Duas características geralmente associadas à emergência do comportamento coletivo complexo são a existência de fenômenos limiares (ou críticos) separando diferentes regimes estacionários ou dinâmicos e a dependência desses regimes com as condições iniciais (quebra de ergodicidade). Modelos típicos de comportamento social exibem pelo menos uma dessas características. Por exemplo, o modelo do voto da maioria exibe quebra de ergodicidade apenas; já o Modelo de Axelrod exibe as duas características. Utilizamos métodos da mecânica estatística, em particular a aproximação de n-sítios e teoria de escala de tamanho finito, para estudar a dinâmica e propriedades estatísticas dos estados estacionários de uma ampla gama de modelos mínimos de comportamento social. Apesar de altamente simplificados, esses modelos são bem mais complexos que os modelos clássicos usuais de spins da mecânica estatística, o que torna seu estudo bastante desafiador sob o ponto de vista técnico dessa disciplina. De fato, no caso do modelo de Axelrod de disseminação cultural, que exibe um número infinito de estados absorventes, praticamente nada se sabe sobre a natureza da transição de fase entre estados absorventes espacialmente homogêneos (regime mono-cultural) e estados absorventes heterogêneos (regime multicultural). O objetivo do projeto é oferecer uma análise completa e coerente desses modelos seguindo os padrões de qualidade bem estabelecidos na comunidade de mecânica estatística tradicional.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador / Peres, Lucas R - Integrante / Tilles, Paulo F C - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

  • 2004 - 2010

    Replicadores: aplicações em evolução pré-biótica e linguagem, Descrição: Uma das idéias científicas mais originais e controversas é a sugestão de que muito da complexidade associada à vida e ao comportamento humano é conseqüência da ação não planejada de replicadores. Entende-se por replicador a entidade (genes no caso biológico e idéias ou memes no caso cultural) capaz de se auto-replicar, dadas as condições necessárias para isso. Uma característica importante, embora extremamente restritiva, é que as cópias produzidas, perfeitas ou não, sejam também replicadores. Essa condição é necessária para que a força organizadora da seleção natural possa atuar. Nossa proposta é estudar a emergência e a evolução de replicadores em dois casos de grande importância para muitos ramos da ciência: evolução pré-biótica (origem da vida) e evolução da linguagem. Devido ao conceito unificador de replicador, a formalização matemática bem como a metodologia de estudo são idênticas nessas duas situações, apesar de à primeira vista corresponderem a fenômenos completamente distintos. Métodos analíticos da mecânica estatística de sistemas desordenados (a técnica das réplicas e a contagem de estados meta-estáveis, por exemplo), teoria de processos de ramificação e teoria de sistemas dinâmicos são ferramentas que podem ser empregadas na caracterização dos estados estacionários da dinâmica de replicadores. No contexto da evolução da linguagem, nosso objetivo principal é entender como as limitações sensoriais e de processamento dos agentes determinam e limitam a estrutura da linguagem desenvolvida. Já no contexto da evolução pré-biótica, pretendemos nos concentrar principalmente na questão da emergência de metabolismos através da simulação de uma cinética química artificial, sendo esta uma forma de abordar, através de ?primeiros-princípios?, a origem dos replicadores, visto por muitos como o evento mais fundamental da história da vida. Além desses objetivos admitidamente ambiciosos que servem para nortear o rumo da pesquisa, diversas outras questõ. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 1999 - 2004

    Evolução Molecular Teórica, Descrição: A introdução de métodos moleculares no estudo da Evolução transformou esse campo de pesquisa numa ciência exata, na qual os parâmetros relevantes podem ser medidos com precisão e as teorias testadas contra os dados experimentais. Neste projeto vamos nos concentrar em duas áreas de estudo, a saber, (a) reconstrução da história evolucionária de genes e organismos (inferência ancestral), e (b) evolução pré-biótica ou a origem da vida. Embora essas áreas tenham sido tradicionalmente estudadas separadamente, principalmente porque a origem da vida ainda é uma questão bastante especulativa, vamos argumentar que, pelo menos do ponto de vista teórico, os modelos usados para estudar esses dois problemas são essencialmente os mesmos; a principal diferença sendo a ênfase dada a diferentes características ou grandezas do processo evolucionário. Neste sentido, planejamos usar nossa experiência de 5 anos de trabalho em evolução pré-biótica para abordar problemas de reconstrução filogenética e genealógica. Esse tipo de problema possui enorme importância prática como, por exemplo, a elucidação da origem e história natural dos vírus. Mais especificamente, vamos nos concentrar nos efeitos da seleção (ou reprodução diferenciada) nas propriedades estatísticas de árvores genealógicas tais como os padrões de adjacência e a distribuição de distâncias internodais. Embora essas propriedades sejam bem entendidas no caso de evolução neutra, há muito poucos trabalhos que levam a seleção em conta. Com relação ao tema evolução pré-biótica, vamos nos concentrar principalmente na aplicação de idéias da teoria de seleção de grupos para explicar a coexistência estável de moléculas auto-replicadoras com taxas de replicação distintas. Essa coexistência é fundamental para o surgimento de aglomerados moleculares complexos capazes de funcionar como um metabolismo rudimentar.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

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Prêmios

2004

Fellow of The Institute of Physics, The Institute of Physics - England.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade de São Paulo, Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar. , Avenida Trabalhador SãoCarlense, 400, Arnold Schmidt, 13566-590 - Sao Carlos, SP - Brasil - Caixa-postal: 369, Telefone: (16) 33739849, Fax: (16) 33739877

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Experiência profissional

  • 2003 - Atual

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 1994 - 2003

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 1988 - 1994

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 01/2009

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Física de São Carlos, .,Linhas de pesquisa

    • 11/1988

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.,Linhas de pesquisa

    • 11/1988

      Ensino, Bacharelado Em Física, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Mecânica Quântica, Mecânica Estatística, Física Geral

    • 11/1988

      Ensino, Física São Carlos, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Eletromagnetismo, Mecânica Quântica, Mecânica Estatística, Processos Estocásticos

    • 04/2010 - 03/2014

      Direção e administração, Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.,Cargo ou função, Chefe de Departamento.

    • 12/2003 - 12/2007

      Direção e administração, Instituto de Física de São Carlos, .,Cargo ou função, Vice-Diretor.

    • 02/2002 - 07/2004

      Direção e administração, Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.,Cargo ou função, Presidente da Comissão de Pós-Graduação.

    • 02/2002 - 07/2004

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.,Cargo ou função, Presidente da Comissão de Pós-Graduação.