Viviane Schuch
Atualmente realizando o pós-doutorado no Computational Systems Biology Laboratory (CSBL). Possui Doutorado em Educação e Saúde na Infância e Adolescência pela Universidade Federal de São Paulo (2017), trabalhando com TDAH, epigenética e modulação do comportamento humano. Possui Doutorado e Mestrado em Microbiologia Agropecuária pela Universidade Estadual Julio de Mesquita Filho (2011), com período sanduíche na Universitat de Barcelona, Espanha (2008), trabalhando principalmente com metagenoma e prospecção de genes com interesse biotecnológico. Bacharel e licenciada em Ciências Biológicas pela Universidade de São Paulo, atua nas áreas de biologia molecular, microbiologia, imunologia, neurologia, epigenética e biologia computacional, com interesse especial em análise multidimensional e integração de dados.
Informações coletadas do Lattes em 19/09/2025
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Educação e Saúde na Infância e Adolescência
2013 - 2017
Universidade Federal de São Paulo
Título: Desregulação Emocional Grave em Crianças e Adolescentes com TDAH: Estudo multidimensional dos fatores ambientais, neuropsicológicos e epigenéticos.
Mauro Muszkat. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: epigenetics; emotional self-regulation; executive functions; DESR-CBCL.Grande área: Ciências Biológicas
Doutorado em Microbiologia Agropecuária
2007 - 2011
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Prospecção de genes com interesse biotecnológico
Orientador: em Universitat de Barcelona ( Angeles Manresa Presas)
com Prof. Dr. Eliana Gertrudes de Macedo Lemos. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Mestrado em Microbiologia Agropecuária
2005 - 2007
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Construção de biblioteca metagenômica para prospecção de genes envolvidos na biossintese de antibióticos,Ano de Obtenção: 2007
Prof. Dr. Eliana Gertrudes de Macedo Lemos.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Graduação em Ciências Biológicas - Bacharelado
1997 - 2003
Universidade de São Paulo
Título: Caracterização Molecular de elementos virais de Eimeria sp de galinha doméstica
Orientador: Arthur Gruber
Pós-doutorado
2020
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas
2018 - 2020
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas
Formação complementar
2018 - 2018
São Paulo School of Advanced Science on Vaccines. (Carga horária: 80h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2017 - 2017
Probabilidade e Estatística. (Carga horária: 60h). , Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil.
2016 - 2016
Seminários de neuromodulação. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil.
2014 - 2014
Seminários de neuromodulação. (Carga horária: 10h). , Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil.
2001 - 2001
Encontro com Educadores do Projeto Álcool e Drogas?. (Carga horária: 20h). , Sociedade Beneficiente Israelita Brasileira Hospital Albert Einstein, SBIBHAA, Brasil.
1999 - 1999
Desenvolvimento de Equipes. (Carga horária: 24h). , Clariant - São Paulo - Matriz, CLARIANT/SP, Brasil.
1998 - 1998
Tópicos Avançados na Abordagem da Infertilidade. (Carga horária: 24h). , Programa de Reprodução Assistida, PROFERT, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Catalão
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Pouco.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia Computacional.
Grande área: Ciências Humanas / Área: Psicologia / Subárea: Psicologia Fisiológica/Especialidade: Psicobiologia.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Epigenética.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia.
Participação em eventos
Biota + 10 - Fapesp. 2009. (Oficina).
Encontro do Biota (FAPESP) Cerimônia de comemoração do 10 aniversário do Programa e workshop de definição de metas para 2020.. 2009. (Encontro).
14th European Congress on Biotechnology. Discovery of genes related to antibiotic biosynthesis into a metagenomic library. 2008. (Congresso).
III Encontro Nacional de Pós-Graduação em Microbiologia e V Fórum dos Coordenadores dos Programas de Microbiologia da Área de Ciências Agrárias.. Prospecção de genes envolvídos na biossíntese de antibióticos através da abordagem metagenômica.. 2008. (Congresso).
XI Simpósio de Genética e I Simpósio de Células-Tronco.Metagenoma: Uma abordagem biotecnologica.. 2008. (Simpósio).
II Encontro dos Alunos dos Cursos de Pós-Graduação em Microbiologia das Áreas Agrárias.Construção de Bibliotecas Metagenômicas para Prospecção de Genes envolvidos na Biossíntese de Antibióticos. 2007. (Encontro).
