José Luiz Rybarczyk Filho

Possui graduação em Bacharelado em Física pelo Instituto de Física da Universidade Federal do Rio Grande do Sul- UFRGS (2004), Mestrado em Medicina: Ciências Médicas pela Faculdade de Medicina da Universidade Federal do Rio Grande do Sul-UFRGS (2006), Doutorado em Física pelo Instituto de Física da Universidade Federal do Rio Grande do Sul-UFRGS (2011), Pós-Doutorado na área de Bioquímica pelo Instituto de Ciências Básicas da Saúde da Universidade Federal do Rio Grande do Sul- UFRGS (2011/2012), Livre-Docente em Bioinformática pelo Instituto de Biociências de Botucatu da Universidade Estadual Paulista ?Júlio de Mesquita Filho? - UNESP (2019). Atualmente é Professor Associado no Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP ministrando aulas nos cursos de graduação de Física Médica, Ciências Biológicas e Biomedicina e na pós-graduação para os cursos de Biotecnologia, Ciências Biológicas - Genética e Biologia Geral e Aplicada. Têm experiência nas área de sinais biomédicos, bioinformática, redes biológicas.

Informações coletadas do Lattes em 14/01/2024

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Física

2007 - 2011

Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: Medida de performance metabólica usando a expressão gênica de genoma completo
Rita Maria Cunha de Almeida. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Mestrado em Medicina: Ciências Médicas

2005 - 2006

Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: Classificação de Fusos de Sono por Técnicas Não-Lineares, Ano de Obtenção: 2006
Marcia Lorena Fagundes Chaves.Coorientador: Gunther Johannes Lewczuk Gerhardt. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências da SaúdeSetores de atividade: Neurociências.

Especialização em MBA Datascience & Machine Learning

2019 - 2021

Universidade Paulista
Título: Avaliação da U-NET e Efficient Net na detecção de câncer de mama

Graduação em Bacharelado Em Fisica

2000 - 2004

Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Orientador: Johnny Ferraz Dias
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Pós-doutorado

2019

Livre-docência. , Universidade Estadual Paulista Julio De Mesquita F, UNESP, Brasil. , Título: Desenvolvimento de ferramenta computacional para integração de transcriptomas e redes biológicas para avaliação de assinaturas transcricionais, Ano de obtenção: 2019., Grande área: Ciências Biológicas

2011 - 2012

Pós-Doutorado. , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética / Especialidade: Rotas Metabólicas. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

Formação complementar

2020 - 2020

Entre fórmulas e funções: explorando as Planilhas Google. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2020 - 2020

Podcasts pedagógicos: produzindo e distribuindo conhecimento interativo. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2020 - 2020

Criando slides impactantes com as Apresentações Google. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2020 - 2020

Avaliando com rubricas. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2020 - 2020

Como conectar-se com os alunos via Meet e produzir videoaulas. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2020 - 2020

Criando objetos digitais com os Formulários Google. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2020 - 2020

Estratégias para aulas remotas ao vivo. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2020 - 2020

Gamificando a aprendizagem com Quizizz. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2020 - 2020

omo editar uma videoaula?. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2020 - 2020

Gestão da educação: criando painéis de indicadores com Planilhas e Data Stu. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2020 - 2020

Criando questões digitais com os Formulários Google. (Carga horária: 2h). , Nuvem Mestra, NM, Brasil.

2018 - 2019

Fundamentos de AI & Machine Learning. (Carga horária: 96h). , Udacity, UDACITY, Brasil.

2015 - 2015

Current methodologies in transcriptome analysis. (Carga horária: 3h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2015 - 2015

Análises transcriptômicas e biologia de sistemas - avançado. (Carga horária: 15h). , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.

2014 - 2014

rotein-Protein Docking,Protein Structural Alignmen. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2014 - 2014

Dinâmica Molecular Básica. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2014 - 2014

Cálculo de Modos Normais em Proteínas. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2013 - 2013

Mapping of epitopes using proteomic techniques, mo. (Carga horária: 3h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2013 - 2013

II Jornada de Integração e Capacitação do LBBC. (Carga horária: 4h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2008 - 2008

Bioinformática de RNA. (Carga horária: 8h). , Sociedade Brasileira de Computação, SBC, Brasil.

2008 - 2008

Genômica Comparativa. (Carga horária: 8h). , Sociedade Brasileira de Computação, SBC, Brasil.

2008 - 2008

Cultura de células. , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.

2004 - 2004

Segurança e Proteção Radiológica. , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica de Processos e Sistemas.

Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Eletroencefalograma.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Sistemas Complexos.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Matemática / Subárea: Wavelets.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Inteligência Artificial.

Organização de eventos

Rybarczyk-Filho, J. L. . IV WORKBIOTECH. 2018. (Congresso).

FERNANDEZ, R. M. ; HORMAZA, J. M. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; COSTA, V. E. . XII Congresso de Física aplicada à Medicina. 2016. (Congresso).

HORMAZA, J. M. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Lemke, N. ; FONTES, M. R. M. ; MIRANDA, J. R. A. ; PINA, D. R. ; FERNANDES, M. A. R. ; FERNANDEZ, R. M. . XI Congresso de Física Aplicada à Medicina. 2015. (Congresso).

FLEURI, L. F. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . I Workbio Workshop de Biotecnologia. 2015. (Outro).

Rybarczyk-Filho, J. L. ; HORMAZA, J. M. ; MIRANDA, J. R. A. ; FONTES, M. R. M. ; Lemke, N. ; COSTA, V. E. . X Congresso de Física Aplicada à Medicina (CONFIAM). 2014. (Congresso).

Rybarczyk-Filho, J. L. . Membro do Comitê Organizador Local do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica. 2013. (Congresso).

Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; FERNANDEZ, R. M. ; COSTA, V. E. ; MIRANDA, J. R. A. ; HORMAZA, J. M. ; FERNANDES, M. A. R. ; FONTES, M. R. M. . VIII Congresso de Física Aplicado à Medicina. 2012. (Congresso).

Participação em eventos

X-meeting 2019 - 15th International Conference of the AB3C. Neuroblastoma Meta-Analysis for Gene Characterization of INSS Stages. 2019. (Congresso).

X-meeting 2018 - 14th International Conference of the AB3C. LEVI ? AN R PACKAGE FOR INTEGRATION OF NETWORKS AND GENE EXPRESSION DATA,. 2018. (Congresso).

13th International Conference of the AB3C. RTranscriptogram: a tool for biological data integration. 2017. (Congresso).

GDG Campinas DataFest. 2017. (Encontro).

GDG Campinas DevFest. 2017. (Encontro).

XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq). ModulaRmap: a R package to analysis of toxicogenomic data. 2017. (Congresso).

The fourth International Society for Computational Biology Latin America Bioinformatics Conference (ISCB-LA). R-Transcriptogram: a tool for integrate networks and microarray data. 2016. (Congresso).

11th International Conference of the AB3C+Brazilian Symposium of Bioinformatics. 2015. (Congresso).

23 rd IUBMB and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology-SBBq. Modular and Functional analysis of non-model organisms protein networks. 2015. (Congresso).

I Escola Gaúcha de Bioinformática. 2015. (Outra).

XI Congresso de Física Aplicada à Medicina. 2015. (Congresso).

10th International Conference of the AB3C+Brazilian Symposium of Bioinformatics. 2014. (Congresso).

VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.Triplet Entropy Analysis and Molecular Modeling of Hemagglutinin as Tools for Understanding Influenza Virus Phylodynamics. 2014. (Outra).

XVIII Conference on Nonequilibrium Statistical Mechanics and Nonlinear Physics. WaveFinder: a tool for signal processing using Neuroheadsets and Android System. 2014. (Congresso).

21st Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. TRANSTAGING: Transcriptogram-based staging of cancer. 2013. (Congresso).

CAMDA 2013 Critical Assessment of Massive Data Analysis. TRANSTAGING: Transcriptogram-based staging of cancer. 2013. (Congresso).

International Conference of the AB3C e Brazilian Symposium on Bioinformatics. 2013. (Congresso).

XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica. Comparação de Fusos do Sono: Métodos automáticos vs. perito. 2013. (Congresso).

XXXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Development of a transcriptional staging for cancer by the transcriptogram method. 2013. (Congresso).

XXXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Quantifiyng fylodynamics of Influenza Virus by means of Triplet Entropy. 2013. (Seminário).

8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Integrating proposed and novel putative gene-environment interactions within the autistic puzzle through a systems biology analysis. 2012. (Congresso).

8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. PROGENET: an integrative protein/gene network web tool. 2012. (Congresso).

UNESP e seus novos docentes. 2012. (Outra).

VIII Congresso de Física Aplicado à Medicina. Transcriptograma: Integração de redes protéicas e expressão gênica. 2012. (Congresso).

XXXV Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada. Towards a genome-wide transcriptogram: the Homo sapiens case. 2012. (Congresso).

6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Gene expression analysis of an ordered network: A search for tumoral patterns. 2010. (Congresso).

VIII Mostra PG IF UFRGS.Expression analysis on interactome of Saccharomyces cerevisiae. 2010. (Encontro).

5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Expression Analysis on Interactome for Saccharomyces cerevisiae. 2009. (Congresso).

Conference on Computational Physics. Metropolis Algorithm Modified for Protein Networks. 2008. (Congresso).

I Escola Brasileira de Bioinformática.GNATT: Ferramentas de análise de redes gênicas/protéicas e ordenamento de Interatomas. 2008. (Outra).

III Brazilian Simposium on Bioinformatics. 2008. (Simpósio).

BIOMAT International Symposium on Mathematical and Computational Biology.A New Tool for Analysis of Interactome. 2007. (Simpósio).

VI MostraPG IF UFRGS.Uma nova ferramenta para análise de Interatomas. 2007. (Encontro).

XVI Salão de Iniciação Cientifica.Análise Elementar do Café. 2004. (Encontro).

XV Salão de Iniciação Científica.Calibraçao do Sistema PIXE do Institudo de Fisíca da Universidade Federal do Rio Grande do Sul. 2003. (Encontro).

Participação em bancas

Aluno: Giovanna Melato Bonança

Rybarczyk-Filho, J. L.; Laurita dos Santos; HORTA JUNIOR, J. A. C. E.. Análise das bandas alfa e teta do eletroencefalograma durante tarefa aritmética. 2020. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós Graduaação em Biologia Geral e Aplicada) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Rodrigo Antonio Ezias Grassi

Rybarczyk-Filho, J. L.; RAMOS, P. R. R.; Orselli, M. I. V.. Desenvolvimento de um dispositivo para avaliação objetiva da expansão do casco do equino à locomoção. 2018. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Giordano Bruno Sanches Seco

Magro, A. J.;Rybarczyk-Filho, José Luiz; Zambuzzi, W. F.. Análise Comparativa de Métodos de Determinação de Vias Biológicas Alteradas em Dados Toxicogenômicos de estudos in vitro e in vivo. 2018. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: André Luiz Molan

SIMAO, E. M.; Alonso, D. P.;Rybarczyk-Filho, José Luiz. Construção de uma ferramenta para análise de enriquecimento funcional gênico multiespécie entre amostras comparativas. 2018. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: José Rafael Pilan

Rybarczyk-Filho, J. L.SIMAO, E. M.; FONTES, M. R. M.. Desenvolvimento de um método de classificação taxonômica de dados de metagenomas. 2017. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Alex Augusto Biazotti

Rybarczyk-Filho, J. L.; Magro, A. J.; Almeida, O. C. P.. Desenvolvimento de Ferramenta Computacional para integração de transcriptomas e redes biológicas: medidas de desempenho global. 2017. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carlos Alberto Oliveira de Biagi Júnior

Rybarczyk-Filho, J. L.; Silva-Junior, W. A.; Simões, R. P.. Meta-análise do Projeto Toxicogenômico Japonês: diferenças entre modelos in vivo e in vitro. 2017. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Guilherme de Almeida Silva Creste

Rybarczyk-Filho, J. L.; Laurita dos Santos; PEDROSA, V. A.. Utilização de um aparelho de eletroencefalografia na domótica. 2017. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carlos Eduardo Giuliani Baú

SIMAO, E. M.Rybarczyk-Filho, J. L.; SILVA, S. C.. Identificação de genes diferencialmente expressos em glioblastoma e sua relação nas vias do sistema imunológico. 2016. Dissertação (Mestrado em Nanociências) - Universidade Franciscana.

Aluno: Tahila Andrighetti

Rybarczyk-Filho, J. L.; Laurita dos Santos; Da-SILVA, M. L.. Ferramenta computacional para identificação de micro-organismos com base em assinaturas genômicas. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas: Genética) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Pedro Rafael Costa

Lemke, N.Rybarczyk-Filho, J. L.; SILVA, S. A. E.. Modelo cinético estocástico para a transição considerando colisões entre moléculas de RNA Polimerase. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas: Genética) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Rainer Marco Lopez Lapa

Carvalho, R. F.; Linde, S. A. D.;Rybarczyk-Filho, José Luiz. Identificação de alterações na expressão de pseudogenes e seus genes parentais correspondentes em adenocarcinoma pulmonar. 2018. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rafael Bottaro Gelaleti

RUDGE, M. V. C.; CALDERON, I. M. P.;Rybarczyk-Filho, J. L.; NEGRATO, C. A.; SILVA, G. N.. Avaliação no Padrão de Expressão Gênica em Células do Sangue Total de Gestantes Diabéticas e com Hiperglicemia Gestacional Leve. 2016. Tese (Doutorado em Ginecologia, Obstetrícia e Mastologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Guilherme Targino Valente

MARTINS, C.;Rybarczyk-Filho, José Luiz; BRITO, R. O. A. A.; BRAZ, A. S. K.; GALETTI JUNIOR, P. M.. Analisando a determinação sexual de vertebrados com base em redes de interação entre proteínas. 2013. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Amanda Cristina Mazer

YORIYAZ, H.;Rybarczyk-Filho, J. L.. Avaliação de dose em Radioterapia Guiada por Imagem (IGRT). 2022. Exame de qualificação (Doutorando em Tecnologia Nuclear) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Julliano da Silva Otoni

Rybarczyk-Filho, José Luiz; HORMAZA, J. M.; MIRANDA, J. R. A.. Desenvolvimento de um aparelho de eletroencefalografia mobile de baixo custo. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carlos Alberto Oliveira de Biagi Júnior

ARAUJO JUNIOR, J. P.;Rybarczyk-Filho, J. L.; Sandrim, V. C.. Meta-análise do Projeto Toxicogenômico Japonês: diferenças entre modelos in vivo e in vitro. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Guilherme de Almeida Silva Creste

Rybarczyk-Filho, J. L.; PEDROSA, V. A.; MIRANDA, J. R. A.. Utilização de um aparelho de eletroencefalografia portátil na domótica. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rodrigo Antonio Ezias Grassi

Rybarczyk-Filho, J. L.; HORMAZA, J. M.; Alonso, J. M.. Desenvolvimento de um dispositivo para avaliação objetiva da expansão do casco equino à locomoção. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: José Rafael Pilan

Rybarczyk-Filho, J. L.; FERNANDEZ, R. M.; Gushi, L. T.. Desenvolvimento de um método de classificação taxonômica de dados de metagenomas. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Alex Augusto Biazotti

Rybarczyk-Filho, J. L.; RAINHO, C. A.; Marcondes, J. P. C.. Desenvolvimento de Ferramenta Computacional para integração de transcriptomas e redes biológicas: medidas de desempenho global. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Tahila Andrighetti

Rybarczyk-Filho, J. L.; RAINHO, C. A.; SOUZA-NETO, J. A.. Ferramenta computacional para identificação de micro-organismos com base em assinaturas genômicas. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas: Genética) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Pedro Rafael Costa

Acencio, M. L.Rybarczyk-Filho, José LuizLemke, N.. Modelo cinético estocástico para a transcrição considerando colisões entre moléculas de RNA Polimerase. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas: Genética) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Patrícia Luisa Bergamo

Rybarczyk-Filho, J. L.. Mapeamento espacial dos níveis radiométricos do serviço de medicina nuclear do hospital das clínicas da faculdade de medicina de Botucatu - UNESP. 2020. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Programa de Residência em Física Médica) - Hospital das Clinicas da Faculdade de Medicina de Botucatu.

