Fábio Nunes de Mello

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• DE MELLO, FABIO N ; TAHIRA, ANA C ; BERZOTI-COELHO, MARIA GABRIELA ; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO . The CUT&RUN greenlist: genomic regions of consistent noise are effective normalizing factors for quantitative epigenome mapping. Briefings in Bioinformatics , v. 25, p. bbad538, 2024.

• DE OLIVEIRA MAGALHÃES, LARISSA ; NUNES DE MELLO, FABIO ; VISCHI WINCK, FLAVIA . Characterization of the Nuclear Proteome of Chlamydomonas in Response to Salt Stress. Phycology , v. 2, p. 280-296, 2022.

• MOLINO, JOÃO VITOR ; LUBIANA ALVES, TIAGO ; FERREIRA-CAMARGO, LIVIA ; CROCE, MIGUEL ; TANAKA, ALLAN ; BUSON, FELIPE ; RIBEIRO, PEDRO ; CAMPOS-SALAZAR, ANTONY ; ANTONIO, EDUARDO ; MAIZEL, ANDRÉ ; SIRATUTI, VIVIANE ; COSTA, CLAUDIA ; WLODARCZYK, SAMARINA ; DE SOUZA LIMA, RAQUEL ; MELLO, FABIO ; MAYFIELD, STEPHEN ; CARVALHO, JOÃO . Chimeric spider silk production in microalgae: a modular bionanomaterial. RESEARCH IDEAS AND OUTCOMES , v. 2, p. e9342, 2016.

• MELLO, F. N. ; COELHO, M. G. B. ; TAHIRA, A. C. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . Analysis of the transcriptional and epigenetic regulation mechanisms mediated by lincRNA PVT1 in a prostate cancer cell model. 2023. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• MELLO, F. N. ; COELHO, M. G. B. ; TAHIRA, A. C. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . Analysis of the transcriptional regulation mechanisms mediated by lincRNA PVT1 in a prostate cancer model. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MELLO, FABIO ; GIRALDI, Lais ; WINCK, Flavia . Análise de Proteoma Nuclear e Caracterização de Mecanismos Regulatórios em Chlamydomonas reinhardtii. 2020. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Projetos de pesquisa

• 2022 - Atual

  Análise dos mecanismos de regulação transcricional mediados pelo lincRNA PVT1 em modelo de câncer de próstata, Descrição: O desenvolvimento de câncer de próstata é conhecidamente dependente da presença do hormônio andrógeno, com o receptor de andrógeno (AR) atuando para regular a transcrição de centenas de genes envolvidos com o processo oncogênico. Porém, pouco ainda se sabe sobre os exatos mecanismos para essa regulação. Já foi demonstrado que diversos RNAs não-codificantes intergênicos longos (lincRNAs) podem se associar a AR, recrutando enzimas modificadoras da cromatina e direcionando sua atuação no genoma, porém poucos desses lincRNAs foram caracterizados por completo, ainda menos em escala genômica. Dando sequência a trabalhos prévios do nosso laboratório, nós focamos no lincRNA PVT1, oncogene cuja super-expressão é observada em diversos tipos de câncer mas cujo mecanismo de tumorigênese ainda não é caracterizado. Para isso, desenvolvemos um modelo de knockdown de PVT1 em linhagem de células de câncer de próstata, e pretendemos avaliar o impacto da diminuição de PVT1 sobre a deposição de diferentes marcas de cromatina e proteínas regulatórias ao longo do genoma. Ademais, pretendemos analisar os efeitos do knockdown e da presença do hormônio andrógeno no transcriptoma dessas células, a fim de correlacionar as marcas epigenéticas observadas e as mudanças de expressão gênica induzidas pela associação de PVT1 e AR, para caracterizar seus mecanismos oncogênicos em câncer de próstata.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Fábio Nunes de Mello - Integrante / Sergio Verjovski Almeida - Coordenador / Maria Gabriela Berzoti Coelho - Integrante.

• 2019 - 2021

  Análise de Proteoma Nuclear e Caracterização de Mecanismos Regulatórios em Chlamydomonas reinhardtii, Descrição: A produção de lipídeos pela alga unicelular Chlamydomonas reinhardtii mantém grande interesse industrial, porém os mecanismos regulatórios que coordenam a expressão de enzimas chave deste fenótipo ainda é largamente desconhecido. Neste trabalho, propomos a análise de proteoma nuclear como ponto de partida para a identificação de proteínas candidatas que são moduladas em resposta a privação de nitrogênio, condição nutricional capaz de aumentar a síntese lipídica em tais células. Para isso, dados do proteoma total e de proteoma nuclear de C. reinhardtii em condição de privação de nitrogênio por 1h foram analisados. A partir da comparação entre a proteômica nuclear e proteômica total, foi possível identificar proteínas candidatas relevantes para o fenótipo de acúmulo de lipídios sob privação de nitrogênio. No futuro, pretendemos usar tal identificação como ponto de partida para validação in silico e in vivo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Fábio Nunes de Mello - Integrante / Laís Albuquerque Giraldi - Integrante / Flavia Vischi Winck - Coordenador., Número de produções C, T & A: 1

• 2016 - 2019

  Caracterização de células deficientes para reparo acoplado à transcrição em resposta a estresse oxidativo, Descrição: O reparo de bases de DNA modificadas por espécies reativas de oxigênio (ROS) pela via de reparo por excisão de bases (BER) já é amplamente conhecido na literatura. Porém, evidências sugerem que esse tipo de lesão também possa ser reparado pelo reparo acoplado à transcrição (TCR) da via de reparo por excisão de nucleotídeos (NER), que repara lesões que bloqueiam o progresso da maquinaria de transcrição ( bulky lesions) . A parada da transcrição por lesões de bases oxidadas se apresenta como hipótese plausível para explicar o fenótipo de neurodegeneração da Síndrome de Cockayne (CS), doença genética relacionada ao comprometimento da via de TCR-NER. Células mutantes para CSB já foram caracterizadas quanto à sua sensibilidade à luz UV, agente conhecido por causar lesões maiores, pela deficiência na proteína CSB, importante para a via de TCR-NER. Assim, este trabalho se propõe a caracterizar a resposta de células CSB a agente causadores de estresse oxidativo, a partir da parada de transcrição por bases oxidadas. Ademais, evidências sugerem o papel das proteínas de TCR-NER na resolução de R-loops, estruturas formadas por híbridos de DNA:RNA. O aumento de R-loops, e quebras da fita dupla do DNA causadas em sua decorrência, se apresentam como um mecanismo plausível para causar a morte de células deficientes de nessa via. Assim, este trabalho também se propõe a quantificar os R-loops de células CSB frente ao estresse oxidativo, em busca de explicar o fenótipo clínico de neurodegeneração e envelhecimento precoce de pacientes CS.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Fábio Nunes de Mello - Integrante / Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador / Giovana da Silva Leandro - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

Prêmios