Fabiana Rodrigues de Góes

Possui graduação e mestrado em Ciência da Computação pela Universidade Federal do Pará (UFPA). Obteve o título de doutora pelo Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação da Universidade de São Paulo (ICMC-USP) em 2022. Realizou estágio de doutoramento na Universidade Dalhousie, Canadá, sob a supervisão do Prof. Dr. Evangelos Milios (2019). Atua na área de Inteligência Artificial e Aprendizado de Máquina, principalmente em problemas relacionados a análise e mineração de redes complexas, e tem interesse em aplicações biomédicas.

Informações coletadas do Lattes em 29/01/2026

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciências da Computação e Matemática Computacional

2016 - 2022

Universidade de São Paulo
Título: Mineração de redes complexas k-partidas
Orientador: Alneu de Andrade Lopes
com Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Mestrado em Ciência da Computação

2014 - 2016

Universidade Federal do Pará
Título: GeneFinder-MG: Um pipeline para a predição de genes em dados metagenômicos
, Ano de Obtenção: 2016.Ronnie Cley de Oliveira Alves.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Bioinformática.

Graduação em Ciência da Computação

2009 - 2013

Universidade Federal do Pará
Título: Um Pipeline para Predição de Genes em Experimentos Metagenômicos
Orientador: Ronnie Cley de Oliveira Alves

Pós-doutorado

2024

Pós-Doutorado. , Rosalind Franklin Institute, RFI, Inglaterra.

2023 - 2024

Pós-Doutorado. , Universidade Tecnológica Federal do Paraná, UTFPR, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico, FAADCT/PR, Brasil.

Formação complementar

2015 - 2015

Current methodologies in transcriptome analysis. (Carga horária: 3h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2010 - 2010

Manutenção de microcomputadores. (Carga horária: 32h). , Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.

2010 - 2010

Programação em JAVA. (Carga horária: 30h). , Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.

2010 - 2010

PHP e MySql. (Carga horária: 32h). , Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Aprendizado de Máquina.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Bioinformática.

Participação em eventos

International Conference on Language Resources and Evaluation (LREC). HateBR: A large expert annotated corpus of Brazilian instagram comments for offensive language and hate speech detection. 2022. (Congresso).

13th International Conference on Recent Advances in Natural Language Processing (RANLP). 2021. (Congresso).

X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics. 2015. (Simpósio).

Brazilian Symposium on Bioinformatics.Towards an Ensemble Learning Strategy for Metagenomic Gene Prediction. 2014. (Simpósio).

BIOINFORMATICS WORKSHOP: Big data handling, integration and analysis in data-rich Life Sciences. 2013. (Outra).

Congresso Internacional de Software Livre e Governo Eletrônico. 2012. (Congresso).

Encontro da Qualidade e Produtividade em Software - EQPS. 2012. (Encontro).

II Fórum Brasil-Amazônia de TIC. 2012. (Outra).

XII Escola Regional de Informática Norte - ERN. 2012. (Outra).

XXXI Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2011. (Congresso).

IX Simpósio Brasileiro de Qualidade de Software. 2010. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: Rodrigo Anes Sena de Araujo

GOES, FABIANA; PONTI, M. A.. Desenvolvimento de Sistema de Informação para Auxílio da Qualidade de Fornecedores. 2022 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Henrique Hiram Libutti Nunez

GOES, FABIANA; CERVATI NETO, A.. Desenvolvimento e experimentação para a melhoria da Experiência do Usuário em Comércio Eletrônico. 2022 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Oscar Cardoso de Lima Neto

LOPES, A. A.;GÓES, F. R.. Estágio em Gerenciamento de Tecnologias de Informação e Comunicação. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências de Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Henrique de Almeida Machado da Silveira

TOLEDO, C. F. M.;GÓES, F. R.. Variations of Deep Learning for Cancer Diagnosis Using Gene Expression Data. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Caio Ferraresi Ananias

Guessi Margarido, M.;GÓES, F. R.. Big Data Aplicado ao Marketing Digital. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Yuri Toledo Neves

MANZATO, M. G.;GÓES, F. R.. Estágio de Tech and Automation em Business Intelligence. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo.

Produções bibliográficas

  • SILVA, RAÍSSA ; PADOVANI, KLEBER ; GÓES, FABIANA ; ALVES, RONNIE . geneRFinder: gene finding in distinct metagenomic data complexities. BMC BIOINFORMATICS , v. 22, p. 87, 2021.