Real Time PCR: Users Meeting 2006. 2006. (Encontro).
I Seminário Profert - Tópicos Avançados na Abordagem da Infertilidade Humana. 1998. (Seminário).
Participação em bancas
Rizzutti S; Belim CM;Schuch, V,. Influência dos fatores ambientais e a correlação da autorregulação emocional deficiente em crianças com Transtorno de Déficit de Atenção e Hiperatividade. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Educação e Saúde na Infância e Adolescência) - Universidade Federal de São Paulo.
Orientou
Influência da Hidroquinona nas respostas imune humoral e celular induzida por vacina viral com proteína recombinante (Dengue); 2019; Dissertação (Mestrado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Viviane Schuch;
Produções bibliográficas
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SANTOS E SILVA, JUAN CARLO ; VASCONCELOS, AMANDA PEREIRA ; NOMA, ISABELLA HARUMI YONEHARA ; NORONHA, NATÁLIA YUMI ; AQUINO, RODRIGO ; GIDDALURU, JEEVAN ; DURÃO, LUIZ ; COSTA-MARTINS, ANDRÉ GUILHERME ; SCHUCH, VIVIANE ; MORAES-VIEIRA, PEDRO M. ; NAKAYA, HELDER I. . Gene signatures of autopsy lungs from obese patients with COVID-19. CLINICAL NUTRITION ESPEN , v. 44, p. 475-478, 2021.
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LÜSCHER DIAS, THOMAZ ; SCHUCH, VIVIANE ; BELTRÃO-BRAGA, PATRÍCIA CRISTINA BALEEIRO ; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL ; BRENTANI, HELENA PAULA ; FRANCO, GLÓRIA REGINA ; NAKAYA, HELDER IMOTO . Drug repositioning for psychiatric and neurological disorders through a network medicine approach. Translational Psychiatry , v. 10, p. 141, 2020.
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AGUIAR, RENATO S. POHL, FABIO MORAIS, GUILHERME L. NOGUEIRA, FABIO C. S. CARVALHO, JOSEANE B. GUIDA, LETÍCIA ARGE, LUIS W. P. MELO, ADRIANA MOREIRA, MARIA E. L. CUNHA, DANIELA P. GOMES, LEONARDO PORTARI, ELYZABETH A. VELASQUEZ, ERIKA MELANI, RAFAEL D. PEZZUTO, PAULA DE CASTRO, FERNANDA L. GEDDES, VICTOR E. V. GERBER, ALEXANDRA L. AZEVEDO, GIRLENE S. SCHAMBER-REIS, BRUNO L. GONÇALVES, ALESSANDRO L. JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, INÁCIO NISHIYAMA, MILTON Y. HO, PAULO L. SCHANOSKI, ALESSANDRA S. , et al. SCHUCH, VIVIANE TANURI, AMILCAR CHIMELLI, LEILA VASCONCELOS, ZILTON F. M. DOMONT, GILBERTO B. VASCONCELOS, ANA T. R. NAKAYA, HELDER I. ; Molecular alterations in the extracellular matrix in the brains of newborns with congenital Zika syndrome. Science Signaling , v. 13, p. eaay6736, 2020.
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FABRIS, ANDRÉ LUIS ; NUNES, ANDRE VINICIUS ; SCHUCH, VIVIANE ; DE PAULA-SILVA, MARINA ; ROCHA, GHO ; NAKAYA, HELDER I. ; HO, PAULO LEE ; SILVEIRA, EDUARDO L.V. ; FARSKY, SANDRA HELENA POLISELLI . Hydroquinone exposure alters the morphology of lymphoid organs in vaccinated C57Bl/6 mice. ENVIRONMENTAL POLLUTION , v. 257, p. 113554, 2020.
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RIZZUTTI, SUELI ; SCHUCH, VIVIANE ; AUGUSTO, BRUNO MUSZKAT ; COIMBRA, CAIO COLTURATO ; PEREIRA, JOÃO PEDRO CABRERA ; BUENO, ORLANDO FRANCISCO AMODEO . Neuropsychological Profiles Correlated with Clinical and Behavioral Impairments in a Sample of Brazilian Children with Attention-Deficit Hyperactivity Disorder. Frontiers in Psychiatry , v. 6, p. 163, 2015.
