JOSE FERNANDO FONTANARI

Possui graduação em Bacharelado em Física pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (1985) e doutorado em Física pelo Instituto de Física de São Carlos da Universidade de São Paulo (1988). É Professor Titular da Universidade de São Paulo desde 2003. Tem experiência na área de Física Estatística, com ênfase em aplicações em problemas biológicos e sócio-culturais atuando principalmente nos seguintes temas: dinâmica de populações, inteligência coletiva e modelagem matemática de sistemas sociais. Atualmente é editor chefe do Physics of Life Reviews (Elsevier, IF: 14.3). Atua também como membro do corpo editorial dos periódicos Theory in Biosciences (Springer, IF: 1.3), Mathematics (MDPI, IF: 2.2) e Frontiers in Ecology and Evolution - Behavioral and Evolutionary Ecology (Frontiers, IF: 2.6).

Informações coletadas do Lattes em 20/07/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Física São Carlos

1985 - 1988

Universidade de São Paulo
Título: Processamento de Informações em Redes de Neurônios Síncronas
Orientador: Roland Köberle
, Ano de obtenção: 1988. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Redes Neurais; Vidros de Spin; memória associativa.Grande área: Ciências Exatas e da TerraSetores de atividade: Informática.

Graduação em Bacharelado Em Física

1981 - 1985

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Pós-doutorado

1994

Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: , Ano de obtenção: 1994.

1988 - 1989

Pós-Doutorado. , California Institute of Technology, CALTECH, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Idiomas

Inglês

Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Fala Razoavelmente, Escreve Pouco.

Francês

Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Física Estatística e Termodinâmica.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Física Biológica.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Probabilidade e Estatística Aplicadas.

Organização de eventos

PERLOVSKY, L. I. ; Fontanari, José F. ; CANGELOSI, A. ; LEVINE, D. ; KOZMA, R. . CCMB14 - Symposium Series on Computational Intelligence. 2014. (Congresso).

PERLOVSKY, L. I. ; COYLE, D. ; ANG, K. K. ; Fontanari, José F ; KOZMA, R. . CCMB 2013, IEEE Symposium on Computational Intelligence, Cognitive Algorithms, Mind, and Brain. 2013. (Congresso).

YANG, H. M. ; FONTANARI, J. F. . II Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics. 2007. (Congresso).

PERLOVSKY, L. I. ; FONTANARI, J. F. . IEEE 2005 Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems KIMAS'05. 2005. (Congresso).

FONTANARI, J. F. . XXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1999. (Congresso).

Participação em eventos

2nd Workshop on Modeling and Applications of Evolutionary Game Theory.When less is more: Evolutionary dynamics of deception in a sender?receiver game. 2025. (Oficina).

Evolution of complexity and statistical physics. When less is more: Evolutionary dynamics of deception in a sender?receiver game. 2025. (Congresso).

Evolution of complexity and statistical physics.A soluble model for synchronized rhythmic activity in social insects.. 2024. (Oficina).

I Workshop on Applied Statistics and Stochastic Processes.Citation counts: the world of sleeping beauties and shooting stars. 2023. (Oficina).

Evolution of Complexity from the Statistical Physics Perspective.The threat of disinformation to epistemic security: an exactly solvable model.. 2022. (Simpósio).

Models in Population Dynamics, Ecology and Evolution 2022. The threat of disinformation to epistemic security: an exactly solvable model. 2022. (Congresso).

Encontro Nacional de Física Estatística.Burnout in times of Covid-19: a mathematical model. 2021. (Encontro).

Workshop on Sociophysics: Social Phenomena from a Physics Perspective.Wisdom of Crowds: fact or fake?. 2021. (Oficina).

XXXV Encontro de Física do Norte e Nordeste.Wisdom of Crowds: fact or fake?. 2021. (Encontro).

Joint ICTP-SAIFR/ICTP-Trieste School on Mathematical Models of Evolution. 2019. (Simpósio).

The Mathematics of Games in the Applied Sciences.Population dynamics of overshoot and collapse. 2018. (Oficina).

Encontro Nacional de Física Estatística (ENFE 2017).Task-forces: what is the optimal organization?. 2017. (Encontro).

4°. Workshop de High Performance Computing.Effect of group organization on the performance of cooperative problem-solving systems. 2016. (Oficina).

Seventh Workshop Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences.When more of the same is better. 2016. (Oficina).

Models in Population Dynamics and Ecology 2015.Diffusion of innovations in Axelrod?s model of culture dissemination. 2015. (Oficina).

Non standard transport: from anomalous diffusion to reaction spreading in heterogeneous systems.Diffusion approximation and multi-level selection. 2015. (Oficina).

Simpósio de Evolução Cultural.Evolução Cultural e aquisição da linguagem. 2015. (Simpósio).

14th International Conference Computational and Mathematical Methods in Science and Engineering. Cooperative solution of cryptarithmetic problems. 2014. (Congresso).

7th Workshop on Thermodynamics, Disequilibrium and Evolution (TDE).Non-zero sum games in prebiotic evolution. 2014. (Oficina).

Fifth Workshop on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences.Hamilton's rule in Kimura's diffusion model of intergroup selection. 2014. (Oficina).

IEEE Symposium Series on Computational Intelligence (IEEE SSCI 2014).Solving a cryptarithmetic problem using a social learning heuristic. 2014. (Simpósio).

Models in Population Dynamics and Ecology MPDE14. Synergistic effects in the evolution of social behavior. 2014. (Congresso).

Fourth Workshop on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences.The diffusion approximation for template coexistence in protocells. 2013. (Oficina).

Mathematical Congress of the Americas. A diffusion model of intergroup selection for the evolution of coexistence between distinct self-replicating molecules. 2013. (Congresso).

The Society for Mathematical Biology Annual Meeting and Conference 20 (SMB 2013). Effect of migration in a diffusion model for template coexistence in protocells. 2013. (Congresso).

BIOMAT 2012 International Symposium on Mathematical and Computational Biology.. ..Associative learning of a lexicon in a noisy cross-situational scenario. 2012. (Simpósio).

Models in Population Dynamics and Ecology MPDE12.Non-zero-sumness and the origin of complexity in prebiotic evolution. 2012. (Oficina).

Third Workshop on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Science.Analytical solution of the n-site approximation of the dynamics of the majority model for the spread of rumors in a chain. 2012. (Oficina).

BIOMAT 2011 International Symposium on Mathematical and Computational Biology.Genetic Redundancy and the origin of chromosomes. 2011. (Simpósio).

IEEE Symposium Series on Computational Intelligence SSCI2011.The performance of a linear learning algorithm for cross-situational vocabulary learning. 2011. (Simpósio).

Microbial and Viral Evolution.Remarks on cultural evolution. 2011. (Oficina).

The 2011 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN 2011). Emotions of Cognitive Dissonance. 2011. (Congresso).

2010 IEEE World Congress on Computational Intelligence. A Computational model of adults' performance in naming objecys using cross-situational learning. 2010. (Congresso).

BIOMAT 2010 International Symposium on Mathematical and Computational Biology.Cultural Evolution in a lattice: the majority-vote model as a frequency-dependent bias model of cultural transmission. 2010. (Simpósio).

Interdisciplinary Workshop on Society, Culture and Language.How NOT to influence people. 2010. (Oficina).

The 3rd Conference of Computational and Mathematical Population Dynamics. A model of frequency-dependent bias for the spread of opinions in a lattice. 2010. (Congresso).

2009 International Joint Conference on Neural Networks. A cross-situational algorithm for learning a lexicon using Neural Modeling Fields. 2009. (Congresso).

55 Congresso Brasileiro de Genética. Preservação da informação em modelos de empacotamento genético. 2009. (Congresso).

BIOMAT 2009 International Symposium on Mathematical amd Computational Biology.Effect of mass media on the cultural diversity of Axelrod model of social influence. 2009. (Simpósio).

XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Effect of mass media on the cultural diversity of Axelrod Model of social influence. 2009. (Congresso).

2008 IEEE World Congress on Computational Intelligence. Object perception in the Neural Modeling Fields framework. 2008. (Congresso).

BIOMAT 2008 International Symposium on Mathematical and Computational Biology.A population dynamics approach to language evolution. 2008. (Simpósio).

2007 IEEE International Conference on Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. How communication can improve differentiation in the Modeling Field Theory framework. 2007. (Congresso).

2007 International Joint Conference on Neural Networks. Language acquisition and category discrimination in the Modeling Field Theory Framework. 2007. (Congresso).

II Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics (CMPD2). Inverse density dependence in the evolution of communication. 2007. (Congresso).

Workshop on Genes, Infections and Epidemics.Preservation of information in gene package models. 2007. (Oficina).

2006 IEEE World Congress on Computational Intelligence and IEEE International Joint Conference on Neural Networks IJCNN'06. Meaning creation and communication in a community of agents. 2006. (Congresso).

6th International Conference on Language Evolution (EVOLANG6). Allee Effect on language evolution. 2006. (Congresso).

XXIV Encontro de Físicos do Norte e Nordeste. Jogos de adivinhação e a aquisição da linguagem. 2006. (Congresso).

1st Latin American School and Conference on: ?Statistical Physics and Applications". Theoretical Aspects of Population Genetics: Kimura's approach. 2005. (Congresso).

IEEE 2005 International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. Meaning Creation and Modeling Field Theory. 2005. (Congresso).

Workshop on Aspects of Self-Organization in Evolution.Muller's ratchet and host-parasite dynamics. 2005. (Oficina).

Workshop on Biomathematics.Zipf law, language and population genetics. 2004. (Oficina).

IEEE International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. Catalytic Reaction Sets, Decay, and the Preservation of Information. 2003. (Congresso).

Participação em bancas

Aluno: Alex Kunze Susemihl

ALFONSO, N. F. C.; HENRIQUES, V. B.;Fontanari, José F. Aplicações de Mecânica Estatística à Psicologia Moral. 2010. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Felipe Lorenzen

MOUSSA, M. H. Y.; ALMEIDA, N. G.;FONTANARI, J. F.. Extensão dos Be-ables de Bell e competição Atenuação x Amplificação. 2009. Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Guilherme da Costa Pereira Innocentini

HORNOS, J. E. M.; BOSCO, F. A. R.;FONTANARI, J. F.. Modelamento Estocástico para a expressão genica. 2008. Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: David Dobrigkeit Chinellato

AGUIAR, M. A. M.; CERDEIRA, F.;FONTANARI, J. F.. Processos Dinâmicos em Redes Complexas. 2007. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fábio Schittler Neves

ERICHSEN JR, R.;FONTANARI, J. F.; VEIT, E. A.; THEUMANN, A. G. R.. Redes de Neurônios Não-Monótonas em Camadas. 2006. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Oscar Felipe Falcão Raposo

CAMPOS, P. R. A.;FONTANARI, J. F.; CORDEIRO, G. M.. Dependência da velocidade da Catraca de Muller com fluxo de mutações benéficas. 2006. Dissertação (Mestrado em Biometria e Estatística Aplicada) - Universidade Federal Rural de Pernambuco.