Aluno: Marcelo Dante Tacconi Alvarez

MIRANDA, J. R. A.;Rybarczyk-Filho, J. L.; OLIVEIRA NETO, M.. Problema Inverso Aplicado em Imagens de Biosusceptometria AC de Nanopartículas Magnéticas. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Arthur Marchi Bellon

MIRANDA, J. R. A.;Rybarczyk-Filho, J. L.; FERNANDEZ, R. M.. Aspectos de Proteção Radiológica em uma Clínica de Radiodiagnóstico Veterinário. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rafael Guazzelli

Rybarczyk-Filho, J. L.; HORMAZA, J. M.; FERNANDEZ, R. M.. Cálculo de multiplicidade de nêutrons , prótons em reação p+ 16O para energias de interesse em protonterapia empregando um modelo de bilhar nuclear. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carolina Harumi Kaneko

FLEURI, L. F.;Rybarczyk-Filho, J. L.; OLIVEIRA NETO, M.. Caracterização Química do Caroá in Natura. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rodolfo Cicolin

Rybarczyk-Filho, J. L.; MORIGUCHI, S. M.. Otimização de Sensor de Biosusceptometria AC para quantificação de nanopartículas magnéticas. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Maria Eugênia Dela Rosa

PINA, D. R.;Rybarczyk-Filho, J. L.; COSTA, V. E.. Desenvolvimento de um Simulador Radiográfico Homogêneo Equivalente ao Tórax Canino para procedimentos de otimização de imagens radiográficas. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ravan Abner Rosa

HORMAZA, J. M.;Rybarczyk-Filho, J. L.; COSTA, V. E.. Protocolos para aplicação do 13C-UBT na detecção da infecção pelo Helicobacter pylori no Hospital das Clínicas analisado por IRMS. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Caio Santiloni Cury

Rybarczyk-Filho, José Luiz; FERNANDEZ, R. M.; COSTA, V. E.. Comparação do 13C-UBT com método convencional para diagnóstico da infecção por Helicobacter pilori no Hospital das Clínicas de Botucatu - SP. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: César Buchile Abud de Oliveira

Rybarczyk-Filho, J. L.; MANCERA, P. F. A.; TRINCA, L. A.. Ferramenta computacional para avaliação da capacidade preditiva de delineamentos experimentais. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Alexia Dimitra Zarbinati de Oliveira

Rybarczyk-Filho, J. L.. Análise in silico Indica Similaridade da Expressão Gênica na Rede de Interação do Receptor de Vitamina D na Síndrome Clinicamente Isolada e Esclerose Múltipla. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biomédicas) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Fernando Antonio Bacchim Neto

HORMAZA, J. M.;Rybarczyk-Filho, J. L.; PINA, D. R.. Avaliação da Exposição à Radiação no Médico Intervencionista em Procedimentos no Setor de Hemodinâmica. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Guilherme Giacomini

PINA, D. R.;RYBARCZYK FILHO, Jose LuizLemke, N.. Quantificação de Compromentimento Pulmonar Causado por Tuberculose em Exames de Raios-X e Tomografia Computadorizada. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Paola Cristina Faccin

Rybarczyk-Filho, J. L.; COSTA, V. E.; FERNANDES, M. A. R.. Turnover do Carbono-13 no Teste respiratório para diagnóstico da Helicobacter pylori em diferentes tempos de Jejum. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Beatriz de Oliveira Garcia

Rybarczyk-Filho, J. L.; FERNANDES, M. A. R.; COSTA, V. E.. Influência do Estado de Jejum no 13C-UBT para detecção da infecção da Helicobacter pylori em diferentes tempos de coleta do sopro. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: CAIO VINICIUS DE OLIVEIRA

Rybarczyk-Filho, J. L.Lemke, N.. Distribuição e Dispersão dos Níveis Radiométricos do Setor Técnico de Medicina Nuclear do Hospital das Clinícas da Faculdade de Medicina de Botucatu. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Ana Julia Martins Sampaio

Rybarczyk-Filho, J. L.Lemke, N.. Radioterapia Bidimensional e Radioterapia Conformada Tridimensional. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Francielen Barreto Hortencio

Lemke, N.; FERNANDEZ, R. M.;Rybarczyk-Filho, J. L.. Estagiamento do sono e análise de sinais em apnéia obstrutiva do sono. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Aluno: Ivan Pagotto

Acencio, M. L.Rybarczyk-Filho, José Luiz. Determinação de genes potencialmente responsivos à radiação ionizante através de aprendizado de máquina.. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

MIRANDA, J. R. A.;Rybarczyk-Filho, J. L.; OLIVEIRA NETO, M.. Professor Substituto (Depto de Biofísica e Farmacologia) para as disciplinas de Eletromagnetismo, Mecânica Quântica, Mecânica Clássica I. 2021. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

MIRANDA, J. R. A.;Rybarczyk-Filho, J. L.; FERNANDEZ, R. M.. Professor Substituto (Depto de Biofísica e Farmacologia) para as disciplinas de Mecânica Clássica I e II, Física das Radiações, Física Experimental e Fìsica. 2020. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

HORMAZA, J. M.;Rybarczyk-Filho, J. L.; OLIVEIRA NETO, M.. Professor Substituto: "Eletrônica Experimental e Aplicada","Física Experimental I", "Física das Radiações", "Técnicas Fìsicas de Radiação não-Ionizante","Física Experimental IV", "Medicina Nuclear e Radiobiologia". 2018. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

HORMAZA, J. M.;Rybarczyk-Filho, J. L.; FERNANDEZ, R. M.. Professor Substituto: Termodinâmica & Mecânica Estatítstica e Mecânica Quântica. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

VASKE-JUNIOR, T.;Rybarczyk-Filho, J. L.; TERAMOTO, E. T.. Professor Assistente Doutor nas disciplinas de "navegação I", "navegação II", "Fisica I" e "Física II" Campus de Registro. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, J. L.; HORMAZA, J. M.; RAMOS, P. R. R.. Professor Substituto : física III; Eletrônica Experimental Aplicada. 2016. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

REZENDE, M. A.; COSTA, V. E.;Rybarczyk-Filho, J. L.. Concurso publico para vaga de física aplicada. 2014. Faculdade de Tecnologia de Botucatu.

WELFER, D.;Rybarczyk-Filho, J. L.; CHIWIACOWSKY, L. D.. Modelagem Computacional. 2013. Universidade Federal do Pampa.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Professor Adjunto de Biofísica. 2013. Universidade Federal da Bahia.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Avaliador de Trabalhos do XV CONFIAM. 2019. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Comissão Científica do IV WorkBiotech. 2018. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Avaliador de Pôster no 14th International Conference of the AB3C. 2018. Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.

Rybarczyk-Filho, J. L.; ARAUJO JUNIOR, J. P.; PEDROSA, V. A.. Seleção de Mestrado/Doutorado em Biotecnologia 2017/2. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

RICCARDI, C. S.;Rybarczyk-Filho, J. L.; ARAUJO JUNIOR, J. P.. Seleção Mestrado/Doutorado em Biotecnologia 2018/1. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Avaliador de Poster no XVII Workshop de Genética. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Comissão CIentífica do XIII CONFIAM. 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Avaliador de trabalhos do 13th International Conference of the AB3C. 2017. Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Parecerista do programa PIBIC/UNESP (2 projetos). 2017. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, J. L.; NOBREGA, R. H.; LIMA, C. A. H.. Processo Seletivo PNPD/2016 - Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Genética). 2016. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Parecerista do programa PIBIC/UNESP (2 projetos). 2016. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Parecerista de Projetos de Extensão Universitária (2 projetos) - UNESP. 2016. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

VALENTE, G. T.;Rybarczyk-Filho, José Luiz; RICCARDI, C. S.. Seleção Mestrado/Doutorado em Biotecnologia 2017/1. 2016. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

SOUZA-NETO, J. A.;Rybarczyk-Filho, J. L.; OLIVEIRA, C.. Seleção Mestrado/Doutorado em Ciências Biológicas (Genética) 2016/2. 2016. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Membro de Comissão Científica do XII CONFIAM. 2016. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, J. L.; FERNANDEZ, R. M.. Membro da Comissão Científica do XI CONFIAM e I EPRAD. 2015. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Parecerista do XI CONFIAM e I EPRAD. 2015. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Parecerista de Projetos de Extensão Universitária (1 projeto) - UNESP. 2015. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, José Luiz; HERNANDES, R. T.; CESARINO, I.. Seleção de Mestrado/Doutorado (2015/2) em Biotecnologia. 2015. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, José Luiz; ARAUJO JUNIOR, J. P.; PEDROSA, V. A.. Seleção de Mestrado/Doutorado (2016/1) em Biotecnologia. 2015. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Comissão de Avaliação de Cartazes para o Prêmio SBBq 44° Reunião da SBBq/ 23° IUBMB. 2015. Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Parecerista do programa IC SEM BOLSA/UNESP (1 projeto). 2015. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, José Luiz. Parecerista de trabalhos do XII Workshop da Pós-Graduação do Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP. 2013. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Membro do Comitê Científico e Parecerista do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, V SIIM e IX CONFIAM. 2013. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, J. L.. Parecerista do programa IC SEM BOLSA/UNESP (1 projeto). 2013. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rybarczyk-Filho, José Luiz. Membro da Comitê de Organização Local do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, V SIIM e IX CONFIAM. 2013. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, José Luiz. Avaliação de trabalhos da 1ª fase do XXIV Congresso de Iniciação Científica da UNESP. 2012. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, José Luiz. Parecerista de trabalhos do VIII CONFIAM. 2012. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Rybarczyk-Filho, José Luiz. Membro da Comissão Científica do VIII CONFIAM. 2012. Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP.

Comissão julgadora das bancas

Daniel Adrian Stariolo

R. M. C. de Almeida; M. A. F. de Menezes; N. Lemke;ARENZON, J. J.STARIOLO, D. A.. Medidas de performance metabólica usando a expressão gênica de ganoma completo. 2011. Tese (Doutorado em Programa de Pós Graduação em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Daniel Adrian Stariolo

R. M. C. de Almeida; R. F. S. Andrade; IDIART, M. A. P.;STARIOLO, D. A.. Medidas de performance metabólica usando a expressão gênica de ganoma completo. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós Graduação em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Odilon Giovannini Junior

Hidalgo, M. P. L.; CANANI, S. F.;GIOVANNINI, O.. Classificação de fusos do sono por meio de técnicas não-lineares. 2006. Dissertação (Mestrado em Medicina: Ciências Médicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Emerson Luis de Santa Helena

Santa-Helena, E. L. deSCHONWALD, Suzana V. Aquisição de Sinais. 2007. Dissertação (Mestrado em Medicina: Ciências Médicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Simone Chaves Fagondes

Fagondes, S. C.; HIDALGO, M. P. L.; GIOVANNINI JUNIOR, O.; CHAVES, M. L. F.; GERHARDT, G. J.. Classificação dos Fusos do Sono por Meio de Técnicas Não-Lineares. 2006. Dissertação (Mestrado em Medicina: Ciências Médicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Maria Paz Loayza Hidalgo

CHAVES, M L FHIDALGO, Maria Paz Loayza; GIOVANNINI, O; CANANI, S. F.. Classificação de Fusos do Sono por Meio de Técnicas Não-Lineares. 2006. Dissertação (Mestrado em Medicina: Ciências Médicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Jeferson Jacob Arenzon

Arenzon, J. J.. Medidas de performance metabólica usando a expressão gênica de genoma completo. 2011. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Marino Muxfeldt Bianchin

Muxfeldt Bianchin M. Classificação de Fusos do Sono por Meio de Técnicas Não-Lineares. 2006. Dissertação (Mestrado em Curso de Pós-graduação Clínica Medica) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Marino Muxfeldt Bianchin

CHAVES, M. L. F.Bianchin, M. M.. Classificação de Fusos de Sono por Meio de Técnicas Não-Lineares.. 2006. Dissertação (Mestrado em Medicina: Ciências Médicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Marino Muxfeldt Bianchin

CHAVES, M. L. F.Bianchin, M. M.. José Luiz Rybarczyk Filho. 2007. Exame de qualificação (Mestrando em Medicina: Ciências Médicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Suzana Veiga Schönwald

SCHÖNWALD, SUZANA V; BIANCHIN, M. M.; de Santa-Helena, Emerson L.. Aquisição de Sinal. 2007. Exame de qualificação (Mestrando em Medicina: Ciências Médicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Orientou

André Luiz Molan

Início: 2022; Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP;

Allan Gabriel Alves

Análise Espaço-Temporal da Pandemia de Covid-19 em São Paulo: Uma Abordagem de Ciência de Dados e Machine Learning; Início: 2023; Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

Vitor José Medeiros

Integração de Tecnologia de Jogos e Ensino de Física: Um Estudo de Caso na Aplicação das Leis de Newton com Unity; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

Jadson Gabriel Ferreira

Identificação e Classificação de Tipos de Traumas Abdominais em Tomografias: Um Estudo de Diagnóstico; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

LUIS FELIPE PEREIRA

Aprendizado Profundo para a Caracterização de Fusos do Sono Utilizando Espectrogramas; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

Maria Eduarda Carneiro

Aprimorando a Precisão de Diagnósticos de Radiografia de Tórax por Meio de Data Augmentation e Modelos de Aprendizado Supervisionado; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

João Lucas Sacomani Gardenal

Redes Políticas e Corrupção Utilizando Link Prediction para Expor Conexões Ocultas; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

Bianca de Oliveira Gomes

Personalização do Diagnóstico de Câncer do Colo do Útero: Desenvolvimento de um Painel de Biomarcadores com Aprendizado de Máquina; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

Matheus Henrique Massuda

Modelagem Preditiva de Crimes: Integrando Dados Espaciais e Temporais com Machine Learning; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; (Orientador);

Giovanna Melato Bonança

Análise das bandas alfa e teta do eletroencefalograma durante tarefa de aritmética; 2020; Dissertação (Mestrado em Biologia Geral e Aplicada) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Julliano da Silva Otoni

Desenvolvimento de um aparelho de eletroencefalograa mobile de baixo custo; ; 2019; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Rodrigo Antonio Ezias Grassi

Desenvolvimento de um dispositivo para avaliação objetiva da expansão do casco do equino à locomoção; 2018; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

André Luiz Molan

Construção de uma ferramenta para análise de enriquecimento funcional gênico multiespécie entre amostras comparativas; 2018; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Giordano Bruno Sanches Seco

Análise Comparativa de Métodos de Determinação de Vias Biológicas Alteradas em Dados Toxicogenômicos de estudos in vitro e in vivo; 2018; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

José Rafael Pilan

Desenvolvimento de um método de classificação taxonômica de dados de metagenomas; 2017; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP,; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Alex Augusto Biazotti

Desenvolvimento de Ferramenta Computacional para integração de transcriptomas e redes biológicas: medidas de desempenho global; 2017; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP,; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Carlos Alberto Oliveira de Biagi Júnior

Meta-análise do Projeto Toxicogenômico Japonês: diferenças entre modelos in vivo e in vitro; 2017; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Guilherme Silva Creste

automação residêncial via neuroheadset para pessoas portadoras de deficiência; 2017; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Tahila Andrighetti

Ferramenta computacional para identificação de micro-organismos com base em assinaturas genômicas; 2015; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas: Genética) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Ivaine Tais Sauthier Sartor

Caracterização de redes de interação gênica/proteica dependentes de GDNF; 2012; Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Ciências Básicas da Saúde,; Coorientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

José Rafael Pilan

Desenvolvimento de ferramentas de biologia de sistemas para avaliação de dados transcriptômicos; 2022; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

André Luiz Molan

Construção de um Modelo Preditivo para o Prognóstico de Pacientes com Neuroblastoma baseado em Assinaturas Transcricionais; 2022; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Giordano Bruno Sanches Seco

Análise modular de dados de expressão para avaliação de múltiplos tumores com auxílio de métodos heurísticos; 2022; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Heleno Carmo Borges Cabral

Utilizando redes complexas para comparar padrões de expressão de vias e proteínas associadas ao desenvolvimento e tratamento do Glioblastoma Multiforme; 2020; Tese (Doutorado em Nanociências) - Universidade Franciscana,; Coorientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Antônio de Pádua Mendes

Caracterização de Eletroencefalograma utilizando Análise de Quantificação da Recorrência; 2020; Tese (Doutorado em ENGENHARIA BIOMÉDICA) - Universidade Brasil,; Coorientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Rafael Toledo Fernandes de Souza

Dinâmica de Grafoelementos do Sono e seus Impactos na Neurofisiologia de Pacientes com Apnéia Obstrutiva através de Sinais de Eletroencefalografia; 2012; Tese (Doutorado em Biologia Geral e Aplicada) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gustavo Bortolanza de Andrade

Análise de plasticidade das vias de senescência celular, apoptose e estabilidade genômica; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Letícia Del Conte

Avaliação da disponibilidade de aceleradores lineares e os tratamentos realizados na radioterapia do brasil; 2021; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Fisioterapia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Victória Santos Soares de Pinho

Análise Exploratória do Fuso do Sono com o uso de heatmaps; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Juan Lopes Costa

Análise de métricas de centralidades em redes de interações entre drogas quimioterápicas usadas no tratamento de câncer de pulmão; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Diogo Henrique Godoi

Análise exploratória da distribuição dos equipamentos de diagnóstico por imagem e da demanda de exames nos estados de São Paulo e Rio de Janeiro; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Marcela Sponchiado Serra

Comparação Gráfica da Técnica do Soco Gyaku Tsuki do Karatê através de unidade de sistemas inerciais; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Jéssica Florentino

Predição da toxicidade de anticolesterolêmicos em humanos por meio de modelo animal; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gustavo Moreira Jarola

Avaliação das ondas Theta resultantes da atividade cerebral captada durante a realização de operações matemáticas; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Luiz Miguel Alves de Oliveira

ANÁLISE DO EFEITO BERGER COM ELETROENCEFALOGRAMA PORTÁTIL; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

João Paulo Ballerini Bruno

Análise da variação da frequência na banda alfa durante o Efeito Berger; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

André Luiz Molan

Criação de um Algoritmo para Organização Hierárquica de Elementos Interagentes: uma aplicação em redes protéicas, pequenas moléculas e miRNAs; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Raphael de Melo Borache

Estudo de fusos do sonos obtidos por técnicas automáticas de detecção; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Giordano Bruno Sanches Seco

Otimização da Quantificação do Ritmo Alfa em Sinais de EEG obtido com dispositivo portátil; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gustavo Luis da Silva

Classificação de fusos do sono usando técnicas de neuroinformática; 2013; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Rodrigo Teixeira de Abreu

Integração de Transcriptomas e rede Quimio-protéica para avaliação de novos alvos protéicos para o tratamento de câncer de Pulmonar; 2013; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Carlos Alberto Oliveira de Biagi Júnior

Integração de Transcriptomas e rede Quimio-protéica para avaliação de novos alvos protéicos para o tratamento de câncer de Mama; 2013; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Arthur Gasparindo Moreira

Desenvolvimento de um preditor de prognóstico para Neuroblastoma; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, PIBIC/Reitoria - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gustavo Bortolanza de Andrade

Análise da senescência, apoptose e estabilidade cromossômica do ponto de vista da biologia de sistemas; 2021; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gustavo Moreira Jarola

Análise de ondas theta com o uso do EMOTIV EPOC+; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Luiz Miguel Alves de Oliveira

Análise de ondas alfa com o uso do EMOTIV EPOC+; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gabriel Augusto do Nascimento Arruda

Ensino de programação em escolas públicas; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP Pró Reitoria de Extensão; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gabriel Augusto do Nascimento Arruda

Integração do Emotiv com raspberry pie e sistema arduino; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Giordano Bruno Sanches Seco

Detecção de ondas alfas com o uso do raspberry pie; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Mahan Vaz Silva

Validação do software Wavefinder para detecção de ondas alfas; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Luiz Miguel Alves de Oliveira

Teste de desempenho do Wavefinder em diferentes processadores; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Felipe Chimin

Validação do Wavefinder usando ondas alfas; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

André Luiz Molan

Criação de um Algoritmo para Organização Hierárquica de Elementos Interagentes: uma aplicação em redes protéicas, pequenas moléculas e miRNAs; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Alex Augusto Biazotti

Desenvolvimento de Métodos de Detecção de ondas alfas; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Análise de Sistemas e Tecnologias da Informação) - Centro Estadual de Educação Tecnológica Paula Souza, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Giordano Bruno Sanches Seco

Análise de ondas alfas através do método matching pursuit; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

GERSON SANTOS DE ALMEIDA

Integração de transcriptomas e redes quimio-protéicas para avaliação de novos alvos protéicos para o tratamento de câncer de Estômago; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Raphael de Melo Borache

Agrupamento e Classificação de Fusos de Sono usando técnicas de Neuroinformática; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gustavo Luis da Silva

Agrupamento e Classificação de fusos do sono usando técnicas de neuroinformática; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Rodrigo Teixeira de Abreu

Integração de Transcriptomas e rede Quimio-protéica para avaliação de novos alvos protéicos para o tratamento de câncer de Pulmonar; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Nicolly Baptista Alves

Atividade de Formação Complementar: Capacitação em programas para aquisição de competências específicas (30h); 2023; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Lorraine Silva Requena

Monitoria Voluntária na disciplina de Física I; 2022; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Victor Garcez Batista

Atividade Observação em Laboratório na área de Bioinformática (30h); 2022; Orientação de outra natureza; (Ciências Biomédicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Isabella Mira da Silva

Atividade de Monitoria Voluntária na disciplina de Bioinformática; 2020; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Lorraine Silva Requena

Monitoria Voluntária na disciplina de Física I; 2020; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Jorge Henrique Faine Monteiro

MoNet: Um visualizador de redes molecurares em ambiente de realidade virtual; 2019; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Victor Santos Silva

Análise da rede de interação de pacotes da plataforma Bioconductor; 2019; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Luiz Miguel Alves de Oliveira

Estudo de vias alteradas de câncer de pulmão por meio de RNAseq; 2019; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gustavo Bortolanza de Andrade

Comparação de workflows de análise de RNA-seq; 2019; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Kevin Silva Muller

Comparação de workflows de enriquecimento funcional de RNA-seq; 2019; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Arthur Gasparindo Moreira

Análise de genes diferencialmente expressos com o protocolo Tuxedo; 2019; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Luiz Miguel Alves de Oliveira

Análise de miRNAs em câncer de pulmão; 2019; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gabriel Henrique Padilha de Campos

Monitoria Voluntária na disciplina de Termodinâmica e Mecânica Estatística; 2019; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Eduardo Osamu Ohashi

Monitoria Voluntária na disciplina de Física I; 2019; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Kevin Silva Muller

Capacitação em programas para aquisição de competências específicas na área de Bioinformática (30h); 2019; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Emerson Mosqueti

Atividade de Estágio Observacional de Capacitação em programas para aquisição de competências específicasna área de Bioinformática; 2019; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Isabella Mira da Silva

Atividade de Estágio Observacional de Capacitação em programas para aquisição de competências específicasna área de Bioinformática; 2019; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Aline Yumi Takata

Pocessamento de Sinais de Eletroencefalografia; 2018; Orientação de outra natureza; (Ciências Biomédicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Jomar Bena Galves Junior

Tomografia computadorizada e ressonância magnética aplicados no diagnóstico em casos de dissecção de aorta; 2015; Orientação de outra natureza; (Ciências Biomédicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Marcel wedii

Estudo de similaridades nas sequências de 5 cepas do Ebola; 2014; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, UNESP - AREX; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Roman Till Krämer

Aplicação da Técnica de Transcriptograma em Câncer de pulmão e mama; 2014; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, UNESP - AREX; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Daniela Korth

Estudo das limitações da Transformada de Gabor para detecção de Fusos do Sono; 2014; Orientação de outra natureza - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, UNESP - AREX; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Nela Jantol

Teoria da Informação aplicada à sequências de DNA de fungos; 2013; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP - AREX; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Luiza Leite de Castro Meira

Monitoria de Física das Radiações; 2013; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Rodrigo Teixeira de Abreu

Monitoria de Termodinâmica e Mecânica Estatística; 2013; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Edson José Comparetti

Monitoria de Fundamentos de Física (Biomedicina); 2013; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Marcel Rodrigues Ferreira

Monitoria de Fundamentos de Física (Biomedicina); 2013; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Rafael Toledo Fernandes de Souza

; Monitoria de Processamento e Análise de Sinais e Imagens Médicas; 2013; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Gustavo Luis da Silva

Monitoria de LaTeX para a disciplina de Processamento e Análise de Sinais e Imagens Médicas; 2012; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Mariana Andreazzi

Monitoria de LaTeX para a disciplina de Processamento e Análise de Sinais e Imagens Médicas; 2012; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Lucas Verdi Angelocci

Monitoria de LaTeX para a disciplina de Processamento e Análise de Sinais e Imagens Médicas; 2012; Orientação de outra natureza; (Física Médica) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Bruno Barbosa Affeldt

Construção de uma ferramenta web para integração rede protéica e transcriptoma; 2011; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Ben-hur Neves de Oliveira

Ferramenta de estadiamento de tumores baseada em informação de expressão gênica; 2011; Orientação de outra natureza; (Biotecnologia - Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Luís Henrique Trentin de Souza

Assinatura transcricional de tumores gliais; 2011; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jose Luiz Rybarczyk Filho;

Foi orientado por

Gunther Johannes Lewczuk Gerhardt

Classificação de Fusos de Sono por Técnicas Não-lineares; 2006; Dissertação (Mestrado em Medicina: Ciências Médicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Günther Johannes Lewczuk Gerhardt;

José Cláudio Fonseca Moreira

Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para análise de transcriptogramas; ; 2013; Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Jose Claudio Fonseca Moreira;

Johnny Ferraz Dias

Análise de Materiais por Feixes Iônicos: RBS e PIXE; 2004; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Pró Reitoria de Pesquisa; Orientador: Johnny Ferraz Dias;

Rita Maria Cunha de Almeida

Medida de performance metabólica usando a expressão gênica de genoma completo; 2011; Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rita Maria Cunha de Almeida;

Produções bibliográficas

  • CABRAL, HELENO CARMO BORGES ; PEDROLO, BRUNA GARCIA ; ANJOS, JOSIANE FONTOURA ; SAGRILLO, MICHELE RORATO ; GÓES, EVAMBERTO GARCIA ; RYBARCZYK FILHO, JOSÉ LUIZ ; SIMÃO, ÉDER MAIQUEL . Ferramenta em R para comparar padrões de expressão de vias metabólicas e proteínas associadas ao glioblastoma. Brazilian Journal of Development , v. 6, p. 3384-3395, 2020.

  • SECO, G. B. S. ; GERHARDT, G. J. L. ; BIAZOTTI, A. A. ; MOLAN, A. L. ; SCHÖNWALD, Suzana V ; Rybarczyk-Filho, J. L. . EEG alpha rhythm detection on a portable device. Biomedical Signal Processing and Control , v. 52, p. 97-102, 2019.

  • SOUZA, R. T. F. ; GERHARDT, Gunther J L ; SCHÖNWALD, Suzana V ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Lemke, N. . Synchronization and Propagation of Global Sleep Spindles. Plos One , v. 11, p. e0151369, 2016.

  • FERREIRA, RICARDO M. ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; DALMOLIN RJS ; Castro, Mauro A. A. ; Moreira, José C. F. ; BRUNNET, LEONARDO G. ; DE ALMEIDA, RITA M. C. . Correction: Preferential Duplication of Intermodular Hub Genes: An Evolutionary Signature in Eukaryotes Genome Networks. Plos One , v. 10, p. e0118425, 2015.

  • Albanus, Ricardo D'Oliveira. ; Rodrigo J. S. Dalmolin ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Mauro A. A. Castro ; MOREIRA, J. C. F. . Differential evolutionary constraints in the evolution of chemoreceptors: a murine and human case study. The Scientific World Journal , v. 2014, p. Article ID 6964-9, 2014.

  • GERHARDT, G. J. L. ; LEMKE, NEY ; CARVALHO, D. Z. ; de Santa-Helena, Emerson L. ; SCHÖNWALD, SUZANA V ; DALLAGUSTIN, G. ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz . Analysis of EEG Sleep Spindle Parameters from Apnea Patients Using Massive Computing and Decision Tree. Scientia cum Industria , v. 2, p. 15-18, 2014.

  • Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Ferreira, R. M. ; Dalmolin, R. J. S. ; Mauro A. A. Castro ; Leonardo Gregory Brunnet ; MOREIRA, J. C. F. ; de Almeida, R. M. C. . Preferential Duplication of Intermodular Hub Genes: An Evolutionary Signature in Eukaryotes Genome Networks. Plos One , v. 8, p. e56579, 2013.

  • Zeidán-Chuliá, Fares ; Gelain, Daniel P. ; Kolling, E. A. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Ambrosi, P. ; Terra, S. R. ; Simões-Pires, A. ; ROCHA, J. B. T. ; Behr, G. A. ; MOREIRA, J. C. F. . Major components of energy drinks (caffeine, taurine, and guarana) exert cytotoxic effects on human neuronal SH-SY5Y cells by decreasing reactive oxygen species production. Oxidative Medicine and Cellular Longevity (Print) , v. 2013, p. 791795-22, 2013.

  • Zeidán-Chuliá, Fares ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; SALMINA, ALLA B. ; OLIVEIRA, BEN-HUR NEVES ; NODA, MAMI ; MOREIRA, JOSÉ CLÁUDIO F. . Exploring the Multifactorial Nature of Autism Through Computational Systems Biology: Calcium and the Rho GTPase RAC1 Under the Spotlight. NeuroMolecular Medicine , v. 15, p. 364-383, 2013.

  • Gerhardt, G.J.L. ; TAKEDA, A. A. S. ; ANDRIGHETTI, T. ; Sartor, Ivaine T. S. ; LAGUNA, S. E. ; SILVA, S. A. E. ; Santos, L. dos ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Triplet entropy analysis of hemagglutinin and neuraminidase sequences measures influenza virus phylodynamics. Gene (Amsterdam) , v. 528, p. 277-281, 2013.

  • CAMILO, E. ; BOVOLENTA, L. A. ; Acencio, M. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Mauro A. A. Castro ; MOREIRA, J. C. F. ; Lemke, N. . GALANT: a Cytoscape plugin for visualizing data as functional landscapes projected onto biological networks. Bioinformatics (Oxford. Print) , v. 29, p. 2505-2506, 2013.

  • Rybarczyk-Filho, J. L. ; Zeidán-Chuliá, Fares ; Gursoy, M. ; Könönen, E. ; Uitto, V. J. ; Gursoy, O. V. ; Cakmakci, L. ; MOREIRA, J. C. F. ; Gursoy, U. K. . Bioinformatical and in vitro approaches to essential oil-induced matrix metalloproteinase inhibition. Pharmaceutical Biology , v. 50, p. 675-686, 2012.

  • Petronilho F. ; Vuolo, F. ; Galant, L. S. ; Constantino, L. ; Tomasi, C. D. ; Giombelli, V. R. ; Souza, C. T. ; da Silva, S. ; Barbeiro, D. F. ; Soriano, F. G. ; Streck, E. L. ; Ritter, C. ; ZANOTTO-FILHO, A. ; PASQUALI, M. A. B. ; Gelain, Daniel P. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; MOREIRA, J. C. F. ; Block, N. L. ; Roesler, R. ; Schwartsmann, G. ; Schally, A. V. ; Dal-Pizzol, F. . Gastrin-Releasing Peptide Receptor Antagonism Induces Protection from Lethal Sepsis: Involvement of Toll-like Receptor 4 Signaling. Molecular Medicine (Cambridge, Mass. Print) , v. 18, p. 1209-1219, 2012.

  • Rabelo, Thallita Kelly ; Zeidán-Chuliá, Fares ; Vasques, Laura Milán ; dos Santos, João Paulo Almeida ; da Rocha, Ricardo Fagundes ; Pasquali, Matheus Augusto de Bittencourt ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Araújo, Adriano Antunes Souza ; Moreira, José Claudio Fonseca ; Gelain, Daniel Pens . Redox characterization of usnic acid and its cytotoxic effect on human neuron-like cells (SH-SY5Y). Toxicology in Vitro , v. 26, p. 304-314, 2012.

  • Dalmolin, R. J. S. ; Mauro A. A. Castro ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Souza, Luis H. T. ; de Almeida, R. M. C. ; MOREIRA, J. C. F. . Evolutionary plasticity determination by orthologous groups distribution. Biology Direct , v. 6, p. 1-18, 2011.

  • Rybarczyk-Filho, J. L. ; Castro, M. A. A. ; Dalmolin, R. J. S. ; MOREIRA, J. C. F. ; Brunnet, L. G. ; de Almeida, R. M. C. . Towards a genome-wide transcriptogram: the Saccharomyces cerevisiae case. Nucleic Acids Research , v. 39, p. 3005-3016, 2011.

  • Santos, L. dos ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Gerhardt, G.J.L. . Triplet Entropy in H1N1 Virus. TEMA. Tendências em Matemática Aplicada e Computacional , v. 12, p. 253-261, 2011.

  • Mauro A. A. Castro ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Rodrigo J. S. Dalmolin ; Marialva Sinigaglia ; MOREIRA, J. C. F. ; José C. M. Mombach ; Rita M. C. de Almeida . ViaComplex: software for landscape analysis of genome maintenance mechanisms. Bioinformatics (Oxford. Print) , v. 25, p. 1468-1469, 2009.

  • Santa_Helena E. L. ; SCHÖNWALD, Suzana V ; Karina C. da Motta Dall'Agno ; Rossato R. ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; CHAVES, Márcia L F ; GERHARDT, Gunther J L . Detectando Eventos de Curta Duração em EEG usando Banco de Séries e Técnicas de Similaridade. Scientia Plena , v. 5, p. 109901-1-109901-7, 2009.

  • SHUBEITA, S M ; SANTOS, C e I dos ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; GIULIAN, R ; MEIRA, L ; SILVA, P R ; AMARAL, L ; DIAS, J F ; YONEAMA, M L . Residual activity induced by ion bombardment on insulating samples. Nuclear Instruments & Methods in Physics Research. Section B, Beam Interactions with Materials and Atoms (Print) , v. 240, n.1-2, p. 297-302, 2005.

  • Laurita dos Santos ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; GERHARDT, Gunther J L ; Sartor, Ivaine T. S. . Exploring Triplet Entropy in HIV Sequences. In: Rubem P Mondaini. (Org.). BIOMAT 2011:International Symposium on Mathematical and Computational Biology. 1ed.: World Scientific Publishing Co., 2011, v. único, p. -.

  • Marialva Sinigaglia ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Rodrigo J. S. Dalmolin ; MOREIRA, J. C. F. ; Rita M. C. de Almeida ; Mauro A. A. Castro ; José C. M. Mombach ; Giovani R. Librelotto . Bioinformatics Analysis of Gene Networks Involved in Genomic Stability and Cancer. In: Helen C. Kristoff. (Org.). Cancer Biomarkers. 1ed.Nova York: Nova Science Publishers, Inc, 2010, v. , p. -.

  • MENDES, A. P. ; Jarola, G. M. ; OLIVEIRA, L. M. A. ; Gerhardt G. J. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Laurita dos Santos . Characterization of Electroencephalogram Obtained During the Resolution of Mathematical Operations Using Recurrence Quantification Analysis. In: XXVII Brazilian Congress on Biomedical Engineering (CBEB 2020), 2020, Vitória. Anais do XXVII Brazilian Congress on Biomedical Engineering (CBEB 2020), 2020.

  • MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Desenvolvimento e Comparação de Algoritmos para a organização Hierárquica de Redes. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, Botucatu. Anais do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 117-121.

  • MOREIRA, A. G. ; MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Desenvolvimento de um preditor de prognóstico em Neuroblastoma.. In: XXXIII Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2021, Botucatu. Anais do XXXIII Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2021.

  • ARRUDA., G. A. N. ; GERHARDT, Gunther J L ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Desenvolvimento de aplicativo para integração do raspberry pi e epoc+. In: XI Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2015, Botucatu. Anais do XI Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2015.

  • OLIVEIRA, L. M. A. ; BIAZOTTI, A. A. ; GERHARDT, Günther J L ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Análise de desempenho do wavefinder em diferentes tecnologias de processamento de dados. In: XI Congresso de Física Aplicado à Medicina, 2015, Botucatu. Anais do XI Congresso de Física Aplicado à Medicina, 2015.

  • SECO, G. B. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Aplicação do Método Matching Pursuit para detecção de ondas alfas obtidas com o epoc+. In: XXVII Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2015, Botucatu. Anais do XXVII Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2015.

  • OLIVEIRA, L. M. A. ; BIAZOTTI, A. A. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Análise de desempenho do Wavefinder em diferentes tipos de computadores. In: XXVII Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2015, Botucatu. Anais do XXVII Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2015.

  • ARRUDA., G. A. N. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Integração do Neuroheadset EPOC+ com o Raspberry pi. In: XXVII Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2015, Botucatu. Anais do XXVII Congresso de Inciação Científica da UNESP, 2015.

  • BIAGI-JUNIOR, C. A. O. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Prediction of new chemotherapeutic targets for the treatment of breast cancer based on network topologies. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, Botucatu. Livro de Resumos do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 20-20.

  • SOUZA, R. T. F. ; Suzana V. Schowald ; Gerhardt, G.J.L. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Lemke, N. . Chirp Evaluation of Sleep Spindles in polyssomnograms. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, BOTUCATU. Livro de Resumos do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 65-66.

  • GAVA, V. A. ; GERHARDT, Gunther J L ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Using Raspberry Pi, a Android Smartphone as an EEG Signal Processing ManMachine Interface.. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, BOTUCATU. Livro de Resumos do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 99-99.

  • ALMEIDA, G. S. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Search New Protein Targets of Chemotherapeutics to Treatment of Gastric Cancer.. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, Botucatu. Livro de Resumos do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 110-11.

  • PILAN, J. R. ; ANDRIGHETTI, T. ; GERHARDT, Gunther J L ; TAKEDA, A. A. S. ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . METANO: a software for analysis of metagenome based on N-entropies and GC-content. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, Botucatu. Livro de Resumos do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 114-115.

  • BORACHE, R. M. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Structural characteristics of sleep spindles. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, Botucatu. Livro de Resumos do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 116-116.

  • SECO, G. B. S. ; Gerhardt G. J. L. ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Detection of Alpha Waves Using the Matching Pursuit Method. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, Botucatu. Livro de Resumos do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 126-127.

  • BIAZOTTI, A. A. ; Gerhardt G. J. L. ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . WaveFinder: Software for signal analysis of eletroctroencephalogram. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, Botucatu. Livro de Resumos do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 130.

  • WEDII, M. F. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Triplet entropy for comparison of different species of Ebola. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, Botucatu. Livro de Resumos do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 137-138.

  • ANDRIGHETTI, T. ; Gerhardt G. J. L. ; TAKEDA, A. A. S. ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Application of sequence organization patterns for taxonomic identification of metagenomes. In: X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014, Botucatu. Livro de Resumos do X Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2014. v. 1. p. 139-140.

  • GAVA, V. A. ; GERHARDT, Gunther J L ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Lemke, N. . Integração do Sistema Operacional Android e Raspberry PI para Possíveis Aplicações para Pessoas Portadores de Deficiências.. In: XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014, Botucatu. Anais do XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014.

  • BORACHE, R. M. ; Gerhardt, G.J.L. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . CARACTERIZAÇÃO DE UMA AMOSTRA DE FUSOS DO SONO DE INDIVÍDUOS SAUDÁVEIS. In: XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014, Botucatu. Anais do XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014.

  • SECO, G. B. S. ; Gerhardt G. J. L. ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . DETECÇÃO DE ONDAS ALFA UTILIZANDO O MÉTODO MATCHING PURSUIT. In: XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014, Botucatu. Anais do XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014.

  • ALMEIDA, G. S. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Procurando similaridades em alvos proteicos de quimioterapicos utilizados em tratamento de Câncer Gástrico.. In: XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014, Botucatu. Anais do XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014.

  • BIAGI-JUNIOR, C. A. O. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Predição de novos alvos quimioterápicos para o tratamento de câncer de mama baseado em centralidades de rede. In: XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014, Botucatu. Anais do XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014.

  • MOLAN, A. L. ; BIAGI-JUNIOR, C. A. O. ; ALMEIDA, G. S. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . DESENVOLVIMENTO DE UM ALGORITMO PARA ORGANIZAÇÃO HIERÁRQUICA DE REDES BIOLÓGICAS. In: XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014, Botucatu. Anais do XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014.

  • BIAZOTTI, A. A. ; Gerhardt G. J. L. ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . WAVEFINDER: SOFTWARE PARA ENCONTRAR FREQUÊNCIAS CEREBRAIS. In: XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014, Botucatu. Anais do XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014.

  • SOUZA, R. T. F. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; GERHARDT, Gunther J L ; Suzana V. Schowald ; HELENA, Emerson L Santa ; Lemke, N. . Correlações de fusos do sono em exames de pacientes com suspeita de apneia obstrutiva do sono. In: XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, 2013, São Pedro. Anais do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica. Natal: Associação Brasileira de Física Médica, 2013. v. 1. p. 1.

  • SOUZA, R. T. F. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; SILVA, M. V. ; GERHARDT, Gunther J L ; SCHÖNWALD, Suzana V ; HELENA, Emerson L Santa ; Lemke, N. . Utilização do Matching Pursuit para sinais de EEG com diferentes amostragens. In: XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, 2013, São Pedro. Anais do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica. Natal: Associação Brasileira de Física Médica, 2013. v. 1. p. 1.

  • BIAGI-JUNIOR, C. A. O. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Predição de Novos Alvos Quimioterápicos para o Tratamento de Câncer de Mama Baseado em Topologias de Redes. In: XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, 2013, São Pedro. Anais do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica. Natal: Associação Brasileira de Física Médica, 2013. v. 1. p. 1.

  • ANDRIGHETTI, T. ; GERHARDT, Gunther J L ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Análise de sequencias de microorganismos do trato digestivo obtidas por metagenômica. In: XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, 2013, São Pedro. Anais do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica. Natal: Associação Brasileira de Física Médica, 2013. v. 1. p. 1.

  • MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Análise de Expressão Gênica de Câncer: Integração de rede e transcriptoma. In: XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, 2013, São Pedro. Anais do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica. Natal: Associação Brasileira de Física Médica, 2013. v. 1. p. 1.

  • SILVA, G. L. ; GERHARDT, Gunther J L ; Suzana V. Schowald ; HELENA, Emerson L Santa ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Comparação de Fusos do Sono: Métodos automáticos vs. perito. In: XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, 2013, São Pedro. Anais do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica. Natal: Associação Brasileira de Física Médica, 2013. v. 1. p. 1.

  • SOUZA, R. T. F. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; HORTENCIO, F. B. ; SCHÖNWALD, Suzana V ; CARVALHO, D. Z. ; HELENA, Emerson L Santa ; GERHARDT, Gunther J L ; Lemke, N. . Análise de Autocorrelação de Fusos do Sono em Diferentes Canais de Eletroencefalogramas. In: VIII Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2012, Botucatu. Anais do VIII CONFIAM, 2012.

  • ABREU, R. T. ; Zeidán-Chuliá, Fares ; MOLAN, A. L. ; Oliveira, B. N. ; MOREIRA, J. C. F. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . NETKILL: Predição de Novos Alvos para o Tratamento de Câncer Baseado em Topologia de Redes. In: VIII Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2012, Botucatu. Anais do VIII CONFIAM, 2012.

  • MOLAN, A. L. ; ABREU, R. T. ; Zeidán-Chuliá, Fares ; Oliveira, B. N. ; MOREIRA, J. C. F. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Transtaging: Estadiamento de Câncer de Pulmão Baseado em Transcriptogramas. In: VIII Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2012, Botucatu. Anais do VIII CONFIAM, 2012.

  • Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Zeidán-Chuliá, Fares ; MOLAN, A. L. ; ABREU, R. T. ; MOREIRA, J. C. F. . Transcriptograma: Integração de redes protéicas e expressão gênica. In: VIII Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2012, Botucatu. Anais do VIII CONFIAM, 2012.

  • ANDRIGHETTI, T. ; SILVA, S. A. E. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Laurita dos Santos ; LAGUNA, S. E. ; Gerhardt G. J. L. ; Sartor, Ivaine T. S. . Analysis of DNA Sequences of HIV Virus Using Information Theory. In: International Society for Computational Biology - Latin America, 2012, Santiago. Anais of ISCB Latin-America2 012, 2012.

  • Borba, M. S ; GAMA, K. C. L. ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Mauro A. A. Castro . Caracterização de redes de interação protéica associadas ao desenvolvimento de melanoma. In: Feira de Iniciação Cientifica-ULBRA, 2008, Canoas. Revista de Iniciação Científica da ULBRA, 2008. v. 7. p. 47-51.

  • OLIVEIRA, L. C. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . A Disponibilidade de aceleradores lineares no Brasil em 2021. In: XVI CONFIAM - Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2021, Botucatu. Anais do XVI CONFIAM, 2021.

  • SEVERINO, F. E. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; GAMBARATO, V. T. S. . Uso de modelos de aprendizado de máquina para previsão de casos de COVID-19 no município de Botucatu/SP. In: 10ª JORNACITEC da Faculdade de Tecnologia de Botucatu - FATEC, 2021, Botucatu. Anais da X Jornada Científica e Tecnologia - JORNACITEC, 2021.

  • MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Neuroblastoma logistic regression for survival patients prediction. In: ISMB 2020 - International Society for Computational Biology, 2020, Montreal. Annals ISMB 2020 - International Society for Computational Biology, 2020.

  • MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Neuroblastoma Meta-Analysis for Gene Characterization of INSS Stages. In: X-Meeting 2019 - 15th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2019, Campos do Jordão. Anais X-Meeting 2019, 2019.

  • Faine-Monteiro, J. H. ; PILAN, J. R. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . MONET - SMARTPHONE APPLICATION FOR VIEWING MOLECULAR INTERACTIONS IN VIRTUAL REALITY ENVIRONMENT. In: X-Meeting 2019 - 15th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2019, Campos do Jordão. Anais X-Meeting 2019, 2019.

  • SECO, G. B. S. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . A Network-Based Approach to Study lncRNA associated with Posttranscriptional Regulation Pathways in Hepatocites Treated with Anticancer Drugs Through the Use of Outdated Microarray Data. In: X-Meeting 2019 - 15th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2019, Campos do Jordão. Anais X-Meeting 2019, 2019.

  • BONANCA, G. M. ; PILAN, J. R. ; GERHARDT, G. J. L. ; SCHÖNWALD, Suzana V ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Desenvolvimento de uma ferramenta em R para análise e visualização de sinais de eletroencefalograma. In: 21 Encontro Nacional de Biomedicina, 2018, Botucatu. Anais do 21 Encontro Nacional de Biomedicina, 2018.

  • MOLAN, A. L. ; SECO, G. B. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . EntropyClusterGenes: Um pacote R para análise de enriquecimento funcional quanto à atividade e diversidade gênica. In: IV WorkBiotech, 2018, Botucatu. Anais do IV WorkBiotech, 2018.

  • SECO, G. B. S. ; MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Meta-análise comparativa de antineoplásicos revela potêncial regulação pós-transcricional por lncRNAs em hepatócitos de homo sapiens. In: IV WorkBiotech, 2018, Botucatu. Anais do IV WorkBiotech, 2018.

  • PILAN, J. R. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . LEVI: Um pacote em R para visualização de dados de expressão em redes biológicas. In: IV WorkBiotech, 2018, Botucatu. Anais do IV WorkBiotech, 2018.

  • BONANCA, G. M. ; GERHARDT, Günther J L ; SCHÖNWALD, Suzana V ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Avaliação de ritmos cerebrais durante a realizaçao de operações matemáticas. In: IV WorkBiotech, 2018, Botucatu. Anais do IV WorkBiotech, 2018.

  • Otoni. J. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Desenvolvimento de aparalho móvel de baixo custo para captura de biopotenciais. In: 21 Encontro Nacional de Biomedicina, 2018, Botucatu. Anais do 21 Encontro Nacional de Biomedicina, 2018.

  • Otoni. J. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Desenvolvimento de um aparelho de eletroencefalografia mobile de baixo custo. In: XIV Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2018, Botucatu. Anais XIV Congresso de Física Aplicada à Medicina, 2018.

  • Otoni. J. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Projeto e Construção de dispositivo móvel para captura de biopotênciais de eletroencefalograma e eletro-oculograma de baixo custo. In: IV WorkBiotech, 2018, Botucatu. Anais IV WorkBiotech, 2018.

  • SECO, G. B. S. ; MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Determination of Biological Processes Altered by Antineoplastics According to Different Methodologies Reveals Complementarity of Results. In: 14th International Conference of the AB3C (X-meeting), 2018, São Pedro. Anais 14th International Conference of the AB3C (X-meeting), 2018.

  • MOLAN, A. L. ; SECO, G. B. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Functional enrichment analysis of Aedes aegypti and Drosophila melanogaster in the context of gene diversity and activity. In: 14th International Conference of the AB3C (X-meeting), 2018, São Pedro. Anais 14th International Conference of the AB3C (X-meeting), 2018.

  • SECO, G. B. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Análise Modular de Tumores usando Aprendizado de Máquina Não Supervisionado. In: 9o Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Genética), 2018, Botucatu. Anais do 9o Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Genética), 2018.

  • MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Construção de um Modelo Preditivo para o Prognóstico de Pacientes com Neuroblastoma baseado em Assinaturas Transcricionais. In: 9o Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Genética), 2018, Botucatu. Anais do 9o Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Genética), 2018.

  • PILAN, J. R. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . LEVI - An R package for integration of networks and gene expression data. In: 14th International Conference of the AB3C (X-meeting), 2018, São Pedro. Anais 14th International Conference of the AB3C (X-meeting), 2018.

  • PILAN, J. R. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . LEVI - An R package for integration of networks and gene expression data. In: 14th International Conference of the AB3C (X-meeting), 2018, São Pedro. Anais 14th International Conference of the AB3C (X-meeting), 2018.

  • PILAN, J. R. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . LEVI ? AN R PACKAGE FOR INTEGRATION OF NETWORKS AND GENE EXPRESSION DATA. In: X- Meeting 2018 - 14th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2018, São Pedro. Anais X-Meeting 2018, 2018.

  • MOLAN, A. L. ; SECO, G. B. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Functional enrichment analysis of Aedes aegypti and Drosophila melanogaster in the context of gene diversity and activity. In: X- Meeting 2018 - 14th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2018, São Pedro. Anais X-Meeting 2018, 2018.

  • SECO, G. B. S. ; MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Functional Enrichment Analysis by MEA and GSEA Techniques Reveals Convergence and Complementarity in the Study of Antineoplastics. In: X- Meeting 2018 - 14th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2018, São Pedro. Anais X-Meeting 2018, 2018.

  • BIAZOTTI, A. A. ; MOLAN, A. L. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Fernandes, T. M. . RTranscriptogram: a tool for biological data integration. In: 13th International Conference of the AB3C, 2017, São Pedro. Anais do 13th International Conference of the AB3C, 2017.

  • MOLAN, A. L. ; SECO, G. B. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . EntropyClusterGenes: a R package for clustering genes according ontologies and pathways. In: 13th International Conference of the AB3C, 2017, São Pedro. Anais 13th International Conference of the AB3C, 2017.

  • SECO, G. B. S. ; MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Comparison of bioinformatics approaches to evaluate altered GO processes in in vivo and in vitro studies of antineoplastics of OPEN TG-GATEs online database,. In: 13th International Conference of the AB3C, 2017, São Pedro. Anais 13th International Conference of the AB3C, 2017.

  • GRASSI, R. A. E. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Hussni, C. A. . Objective evaluation of the horse's hoof expansion in locomotion. In: 9th IUPAP International Conference on Biological Physics, 2017, Rio de Janeiro. Anais 9th IUPAP International Conference on Biological Physics, 2017.

  • Florentino, J. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Avaliação da Toxicidade de Estatinas no Rim e Fígado de Rattus novergicus in vivo utilizando a Base de dados Drugmatrix. In: XXIX Congresso de Iniciação Científica da UNESP (primeira fase), 2017, Botucatu. Anais XXIX Congresso de Iniciação Científica da UNESP (primeira fase), 2017.

  • Florentino, J. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Avaliação da Toxicidade de Estatinas no Rim e Fígado de Rattus novergicus in vivo utilizando a Base de dados Drugmatrix. In: XXIX Congresso de Iniciação Científica da UNESP (Segunda Fase), 2017, Bauru. Anais XXIX Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2017.

  • Florentino, J. ; SECO, G. B. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Evaluation of the toxicity of statins on the kidney and liver from Rattus norvegicus in vivo using DrugMatrix Database. In: XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2017, Águas de Lindóia. Anais XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2017.

  • SECO, G. B. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Meta analysis of toxicogenomic data of Homo sapiens and Rattus norvegicus: an evaluation of antineoplastics and non steroidal anti-inflammatory drugs. In: XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2017, Águas de Lindóia. Anais XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2017.

  • MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Analysis of functionally associated genes (gfags) of aedes aegypti infected with dengue. In: XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2017, Águas de Lindóia. Anais XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2017.

  • PILAN, J. R. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Development of a method of taxonomic classification of metagenomic data. In: XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2017, Águas de Lindoia. Anais XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2017.

  • BIAZOTTI, A. A. ; TAKEDA, A. A. S. ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz . Application of the Transcriptograma Method in Lung Cancer Smokers. In: XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2017, Águas de Lindóia. Anais XLVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2017.

  • BIAZOTTI, A. A. ; MOLAN, A. L. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Desenvolvimento de ferramentas de análise de transcriptomas. In: XVI Workshop de Genética, 2016, Botucatu. anais do XVI Workshop de Genética, 2016.

  • PILAN, J. R. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Aplicação de metodologia baseada em n-entropias e concentração guanina-citosina para o gênero Escherichia. In: XVI Workshop de Genética, 2016, Botucatu. anais do XVI Workshop de Genética, 2016.

  • CRESTE, G. A. ; GERHARDT, Gunther J L ; Suzana V. Schowald ; Rybarczyk-Filho, J. L. . To infinity and Beyond - your head in control. In: World Congress on Brain, Behaviour and Emotions, 2016, Buenos Aires. Anais World Congress on Brain, Behaviour and Emotions, 2016.

  • BIAGI-JUNIOR, C. A. O. ; BATRA, R. ; BAUMBACH, J. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Meta-analysis of Japanese Toxicogenomics data: differences between in vivo and in vitro models. In: 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C),, 2016, Belo Horizonte. Anais do 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C),, 2016.

  • BIAZOTTI, A. A. ; TAKEDA, A. A. S. ; MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . R-Transcriptogram: a tool for integrate networks and microarray data. In: The fourth International Society for Computational Biology Latin America Bioinformatics Conference (ISCB-LA), 2016, Buenos Aires. Anais The fourth International Society for Computational Biology Latin America Bioinformatics Conference (ISCB-LA), 2016.

  • TAKEDA, A. A. S. ; PILAN, J. R. ; GERHARDT, G. J. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Development of a new tool based on compositional method for identification of bacterial genomes. In: The fourth International Society for Computational Biology Latin America Bioinformatics Conference (ISCB-LA), 2016, Buenos Aires. Anais The fourth International Society for Computational Biology Latin America Bioinformatics Conference (ISCB-LA), 2016.

  • SECO, G. B. S. ; GERHARDT, Günther J L ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Detecção de ondas alfas obtidas com o EPOC+. In: XI Congresso de Física Aplicado à Medicina, 2015, Botucatu. Anais do XI Congresso de Física Aplicado à Medicina, 2015.

  • SECO, G. B. S. ; GERHARDT, Günther J L ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Aplicação do matching pursuit na busca de ondas alfas. In: XX Congresso Brasileiro de Física Médica e Simpósio Internacional de Proteção Radiológica em Medicina, 2015, Rio de Janeiro. Anais do XX Congresso Brasileiro de Física Médica e Simpósio Internacional de Proteção Radiológica em Medicina, 2015.

  • PILAN, J. R. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Metano: Metagenomics analysis software based on n-entropies. In: Workshop Innovation & Entrepreneurship in Biotechnology, 2015, Botucatu. Annals Innovation & Entrepreneurship in Biotechnology, 2015. p. 7-7.

  • BIAZOTTI, A. A. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Study of transcriptional signature in cancer: development of computational tools in cuda language for integration transcriptome and biological networks. In: Workshop Innovation & Entrepreneurship in Biotechnology, 2015, Botucatu. Annals Innovation & Entrepreneurship in Biotechnology, 2015. p. 8-8.

  • PILAN, J. R. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Comparison of binning softwares in metagenomic sequences from human gut microbial. In: X-meeting 2015, 2015, São Paulo. Proceedings X-meeting 2015, 2015. p. 18-18.

  • MOLAN, A. L. ; DREYER, C. S. ; SOUZA-NETO, J. A. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Functional Analysis of Protein Networks from Aedes aegypti. In: X-meetings 2015, 2015, São Paulo. Proceedings X-meeting 2015, 2015. p. 118-118.

  • BIAZOTTI, A. A. ; MOLAN, A. L. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Development of new models of proteins network clustering for transcrptogram methodology. In: X-meeting 2015, 2015, São Paulo. Proceedings X-meeting 2015, 2015. p. 163-163.

  • BIAGI-JUNIOR, C. A. O. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Expression gene levels display differences between in vivo and in vitro models. In: X-meeting 2015, 2015, São Paulo. Proceedings X-meeting 2015, 2015. p. 221-221.

  • BAU, C. E. G. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; PORTA, L. D. ; SIMAO, E. M. . Análise de fatores de corte do valor p e mudança de expressão na expressão gênica em glioblastoma. In: XIX SEPE Simpósio de Ensino e Pesquisa e Extensão, 2015, Santa Maria. Anais do XIX SEPE, 2015.

  • VIEIRA, S. A. G. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; SIMAO, E. M. . Sistema computacional de pesquisa de proteínas envolvidas nas vias de manutenção do genoma e relacionamentos com doenças genéticas. In: XIX SEPE Simpósio de Ensino, Pesquisa e Extensão, 2015, Santa Maria. Anais do XIX SEPE, 2015.

  • MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Modular and Functional analysis of non-model organisms protein networks. In: 23rd IUBMB and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology-SBBq, 2015, Foz do Iguaçu. Abstract Book of 23rd IUBMB and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology-SBBq, 2015.

  • TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Lemke, N. . Differential gene expression analysis of KPNA genes in Human embryogenesis. In: 23rd IUBMB and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology-SBBq, 2015, Foz do Iguaçu. Abstract Book of 23rd IUBMB and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology-SBBq, 2015.

  • PILAN, J. R. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Comparação de metodologias de binning em sequências de metagenômica. In: XV Workshop de Genética, 2015, Botucatu. Anais do XV Workshop de Genética, 2015.

  • MOLAN, A. L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Análise modular e funcional de redes protéicas de Rattus norvegicus, Aedes aegypti e Anopheles gambiae. In: XV Workshop de Genética, 2015, Botucatu. Anais do XV Workshop de Genética, 2015.

  • ANDRIGHETTI, T. ; GERHARDT, Gunther J L ; TAKEDA, A. A. S. ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . Microbial species Identification through a signature based methodology. In: III International Workshop on Environmental Microbiology, 2014, Belo Horizonte. Abstracts Book of III International Workshop on Environmental Microbiology. Belo Horizonte: AB3C, 2014. v. 1. p. 10-11.

  • SOUZA, R. T. F. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; SILVA, M. V. ; GERHARDT, Gunther J L ; SCHÖNWALD, Suzana V ; HELENA, Emerson L Santa ; Lemke, N. . Phase synchronization evaluation in sleep spindles coincident at different EEG channels. In: 30th International Congress of Clinical Neurophysiology, 2014, Berlin. Abstracts Book 30th International Congress of Clinical Neurophysiology. Berlin: IFCN, 2014. v. 1. p. 1039-1040.

  • TAKEDA, A. A. S. ; Gerhardt, G.J.L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Triplet Entropy Analysis and Molecular Modeling of Hemagglutinin as Tools for Understanding Influenza Virus Phylodynamics. In: VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2014, Petrópolis. Anais do VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. Petrópolis: LNCC, 2014. v. 1. p. 96-96.

  • BIAZOTTI, A. A. ; Gerhardt G. J. L. ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz . WaveFinder: a tool for signal processing using Neuroheadsets and Android System. In: XVIII Congresso on Nonequilibrium Statistical Mechanics and Nonlinear Physics, 2014, Maceió. Anais do XVIII Congresso on Nonequilibrium Statistical Mechanics and Nonlinear Physics. v. 1. p. 40-40.

  • SOUZA, R. T. F. ; Gerhardt G. J. L. ; Suzana V. Schowald ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Lemke, N. . Sleep Spindle Chirp Analysis in EEG control examinations. In: XVIII Congresso on Nonequilibrium Statistical Mechanics and Nonlinear Physics, 2014, Maceió. Anais do XVIII Congresso on Nonequilibrium Statistical Mechanics and Nonlinear Physics, 2014. v. 1. p. 25-25.

  • Gerhardt G. J. L. ; Suzana V. Schowald ; HELENA, Emerson L Santa ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . The role of short-time chirps in EEG. In: XVIII Congresso on Nonequilibrium Statistical Mechanics and Nonlinear Physics, 2014, Maceió. Anais do XVIII Congresso on Nonequilibrium Statistical Mechanics and Nonlinear Physics, 2014. v. 1. p. 26-26.

  • TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Lemke, N. . Expression Levels Of Kpna Genes In Human Embryogenegis. In: III ISCB-LAtin America, X-meeting in Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014, Belo Horizonte. Anais do III ISCB-LAtin America, X-meeting in Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014. v. 1. p. G07-G07.

  • ANDRIGHETTI, T. ; Gerhardt G. J. L. ; TAKEDA, A. A. S. ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Identification of metagenomic data by genome signatures and n-entropy analysis. In: III ISCB-LAtin America, X-meeting in Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014, Belo Horizonte. Anais do III ISCB-LAtin America, X-meeting in Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014. v. 1. p. J07-J06.

  • PILAN, J. R. ; ANDRIGHETTI, T. ; Gerhardt, G.J.L. ; TAKEDA, A. A. S. ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . METANO: Metagenomics Analysis based on N-entropies and GC content. In: III ISCB-LAtin America, X-meeting in Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014, Belo Horizonte. Anais do III ISCB-LAtin America, X-meeting in Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014. v. 1. p. J12-J12.

  • ALMEIDA, G. S. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Using System Biology to Predict New Targets for Treatment of Cancer Gastric. In: III ISCB-LAtin America, X-meeting in Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014, Belo Horizonte. Anais do III ISCB-LAtin America, X-meeting in Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014. v. 1. p. A28-A28.

  • SCHÖNWALD, Suzana V ; CARVALHO, D. Z. ; DELLAGUSTIN, G. ; Lemke, N. ; de Santa-Helena, Emerson L. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; SEGAL, A. Z. ; GERHARDT, Günther J L . Sleep Spindles in obstructive sleep apnea: a summary of results. In: XXVI Congresso Brasileiro de Neurologia, 2014, Curitiba. Anais do XXVI Congresso Brasileiro de Neurologia, 2014.

  • GERHARDT, Gunther J L ; TAKEDA, A. A. S. ; ANDRIGHETTI, T. ; SILVA, S. A. E. ; LAGUNA, S. E. ; Laurita dos Santos ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Quantifiyng fylodynamics of Influenza Virus by means of Triplet Entropy. In: XXXVI Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada, 2013, Águas de Lindóia. Anais do XXXVI Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada, 2013. v. Unico. p. 10-10.

  • Rybarczyk-Filho, J. L. ; Acencio, M. L. ; Lemke, N. ; MOREIRA, J. C. F. . Development of a transcriptional staging for cancer by the transcriptogram method. In: XXXVI Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada, 2013, Águas de Lindóia. Anais do XXXVI Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada, 2013. v. unico. p. 10-10.

  • SOUZA, R. T. F. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Gerhardt G. J. L. ; SCHÖNWALD, Suzana V ; CARVALHO, D. Z. ; Santa_Helena E. L. ; Lemke, N. . Correlations map between sleep spindles analyzed with Matching Pursuit in EEG signals of sleep apnea patients. In: XXXVI Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada, 2013, Águas de Lindóia. Anais do XXXVI Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada, 2013. v. unico. p. 12-12.

  • Sartor, Ivaine T. S. ; Albanus, Ricardo D'Oliveira. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Mauro A. A. Castro ; Rodrigo J. S. Dalmolin ; MOREIRA, J. C. F. . Master Regulators of Pancreatic Cancer Transcriptional Network. In: XLI Reuniao Anual da SBBq, 2013, Foz do Iguaçu. Anais do XLI Reuniao Anual da SBBq, 2013. v. unico.

  • SOUZA, R. T. F. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; SCHÖNWALD, Suzana V ; HELENA, Emerson L Santa ; GERHARDT, Gunther J L ; Lemke, N. . Quantification of correlations between sleep spindles in EEG for patients with sleep apnea. In: 3rd IEEE International Conference on Computational Advances in Bio and Medical Sciences (ICCABS), 2013, New Orleans. Anais of ICCABS 2013. New Orleans: IEEE, 2013. v. único. p. 11-1.

  • Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Acencio, M. L. ; Lemke, N. . TRANSTAGING: Transcriptogram-based staging of cancer. In: 21st Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, 2013, Berlin. anais do 21st Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISCB: ISCB, 2013. v. 1. p. 10.

  • Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Acencio, M. L. ; Lemke, N. . TRANSTAGING: Transcriptogram-based staging of cancer. In: CAMDA 2013 Critical Assessment of Massive Data Analysis, 2013, Berlin. Anais do CAMDA 2013 Critical Assessment of Massive Data Analysis. Berlin: CAMDA, 2013. v. 1. p. 10-11.

  • ANDRIGHETTI, T. ; GERHARDT, Gunther J L ; Lemke, N. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Sequence organization as a potential tool for metagenomics. In: Anais of International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2013, Recife. AnaisInternational Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics. Sao Paulo: AB3C, 2013. v. 1. p. 10-10.

  • BIAGI-JUNIOR, C. A. O. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Discovery of new chemotherapeutics targets for the treatment of breast cancer. In: International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2013, Recife. Anais International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics. Sao Paulo: AB3C, 2013. v. 1. p. 11-11.

  • SOUZA, R. T. F. ; SILVA, M. V. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; GERHARDT, Gunther J L ; SCHÖNWALD, Suzana V ; HELENA, Emerson L Santa ; Lemke, N. . Phase synchronization in sleep spindles at different EEG channels. In: International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2013, Recife. Anais International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics. Sao Paulo: AB3C, 2013. v. 1. p. 12-12.

  • Rybarczyk-Filho, J. L. ; Zeidán-Chuliá, Fares ; MOREIRA, J. C. F. ; de Almeida, R. M. C. . Towards a genome-wide transcriptogram: the Homo sapiens case. In: XXXV Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada, 2012, Águas de Lindóia. Livro de Resumos do XXXV Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada, 2012. v. 1. p. x-x.

  • Dalmolin, R. J. S. ; Mauro A. A. Castro ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Souza, L. H. T. ; Oliveira, B. N. ; Brunnet, L. G. ; de Almeida, R. M. C. ; MOREIRA, J. C. F. . Transcriptional patterns as tumor biomarkers. In: XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012. v. unico. p. 1-1.

  • Albanus, Ricardo D'Oliveira. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Dalmolin, R. J. S. ; MOREIRA, J. C. F. . A System Biology Approach in the Evolution of the Chemosensory Receptors Networks in Mus musculus, Homo sapiens and Rattus norvegicus. In: XXXV Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012. v. unico. p. 1-1.

  • Kolling, E. A. ; Zeidán-Chuliá, Fares ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Simões-Pires, A. ; Behr, G. A. ; Gelain, Daniel P. ; MOREIRA, J. C. F. . Study of the Effects of the Main Components of Energy Drinks (Guarana, Caffeine and Taurine) in SH-SY5Y Cells. In: XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2012. v. unico. p. 1-1.

  • ANDRIGHETTI, T. ; SILVA, S. A. E. ; LAGUNA, S. E. ; Santos, L. dos ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Sartor, Ivaine T. S. ; GERHARDT, Gunther J L . Study of the Hemagglutinin differentiation in H1N1 and H3N2 virus using triplet entropy. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012, Campinas. Anais do 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.

  • CAMILO, E. ; Acencio, M. L. ; Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Lemke, N. . ViaComplex for Cytoscape: Visualizing data as functional landscapes projected onto gene network maps. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012, Campinas. Anais do 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.

  • Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Zeidán-Chuliá, Fares ; Salmina, A. B. ; Noda, M. ; MOREIRA, J. C. F. . Integrating proposed and novel putative gene-environment interactions within the autistic puzzle through a systems biology analysis. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012, Campinas. Anais do 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; AFFELDT, B. B. ; Zeidán-Chuliá, Fares ; MOREIRA, J. C. F. . PROGENET: an integrative protein/gene network web tool. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012, Campinas. Anais do 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.

  • Dalmolin, R. J. S. ; Castro, M. A. A. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Souza, L. H. T. ; Brunnet, L. G. ; de Almeida, R. M. C. ; MOREIRA, J. C. F. . Busca de Padrões Transcricionais como biomarcadores tumorais. In: III Mostra da Bioquímica - UFRGS, 2011, Porto Alegre. Livro de Resumos da III Mostra da Bioquímica, 2011. v. único. p. 25-25.

  • Rabelo, Thallita Kelly ; Zeidán-Chuliá, Fares ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; MOREIRA, J. C. F. ; Gelain, Daniel P. . Usnic acid increases reactive species formation: in silico and in vitro evidences on human neuron-like cells (SH-SY5Y). In: III Mostra da Bioquímica - UFRGS, 2011, Porto Alegre. Livro de Resumos da III Mostra da Bioquímica, 2011. v. unico. p. 28-28.

  • Kolling, E. A. ; Zeidán-Chuliá, Fares ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Simões-Pires, A. ; Behr, G. A. ; MOREIRA, J. C. F. ; Gelain, Daniel P. . Guaraná, Cafeina e Taurina como os três maiores componentes de bebidas energéticas: um estudo redox em células do tipo neuronais humanas. In: III Mostra da Bioquímica - UFRGS, 2011, Porto Alegre. Livro de Resumos da III Mostra da Bioquímica, 2011. v. unico. p. 41-41.

  • Souza, Luis H. T. ; Dalmolin, R. J. S. ; Castro, M. A. A. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; de Almeida, R. M. C. ; MOREIRA, J. C. F. . Estudo da Plasticidade evolutiva através da distribuição de grupos ortólogos. In: III Mostra da Bioquímica - UFRGS, 2011, Porto Alegre. Livro de Resumos da III Mostra da Bioquímica, 2011. v. unico. p. 62-62.

  • Albanus, Ricardo D'Oliveira. ; Rybarczyk-Filho, J. L. ; Dalmolin, R. J. S. ; MOREIRA, J. C. F. . Estudo da evolução dos receptores químicos nos organismos Mus musculus, Homo sapiens e Rattus norvegicus através de ferramentas de biologia de sistemas. In: III Mostra da Bioquímica - UFRGS, 2011, Porto Alegre. Livro de Resumos da III Mostra da Bioquímica, 2011. v. Unico. p. 73-73.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Mauro A. A. Castro ; Rodrigo J. S. Dalmolin ; MOREIRA, J. C. F. ; Leonardo Gregory Brunnet ; Rita M. C. de Almeida . Towards a genome-wide transcriptogram: from yeast to human. In: XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2010, Águas de Lindóia. XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2010.

  • Laurita dos Santos ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; GERHARDT, Gunther J L . Sequence complexity in h1n1 virus. In: XXXIII Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional, 2010, Águas de Lindóia. Livro de Resumos do XXXIII Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional, 2010. v. unico. p. 200-201.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Benetti, F. P. da C. ; Rodrigo J. S. Dalmolin ; MOREIRA, J. C. F. ; Leonardo Gregory Brunnet ; Rita M. C. de Almeida . Gene expression analysis of an ordered network: A serach for tumoral patterns. In: 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010, Ouro Preto. X-meeting abstracts book, 2010. v. 1. p. 166-166.

  • Rodrigo J. S. Dalmolin ; Mauro A. A. Castro ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Souza, L. H. T. ; Rita M. C. de Almeida ; MOREIRA, J. C. F. . Evolutionary plasticity index: A straightforward method to evaluate evolutionary plasticity based on orthologs distribution. In: 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010, Ouro Preto. X-meeting abstracts book, 2010. v. 1. p. 25-25.

  • Hoffmann, D. S. ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; GERHARDT, Gunther J L . Implications of low and high-frequency periodic perturbations in maps. In: Dynamics Days Europe, 2010, Bristol. Dynamics Days Europe, 2010. v. 1. p. 80-81.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Mauro A. A. Castro ; Rodrigo J. S. Dalmolin ; MOREIRA, J. C. F. ; Leonardo Gregory Brunnet ; Rita M. C. de Almeida . Expression Analysis on Interactome for Saccharomyces cerevisiae. In: 5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (X-meeting), 2009, Angra dos Reis/RJ. Livro de Resumos do X-meeting, 2009. v. 1. p. 83-83.

  • Benetti, F. P. da C. ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Leonardo Gregory Brunnet ; Mauro A. A. Castro ; Rita M. C. de Almeida . Modularidade e Expressão Gênica em Redes Protéicas. In: XXI Salão de Iniciação Científica, 2009, Porto Alegre. Resumos dos Trabalhos do XXI SIC, 2009. p. 38-38.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Mauro A. A. Castro ; Rita M. C. de Almeida . Metropolis Algorithm Modified for Protein Networks. In: Conference on Computational Physics, 2008, Ouro Preto. CCP 2008 Abstracts (CD), 2008.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Mauro A. A. Castro ; Rita M. C. Almeida . GNATT: Ferramentas de análise de redes gênicas/protéicas e ordenamento de interatomas. In: I Escola Brasileira de Bioinformática, 2008, Santo André. I Escola Brasileira de Bioinformática (CD), 2008.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Mauro A. A. Castro ; Leonardo Gregory Brunnet ; Rita M. C. de Almeida . Uma nova ferramenta para análise de Interatomas. In: VI MostraPG IF UFRGS, 2007, Porto Alegre. http://www.if.ufrgs.br/mostrapg/, 2007.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Rita M. C. Almeida ; Mauro A. A. Castro ; Leonardo Gregory Brunnet . A New Tool for Analysis of Interactome. In: BIOMAT International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2007, Armação dos Búzios. CD BIOMAT 2007, 2007.

  • GERHARDT, Gunther J L ; SCHÖNWALD, Suzana V ; CHAVES, Márcia L F ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; HELENA, Emerson L Santa . Are there Chirp-like Time-frequency Structures in Sleep Spindles?. In: XXIV Semana Cientifica do Hospital de Clinicas de Porto Alegre, 2006, Porto Alegre. Revista do HCPA,, 2006. v. 26. p. 109-109.

  • SCHÖNWALD, Suzana V ; GERHARDT, Gunther J L ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; CHAVES, Márcia L F ; HELENA, Emerson L Santa . Análise de Ondas em Dente de Serra de Sono por Transformada de Gabor. In: XXIV Semana Cientifica do Hospital de Clinicas de Porto Alegre, 2006, Porto Alegre. Revista do HCPA, 2006. v. 26. p. 109-109.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Santa_Helena E. L. ; Gerhardt G. J. L. ; Rossato R. ; Suzana V. Schowald ; Chaves M. L. F. . Classificação dos Fusos de Sono por meio de Análise de Dinamica Não-Linear. In: III Congresso Gaucho de Neurologia e Neurocirurgia, 2005, Bento Gonçalves. Revista da sociedade de Neurologia e Neurocirurgia do Rio Grande do Sul, 2005. v. 4. p. 19-19.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Santa_Helena E. L. ; Gerhardt G. J. L. ; Rossato R. ; Suzana V. Schowald ; Chaves M. L. F. . Características de Fusos de Sono representativas de noite inteira.. In: III Congresso Gaúcho de Neurologia e Neurocirurgia, 2005, Bento Gonçalves. Revista da Sociedade de Neurologia e Neurocirurgia do Rio Grande do Sul, 2005. v. 4. p. 20-20.

  • Suzana V. Schowald ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Santa_Helena E. L. ; Gerhardt G. J. L. ; Rossato R. ; Chaves M. L. F. . Redes Neurais aplicadas à Classificação de Fusos de Sono.. In: III Congresso Gaúcho de Neurologia e Neurocirurgia, 2005, Bento Gonçalves. Revista da Sociedade de Neurologia e Neurocirurgia do Rio Grande do Sul, 2005. v. 4. p. 19-19.

  • Suzana V. Schowald ; Santa_Helena E. L. ; Gerhardt G. J. L. ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Chaves M. L. F. . Teste de sensibilidade e especifidade do algorithmo Matching Pursuit para procura de Fusos de Sono.. In: III Congresso Gaúcho de Neurologia e Neurocirurgia, 2005, Bento Gonçalves. Revista da Sociedade de Neurologia e Neurocirurgia do Rio Grande do Sul, 2005. v. 4. p. 19-19.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Santa_Helena E. L. ; Gerhardt G. J. L. ; Suzana V. Schowald ; Chaves M. L. F. . Nonlinear approach to describe EEG Sleep Spindles.. In: XXVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2005, Santos. XXVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2005. v. 1. p. 57-58.

  • Santa_Helena E. L. ; Gerhardt G. J. L. ; Suzana V. Schowald ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Chaves M. L. F. . Symbolic dynamics in EEG Sleep Spindle intervals. In: XXVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2005, Santos. XXVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2005. v. 1. p. 243-243.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Gerhardt G. J. L. ; Suzana V. Schowald ; Chaves M. L. F. . Uma comparação das características de Fusos de Sono encontrados visualmente com os encontrados por Transformada de Gabor. In: Mostra INOVA UFRGS, 2005, Porto Alegre. Mostra Inova catalogo on-line, 2005. v. 1.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Santa_Helena E. L. ; Gerhardt G. J. L. ; Rossato R. ; Suzana V. Schowald ; Chaves M. L. F. . Estudo dos Fusos do Sono usando Delays. In: X congresso Brasileiro de Física Médica, 2005, Bahia. CD do X Congresso Brasileiro de Física Médica, 2005. v. unico.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; SCHÖNWALD, Suzana V ; HELENA, Emerson L Santa ; CHAVES, Márcia L F ; GERHARDT, Gunther J L . Autocorrelagram approach to Characterize Sleep Spindle. In: IX latin American Workshop on Nonlinear Phenomena (LAWNP), 2005, San Carlos de Bariloche. IX latin American Workshop on Nonlinear Phenomena 2005, 2005. p. 71.

  • GERHARDT, Gunther J L ; SCHÖNWALD, Suzana V ; HELENA, Emerson L Santa ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; CHAVES, Márcia L F . Comparação entre Métodos baseados em Matching Pursuit e Transformada de Gabor na procura de automática de Fusos de Sono. In: X Congresso Brasileiro de Sono, 2005, Curitiba. X Congresso Brasileiro de Sono, 2005.

  • HELENA, Emerson L Santa ; GERHARDT, Gunther J L ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; CHAVES, Márcia L F ; SCHÖNWALD, Suzana V . Finding Sleep Spindles using neural network with unsupervised learning in Gabor Transform. In: X Congresso Brasileiro de Sono, 2005, Curitiba. X Congresso Brasileiro de Sono, 2005.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; SCHÖNWALD, Suzana V ; CHAVES, Márcia L F ; GERHARDT, Gunther J L . Análise Espectral de Grafo-Elementos de um Políssonograma. In: IV Mostra da Pós Graduação da Física da UFRGS, 2005, Porto Alegre. Livro de Resumos da IV Mostra da Pós Graduação da Física da UFRGS, 2005. p. 26-27.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; GERHARDT, Gunther J L ; HELENA, Emerson L Santa ; SCHÖNWALD, Suzana V ; CHAVES, Márcia L F . Classification of EEG Transients with Dynamic Time Warping. In: XXIX Encontro Nacional da Fisica da Materia Condensada, 2005, São Lourenço. Anais (CD) do XXIX Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada, 2005.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; SHUBEITA, S. M. ; C.E.I. dos Santos ; R. Giulian ; J. F. Dias . Análise Elementar do Café. In: XVI Salão de Iniciação Científica e XIII Feira de Iniciação Científica, 2004, Porto Alegre. Livro de Resumos do XVI Salão de Iniciação Científica. Porto Alegre: Editora da UFRGS, 2004. v. unico. p. 345-345.