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SCHUCH, VIVIANE ; UTSUMI, DANIEL AUGUSTO ; COSTA, THAÍS VIRGÍNIA MOURA MACHADO ; KULIKOWSKI, LESLIE DOMENICI ; MUSZKAT, MAURO . Attention Deficit Hyperactivity Disorder in the Light of the Epigenetic Paradigm. Frontiers in Psychiatry , v. 6, p. 126, 2015.
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SCHUCH, VIVIANE ; Martins, Felipe ; Ten Caten, Felipe ; Araujo-Pereira, Mariana ; Cunha, Marielton Dos Passos ; El Khawanky, Nadia ; Cabral-Marques, Otavio ; NAKAYA, HELDER I. . Systems immunology of flavivirus infection. In: Colin R. Martin; Caroline J. Hollins Martin; Victor R. Preedy; Rajkumar Rajendram. (Org.). Zika Virus Biology, Transmission, and Pathology. 1ed.: Elsevier, 2021, v. , p. 221-234.
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COSTA, T. ; MARCHI, F. A. ; MILANI, C. ; DAMASCENO, J.G. ; ZANARDO, E. A. ; NOVO-FILHO, G. M. ; MONTENEGRO, M. M. ; MADIA, F. A. R. ; DIAS, A. T ; PIAZZON, F. B. ; DUTRA, R. L. ; NASCIMENTO, A. M. ; ROCHA, M. ; KIM, C. A. ; SCHUCH, V. ; MELLO, C. B ; MUSZKAT, M. ; KULIKOWSKI, L. D. . Differential DNA methylation and comparison between boys and girls with ADH. In: European Human Genetics Conference, 2016, Barcelona. European Journal of Human Genetics, 2016. v. 24. p. 363.
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COSTA, T. ; MILANI, C. ; MARCHI, F. A. ; NOVO-FILHO, G. M. ; ZANARDO, E. A. ; MONTENEGRO, M. M. ; MADIA, F. A. R. ; DUTRA, R. L. ; PIAZZON, F. B. ; NASCIMENTO, A. M. ; ROCHA, M. ; VERONESI, M. B. ; KIM, C. A. ; SCHUCH, V. ; MELLO, C. B ; MUSZKAT, M. ; KULIKOWSKI, L. D. . DNA methylation profiles in ADHD: comparison between boys and girls. In: 65th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics (ASHG),, 2015, Baltimore. 65th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics (ASHG), 2015. v. 408F. p. 9.
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COSTA, T. ; MILANI, C. ; MARCHI, F. A. ; MONTENEGRO, M. M. ; NOVO-FILHO, G. M. ; ZANARDO, E. A. ; MADIA, F. A. R. ; DUTRA, R. L. ; DIAS, A. T ; PIAZZON, F. B. ; NASCIMENTO, A. M. ; ROCHA, M. ; KIM, C. A. ; SCHUCH, V. ; MELLO, C. B ; MUSZKAT, M. ; KULIKOWSKI, L. D. . Differential methylation profiles of ten patients disclose the glutamate pathways association with attention deficit hyperactivity disorder. In: European Human Genetics Conference, 2015, Glasgow. European Journal of Human Genetics, 2015. v. 23. p. 467.
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MILANI, C. ; COSTA, T. ; MONTENEGRO, M. ; NOVO-FILHO, G. ; ZANARDO, E. ; DUTRA, R. ; DIAS, A. ; PIAZZON, F. ; NASCIMENTO, A. ; SCHUCH, V. ; MELLO, C. ; MUSZKAT, M. ; KIM, C. ; KULIKOWSKI, L. . DNA methylation profiles of ten patients with Attention Deficit Hyperactivity Disorder: a proof-of-principle study.. In: American Society of Human Genetics 64th Annual Meeting, 2014, San Diego. American Society of Human Genetics 64th Annual Meeting, 2014. p. 14.
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Gomes, E.S. ; Schuch, V, ; Kishi, L.T. ; Giuliatti, S. ; Padilla, G ; Lemos, E.G.M . Estudo 'in silico' de genes envolvidos na produção de policetídeos aromáticos.. In: 26o Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçú. 26o Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011. v. 4. p. 190.
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Schuch, V, ; Lemos, E.G.M . Discovery of genes related to antibiotic biosynthesis into a metagenomic library.. In: The 12th Internacional Symposium on Microbial Ecology ISME 12 Microbial Diversity - Sustaining the blue planet, 2008, Cairns, Austrália. The 12th Internacional Symposium on Microbial Ecology ISME 12 Microbial Diversity - Sustaining the blue planet, 2008.
