Fabiana Rodrigues de Góes
Possui graduação e mestrado em Ciência da Computação pela Universidade Federal do Pará (UFPA). Obteve o título de doutora pelo Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação da Universidade de São Paulo (ICMC-USP) em 2022. Realizou estágio de doutoramento na Universidade Dalhousie, Canadá, sob a supervisão do Prof. Dr. Evangelos Milios (2019). Atua na área de Inteligência Artificial e Aprendizado de Máquina, principalmente em problemas relacionados a análise e mineração de redes complexas, e tem interesse em aplicações biomédicas.
Informações coletadas do Lattes em 29/01/2026
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Ciências da Computação e Matemática Computacional
2016 - 2022
Universidade de São Paulo
Título: Mineração de redes complexas k-partidas
Orientador: Alneu de Andrade Lopes
com Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Mestrado em Ciência da Computação
2014 - 2016
Universidade Federal do Pará
Título: GeneFinder-MG: Um pipeline para a predição de genes em dados metagenômicos
, Ano de Obtenção: 2016.Ronnie Cley de Oliveira Alves.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Bioinformática.
Graduação em Ciência da Computação
2009 - 2013
Universidade Federal do Pará
Título: Um Pipeline para Predição de Genes em Experimentos Metagenômicos
Orientador: Ronnie Cley de Oliveira Alves
Pós-doutorado
2024
Pós-Doutorado. , Rosalind Franklin Institute, RFI, Inglaterra.
2023 - 2024
Pós-Doutorado. , Universidade Tecnológica Federal do Paraná, UTFPR, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico, FAADCT/PR, Brasil.
Formação complementar
2015 - 2015
Current methodologies in transcriptome analysis. (Carga horária: 3h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
2010 - 2010
Manutenção de microcomputadores. (Carga horária: 32h). , Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
2010 - 2010
Programação em JAVA. (Carga horária: 30h). , Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
2010 - 2010
PHP e MySql. (Carga horária: 32h). , Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Aprendizado de Máquina.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Bioinformática.
Participação em eventos
International Conference on Language Resources and Evaluation (LREC). HateBR: A large expert annotated corpus of Brazilian instagram comments for offensive language and hate speech detection. 2022. (Congresso).
13th International Conference on Recent Advances in Natural Language Processing (RANLP). 2021. (Congresso).
X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics. 2015. (Simpósio).
Brazilian Symposium on Bioinformatics.Towards an Ensemble Learning Strategy for Metagenomic Gene Prediction. 2014. (Simpósio).
BIOINFORMATICS WORKSHOP: Big data handling, integration and analysis in data-rich Life Sciences. 2013. (Outra).
Congresso Internacional de Software Livre e Governo Eletrônico. 2012. (Congresso).
Encontro da Qualidade e Produtividade em Software - EQPS. 2012. (Encontro).
II Fórum Brasil-Amazônia de TIC. 2012. (Outra).
XII Escola Regional de Informática Norte - ERN. 2012. (Outra).
XXXI Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2011. (Congresso).
IX Simpósio Brasileiro de Qualidade de Software. 2010. (Simpósio).
Participação em bancas
GOES, FABIANA; PONTI, M. A.. Desenvolvimento de Sistema de Informação para Auxílio da Qualidade de Fornecedores. 2022 - Universidade de São Paulo.
GOES, FABIANA; CERVATI NETO, A.. Desenvolvimento e experimentação para a melhoria da Experiência do Usuário em Comércio Eletrônico. 2022 - Universidade de São Paulo.
LOPES, A. A.;GÓES, F. R.. Estágio em Gerenciamento de Tecnologias de Informação e Comunicação. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências de Computação) - Universidade de São Paulo.
TOLEDO, C. F. M.;GÓES, F. R.. Variations of Deep Learning for Cancer Diagnosis Using Gene Expression Data. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade de São Paulo.
Guessi Margarido, M.;GÓES, F. R.. Big Data Aplicado ao Marketing Digital. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.
MANZATO, M. G.;GÓES, F. R.. Estágio de Tech and Automation em Business Intelligence. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo.
Produções bibliográficas
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SILVA, RAÍSSA ; PADOVANI, KLEBER ; GÓES, FABIANA ; ALVES, RONNIE . geneRFinder: gene finding in distinct metagenomic data complexities. BMC BIOINFORMATICS , v. 22, p. 87, 2021.