  • SHUBEITA, S. M. ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; C.E.I. dos Santos ; R. Giulian ; M. Y> Yoneama ; J. F. Dias . Atividade residual de amostras isolantes induzidas por bombardeamento ionico. In: XVI Salão de Iniciação Científica e XIII Feira de Iniciação Científica., 2004, Porto Alegre. Livro de resumos do XVI Salão de Iniciação Científic. Porto Alegre: Editora da UFRGS, 2004. v. unico. p. 345-345.

  • Schünemann, Lúcia Duclos ; J. F. Dias ; R. Giulian ; SHUBEITA, S. M. ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Grande, Pedro Luis . Presença de alumínio no leite em embalagens do tipo longa vida. In: XV Salão de Iniciação Científica e XII Feira de Iniciação Científica, 2003. Livro de Resumos do XV Salão de Iniciação Científica. Porto Alegre: Editora da UFRGS, 2003. v. unico.

  • SHUBEITA, S. M. ; R. Giulian ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; J. F. Dias . Medida da ingestão de metais pesados durante o ato de fumar. In: XV Salão de Iniciação Científica e XII Feira de Iniciação Científica, 2003, Porto Alegre. Livro de Resumos do XV Salão de Iniciação Científica. Porto Algre: Editora da UFRGS, 2003. v. unico.

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; R. Giulian ; SHUBEITA, S. M. ; J. F. Dias . Calibração do sistema PIXE do IF-UFRGS. In: XV Salão de Iniciação Científica e XII Feira de Iniciação Científica, 2003, Porto Alegre. Livro de Resumos do XV Salão de Iniciação Científica. Porto Alegre: Editora da UFRGS, 2003. v. unico.

  • Rybarczyk-Filho, J. L. . OpenLab - Laboratório de Estudos em Biocomplexidade. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • Rybarczyk-Filho, J. L. . Integração de dados biológicos e datamining. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz . Transcriptograma: Uma ferramenta para análise de expressão gênica. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • Rybarczyk-Filho, J. L. . Ordenamento de redes protéicas. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • Rybarczyk-Filho, J. L. . Transcriptogram Tool: Estudo do caso da E. coli. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz . Medidas de performance metabólica usando a expressão gênica de genoma completo. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Mauro A. A. Castro ; Rodrigo J. S. Dalmolin ; MOREIRA, J. C. F. ; Leonardo Gregory Brunnet ; Rita M. C. de Almeida . Expression analysis on interactome of Saccharomyces cerevisiae. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz . Aquisição de Sinal. 2007. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • Rybarczyk-Filho, José Luiz . Anais do X Congresso de Física Aplicada à Medicina 2014 (Anais do X Congresso de Física Aplicada à Medicina).

Outras produções

BIAZOTTI, A. A. ; MOLAN, A. L. ; TAKEDA, A. A. S. ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Rtranscriptogram: ferramenta de integração de dados para análise de redes e dados de expressão gênica. 2016.

BIAZOTTI, A. A. ; Gerhardt, G.J.L. ; Suzana V. Schowald ; Rybarczyk-Filho, J. L. . Wavefinder. 2015.

Mauro A. A. Castro ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Rodrigo J. S. Dalmolin ; Marialva Sinigaglia ; José C. M. Mombach ; MOREIRA, J. C. F. ; Rita M. C. de Almeida . ViaComplex. 2009.

RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Mauro A. A. Castro ; Rodrigo J. S. Dalmolin ; Leonardo Gregory Brunnet ; Rita M. C. de Almeida . Gnatt- Gene/Protein Network Analysis Tool for Tracing Interactome. 2009.

Mauro A. A. Castro ; RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Rita M. C. de Almeida . Karyocomplex : citogenetic diagnosis based on karyotipic complexity analysis.. 2008.

RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz ; Castro, M. A. A. ; Dalmolin, R. J. S. ; Leonardo Gregory Brunnet ; Bonatto, Diego ; MOREIRA, J. C. F. ; Rita M. C. de Almeida . Método, Sistema e Aparato de Análise de Dados de Expressão Gênica (Transcriptograma). 2011.

Rybarczyk-Filho, José Luiz . Convênio FATEC BOTUCATU - IBTEC UNESP. 2017. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Rybarczyk-Filho, J. L. . Neurociências. 2013. (Coordenação de Sessão - XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica).

Rybarczyk-Filho, J. L. . Informática Médica. 2013. (Coordenação de Sessão - XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica).

Rybarczyk-Filho, J. L. . Experimental Methods in Biophysics I. 2013. (Coordenação de Sessão - XXXVI Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada).

RYBARCZYK FILHO, Jose Luiz . Introdução a Wavelets. 2006. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Rybarczyk-Filho, José Luiz ; Lemke, N. ; FERNANDEZ, R. M. ; HORMAZA, J. M. ; COSTA, V. E. ; MIRANDA, J. R. A. ; FONTES, M. R. M. ; FERNANDES, M. A. R. . VIII CONFIAM - Entrevistas dos Convidados. 2012. Vídeo.

Projetos de pesquisa

  • 2015 - 2018

    Meta-análise do Projeto Toxicogenômico Japonês: diferenças entre modelos in vivo e in vitro, Descrição: É possível prever o potencial de toxicidade na fase inicial de desenvolvimento de medicamentos as empresas farmacêuticas podem evitar enormes perdas financeiras devido à retirada de medicamentos do ensaio clínico ou do mercado. Isso economiza recursos e estabiliza a gestão da empresa farmacêutica. Além disso, o desenvolvimento eficiente de drogas mais seguras é a missão social para as empresas farmacêuticas.Recentemente, o afunilamento da seleção para o composto principal mais adequado está mudando a partir da triagem de eficácia para a toxicidade. Uma estimativa eficaz e a previsão de toxicidade baseado na realização do Projeto Toxicogenômico será útil no futuro para o desenvolvimento de drogas. Os progressos na compreensão do modo em que o efeito de certo químico vai ocorrer, bem como a toxicidade das drogas no nível de expressão gênica por toxicogenômica vai melhorar a extrapolação a partir de testes em animais para seres humanos, e será possível para a reavaliação de drogas que tinham uma única atividade farmacológica que tiveram seu desenvolvimento parado por causa da toxicidade.Uma vez que o sistema de previsão para a toxicidade é estabelecida pelo Projeto Toxicogenômico, será possível que os produtos químicos com elevado risco de efeitos colaterais sejam eliminados antes da entrada no estudo clínico. Isso iria reduzir o risco de efeitos colaterais inesperados e, posteriormente, contribuir para a garantia de segurança para os pacientes. O tempo e os custos de desenvolvimento de drogas serão então reduzidos, e, por consequência, o custo total de medicação é diminuído.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Carlos Alberto Oliveira de Biagi-Júnior - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

  • 2014 - 2020

    Desenvolvimento de Wearables para ciências biomédicas., Descrição: Este projeto visa o desenvolvimento de dispositivos eletrônicos inteligentes que podem ser "vestidos" e que possam interagir com computadores. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Gunther J L Gerhardt - Integrante / Guilherme de Almeida Creste - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

  • 2013 - 2020

    Alfa2Bit: Criação de chaves liga-desliga com o uso de ondas alfas, Descrição: Com o auxílio de headsets podemos criar aplicativos que possam controlar muitos utensílios de uma casa, por exemplo, ligar e desligar aparelhos eletrodomésticos. Uma boa parte do controle de uma casa passa por ordens binárias, que podem ser sim ou nao, liga e desliga A novidade está na obtenção relativamente barata do sinal e processamento em tempo real. Quanto ao processamento em tempo real podemos utilizar hardware livre, o arduíno é uma plataforma de prototipagem eletrônica, desenvolvida com um microcontrolador de placa única, com suporte de entrada e saída embutido. Isto é perfeito para o desenvolvimento de objetos interativos e ainda podem ser conectado via wireless ou bluetooth a um computador hospedeiro para auxiliar no processamento. O Raspberry PI é um computador de excelente modelo para processar um sinal biométrico em tempo real, tem o tamanho de um cartão de crédito, isso possibilita a fixação dele em qualquer lugar. No caso o Headset pode ser conectado ao raspberry para o processamento do sinal e enviar o resultado para o arduíno que irá realizar a operação liga-desliga. O uso da atividade cerebral e técnicas de processsamento de sinais podem faciltar muito a vida de uma PPD e estão se tornando uma realidade. O nosso grupo possui experiencia no processamento de sinal de EEG e na utilização de ferramentas computacionais para sua caracterização. O sinal obtido de uma ferramenta como o EMOTIV (headset) não é muito diferente do que já estamos analisando ha algum tempo, sendo que o desafio será separar estados diferentes de atividade de forma automática e transformar esses estados em ordens de acordo com a vontade do individuo. O controle do ritmo alfa, por exemplo, não é nenhuma novidade na literatura e esse sinal pode ser transformado em comandos binários. (O projeto foi contemplado com 3 Bolsas de ITI e 2 de Pesquisador visitante). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Suzana V Schönwald - Integrante / Gunther J L Gerhardt - Integrante / Luiz Miguel Alves de Oliveira - Integrante / Giordano Bruno Sanches Seco - Integrante / Guilherme de Almeida Creste - Integrante / Gustavo Moreira Jarola - Integrante / João Paulo Ballerini Bruno - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 9

  • 2013 - 2017

    Ferramenta computacional para identificação de micro-organismos com base em assinaturas genômicas, Descrição: O avanço das tecnologias de sequenciamento de DNA permitiu a diminuição de seu custo e o aumento de sua velocidade, consequentemente causando um aumento considerável no montante de dados gerados. Entretanto, o desenvolvimento de algoritmos eficientes para a análise desses dados não tem acompanhado esse progresso, principalemnte tratando-se de dados metagenômicos. A Metagenômica consiste no sequenciamento de vários microorganismos de uma amostra de um determinado ambiente sem que haja a necessidade de isolamento dos mesmos. É importante para a caracterização de ambientes, pois a maioria dos microorganismos não podem ser cultivados em laboratório. As sequências obtidas por metagenômica são pequenos fragmentos com não mais de 700pb, que geralmente são identificados a partir do alinhamento com genomas inteiros armazenados em bancos de dados. Contudo, essa metodologia de análise é demorada e não se mostra tão precisa quando utilizamos pequenos fragmentos de DNA, pois fatores biológicos como transferência lateral de genes e rearranjos cromossômicos interferem no resultado. Uma das alternativas para facilitar essa caracterização é a utilização de assinaturas genômicas para uma análise prévia das sequências. Assinaturas genômicas são padrões de organização das sequências formadas pela pressão de seleção dos meios em que os organismos vivem. Elas são específicas de cada espécie, e quanto mais próximos da escala evolutiva dois organismos estiverem, menos modificadas serão suas assinaturas genômicas. Esse método não sofre as mesmas interferências do alinhamento, pois as assinaturas estão presentes no genoma inteiro. Neste projeto utilizaremos medidas de organização de sequências em fragmentos de DNA de várias espécies de microrganismos, com o intuito de encontrar assinaturas genômicas que possam ser utilizadas para auxiliar na identificação dos fragmentos a nível de gênero, reduzindo as possibilidades a serem analisadas e assim simplificando as metodologias de caracterização de sequências.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Gerhardt, G.J.L. - Integrante / André Luiz Molan - Integrante / Agnes Alessandra Sekijima Takeda - Integrante / Alex Augusto Biazotti - Integrante / José Rafael Pilan - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

  • 2013 - 2014

    Aprendizado de Máquina em Biologia Molecular de Sistemas (AMBiS) aplicação em letalidade sintética, genes condicionalmente essenciais e transcrição gênica cooperativa, Descrição: O desenvolvimento de técnicas de alta produção de dados está transformando a biologia em uma disciplina rica em dados. Neste projeto nós consideramos redes biológicas integradas que incluem interações gênicas envolvendo metabolismo regulação e interação proteína-proteína. Nós iremos desenvolver ferramentas de aprendizado de máquina que utilizarão informações topológicas integradas com dados de expressão, localização celular e organização dos genomas para extrair informações biológicas relevantes. Nesse projeto iremos utilizar ferramentas de inteligência artificial para determinar a influência de propriedades topológicas na letalidade sintética de pares de genes e a influência do meio na essencialidade de genes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (5) . , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Integrante / Ney Lemke - Coordenador / Marcio Luis Acencio - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    Integração de Transcriptomas e Redes para o Estudo de Câncer, Descrição: A cada dia surgem novas tecnologias que possibilitam aos cientistas medirem a expressão de muitos genes em uma única experiência com uma alta rapidez e eficiência. No entanto, ainda não existem muitas metodologias que sirvam para a análise do funcionamento de células e tecidos que possibilitem diagnóstico, prevenção e terapias de doenças. Nós iremos utilizar uma nova metodologia de análise de expressão gênica que tem poder de diagnóstico quando uma célula cancerosa é comparada com uma célula normal. Partimos da idéia de que rotas bioquímicas podem ser representadas por uma rede de interações entre metabólitos, entre os quais muitas são proteínas codificadas a partir do genoma. Sendo assim, o funcionamento de uma célula implica em interações que compõem uma rede intricada e complexa. Reorganizamos a lista de genes em uma dimensão e reescrevemos a matriz de interação, sem a criação ou a destruição de interações, buscando correlacionar cada um dos genes com os seus respectivos vizinhos na lista unidimensional. Com base nisto, sobrepondo dados de expressão gênica sobre a lista unidimensional (transcriptograma), teremos um perfil transcricional de um tecido no ato da medida experimental. Se medirmos a expressão gênica de um tecido normal com um tecido canceroso. Como resultado desta comparação saberíamos quais conjuntos de proteínas estão super expressos e os subexpressos em relação ao tecido normal. E assim podemos propôr uma nova classificação para estadiamento para o câncer, encontrar novos alvos quimioterápicos, etc.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / André Luiz Molan - Integrante / Agnes Alessandra Sekijima Takeda - Integrante / Alex Augusto Biazotti - Integrante / José Rafael Pilan - Integrante / Felipe Chimin - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2019

    Busca de novos alvos quimioterápicos para o tratamento de câncer, Descrição: A biologia de sistemas pode auxiliar na busca de novos alvos quimioterápicos para o tratamento de câncer. Câncer é uma doença que não possuí cura, em muitos casos, após o tratamento o câncer retorna mais agressivo e o indivíduo se torna imune ao quimioterápicos utilizado no tratamento anterior. Usando a biologia de sistemas, é possivel descrever um sistema de interação protéica que representa o câncer (ex.: neuroblastoma, câncer de mama, câncer de pulmão, etc) e com o uso de métricas da teoria de grafos é possivel inferir novos alvos quimioterápicos associando conceitos como drogabilidade, comorbidade, etc. (O projeto foi contemplado com uma bolsa de IC). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / André Luiz Molan - Integrante / Agnes Alessandra Sekijima Takeda - Integrante / Carlos Alberto Oliveira de Biagi-Júnior - Integrante / Alex Augusto Biazotti - Integrante / Gerson Santos de Almeida - Integrante., Financiador(es): Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2013

    Autismo e fatores ambientais, Descrição: O autismo é uma disfunção global do desenvolvimento. É uma alteração que afeta a capacidade de comunicação do indivíduo, de socialização e de comportamento Esta desordem faz parte de um grupo de síndromes chamado transtorno global do desenvolvimento (TGD), também conhecido como transtorno invasivo do desenvolvimento (TID), do inglês pervasive developmental disorder (PDD). O Objetivo deste projeto é correlacionar todos os genes envolvidos nesta sindrome e possíveis agentes. Esta correlação é obtida a partir da biologia de sistemas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Integrante / José C. F. Moreira - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2011 - 2012

    Desenvolvimento de ferramentas para análise de transcriptomas, Descrição: A carência de ferramentas para análise de transcriptomas é o nosso motivador. Uma maneira de analisar transcriptomas é usando um método que considere os níveis de expressão do genoma completo com a organização de genes a partir de uma rede de interação protéica. Projetando o transcriptoma sobre a rede é possível avaliar a nível global a expressão do organismo desejado.. , Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Rita M. C. de Almeida - Integrante / Rodrigo J. S. Dalmolin - Integrante / José C. F. Moreira - Integrante.