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Gomes, E.S. ; Schuch, V, ; Lemos, E.G.M . Utilização da metagenoma como ferramenta para prospecção de novos genes envolvidos na biossíntese de antibióticos policetídeos sintetizados pelo sistema PKS tipo II.. In: XX Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2008, São José dos Campos. XX Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2008.
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Campana RA ; NAMUR, J. A. M. ; SCHUCH, V. ; TAKATA, C. S. ; ARAUJO, P. S. ; COSTA, M. H. B. . A simple method to obtain purified Diphtheria toxoid. In: XXXII Reunão Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular,, 2003, Caxambu - SP. Programas e Resumos da XXXII Reunião Anual da SBBq. p. 192-193.
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SCHUCH, V. . System Biology Applied to Human Diseases. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCHUCH, V. . System Biology Applied to Human Diseases. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCHUCH, V. . Systems Biology of Inflammatory Diseases. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCHUCH, V. . O Papel da Bioinformática na Formação do Cientista do Século XXI. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SCHUCH, V. . Importância da Epigenética em Desordens Humanas. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCHUCH, V. . Transtorno de déficit de atenção e hiperatividade sob à luz da epigenética. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCHUCH, V. . 194 dias vivendo o desastre de Mariana - MG - Impactos ambientais e aspectos técnicos. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SCHUCH, V. . ?Desastre Ambientais ? O caso de Mariana?. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Schuch, V, ; Paixão, D.A.A ; Dimitrov, M.R. ; Alves, L.M.C. . Metagenoma: uma abordagem biotecnológica. 2008. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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Schuch, V, . 11 Fórum de Informação Profissional realizado pelo Colégio Visconde de Porto Seguro, na condição de especialista em Biologia - Palestrante Convidada. 2002. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Schuch, V, . 10 Fórum de Informação Profissional realizado pelo Colégio Visconde de Porto Seguro, na condição de Universitária / Biologia - Palestrante Convidada. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Outras produções
ESTON, S. M. ; RIBEIRO, W. C. ; SCHUCH, V. . Complicações: desastre ambiental de Mariana, os impactos ambientais e o modelo de mineração brasileiro.. 2016. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).
SCHUCH, V. . Den giftiga leran dränkte Servulos by. 2016. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
SCHUCH, V. . Desastre ambiental incentiva monitoramento alternativo de ciência aberta. 2016. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
PAVAN, D. ; SCHUCH, V. . 8 meses do desastre de Mariana (MG): ?lucro privado, prejuízo coletivo?. 2016. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
SCHUCH, V. . Grupo de cientistas que conta com 5.000 voluntários coleta amostras do Rio Doce. 2015. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
SCHUCH, V. ; SANTOS, V. . Cientistas e voluntários se reúnem para recuperar o Rio Doce. 2015. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
SCHUCH, V. . Substâncias misturadas à lama contaminada ainda são desconhecidas.. 2015. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
SCHUCH, V. ; Duarte Júnior ; AMORIM, J. ; CARRIL, C. . Desastre de Mariana (MG) - Observatório do Terceiro Setor. 2015. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).
SCHUCH, V. . Primeiros resultados sobre água da bacia do Rio Doce são revelados. 2015. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
SCHUCH, V. . Au Brésil, des vies englouties par la boue.. 2015. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
Schuch, V, . Giaia - Grupo Independente para Avaliação do Impacto Ambiental - Rio Doce. 2015. (Site).
SCHUCH, V. ; DIAS, P. C. G. . Bioinformática. 2019. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
Schuch, V, ; Paixão, D.A.A ; Dimitrov, M.R. ; Alves, L.M.C. . Metagenoma: Uma abordagem biotecnologica.. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
SCHUCH, V. ; ESTON, S. M. ; RIBEIRO, W. C. . Desastre ambiental de Mariana, os impactos ambientais e o modelo de mineração. 2015. Vídeo.
Projetos de pesquisa
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2020 - Atual
MEDICINA EM REDE APLICADA A SAÚDE HUMANA, Descrição: A maioria das doenças humanas envolve redes de interações moleculares e funcionais entre milhares de componentes biológicos. Na última década, o número e a complexidade de conjuntos de dados gerados por experimentos de alto rendimento, quantificando a variação biológica subjacente a várias condições e fenótipos aumentou bastante. Como consequência, temos acesso a uma quantidade imensa de dados ômicos, clínicos, imunológicos e ambientais. Os artigos científicos também se acumulam de forma exponencial. Neste projeto propomos sintetizar os dados disponíveis na literatura biomédica e dados biológicos de expressão gênica associados à doenças humanas, publicamente disponíveis, utilizando a Medicina em Rede, para desvendar os programas reguladores da transcrição subjacentes aos fenótipos e propor estratégias de reposicionamento de medicamentos. A análise e integração destas informações são fundamentais para melhorar nosso entendimento sobre a fisiopatologia das doenças, sua transmissão, assim como seu diagnóstico e tratamento. Os resultados obtidos irão revelar novos genes consistentemente expressos que podem ser potenciais alvos de medicamentos. Além disso, utilizaremos as redes de conhecimento baseadas na literatura biomédica para propor estratégias de reposicionamento de drogas, diminuindo o custo e o tempo para que a pesquisa gere benefícios diretos para os pacientes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Viviane Schuch - Integrante / Helder Imoto Nakaya - Coordenador.
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2018 - 2020
Regulação epigenética de RNAs não codificadores longos no contexto de infecções, Descrição: Epigenética estuda as modificações potencialmente hereditárias que modulam a expressão dos genes sem alterar a sequência de nucleotídeos do DNA. Os mecanismos epigenéticos estão intimamente envolvidos na execução de programas genômicos fundamentais, sendo bastante estudados em imunologia para entender os mecanismos de diferenciação de células e resposta imune. Longos RNAs não codificadores (lncRNAs) possuem um papel fundamental na regulação epigenética e diversos deles têm sido descritos recentemente. No entanto, ainda não existem estudos sistemáticos que investigam como os lncRNAs são regulados epigeneticamente no contexto da imunologia. A maioria dos estudos que utilizam técnicas de larga-escala, como microarrays e sequenciamento de nova geração (RNA-seq), tem como objetivo principal monitorar a expressão dos genes codificadores de proteína. Porém, muitos destes dados, não explorados nas publicações originais, são provenientes de lncRNAs. O objetivo deste projeto é utilizar dados de epigenética e transcritômica disponíveis em bancos de dados públicos e aplicar ferramentas de bioinformática e biologia de sistemas na reanálise e integração de dados de epigenética e transcritômica (microarrays e RNA-seq) para identificar lncRNAs possivelmente envolvidos na regulação epigenética das respostas imunes induzidas por infecção.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Viviane Schuch - Integrante / Helder Imoto Nakaya - Coordenador.
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2013 - Atual
Desregulação Emocional Grave em Crianças e Adolescentes com TDAH: Estudo multidimensional dos fatores ambientais, neuropsicológicos e epigenéticos., Descrição: O objetivo deste trabalho é avaliar o perfil de metilação do genoma, a presença de variáveis ambientais e perfis endofenotípicos de risco em crianças e adolescentes com diagnóstico de transtorno de déficit de atenção/hiperatividade (TDAH).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Viviane Schuch - Integrante / Mauro Muszkat - Coordenador / Leslie Kulikowski - Integrante / Thaís Moura - Integrante.
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2010 - 2011
Análise "in silico" de um novo cluster de PKS II metagenômico, Descrição: As PKSs tipo II são complexos enzimáticos envolvidos na produção de policetídeos. Estes são metabólitos secundários que possuem papel-chave no desencadeamento das respostas bioquímicas que levam à diversificação fisiológica frente a fatores adversos, fazem parte da composição de pigmentos de esporos microbianos, além de comporem a estrutura química de importantes antibióticos explorados pela indústria farmacêutica. Foi feita a prospecção de novos clusters gênicos para PKSs tipo II em uma biblioteca metagenômica de 9.320 clones, através de amplificação por PCR com primers degenerados para uma região gênica conservada. Dentre três clones encontrados, um foi sequenciado pela estratégia de shotgun, resultando em um consensus de 22.988 pares de bases. Foi feita a predição funcional de ORFs por homologia obtida com a ferramenta Blast (NCBI) e também a identificação de domínios enzimáticos pelo PRODOM e PFAM. Dentre os resultados da predição por homologia de domínios enzimáticos foi possível identificar ORFs homologas à: reguladores gênicos (LacI e LuxR); carboidrases (Lacases, -glucosidases, Quitinases/Celulases); transferases (O-metil-transferases, Acíl-transferases); pks mínima; ciclases, aromatases, hidroxilases, mono-oxigenases e transportadores ABC. Alguns clusters enzimáticos podem ainda atuar em degradação de celulose e lignina. As enzimas candidatas ao core biossíntético do cluster (pks mínima) foram submetidas à modelagem de estrutura tridimensional in silico. Os modelos 3D foram avaliados quanto a acurácia, utilizando as ferramentas: Verify3D, Qmean, Procheck, Rampage e Swiss-Model. Uma vez validados, as KSA e CLF foram submetidas a simulações de docking enzimático.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Viviane Schuch - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Coordenador / Elisangela Soares Gomes - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
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2007 - 2011
Isolamento e caracterização de consórcios microbianos degradadores de hidrocarboneto e prospecção de genes em bibliotecas metagenômicas Convênio Brasil - Espanha (CAPES/DGU), Descrição: Esse projeto de cooperação com a Universitat de Barcelona (ESP) teve como objetivo isolar e caracterizar consórcios microbianos degradadores de hidrocarbonetos e prospectar de genes de interesse biotecnológico em bibliotecas metagenomicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Viviane Schuch - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Coordenador / Lúcia Maria Carareto Alves - Integrante / Teresa Cristina L Castellane - Integrante / Silvana Pompeia do Val Moraes - Integrante / Karla Stropa - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação.
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2007 - 2011
Prospecção e caracterização de novos genes de xilose isomerase, Descrição: A enzima xilose isomerase catalisa a isomerização reversível da D-xilose a D-xilulose e a conversão de D-glicose para D-frutose. Possui imensa importância biotecnológica, pois é utilizada na produção de frutose a partir de amido e na fermentação de etanol para produção de biocombustível. Neste trabalho foi realizada a prospecção de novos genes de xilose isomerase em bibliotecas metagenômicas e em linhagens de Burkholderia através da técnica de reação em cadeia da polimerase. Não foi possível recuperar genes oriundos das bibliotecas metagenômicas. Das treze linhagens de Burkholderia testadas, seis apresentaram amplificação positiva para o gene de xilose isomerase. Os genes foram completamente sequenciados e as sequências foram utilizadas em análises computacionais, que permitiram estabelecer a identidade entre as sequências e a dedução da função das proteínas baseado em similaridades. Foi realizada a medida do índice de adaptação de códons, com a finalidade de se encontrar um hospedeiro onde a expressão seja maximizada, baseando-se na presença de códons preferenciais e raros. Está análise mostrou que os genes encontrados possuem boas possibilidades de expressão em Escherichia coli, mas que podem apresentar uma taxa de expressão ineficiente em Saccharomyces cerevisiae. Foi realizado um teste de complementação gênica utilizando um dos genes descobertos e uma linhagem de Escherichia coli que possui o gene de xilose isomerase nocauteado. Os transformantes foram capazes de crescer em meio cuja única fonte de carbono era o açúcar xilose, mostrando que o gene é funcional. Estes genes serão utilizados futuramente em ensaios de expressão para caracterização da enzima.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Viviane Schuch - Coordenador / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
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2007 - 2009
Prospecção, análise e expressão de genes de importância biotecnológica em bibliotecas metagenômicas., Descrição: A equipe do Laboratório de Bioquímica de Microrganismos e Plantas da FCAV - UNESP construiu uma biblioteca metagenômica em vetor cosmídeo com aproximadamente 9500 clones. Esta biblioteca foi utilizada para prospecção de genes de importância biotecnológica, incluindo policetídeo-sintases, poli-hidroxibutirato desidrogenases, lipases e lipoxigenases. Para a prospecção, foram utilizadas as técnicas de PCR, microarranjos, macroarranjos e ensaios bioquímicos. A sub-clonagem dos cosmídeos selecionados permitiu o isolamento e seqüenciamento dos genes de interesse.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Viviane Schuch - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Coordenador / Douglas Antonio Alvaredo Paixão - Integrante / Maurício Rocha Dimitrov - Integrante / Elisangela Soares Gomes - Integrante / Mariana Rangel - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
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2004 - 2008
Prospecção de genes de biossintese de antibioticos através da abordagem metagenômica, Descrição: A proposta geral deste projeto foi construir uma biblioteca metagenômica de solo de Mata Atlântica e a prospectar genes envolvidos na biossíntese de antibióticos sintetizados pelo sistema PKS (policetídeo sintase).Para obtenção de DNA metagenômico, amostras de solo foram coletadas em duas regiões: no Parque Estadual de Ilha Bela ? SP e no Arboreto de Eucaliptos do Campus da UNESP de Jaboticabal ? SP. Uma biblioteca feita com DNA metagenômico de alto peso molecular foi obtida. A biblioteca possui 9.320 clones e foi construída em vetor cosmídeo, e o tamanho médio dos insertos era 30 kb. A avaliação da presença de genes envolvidos na biossíntese antibióticos sintetizados pelo sistema enzimático PKS do tipo I foi realizada através da amplificação por PCR dos clones da biblioteca utilizando-se oligonucleotídeos iniciadores degenerados específicos. Inicialmente, os clones da biblioteca foram prospectados em pools de 96 clones, sendo que 15 apresentaram amplificação positiva. Os pools selecionados foram desmembrados e 5 produtos de PCR foram obtidos a partir de clones individuais. Um dos cosmídeos selecionados foi subclonado e totalmente seqüenciado, gerando um contig de 29.6 kb. Após o sequenciamento, os dados brutos dos eletroferogramas de seqüências de DNA foram analisados pelo programa PhredPhrap e Consed a fim de gerar seqüências FASTA e avaliar a qualidade e alinhamento das mesmas. A anotação dos genes encontrados foi realizada de forma manual com a utilização do programa Artemis, que também determinou, além das possíveis ORFs, conteúdo de bases CG. As seqüências FASTA foram submetidas ao banco de genes do National Center for Biotechnolgy Information (NCBI) (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST), através do programa BLASTP, para comparação com seqüências homólogas de proteínas depositadas no banco de dados.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Viviane Schuch - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Coordenador / Elisangela Soares Gomes - Integrante / Gabriel Padilla - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Prêmios
2018
PREMIO ABRIL & DASA DE INOVAÇÃO MÉDICA, EDITORA ABRIL.
2018
Prêmio Melhor Poster, ISCB-LA SOIBIO EMBnet.
Histórico profissional
Endereço profissional
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Universidade de São Paulo, Faculdade de Ciências Farmacêuticas. , Avenida Professor Lineu Prestes, 580, Butantã, 05508000 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30913674, URL da Homepage:
Experiência profissional
2020 - Atual
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2018 - 2020
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2003 - 2004
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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02/2018
Pesquisa e desenvolvimento, Faculdade de Ciências Farmacêuticas.,Linhas de pesquisa
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03/2003 - 03/2004
Estágios , Instituto de Ciências Biomédicas.,Estágio realizado, Laboratório de Genética de Streptomyces, sob orientação do Prof. Dr. Gabriel Padilla.
2013 - 2017
Universidade Federal de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Cientista, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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08/2013
Pesquisa e desenvolvimento, Campus Guarulhos.,Linhas de pesquisa
2004 - 2011
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita FilhoVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Cientista, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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03/2004 - 07/2011
Pesquisa e desenvolvimento, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal.,Linhas de pesquisa
1999 - 2000
Clariant S. A.Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Tecnica de labotatório, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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07/1999 - 03/2000
Serviços técnicos especializados , Laboratório de Microbiologia, Departamento de Surfactantes.,Serviço realizado, Responsável por análises microbiológicas de surfactantes, tais como plaqueamento, "challenge tests", biodegradabilidade, controle de qualidade de matérias primas e atendimento a clientes e vendedores, bem como todas as demais atividades rotineiras.
2001 - 2002
Colégio Visconde de Porto SeguroVínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Tecnica de laboratório, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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01/2001 - 06/2002
Ensino,,Disciplinas ministradas, Aulas práticas de biologia e ciências.
2015 - 2015
Centro Universitário SenacVínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Docente, Carga horária: 16
Outras informações:
Aulas de microbiologia e biossegurança para alunos dos cursos de estética e podologia.
2005 - 2005
E.E.P.G Núcleo Educacional "Jose Paulino"Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor de Ciências, Carga horária: 20
Atividades
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03/1995 - 12/1995
Ensino,,Disciplinas ministradas, Ciências
2013 - 2013
Instituto LumiarVínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 4
Atividades
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02/2013 - 04/2013
Ensino,,Disciplinas ministradas, Ciências
2000 - 2000
Companhia de Transmissão de Energia Elétrica PaulistaVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiária, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Estagiária Nivel Universitário, atuando na Assessoria de Meio Ambiente.
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de Viviane Schuch e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Criando um monitoramento
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Confirma a exclusão?