Wendel de Oliveira Castro

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Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO ; CASTRO, WENDEL DE OLIVEIRA ; MORAES, PABLO HENRIQUE GONÇALVES ; SIQUEIRA, ANDREI SANTOS ; AGUIAR, DÉLIA CRISTINA FIGUEIRA ; DE LIMA, CLAYTON PEREIRA SILVA ; VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO LÍDIO SILVA GONÇALVES ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA ; DALL?AGNOL, LEONARDO TEIXEIRA ; GONÇALVES, EVONNILDO COSTA . Draft Genome Sequence of Alkalinema sp. Strain CACIAM 70d, a Cyanobacterium Isolated from an Amazonian Freshwater Environment. GENOME ANNOUNCEMENTS , v. 5, p. e00635-17, 2017.

• CASTRO, WENDEL DE OLIVEIRA ; LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO ; MORAES, PABLO HENRIQUE GONÇALVES ; SIQUEIRA, ANDREI SANTOS ; AGUIAR, DÉLIA CRISTINA FIGUEIRA ; BARAÚNA, ANNA RAFAELLA FERREIRA ; MARTINS, LUISA CARÍCIO ; FUZII, HELLEN THAIS ; COUTO, DANIELLE COSTA CARRARA ; FRANCÊS, REGIANE SILVA KAWASAKI ; SILVA DE LIMA, CLAYTON PEREIRA ; VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO LÍDIO SILVA GONÇALVES ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA ; DALL?AGNOL, LEONARDO TEIXEIRA ; GONÇALVES, EVONNILDO COSTA . Complete Genome Sequence of Porphyrobacter sp. Strain CACIAM 03H1, a Proteobacterium Obtained from a Nonaxenic Culture of Microcystis aeruginosa. GENOME ANNOUNCEMENTS , v. 5, p. e01069-17, 2017.

• CASTRO, WENDEL OLIVEIRA ; LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO ; MORAES, PABLO HENRIQUE GONÇALVES ; SIQUEIRA, ANDREI SANTOS ; AGUIAR, DÉLIA CRISTINA FIGUEIRA ; BARAÚNA, ANNA RAFAELLA FERREIRA ; MARTINS, LUISA CARÍCIO ; FUZII, HELLEN THAIS ; DE LIMA, CLAYTON PEREIRA SILVA ; VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO LÍDIO SILVA GONÇALVES ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA ; DALL'AGNOL, LEONARDO TEIXEIRA ; GONÇALVES, EVONNILDO COSTA . Draft Genome Sequence of Microcystis aeruginosa CACIAM 03, a Cyanobacterium Isolated from an Amazonian Freshwater Environment. GENOME ANNOUNCEMENTS , v. 4, p. e01299-16, 2016.

• DE OLIVEIRA VERAS, ADONNEY ALLAN ; DA SILVA, MIRIAM LOPES ; GOMES, JAQUELINE CONCEIÇÃO MEIRELES ; DIAS, LARISSA MARANHÃO ; DE SÁ, PABLO CARACCIOLO GOMES ; ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO ; CASTRO, WENDEL ; MIRANDA, FÁBIO ; KAZUO, EHILTON ; MARINHO, DIOGO ; RODRIGUES, MATEUS ; FREIRE, MATHEUS ; ZAHLOUTH, RAMIRO ; RENAN, WENDEL ; LOPES, THIAGO SOUZA ; MATTÉ, MARIA HELENA ; DA SILVA MAYER, CINTIA CAROLINA ; DE ALMEIDA VASCONCELOS BARBONI, SUZI ; MATTÉ, GLAVUR ROGÉRIO ; CARNEIRO, ADRIANA RIBEIRO . Draft Genome Sequences of Vibrio fluvialis Strains 560 and 539, Isolated from Environmental Samples. Genome Announcements , v. 3, p. e01344-14, 2015.

• CASTRO, W. D. O. ; TORRES-BALLESTEROS, A. M. ; NAKAYAMA, C. R. ; MELO, I. S. ; PELLIZARI, V. H. ; SILVA, A. ; RAMOS, R. T. J. . Draft Genome Sequence of Haloferax sp. Strain ATB1, Isolated from a Semi-Arid Region in the Brazilian Caatinga. Genome Announcements , v. 2, p. e00812-14-e00812-14, 2014.

• CASTRO, W. O. . Linguagens, Culturas, Tecnologias e Inclusão. 1. ed. São Paulo: Grupo de pesquisa LICTI, 2020.

• CASTRO, WENDEL . T e c n o l o g i a n a A dmi n i s t r a ç ã o P ú b l i c a d a Ama z ô n i a. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CASTRO, WENDEL . Aplicação da Informática em Startups. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CASTRO, W. O. . Bioinformática: Aplicações de Técnicas e Análise Computacionais nas Áreas Biológicas. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• CASTRO, W. O. . A trajetória de minha carreira Profissional. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CASTRO, W. O. . A importância da publicação científica. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CASTRO, W. O. . Guia das Startups: Como Startups e Empresas Estabelecidas podem criar Produtos Rentáveis. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CASTRO, W. O. . As Oportunidades, a valorização e o mercado em crescimento contínuo para a força de TIC da região NOrte. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2017 - Atual

  GRUPO DE PESQUISA: GRADIENTE DE MODELAGEM MATEMÁTICA E SIMULAÇÃO COMPUTACIONAL - GM²SC, Descrição: A Matemática e a Computação formam um grupo de linguagens capaz de representar a maioria dos fenômenos naturais e sociais. Com base nos conceitos de algoritmos dessas áreas da Ciência, o grupo GRADIENTE DE MODELAGEM MATEMÁTICA E SIMULAÇÃO COMPUTACIONAL - GM²SC, realiza pesquisas, análises, interpretações e estimações de eventos que comportem um grande número de variáveis associadas por complexas relações. O grupo está comprometido com o desenvolvimento de competências que possibilitem modelos matemáticos de forma sistêmica e propor soluções computacionais alinhadas às necessidades das aplicações, transformando em um agente fundamental da integração IFPA / COMUNIDADE, indispensável para o desenvolvimento tecnológico regional e nacional. Portanto, esse grupo de pesquisa, prevê que o resultado do seu trabalho esteja apto a ajudar no crescimento científico, tecnológico e educacional, atuando na execução, supervisão e consultoria de projetos, além de estimular os discentes em programas de pesquisa e/ou para o magistério.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Wendel de Oliveira Castro - Coordenador / DENIS COSTA - Integrante.

• 2013 - Atual

  Avaliação do Potencial de Biorremediação da Amazônia Atlântica pela Indústria de Petróleo, Descrição: Apesar de o Brasil ser um dos lideres mundiais em investimentos na área de energias renováveis, este ainda tem uma tradição e atual domínio de sua matriz energética por combustíveis fósseis, predominantemente o petróleo (Sachs 2005; Goldemberg & Lucon 2007). Inclusive, a expansão recente na rede de infraestrutura brasileira é em grande parte resultado dos investimentos no setor energético, essencialmente a exploração de petróleo e gás natural na costa brasileira, tal como realizado no projeto Pré-sal, na Bacia de Santos. Fator que contribuiu para o crescimento expressivo do país, bem como o desenvolvimento econômico e social. Aliado a esse desenvolvimento, houvera um aumento significativo da população e consequentemente um aumento na demanda de energia. Desta forma, para suprir essa demanda, umas das medidas necessárias é a busca por novas áreas de exploração de petróleo, a exemplo da Bacia Pará-Maranhão (Tolmasquim 2012). A importância do petróleo para o cotidiano da população e da indústria nacional e mundial como destacada acima, também traz consigo um grande risco ao meio ambiente. Risco o qual está associado a derramamentos e vazamentos acidentais durante os processos de exploração, produção, refinamento e principalmente transporte e armazenamento deste produto e seus derivados. Grandes desastres ambientes, tal como o do navio Exxon Valdez e da plataforma Deepwater Horizon, deterioram o ecossistema local e por isso atraem a atenção para estudos de comunidades em áreas contaminadas ou de possível contaminação por petróleo (Leahy & Colwell 1990; Das & Chandran 2011; Atlas & Hazen 2011). O petróleo é constituído, predominantemente por hidrocarbonetos, que podem chegar a 97% de sua composição e, em menor quantidade, de derivados orgânicos sulfurados, nitrogenados, oxigenados e organo-metálicos (Atlas, 1981; Atlas, 1995; Mair & Schicktanz, 1936; Posthuma, 1977; Santos et al, 2010). Devido à predominância dos hidrocarbonetos no petróleo, esses são os compostos mais utilizados como indicadores deste tipo de poluição, e podem ser divididos em quatro classes: os saturados, os aromáticos, asfaltenos (fenóis, ácidos graxos, cetonas, ésteres e porfirinas), e as resinas (piridinas, quinolinas, carbazóis, sulfóxidos e amidas) (Colwell 1977). A biodegradação por microrganismos representa um dos primeiros mecanismos de remoção de petróleo e hidrocarbonetos do ambiente, além de ser o método mais barato de biorremediação (Leahy & Colwell 1990), porém é um processo complexo que depende da natureza e da quantidade de hidrocarbonetos presentes. A suscetibilidade dos hidrocarbonetos do petróleo a degradação microbiana é ordenada da seguinte forma: alcanos lineares > alcanos ramificados > pequenos aromáticos > alkanos cíclicos. Os Hidrocarbonetos Policíclicos Aromáticos (HPAs) merecem atenção especial por serem de difícil degradação e um dos mais tóxicos ao homem. A biodegradação destes hidrocarbonetos do petróleo já foi reportada em diversos trabalhos, e mais de 79 gêneros bacterianos já foram identificados como capazes de realizar a degradação (Head et al. 2006). 6 A biodegradação microbiana de hidrocarbonetos do petróleo envolve um ataque oxidativo inicial intracelular dos poluentes orgânicos catalisada por oxigenases e peroxidases. Vias de degradação periféricas convertem poluentes orgânicos em intermediários do metabolismo central, por exemplo, o ciclo de ácido tricarboxilico. A biossíntese de biomassa celular ocorre a partir dos precursores metabólitos centrais, por exemplo, acetil-CoA, succinato e piruvato. Açúcares necessários para várias biossínteses são sintetizados através da gliconeogênese (Das & Chandran, 2011).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Wendel de Oliveira Castro - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Adriana Ribeiro Carneiro - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante / Maria Paula Cruz Schneider - Integrante / Vivian Helena Pellizari - Integrante / Rafael Azevedo Baraúna - Integrante / Diogo Marinho Almeida - Integrante / Thiago Souza Lopes - Integrante / Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá - Integrante / Adriana Maria Torres Ballesteros - Integrante / Adonney Allan de Oliveira Veras - Integrante.