  • 2009 - 2012

    Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para análise de interatomas e identificação de redes de biomarcadores tumorais., Descrição: A progressão das neoplasias sólidas é um processo complexo, não segue uma seqüência universal e é caracterizada pela marcada heterogeneidade tumoral na ocasião do diagnóstico. Anormalidades cromossômicas, mutações somáticas e alterações epigenéticas estão entre as principais alterações celulares decorrentes da instabilidade do genoma destas neoplasias. Essa instabilidade tem importantes implicações clínicas, pois impõe dificuldades ao desenvolvimento de novos biomarcadores tumorais, tais como a baixa recorrência de mutações somáticas causalmente relacionadas ao desenvolvimento do câncer e a grande diversidade amostral. Segundo o atual sistema de estadiamento de tumores, apenas neoplasias de testículo são estadiadas com auxílio de marcadores moleculares (i.e. sistema TNM+S). Nas demais neoplasias sólidas o estadiamento é feito exclusivamente por critérios anatômicos, apesar das inúmeras ferramentas disponíveis para a análise molecular do genoma, do proteoma e do transcriptoma de biópsias de tecidos malignos. Visto que biomarcadores isoladamente não parecem ser efetivos para traduzir heterogeneidade tumoral em informação clínica relevante, neste projeto nos propomos a aumentar a robustez da classificação molecular de neoplasias sólidas através da identificação redes de biomarcadores tumorais (Edital Universal MCT/CNPq 14/2009 - 472658/2009-3).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Integrante / Mauro A. A. Castro - Coordenador / Rita M. C. de Almeida - Integrante / Rodrigo J. S. Dalmolin - Integrante / José C. F. Moreira - Integrante / José C. M. Mombach - Integrante / Fabio Klamt - Integrante.

Projetos de desenvolvimento

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante / Rogério Ferreira Sgoti - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante / Rogério Ferreira Sgoti - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante / Rogério Ferreira Sgoti - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante / Rogério Ferreira Sgoti - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante / Rogério Ferreira Sgoti - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante / Rogério Ferreira Sgoti - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante / Rogério Ferreira Sgoti - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante / Rogério Ferreira Sgoti - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante / Rogério Ferreira Sgoti - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Desenvolvimento do sistema de gerenciamento do Instituto de Biotecnologia da UNESP, Descrição: Criação do sistema de informática que permitirá o gerenciamento de todos os setores e laboratórios residentes do instituto de biotecnologia da unesp. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Paulo Eduardo Martins Ribolla - Integrante / Rogério Ferreira Sgoti - Integrante.

  • 2012 - Atual

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

  • 2021 - Atual

    Apllicação de técnicas de inteligência artificial para problemas biomédicos, Descrição: Usar as técnicas de Deep Learning e Aprendizado de máquina explicável para problemas de predição de prognóstico de tumores.Desenvolvimento de modelos que sejam capazes de predizer o prognostico a partir de dados moleculares e o desenvolvimento de ferramentas web para o uso dos modelos na clínica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / André Luiz Molan - Integrante / Agnes Alessandra Sekijima Takeda - Integrante / Giordano Bruno Sanches Seco - Integrante.

  • 2019 - Atual

    Criação de aplicativos mobile e software de bioinformática, Descrição: Desenvolvimento de aplicativos mobiles que utilizam realidade virtual para visualização de dados biológicos. Também este projeto conta o desenvolvimento de software de integração de vários níveis de dados biológicos. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / André Luiz Molan - Integrante / Agnes Alessandra Sekijima Takeda - Integrante / José Rafael Pilan - Integrante / Giordano Bruno Sanches Seco - Integrante / JORGE HENRIQUE FAINE MONTEIRO - Integrante.

  • 2012 - 2017

    Criação de uma nova classificação de estadiamento para canceres usando informação transcriptômica, Descrição: Usando a metodologia do transcriptograma é possível desenvolver uma nova forma para realizar o estadiamento de câncer. Atualmente isto é realizado de forma histológica.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jose Luiz Rybarczyk Filho - Coordenador / Fares Zeidán-Chuliá - Integrante.

Prêmios

2017

Prêmio de Melhor Pôster em ômicas - Encontro da SBBq 2017, SBBq.

2017

Terceiro lugar melhor apresentação de trabalho no XXIX Congresso de Inciação Científica, Instituto de Biociências de Botucatu.

2016

Melhor apresentação Pôster - Pós-Graduação - XVI Workshop de Genética, Instituto de Biociências de Botucatu.

2015

Melhor apresentação Pôster - Iniciação Científica - XV Workshop de Genética, Instituto de Biociências de Botucatu.

2014

Best Poster Award - III International Workshop on Environmental Microbiology, AB3C.

2010

Best Poster Awards in Systems Biology and Networks: X-meeting 2010, AB3C.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica. , Distrito de Rubião Júnior s/n, Rubião Júnior, 18618970 - Botucatu, SP - Brasil - Caixa-postal: 510, Telefone: (14) 38800264, Fax: (14) 38800262

Experiência profissional

2022 - Atual

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Associado MS5.3, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2019 - 2022

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Associado MS5.1, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2012 - 2019

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor Assistente Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 08/2023

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Ciência de Dados II: Aprendizado de Máquina (60h)

  • 02/2022

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Representante Suplente no Conselho do Departamento de Biofísica e Farmacologia.

  • 11/2021

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Represente Docente da Comissão Assessora para análise das inscrições de Concurso de Livre-Docência e Plano de Carreira Docente.

  • 09/2020

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Membro Titular do Conselho de Curso da Física Médica.

  • 07/2023 - 07/2023

    Ensino, Ciências Biológicas (Genética), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Programação em Python (60h)

  • 04/2023 - 07/2023

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física I (64h), Termodinâmica e Mecânica Estatística (64h), Mecânica Clássica I (64h)

  • 04/2023 - 07/2023

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática (16h)

  • 09/2022 - 01/2023

    Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Física (30h)

  • 09/2022 - 01/2023

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Ciência de Dados III: Aprendizado Profundo (60h)

  • 04/2022 - 08/2022

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Termodinâmica e Mecânica Estatística (68h), Física I (102h)

  • 04/2022 - 08/2022

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Termodinâmica e Mecânica Estatística (68h), Física I (102h)

  • 04/2022 - 08/2022

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática (60h)

  • 10/2021 - 03/2022

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Ciência de Dados II: Aprendizado de Máquina (Optativa) - (60h)

  • 02/2020 - 01/2022

    Direção e administração, Instituto de Biociências, Departamento de Biofísica e Farmacologia.,Cargo ou função, Chefe de Departamento.

  • 02/2020 - 01/2022

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Membro Titular da Congregação do Instituto de Biociências de Botucatu - Representando o Depto de Biofísica e Farmacologia.

  • 10/2021 - 11/2021

    Ensino, Biologia Geral e Aplicada, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Programação em Python (60h), Aprendizado de Máquina em Python (60 h)

  • 10/2021 - 11/2021

    Ensino, Ciências Biológicas (Genética), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Programação em Python (60h), Aprendizado de Máquina em Python (60h)

  • 05/2021 - 09/2021

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Termodinâmica e Mecânica Estatística (60h), Física I (72h), Física I - Turma Extra (90h)

  • 05/2021 - 09/2021

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática (60h)

  • 11/2020 - 03/2021

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física das Radiações (30h)

  • 11/2020 - 03/2021

    Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Física (15h)

  • 02/2020 - 10/2020

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física das Radiações (90h), Física I (72h), Termodinâmica e Mecânica Estatística (60h)

  • 02/2020 - 10/2020

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática (48h)

  • 06/2015 - 08/2020

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Membro suplente do Conselho de Curso da Física Médica.

  • 02/2018 - 01/2020

    Direção e administração, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Chefe de Departamento.

  • 02/2018 - 01/2020

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Membro Titular da Congregação do Instituto de Biociências de Botucatu - Representando o Depto de Física e Biofísica.

  • 08/2019 - 12/2019

    Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Física (09h)

  • 08/2019 - 12/2019

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física das Radiações (24h)

  • 07/2019 - 07/2019

    Ensino, Ciências Biológicas (Genética), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioestatística usando ambiente estatístico R (60h)

  • 07/2019 - 07/2019

    Ensino, Biologia Geral e Aplicada, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioestatística usando ambiente estatístico R (60h)

  • 07/2019 - 07/2019

    Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioestatística (60h)

  • 02/2019 - 07/2019

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física I (96h), Termodinâmica e Mecânica Estatística (64h)

  • 02/2019 - 07/2019

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática (64h)

  • 08/2017 - 06/2019

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Membro titular do Conselho de Pós-Graduação em Biotecnologia.

  • 08/2018 - 12/2018

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física das Radiações (90h)

  • 08/2018 - 12/2018

    Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Física (45h)

  • 09/2018 - 09/2018

    Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Tópicos Especiais em Biotecnologia: Introdução à Biologia de Sistemas e Análise de Balanço de Fluxo (12h)

  • 09/2018 - 09/2018

    Ensino, Ciências Biológicas (Genética), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, 	Tópicos Especiais em Genética: Introdução à Biologia de Sistemas e Análise de Balanço de Fluxo (12h)

  • 04/2014 - 09/2018

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Membro Titular do Conselho do Curso de Graduação em Ciências Biomédicas do IBB.

  • 02/2018 - 07/2018

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Termodinâmica e Mecânica Estatística (60h)

  • 02/2018 - 07/2018

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática (60h)

  • 03/2017 - 01/2018

    Direção e administração, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Vice-chefe de Departamento.

  • 08/2017 - 12/2017

    Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Física (45h)

  • 08/2017 - 12/2017

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Processamento e Análise de Sinais e Imagem Médica (60h)

  • 10/2014 - 12/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Membro Suplente do Conselho Municipal de Ciência, Tecnologia e Inovação de Botucatu (COMCITI).

  • 08/2017 - 10/2017

    Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, BIoestatística (60h), 	Tópicos Especiais em Biotecnologia - Bioinformática: dos Genes à Estrutura de Proteínas (16h)

  • 08/2017 - 10/2017

    Ensino, Biologia Geral e Aplicada, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Tópicos Especiais em Biologia Geral e Aplicada - Bioinformática: dos genes à estrutura de proteínas. (16h)

  • 08/2017 - 10/2017

    Ensino, Ciências Biológicas (Genética), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Tópicos Especiais em Genética - Bioinformática: dos genes à estrutura de proteínas (16h)

  • 07/2017 - 07/2017

    Ensino, Biologia Geral e Aplicada, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioestatística usando ambiente estatístico R (60h)

  • 07/2017 - 07/2017

    Ensino, Ciências Biológicas (Genética), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioestatística usando ambiente estatístico R (60 h)

  • 03/2017 - 07/2017

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fisica das Radiações (45h), Termodinâmica e Mecânica Estatística (60h)

  • 05/2014 - 07/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Membro suplente do conselho do Programa de Pós Graduação em Biotecnologia.

  • 07/2016 - 02/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Membro Titular do Conselho do Departamento.

  • 08/2016 - 12/2016

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Processamento e Análise de Sinais e Imagem Médica (60h)

  • 08/2016 - 12/2016

    Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Física (45h)

  • 01/2016 - 12/2016

    Extensão universitária , Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Atividade de extensão realizada, Escola de Programação para Ensino Médio (EPEM).

  • 02/2015 - 12/2016

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Membro Titular da Comissão Local de Contratação Docente do Instituto de Biociências do Câmpus de Botucatu.

  • 11/2015 - 09/2016

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Vice Presidente da Comissão de Estágios do Curso de Física Médica.

  • 06/2016 - 06/2016

    Ensino, Ciências Biológicas (Genética), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Laboratório de Bioinformática: proteínas e expressão gênica (60h)

  • 02/2016 - 06/2016

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física das Radiações (90h), Termodinâmica e Mecânica Estatística (60h)

  • 02/2012 - 06/2016

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Membro Suplente do Conselho do Departamento de Física e Biofísica.

  • 08/2015 - 12/2015

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Processamento e Análise de Sinais e Imagem Médica (60h)

  • 08/2015 - 12/2015

    Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Física (45h)

  • 08/2015 - 11/2015

    Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Laboratório de Bioinformática (60h)

  • 08/2013 - 10/2015

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Membro da Comissão de estágios do curso de Física Médica.

  • 07/2015 - 07/2015

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Comissão para Apuração Preliminar de Plágio.

  • 03/2015 - 07/2015

    Ensino, Ciências Biológicas (Genética), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Laboratório de Bioinformática: Proteínas e Expressão Gênica (60h)

  • 02/2015 - 07/2015

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física das Radiações (90h), Termodinâmica e Mecânica Estatística (60h)

  • 11/2014 - 01/2015

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Membro da Comissão de Transferência - Física Médica.

  • 09/2014 - 01/2015

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Processamento e Análise de Sinais e Imagens Médicas (60h)

  • 09/2014 - 01/2015

    Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Física (39h)

  • 08/2014 - 11/2014

    Ensino, Ciência Biológica AC.: Genética, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Algoritmos e Programação em Python (60h)

  • 02/2014 - 08/2014

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física das Radiações (44h), Termodinâmica e Mecânica Estatística (60h)

  • 09/2012 - 03/2014

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Membro Suplente do Conselho do Curso de Graduação em Ciências Biomédicas do IBB.

  • 11/2013 - 02/2014

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Presidente da Comissão de Transferência - Física Médica.

  • 08/2013 - 01/2014

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Medicina Nuclear e Radiobiologia (24h), Processamento e Análise de sinais e imagens médicas (60h)

  • 08/2013 - 01/2014

    Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Física (45h)

  • 08/2013 - 11/2013

    Ensino, Ciências Biológicas (Genética), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Algoritmos e Programação em Python (60h)

  • 09/2013 - 09/2013

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Membro titular da mesa da eleição para Representante junto ao Conselho do Departamento de Física e Biofísica.

  • 03/2013 - 07/2013

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física das Radiações (90h), Termodinâmica e Mecânica Estatística (60h)

  • 03/2013 - 07/2013

    Extensão universitária , Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Atividade de extensão realizada, Curso de Python (30h) (Ensino propulsor de física e matemática).

  • 06/2013 - 06/2013

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Física e Biofísica.,Cargo ou função, Membro Titular da mesa da Eleição do Chefe e Vice-Chefe do Departamento de Física e Biofísica.

  • 11/2012 - 01/2013

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Membro da Comissão de Transferência - Física Médica.

  • 07/2012 - 12/2012

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Medicina Nuclear e Radiobiologia - 28h, Processamento e Análise de sinais e imagens médicas - 60h

  • 07/2012 - 12/2012

    Ensino, Ciências Biomédicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral - 24h

  • 01/2012 - 06/2012

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física das Radiações - 90h, Termodinâmica e Mecânica Estatística - 60h

2020 - 2021

Universidade virtual do Estado de São Paulo

Vínculo: Contrato Temporário, Enquadramento Funcional: Professor Conteúdista, Carga horária: 4

Atividades

  • 11/2020 - 07/2021

    Ensino, Licenciatura em Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Estatística (80h)

2015 - 2017

Instituto de Biotecnologia - Universidade Estadual Paulista

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 20

2003 - 2012

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista

Atividades

  • 01/2008 - 09/2010

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Física.,Cargo ou função, Representande Discente ao Conselho do Programa de Pós-Graduação.

  • 03/2010 - 07/2010

    Estágios , Instituto de Física.,Estágio realizado, FIS01206 Métodos Computacionais da Física B.

  • 05/2008 - 05/2009

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Física.,Cargo ou função, Representante Titular Discente do Conselho do Instituto de Física.

  • 09/2008 - 11/2008

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Física.,Cargo ou função, Representante Discente da Comissão de Consulta para nomeação do Diretor.

  • 03/2006 - 07/2006

    Estágios , Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação, Curso de Pós-Graduação em Medicina: Clínica Médica.,Estágio realizado, MED 26 Introdução à Bioestatística.

  • 04/2003 - 12/2004

    Estágios , Instituto de Física.,Estágio realizado, Bolsista do laboratório de Implantação Iônica, no qual realizava análise de materiais via PIXE.