Aluno: Pedro Castro Menezes Xavier de Mello e Silva

FONTANARI, J. F.; GUSMAO, M. A. C.; GAY, M. B.; THEUMANN, A. G. R.. Modelo Esférico Quântico de Vidro de Spin na Aproximação de Recozimento. 2005. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Milton Taidi Sonoda

SONODA, M. T.;FONTANARI, J. F.; CASTRO, T. T.; THIEMANN, O. H.. Dinâmica e Genealogia de Modelos de Evolução. 2001. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Alexandre Colato

COLATO, A.; MIZRAHI, S. S.;FONTANARI, J. F.; MALTA, C. P.. Efeitos de difusão em dinâmica de populações em uma e duas dimensões. 2000. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal de São Carlos.

Aluno: Didier Augusto Vega Oliveros

RODRIGUES, FRANCISCO A.; TRAVIESO, G.; SILVA FILHO, A. C. R.; MELLO, M. A. R.;Fontanari, José F.. Dinâmicas de propagação de informações e rumores em redes sociais. 2017. Tese (Doutorado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Roberta Regina Delboni

YANG, H. M.; CALSAVARA, B. M. R.; BOLDRINI, J. L.;FONTANARI, J. F.; MANCERA, P. F. A.. Estudo de Estratégia de Contenção do Crescimento de Micro-organismos Patogênicos em Alimentos. 2015. Tese (Doutorado em Matemática Aplicada) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Hansenclever de França Bassani

CAVALCANTI, G. D. C.; VASCONCELOS, G. C.;FONTANARI, J. F.; BRAGA, A. P.; LIMA NETO, F. B.. Modelos Neurais Modulares para Aquisição de Linguagem Natural. 2014. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Rafael Sola de Paula de Angelo Calsaverini

PRADO, C. P. C.; PENNA, T. J. P.; IDIART, M. A. P.; VIEIRA, A. P.;FONTANARI, J. F.. Tópicos em mecânica estatística de sistemas complexos: Uma abordagem mecânico-estatística de dois tópicos de interesse em finanças, economia e sociologia. 2013. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Júlio César Mansur Filho

DICKMAN, R.; PIRES, A. S. T.; FERREIRA JUNIOR, S. C.; CASTRO, T. T.;FONTANARI, J. F.. Caminhantes aleatórios sonolentos: Análise exata em sistemas pequenos e simulações de Monte Carlo. 2012. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Elizabeth Machado Baptestini Andrade

AGUIAR, M. A. M.; TANASHIRO, M. N.; FREITAS, A. V. L.;Fontanari, José F; MARTINS, Marcelo Lobato. Especiação sem Barreiras e Padrões de diversidade. 2010. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Lauro Antônio Barbosa

SILVA, Jafferson Kamphorst Leal da; DICKMAN, R.; OLIVEIRA, P. M.;FONTANARI, J. F.; BARBOSA, P. L. M.. Leis de Escala Alométricas para as taxas metabólicas interespecíficas e para cadeias alimentares. 2007. Tese (Doutorado em Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Tiago de Paula Peixoto

PRADO, C. P. C.; ALFONSO, N. F. C.;FONTANARI, J. F.; MARTINS, J. S. S.; VASCONCELOS, G. L.. Criticalidade auto-organizada no modelo Olami-Feder-Christensen de terremotos: dinâmica de epicentros. 2007. Tese (Doutorado em doutorado em física IFUSP) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carlos Eduardo Fiore dos Santos

OLIVEIRA, M. J.; PRADO, C. P. C.; PLASCAK, J. A.; STILCK, J. F.;FONTANARI, J. F.. Sistemas fora do equilíbrio termodinâmico: Um estudo em diferentes abordagens. 2006. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Guilherme José de Moraes Garcia

FONTANARI, J. F.; BERNARDES, A. T.; CASTRO, T. T.; OLIVEIRA, A. G.; DICKMAN, R.. Tópicos em Biofísica: Alometria dos ossos; O modelo BS para a evolução das espécies; O fluxo de ar no nariz humano. 2005. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Silvio da Costa Ferreira Júnior

FONTANARI, J. F.; MARTINS, Marcelo Lobato; VILELA, Marcelo José; VASCONCELOS, Amílton César; COUTINHO, Sergio Galvão; SILVA, Jafferson Kamphorst Leal da. Modelos de Reação-Difusão para o Crescimento de Tumores. 2003. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: Fernando Fagundes Ferreira

FERREIRA, F. F.;FONTANARI, J. F.KOBERLE, R.; ONODY, R. N.; OLIVEIRA, P. M.; MARCHETTI, D. H. U.. Análise estatística do problema da partição numérica. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Claudia Pio Ferreira

FERREIRA, C. P.FONTANARI, J. F.; ONODY, R. N.; CALIRI, A.; BERNARDES, A. T.; OLIVEIRA, S. M.. Dinâmica de replicação na rede: aplicações em modelos de evolução pré-biótica e de formação de úlceras.. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paulo Roberto de Araújo Campos

CAMPOS, P. R. A.FONTANARI, J. F.; ALFONSO, N. F. C.; MENDES, T.; MIZRAHI, S. S.; CALIRI, A.. Modelos de integração de informação em evolução pré-biótica. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Nazareno Getter Ferreira de Medeiros

ONODY, R. N.; MEDEIROS, N. G. F.;FONTANARI, J. F.; GARRATT, R. C.; OLIVEIRA, S. M.; PRADO, C. P. C.. Modelos evolucionários de envelhecimento biológico. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Alexandre da Silva Rosas

ROSAS, A. S.; COUTINHO, S. G.; COUTINHO FILHO, M. D.; RAPOSO, E. C. P.; CONTINENTINO, M. A.;FONTANARI, J. F.. Modelo de Ising com campo aleatório: termodinâmica, propriedades críticas e estrutura local do parâmetro de ordem.. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Rogério A L

COSTA, R. A. L.;FONTANARI, J. F.. Costa. O problema de generalização em uma rede de Hopfield com exemplos ponderados. 2000. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

UGARTE, D. M.; HICKMAN, I. A. B. E.; BARBOSA, M. C. B.; CANUTO, S.;Fontanari, José F.. Concurso para Professor Titular no Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar do IFS-USP. 2022. Universidade de São Paulo.

FERREIRA, L. C. F.; STRUCHINER, C. J.; NACHBIN, A.;Fontanari, José F.; RINCON, M. A.. Avaliação de acesso à Classe E (Professor Titular) de Max Oliveira de Souza IME-UFF. 2021. Universidade Federal Fluminense.

ALBUQUERQUE, E. L.; CANTO, F.; PEREIRA, D.; RIVELLES, V.;Fontanari, José F. Concurso para Professor Titular do IF/UFF. 2009. Universidade Federal Fluminense.

CALDEIRA, A. O.; ZANOTTO, E. D.; CERDEIRA, F.; OLIVEIRA JUNIOR, O. N.;Fontanari, José F. Concurso para Professor Titular IFSC-USP. 2009. Universidade de São Paulo.

FONTANARI, J. F.; STRUCHINER, C. J.; MASSAD, E.; BOLDRINI, J. L.; SOTOMAYOR, P. A. L.. Concurso Professor Titular em Biomatemática UNICAMP. 2005. Universidade Estadual de Campinas.

VEIGA, P. A. F.; SILVA, T. P.;Fontanari, Jose Fernando; SILVA, P. J. S. E.; DIAS, R.. Concurso para Professor Doutor na área Matemática e Estatística Aplicadas à Indústria. 2022. Universidade de São Paulo.

NASCIMENTO, R. V.;Fontanari, José F.; FOSSALUZA, V.; POLDI, K. C.; DUCATI, G. C.. Concurso para Professor Adjunto na área de Matemática Aplicada na UFABC. 2018. Universidade Federal do ABC.

ORTIZ, W. A.; CARDOSO, C. A.;FONTANARI, J. F.; SILVA, L. C.; ROVERSI, J. A.. Concurso para Professor Adjunto A-DE no DF-UFSCar. 2014. Universidade Federal de São Carlos.

BASSANEZI, R. C.;Fontanari, Jose Fernando; VARRIALE, M. C.. Concurso para Professor Adjunto no IM-UFRGS. 2013. Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Orientou

Eduardo Vinícius Macedo Vieira

A evolução da mentira: o jogo do Remetente-Receptor; Início: 2023; Dissertação (Mestrado em Fisica (SC)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

PEDRO MASOTTI MORETTI DA SILVEIRA

Divisão do trabalho e sincronicidade; Início: 2023; Dissertação (Mestrado em Fisica (SC)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Henrique de Almeida Tórtura

Credulidade completa e erosão da confiança em um modelo de informação enganosa; 2025; Dissertação (Mestrado em Fisica (SC)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Guilherme Martins Lopes

Dinâmica populacional de engenheiros de ecossistemas com a função de crescimento de Beverton-Holt; 2021; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Jorge Augusto Salgado Salhani

Modelando brainstorming com sistemas quadro-negro; 2021; Dissertação (Mestrado em Fisica (SC)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Heitor Bittencourt

Estratégias de busca e transição de fase no problema da satisfatibilidade Booliana aleatório; 2021; Dissertação (Mestrado em Fisica (SC)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Larissa Fernandes Aquino

Algoritmos bio e socio-inspirados na busca pelos máximos globais de relevos adaptativos; 2020; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Caroline Franco

A dinâmica espacial de engenheiros de ecossistemas; 2018; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Elias José Portes Biral

O limite termodinâmico do modelo de Axelrod unidimensional de duas características e dois estados; 2016; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Lucas Vieira Guerreiro Rodrigues Peres

A modelagem estocástica aplicada à manutenção da diversidade cultural; 2010; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Daniel Marques Gomes Silvestre

Cooperação e conflito em modelos de vesículas pré-bióticas; 2006; 0 f; Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Danielle Oliveira Costa Santos

Modelos de ecossistemas com interações não lineares; 2004; Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Daniela Favarão Botelho

Dinâmica de Modelos de Genética de Populações com Recombinação; 2003; Dissertação - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Milton Taidi Sonoda

Dinâmica e genealogia de modelos de evolução; 2001; Dissertação - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Daniela Maria Lemos Barbato

