Mariana Galvão Ferrarini

Formada em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia pela Universidade Federal do Paraná e Mestre pelo programa de pós-graduação em Biologia Celular e Molecular pela UFPR, com projeto de pesquisa desenvolvido em parceria com o Instituto Carlos Chagas (Fiocruz - PR). Sou doutora em Bioinformática pela Universidade Claude Bernard Lyon 1, no Laboratório de Biometria e Biologia Evolutiva, na França; em cotutela com a Universidade Federal do Rio Grande do Sul (Centro de Biotecnologia, UFRGS). Minha pesquisa baseou-se principalmente na modelização matemática do metabolismo diferencial de bactérias patogênicas do trato respiratório de suínos. Desde então meus pós-doutorados tiveram ênfase em análises de transcriptômica, modelagem matemática do metabolismo, integração de dados ômicos com um foco em simbioses. Tenho experiência nas áreas de Bioinformática e Bioestatística, Metabolismo, Transcriptômica, Bioquímica, Microbiologia, Imunologia, Simbiose, Parasitologia e Evolução.

Informações coletadas do Lattes em 22/04/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Biotechnologie et Bioinformatique

2012 - 2015

Université Claude Bernard - Lyon 1
Título: Exploração BIoinformática da Biodiversidade Metabólica no Ecossistema Microbiano do Trato Respiratório de Suínos
Orientador: Marie-France SAGOT
com Bolsista do(a): Institut National Recherche Informatique et Automatique, INRIA, França. Palavras-chave: Simbiose; Mycoplasma; Trato Respiratório de Suínos; Redes Metabólicas.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular / Especialidade: Bioinformática.

Mestrado em Biologia Celular e Molecular

2010 - 2012

Universidade Federal do Paraná
Título: Investigação da função de grânulos de TcDhh1 na regulação da estabilidade e tradução de mRNAs alvo em Trypanosoma cruzi, Ano de Obtenção: 2012
Andréa Rodrigues Ávila.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Trypanosoma cruzi; Regulação da Expressão Gênica; Dhh1.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Parasitologia / Subárea: Protozoologia de Parasitos.

Graduação em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia

2005 - 2009

Universidade Federal do Paraná

Pós-doutorado

2023

Pós-Doutorado. , Instituto Carlos Chagas - Fiocruz, ICC, Brasil.

2023

Pós-Doutorado. , INRAE, INRAE, França. , Grande área: Ciências Biológicas

2022 - 2022

Pós-Doutorado. , Instituto Carlos Chagas - Fiocruz, ICC, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

2021 - 2022

Pós-Doutorado. , Centre National de la Recherche Scientifique, CNRS, França. , Bolsista do(a): CNRS, CNRS, França.

2019 - 2020

Pós-Doutorado. , INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE Clermont-Auvergne-Rhônes-Alpe, INRAe, França. , Bolsista do(a): INRAE, INRAE, França.

2018 - 2019

Pós-Doutorado. , Institut National des Sciences Appliquées de Lyon, INSA LYON, França. , Bolsista do(a): INSA, INSA, França.

2017 - 2017

Pós-Doutorado. , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.

2016 - 2017

Pós-Doutorado. , Centre de Recherche INRIA Grenoble - Rhône-Alpes, INRIA-GRENOBLE, França. , Bolsista do(a): Institut National Recherche Informatique et Automatique, INRIA, França. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética.

Formação complementar

2011 - 2011

Genômica e Transcriptômica. (Carga horária: 40h). , Instituto Carlos Chagas - Fiocruz, ICC, Brasil.

2011 - 2011

Redes Metabólicas. (Carga horária: 40h). , Instituto Carlos Chagas - Fiocruz, ICC, Brasil.

2010 - 2010

Bioinformática II. (Carga horária: 60h). , Instituto Carlos Chagas - Fiocruz, ICC, Brasil.

2010 - 2010

Bioinformática I. (Carga horária: 120h). , Instituto Carlos Chagas - Fiocruz, ICC, Brasil.

2007 - 2007

Separação e Recuperação de Bioprodutos. (Carga horária: 6h). , XVI Simpósio Nacional de Bioprocessos, SINAFERM 2007, Brasil.

2005 - 2005

Biologia Molecular Forense. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Morfologia / Subárea: Citologia e Biologia Celular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Morfologia / Subárea: Histologia.