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FERREIRA, ROUMAYNE L. ; REZENDE, GRAZIELA S. ; DAMAS, MARCELO SILVA FOLHAS ; OLIVEIRA-SILVA, MARIANA ; PITONDO-SILVA, ANDRÉ ; BRITO, MÁRCIA C. A. ; LEONARDECZ, EDUARDO ; GÓES, FABIANA R. DE ; CAMPANINI, EMELINE BONI ; MALAVAZI, IRAN ; DA CUNHA, ANDERSON F. ; PRANCHEVICIUS, MARIA-CRISTINA DA SILVA . Characterization of KPC-Producing Serratia marcescens in an Intensive Care Unit of a Brazilian Tertiary Hospital. Frontiers in Microbiology , v. 11, p. 1, 2020.
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VALEJO, ALAN ; GÓES, FABIANA ; ROMANETTO, LUZIA ; FERREIRA DE OLIVEIRA, MARIA CRISTINA ; DE ANDRADE LOPES, ALNEU . A benchmarking tool for the generation of bipartite network models with overlapping communities. KNOWLEDGE AND INFORMATION SYSTEMS , v. 36, p. 3, 2019.
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VARGAS, F. A. ; CARVALHO, I. ; GOES, FABIANA ; PARDO, T. A. S. ; BENEVENUTO, F. . HateBR: A large expert annotated corpus of Brazilian instagram comments for offensive language and hate speech detection. In: 13th International Conference on Language Resources and Evaluation, 2022, Marselha. Proceedings of the 13th International Conference on Language Resources and Evaluation (LREC 2022). Marselha, 2022. p. 7174-7183.
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VARGAS, FRANCIELLE ; GÓES, FABIANA ; CARVALHO, ISABELLE ; BENEVENUTO, FABRÍCIO ; A. S. PARDO, THIAGO . Contextual-Lexicon Approach for Abusive Language Detection. In: International Conference Recent Advances in Natural Language Processing, 2021. Proceedings of the Conference Recent Advances in Natural Language Processing - Deep Learning for Natural Language Processing Methods and Applications. p. 1438-1451.
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SILVA, RAISSA ; PADOVANI, KLEBER ; GOES, FABIANA ; CLEY ALVES, RONNIE . A Random Forest Classifier for Prokaryotes Gene Prediction. In: 2019 8th Brazilian Conference on Intelligent Systems (BRACIS), 2019, Salvador. 2019 8th Brazilian Conference on Intelligent Systems (BRACIS), 2019. p. 545.
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GÓES, F. R. ; ALVES, R. ; CORREA, L. H. S. ; CHAPARRO, C. ; THOM, L. H. . Towards an Ensemble Learning Strategy for Metagenomic Gene Prediction. In: 9th Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB), 2014, Belo Horizonte. Advances in Bioinformatics and Computational Biology (LNCS). New York: Springer International Publishing, 2014. v. 8826. p. 17-24.
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GÓES, F. R. ; ALVES, R. ; CORREA, L. H. S. ; CHAPARRO, C. ; THOM, L. H. . A Comparison of Classification Methods for Gene Prediction in Metagenomics. In: Third Workshop Workshop on New Frontiers in Mining Complex Patterns, 2014, Nancy. Proceedings of the 3rd Workshop on New Frontiers in Mining Complex Patterns , 2014. p. 136-147.
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CORREA, L. H. S. ; ALVES, R. ; GÓES, F. R. ; CHAPARRO, C. ; THOM, L. H. . A Pipeline for Functional and Visual Analytics of Microbial Genetic Networks. In: 2nd International Workshop on Dynamic Networks and Knowledge Discovery, 2014, Nancy. Proceedings of the 2nd International Workshop on Dynamic Networks and Knowledge Discovery, 2014. p. 13-24.
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CORREA, L. H. S. ; ALVES, R. ; GÓES, F. R. ; CHAPARRO, C. ; THOM, L. H. . FUNN-MG: A Metagenomic Systems Biology Computational Framework. In: 9th Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB), 2014, Belo Horizonte. Advances in Bioinformatics and Computational Biology (LNCS). New York: Springer International Publishing, 2014. v. 8826. p. 25-32.
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GOES, FABIANA . Feature extraction based on Complex Networks for classification of genomic sequences. In: 3rd Women in Bioinformatics & Data Science LA Conference, 2022. Women in Bioinformatics & Data Science LA Conference.
