Eduardo Gade Gusmão

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• LI, ZHIJIAN ; KUO, CHAO-CHUNG ; TICCONI, FABIO ; SHAIGAN, MINA ; GEHRMANN, JULIA ; GUSMAO, EDUARDO GADE ; ALLHOFF, MANUEL ; MANOLOV, MARTIN ; ZENKE, MARTIN ; COSTA, IVAN G. . RGT: a toolbox for the integrative analysis of high throughput regulatory genomics data. BMC BIOINFORMATICS , v. 24, p. 79, 2023.

• ACHARYA, AVISEKA ; NEMADE, HARSHAL ; PAPADOPOULOS, SYMEON ; HESCHELER, JÜRGEN ; NEUMAIER, FELIX ; SCHNEIDER, TONI ; RAJENDRA PRASAD, KRISHNA ; KHAN, KHADIJA ; HEMMERSBACH, RUTH ; GUSMAO, EDUARDO GADE ; MIZI, ATHANASIA ; PAPANTONIS, ARGYRIS ; SACHINIDIS, AGAPIOS . Microgravity-induced stress mechanisms in human stem cell-derived cardiomyocytes. Iscience , v. 25, p. 104577, 2022.

• KARGAPOLOVA, YULIA ; REHIMI, RIZWAN ; KAYSERILI, HÜLYA ; BRÜHL, JOANNA ; SOFIADIS, KONSTANTINOS ; ZIRKEL, ANNE ; PALIKYRAS, SPIROS ; MIZI, ATHANASIA ; LI, YUN ; YIGIT, GÖKHAN ; HOISCHEN, ALEXANDER ; FRANK, STEFAN ; RUSS, NICOLE ; TRAUTWEIN, JONATHAN ; VAN BON, BREGJE ; GILISSEN, CHRISTIAN ; LAUGSCH, MAGDALENA ; GUSMAO, EDUARDO GADE ; JOSIPOVIC, NATASA ; ALTMÜLLER, JANINE . Overarching control of autophagy and DNA damage response by CHD6 revealed by modeling a rare human pathology. Nature Communications , v. 12, p. 3014, 2021.

• SOFIADIS, KONSTANTINOS ; JOSIPOVIC, NATASA ; NIKOLIC, MILOS ; KARGAPOLOVA, YULIA ; ÜBELMESSER, NADINE ; VARAMOGIANNI'MAMATSI, VASSILIKI ; ZIRKEL, ANNE ; PAPADIONYSIOU, IOANNA ; LOUGHRAN, GARY ; KEANE, JAMES ; MICHEL, AUDREY ; GUSMAO, EDUARDO G ; BECKER, CHRISTIAN ; ALTMÜLLER, JANINE ; GEORGOMANOLIS, THEODORE ; MIZI, ATHANASIA ; PAPANTONIS, ARGYRIS . HMGB1 coordinates SASP-related chromatin folding and RNA homeostasis on the path to senescence. Molecular Systems Biology , v. 17, p. e9760, 2021.

• ZAMPETIDIS, CHRISTOS P. ; GALANOS, PANAGIOTIS ; ANGELOPOULOU, ANDRIANI ; ZHU, YAJIE ; POLYZOU, AIKATERINI ; KARAMITROS, TIMOKRATIS ; KOTSINAS, ATHANASSIOS ; LAGOPATI, NEFELI ; MOURKIOTI, IOANNA ; MIRZAZADEH, REZA ; POLYZOS, ALEXANDROS ; GARNERONE, SILVANO ; MIZI, ATHANASIA ; GUSMAO, EDUARDO G. ; SOFIADIS, KONSTANTINOS ; GÁL, ZITA ; LARSEN, DORTHE H. ; PEFANI, DAFNI-ELEFTHERIA ; DEMARIA, MARCO ; TSIRIGOS, ARISTOTELIS . A recurrent chromosomal inversion suffices for driving escape from oncogene-induced senescence via subTAD reorganization. MOLECULAR CELL , v. 81, p. 4907-4923.e8, 2021.