Produções bibliográficas

  • LUCENA, ALINE CASTRO RODRIGUES ; FERRARINI, MARIANA GALVÃO ; DE OLIVEIRA, WILLIAN KLASSEN ; MARCON, BRUNA HILZENDEGER ; MORELLO, LUIS GUSTAVO ; ALVES, LYSANGELA RONALTE ; FAORO, HELISSON . Modulation of Klebsiella pneumoniae Outer Membrane Vesicle Protein Cargo under Antibiotic Treatment. Biomedicines , v. 11, p. 1515, 2023.

  • FERRARINI, MARIANA GALVÃO ; VALLIER, AGNÈS ; VINCENT-MONÉGAT, CAROLE ; DELL?AGLIO, ELISA ; GILLET, BENJAMIN ; HUGHES, SANDRINE ; HURTADO, OPHÉLIE ; CONDEMINE, GUY ; ZAIDMAN-RÉMY, ANNA ; REBOLLO, RITA ; PARISOT, NICOLAS ; HEDDI, ABDELAZIZ . Coordination of host and endosymbiont gene expression governs endosymbiont growth and elimination in the cereal weevil Sitophilus spp.. Microbiome , v. 11, p. 274, 2023.

  • FERRARINI, MARIANA GALVÃO ; VALLIER, AGNÈS ; DELL?AGLIO, ELISA ; BALMAND, SÉVERINE ; VINCENT-MONÉGAT, CAROLE ; DEBBACHE, MÉRIEM ; MAIRE, JUSTIN ; PARISOT, NICOLAS ; ZAIDMAN-RÉMY, ANNA ; HEDDI, ABDELAZIZ ; REBOLLO, RITA . Endosymbiont-containing germarium transcriptional survey in a cereal weevil depicts downregulation of immune effectors at the onset of sexual maturity. Frontiers in Physiology , v. 14, p. 1, 2023.

  • VALLIER, AGNÈS ; DELL?AGLIO, ELISA ; FERRARINI, MARIANA GALVÃO ; HURTADO, OPHÉLIE ; VINCENT-MONÉGAT, CAROLE ; HEDDI, ABDELAZIZ ; REBOLLO, RITA ; ZAIDMAN-RÉMY, ANNA . Transcriptomic-based selection of reference genes for quantitative real-time PCR in an insect endosymbiotic model. FRONTIERS IN ECOLOGY AND EVOLUTION , v. 11, p. 1, 2023.

  • GRENIER, THÉODORE ; CONSUEGRA, JESSIKA ; FERRARINI, MARIANA G ; AKHERRAZ, HOUSSAM ; BAI, LONGWEI ; DUSABYINEMA, YVES ; RAHIOUI, ISABELLE ; DA SILVA, PEDRO ; GILLET, BENJAMIN ; HUGHES, SANDRINE ; RAMOS, CATHY I ; MATOS, RENATA C ; LEULIER, FRANÇOIS . Intestinal GCN2 controls Drosophila systemic growth in response to Lactiplantibacillus plantarum symbiotic cues encoded by r/tRNA operons. eLife , v. 12, p. 1, 2023.

  • HOMBERG, NICOLAS ; GALVÃO FERRARINI, MARIANA ; GASPIN, CHRISTINE ; SAGOT, MARIE-FRANCE . MicroRNA Target Identification: Revisiting Accessibility and Seed Anchoring. Genes , v. 14, p. 664, 2023.

  • FERRARINI, M. G. ; ZISKA, I. ; ANDRADE, R. ; JULIEN-LAFERRIERE, A. ; DUCHEMIN, L. ; CESAR JR, R. M. ; MARY, A. ; VINGA, S. ; SAGOT, MARIE-FRANCE . Totoro: Identifying Active Reactions During the Transient State for Metabolic Perturbations. Frontiers in Genetics , v. 13, p. 815476, 2022.

  • LAL, AVANTIKA ; GALVAO FERRARINI, MARIANA ; GRUBER, ANDREAS J. . Investigating the Human Host-ssRNA Virus Interaction Landscape Using the SMEAGOL Toolbox. Viruses-Basel , v. 14, p. 1436, 2022.

  • MORAGA, CAROL ; SANCHEZ, EVELYN ; FERRARINI, MARIANA GALVÃO ; GUTIERREZ, RODRIGO A ; VIDAL, ELENA A ; SAGOT, MARIE-FRANCE . BrumiR: A toolkit for discovery of microRNAs from sRNA-seq data. GigaScience , v. 11, p. 1, 2022.

