Sílvia Delgado Olabarriaga
Silvia cursou Tecnólogo em Processamento de Dados na Universidade Federal do Rio Grande do Sul (1982), e depois obteve mestrado em Ciencia da Computação pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (1987). Em 1999 Silvia obteve o grau de doutor em Computer Science na University of Amsterdam, Holanda, com a tese "Segmentacao interativa de imagens medicas". Silvia retornou ao Instituto de Informatica da UFRGS como professora, e depois retornou a Holanda como post-doctoral fellow em duas instituicoes.
Desde 2010 Silvia é professora assistente no Academic Medical Center of the University of Amsterdam (AMC), onde lidera o grupo de pesquisa em "e-science". Silvia tem interesse na interseccao das área de Ciência da Computação e Life Sciences, tendo atuado principalmente nos seguintes temas: segmentação de imagens médicas, computação gráfica, interação homem-máquina, computacao distribuida e e-science.
Informações coletadas do Lattes em 30/09/2025
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Computer Science
1995 - 1999
Universiteit van Amsterdam, UvA
Título: Human-Computer Interaction for the Segmentation of Medical Images
Orientador: Arnold M W. Smeulders
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: segmentação de imagens; interação homem-máquina; imagens médicas.Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Processamento Gráfico (Graphics). Setores de atividade: Informática; Saúde Humana.
Mestrado em Computação
1984 - 1987
Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Orientador: Anatólio Laschuk
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Palavras-chave: computação gráfica; animação por computador; animação modelada.Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Processamento Gráfico (Graphics). Setores de atividade: Informática.
Graduação em Tecnólogo Em Processamento de Dados
1980 - 1982
Pós-doutorado
2005 - 2008
Pós-Doutorado. , Universiteit van Amsterdam, UvA, Holanda.
2002 - 2004
Pós-Doutorado. , University Medical Center - Utrecht.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem.
Francês
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente.
Holandês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: e-Science.
Organização de eventos
Olabarriaga, S.D. ; Glatard, Tristan ; Solomonides, T ; Krefting, D . HealthGrid conference. 2012. (Congresso).
Glatard, Tristan ; Solomonides, T ; Blanchet, C ; Olabarriaga, S.D. . CCGrid-Health: Workshop on Applications of Grids in Health. 2010. (Congresso).
Glatard, Tristan ; Solomonides, T ; Blanchet, C ; Olabarriaga, S.D. . CCGrid-Health: Applications of grid in healthcare. 2009. (Congresso).
Montagnat, Johan ; Olabarriaga, S.D. . MICCAI-Grid: Medical Imaging on Grids. 2008. (Congresso).
OLABARRIAGA, S. D. ; NIESSEN, W. ; GERRITSEN, F. . Workshop on Interactive Medical Image Visualization and Analysis. 2001. (Congresso).
Orientou
Gateway for NGS sequencing at the AMC; Início: 2013; Dissertação (Mestrado em Medical Informatics) - Academic Medical Center of the University of Amsterdam; (Orientador);
Real-Time Image Processing with GPGPU; Início: 2012; Dissertação (Mestrado em Master in Grid Computing) - Universiteit van Amsterdam; (Coorientador);
Front-ends for biomedical data analysis on e-infrastructures; Início: 2011; Tese (Doutorado em AMC Graduate School) - Academic Medical Center of the University of Amsterdam; (Coorientador);
Security of genomic data on virtual research environments; 2012; Dissertação (Mestrado em Medical Informatics) - Academic Medical Center of the University of Amsterdam,; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Problem Solving Environment for Medical Image Analysis Application Development; 2007; Dissertação (Mestrado em Master in Grid Computing) - Universiteit van Amsterdam,; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Evaluation of Results of Segmentation of Vascular Structures; 2005; Dissertação (Mestrado em Computer Science) - Utrecht University,; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Echo Off-line: uma ferramenta para medidas ecocardiograficas pos-exame; 2003; Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul,; Coorientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Setting up and evaluating a local desktop grid at the Academic Medical Center of Amsterdam; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bachelor Medical Informatics) - Academic Medical Center of the University of Amsterdam; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Visualization of Medical Image Data on a Tiled Panel Display; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Computer Science) - Universiteit van Amsterdam; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Ferramenta interativa para visualização de cortes tomográficos; 1995; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
SLICER: sistema interativo para licalização de cortes em planos arbitrários em volumes tomográficos; 1995; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Afonso; Um protocolo para transmissão de bitmaps por linha serial; 1993; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
TODIE - Topologia de diagramas de engenharia; 1992; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
FRACTARTE: um ambiente para criação de fractais; 1992; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
ANIMAKER: sistema de animação; 1992; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Computador & Arte; 1992; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Computador & Arte; 1992; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Ambiente para estudo de fractais; 1990; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Ciências de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Sílvia Delgado Olabarriaga;
Produções bibliográficas
-
Caan, M.W.A. ; Shahand, S. ; Vos, F.M. ; van Kampen, A.H.C. ; Olabarriaga, S.D. . Evolution of grid-based services for Diffusion Tensor Image analysis. Future Generation Computer Systems , v. 28, p. 1194-1204, 2012.
-
de Vries, Michel ; OUDE MUNNINK, BAS B. ; DEIJS, MARTIN ; CANUTI, MARTA ; KOEKKOEK, SYLVIE M. ; MOLENKAMP, RICHARD ; BAKKER, MARGREET ; JURRIAANS, SUZANNE ; VAN SCHAIK, BARBERA D. C. ; LUYF, ANGELA C. ; Olabarriaga, Silvia D. ; VAN KAMPEN, ANTOINE H. C. ; VAN DER HOEK, LIA . Performance of VIDISCA-454 in Feces-Suspensions and Serum. Viruses , v. 4, p. 1328-1334, 2012.
-
RIENSTRA, ANNE ; GROOT, PAUL F. C. ; SPAAN, PAULINE E. J. ; MAJOIE, CHARLES B. L. M. ; Nederveen, Aart J. ; WALSTRA, GERARD J. M. ; DE JONGHE, JOS F. M. ; VAN GOOL, WILLEM A. ; Olabarriaga, Silvia D. ; KORKHOV, VLADIMIR V. ; SCHMAND, BEN . Symptom validity testing in memory clinics: Hippocampal-memory associations and relevance for diagnosing mild cognitive impairment. Journal of Clinical and Experimental Neuropsychology (Online) , v. 12, p. 1-12, 2012.
-
van Schaik, Barbera DC ; Mark Santcroos ; Benabdelkader, A ; JONGEJAN, A. ; WILLEMSEN, M. ; van Kampen, A.H.C. ; Olabarriaga, Sílvia D . Challenges in DNA sequence analysis on a production grid. Pos Proceedings of Science , v. 039, p. 1, 2012.
-
PETERS, B. D. ; MACHIELSEN, M. W. J. ; HOEN, W. P. ; CAAN, M. W. A. ; MALHOTRA, A. K. ; SZESZKO, P. R. ; DURAN, M. ; OLABARRIAGA, S. D. ; DE HAAN, L. . Polyunsaturated Fatty Acid Concentration Predicts Myelin Integrity in Early-Phase Psychosis. Schizophrenia Bulletin , v. 1, p. 1-1, 2012.
-
VAN WINGEN, G. A. ; GEUZE, E. ; CAAN, M. W. A. ; KOZICZ, T. ; OLABARRIAGA, S. D. ; DENYS, D. ; VERMETTEN, E. ; FERNANDEZ, G. . Persistent and reversible consequences of combat stress on the mesofrontal circuit and cognition. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (Online) , v. 109, p. 15508-15513, 2012.
-
SHAHAND, SHAYAN ; SANTCROOS, MARK ; KAMPEN, ANTOINE H. C. ; OLABARRIAGA, SÍLVIA DELGADO . A Grid-Enabled Gateway for Biomedical Data Analysis. Journal of Grid Computing , v. 10, p. 725-742, 2012.
-
Olabarriaga, Sílvia D. ; Montagnat, Johan . Special section: Medical imaging on grids. Future Generation Computer Systems , v. 26, p. 678-680, 2010.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; Glatard, Tristan ; de Boer, Piter T . A Virtual Laboratory for Medical Image Analysis. IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine , v. 14, p. 979-985, 2010.
-
Glatard, Tristan ; Soleman, Remi S. ; Veltman, Dick J. ; Nederveen, Aart J. ; Olabarriaga, Sílvia D. . Large-scale functional MRI study on a production grid. Future Generation Computer Systems , v. 26, p. 685-692, 2010.
-
Caan, Matthan W A ; Khedoe, H Ganesh ; Poot, Dirk H J ; den Dekker, Arjan J ; OLABARRIAGA, S. D. ; Grimbergen, Kees A ; van Vliet, Lucas J ; Vos, Frans M . Estimation of diffusion properties in crossing fiber bundles. IEEE Transactions on Medical Imaging (Print) , v. 29, p. 1504-1515, 2010.
-
Luyf, Angela CM ; van Schaik, Barbera DC ; de Vries, Michel ; Baas, Frank ; van Kampen, Antoine HC ; Olabarriaga, Silvia D . Initial steps towards a production platform for DNA sequence analysis on the grid. BMC Bioinformatics , v. 11, p. 598, 2010.
-
Sluimer, Jasper D. ; Flier, Wiesje M. ; Karas, Giorgos B. ; Schijndel, Ronald ; Barnes, Josephine ; Boyes, Richard G. ; Cover, Keith S. ; Olabarriaga, Sílvia D. ; Fox, Nick C. ; Scheltens, Philip ; Vrenken, Hugo ; Barkhof, Frederik . Accelerating regional atrophy rates in the progression from normal aging to Alzheimer s disease. European Radiology , v. 19, p. 2826-2833, 2009.
-
van `t Noordende, Guido J. ; Olabarriaga, Silvia D. ; Koot, Matthijs R. ; de Laat, Cees Th. A.M. . A Trusted Data Storage Infrastructure for Grid-Based Medical Applications. International Journal of Grid and High Performance Computing , v. 1, p. 1-14, 2009.
-
de Win, M. M. L. ; Jager, G. ; Booij, J. ; Reneman, L. ; Schilt, T. ; Lavini, C. ; OLABARRIAGA, S. D. ; den Heeten, G. J. ; van den Brink, W. . Sustained effects of ecstasy on the human brain: a prospective neuroimaging study in novel users. Brain (London. Print) , v. 131, p. 2936-2945, 2008.
-
de Win, M. M. L. ; Jager, G. ; Booij, J. ; Reneman, L. ; Schilt, T. ; Lavini, C. ; OLABARRIAGA, S. D. ; Ramsey, N. F. ; HEETEN, G. J. D. ; van den Brink, W. . Neurotoxic effects of ecstasy on the thalamus. British Journal of Psychiatry (Print) , v. 193, p. 289-296, 2008.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; SNEL, J. G. ; BOTHA, C. P. ; BELLEMAN, R. G. . Integrated Support for Medical Image Analysis Methods: from Development to Clinical Application. IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine, v. 11, p. 47-57, 2007.
-
de Win, Maartje M L ; Reneman, Liesbeth ; Jager, Gerry ; Vlieger, Erik-Jan P ; OLABARRIAGA, S. D. ; Lavini, Cristina ; Bisschops, Ivo ; Majoie, Charles B L M ; Booij, Jan ; den Heeten, Gerard J ; van den Brink, Wim . A Prospective Cohort Study on Sustained Effects of Low-Dose Ecstasy Use on the Brain in New Ecstasy Users. Neuropsychopharmacology (New York, N.Y.) , v. 32, p. 458-470, 2006.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; ROUET, J. ; FRADKIN, M. ; BREEUWER, M. ; NIESSEN, W. . Segmentation of Thrombus in Abdominal Aortic Aneurysms from CTA with Non-Parametric Statistical Grey Level Appearance Modelling. IEEE Transactions on Medical Imaging, v. 24, n.4, p. 477-485, 2005.
-
CAETANO, T. S. ; OLABARRIAGA, S. D. ; BARONE, D. A. C. . Do mixture models in chromaticity space improve skin detection?. Pattern Recognition Letters , v. 36, p. 3019-3021, 2003.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; SMEULDERS, A. W. M. . Interaction in the Segmentation of Medical Images: a Survey. Medical Image Analysis (Print) , Amsterdam, v. 5, n.2, p. 127-142, 2001.
-
OLABARRIAGA, S. D. . Tricromacia e a reprodução de cores em computador. Revista de Informática Teórica e Aplicada , Porto Alegre, v. 3, n.1, p. 91-109, 1996.
-
gesing, S. (Org.) ; Glatard, Tristan (Org.) ; Kruger, J (Org.) ; Olabarriaga, S.D. (Org.) ; Solomonides, T (Org.) ; Silverstein, J. (Org.) ; Montagnat, Johan (Org.) ; Gaignard, A. (Org.) ; Krefting, D (Org.) . HealthGrid Applications and Technologies Meet Science Gateways for Life Sciences. Amsterdam: IOS Press, 2012. v. 1. 232p .
-
van 't Noordende, G ; Olabarriaga, S.D. ; Koot, M.R. ; de Laat, Cees Th. A.M. . Trusted Data Management for Grid-Based Medical Applications. Cloud, Grid and High Performance Computing: Emerging Applications. : IGI Global, 2011, v. , p. 208-220.
-
Mouw, E. ; van `t Noordende, Guido J. ; van Kampen, A.H.C. ; Mark Santcroos ; Olabarriaga, S.D. . Legal constraints on genetic data processing in European grids. In: HealthGrid, 2012, Amsterdam. HealthGrid Applications and Technologies Meet Science Gateways for Life Sciences. Amsterdam: IOS Press, 2012. v. 175. p. 49-58.
-
Souley Madougou ; Mark Santcroos ; Benabdelkader, A ; van Schaik, Barbera DC ; Shahand, S. ; Korkhov, V ; van Kampen, A.H.C. ; Olabarriaga, Sílvia D . Provenance for distributed biomedical workflow execution. In: HealthGrid, 2012, Amsterdam. Proceedings of HealthGrid, Studies in Health Technology and Informatics. Amsterdam: IOS Press, 2012. v. 175. p. 91-100.
-
Shahand, S. ; Caan, Matthan W A ; van Kampen, Antoine HC ; Olabarriaga, Sílvia D . Integrated Support for Neuroscience Research: from Study Design to Publication. In: HealthGrid, 2012, Amsterdam. Proceedings of HealthGrid, Studies in Health Technology and Informatics. Amsterdam: IOS Press, 2012. v. 175. p. 195-204.
-
MARQUERING, H. ; ENGELBERS, J. ; Majoie, Charles B L M ; BENEN, L. ; van Kampen, Antoine HC ; Olabarriaga, Sílvia D . Optimization and Parallelization of the Matched Masked Bone Elimination Method for CTA. In: MICCAI workshop on Data- and Compute-Intensive Clinical and Translational Imaging Applications, 2012, Nice. Proceedings of the MICCAI workshop on Data- and Compute-Intensive Clinical and Translational Imaging Applications, 2012. p. 31-40.
-
Benabdelkader, A ; Mark Santcroos ; Souley Madougou ; van Kampen, A.H.C. ; Olabarriaga, S.D. . A Provenance Approach to Trace Scientific Experiments on a Grid Infrastructure. In: IEEE 7th International Conference on E-Science (e-Science), 2011, 2011, Stockholm. IEEE 7th International Conference on E-Science (e-Science), 2011, 2011. p. 134-141.
-
Mohammed, Y ; Korkhov, V ; Luyf, Angela CM ; van Schaik, Barbera DC ; Caan, Matthan W A ; van Kampen, Antoine HC ; Olabarriaga, S.D. . Data Decomposition in Biomedical e-Science Applications. In: e-Science Workshops (eScienceW), 2011 IEEE Seventh International Conference on, 2011, Stockholm. IEEE Seventh International Conference on e-Science - Workshops (eScienceW), 2011. p. 158-165.
-
Korkhov, V ; Krefting, D ; Kukla, T ; Terstyanszky, G. Z. ; Caan, M.W.A. ; Olabarriaga, S.D. . Exploring workflow interoperability tools for neuroimaging data analysis. In: WORKS '11 - 6th workshop on Workflows in support of large-scale science, 2011, Seatle. Proceedings of the 6th workshop on Workflows in support of large-scale science. New York: ACM, 2011. p. 87-96.
-
Krefting, D ; Glatard, Tristan ; Korkhov, V ; Montagnat, Johan ; Olabarriaga, S.D. . Enabling Grid Interoperability at Workflow Level. In: Grid Workflow Workshop (GWW 2011), 2011, Paderborn. Proceedings of Grid Workflow Workshop (GWW), 2011.
-
Shahand, S. ; Mark Santcroos ; Mohammed, Y ; Luyf, Angela CM ; van Kampen, A.H.C. ; Olabarriaga, Sílvia D . Front-ends to Biomedical Data Analysis on Grid. In: HealthGrid, 2011, Bristol. Proceedings of HealthGrid. Amsterdam: IOS Press, 2011.
-
Gwadry-Sridhar, F ; OLABARRIAGA, S. D. ; van Kampen, Antoine HC ; Bauer, M ; Solomonides, T . Hitting the ground running: Healthgrid deployment and adoption. In: HealthGrid, 2010, Paris. Studies in Health Technology and Informatics, Healthgrid Applications and Core Technologies, Proceedings of HealthGrid 2010. Amsterdam: IOS Press, 2010. v. 159. p. 40-51.
-
Caan, Matthan W A ; Vos, F.M. ; van Kampen, A.H.C. ; Olabarriaga, S.D. ; van Vliet, Lucas J . Gridifying a Diffusion Tensor Imaging Analysis Pipeline. In: CCGrid, 2010, Melbourne. 10th IEEE/ACM International Conference on Cluster, Cloud and Grid Computing (CCGrid). Los Alamitos: IEEE Computer Society, 2010. p. 733-738.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; Glatard, Tristan ; Hoheisel, A ; Nederveen, Aart J. ; Krefting, D . Crossing Healthgrid borders: early results in medical imaging. In: HealthGrid, 2009, Berlin. Studies in Health Technology and Informatics - Healthgrid Research, Innovation and Business Case - Proceedings of HealthGrid 2009. Amsterdam: IOS Press. v. 147. p. 62-71.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; Glatard, Tristan ; Boulebiar, K ; de Boer, Piter T . From Low Hanging to User Ready : Initial Steps into a HealthGrid. In: HealthGrid, 2008, Chicago. tudies in Health Technology and Informatics - Global Healthgrid: e-Science Meets Biomedical Informatics - Proceedings of HealthGrid 2008. Amsterdam: IOS Press, 2008. v. 138. p. 70-79.
-
Glatard, Tristan ; OLABARRIAGA, S. D. . User Friendly Management of Workflow Results: From Provenance Information to Grid Logical File Names. In: International Conference on eScience, eScience'08, 2008, Indianapolis. IEEE Fourth International Conference on eScience. Washington: IEEE Computer Society, 2008. p. 103-110.
-
Caton, S ; Caan, Matthan W A ; Olabarriaga, S.D. ; Rana, O ; Batchelor, B . Using Dynamic Condor-Based Services for Classifying Schizophrenia in Diffusion Tensor Images. In: 8th IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid, 2008. CCGRID '08., 2008, Lyon. 8th IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid, 2008. p. 234-241.
-
Glatard, Tristan ; Boulebiar, K ; Olabarriaga, S.D. . Workflow Integration in VL-e Medical. In: 21st IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems. CBMS '08., 2008, Jyvaskyla. 21st IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems, 2008. p. 144-146.
-
van 't Noordende, G ; Olabarriaga, S.D. ; Koot, M.R. ; de Laat, C.T.A. . A Trusted Data Storage Infrastructure for Grid-Based Medical Applications. In: 8th IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid, 2008. CCGRID '08., 2008, Lyon. 8th IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid, 2008. p. 627-632.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; Nederveen, Aart J. ; O Nuallain, B . Parameter Sweeps for Functional MRI Research in the "Virtual Laboratory for e-Science" Project. In: CCGrid, 2007, Rio de Janeiro. Proceedings Seventh IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid. Los Alamitos: IEEE Computer Society, 2007. p. 685-690.
-
Maheshwari, K ; Olabarriaga, S.D. ; BOTHA, C. P. ; SNEL, J. G. ; ALKEMADE, J. ; Belloum, A . Problem Solving Environment for Medical Image Analysis. In: Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems. CBMS '07., 2007, Maribor. Twentieth IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems, 2007. p. 165-170.
-
HUFF, R. ; DIETRICH, C. A. ; NEDEL, L. P. ; FREITAS, C. M. D. S. ; COMBA, J. L. ; OLABARRIAGA, S. D. . Erasing, Digging and Clipping in Volumetric Datasets with One or Two Hands. In: ACM International Conference on Virtual Reality Continuum and Its Applications, 2006. ACM, 2006.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; NEDERVEEN, A. ; SNEL, J. G. ; BELLEMAN, R. G. . Towards a Virtual Laboratory for fMRI Data Management and Analysis. In: HealthGrid, 2006, Valencia. Studies in Health Technology and Informatics - Challenges and Opportunities of HealthGrids - Proceedings of Healthgrid 2006. Amsterdam: IOS Press, 2006. v. 120. p. 43-54.
-
SNEL, J. G. ; OLABARRIAGA, S. D. ; ALKEMADE, J. ; ANDEL, H. G. V. ; NEDERVEEN, A. ; MAJOIE, C. B. ; HEETEN, G. J. D. ; STRATEN, M. V. ; BELLEMAN, R. G. . A Distributed Workflow Management System for Automated Medical Image Analysis and Logistics. In: IEEE CMBS, special track on Grids for Biomedical Informatics, 2006, Salt Lake City. IEEE, 2006.
-
Olabarriaga, S.D. ; de Boer, Piter T ; Maheshwari, K ; Belloum, A ; SNEL, J. G. ; NEDERVEEN, A. ; Bouwhuis, M . Virtual Lab for fMRI: Bridging the Usability Gap. In: e-science conference, 2006, Amsterdam. E-SCIENCE '06 Proceedings of the Second IEEE International Conference on e-Science and Grid Computing. Amsterdam: IEEE Computer Society, 2006. p. 53.
-
DIETRICH, C. A. ; NEDEL, L. P. ; OLABARRIAGA, S. D. ; COMBA, J. L. ; SILVA, A. M. M. . Real-time interactive visualization and manipulation of the volumetric data using GPU-based methods. In: SPIE Medical Imaging, 2004, San Diego. Proceedings of the SPIE, 2004.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; BREEUWER, M. ; NIESSEN, W. . Segmentation of Abdominal Aortic Aneurysms with a Non-parametric Appearance Model. In: Computer Vision and Mathematical Methods in Medical and Biomedical Image Analysis, 2004, Praga. Lecture Notes in Computer Science, 2004. v. 3117. p. 257-268.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; BREEUWER, M. ; NIESSEN, W. . Multi-scale Statistical Grey Value Modelling for Thrombus Segmentation from CTA. In: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, 2004, Saint Malo. Lecture Notes in Computer Science, 2004. v. 3216. p. 467-474.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; BREEUWER, M. ; NIESSEN, W. . Evaluation of Hessian-based filters to enhance the axis of coronary arteries in MSCT scans. In: Computer Assisted Radiology and Surgery, 2003, London. International Congress Series, 2003. v. 1256. p. 1191-1196.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; BREEUWER, M. ; NIESSEN, W. . Minimum Cost Path Algorithm for Coronary Artery Central Axis Tracking in CT images. In: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, 2003, Montreal. Lecture Notes in Computer Science, 2003. v. 2879. p. 687-694.
-
CAETANO, T. S. ; OLABARRIAGA, S. D. ; BARONE, D. A. C. . Performance evaluation of single and multiple-gaussian models for skin color modeling. In: SIBGRAPI - SIMPÓSIO BRASILEIRO DE COMPUTAÇÃO GRÁFICA E PROCESSAMENTO DE IMAGENS, 2002, Fortaleza. Proceedings of SIBGRAPI 2002 - XV Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing. Los Alamitos, California: IEEE Computer Society, 2002. p. 275-282.
-
ZUCCOLOTTO, M. ; OLABARRIAGA, S. D. ; SCHUCK JR., A. . Segmentação de Cavidades em Imagens Ecocardiográficas Utilizando Espaço de Escalas. In: Congresso Brasileiro de Engenharia Biomedica, 2002, São José dos Campos. CBEB2002 - XVIII Congresso Brasileiro de Eng. Biomédica - Anais de Trabalhos Completos, 2002. v. 5. p. 276-280.
-
MANSSOUR, I. H. ; FURUIE, S. S. ; OLABARRIAGA, S. D. ; FREITAS, C. M. D. S. . Visualizing Inner Structures in Multimodal Volume Data. In: Simposio Brasileiro de Computacao Grafica e Processamento de Imagens, 2002, Fortaleza. Proceedings of SIBGRAPI 2002 - XV Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 2002. p. 51-58.
-
SILVA, A. M. M. ; OLABARRIAGA, S. D. ; DIETRICH, C. A. ; SCHMITZ, C. A. . On determining a signature for skeletal maturity. In: XIV Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 2001, Florianópolis. Proceedings of SIBGRAPI 2001. Los Alamitos: IEEE Computer Society, 2001. p. 246-251.
-
SILVA, A. M. M. ; DIETRICH, C. A. ; OLABARRIAGA, S. D. . Estimating and Enhancing Robustness against Variation in User Initialization for Interactive Segmentation. In: Workshop on Interactive Medical Image Visualization and Analysis, 2001, Utrecht. Proceedings of IMIVA 2001. Utrecht: Image Sciences Institute, 2001. p. 21-24.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; SMEULDERS, A. W. M. ; MARIJNISSEN, A. C. A. ; VINCKEN, K. L. . An intelligent interactive segmentation method for the joint space in osteoarthritic ankles. In: Information Processing in Medical Imaging, 1999, Visegrád. Lecture Notes in Computer Science, 1999. v. 1613. p. 394-399.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; SMEULDERS, A. W. M. . Setting the mind for intelligent interactive segmentation. In: Information Processing in Medical Imaging, 1997, Poultney. Lecture Notes in Computer Science, 1997. v. 1230. p. 417-422.
-
SMEULDERS, A. W. M. ; OLABARRIAGA, S. D. ; BOOMGAARD, R. V. D. ; WORRING, M. . Design considerations for interactive segmentation. In: Visual Information Systems, 1997, San Diego, 1997. p. 5-12.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; KOELMA, D. ; SMEULDERS, A. W. M. . A simple application framework for interactive segmentation systems. In: Annual Conference of the Advanced School for Computing and Imaging, 1997, 1997. p. 151-156.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; SMEULDERS, A. W. M. . Towards Interactive tools for medical volume image segmentation. In: Annual Conference of the Advanced School for Computing and Imaging, 1996, 1996. p. 337-342.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; RANGAYYAN, R. . Subjective and Objective evaluation of image sharpness: behavior of the region-based image edge-profile acutance measure. In: Medical Imaging - Image Perception, 1996, New Port. Proceedings of the SPIE, 1996. v. 2712. p. 154-162.
-
OLABARRIAGA, S. D. . Visualization of Oscillation Data via Spirals. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1993, Recife, 1993. p. 99-105.
-
MUSSE, S. ; SCHMIDT, A. ; OLABARRIAGA, S. D. . PREVIEW: Ferramenta para Animação e Integração de sistemas. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1992, Águas de Lindóia, 1992. p. 251-258.
-
SILVA, R. L. ; OLABARRIAGA, S. D. . ANIMAKER: Sistema de Animação Modelada. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1992, Águas de Lindóia, 1992. p. 259-267.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; SCHMIDT, A. ; FREITAS, C. M. D. S. ; OLIVEIRA NETO, M. ; NASCIMENTO, M. ; BASTOS, R. ; CASACURTA, A. ; LASCHUK, A. ; SOUZA, J. B. ; DOSSA, M. ; LEMOS, R. ; MUSSE, S. . Integrating graphic software: the making of MATE. In: Conferencia Latinoamericana de Informatica, 1992, Las Palmas de Gran Canaria, 1992.
-
OLABARRIAGA, S. D. . Computador & Arte. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1991, São Paulo, 1991. p. 179-184.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; LOPES, P. F. . MESH - uma proposta para descrição de malhas de polígonos. In: Encontro Português de Computação Gráfica, 1989, Porto, 1989.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; BRASIL, A. . RETRISE - um sistema para reconstrução tridimensional a partir de cortes seriais. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1989, Águas de Lindóia, 1989.
-
FREITAS, C. M. D. S. ; COPSTEIN, B. ; OLABARRIAGA, S. D. . Ferramentas de especificação e controle da interface com o usuário do sistema AMPLO. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1989, Águas de Lindóia, 1989.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; LASCHUK, A. . SPA - um sistema para animação modelada. In: Congresso Nacional de Informática (SUCESU), 1988, Rio de Janeiro, 1988.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; PINHO, M. ; COMBA, J. L. ; FREITAS, C. M. D. S. . Ferramentas Gráficas do sistema AMPLO. In: Simp'osio Brasileirode Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1988, Petrópolis, 1988.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; LASCHUK, A. . SPA - um sistema extensível para animação modelada. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1988, Petrópolis, 1988.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; NEDERVEEN, A. ; SNEL, J. G. ; BELLEMAN, R. G. . A Virtual Laboratory for fMRI Data Management and Analysis. In: Human Brain Mapping, 2006, Florence. HBM, 2006.
-
SILVA, A. M. M. ; OLIVEIRA, G. L. ; NOAL, G. P. ; SCHMITZ, C. A. ; HAEFFNER, L. S. B. ; ANTUNES, P. S. P. ; OLABARRIAGA, S. D. . EasyTW: computer aided-system for skeletal age assessment. In: Computers in Radiology and Surgery, 2002, Paris. Proceedings of CARS 2002, 2002. p. 1015-1015.
-
OLABARRIAGA, S. D. ; PIMENTA, M. S. . Structuring the space of interaction practices in the segmentation of medical images: a first discussion. In: IV Workshop sobre Fatores Humanos em Sistemas Computacionais, 2001, Florianópolis. Anais do IHC'2001. Florianóplois: SBC, 2001. p. 297-299.
-
OLABARRIAGA, S. D. . Some Thoughts on the Evaluation of Interactive Methods for Medical Image Segmentation. In: Dagstuhl Seminar No. 01111: on Methodology of Evaluation in Medical Image Computing, 2001, Wadern. Dagstuhl Report No. 301. Wadern: IBFI gem. GmbH, Schloss Dagstuhl, 2001. p. 12-12.
-
OLABARRIAGA, S. D. . Super-elipsóides: ensino e aplicação em Computação Gráfica. In: Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional, 1990, Águas de Lindóia. Anais do Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional, 1990.
-
OLABARRIAGA, S. D. . Some Thoughts on the Evaluation of Interactive Methods for Medical Image Segmentation. 2001. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
-
OLABARRIAGA, S. D. . Human-Computer Interaction for the Segmentation of Medical Images. Amsterdam: Universidade de Amsterdam, 1999 (Tese de Doutorado).
-
OLABARRIAGA, S. D. ; SMEULDERS, A. W. M. . Interaction in the segmentation of medical images: a survey. Amsterdam: ISIS/WINS - University of Amsterdam, 1999 (Relatório de Pesquisa).
-
OLABARRIAGA, S. D. ; PFLUGER, P. R. ; SMEULDERS, A. W. M. . Piecewise DM: a locally controllable deformable model. Amsterdam: ISIS/WINS - University of Amsterdam, 1999 (Relatório de Pesquisa).
-
FRANCISCO, L. M. ; OLABARRIAGA, S. D. . GRAFITE - Pacote Gráfico para ensino de Computação Gráfica. Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1992 (Relatório de Pesquisa).
-
OLABARRIAGA, S. D. ; MONTENEGRO, F. S. . BIBFRAC - Biblioteca para geração de fractais. Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1992 (Relatório de Pesquisa).
-
OLABARRIAGA, S. D. ; CORRÊA, E. M. ; CALLIARI, C. ; POMPERMAYER, A. . Desenvolvimento de ASA e TRAMA. Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1991 (Relatório de Pesquisa).
-
OLABARRIAGA, S. D. ; MONTENEGRO, F. S. . Ambiente para estudo de fractais. Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1991 (Relatório de Pesquisa).
-
OLABARRIAGA, S. D. . Relatório sobre o PIPE3D: Pipeline para visualização tridimensional. Lisboa: INESC, 1989 (Relatório Técnico).
-
OLABARRIAGA, S. D. . Relatório sobre o desenvolvimento do MODELADOR. Lisboa: INESC, 1989 (Relatório Técnico).
-
OLABARRIAGA, S. D. . Proposta para descrição de malhas de polígonos. Porto Alegre: INESC, 1989 (Relatório de Pesquisa).
-
OLABARRIAGA, S. D. ; COPSTEIN, B. ; FREITAS, C. M. D. S. . Ferramentas para especificação e controle de interface com o usuário. Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1989 (Relatório de Pesquisa).
-
PINHO, M. ; COMBA, J. L. ; OLABARRIAGA, S. D. ; FREITAS, C. M. D. S. . Pacote Gráfico do AMPLO. Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1988 (Relatório de Pesquisa).
-
OLABARRIAGA, S. D. . SPA - um sistema computacional para produção de animação. Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1987 (Dissertação de Mestrado).
-
OLABARRIAGA, S. D. ; COMBA, J. L. . Extensão da Interface de saída em dispositivos gráficos. Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1987 (Relatório de Pesquisa).
-
OLABARRIAGA, S. D. . Interface padrão com dispositivos de entrada gráfica . Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1987 (Relatório de Pesquisa).