• ZHANG, SHU ; ÜBELMESSER, NADINE ; JOSIPOVIC, NATASA ; FORTE, GIADA ; SLOTMAN, JOHAN A. ; CHIANG, MICHAEL ; GOTHE, HENRIKE JOHANNA ; GUSMAO, EDUARDO GADE ; BECKER, CHRISTIAN ; ALTMÜLLER, JANINE ; HOUTSMULLER, ADRIAAN B. ; ROUKOS, VASSILIS ; WENDT, KERSTIN S. ; MARENDUZZO, DAVIDE ; PAPANTONIS, ARGYRIS . RNA polymerase II is required for spatial chromatin reorganization following exit from mitosis. SCIENCE ADVANCES , v. 7, p. eabg8205, 2021.

• MIZI, ATHANASIA ; GADE GUSMAO, EDUARDO ; PAPANTONIS, ARGYRIS . iHi-C 2.0: A simple approach for mapping native spatial chromatin organisation from low cell numbers. METHODS , v. 170, p. 33-37, 2020.

• CASA, VALENTINA ; MORONTA GINES, MACARENA ; GADE GUSMAO, EDUARDO ; SLOTMAN, JOHAN A. ; ZIRKEL, ANNE ; JOSIPOVIC, NATASA ; OOLE, EDWIN ; VAN IJCKEN, WILFRED F.J. ; HOUTSMULLER, ADRIAAN B. ; PAPANTONIS, ARGYRIS ; WENDT, KERSTIN S. . Redundant and specific roles of cohesin STAG subunits in chromatin looping and transcriptional control. Genome Research , v. 30, p. 515-527, 2020.

• GOTHE, HENRIKE JOHANNA ; BOUWMAN, BRITTA ANNIKA MARIA ; GUSMAO, EDUARDO GADE ; PICCINNO, ROSSANA ; PETROSINO, GIUSEPPE ; SAYOLS, SERGI ; DRECHSEL, OLIVER ; MINNEKER, VERA ; JOSIPOVIC, NATASA ; MIZI, ATHANASIA ; NIELSEN, CHRISTIAN FRIBERG ; WAGNER, EVA-MARIA ; TAKEDA, SHUNICHI ; SASANUMA, HIROYUKI ; HUDSON, DAMIEN FRANCIS ; KINDLER, THOMAS ; BARANELLO, LAURA ; PAPANTONIS, ARGYRIS ; CROSETTO, NICOLA ; ROUKOS, VASSILIS . Spatial Chromosome Folding and Active Transcription Drive DNA Fragility and Formation of Oncogenic MLL Translocations. MOLECULAR CELL , v. 75, p. 267-283.e12, 2019.

• ZIRKEL, ANNE ; NIKOLIC, MILOS ; SOFIADIS, KONSTANTINOS ; MALLM, JAN-PHILIPP ; BRACKLEY, CHRIS A. ; GOTHE, HENRIKE ; DRECHSEL, OLIVER ; BECKER, CHRISTIAN ; ALTMÜLLER, JANINE ; JOSIPOVIC, NATASA ; GEORGOMANOLIS, THEODORE ; BRANT, LILIJA ; FRANZEN, JULIA ; KOKER, MIRJAM ; GUSMAO, EDUARDO G. ; COSTA, IVAN G. ; ULLRICH, ROLAND T. ; WAGNER, WOLFGANG ; ROUKOS, VASSILIS ; NÜRNBERG, PETER . HMGB2 Loss upon Senescence Entry Disrupts Genomic Organization and Induces CTCF Clustering across Cell Types. MOLECULAR CELL , v. 70, p. 730-744.e6, 2018.

• AXELSSON, A. S. ; MAHDI, T. ; NENONEN, H. A. ; SINGH, T. ; HÄNZELMANN, S. ; WENDT, A. ; BAGGE, A. ; REINBOTHE, T. M. ; MILLSTEIN, J. ; YANG, X. ; ZHANG, B. ; GUSMAO, E. G. ; SHU, L. ; SZABAT, M. ; TANG, Y. ; WANG, J. ; SALÖ, S. ; ELIASSON, L. ; ARTNER, I. ; FEX, M. . Sox5 regulates beta-cell phenotype and is reduced in type 2 diabetes. Nature Communications , v. 8, p. 15652, 2017.

• GUSMAO, EDUARDO G ; ALLHOFF, MANUEL ; ZENKE, MARTIN ; COSTA, IVAN G . Analysis of computational footprinting methods for DNase sequencing experiments. NATURE METHODS , v. 13, p. 303-309, 2016.