O Efeito de Lesões Nas Capacidades de Memorização e Generalização de Um Perceptron; 1993; Dissertação (Mestrado em Física) - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Lucas Rodrigues Peres

Estudos no modelo de Axelrod de disseminação cultural: transição de fase e campo externo; 2014; Tese (Doutorado em Física São Carlos) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

[Nome removido após solicitação do usuário]

Ensaios analíticos e numéricos de processos estocásticos unidimensionais; 2009; Tese (Doutorado em Física São Carlos) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Fábio Campos Poderoso

Ecossistemas de Replicadores: uma abordagem via Mecânica Estatística de Sistemas Desordenados; 2007; Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Giovano de Oliveira Cardozo

Dinâmica de populações em autômatos celulares; 2006; Tese (Doutorado em Física São Carlos) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Leonardo Paulo Maia

Dinâmica Adaptativa, Genealogias e Testes Estatísticos de Neutralidade em Evolução Molecular; 2004; Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Alexandre Colato

Acúmulo de mutações em linhagens assexuadas: uma abordagem via experimentos computacionais; 2004; Tese (Doutorado em Física São Carlos) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Fernando Fagundes Ferreira

Análise Estatística do Problema da Partição Numérica; 2001; Tese (Doutorado em Física São Carlos) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Paulo Roberto de Araújo Campos

Modelos de integração de informação em evolução pré-biótica; 2001; Tese - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Claudia Pio Ferreira

Dinâmica de replicação na rede: aplicações em modelos de evolução pré-biótica e de formação de úlceras; 2001; Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Viviane Moraes de Oliveira

Modelos de vidros de spin com interações de ordem alta; 2000; Tese - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Ana Tereza Costa Silva

Modelos de Seleção de Grupo em Evolução Pré-biótica; 2000; Tese - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Domingos Alves

Análise Estatística da Teoria de Quase-Espécies de Evolução Molecular; 1999; Tese - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Daniela Maria Lemos Barbato

Estudo Analítico do Efeito da Diluição Em Perceptrons; 1998; Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Camilo Rodrigues Neto

Propriedades de Recuperação de Memórias Em Redes Neurais Atratoras; 1997; Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Sandro Martinelli Reia

2020; Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Jose Fernando Fontanari;

Paulo Freitas Gomes

2018; Universidade de São Paulo, ; Jose Fernando Fontanari;

Paulo Fernando Coimbra Tilles

2015; Instituto de Física de São Carlos, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Jose Fernando Fontanari;

Lauro Antônio Barbosa

2008; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Jose Fernando Fontanari;

Alexandre Rosas

2002; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Jose Fernando Fontanari;

Willem Hordijk

2002; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Jose Fernando Fontanari;

Matheus Stefanini Mariano

Cooperação e competição na evolução pré-biótica: o efeito da população finita; 2022; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Físicas e Biomoleculares) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Matheus Steigenberg Populim

O problema do caminho mínimo: Physarum polycephalum vs; redes neurais; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Davi Arrais Nobre

A sabedoria das massas: o efeito da distribuição das estimativas individuais; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Fernando Fontanari;