  • FERREIRA, ROUMAYNE L. ; REZENDE, GRAZIELA S. ; DAMAS, MARCELO SILVA FOLHAS ; OLIVEIRA-SILVA, MARIANA ; PITONDO-SILVA, ANDRÉ ; BRITO, MÁRCIA C. A. ; LEONARDECZ, EDUARDO ; GÓES, FABIANA R. DE ; CAMPANINI, EMELINE BONI ; MALAVAZI, IRAN ; DA CUNHA, ANDERSON F. ; PRANCHEVICIUS, MARIA-CRISTINA DA SILVA . Characterization of KPC-Producing Serratia marcescens in an Intensive Care Unit of a Brazilian Tertiary Hospital. Frontiers in Microbiology , v. 11, p. 1, 2020.

  • VALEJO, ALAN ; GÓES, FABIANA ; ROMANETTO, LUZIA ; FERREIRA DE OLIVEIRA, MARIA CRISTINA ; DE ANDRADE LOPES, ALNEU . A benchmarking tool for the generation of bipartite network models with overlapping communities. KNOWLEDGE AND INFORMATION SYSTEMS , v. 36, p. 3, 2019.

  • VARGAS, F. A. ; CARVALHO, I. ; GOES, FABIANA ; PARDO, T. A. S. ; BENEVENUTO, F. . HateBR: A large expert annotated corpus of Brazilian instagram comments for offensive language and hate speech detection. In: 13th International Conference on Language Resources and Evaluation, 2022, Marselha. Proceedings of the 13th International Conference on Language Resources and Evaluation (LREC 2022). Marselha, 2022. p. 7174-7183.

  • VARGAS, FRANCIELLE ; GÓES, FABIANA ; CARVALHO, ISABELLE ; BENEVENUTO, FABRÍCIO ; A. S. PARDO, THIAGO . Contextual-Lexicon Approach for Abusive Language Detection. In: International Conference Recent Advances in Natural Language Processing, 2021. Proceedings of the Conference Recent Advances in Natural Language Processing - Deep Learning for Natural Language Processing Methods and Applications. p. 1438-1451.

  • SILVA, RAISSA ; PADOVANI, KLEBER ; GOES, FABIANA ; CLEY ALVES, RONNIE . A Random Forest Classifier for Prokaryotes Gene Prediction. In: 2019 8th Brazilian Conference on Intelligent Systems (BRACIS), 2019, Salvador. 2019 8th Brazilian Conference on Intelligent Systems (BRACIS), 2019. p. 545.

  • GÓES, F. R. ; ALVES, R. ; CORREA, L. H. S. ; CHAPARRO, C. ; THOM, L. H. . Towards an Ensemble Learning Strategy for Metagenomic Gene Prediction. In: 9th Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB), 2014, Belo Horizonte. Advances in Bioinformatics and Computational Biology (LNCS). New York: Springer International Publishing, 2014. v. 8826. p. 17-24.

  • GÓES, F. R. ; ALVES, R. ; CORREA, L. H. S. ; CHAPARRO, C. ; THOM, L. H. . A Comparison of Classification Methods for Gene Prediction in Metagenomics. In: Third Workshop Workshop on New Frontiers in Mining Complex Patterns, 2014, Nancy. Proceedings of the 3rd Workshop on New Frontiers in Mining Complex Patterns , 2014. p. 136-147.

  • CORREA, L. H. S. ; ALVES, R. ; GÓES, F. R. ; CHAPARRO, C. ; THOM, L. H. . A Pipeline for Functional and Visual Analytics of Microbial Genetic Networks. In: 2nd International Workshop on Dynamic Networks and Knowledge Discovery, 2014, Nancy. Proceedings of the 2nd International Workshop on Dynamic Networks and Knowledge Discovery, 2014. p. 13-24.

  • CORREA, L. H. S. ; ALVES, R. ; GÓES, F. R. ; CHAPARRO, C. ; THOM, L. H. . FUNN-MG: A Metagenomic Systems Biology Computational Framework. In: 9th Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB), 2014, Belo Horizonte. Advances in Bioinformatics and Computational Biology (LNCS). New York: Springer International Publishing, 2014. v. 8826. p. 25-32.

  • GOES, FABIANA . Feature extraction based on Complex Networks for classification of genomic sequences. In: 3rd Women in Bioinformatics & Data Science LA Conference, 2022. Women in Bioinformatics & Data Science LA Conference.

