Paulo Mascarello Bisch

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Produções bibliográficas

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• CHEN, W. ; PRAZERES, G. M. P. ; PASCUTTI, P. G. ; BISCH, P. M. . Modelagem Molecular de Proteinas Formadoras de Poros Em Biomembranas. In: XI FESBE, 1996. CAXAMBU, MG.

• RIBEIRO, S. J. M. ; HILL, C. E. M. ; PASCUTTI, P. G. ; BISCH, P. M. . Openthor: Uma Ferramenta Rápida Para Visualizacao Distribuida da Dinamica Molecular.. In: XVIII JORNADA INTERNA DE INIC. CIENTIFICA, 1996. RIO DE JANEIRO.

• CARVALHO, M. L. ; SOUA, T. P. ; DARDENNE, L. E. ; BISCH, P. M. . Modelagem Molecular de Enzimas Proteoliticas e de Seus Inibidores.. In: XVIII JORNADA INTERNA DE INIC. CIENTIFICA, 1996. RIO DE JANEIRO.

• SILVA, F. M. K. ; PRAZERES, G. M. P. ; BISCH, P. M. . Epr de Mip de Cristalino Reconstituida Em Vesicula de Fosfolipideos.. In: XVIII JORNADA INTERNA DE INIC. CIENTIFICA, 1996. RIO DE JANEIRO.

• CHEN, W. ; PASCUTTI, P. G. ; PERSECHINI, P. M. ; BISCH, P. M. . Modelagem Molecular do Peptideo N-Terminal da Perforina. In: XVIII JORNADA INTERNA DE INIC., CIENTIFICA, 1996. UFRJ.

• PRAZERES, G. M. P. ; LINHARES, M. P. ; BISCH, P. M. . Utilizacao da Tecnica de Marcadores de Spin No Etsudo de Biomembranas Reconstituidas.. In: XVIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1995. CAXAMBU, MG.

• SOUZA, K. M. O. ; COSTA, M. C. P. ; BISCH, P. M. . Influencia dos Gradientes de Densidade Na Formacao de Estruturas Dissipativas Em Celulas de Dialise.. In: XVIII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1995. CAXAMBU, MG.

• PASCUTTI, P. G. ; ITO, A. S. ; MUNDIN, K. C. ; BISCH, P. M. . Molecular Dynamics Simulation At Water/Membrane Interfaces. In: III CONGRESS OF BIOPHYSICS OF THE SOUTHERN CONE AND XX ANNUAL CONGRESS OF THE BRAZILIAN BIOPHYSICS SOCIETY, 1995. BELO HORIZONTE, MG.

• PRAZERES, G. M. P. ; LINHARES, M. P. ; BISCH, P. M. . Electron Spin Resonance Spectroscopic Studies Of Reconstituted Biomembranes. In: III CONGRESS OF BIOPHYSICS OF THE SOUTHERN CONE AND XX ANNUAL CONGRESS OF THE BRAZILIAN BIOPHYSICAL SOCIETY, 1995. BELO HORIZONTE , MG.

• SOUZA, E. R. ; PINTO, N. M. C. ; BISCH, P. M. . Dinamica Nao-Linear de Filmes Lipidicos (Fl) Eletricamente Carregados. In: III CONGRESS OF BIOPHYSICS OF THE SOUTHERN CONE AND XX ANNUAL CONG. BRAZ. BIOPHYSICAL SOCIETY, 1995. BELO HORIZONTE, MG.

• AMORIM, M. C. L. ; BISCH, P. M. ; WEISMULLER, G. . Reconstituicao Defilmes Lipidicos Em Balancas de Langmuir. In: XVII JORNADA INTERNA DE INICIACAO CIENTIFICA, 1995. RIO DE JANEIRO.

• RIBEIRO, S. J. M. ; HILL, C. E. M. ; PASCUTTI, P. G. ; BISCH, P. M. . Winthor: Um Programa Rapido e Realístico Para A Visualizacao da Dinamica Molecular. In: XVII JORNADA INTERNA DE INIC. CIENTIFICA, 1995. RIO DE JANEIRO.