Produções bibliográficas

ISHIKAWA, BIANCA Y. S. ; Fontanari, José F. . Revisiting institutional punishment in the N-person prisoner?s dilemma. THEORY IN BIOSCIENCES , v. 144, p. 1-17, 2025.
VIEIRA, EDUARDO V.M. ; Fontanari, José F. . When less is more: Evolutionary dynamics of deception in a sender-receiver game. PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS , v. 670, p. 130614, 2025.
VIEIRA, EDUARDO V. M. ; Fontanari, José F. . A Soluble Model for the Conflict between Lying and Truth-Telling. Mathematics , v. 12, p. 414, 2024.
Fontanari, José F. ; SANTOS, MAURO . The dynamics of casual groups can keep free-riders at bay. MATHEMATICAL BIOSCIENCES , v. 372, p. 109188, 2024.
Fontanari, José F. ; DE OLIVEIRA, VIVIANE M. ; CAMPOS, PAULO R.A. . Evolving division of labor in a response threshold model. Ecological Complexity , v. 58, p. 101083, 2024.
SOARES, J. P. M. ; Fontanari, José F. . N-player game formulation of the majority-vote model of opinion dynamics. PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS , v. 643, p. 129829, 2024.
Fontanari, José F. . Imitation dynamics and the replicator equation. EPL , v. 146, p. 47001, 2024.
DA SILVEIRA, PEDRO M.M. ; Fontanari, José F. . A soluble model for synchronized rhythmic activity in ant colonies. MATHEMATICAL BIOSCIENCES , v. 375, p. 109245, 2024.
MARIANO, MATHEUS S. ; Fontanari, José F. . Evolutionary Game-Theoretic Approach to the Population Dynamics of Early Replicators. Life-Basel , v. 14, p. 1064, 2024.
Fontanari, José F. ; SANTOS, MAURO . Solving the prisoner?s dilemma trap in Hamilton?s model of temporarily formed random groups. JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY , v. 595, p. 111946, 2024.
Fontanari, José F. . Cooperation in the face of crisis: effect of demographic noise in collective-risk social dilemmas. Mathematical Biosciences and Engineering , v. 21, p. 7480-7500, 2024.
DA SILVEIRA, PEDRO M. M. ; Fontanari, José F. . Synchronized Rhythmic Activity of Ants with Distributed Rest Periods. Mathematics , v. 12, p. 3893, 2024.
NETO, NILTON S. SIQUEIRA ; Fontanari, José F. . On the efficacy of the wisdom of crowds to forecast economic indicators. EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL B , v. 96, p. 6, 2023.
Fontanari, José F. . Kant?s Modal Asymmetry between Truth-Telling and Lying Revisited. Symmetry-Basel , v. 15, p. 555, 2023.
Fontanari, José F. . Stochastic Simulations of Casual Groups. Mathematics , v. 11, p. 2152, 2023.
Fontanari, José F. ; MATOS, MARGARIDA ; SANTOS, MAURO . Local adaptation, phenotypic plasticity, and species coexistence. FRONTIERS IN ECOLOGY AND EVOLUTION , v. 11, p. 1077374, 2023.
PINEDA, ARUANE M. ; REIA, SANDRO M. ; CONNAUGHTON, COLM ; Fontanari, José F. ; RODRIGUES, FRANCISCO A. . Cultural heterogeneity constrains diffusion of innovations. EPL , v. 143, p. 42003, 2023.
REIA, SANDRO M. ; Fontanari, José F. . Long-term scientific impact revisited. European Physical Journal Plus , v. 137, p. 161, 2022.
TÓRTURA, HENRIQUE A. ; Fontanari, José F. . The synergy between two threats: Disinformation and COVID-19. MATHEMATICAL MODELS & METHODS IN APPLIED SCIENCES , v. 32, p. 2077-2097, 2022.
HARDY, PETER ; MARCOLINO, LEANDRO SORIANO ; Fontanari, José F. . The paradox of productivity during quarantine: an agent-based simulation. EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL B , v. 94, p. 40, 2021.
REIA, SANDRO M. ; Fontanari, José F. . A SIR epidemic model for citation dynamics. European Physical Journal Plus , v. 136, p. 207, 2021.
REIA, SANDRO M ; Fontanari, José F . Wisdom of crowds: much ado about nothing. JOURNAL OF STATISTICAL MECHANICS-THEORY AND EXPERIMENT , v. 2021, p. 053402, 2021.
Fontanari, José F. . A stochastic model for the influence of social distancing on loneliness. PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS , v. 584, p. 126367, 2021.
REIA, SANDRO M ; GOMES, PAULO F ; Fontanari, José F . Comfort-driven mobility produces spatial fragmentation in Axelrod?s model. JOURNAL OF STATISTICAL MECHANICS-THEORY AND EXPERIMENT , v. 2020, p. 033402, 2020.
REIA, SANDRO M. ; AQUINO, LARISSA F. ; Fontanari, José F. . The surprising little effectiveness of cooperative algorithms in parallel problem solving. EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL B , v. 93, p. 140, 2020.
NOBRE, DAVI A. ; Fontanari, José F. . Prediction Diversity and Selective Attention in the Wisdom of Crowds. COMPLEX SYSTEMS , v. 29, p. 861-875, 2020.
REIA, SANDRO M. ; AMADO, ANDRÉ C. ; Fontanari, José F. . Agent-based models of collective intelligence. Physics of Life Reviews , v. 31, p. 320-331, 2019.
CAMPOS, PAULO R A ; Fontanari, José F . Predictability of imitative learning trajectories. JOURNAL OF STATISTICAL MECHANICS-THEORY AND EXPERIMENT , v. 2019, p. 013501, 2019.
GOMES, PAULO F. ; REIA, SANDRO M. ; RODRIGUES, FRANCISCO A. ; Fontanari, José F. . Mobility helps problem-solving systems to avoid groupthink. PHYSICAL REVIEW E , v. 99, p. 032301, 2019.
M LOPES, GUILHERME ; F FONTANARI, JOSÉ . Influence of technological progress and renewability on the sustainability of ecosystem engineers populations. MATHEMATICAL BIOSCIENCES AND ENGINEERING (ONLINE) , v. 16, p. 3450-3464, 2019.
REIA, SANDRO M. ; GOMES, PAULO F. ; Fontanari, José F. . Individual decision making in task-oriented groups. EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL. B, CONDENSED MATTER AND COMPLEX SYSTEMS (INTERNET) , v. 92, p. 109, 2019.
REIA, SANDRO M. ; GOMES, PAULO F. ; Fontanari, José F. . Policies for allocation of information in task-oriented groups: elitism and egalitarianism outperform welfarism. EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL. B, CONDENSED MATTER AND COMPLEX SYSTEMS (INTERNET) , v. 92, p. 205, 2019.
Fontanari, José . The Collapse of Ecosystem Engineer Populations. Mathematics , v. 6, p. 9, 2018.
Fontanari, José F. . Reputation blackboard systems. Cognitive Systems Research , v. 50, p. 29-35, 2018.
Fontanari, José F. . Awareness improves problem-solving performance. Cognitive Systems Research , v. 45, p. 52-58, 2017.
FRANCO, CAROLINE ; Fontanari, José F. . The spatial dynamics of ecosystem engineers. MATHEMATICAL BIOSCIENCES , v. 292, p. 76-85, 2017.
Fontanari, José F. ; SANTOS, MAURO . The revival of the Baldwin effect. EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL B , v. 90, p. 186, 2017.
REIA, SANDRO M. ; HERRMANN, SEBASTIAN ; Fontanari, José F. . Impact of centrality on cooperative processes. PHYSICAL REVIEW E , v. 95, p. 022305, 2017.
Fontanari, José F. . When more of the same is better. Europhysics Letters (Print) , v. 113, p. 28009, 2016.
Fontanari, José F. ; RODRIGUES, FRANCISCO A. . Influence of network topology on cooperative problem-solving systems. Theory in Biosciences , v. 135, p. 101-110, 2016.
REIA, SANDRO M. ; Fontanari, José F. . Effect of long-range interactions on the phase transition of Axelrod's model. PHYSICAL REVIEW E , v. 94, p. 052149, 2016.
REIA, SANDRO M. ; Fontanari, José F. . Effect of group organization on the performance of cooperative processes. Ecological Complexity , v. 30C, p. 47-56, 2016.
SANTOS, MAURO ; SZATHMÁRY, EÖRS ; Fontanari, José F. . Phenotypic plasticity, the Baldwin effect, and the speeding up of evolution: The computational roots of an illusion. Journal of Theoretical Biology , v. 371, p. 127-136, 2015.
BIRAL, ELIAS J P ; Tilles, Paulo F C ; Fontanari, José F . The consensus in the two-feature two-state one-dimensional Axelrod model revisited. Journal of Statistical Mechanics , v. 2015, p. P04006, 2015.
Fontanari, José F. . Exploring NK fitness landscapes using imitative learning. European Physical Journal. B, Condensed Matter and Complex Systems (Internet) , v. 88, p. 251, 2015.
Tilles, Paulo F C ; Fontanari, José F . Diffusion of innovations in Axelrod?s model. Journal of Statistical Mechanics , v. 2015, p. P11026, 2015.
PERES, LUCAS R. ; Fontanari, José F. . The nature of the continuous non-equilibrium phase transition of Axelrod's model. EPL (Europhysics Letters) , v. 111, p. 58001, 2015.
Fontanari, José F. ; SERVA, MAURIZIO . Nonlinear group survival in Kimura?s model for the evolution of altruism. Mathematical Biosciences , v. 249, p. 18-26, 2014.
Fontanari, José F. ; SERVA, MAURIZIO . Effect of Migration in a Diffusion Model for Template Coexistence in Protocells. Bulletin of Mathematical Biology , v. 76, p. 654-672, 2014.
Fontanari, José F. . Imitative Learning as a Connector of Collective Brains. PLoS One , v. 9, p. e110517, 2014.
FONTANARI, J. F. ; SERVA, M. . Solvable model for template coexistence in protocells. Europhysics Letters (Print) , v. 101, p. 38006, 2013.
Tilles, Paulo F C ; Fontanari, José F . Reinforcement and inference in cross-situational word learning. Frontiers in Behavioral Neuroscience , v. 7, p. 163, 2013.
Fontanari, José F ; BONNIOT-CABANAC, M.-C. ; CABANAC, M. ; PERLOVSKY, L. I. . A structural model of emotions of cognitive dissonances. Neural Networks , v. 32, p. 57-64, 2012.
Tilles, Paulo F C ; Fontanari, José F . Mean-field analysis of the majority-vote model broken-ergodicity steady state. Journal of Statistical Mechanics , v. 2012, p. P07003, 2012.
TILLES, P. F. C. ; FONTANARI, J. F. . Critical behavior in a cross-situational lexicon learning scenario. Europhysics Letters (Print) , v. 99, p. 60001, 2012.
Peres, Lucas ; Fontanari, José . Effect of external fields in Axelrod's model of social dynamics. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear and Soft Matter Physics (Online) , v. 86, p. 031131, 2012.
TILLES, PAULO F.C. ; Fontanari, José F. . Minimal model of associative learning for cross-situational lexicon acquisition. Journal of Mathematical Psychology (Print) , v. 56, p. 396-403, 2012.
Fontanari, Jose Fernando ; Cangelosi, Angelo . Cross-situational and supervised learning in the emergence of communication. Interaction Studies , v. 12, p. 119-133, 2011.
Peres, L.R. ; Fontanari, José F . The media effect in Axelrod?s model explained. Europhysics Letters (Print) , v. 96, p. 38004, 2011.
Peres, Lucas R ; Fontanari, José F . The mass media destabilizes the cultural homogenous regime in Axelrod's model. Journal of Physics. A, Mathematical and Theoretical (Print) , v. 43, p. 055003, 2010.
Peres, L.R. ; Fontanari, José F . Statistics of opinion domains of the majority-vote model on a square lattice. Physical Review E. (Cessou em 2000. Cont. 1539-3755 Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics) , v. 82, p. 046103, 2010.
Fontanari, José F . Social interaction as a heuristic for combinatorial optimization problems. Physical Review E. (Cessou em 2000. Cont. 1539-3755 Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics) , v. 82, p. 056118, 2010.
Ferreira, Anderson A ; FONTANARI, J. F. . The n -site approximation for the triplet-creation model. Journal of Physics. A, Mathematical and Theoretical (Print) , v. 42, p. 085004, 2009.
BARBOSA, L. A. ; Fontanari, José F . Culture?area relation in Axelrod's model for culture dissemination. Theory in Biosciences , v. 128, p. 205-210, 2009.
Fontanari, José F ; TIKHANOFF, V. ; CANGELOSI, A. ; ILIN, R. ; PERLOVSKY, L. I. . Cross-situational learning of object-word mapping using Neural Modeling Fields. Neural Networks , v. 22, p. 579-585, 2009.
SAAKIAN, D. B. ; FONTANARI, J. F. . Evolutionary dynamics on rugged fitness landscapes: Exact dynamics and information theoretical aspects. Physical Review E. (Cessou em 2000. Cont. 1539-3755 Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics) , v. 80, p. 041903, 2009.
TANNENBAUM, E. ; FONTANARI, J. F. . A quasispecies approach to the evolution of sexual replication in unicellular organisms. Theory in Biosciences , v. 127, p. 53-65, 2008.
SILVESTRE, D.A.M. M. ; FONTANARI, J. F. . Package models and the information crisis of prebiotic evolution. JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY , v. 252, p. 326-337, 2008.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . How language can help discrimination in the Neural Modelling Fields framework. Neural Networks , v. 21, p. 250-256, 2008.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . A game theoretical approach to the evolution of structured communication codes. Theory in Biosciences , v. 127, p. 205-214, 2008.
SILVESTRE, D.A.M. M. ; FONTANARI, J. F. . The information capacity of hypercycles. Journal of Theoretical Biology , p. 804, 2008.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . Evolving Compositionality in Evolutionary Language Games. IEEE Transactions on Evolutionary Computation , v. 11, p. 758-769, 2007.
SILVESTRE, Daniel Marques Gomes ; FONTANARI, J. F. . Preservation of information in a prebiotic package model. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , v. 75, p. 051909, 2007.
PODEROSO, F. C. ; FONTANARI, J. F. . Model ecosystem with variable interspecies interactions. Journal of Physics. A, Mathematical and General , v. 40, p. 8723-8738, 2007.
CANGELOSI, A. ; TIKHANOFF, V. ; FONTANARI, J. F. ; HOURDAKIS, E. . Integrating Language and Cognition: A Cognitive Robotics Approach. IEEE Computational Intelligence Magazine , v. 2, p. 65-70, 2007.
CARDOZO, G. O. ; FONTANARI, J. F. . First-order transitions in a two-dimensional nonequilibrium replicator model. Physica. A , Amsterdam, v. 359, p. 478-494, 2006.
FONTANARI, J. F. ; SANTOS, M. ; SZATHMARY, E. . Coexistence and error propagation in pre-biotic vesicle models: A group selection approach. Journal of Theoretical Biology , Nova Iorque, v. 239, n.2, p. 247-256, 2006.
CARDOZO, G. O. ; FONTANARI, J. F. . Revisiting the nonequilibrium phase transition of the triplet-creation model. European Physical Journal B , v. 51, p. 555-561, 2006.
TIKHANOFF, V. ; FONTANARI, J. F. ; CANGELOSI, A. ; PERLOVSKY, L. I. . Language and Cognition Integration Through Modeling Field Theory: Category Formation for Symbol Grounding. Lecture Notes in Computer Science , v. 4131, p. 376-385, 2006.
FONTANARI, J. F. ; PODEROSO, F. C. . Controlling species richness in spin-glass model ecosystems. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , v. 74, p. 051919, 2006.
FONTANARI, J. F. . Statistical analysis of discrimination games. European Physical Journal B , v. 54, p. 127-130, 2006.
SILVESTRE, Daniel Marques Gomes ; FONTANARI, J. F. . Template coexistence in prebiotic vesicle models. European Physical Journal B , Berlin, v. 47, n.3, p. 423-429, 2005.
PODEROSO, F. C. ; FONTANARI, J. F. . The random replicator model at nonzero temperature. European Physical Journal B , Paris, v. 48, n.4, p. 557-565, 2005.
MAIA, L. P. ; COLATO, A. ; FONTANARI, J. F. . Effect of selection on the topology of genealogical trees. Journal of Theoretical Biology , Nova Iorque, v. 226, p. 315-320, 2004.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . Solvable null model for the distribution of word frequencies. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , Nova Iorque, v. 70, p. 1-4, 2004.
SANTOS, D. O. C. ; FONTANARI, J. F. . Model ecosystems with random nonlinear interspecies interactions. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , Nova Iorque, v. 70, p. 1-10, 2004.
HORDIJK, W. ; FONTANARI, J. F. ; STADLER, P. F. . Shapes of tree representations of spin-glass landscapes. Journal of Physics. A, Mathematical and General , Bristol, Inglaterra, v. 36, n.13, p. 3671-3681, 2003.
STADLER, P. F. ; HORDIJK, W. ; FONTANARI, J. F. . Phase transition and landscape statistics of the number partitioning problem. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , Nova Iorque, v. 67, n.5, p. 1-6, 2003.
ROSAS, A. ; FONTANARI, J. F. . Spatial Dynamics and the Evolution of Enzyme Production. Origins of Life and Evolution of the Biosphere , Amsterdam, Holanda, v. 33, n.4-5, p. 357-374, 2003.
NOGUEIRA JR., E. ; FONTANARI, J. F. . Slow interaction dynamics in the spherical spin-glass model. Physica. A , Amsterdam, Holanda, v. 329, p. 365-370, 2003.
MAIA, L. P. ; BOTELHO, D. F. ; FONTANARI, J. F. . Analytical solution of the evolution dynamics on a multiplicative-fitness landscape. Journal of Mathematical Biology , Heidelberg, Alemanha, v. 47, n.5, p. 453-456, 2003.
FONTANARI, J. F. ; COLATO, A. ; HOWARD, R. S. . Mutation Accumulation in growing asexual lineages. Physical Review Letters , Nova Iorque, v. 91, n.212, p. 1-4, 2003.
FERREIRA, C. P. ; FONTANARI, J. F. . Nonequilibrium phase transitions in a model for the origin of life. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , Nova Iorque, v. 65, n.2, p. 1-10, 2002.
FONTANARI, J. F. ; STADLER, P. F. . Fractal geometry of spin-glass models. Journal of Physics. A, Mathematical and General , Londres, v. 35, n.7, p. 1509-1516, 2002.
V M de Oliveira ; FONTANARI, J. F. . Complementarity and Diversity in a soluble model ecosystem. Physical Review Letters , Nova Iorque, v. 89, n.14, p. 1-4, 2002.
WILKE, C. O. ; CAMPOS, P. R. A. ; FONTANARI, J. F. . Genealogical Process on a Correlated Fitness Landscape. The Journal of Experimental Zoology , Nova Iorque, v. 294, p. 274-284, 2002.
ROSAS, A. ; FERREIRA, C. P. ; FONTANARI, J. F. . Evolution of protein synthesis in a lattice model of replicators. PHYSICAL REVIEW LETTERS , Nova Iorque, v. 89, n.18, p. 1-4, 2002.
ROSAS, A. ; NOGUEIRA JR., E. ; FONTANARI, J. F. . Multifractal analysis of DNA walks and trails. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , Nova Iorque, EUA, v. 66, n.6, p. 1-6, 2002.
ALVES, D. ; CAMPOS, P. R. A. ; SILVA, A. T. C. ; FONTANARI, J. F. . Group selection models in prebiotic evolution. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , Nova Iorque, EUA, v. 63, n.1, p. 1-9, 2001.
FERREIRA, C. P. ; FONTANARI, J. F. ; SANTOS, R. M. Z. . Phase transitions in a model for the formation of herpes simplex ulcers. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , Nova Iorque, EUA, v. 64, n.4, p. 1-7, 2001.
V M de Oliveira ; FONTANARI, J. F. . Extinctions in the random replicator model. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , Nova Iorque, EUA, v. 64, n.5, p. 1-6, 2001.
COLATO, A. ; FONTANARI, J. F. . Soluble model for the accumulation of mutations in asexual populations. Physical Review Letters , Nova Iorque, EUA, v. 87, n.23, p. 1-4, 2001.
CAMPOS, P. R. A. ; FONTANARI, J. F. ; STADLER, P. F. . Error propagation in the hypercycle. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics , Nova Iorque, v. 61, n.3, p. 2996-3002, 2000.
CAMPOS, P. R. A. ; M T Sonoda ; FONTANARI, J. F. . On the structure of genealogical trees in the presence of selection. Physica. A , Amsterdam, Holanda, v. 283, n.1-2, p. 11-16, 2000.
FERREIRA, F. F. ; FONTANARI, J. F. . Instance space of the number partitioning problem. Journal of Physics. A, Mathematical and General , Londres/Inglaterra, v. 33, n.41, p. 7265-7276, 2000.
V M de Oliveira ; FONTANARI, J. F. . Random replicators with high-order interactions. Physical Review Letters , Nova Iorque, EUA, v. 85, n.23, p. 4984-4987, 2000.
FERREIRA, F. F. ; FONTANARI, J. F. ; STADLER, P. F. . Landscape statistics of the low-autocorrelation binary string problem. Journal of Physics. A, Mathematical and General , Londres, v. 33, n.48, p. 8635-8647, 2000.
CAMPOS, P. R. A. ; FONTANARI, J. F. . Finite-Size Scaling Of The Error Threshold Transition In Finite Populations. Journal of Physics. A, Mathematical and General (Print) (Cessou em 2006. Cont. ISSN 1751-8113 Journal of Physics. A, Mathematical and Theoretical (Pri , Londres, Inglaterra, v. 32, n.1, p. L1-L7, 1999.
SILVA, A. T. C. ; FONTANARI, J. F. . Deterministic Group Selection Model Model For The Evolution Of Altruism. European Physical Journal B, Paris,França, v. 7, n.3, p. 385-392, 1999.
OLIVEIRA ; M, V. ; FONTANARI, J. F. . Replica Analysis Of The P-Spin Interaction Ising Spin-Glass Model. Journal of Physics A: Mathematical and General, Londres/Inglaterra, v. 32, n.12, p. 2285-2296, 1999.
FONTANARI, J. F. ; SILVA, A. T. C. ; Stochastic group selection model for the evolution of altruism. Physica. A (Print) , Amsterdam, Holanda, v. 268, n.2, p. 257-268, 1999.
FERREIRA, F. F. ; FONTANARI, J. F. . Statistical Mechanics Analysis Of The Continuous Number Partitioning Problem. Physica A, Amsterdam, Holanda, v. 269, n.1, p. 58-64, 1999.
V M de Oliveira ; FONTANARI, J. F. ; STADLER, P. F. . Metastable states in short-ranged p-spin glasses. Journal of Physics. A, Mathematical and General (Print) (Cessou em 2006. Cont. ISSN 1751-8113 Journal of Physics. A, Mathematical and Theoretical (Pri , Bristol, Inglaterra, v. 32, p. 8793-8802, 1999.
RODRIGUES NETO, ; FONTANARI, J. F. . Categorization In The Pseudo-Inverse Neural Network. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 31, n.2, p. 531-540, 1998.
FERREIRA, F. F. ; FONTANARI, J. F. . Probabilistic Analysis Of The Number Partitioning Problem. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 31, n.15, p. 3417-3428, 1998.
ALVES, D. ; FONTANARI, J. F. . Error Threshold In Finite Populations. Physical Review E, Nova Iorque, EUA, v. 57, n.6, p. 7008-7013, 1998.
CAMPOS, P. R. A. ; FONTANARI, J. F. . Finite-Size Scaling Of The Quasispecies Model. Physical Review E, Nova Iorque, EUA, v. 58, n.2, p. 2664-2667, 1998.
FONTANARI, J. F. . Cycles In A Synchronous Neural Network. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 30, n.19, p. 6655-6659, 1997.
ALVES, D. ; FONTANARI, J. F. . Error Threshold In The Evolution Of Diploid Organisms. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 30, n.8, p. 2601-2607, 1997.
OLIVEIRA ; M, V. ; FONTANARI, J. F. . Landscape Statistics Of The P-Spin Ising Model. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 30, n.24, p. 8445-8457, 1997.
RODRIGUES NETO, ; FONTANARI, J. F. . Multivalley Structure Of Attractor Neural Networks. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 30, n.22, p. 7945-7951, 1997.
FONTANARI, J. F. . A Statistical Mechanics Analysis Of The Set Covering Problem. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 29, n.3, p. 473-483, 1996.
BARBATO, D. M. L. ; FONTANARI, J. F. . Dilution In Boolean Perceptrons That Learn From Noisy Examples. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 29, n.22, p. 7003-7012, 1996.
ALVES, D. ; FONTANARI, J. F. . Population Genetics Approach To The Quasispecies Model. Physical Review E, Nova Iorque, EUA, v. 54, n.4, p. 4048-4053, 1996.
RODRIGUES NETO, ; FONTANARI, J. F. . Retrieval Properties Of Diluted Attractor Neural Networks. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 29, n.12, p. 3041-3051, 1996.
BARBATO, D. M. L. ; FONTANARI, J. F. . Dilution In A Linear Neural Network. Physical Review E, Nova Iorque, EUA, v. 51, n.6, p. 6219-6229, 1995.
FONTANARI, J. F. . A Statistical Analysis Of The Knapsack Problem. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 28, n.17, p. 4751-4759, 1995.
BARBATO, D. M. L. ; FONTANARI, J. F. . A Replica Analysis Of The Minimum Weight Solution To The Linear Equations Problem. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 27, n.24, p. 8029-8038, 1994.
FONTANARI, J. F. ; THEUMANN, A. . Learning Times In A Perceptron That Learns From Examples. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 27, n.2, p. 379-384, 1994.
MEIR, R. ; FONTANARI, J. F. . Data Compression And Prediction In Neural Networks. Physica A, Amsterdam, Holanda, v. 200, n.1-4, p. 644-654, 1993.
FONTANARI, J. F. ; THEUMANN, W. K. . On The Computational Capability Of A Perceptron. Journal of Physics A - Letter, Bristol, Inglaterra, v. 26, n.23, p. 1233-1238, 1993.
FONTANARI, J. F. . Equilibrium Properties Of The Linear Perceptron. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 26, n.22, p. 6147-6160, 1993.
MEIR, R. ; FONTANARI, J. F. . On The Precision Constraints Of Threshold Elements. Network: Computation in neural systems, Bristol, Inglaterra, v. 4, n.3, p. 381-391, 1993.
BARBATO, D. M. L. ; FONTANARI, J. F. . The Effects Of Lesions On The Generalization Ability Of A Perceptron. Journal of Physics A, Bristol, Inglaterra, v. 26, n.8, p. 1847-1863, 1993.
FONTANARI, J. F. ; MEIR, R. . The statistical mechanics of the Ising perceptron. Journal of Physics. A, Mathematical and General (Online) , Bristol, Inglaterra, v. 26, n.26, p. 1077-1089, 1993.
FONTANARI, J. F. ; MEIR, R. ; Calculation of learning curves for inconsistent algorithms. Physical Review. A , Nova Iorque, EUA, v. 45, n.45, p. 8874-8884, 1992.
MEIR, R. ; FONTANARI, J. F. . Learning From Examples In Weight Constrained Neural Networks. JOURNAL OF PHYSICS A, Bristol, Inglaterra, v. 25, n.5, p. 1149-1168, 1992.
FONTANARI, J. F. ; MEIR, R. . Evolving A Learning Algorithm For The Binary Perceptron. NETWORK: COMPUTATION IN NEURAL SYSTEMS., Bristol, Inglaterra, v. 2, n.4, p. 353-359, 1991.
FONTANARI, J. F. . The Adaptive Map Model. JOURNAL OF PHYSICS A, v. 24, n.11, p. 615-620, 1991.
FONTANARI, J. F. ; THEUMANN, W. K. . On the storage of correlated patterns in Hopfield's model. Journal de Physique , v. 51, n.5, p. 375-386, 1990.
MOSCATO, P. ; FONTANARI, J. F. . Stochastic Vs Deterministic Update In Simulated Annealing. PHYSICS LETTERS A, v. 146, n.4, p. 204-208, 1990.
FONTANARI, J. F. ; KOBERLE, R. . Landscape statistics of the binary perceptron. Journal de Physique , v. 51, n.13, p. 1403-1413, 1990.
FONTANARI, J. F. ; MEIR, R. . The Effect Of Learning On The Evolution Of Asexual Populations. COMPLEX SYSTEMS, v. 4, n.6, p. 401-414, 1990.
FONTANARI, J. F. . Generalization in a Hopfield network. Journal de Physique , Paris, França, v. 51, n.21, p. 2421-2430, 1990.
FONTANARI, J. F. ; THEUMANN, W. K. ; DOMINGUEZ, D. R. C. . Potts model in a random field. Physical Review B - Solid State , Nova Iorque, v. 39, n.10, p. 7132-7139, 1989.
FONTANARI, J. F. ; MEIR, R. . Learning noisy patterns in a Hopfield network. Physical Review. A , Nova Iorque, v. 40, n.5, p. 2806-2809, 1989.
FONTANARI, J. F. ; MEIR, R. . Mapping correlated Gaussian patterns in a perceptron. Journal of Physics. A, Mathematical and General , Bristol, Inglaterra, v. 22, p. L803-L808, 1989.
THEUMAN, W. K. ; FONTANARI, J. F. . The spherical model as the limiting n-vector model in a random field. Physica. A , Amsterdam, v. 149, p. 341-357, 1988.
FONTANARI, J. F. ; KÖBERLE, R. . Information processing in synchronous neural networks. Journal de Physique , Paris, v. 49, p. 13-23, 1988.
FONTANARI, J. F. ; KÖBERLE, R. . Enhancing the Learning of a Finite Number of Patterns in Neural Networks. Journal of Physics. A, Mathematical and General , Bristol, v. 21, p. L253-L257, 1988.
FONTANARI, J. F. ; KÖBERLE, R. . Storing correlated patterns in Hopfield's model. Journal of Physics. A, Mathematical and General , Bristol, v. 21, p. 2477-2479, 1988.
FONTANARI, J. F. ; KOBERLE, R. . Neural networks with transparent memory. Journal of Physics. A, Mathematical and General , Bristol, v. 21, p. L259-L262, 1988.
FONTANARI, J. F. ; KOBERLE, R. . Retrieval via Non-Equilibrium States in Neural Networks. Journal of Physics. A, Mathematical and General , Bristol, Inglaterra, v. 21, p. L667-L671, 1988.
FONTANARI, J. F. ; KÖBERLE, R. . Information storage in synchronous neural networks. Physical Review. A , Nova Iorque, v. 36, n.5, p. 2475-2477, 1987.
FONTANARI, J. F. ; THEUMANN, W. K. . Effects of trilinear symmetry breaking on the Potts-model transition of uniaxially stressed SrTiO3. Physical Review B - Solid State , Nova Iorque, v. 33, n.5, p. 3530-3533, 1986.
THEUMANN, W. K. ; FONTANARI, J. F. . The spherical-model limit in a random field. Journal of Statistical Physics , Nova Iorque, v. 45, n.1, p. 99-112, 1986.
FONTANARI, J. F. . Productivity in Times of Covid-19: An Agent-Based Model Approach. In: N. Bellomo; M.A.J. Chaplain. (Org.). Predicting Pandemics in a Globally Connected World. 1ed.Basel: Birkhäuser, 2022, v. 1, p. 213-231.
FONTANARI, J. F. . Moléculas Altruístas. Scientific American Brasil, São Paulo, p. 48 - 55, 01 set. 2005.
Fontanari, José F . Reflexões sobre a origem e evolução da Linguagem. Ciências & Letras (FAPA. Impresso), Porto Alegre, , v. 45, p. 247 - 258.
FONTANARI, J. F. . Cooperative solution of cryptarithmetic problems. In: 14th International Conference Computational and Mathematical Methods in Science and Engineering, 2014, Jerez. CMMSE 2014 : Proceedings of the 14th International Conference on Mathematical Methods in Science and Engineering, 2014. v. 2. p. 559-567.
FONTANARI, JOSE F. . Solving a cryptarithmetic problem using a social learning heuristic. In: 2014 IEEE Symposium on Computational Intelligence, Cognitive Algorithms, Mind, and Brain (CCMB), 2014, Orlando. 2014 IEEE Symposium on Computational Intelligence, Cognitive Algorithms, Mind, and Brain (CCMB), 2014. p. 65.
TILLES, P. F. C. ; FONTANARI, J. F. . ASSOCIATIVE LEARNING OF A LEXICON IN A NOISY CROSS-SITUATIONAL SCENARIO. In: International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2013, Tempe. BIOMAT 2012. p. 244.
FONTANARI, J. F. . GENETIC REDUNDANCY AND THE ORIGIN OF CHROMOSOMES. In: BIOMAT 2011 International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2012, Santiago, Chile. International Symposium on Mathematical and Computational Biology. Cingapura: World Scientific Press, 2012. p. 361-375.
Fontanari, José F . The performance of a linear learning algorithm for cross-situational vocabulary learning. In: IEEE Symposium Series on Computational Intelligence SSCI2011, 2011, França. Proceedings of the IEEE Symposium Series on Computational Intelligence. Piscataway: IEEE Press, 2011. p. 43-46.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. ; BONNIOT-CABANAC, M.-C. ; CABANAC, M. . Emotions of Cognitive Dissonance. In: The 2011 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN 2011), 2011, San Jose. IJCNN 2011 Conference Proceedings, 2011. p. 95-102.
FONTANARI, J. F. . Effect of mass media on the cultural diversity of Axelrod model of social influence. In: BIOMAT 2009 International Symposium on Mathematical amd Computational Biology, 2010, Brasília. Proceedings of the 2009 International Symposium on Mathematical and Computational Biology BIOMAT 2009. Singapura: World Scientific, 2010. p. 231-242.
Fontanari, José F ; PERLOVSKY, L. I. . A Computational model of adults' performance in naming objecys using cross-situational learning. In: 2010 IEEE World Congress on Computational Intelligence, 2010, Barcelona. Proceedings of the 2010 IEEE World Congress on Computational Intelligence. Piscataway: IEEE Press, 2010. p. 106-113.
FONTANARI, J. F. ; Peres, L.R. . Cultural Evolution in a lattice: the majority-vote model as a frequency-dependent bias model of cultural transmission. In: BIOMAT 2010 International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2010, Rio de Janeiro. Biomat 2010 - International Symposium on Mathematical and Computational Biology. Cingapura: World Scientific, 2010. p. 208-223.
Fontanari, José F ; TIKHANOFF, V. ; CANGELOSI, A. ; PERLOVSKY, L. I. . A cross-situational algorithm for learning a lexicon using Neural Modeling Fields. In: 2009 International Joint Conference on Neural Networks, 2009, Atlanta. Proceedings of International Joint Conference on Neural Networks. Piscataway: IEEE Press, 2009. p. 869-876.
FONTANARI, J. F. . A population dynamics approach to language evolution. In: BIOMAT 2008 International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2008, Campos do Jordão. BIOMAT 2008 International Symposium on Mathematical and Computational Biology. Singapura: World Scientific, 2008. p. 170-181.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . Object perception in the neural modeling fields framework. In: 2008 IEEE World Congress on Computational Intelligence, 2008, Hong Kong. WCCI 2008 Proceedings. Piscataway, NJ: Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc., 2008. p. 1775-1780.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . How communication can improve differentiation in the Modeling Field Theory framework. In: 2007 IEEE International Conference on Knowledge Intensive Multi-Agent Systems, 2007, Waltham. Proceedings of the 2007 IEEE International Conference on Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. Piscataway: IEEE Press, 2007. v. 1. p. 151-156.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . A Modeling Field Theory approach to pursuit games. In: 2007 IEEE International Conference on Knowledge Intensive Multi-Agent Systems, 2007, Waltham. Proceedings of the 2007 IEEE International Conference on Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. Piscataway: IEEE Press, 2007. v. 1. p. 157-161.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . Language acquisition and category discrimination in the Modeling Field Theory Framework. In: 2007 International Joint Conference on Neural Networks, 2007, Orlando. IJCNN 2007 Conference Proceedings. Madison EUA: The International Neural Networks Society, 2007. v. 1. p. 1321.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . Meaning creation and communication in a community of agents. In: 2006 IEEE World Congress on Computational Intelligence and IEEE International Joint Conference on Neural Networks IJCNN'06, 2006, Vancouver. Proceedings of the IEEE International Joint Conference on Neural Networks IJCNN'06. Vancouver: IEEE Press, 2006. p. 2892-2897.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . Categorization and symbol grounding in a complex environment. In: 2006 IEEE World Congress on Computational Intelligence and IEEE International Joint Conference on Neural Networks IJCNN'06, 2006, Vancouver. Proceedings of the IEEE International Joint Conference on Neural Networks IJCNN'06. Vancouver: IEEE Press, 2006. p. 10039-10045.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . Evolution of Communication in a Community of Simple-minded Agents. In: IEEE 2005 International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-agent systems, 2005, Waltham, MA, EUA. Proceedings of the IEEE 2005 International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-agent systems. Piscataway: Institute of Electrical and Electronics Enginners, 2005. v. 1. p. 285-290.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . Minimal Models for Text Production and Zipf's Law. In: IEEE 2005 International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems, 2005, Waltham, MA, EUA. Proceedings of the IEEE 2005 International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. Piscataway, EUA: Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2005. v. 1. p. 297-300.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . Meaning Creation and Modeling Field Theory. In: IEEE 2005 International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems, 2005, Waltham, Eua. Proceedings of the IEEE 2005 International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. Piscataway: Institute of Electrical and Electronics Engineering, 2005. v. 1. p. 405-410.
FONTANARI, J. F. ; HORDIJK, W. . Catalytic Reaction Sets, Decay, and the Preservation of Information. In: IEEE International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems, 2003, Boston. Proceedings of the 2003 IEEE International Conference on Integration of Knowledge Intensive Multi-Agent Systems. Boston: IEEE Press, 2003. p. 133-137.
FONTANARI, J. F. ; KOBERLE, R. . Neural spike train reproducibility and variability on the edge of chaos.. In: International Seminar on Bioelectronic Interfaces/III Workshop on Cybernetic Vision, 1999, São Carlos, SP. International Seminar on Bioelectronic Interfaces/III Workshop on Cybernetic Vision - Proceedings, 1999. p. 49-54.
MEIR, R. ; FONTANARI, J. F. . On Learning Noisy Threshold Functions With Finite Precision Weights.. In: 5TH. WORKSHOP ON COMPUTATIONAL LEARNING THEORY, 1992, Snowbird. PROCEEDINGS OF THE 5TH. WORKSHOP ON COMPUTATIONAL LEARNING THEORY. SNOWBIRD - EUA, 1992. p. 280-286.
FONTANARI, J. F. ; PERLOVSKY, L. I. . Allee effect on language evolution. In: 6th International Conference on Language Evolution (EVOLANG6), 2006, Roma. The Evolution of Language. Singapura: World`Scientific, 2006. v. 1. p. 411-412.
PERLOVSKY, L. I. ; FONTANARI, J. F. . How language can guide intelligence. In: 6th International Conference on Language Evolution (EVOLANG6), 2006, Roma. The Evolution of Language. Singapura: World Scientific, 2006. v. 1. p. 438-439.
FONTANARI, J. F. . A model of frequency-dependent bias for the spread of opinions in a lattice. In: The 3rd Conference of Computational and Mathematical Population Dynamics, 2010, Bordeaux. Book of Abstracts CMPD3. Bordeaux: Victor Segalen Bordeaux 2 University, 2010. p. 90-90.
FONTANARI, J. F. . Inverse density dependence in the evolution of communication. In: II Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics (CMPD2), 2007, Campinas. Abstract Book. Campinas: CMPD2 - Organização, 2007.
COLATO, A. ; FONTANARI, J. F. . Estudo de mutações deletérias em populações assexuadas.. In: X Congresso Latino Americano de Biomatemática, 2001, Campinas. X Congresso Latino Americano de Biomatemática - Resumos. Campinas, SP, Brasil, 2001. p. 7.
FERREIRA, C. P. ; FONTANARI, J. F. . Uso de automatos celulares no estudo de competição entre replicadores.. In: X Congresso Latino Americano de Biomatemática, 2001, Campinas. X Congresso Latino Americano de Biomatemática - Resumos. Campinas, SP, Brasil, 2001. p. 4.
ALVES, D. ; CAMPOS, P. R. A. ; FONTANARI, J. F. . Modelo de seleção de grupo em evolução pré-biótica.. In: XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2001, São Lourenço, MG. XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 2001. p. 81.
FERREIRA, C. P. ; FONTANARI, J. F. ; SANTOS, R. M. Z. . Transições de fase num modelo de formação de úlceras.. In: XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2001, São Lourenço, MG. XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 2001. p. 82.
V M de Oliveira ; FONTANARI, J. F. . Modelo de replicadores com diluição.. In: XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2001, São Lourenço, MG. XXIV ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 2001. p. 87.
FERREIRA, C. P. ; FONTANARI, J. F. . Formação de estruturas espaciais em modelos de evolução pré-biótica.. In: XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2000, São Lourenço. XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - R\ESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 2000. p. 136.
FERREIRA, F. F. ; FONTANARI, J. F. . Problema da seqüência binária de mais baixa auto-correlação,. In: XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2000, São Lourenço, MG. XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física. p. 135.
V M de Oliveira ; FONTANARI, J. F. . Modelos de replicadores com interações de multi-espécies.. In: XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 2000, São Lourenço, MG. XXIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 2000. p. 135.
ALVES, D. ; FONTANARI, J. F. . Resultados do modelo de amostragens para quase-espécies virais. In: XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1999, São Lourenço, MG, Brasil. XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1999. p. 122.
FERREIRA, F. F. ; FONTANARI, J. F. . Análise estatística do problema da partição numérica.. In: XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1999, São Lourenço, MG, Brasil. XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1990. p. 107.
FONTANARI, J. F. ; KOBERLE, R. . Reprodutibilidade e variabilidade em trens de pulsos neurais.. In: XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1999, São Lourenço, MG, Brasil. XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1999. p. 121.
SILVA, A. T. C. ; FONTANARI, J. F. . Modelo de tempo discreto para a dinâmica de sistemas parasita-hospedeiro.. In: XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1999, São Louren,co, MG, Brasil. XXII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1999. p. 144.
CAMPOS, P. R. A. ; FONTANARI, J. F. . Teoria de Escala de Tamanho Finito Para O Modelo das Quase-Espécies. In: XXI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 1998. Livro de resumos do XXI ENFMC. Caxambú, MG - Brasil. p. 92-92.
SILVA, A. T. C. ; FONTANARI, J. F. . Modelo Estocástico Para A Evolução do Altruismo. In: XXI ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1998. XXI ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. CAXAMBÚ, MG - BRASIL. p. 115-115.
BARBATO, D. M. L. ; FONTANARI, J. F. . Dilution In A Boolean Neural Network. In: XIX ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA, 1996. XIX ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA - RESUMOS. ÁGUAS DE LINDÓIA, MG - BRASIL. p. 512-512.
ALVES, D. ; FONTANARI, J. F. . Population Genetics Approach To Molecular Evolution. In: XIX ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA, 1996. XIX ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA - RESUMOS. ÁGUAS DE LINDÓIA, MG - BRASIL. p. 520-520.
FONTANARI, J. F. ; RODRIGUES NETO, C. . Categorization on pseudo-inverse neural networks.. In: XIX ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1996, Águas de Lindóia, SP, Brasil. XIX ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1996. p. 515.
FONTANARI, J. F. . Learning From Examples In Neural Networks. In: XVII ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA, 1994. XVII ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA - RESUMOS. CAXAMBÚ, MG - BRASIL. p. 98-98.
ERICHSEN JR, R. ; THEUMANN, W. K. ; FONTANARI, J. F. . Recuperação de memória em uma rede de neurônios com padrões correlacionados.. In: XII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1989, Caxambú, MG, Brasil. XII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA - RESUMOS. São Paulo, SP, Brasil: Sociedade Brasileira de Física, 1989. p. 81-81.