  • FERRARINI, MARIANA GALVÃO ; DELL?AGLIO, ELISA ; VALLIER, AGNÈS ; BALMAND, SÉVERINE ; VINCENT-MONÉGAT, CAROLE ; HUGHES, SANDRINE ; GILLET, BENJAMIN ; PARISOT, NICOLAS ; ZAIDMAN-RÉMY, ANNA ; VIEIRA, CRISTINA ; HEDDI, ABDELAZIZ ; REBOLLO, RITA . Efficient compartmentalization in insect bacteriomes protects symbiotic bacteria from host immune system. Microbiome , v. 10, p. 156, 2022.

  • FERRARINI, MARIANA GALVÃO ; NISIMURA, LINDICE MITIE ; GIRARD, RICHARD MARCEL BRUNO MOREIRA ; ALENCAR, MAYKE BEZERRA ; FRAGOSO, MARIANA SAYURI ISHIKAWA ; ARAÚJO-SILVA, CARLLA ASSIS ; VEIGA, ALAN DE ALMEIDA ; ABUD, ANA PAULA RESSETTI ; NARDELLI, SHEILA CRISTINA ; VOMMARO, ROSSIANE C. ; SILBER, ARIEL MARIANO ; FRANCE-SAGOT, MARIE ; ÁVILA, ANDRÉA RODRIGUES . Dichloroacetate and Pyruvate Metabolism: Pyruvate Dehydrogenase Kinases as Targets Worth Investigating for Effective Therapy of Toxoplasmosis. mSphere , v. 6, p. e01002, 2021.

  • BORDERES, M. ; GASC, C. ; PRESTAT, E. ; FERRARINI, M. G. ; VINGA, S. ; BOUCINHA, L. ; SAGOT, MARIE-FRANCE . A comprehensive evaluation of binning methods to recover human gut microbial species from a non-redundant reference gene catalog. NAR Genomics and Bioinformatics , v. 3, p. lqab009, 2021.

  • FERRARINI, M. G. ; LAL, A. ; PICKET, B. ; AGUIAR-PULIDO, V. ; REBOLLO, RITA . Genome-wide bioinformatic analyses predict key host and viral factors in SARS-CoV-2 pathogenesis. Communications Biology , v. 4, p. 590, 2021.

  • CLAPES, T. ; POLYZOU, A. ; PRATER, P. ; SAGAR, S. ; MORALES-HERNANDEZ, A. ; FERRARINI, M. G. ; REBOLLO, RITA ; GRUN, D. ; TROMPOUKI, E. . Chemotherapy-induced transposable elements activate MDA5 to enhance haematopoietic regeneration. NATURE CELL BIOLOGY , v. 23, p. 704, 2021.

  • FERRARINI, M. G. . Phenotypic and Transcriptomic Responses to Stress Differ According to Population Geography in an Invasive Species. Genome Biology and Evolution , v. 13, p. evab208, 2021.

  • PARISOT, N. ; VARGAS, C. ; GOUBERT, C. ; FERRARINI, M. G. ; REBOLLO, RITA ; VIEIRA, C. ; HEDDI, A. . The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae. BMC BIOLOGY , v. 19, p. 241, 2021.

  • PUSA, T. ; FERRARINI, M. G. ; SAGOT, MARIE-FRANCE . MOOMIN ? Mathematical explOration of ?Omics data on a MetabolIc Network. Bioinformatics , v. 2, p. 514, 2020.

  • REBOLLO, RITA ; GALVÃO-FERRARINI, MARIANA ; GAGNIER, LIANE ; ZHANG, YING ; FERRAJ, ARDIAN ; BECK, CHRISTINE R. ; LORINCZ, MATTHEW C. ; MAGER, DIXIE L. . Inter-Strain Epigenomic Profiling Reveals a Candidate IAP Master Copy in C3H Mice. Viruses-Basel , v. 12, p. 783, 2020.

  • MAIRE, J. ; PARISOT, N. ; FERRARINI, M. G. ; VALLIER, A. ; HEDDI, A. . Spatial and morphological reorganization of endosymbiosis during metamorphosis accommodates adult metabolic requirements in a weevil. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA , v. 117, p. 19347-19358, 2020.

  • OLIVEIRA, WILLIAN K ; FERRARINI, MARIANA ; MORELLO, LUIS G ; FAORO, HELISSON . Resistome analysis of bloodstream infection bacterial genomes reveals a specific set of proteins involved in antibiotic resistance and drug efflux. NAR Genomics and Bioinformatics , v. 2, p. lqaa055, 2020.