• PASCUTTI, P. G. ; ITO, A. S. ; MUNDIN, K. C. ; BISCH, P. M. . Simulacoes de Dinamica Molecular do Peptideo Alfa-Msh Na Interface Membrana-Agua.. In: XVII ENCONTRO NACIONAL DEFISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1994. CAXAMBU, MG.

• CASSIANO, M. M. ; BISCH, P. M. . Desenvolvimento de Uma Interface Gráfica Par Visualizacao Molecular.. In: XVII ENCONTRO NACIONAL DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1994. CAXAMBU, MG.

• LOPES, F. J. P. ; BISCH, P. M. . Formulacao Termodinamica de Nao-Equilibrio Aplicada Ao Estudo de Estruturas Dissipativas Em Celulad de Dialise.. In: XVII ENCONTRO NAC. DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1994. CAXAMBU, MG.

• AREAS, E. P. G. ; PASCUTTI, P. G. ; MUNDIN, K. C. ; BISCH, P. M. . Molecular Dynamics At A Cytoplasm/Membrane Interface Of Signal Peptides Sequence In A Dielectric Dicontinued Medium.. In: IInd WORKSHOP ON CHEMICAL CHEMICAL STRUCTURE AND BIOLOGICAL ACTIVITY, 1994. SAO PAULO.

• SOUZA, K. M. O. ; PRAZERES, G. M. P. ; LOPES, F. J. ; COSTA, M. C. P. ; BISCH, P. M. . A New Class Of Dissipative Structures Observed In Dialysis Cells. In: EUROPEAN LOW GRAVITY RESEARCH ASSOCIATION 94- BIENNAL CONFERENCE, 1994. MADRID - ESPANHA.

Projetos de pesquisa

• 2020 - Atual

  VESÍCULAS EXTRACELULARES: ESTUDOS DAS INTERAÇÕES ENTRE MICRORGANISMOS, MEIO AMBIENTE E HOSPEDEIROS, UM CAMINHO PARA A BIOLOGIA SINTÉTICA, Descrição: Vesículas extracelulares (EV) produzidas por bactérias, ainda pouco estudadas, têm se mostrado essenciais nas interações microbianas, intervindo na adaptação ao meio ambiente e na associação com hospedeiros. Funcionam como carreadores de moléculas sinalizadoras, toxinas e vários tipos de moléculas efetoras, contribuindo no processo de sobrevivência e expansão da comunidade bacteriana. Propomos estudar a estrutura, composição e função de EVs produzidas por bactérias em vários contextos: patógenos humanos (Vibrio sp. e Klebsiella sp.), comunidades microbianas de água doce (Raphidiopsis sp.) e participantes de rizosferas (Paraburkholderia sp.). EVs são atualmente caracterizadas como sistema de secreção tipo zero, pretendemos analisar outro sistema de secreção relacionado, do tipo VI (T6SS) que atua no recrutamento e direcionamento das próprias EVs. Investigaremos ainda EVs como carreadores de moléculas bioativas em processos biotecnológicos. Como resultado, vamos determinar estrutura, composição lipídica e protéica das vesículas produzidas pelas diferentes bactérias em variadas condições ambientais, analisar moléculas efetoras, como toxinas e possível transmissão horizontal de genes, realizando testes de competição em comunidades bacterianas, e de infecção em modelos animais e em culturas de células. Avaliaremos o papel de EVs na comunicação e competição interbacteriana, determinando se vesículas produzidas por uma espécie são recrutadas por outra espécie. Investigaremos se T6SS pode estar envolvido no recrutamento de EVs. Através de modelagem computacional, pretendemos elucidar mecanismos moleculares do funcionamento do T6SS. Na direção de uma biologia sintética, espera-se que estes estudos sejam a base adequada para propostas biotecnológicas de sistemas de produção de vesículas com efetores biológicos, visando aplicações biomédicas, ambientais e agrícolas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Paulo Mascarello Bisch - Coordenador / Gilberto Weissmuller - Integrante / Ana Beatriz Furlanetto Pacheco - Integrante / Carolina Lage Goulart - Integrante / Livia Carvalho Barbosa - Integrante / Letícia Miranda Lery Santos - Integrante / Bianca Cruz Neves - Integrante / Graciela Maria Dias - Integrante / Mauricio Garcia de Souza Costa - Integrante / Paulo Ricardo Batista - Integrante / Polyana Silva Pereira - Integrante / Wanda Maria Almeida von Krüg - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3

• 2017 - Atual

  Análise da expressão dos genes envolvidos na síntese de lipídios ornitina em Vibrio cholerae O1, produzidas sob limitação e abundância de fosfato inorgânico., Descrição: Estudos da resposta da bactéria Vibrio cholerae, o agente etiológico da cólera, e de outros membros do gênero Vibrio, à limitação de fosfato inorgânico (Pi) no meio extracelular, mediada pelo sistema PhoB/PhoR: aspectos moleculares da expressão gênica e patogenicidade. Implementação de técnicas inovadoras para caracterização de lipídios por espectrometria de massas: análise de moléculas envolvidas na interação ambiente-patógeno-hospedeiro. Estudo de Vesículas Extracelulares produzidas por Vibrio cholerae e outros microrganismos: Estrutura, composição e função; papel na interação com o meio ambiente e hospedeiros: seu possível uso em Biologia Sintética.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Paulo Mascarello Bisch - Coordenador / Pacheco, Ana Beatriz Furlanetto - Integrante / LERY, LETICIA MIRANDA SANTOS - Integrante / DE ALMEIDA VON KRÜGER, WANDA MARIA - Integrante / GOULART, CAROLINA LAGE - Integrante / BARBOSA, LIVIA CARVALHO - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 7 / Número de orientações: 1

• 2017 - Atual

  Pesquisa de novos efetores alostéricos para proteínas envolvidas na sinalização celular: do uso de simulações computacionais à proposta de potenciais fármacos moduladores., Descrição: Desenvolvimento metodológico de técnicas de simulação avançadas para o estudo da flexibilidade e modulação alostérica de proteínas envolvidas na sinalização celular (GPCRs e complexos CDK/Ciclinas). Aplicação das metodologias computacionais e proposição de novos fármacos moduladores alostéricos para estes alvos. Validação dos fármacos alostéricos preditos com técnicas experimentais e ensaios in vitro e in vivo. Estudo conformacional dos GPCRs (receptor beta adrenérgico, grelina, vasopressina e neurotensina) através das técnicas de simulações híbridas (MDeNM e cálculo de energia livre). Detecção de cavidades que possam ser possíveis sítios alostéricos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Paulo Mascarello Bisch - Coordenador / Gilberto Weissmuller - Integrante / Mauricio Garcia de Souza Costa - Integrante / Paulo Ricardo Batista - Integrante / Nicolas Floquet - Integrante / Pedro Geraldo Pascutti - Integrante / David Perahia - Integrante / BARTHOLOME DELORT - Integrante / JEAN-LOUIS BANERES - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação., Número de produções C, T & A: 5