• KOLOVOS, PETROS ; GEORGOMANOLIS, THEODORE ; KOEFERLE, ANNA ; LARKIN, JOSHUA D. ; BRANT, LILIJA ; NIKOLIC', MILO? ; GUSMAO, EDUARDO G. ; ZIRKEL, ANNE ; KNOCH, TOBIAS A. ; VAN IJCKEN, WILFRED F. ; COOK, PETER R. ; COSTA, IVAN G. ; GROSVELD, FRANK G. ; PAPANTONIS, ARGYRIS . Binding of nuclear factor B to noncanonical consensus sites reveals its multimodal role during the early inflammatory response. GENOME RESEARCH , v. 26, p. 1478-1489, 2016.

• HÄNZELMANN, SONJA ; BEIER, FABIAN ; GUSMAO, EDUARDO G ; KOCH, CARMEN M ; HUMMEL, SEBASTIAN ; CHARAPITSA, IRYNA ; JOUSSEN, SYLVIA ; BENES, VLADIMIR ; BRÜMMENDORF, TIM H ; REID, GEORGE ; COSTA, IVAN G ; WAGNER, WOLFGANG . Replicative senescence is associated with nuclear reorganization and with DNA methylation at specific transcription factor binding sites. Clinical Epigenetics , v. 7, p. 19, 2015.

• SCHEMIONEK, M ; HERRMANN, O ; MERLE REHER, M ; CHATAIN, N ; SCHUBERT, C ; COSTA, I G ; HAENZELMANN, S ; GUSMAO, E G ; KINTSLER, S ; BRAUNSCHWEIG, T ; HAMILTON, A ; HELGASON, G V ; COPLAND, M ; SCHWAB, A ; MÜLLER-TIDOW, C ; LI, S ; HOLYOAKE, T L ; BRÜMMENDORF, T H ; KOSCHMIEDER, S . MTSS1 is a critical epigenetically regulated tumor suppressor in CML. LEUKEMIA , v. 30, p. 823-832, 2015.

• LIN, QIONG ; CHAUVISTRÉ, HEIKE ; COSTA, IVAN G. ; GUSMAO, EDUARDO G. ; MITZKA, SASKIA ; HÄNZELMANN, SONJA ; BAYING, BIANKA ; KLISCH, THERESA ; MORIGGL, RICHARD ; HENNUY, BENOIT ; SMEETS, HUBERT ; HOFFMANN, KURT ; BENES, VLADIMIR ; SERÉ, KRISTIN ; ZENKE, MARTIN . Epigenetic program and transcription factor circuitry of dendritic cell development. NUCLEIC ACIDS RESEARCH (ONLINE) , v. 43, p. gkv1056-9693, 2015.

• ULLIUS, A. ; LUSCHER-FIRZLAFF, J. ; COSTA, I. G. ; WALSEMANN, G. ; FORST, A. H. ; GUSMAO, E. G. ; KAPELLE, K. ; KLEINE, H. ; KREMMER, E. ; VERVOORTS, J. ; LUSCHER, B. . The interaction of MYC with the trithorax protein ASH2L promotes gene transcription by regulating H3K27 modification. NUCLEIC ACIDS RESEARCH (ONLINE) , v. 42, p. 6901-6920, 2014.

• GUSMAO, E. G. ; DIETERICH, C. ; ZENKE, M. ; COSTA, I. G. . Detection of active transcription factor binding sites with the combination of DNase hypersensitivity and histone modifications. BIOINFORMATICS , v. 30, p. 3143-3153, 2014.

• GUSMAO, EDUARDO G. ; DE SOUTO, MARCILIO C. P. . Issues on sampling negative examples for predicting prokaryotic promoters. In: 2014 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN), 2014, Beijing. 2014 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN), 2014. p. 494.

• GUSMAO, EG ; DIETERICH, C. ; COSTA, I. G. . Prediction of Transcription Factor Binding Sites by Integrating DNase digestion and Histone Modification. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2012, Campo Grande. Lecture Notes in Bioinformatics. Berlin: Springer Verlag, 2012. v. 7409. p. 109-119.

• ARAUJO, F. R. B. ; GUSMAO, EG ; GUIMARAES, K. S. . A Case-Control Study of Non-parametric Approaches for Detecting SNP-SNP Interactions.. In: Jornadas Chilenas de Computación, 2011, Curicó. XXX International Conference of the Chilean Computer Science Society (SCCC'2011), 2011.

• GOTHE, HENRIKE ; GUSMAO, E G ; BOUWMAN, BRITTA ANNIKA MARIA ; PICCINNO, ROSSANA ; DRECHSEL, OLIVER ; PETROSINO, GIUSEPPE ; CROSETTO, NICOLA ; PAPANTONIS, ARGYRIS ; ROUKOS, VASSILIS . Spatial chromosome folding and active transcription drive DNA fragility and formation of oncogenic MLL translocations. In: 2019 EMBO Workshop: The Genome in Three Dimensions, 2019, Kyllini. Proceedings of the 2019 EMBO Workshop: The Genome in Three Dimensions, 2019.

• GUSMAO, E G ; PAPANTONIS, ARGYRIS . Computational optimization allows exploration of native chromatin conformation. In: 2019 EMBO Workshop: The Genome in Three Dimensions, 2019, Kyllini. Proceedings of the 2019 EMBO Workshop: The Genome in Three Dimensions, 2019.

• KABBECH, H. ; GUSMAO, E G . An Integrative Deep-Learning Framework for Analyzing the Interplay between Chromatin Conformation and Epigenetics. In: 2019 EMBO Workshop: The Genome in Three Dimensions, 2019, Kyllini. Proceedings of the 2019 EMBO Workshop: The Genome in Three Dimensions, 2019.

• GUSMAO, E G ; PAPANTONIS, ARGYRIS . Bloom: A computational framework to reveal occult patterns on chromatin conformation experiments. In: 2019 IMB Conference: Chromosome Territories and Nuclear Architecture, 2019, Mainz. Proceedings of the 2019 IMB Conference: Chromosome Territories and Nuclear Architecture, 2019.

• GUSMAO, E G ; LI, Z. ; COSTA, I G . Prediction of transcription factor binding sites using computational footprinting data. In: RECOMB/ISCB Conference on Regulatory and Systems Genomics with DREAM Challenges, 2016, Phoenix. Proceedings of the 2016 RECOMB/ISCB Conference on Regulatory and Systems Genomics with DREAM Challenges, 2016.

• GUSMAO, EG ; COSTA, I. G. . HINT-BC - HMM-based Identification of Transcription Factor Footprints on Bias-Corrected DNase-seq Data. In: Proceedings of the 23rd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 14th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2015) & Regulatory Genomics Special Interest Group (RegGenSIG 2015), 2015, Dublin. Proceedings of the 23rd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 14th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2015) & Regulatory Genomics Special Interest Group (RegGenSIG 2015), 2015.

• GUSMAO, EG ; COSTA, I. G. . Computational approaches to correct biases generated by next-generation sequencing techniques. In: Otto Warburg International Summer School and Research Symposium, 2015, Berlin. Otto Warburg International Summer School and Research Symposium, 2015.

• GUSMAO, EG ; COSTA, I. G. . Are computationally predicted footprints result of DNase I cleavage bias?. In: RECOMB/ISCB Conference on Regulatory and Systems Genomics, 2014, San Diego. Proceedings of the 2014 RECOMB/ISCB Conference on Regulatory and Systems Genomics, 2014.

• GUSMAO, EG ; COSTA, I. G. . Improving TFBS prediction by integrating epigenetic features. In: Proceedings of the 5th Bioinformatics and Stem Cells Satellite Workshop, 2013, Colônia. Proceedings of the 5th Bioinformatics and Stem Cells Satellite Workshop, 2013.

• GUSMAO, EG ; COSTA, I. G. . Search of Cell-Specific Transcription Factor Binding Sites with DNase Hypersensitivity and Histone Modifications. In: International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics (X-meeting/BSB 2013), 2013, Recife. Proceedings of the International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics (X-meeting/BSB 2013), 2013.

• GUSMAO, EG ; GUIMARAES, K. S. . Estudo de Métodos para Identificar Interações entre Polimorfismos. In: XVIII Congresso de Iniciação Científica da Universidade Federal de Pernambuco, 2010, Recife. Anais do XVIII Congresso de Iniciação Científica da Universidade Federal de Pernambuco, 2010.

• COSTA, I. G. ; GUSMAO, EG . Prediction of Transcription Factor Binding Sites by Integrating DNase digestion and Histone Modification. In: European Conference on Computational Biology, 2012, Basel. Proceedings of the 11th European Conference on Computational Biology (ECCB'2012), 2012.

• REGO, T. G. ; ARAUJO FILHO, C. R. ; GUSMAO, EG ; DE SOUTO, M.C.P. ; COSTA, I. G. . Classification Complexity in Gene Marker Selection for Cancer Diagnosis. In: 5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. Proceedings of the 5th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology, 2009.

• GUSMAO, E G . Bloom: A computational framework to reveal occult patterns on chromatin conformation experiments. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• GUSMAO, E. G. . Analysis of computational footprinting methods for DNase sequencing experiments. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• GUSMAO, E G . Analysis of computational footprinting methods for DNase sequencing experiments. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• GUSMAO, E. G. . HINT-BC: HMM-based identification of transcription factor footprints on bias-corrected DNase-seq data. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• GUSMAO, E. G. . Computational approaches to correct biases generated by next-generation sequencing techniques. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• GUSMAO, E. G. ; COSTA, I. G. . Improving TFBS prediction by integrating epigenetic features. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• GUSMAO, E. G. . Search of cell-specific transcription factor binding sites with DNase hypersensitivity and histone modifications. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• GUSMAO, EG ; DIETERICH, C. ; COSTA, I. G. . Prediction of Transcription Factor Binding Sites by Integrating DNase digestion and Histone Modification. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• GUSMAO, EG ; GUIMARAES, K. S. . Estudo de Métodos para Identificar Interações entre Polimorfismos. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• GUSMAO, EG ; GUIMARAES, K. S. . Estudo de Métodos para Identificar Interações entre Polimorfismos. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2022 - 2023

  RGT: a toolbox for the integrative analysis of high throughput regulatory genomics data., Descrição: RGT: a toolbox for the integrative analysis of high throughput regulatory genomics data.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / Ivan Gesteira Costa - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2021 - 2022

  Microgravity-induced stress mechanisms in human stem cell-derived cardiomyocytes., Descrição: Microgravity-induced stress mechanisms in human stem cell-derived cardiomyocytes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (4) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / PAPANTONIS, ARGYRIS - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2020 - 2021

  HMGB1 coordinates SASP-related chromatin folding and RNA homeostasis on the path to senescence., Descrição: HMGB1 coordinates SASP-related chromatin folding and RNA homeostasis on the path to senescence.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (6) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / PAPANTONIS, ARGYRIS - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2020 - 2021

  A recurrent chromosomal inversion suffices for driving escape from oncogene-induced senescence via subTAD reorganization., Descrição: A recurrent chromosomal inversion suffices for driving escape from oncogene-induced senescence via subTAD reorganization.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (7) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / PAPANTONIS, ARGYRIS - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2020 - 2021

  Overarching control of autophagy and DNA damage response by CHD6 revealed by modeling a rare human pathology., Descrição: Overarching control of autophagy and DNA damage response by CHD6 revealed by modeling a rare human pathology.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (6) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / PAPANTONIS, ARGYRIS - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2020 - 2021

  RNA polymerase II is required for spatial chromatin reorganization following exit from mitosis., Descrição: RNA polymerase II is required for spatial chromatin reorganization following exit from mitosis.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (5) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / PAPANTONIS, ARGYRIS - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2019 - 2022

  Exploring the contribution of transcription to native chromatin looping and genome conformation, Descrição: Exploring the contribution of transcription to native chromatin looping and genome conformation. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Integrante / PAPANTONIS, ARGYRIS - Coordenador., Financiador(es): Deutsche Forschungsgemeinschaft - Auxílio financeiro.

• 2019 - 2020

  Redundant and specific roles of cohesin STAG subunits in chromatin looping and transcription control., Descrição: Redundant and specific roles of cohesin STAG subunits in chromatin looping and transcription control.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / PAPANTONIS, ARGYRIS - Integrante / WENDT, KERSTIN S. - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2019 - 2020

  iHi-C 2.0: A simple approach for mapping native spatial chromatin organization from low cell numbers., Descrição: iHi-C 2.0: A simple approach for mapping native spatial chromatin organization from low cell numbers.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / PAPANTONIS, ARGYRIS - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2018 - 2019

  Spatial chromosome folding and active transcription drive DNA fragility and formation of oncogenic MLL translocations., Descrição: Spatial chromosome folding and active transcription drive DNA fragility and formation of oncogenic MLL translocations.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (4) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / PAPANTONIS, ARGYRIS - Integrante / ROUKOS, VASSILIS - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2017 - 2018

  HMGB2 loss upon senescence entry disrupts genomic organization and induces CTCF clustering across cell types., Descrição: HMGB2 loss upon senescence entry disrupts genomic organization and induces CTCF clustering across cell types.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (5) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / PAPANTONIS, ARGYRIS - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2017 - 2017

  Jane Coffin Childs Memorial Fund for Medical Research (declinado), Descrição: Subsidio para pesquisa declinado pelo autor. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador.