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CORREA, L. H. S. ; GÓES, F. R. ; ALVES, A. ; ALVES, R. . Functional network-oriented analysis of environmental metagenomics data. In: 3ème Colloque de Génomique Environnementale (GE2015), 2015, Montpellier. 3ème Colloque de Génomique Environnementale, 2015.
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VARGAS, F. A. ; CARVALHO, I. ; GOES, FABIANA ; PARDO, T. A. S. ; BENEVENUTO, F. . HateBR: A large expert annotated corpus of Brazilian instagram comments for offensive language and hate speech detection. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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GOES, FABIANA . Feature extraction based on Complex Networks for classification of genomic sequences. 2022. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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GOES, FABIANA ; CORREA, L. H. S. ; CHAPARRO, C. ; THOM, L. H. ; ALVES, R. . Towards an Ensemble Learning Strategy for Metagenomic Gene Prediction. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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GÓES, F. R. ; KARMAKAR, A. . Representation Learning and Feature Engineering for Genomic Sequences. 2025. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
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GÓES, F. R. ; KARMAKAR, A. . LLMs in genomics: decoding genomic sequences. 2025. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
Projetos de pesquisa
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2013 - 2015
BioFLows: Modelagem computacional para a descoberta de padrões e tendências em dados experimentais gerados em estudos metagenômicos, Descrição: Descrição: Este projeto está centrado na definição de meta-modelos de processos meta-genômicos e para o desenvolvimento de novas estratégias de mineração de dados que permitam a exploração sistemática dos dados gerados nestes experimentos ômicos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Fabiana Rodrigues de Góes - Integrante / Ronnie Cley de Oliveira Alves - Coordenador / Leandro Henrique Santos Corrêa - Integrante / Cristian Andres Chaparro Egana - Integrante / Lucinéia Heloisa Thom - Integrante / Nelson Monte de Carvalho Filho - Integrante / Hajo Reijers - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 5
Histórico profissional
Experiência profissional
2023 - 2023
Universidade de São PauloVínculo: Outros, Enquadramento Funcional: Professor Contratado, Carga horária: 12
Outras informações:
Docente contratada por tempo determinado para ministrar as disciplinas de:- Introdução à Programação para Engenharias- Teoria da Computação e Compiladores
2022 - 2022
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Tutor, Carga horária: 8
Outras informações:
Tutora da disciplina Redes Complexas para Computação na primeira edição do MBA em Inteligência Artificial e Big Data, realizado pelo Departamento de Ciências de Computação do Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação da Universidade de São Paulo.
2015 - 2015
Faculdades Integradas IPIRANGAVínculo: Contratado, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 16
Outras informações:
Professora contratada para atuar no PRONATEC (Programa Nacional de acesso ao Ensino Técnico e Emprego), lecionando nas disciplinas de Aplicações para Web I, Aplicações para Web II e Segurança da Informação.
2015 - 2015
Faculdades Integradas IPIRANGAVínculo: Contratado, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 12
Outras informações:
Professora contratada para atuar no PRONATEC (Programa Nacional de acesso ao Ensino Técnico e Emprego), lecionando na disciplina de Programação para Servidores Web.
2013 - 2014
Sistema de Proteção da AmazôniaVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor de sistemas de software, Carga horária: 20
Outras informações:
Pesquisa realizada no projeto: Análise de desempenho e escalabilidade de aplicações geográficas distribuídas desenvolvidas com EJB.
2010 - 2012
PRÓ-REITORIA DE ENSINO E GRADUAÇÃOVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor de sistemas de software, Carga horária: 20
Outras informações:
Atuação na equipe desenvolvimento de diversos sistemas Web, destinados para algumas das Pró-Reitorias da UFPA. Participação no desempenho de atividades relacionadas a gerência dos projetos de software desenvolvidos na PROEG, com a utilização da metodologia SCRUM e de práticas da metodologia XP.
2012 - 2013
Centro de Tecnologia da Informação e ComunicaçãoVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor de sistemas de software, Carga horária: 20
Outras informações:
Atuação na equipe de desenvolvimento de sistema Web com a utilização de JEE e MySql. Desempenho de atividades de Engenharia de Software como: elicitação de requisitos e elaboração do modelo de análise e projeto do sistema.
2013 - 2016
Universidade Federal do ParáVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista Capes nível mestrado, Regime: Dedicação exclusiva.
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