Projetos de pesquisa

2020 - Atual

Modelagem matemática e computacional nas ciências sociais, Descrição: A busca de leis estatísticas que descrevem o comportamento social humano é provavelmente uma das tarefas mais ambiciosas da ciência. De fato, a própria ideia de uma sociologia matemática foi introduzida originalmente na trilogia clássica Fundação de Asimov, estando pois ao par com as tecnologias futuristas vislumbradas pela ficção científica. Como muitas daquelas visões, especialmente as referentes à inteligência artificial, a matematização das ciências sociais deverá alcançar a maturidade ainda neste século e seu impacto será inestimável dado o potencial criador e destruidor das massas. Neste projeto vamos olhar, principalmente, para o aspecto positivo mais cotidiano, embora pouco reconhecido, das massas - a inteligência coletiva - que faz com que grupos possam solucionar problemas que estão muito além da capacidade de um único indivíduo. Essa observação não fundamenta apenas toda a ciência da organização do trabalho, mas também embasa um fenômeno misterioso conhecido como sabedoria das massas ou Vox Populi, revelado pela surpreendente precisão da estimativa coletiva de uma grandeza dada pela média das estimativas individuais independentes. Nesse tema principal, vamos explorar paradigmas de cooperação na organização de forças-tarefas, como os sistemas quadro-negro usados para modelar brainstorming. O objetivo é determinar como a eficiência do grupo na resolução de problemas depende das tendências individuais para escrever e copiar informações no quadro-negro, bem como da quantidade de informação exposta no quadro-negro. Já no Vox Populi, vamos investigar como características da distribuição de probabilidade das estimativas individuais influenciam a precisão da estimativa coletiva. Além da inteligência coletiva, vamos considerar também tópicos mais tradicionais da sociologia matemática, como a dinâmica de grupos casuais (grupos em um coquetel, por exemplo) e a propagação de padrões comportamentais (crime, por exemplo) entre membros suscetíveis da população. Ambos os tópicos permitem a validação dos modelos através de dados disponíveis em repositórios de acesso livre. Um objetivo central da proposta é a criação de uma rede de pesquisadores com foco na modelagem do comportamento social humano.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (4) . , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador / Claudia Pio Ferreira - Integrante / Fernando Fagundes Ferreira - Integrante / Hyun Mo Yang - Integrante / REIA, SANDRO M - Integrante / GOMES, PAULO F - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 4
2016 - 2018

Inteligência coletiva: a abordagem de sistemas cooperativos distribuídos, Descrição: A ideia da existência de uma inteligência coletiva responsável pelas estruturas naturais sofisticadas construídas por alguns organismos sugere que as organizações sociais desses organismos tenham sido selecionadas de modo a otimizar a capacidade de resolver problemas na escala de grupo. As vantagens do trabalho cooperativo há muito vêm sendo exploradas pela natureza como revelam, por exemplo, as estruturas coletivas criadas por cupins e mofos mucilaginosos. Essas estruturas podem ser pensadas como sendo as soluções encontradas por aqueles organismos para os problemas que ameaçam sua existência. Nessa perspectiva, a competência para resolver problemas na escala de grupo é vista como uma pressão seletiva que atua no tamanho e na organização dos grupos de organismos sociais. Neste projeto vamos usar modelos mínimos baseados em agentes para estudar como e em quais condições a colaboração favorece a competência do grupo para resolver problemas. As tarefas a serem resolvidas são problemas do tipo NP-Completo tais como encontrar o máximo global de relevos adaptativos NK ou encontrar a solução de certos problemas de satisfação de vínculos. Os agentes cooperam anunciando mensagens sobre os seus status atuais (ou seja, o valor das soluções encontradas no momento) e usam essa informação para imitar o agente de maior status nas suas redes de influência. Essa troca de mensagens entre agentes informando sobre o sucesso parcial de cada um na solução do problema é o elemento definidor de sistemas cooperativos distribuídos. Ainda, uma vez que a disseminação de componentes da solução entre os agentes pode ser visto como um processo de "difusão de inovações" vamos também estudar esse processo no contexto da solução de problemas bem como no contexto do modelo de Axelrod de difusão cultural. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador / REIA, SANDRO M. - Integrante / FRANCO, CAROLINE - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1
2013 - 2015