• 2016 - 2022

  Exploring the contribution of transcription to native chromatin looping and genome conformation, Descrição: Exploring the contribution of transcription to native chromatin looping and genome conformation. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (8) / Doutorado: (6) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Integrante / PAPANTONIS, ARGYRIS - Coordenador., Financiador(es): European Research Center for Information Systems - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2016

  Analysis of computational footprinting methods for DNase sequencing experiments., Descrição: Analysis of computational footprinting methods for DNase sequencing experiments.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / Ivan Gesteira Costa - Integrante / ZENKE, M. - Integrante / ALLHOFF, MANUEL - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2014 - 2015

  Replicative senescence is associated with nuclear reorganization and with DNA methylation at specific transcription factor binding sites., Descrição: Replicative senescence is associated with nuclear reorganization and with DNA methylation at specific transcription factor binding sites.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (4) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Integrante / Ivan Gesteira Costa - Integrante / HÄNZELMANN, SONJA - Coordenador., Número de produções C, T & A: 1

• 2014 - 2015

  Epigenetic program and transcription factor circuitry of dendritic cell development., Descrição: Epigenetic program and transcription factor circuitry of dendritic cell development.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (4) Doutorado: (4) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / Ivan Gesteira Costa - Integrante / HÄNZELMANN, SONJA - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2014 - 2015

  Mtss1 is a critical epigenetically regulated tumor suppressor in CML., Descrição: Mtss1 is a critical epigenetically regulated tumor suppressor in CML.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (5) Doutorado: (4) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / Ivan Gesteira Costa - Integrante / HÄNZELMANN, SONJA - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2013 - 2014

  Detection of active transcription factor binding sites with the combination of DNase hypersensitivity and histone modifications, Descrição: Detection of active transcription factor binding sites with the combination of DNase hypersensitivity and histone modifications. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / Ivan Gesteira Costa - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2013 - 2014

  The interaction of MYC with the trithorax protein ASH2L promotes gene transcription by regulating H3K27 modification, Descrição: The interaction of MYC with the trithorax protein ASH2L promotes gene transcription by regulating H3K27 modification. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Coordenador / COSTA, I.G. - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

• 2011 - 2012

  Identificação de Sítios de Ligação de Fatores de Transcrição Baseada em Dados Epigenéticos, Descrição: O projeto tem como objetivo a utilização de dados epigenéticos, tais como cromatina aberta ou modificações de histonas, obtidos através de tecnologias baseadas em next generation sequencing, para a identificação de elementos regulatórios.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Integrante / Thais Gaudêncio Rêgo - Integrante / Ivan Gesteira Costa - Coordenador., Número de produções C, T & A: 1

• 2009 - 2010

  Estudo de Métodos para Identificar Interações entre Polimorfismos, Descrição: Projeto de iniciação científica tendo como orientador a professora Katia S. Guimarães. O objetivo deste trabalho é avaliar mais cuidadosamente o desempenho da abordagem PIA (Polymorphism Interaction Analysis), analisando a qualidade dos resultados em diferentes cenários. Em particular, será feita uma análise do desempenho com relação a interações entre SNPs (Single Nucleotide Polymorhpisms) associados a diferentes tipos de doenças, e em particular ao câncer. Os resultados da análise devem indicar aspectos não tratados nas ferramentas estudadas e formas como a predição de interações pode ser melhorada. Projeto escolhido para financiamento pelo programa PIBIC no período de um ano (julho 2009 - agosto 2010), com matrícula BIC-1501-1.03/09.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Eduardo Gade Gusmão - Integrante / Katia S. Guimarães - Coordenador / Flávia Roberta Barbosa de Araújo - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco - Bolsa., Número de produções C, T & A: 3

Prêmios