  • MUCHA, SCHEILA G. ; FERRARINI, MARIANA G. ; MORAGA, CAROL ; DI GENOVA, ALEX ; GUYON, LAURENT ; TARDY, FLORENCE ; ROME, SOPHIE ; SAGOT, MARIE-FRANCE ; ZAHA, ARNALDO . Mycoplasma hyopneumoniae J elicits an antioxidant response and decreases the expression of ciliary genes in infected swine epithelial cells. Scientific Reports , v. 10, p. 13707, 2020.

  • FERRARINI, MARIANA GALVÃO ; MUCHA, SCHEILA GABRIELE ; PARROT, DELPHINE ; MEIFFREIN, GUILLAUME ; RUGGIERO BACHEGA, JOSE FERNANDO ; COMTE, GILLES ; ZAHA, ARNALDO ; SAGOT, MARIE-FRANCE . Hydrogen peroxide production and myo-inositol metabolism as important traits for virulence of Mycoplasma hyopneumoniae. MOLECULAR MICROBIOLOGY , v. 108, p. 683-696, 2018.

  • COSTA, JIMENA FERREIRA DA ; FERRARINI, MARIANA GALVÃO ; NARDELLI, SHEILA CRISTINA ; GOLDENBERG, SAMUEL ; ÁVILA, ANDRÉA RODRIGUES ; HOLETZ, FABÍOLA BARBIERI . Trypanosoma cruzi XRNA granules colocalise with distinct mRNP granules at the nuclear periphery. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz , v. 113, p. e170531, 2018.

  • FERRARINI, M. G. ; SIQUEIRA, FRANCIELE M. ; MUCHA, SCHEILA G. ; ZAHA, ARNALDO ; SAGOT, MARIE-FRANCE . Insights on the virulence of swine respiratory tract mycoplasmas through genome-scale metabolic modeling. BMC GENOMICS , v. 17, p. 353, 2016.

  • FERRARINI, M. G. . Metabolic investigation of the swine lung microbiome. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Max-Planck-Gesellschaft. , Hans Knoll Str. 8, Beutenberg, 07745 - Jena, - Alemanha, Telefone: (0049) 3641571501, URL da Homepage:

Experiência profissional

2012 - 2012

Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique - Siège

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Agente Temporário, Carga horária: 35, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Agente temporário para início de atividades de doutorado.

2009 - 2012

Instituto Carlos Chagas - Fiocruz

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de Mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2008 - 2009

Universidade Federal do Paraná

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

Outras informações:
Bolsista de Iniciação Científica (PIBITI/CNPq) no laboratório de Neurobiologia do Depto de Patologia Básica da UFPR. Título do Plano de Trabalho: Purificação de Laminina a partir de linhagem imortalizada cultivável do tumor EHS.

2008 - 2008

Universidade Federal do Paraná

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

Outras informações:
Bolsista de Iniciação Científica (PIBIC/CNPq) no laboratório de Neurobiologia do Depto de Patologia Básica da UFPR. Título do Plano de Trabalho: Expressão e Purificação da Mólécula ADAM23 e sua utilização na Produção de Anticorpos Policlonais.

2007 - 2008

Universidade Federal do Paraná

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estágio Voluntário, Carga horária: 12

Outras informações:
Estágio no Laboratório de Neurobiologia do Departamento de Patologia Básica da UFPR. Estágio em Expressão e Purificação de Proteínas Heterólogas e Purificação de Proteínas de Matrix Extracelular.

2009 - 2009

Biomatech

Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estágiaria em Pesquisa e Desenvolvimento, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Estágio obrigatório em Lyon, FRANÇA; Departamento de Histologia da empresa multinacional BIOMATECH - NAMSA. Obrigatório à conclusão da graduação de Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia.

2016 - 2016

Centre de Recherche INRIA Grenoble - Rhône-Alpes

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorado, Carga horária: 35, Regime: Dedicação exclusiva.

2017 - 2018

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Vínculo: Pós-Doutorado, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorado, Carga horária: 35

2018 - 2019

Institut National des Sciences Appliquees de Lyon

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorado, Carga horária: 35, Regime: Dedicação exclusiva.

2019 - 2020

INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE Clermont-Auvergne-Rhônes-Alpe, INRAe

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorado, Carga horária: 35, Regime: Dedicação exclusiva.

2021 - 2022

Centre National de la Recherche Scientifique

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorado, Carga horária: 35, Regime: Dedicação exclusiva.

2025 - Atual

Max Planck Institute for Chemical Ecology

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisadora