Siomar de Castro Soares

Possui graduação em Biomedicina pela Universidade de Uberaba (2002-2006). Formação complementar em Bioinformática (2007). Mestrado em Genética pela UFMG (2008-2009). Doutorado em Genética pela UFMG (2009-2013) com 1 ano de doutorado sanduíche pelo Center for Biotechnology (CeBiTec) da Universität Bielefeld (2011-2012). Doutorado em Bioinformática pela UFMG (2015-2019). Pós-doutorado em Bioinformática pela UFMG (2013-2014). Pesquisador Sênior Bioinformata no Laboratório Oficial Central do Ministério da Pesca e Aquicultura (2014-2015). Secretário da regional Sudeste da Sociedade Brasileira de Genética (2017-2018), Coordenador Substituto do curso de graduação em Biomedicina da UFTM (2017-2019), Diretor do Departamento de Desenvolvimento de Pesquisa e Inovação Tecnológica da UFTM (2019-2022), Membro Afiliado da Academia Brasileira de Ciências (2018-2022). Atualmente é Professor do Magistério Superior da Universidade Federal do Triângulo Mineiro - UFTM (2015-Atual). Áreas de atuação: genética molecular, sequenciamento genômico e genômica comparativa de microorganismos, com enfoque em pan-genômica, plasticidade genômica na identificação de ilhas de patogenicidade e fatores de virulência, filogenômica, epidemiologia molecular, vacinologia reversa e desenvolvimento de softwares (linguagens perl e java).

Informações coletadas do Lattes em 12/03/2024

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioinformática

2015 - 2019

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Pan-genomics applications in taxonomy, probiotics and therapeutics
, Ano de obtenção: 2019. Vasco Ariston de Carvalho Azevedo.

Doutorado em Genética

2009 - 2013

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Pan-genomic analyses of Corynebacterium pseudotuberculosis and characterization of the biovars ovis and equi through comparative genomics
Orientador: em Universität Bielefeld ( Andreas Walter Tauch)
com Vasco Ariston de Carvalho Azevedo. Coorientador: Andreas Walter Tauch. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Mestrado em Genética

2008 - 2009

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Validação de um método computacional para Identificação, Caracterização e Comparação in silico de Ilhas de Patogenicidade no Gênero Corynebacterium e aplicação no genoma de duas linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis
, Ano de Obtenção: 2009.Anderson Miyoshi.Coorientador: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais, FAPEMIG, Brasil. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Aperfeiçoamento em Aperfeiçoamento em Bioinformática

2007 - 2008

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Bioinformática. Ano de finalização: 2008
Orientador: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo

Graduação em Biomedicina

2002 - 2007

Universidade de Uberaba
Título: Pesquisa de Incidência de Isospora belli em pacientes portadores de HIV.
Orientador: Elaine Grava Japaulo

Pós-doutorado

2013 - 2014

Pós-Doutorado. , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Formação complementar

2021 - 2021

Introdução a análise de transcriptomas. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2021 - 2021

Biotecnologia de vacinas. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2020 - 2020

MC 10. Ciência aplicada à investigação de cenas de crime: uma abordagem teó. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Ciências Forenses, SBCF, Brasil.

2013 - 2013

Workshop Intensivo Publicase. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2013 - 2013

Metagenomas. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2011 - 2011

Montagem e anotação de genomas bacterianos. (Carga horária: 104h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2010 - 2010

Perl for Bioinformatics and Computacional Biology. (Carga horária: 3h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2010 - 2010

Introdução ao Programa BioNumerics. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2010 - 2010

Plataforma de Sequenciamento de Nova Geração. (Carga horária: 90h). , Centro Brasileiro-Argentino de Biotecnologia, CBAB, Brasil.

2010 - 2010

I Curso de Inverno de Toxinologia. (Carga horária: 12h). , Universidade Federal de Uberlândia, UFU, Brasil.

2008 - 2008

Redação de Artigos Científicos. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2005 - 2005

Diagnóstico Molecular. (Carga horária: 5h). , Universidade Federal do Triângulo Mineiro, UFTM, Brasil.

2004 - 2004

Mutagênese Ambiental. (Carga horária: 5h). , Universidade Federal do Triângulo Mineiro, UFTM, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Francês

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Alemão

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Projetos de pesquisa

2022 - Atual

Análise de Salmonella enterica utilizando uma estratégia combinada de pangenômica, transcriptômica e metagenômica em um contexto de saúde única, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Siomar de Castro Soares - Coordenador / Rodrigo profeta - Integrante / Andrei G Felice - Integrante / Bart Weimer - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
2016 - Atual

Implementação e validação de um software integrado de análises filogenômicas, pan-genômicas e de plasticidade genômica bacteriana, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Siomar de Castro Soares - Coordenador / Vasco Azevedo - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Wanderson Marques Silva - Integrante / Artur Silva - Integrante / Rommel T J Ramos - Integrante / Ulisses de Pádua Pereira - Integrante / Luis Carlos Guimarães - Integrante / Flavia Figueira Aburjaile - Integrante / Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá - Integrante / Letícia de Castro Oliveira - Integrante / Leandro Benevides - Integrante / Adonney A O Veras - Integrante / Kenny C Pinheiro - Integrante / Camila Botelho Miguel - Integrante / Wellington Francisco Rodrigues - Integrante / André Luiz Pedrosa - Integrante / CARLO JOSÉ FREIRE DE OLIVEIRA - Integrante.
2016 - Atual

Análise comparativa do transcriptoma da linhagem probiótica Lactoccocus lactis subsp. lactis NCDO 2118 após passagem pelo intestino, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Siomar de Castro Soares - Coordenador / Rommel T J Ramos - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Letícia de Castro Oliveira - Integrante / Camila Botelho Miguel - Integrante / Wellington Francisco Rodrigues - Integrante / Marcos Vinicius da Silva - Integrante / CARLO JOSÉ FREIRE DE OLIVEIRA - Integrante / Arun Kumar Jaiswal - Integrante / Helioswilton Salesde Campos - Integrante / Virmondes Rodrigues Junior - Integrante.
2015 - Atual

Epidemiologia molecular e genômica comparativa de bactérias patogênicas de interesse médico e veterinário, Descrição: Com o advento das tecnologias de sequenciamento de nova geração, o custo por sequenciamento genômico tem diminuído drasticamente, abrindo portas para a realização de análises de big data: genômica comparativa, pangenoma, metagenômica, transcriptômica, epidemiologia molecular de genoma inteiro, dentre outros. Em decorrência disso, a quantidade de dados depositados em bancos de dados públicos cresceu exponencialmente, gerando oportunidades para grupos analisarem e correlacionarem doenças a nível mundial. Neste contexto, os projetos de sequenciamento de genomas completos de bactérias tem crescido exponencialmente, devido ao tamanho diminuto dos genomas, simplicidade na montagem dos mesmos e disponibilidade de ferramentas de bioinformática para comparação destes genomas. Neste projeto, propomos realizar o isolamento, identificação e sequenciamento genômico de bactérias patogênicas isoladas na cidade de Uberaba. Além disso, este trabalho projeto também visa analisar genomas de bactérias de interesse médico e veterinário depositados em bancos de dados online, utilizando metodologias que ainda não tenham sido abordadas no estudo das mesmas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Siomar de Castro Soares - Coordenador / Letícia de Castro Oliveira - Integrante / Camila Botelho Miguel - Integrante / Wellington Francisco Rodrigues - Integrante / Marcos Vinicius da Silva - Integrante / CARLO JOSÉ FREIRE DE OLIVEIRA - Integrante / Marcelo Costa Araújo - Integrante / Arun Kumar Jaiswal - Integrante / Helioswilton Salesde Campos - Integrante / Virmondes Rodrigues Junior - Integrante / Alissa de Sarom Ferreira Freitas - Integrante / Jéssica Coraiola Nevoa - Integrante / Arthur Lacerda Mendonça - Integrante / Flávia Manfré dos Santos - Integrante / Leandro Gomes Alves - Integrante / Marcela Fernandes da Matta - Integrante / Victor Augusto Sallum Ceballos - Integrante.
2014 - Atual

Biologia Computacional - REDE DE COOPERAÇÃO ACADÊMICA PARA O ESTUDO E DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS PARA A GENÔMICA ESTRUTURAL E FUNCIONAL, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Vasco Ariston de Carvalho Azevedo em 08/03/2016., Descrição: Fortalecer e ampliar o intercâmbio acadêmico entre os programas inter-unidades de Pós-Graduação em Bioinformática da UFMG (CAPES 6) e da USP (5), o de Biotecnologia da UFPA (CAPES 5) e o de Bioinformática da UFPR (CAPES 3) com a criação de uma rede voltada a aumentar a formação de recursos humanos em Biologia Computacional, em resposta à presente chamada. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (7) Doutorado: (6) . , Integrantes: Siomar de Castro Soares - Integrante / Sintia Silva de Almeida - Integrante / Carlos Augusto Almeida Diniz - Integrante / Hassan, S. S. - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Coordenador / Sandeep Tiwari - Integrante / Vinicíus AC Abreu - Integrante / Edson Folador - Integrante / Lucas Gonçalves Amorim - Integrante / Diego César Batista Mariano - Integrante / Letícia de Castro Oliveira - Integrante / Edgar L Aguiar - Integrante / Alberto Fernandes Oliveira Júnior - Integrante / Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / José Miguel Ortega - Integrante / Lucas Bleicher - Integrante / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Integrante / Raoni Almeida de Souza - Integrante / Benjamin Viart - Integrante / Camila Franco Batista de Oliveira - Integrante / Andrea Silveira Vilela - Integrante.
2013 - Atual

Biologia Computacional - REDE DE COOPERAÇÃO ACADÊMICA PARA O ESTUDO E DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS PARA A GENÔMICA ESTRUTURAL E FUNCIONAL, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Vasco Ariston de Carvalho Azevedo em 01/07/2017., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Siomar de Castro Soares - Integrante / Vasco Azevedo - Coordenador / Sintia Silva de Almeida - Integrante / Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Hassan, S. S. - Integrante / Sandeep Tiwari - Integrante / Vinicíus AC Abreu - Integrante / Edson Folador - Integrante / Lucas Gonçalves Amorim - Integrante / Diego César Batista Mariano - Integrante / Letícia de Castro Oliveira - Integrante / Edgar L Aguiar - Integrante / Alberto Fernandes Oliveira Júnior - Integrante / José Miguel Ortega - Integrante / Lucas Bleicher - Integrante / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Integrante / Raoni Almeida de Souza - Integrante / Benjamin Viart - Integrante / Camila Franco Batista de Oliveira - Integrante / Andrea Silveira Vilela - Integrante.
2013 - Atual

Análise Pangenômica de Corinebactérias Patogênicas Emergentes, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Artur Luiz da Costa da Silva em 21/04/2016., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Siomar de Castro Soares - Integrante / Vasco Azevedo - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Artur Silva - Coordenador / Rommel T J Ramos - Integrante / Adriana Ribeiro Carneiro - Integrante / Rafael Azevedo Baraúna - Integrante.

Prêmios

2015

Menção honrosa no prêmio Jovem Geneticista pelo trabalho Pan-genomic analyses of Corynebacterium pseudotuberculosis and characterization of the biovars ovis and equi through comparative genomics, Genética 2015 - 61 Congresso Brasileiro de Genética.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade Federal do Triângulo Mineiro, Instituto de Ciências Biológicas e Naturais. , Rua Getúlio Guaritá, S/N, Nossa Senhora da Abadia, 38025180 - Uberaba, MG - Brasil, Telefone: (34) 33185203, Ramal: 5203

Experiência profissional

2013 - Atual

Universidade Federal do Pará

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2015 - Atual

Universidade Federal do Triângulo Mineiro

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor do Magistério Superior, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

03/2015
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Ciências Biológicas e Naturais, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia.,Linhas de pesquisa
12/2019 - 05/2022
Direção e administração, Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação.,Cargo ou função, Diretor do Departamento de Desenvolvimento de Pesquisa e Inovação Tecnológica.
05/2019 - 12/2019
Direção e administração, Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação.,Cargo ou função, Diretor do Departamento de Desenvolvimento da Pesquisa e Tecnologia.
01/2017 - 05/2019
Direção e administração, Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação.,Cargo ou função, Coordenador Substituto de Desenvolvimento em Pesquisa e Tecnologia.
01/2017 - 01/2019
Direção e administração, Instituto de Ciências Biológicas e Naturais, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia.,Cargo ou função, Coordenador Substituto do Curso de Graduação em Biomedicina.

2014 - 2015

Laboratório Oficial Central do Ministério da Pesca e Aquicultura

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisador Sênior Bioinformata, Carga horária: 40

2015 - Atual

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor colaborador - PG em Bioinformatica

2007 - 2007

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2005 - 2006

Instituto de Patologia Clínica Dr. Jorge Furtado

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário no setor de Microbiologia, Carga horária: 36, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
A carga horária total foi de 1548 horas. Estágio ocorreu no setor de Parasito/Urinálise durante o primeiro mês.

2006 - 2006

Universidade de Uberaba

Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitor de Ciência Biomédicas Aplicadas II, Carga horária: 10, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
A matéria de Ciências Biomédicas Aplicadas II é composta das matérias de Biologia Molecular, Hormônios, Hematologia e Líquidos Cavitários (que também contém citologia esfoliativa dentro de seu conteúdo programático).