• 2013 - Atual

  Análise Pangenômica de Corinebactérias Patogênicas Emergentes, Descrição: O número de espécies do gênero Corynebacterium identificadas como causadoras de infecções oportunistas e infecções nosocomiais em humanos vem crescendo bastante atualmente e a importância das corinebactérias para os microbiologistas clínicos e profissionais da saúde aumentou muito nos últimos anos. As espécies patogênicas deste gênero incluem as bactérias potencialmente produtoras de toxina diftérica, principalmente Corynebacterium diphtheriae, e as Corynebacterium spp. não diftéricas. Estas últimas podem ser encontradas naturalmente na mucosa e na microbiota normal da pele, mas o aumento dramático no número de indivíduos susceptíveis na atualidade, incluindo Página 1 de 13pacientes recebendo terapia imunossupressora, vem contribuindo para a identificação cada vez mais freqüente de espécies patogênicas emergentes. Em estudos recentes no Brasil, corinebactérias nãodiftéricas do complexo XSMA (Corynebacterium xerosis, Corynebacterium striatum, Corynebacterium minutissimum e Corynebacterium amycolatum) foram relatadas como importantes agentes causadores de infecções em pacientes com câncer. Estas bactérias têm sido isoladas de diversas fontes, incluindo ferimentos cirúrgicos, trato urinário, trato respiratório, tumores ulcerados e cateteres venosos. As espécies mais comumente isoladas são C. amycolatum e C. minutissimum. Tem sido relatado também um aumento na incidência de outra corinebactéria patogênica emergente, a C. pseudodiphtheriticum. Esta espécie também foi identificada como causadora de um surto de infecções respiratórias recentes em crianças com fibrose cística, na França. Embora estas espécies emergentes sejam geralmente de baixa virulência, as infecções que elas causam podem ser muito severas ou até mesmo fatais quando a terapia antimicrobiana efetiva não é iniciada precocemente, principalmente porque alguns isolados já apresentam resistência múltipla a antibióticos. No entanto, não é incomum encontrar trabalhos relatando identificações ambíguas e até mesmo incorretas destas bactérias pelos métodos mais amplamente utilizados, que se baseiam principalmente em testes bioquímicos, como o sistema API (Rapid) Coryne?. Ainda assim, a empresa líder mundial no fornecimento de kits semi-automatizados para identificação bioquímica de corinebactérias, a empresa bioMérieux, registrou no último ano um aumento significativo nas suas vendas para países do bloco de mercados emergentes, incluindo o Brasil. Atualmente, o auxílio de métodos moleculares baseados no seqüenciamento de genes tem contribuído para avanço no diagnóstico rápido. Dessa forma, justifica-se a realização de um estudo mais detalhado do metabolismo de diferentes isolados destas bactérias emergentes. Neste contexto, o principal objetivo deste projeto é combinar métodos de genômica estrutural e funcional numa estratégia sistêmica para entender a variabilidade bioquímica normalmente observada entre diferentes isolados de corinebactérias patogênicas emergentes, além de identificar novos determinantes moleculares de virulência para um conhecimento mais aprofundado da patogênese bacteriana, e também a seleção de candidatos para o desenvolvimento de medidas profiláticas eficientes contra as enfermidades causadas por C. pseudotuberculosis. Será utilizado um método de seqüenciamento de nova geração de vanguarda que, combinados com estratégias bioinformáticas já disponíveis, permitirá que a montagem e anotação dos genomas sejam feitas em tempo recorde. Espera-se que os resultados gerados neste trabalho contribuam significativamente para a identificação rápida e segura destas corinebactérias no futuro próximo, além melhorar nossa compreensão em escala genômica acerca dessas novas espécies patogênicas do gênero.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Wendel de Oliveira Castro - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante / Anne Cybelle Pinto - Integrante / Adriana Ribeiro Carneiro - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante.

Prêmios