• 2014 - Atual

  Genômica Funcional em Saúde: Agentes Infecciosos e Hospedeiros, Descrição: Desenvolvimento de abordagens inovadoras para análises genômicas e pós-genômicas, incluindo sequenciamento de última geração, genômica comparativa, sequenciamento e quantificação de RNA, estudos de modificações epigenéticas, assim como técnicas para o estudo de interações proteína-proteína. O foco do projeto são doenças infecciosas - causadas por parasitos responsáveis por doenças tropicais, bactérias patogênicas e vírus - todas de relevância para a saúde de nossas populações. Através da genômica e da investigação dos mecanismos de controle da expressão gênica aprofundamos estudos da interação entre patógenos e hospedeiros. O objetivo do projeto é investigar as bases moleculares da patogenicidade, ampliando o conhecimento científica necessária ao desenvolvimento de novos métodos terapêuticos. A aplicação conjunta destas técnicas depende de uma equipe multidisciplinar com conhecimentos e facilidades complementares. Nesta proposta reunimos grupos de três instituições do Rio de Janeiro com este perfil e com perguntas que podem ser respondidas com a utilização destas ferramentas específicas. Estes grupos possuem equipamentos para sequenciamento de última geração e acesso a equipamentos de alta resolução para espectrometria de massas. Contamos ainda com o apoio de vários colaboradores, no Brasil e no exterior, dispondo de equipamentos e tecnologias complementares para o desenvolvimento do projeto. A proposta visa criar no Rio de Janeiro um grupo de excelência com bases sólidas para o desenvolvimento de métodos pós-genômicos, incluindo o sequenciamento e quantificação da expressão de RNA, envolvendo a quantificação simultânea do RNA expresso pelo patógeno e pela célula hospedeira. Como metodologia complementar, será implementado o estudo de interações Proteína-Proteína através de espectrometria de Massas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (15) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Paulo Mascarello Bisch - Coordenador / Ana Beatriz Furlanetto Pacheco - Integrante / Wanda Maria Almeida von Kruger - Integrante / Carolina Lage Goulart - Integrante / Livia Carvalho Barbosa - Integrante / Rosane Silva - Integrante / Turán P. Ürményi - Integrante / Ulisses Gazos Lopes - Integrante / Renata Meirelles dos Santos Pereira - Integrante / Teresa Cristina Calegari‐Silva - Integrante / Clarissa Damaso - Integrante / Francisco M. Bastos de Oliveira - Integrante / Marcelo R. Fantappié - Integrante / Alessandra Mattos Saliba - Integrante / Letícia Miranda Lery Santos - Integrante / Maria Cristina Vidal Pessolani - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 14 / Número de orientações: 1

• 2013 - Atual

  Ferramentas Inovadoras no Estudo de Sistemas Moleculares Biológicos, Descrição: O projeto visa o desenvolvimento e a utilização de vários métodos teóricos-computacionais e de diversas técnicas experimentais, para o estudo estrutural e funcional de biomoléculas. Os métodos computacionais incluem a Modelagem Molecular e métodos de Bioinformática, no estudo de sequências e estruturas de proteínas e outras biomoléculas. As técnicas experimentais incluem os métodos de Biologia Estrutural, como a Microscopia de Força Atômica, no estudo de superfícies celulares e de interações entre receptores e ligantes, além de técnicas de Proteômica, para o fracinonamento e identificação de proteínas por Espectrometria de Massa. Técnicas de sequenciamento genômico em larga escala também tem sido utilizadas pelo grupo. Nos projetos em andamento são estudados diversos sistemas de interesse biológico, envolvendo a colaborações com outros laboratórios e a participação em projetos cooperativos de âmbito regional, nacional e internacional. São estudadas enzimas proteolíticas, interações receptores-ligante, peptídeos com atividade biológica e a regulação da expressão gênica. A equipe utiliza técnicas inovadoras em consonância com os desenvolvimentos atuais de Genômica e Proteômica, envolvendo temas fundamentais em biociências. Nossa proposta é que os métodos implementados possam ser úteis na compreensão à nível molecular e físico-químico dos fenômenos biológicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (10) / Doutorado: (10) . , Integrantes: Paulo Mascarello Bisch - Coordenador / Gilberto Weissmuller - Integrante / Wanda M. A. von Kruger - Integrante / Pacheco, Ana Beatriz Furlanetto - Integrante / FRANCISCO J.P., LOPES - Integrante / Helena Araújo - Integrante / DA SILVA, MANUELA LEAL - Integrante / COSTA, MAURICIO GARCIA DE SOUZA - Integrante / LERY, LETICIA MIRANDA S. - Integrante / PATRICIO, BEATRIZ F. DE C. - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.