Estudos no modelo de Axelrod: transição de fase de não-equilíbrio, difusão de inovações, e computação coletiva, Descrição: A característica que popularizou o modelo de Axelrod de disseminação cultural é a existência de configurações absorventes que exibem diversos domínios culturais, a despeito da regra de interação local entre os agentes que promove a similaridade entre eles. Nesse modelo, os agentes estão fixos em sítios de uma rede quadrada com conexões entre primeiros vizinhos somente e são representados por listas de F características culturais com cada característica podendo adotar um certo número q de traços culturais ou opiniões distintas. Dependendo dos valores desses parâmetros o estado estacionário do modelo exibe coexistência cultural ou não, sendo esses regimes separados por uma transição de fase de não equilíbrio no espaço (q,F). Um ingrediente essencial do modelo é o fato da probabilidade de interação entre dois vizinhos crescer linearmente com sua superposição cultural: agentes similares interagem mais frequentemente e agentes sem nenhuma característica cultural em comum simplesmente não interagem. Nosso primeiro objetivo é caracterizar completamente a natureza da transição de fase de não-equilíbrio do modelo de Axelrod usando escala de tamanho finito, lembrando que o modelo exibe um número infinito de estados absorventes no limite termodinâmico e que, ao contrário do processo de contato, a dinâmica sempre é atraída para um desses estados. Nosso segundo objetivo é investigar o processo clássico de difusão de inovações usando uma variante do modelo de Axelrod que inclui um campo externo local que fará o papel do agente de inovação. Nesse linha, vamos estudar também o efeito da difusão ou expansão demográfica, ou seja, não apenas as idéias propagam-se de agente a agente, mas os agentes também podem se mover pela rede. Finalmente, nosso terceiro objetivo é explorar a idéia da sociedade como um ?cérebro coletivo mais eficiente que indivíduos isolados na execução de tarefas complexas. Nesse caso, o conjunto de características culturais de um agente é interpretado como uma solução tentativa de algum problema de otimização. Enfim, a idéia é utilizar um modelo de agentes na rede relativamente simples para entender com clareza tópicos fundamentais como o processo de disseminação de inovações e o potencial da computação social. Particularmente interessante é a compreensão do papel da transição de fase de não-equilíbrio nesses dois processos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador / Lucas Rodrigues Peres - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2011 - 2013

Coexistência e altruismo através da seleção de grupo, Descrição: A explicação da coexistência entre espécies, indivíduos ou replicadores distintos permanece um desafio para as abordagens convencionais da teoria evolutiva onde a competição é considerada o ingrediente essencial. A abordagem da seleção de grupo permite uma explicação satisfatória ao introduzir um segundo nível de seleção ? a competição entre grupos. No contexto da evolução pré-biótica, que é o nosso foco principal neste projeto, essa competição não é controversa, já que os grupos seriam as protocélulas ou células primitivas. Por outro lado, no contexto de espécies a noção de seleção de grupo, usualmente empregada para explicar o comportamento altruista, é bastante criticada. A formulação matemática do problema da seleção em dois níveis, ou mesmo de populações estruturadas, é muito desafiadora. Procuramos tratar esse problema usando a aproximação difusiva da genética de populações (essencialmente reduzindo o processo estocástico a equações do tipo Focker-Planck) e extrair informações analíticas sobre os diferentes regimes estacionários, dando ênfase a caracterização do fenômenos críticos associados às mudanças desses regimes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador / SERVA, M. - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
2009 - 2010

Aquisição de vocabulário pelo aprendizado observacional, Descrição: O processo de aquisição de um vocabulário através do aprendizado observacional (cross-situational learning) é baseado na ideia intuitiva de que o significado de uma palavra pode ser inferido pela análise das repetidas situações em que aquela palavra é utilizada, isto é, pela busca de um elemento comum nessas situações. Assim, trata-se de uma aplicação direta da filosofia do associacionismo de Locke ao problema da aquisição do vocabulário. Consideramos modelos simplificados de aprendizado em que há uma correspondência biunívoca entre o conjunto de palavras e o conjunto de objetos a serem nomeados. O problema do aprendizado desse mapeamento palavra-objeto é descrito como um processo estocástico e estudado usando técnicas tradicionais dessa área (em particular, cadeias de Markov e simulações de Monte Carlo). A introdução de ruído no processo de aprendizado, modelando palavras fora do contexto, resulta em um fenômeno limiar ou crítico que separa regimes onde o aprendizado é possível ou não. A comparação com experimentos onde adultos tentam aprender o mapeamento (artificial) entre palavras e objetos indica que o esquecimento e o erro de discriminação (essencialmente, a lei de Weber que descreve como humanos diferenciam quantidades) desempenham um papel importante na forma com que humanos inferem o mapeamento palavra-objeto.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador / Leonid I. Perlovsky - Integrante / Angelo Cangelosi - Integrante / Tilles, Paulo F C - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Southern Office of Aerospace Research and Development - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 5
2008 - 2010

Comportamento crítico e quebra de ergodicidade em modelos de comportamento social, Descrição: Duas características geralmente associadas à emergência do comportamento coletivo complexo são a existência de fenômenos limiares (ou críticos) separando diferentes regimes estacionários ou dinâmicos e a dependência desses regimes com as condições iniciais (quebra de ergodicidade). Modelos típicos de comportamento social exibem pelo menos uma dessas características. Por exemplo, o modelo do voto da maioria exibe quebra de ergodicidade apenas; já o Modelo de Axelrod exibe as duas características. Utilizamos métodos da mecânica estatística, em particular a aproximação de n-sítios e teoria de escala de tamanho finito, para estudar a dinâmica e propriedades estatísticas dos estados estacionários de uma ampla gama de modelos mínimos de comportamento social. Apesar de altamente simplificados, esses modelos são bem mais complexos que os modelos clássicos usuais de spins da mecânica estatística, o que torna seu estudo bastante desafiador sob o ponto de vista técnico dessa disciplina. De fato, no caso do modelo de Axelrod de disseminação cultural, que exibe um número infinito de estados absorventes, praticamente nada se sabe sobre a natureza da transição de fase entre estados absorventes espacialmente homogêneos (regime mono-cultural) e estados absorventes heterogêneos (regime multicultural). O objetivo do projeto é oferecer uma análise completa e coerente desses modelos seguindo os padrões de qualidade bem estabelecidos na comunidade de mecânica estatística tradicional.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador / Peres, Lucas R - Integrante / Tilles, Paulo F C - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
2004 - 2010

Replicadores: aplicações em evolução pré-biótica e linguagem, Descrição: Uma das idéias científicas mais originais e controversas é a sugestão de que muito da complexidade associada à vida e ao comportamento humano é conseqüência da ação não planejada de replicadores. Entende-se por replicador a entidade (genes no caso biológico e idéias ou memes no caso cultural) capaz de se auto-replicar, dadas as condições necessárias para isso. Uma característica importante, embora extremamente restritiva, é que as cópias produzidas, perfeitas ou não, sejam também replicadores. Essa condição é necessária para que a força organizadora da seleção natural possa atuar. Nossa proposta é estudar a emergência e a evolução de replicadores em dois casos de grande importância para muitos ramos da ciência: evolução pré-biótica (origem da vida) e evolução da linguagem. Devido ao conceito unificador de replicador, a formalização matemática bem como a metodologia de estudo são idênticas nessas duas situações, apesar de à primeira vista corresponderem a fenômenos completamente distintos. Métodos analíticos da mecânica estatística de sistemas desordenados (a técnica das réplicas e a contagem de estados meta-estáveis, por exemplo), teoria de processos de ramificação e teoria de sistemas dinâmicos são ferramentas que podem ser empregadas na caracterização dos estados estacionários da dinâmica de replicadores. No contexto da evolução da linguagem, nosso objetivo principal é entender como as limitações sensoriais e de processamento dos agentes determinam e limitam a estrutura da linguagem desenvolvida. Já no contexto da evolução pré-biótica, pretendemos nos concentrar principalmente na questão da emergência de metabolismos através da simulação de uma cinética química artificial, sendo esta uma forma de abordar, através de ?primeiros-princípios?, a origem dos replicadores, visto por muitos como o evento mais fundamental da história da vida. Além desses objetivos admitidamente ambiciosos que servem para nortear o rumo da pesquisa, diversas outras questõ. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
1999 - 2004

Evolução Molecular Teórica, Descrição: A introdução de métodos moleculares no estudo da Evolução transformou esse campo de pesquisa numa ciência exata, na qual os parâmetros relevantes podem ser medidos com precisão e as teorias testadas contra os dados experimentais. Neste projeto vamos nos concentrar em duas áreas de estudo, a saber, (a) reconstrução da história evolucionária de genes e organismos (inferência ancestral), e (b) evolução pré-biótica ou a origem da vida. Embora essas áreas tenham sido tradicionalmente estudadas separadamente, principalmente porque a origem da vida ainda é uma questão bastante especulativa, vamos argumentar que, pelo menos do ponto de vista teórico, os modelos usados para estudar esses dois problemas são essencialmente os mesmos; a principal diferença sendo a ênfase dada a diferentes características ou grandezas do processo evolucionário. Neste sentido, planejamos usar nossa experiência de 5 anos de trabalho em evolução pré-biótica para abordar problemas de reconstrução filogenética e genealógica. Esse tipo de problema possui enorme importância prática como, por exemplo, a elucidação da origem e história natural dos vírus. Mais especificamente, vamos nos concentrar nos efeitos da seleção (ou reprodução diferenciada) nas propriedades estatísticas de árvores genealógicas tais como os padrões de adjacência e a distribuição de distâncias internodais. Embora essas propriedades sejam bem entendidas no caso de evolução neutra, há muito poucos trabalhos que levam a seleção em conta. Com relação ao tema evolução pré-biótica, vamos nos concentrar principalmente na aplicação de idéias da teoria de seleção de grupos para explicar a coexistência estável de moléculas auto-replicadoras com taxas de replicação distintas. Essa coexistência é fundamental para o surgimento de aglomerados moleculares complexos capazes de funcionar como um metabolismo rudimentar.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Jose Fernando Fontanari - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

Prêmios

2004

Fellow of The Institute of Physics, The Institute of Physics - England.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade de São Paulo, Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar. , Avenida Trabalhador SãoCarlense, 400, Arnold Schmidt, 13566590 - São Carlos, SP - Brasil - Caixa-postal: 369, Telefone: (16) 33739849, Fax: (16) 33739877

Experiência profissional

2003 - Atual

Universidade de São Paulo

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Regime: Dedicação exclusiva.

1994 - 2003

Universidade de São Paulo

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Regime: Dedicação exclusiva.

1988 - 1994

Universidade de São Paulo

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

01/2009
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Física de São Carlos.,Linhas de pesquisa
11/1988
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.,Linhas de pesquisa
11/1988
Ensino, Física São Carlos, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Eletromagnetismo, Mecânica Quântica, Mecânica Estatística, Processos Estocásticos
11/1988
Ensino, Bacharelado Em Física, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Mecânica Quântica, Mecânica Estatística, Física Geral
04/2010 - 03/2014
Direção e administração, Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.,Cargo ou função, Chefe de Departamento.
12/2003 - 12/2007
Direção e administração, Instituto de Física de São Carlos.,Cargo ou função, Vice-Diretor.
02/2002 - 07/2004
Direção e administração, Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.,Cargo ou função, Presidente da Comissão de Pós-Graduação.
02/2002 - 07/2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.,Cargo ou função, Presidente da Comissão de Pós-Graduação.