-
OLABARRIAGA, S. D. ; COMBA, J. L. ; PINHO, M. ; FREITAS, C. M. D. S. . Interface de saída com dispositivos gráficos. Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1987 (Relatório de Pesquisa).
-
OLABARRIAGA, S. D. . SELIPS - um programa de apoio ao ensino de super-elipsóides. Porto Alegre: CPGCC - UFRGS, 1986 (Trabalho Individual).
Outras produções
BREEUWER, M. ; OLABARRIAGA, S. D. . Segmentation of Thrombus in Abdominal Aortic Aneurysms from CTA. 2005.
BREEUWER, M. ; Olabarriaga, S.D. . Multi-component vessel segmentation. 2005.
OLABARRIAGA, S. D. ; NIESSEN, W. ; GERRITSEN, F. . Proceedings og the Workshop on interactive Medical Image Visualization and Analysis. 2001. (Editoração/Anais).
OLABARRIAGA, S. D. ; LISBOA, M. L. B. ; FREITAS, C. M. D. S. ; TING, W. S. . Revista de Informática Teórica e Aplicada. 2000. (Editoração/Periódico).
NEDEL, L. P. ; OLABARRIAGA, S. D. . Pinscreen. 1991 (orientação de trabalho individual - nível mestrado) .
Prêmios
2008
Best paper award, HealthGrid Conference, Chicago, US, HealthGrid Association.
2008
Second best demo at EGEE User Forum, Clairmont-Ferrand, FR, Enabling Grids for E-science in Europe ( EGEE) project.
Histórico profissional
Endereço profissional
-
Academic Medical Center of the University of Amsterdam, Department of Clinical Epidemiology, Biostatistics and Bioinformatics. , Meibergdreef 9 Room J1B-217-1, 1100DE - Amsterdam, - Holanda, Telefone: (020) 5664660, Ramal: 64660, URL da Homepage:
Experiência profissional
2008 - 2009
Academic Medical Center of the University of AmsterdamVínculo: empregado, Enquadramento Funcional: post doctoral fellow, Carga horária: 36, Regime: Dedicação exclusiva.
2005 - 2007
Universiteit van AmsterdamVínculo: Pesquisador, Enquadramento Funcional: Researcher, Carga horária: 40
2002 - 2005
University Medical Center - UtrechtVínculo: Pesquisador, Enquadramento Funcional: Pos-doctoral fellow, Carga horária: 32
Atividades
-
11/2002 - 02/2005
Pesquisa e desenvolvimento .,Linhas de pesquisa
1989 - 2002
Universidade Federal do Rio Grande do SulVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
-
03/1990 - 11/2002
Ensino, Computação, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Computação Gráfica, Síntese de Imagens Realistas, Tópicos Especiais: Caracterização de Desempenho em Visão Computacional
-
12/1989 - 11/2002
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Informática, Departamento de Informática Aplicada.,Linhas de pesquisa
-
12/1989 - 11/2002
Ensino, Bacharelado Em Ciências de Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Computação Gráfica, Interfaces Homem-Máquina, Introdução ao Processamento Gráfico, Tópicos Especiais em Computação Gráfica
1988 - 1989
Instituto de Engenharia e Sistemas de ComputadoresVínculo: Pesquisadora, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 40
Atividades
-
10/1988 - 11/1989
Pesquisa e desenvolvimento , Grupo de Computação Gráfica de Lisboa, .,Linhas de pesquisa
-
06/1989 - 06/1989
Treinamentos ministrados , Grupo de Computação Gráfica de Lisboa, .,Treinamentos ministrados, Introdução a CAD/CAM, Computação Gráfica para Bailarinos, Introdução à Computação Gráfica
1981 - 1982
Eletrônica Digital SaVínculo: Auxiliar de documentação, Enquadramento Funcional: Estagiária, Carga horária: 20
Atividades
-
02/1982 - 09/1983
Pesquisa e desenvolvimento , Desenvolvimento, .,Linhas de pesquisa
-
09/1981 - 01/1982
Estágios , Documentação, .,Estágio realizado, Documentação de Equipamentos.
1985 - 1985
Pensamento Processamento de Dados LtdaVínculo: Projetista de Software, Enquadramento Funcional: Funcionário, Carga horária: 30
Atividades
-
03/1985 - 09/1985
Pesquisa e desenvolvimento .,Linhas de pesquisa
1992 - 1993
San Diego Supercomputing CenterVínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Colaborador, Carga horária: 40
Atividades
-
12/1992 - 02/1993
Pesquisa e desenvolvimento , Scientific Visualization Laboratory, .,Linhas de pesquisa
2000 - 2000
University of CalgaryVínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: , Carga horária: 40
Atividades
-
11/2000 - 11/2000
Pesquisa e desenvolvimento , Dept Of Electrical And Computer Engineering, University Of Calgary.,Linhas de pesquisa
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de Sílvia Delgado Olabarriaga e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todas as movimentações desse processo e sempre que o processo aparecer em publicações dos Diários Oficiais e nos Tribunais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Confirma a exclusão?