  • CORREA, L. H. S. ; GÓES, F. R. ; ALVES, A. ; ALVES, R. . Functional network-oriented analysis of environmental metagenomics data. In: 3ème Colloque de Génomique Environnementale (GE2015), 2015, Montpellier. 3ème Colloque de Génomique Environnementale, 2015.

  • VARGAS, F. A. ; CARVALHO, I. ; GOES, FABIANA ; PARDO, T. A. S. ; BENEVENUTO, F. . HateBR: A large expert annotated corpus of Brazilian instagram comments for offensive language and hate speech detection. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • GOES, FABIANA . Feature extraction based on Complex Networks for classification of genomic sequences. 2022. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • GOES, FABIANA ; CORREA, L. H. S. ; CHAPARRO, C. ; THOM, L. H. ; ALVES, R. . Towards an Ensemble Learning Strategy for Metagenomic Gene Prediction. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • GÓES, F. R. ; KARMAKAR, A. . Representation Learning and Feature Engineering for Genomic Sequences. 2025. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

  • GÓES, F. R. ; KARMAKAR, A. . LLMs in genomics: decoding genomic sequences. 2025. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

  • 2013 - 2015

    BioFLows: Modelagem computacional para a descoberta de padrões e tendências em dados experimentais gerados em estudos metagenômicos, Descrição: Descrição: Este projeto está centrado na definição de meta-modelos de processos meta-genômicos e para o desenvolvimento de novas estratégias de mineração de dados que permitam a exploração sistemática dos dados gerados nestes experimentos ômicos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Fabiana Rodrigues de Góes - Integrante / Ronnie Cley de Oliveira Alves - Coordenador / Leandro Henrique Santos Corrêa - Integrante / Cristian Andres Chaparro Egana - Integrante / Lucinéia Heloisa Thom - Integrante / Nelson Monte de Carvalho Filho - Integrante / Hajo Reijers - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 5

Histórico profissional

Experiência profissional

2020 - Atual

VISIBILIA

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Cientista de Dados

2023 - 2023

Universidade de São Paulo

Vínculo: Outros, Enquadramento Funcional: Professor Contratado, Carga horária: 12

Outras informações:
Docente contratada por tempo determinado para ministrar as disciplinas de:- Introdução à Programação para Engenharias- Teoria da Computação e Compiladores

2022 - 2022

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Tutor, Carga horária: 8

Outras informações:
Tutora da disciplina Redes Complexas para Computação na primeira edição do MBA em Inteligência Artificial e Big Data, realizado pelo Departamento de Ciências de Computação do Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação da Universidade de São Paulo.

2015 - 2015

Faculdades Integradas IPIRANGA

Vínculo: Contratado, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 16

Outras informações:
Professora contratada para atuar no PRONATEC (Programa Nacional de acesso ao Ensino Técnico e Emprego), lecionando nas disciplinas de Aplicações para Web I, Aplicações para Web II e Segurança da Informação.

2015 - 2015

Faculdades Integradas IPIRANGA

Vínculo: Contratado, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 12

Outras informações:
Professora contratada para atuar no PRONATEC (Programa Nacional de acesso ao Ensino Técnico e Emprego), lecionando na disciplina de Programação para Servidores Web.

2013 - 2014

Sistema de Proteção da Amazônia

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor de sistemas de software, Carga horária: 20

Outras informações:
Pesquisa realizada no projeto: Análise de desempenho e escalabilidade de aplicações geográficas distribuídas desenvolvidas com EJB.

2010 - 2012

PRÓ-REITORIA DE ENSINO E GRADUAÇÃO

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor de sistemas de software, Carga horária: 20

Outras informações:
Atuação na equipe desenvolvimento de diversos sistemas Web, destinados para algumas das Pró-Reitorias da UFPA. Participação no desempenho de atividades relacionadas a gerência dos projetos de software desenvolvidos na PROEG, com a utilização da metodologia SCRUM e de práticas da metodologia XP.

2012 - 2013

Centro de Tecnologia da Informação e Comunicação

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor de sistemas de software, Carga horária: 20

Outras informações:
Atuação na equipe de desenvolvimento de sistema Web com a utilização de JEE e MySql. Desempenho de atividades de Engenharia de Software como: elicitação de requisitos e elaboração do modelo de análise e projeto do sistema.

2013 - 2016

Universidade Federal do Pará

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista Capes nível mestrado, Regime: Dedicação exclusiva.