Marbella Maria Bernardes da Fonseca

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• DA FONSÊCA, Marbella Maria ; FREITAS, J. F. ; SILVA, Rita de Cássia Barreto da ; MINNICELLI, CAROLINA FONSECA ; SILVA, K. K. ; AGNEZ-LIMA, L. F. . First insights into bacterial communities in pre-salt oil reveal a far-from-sterile environment. Fuel , v. 312, p. 122860, 2022.

• ARAUJO, W. ; OLIVEIRA, J. ; ARAUJO, S. C. S. ; MINNICELLI, CAROLINA FONSECA ; SILVA, Rita de Cássia Barreto da ; FONSÊCA, M. M. B. ; FREITAS, J. F. ; SILVA, K. K. ; NAPP, AMANDA P. ; PEREIRA, E. ; PERALBA, M. C. ; PASSAGLIA, L. M. P. ; VAINSTEIN, M. H. ; AGNEZ-LIMA, L. F. . Microbial Culture in Minimal Medium With Oil Favors Enrichment of Biosurfactant Producing Genes. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY , v. 8, p. 962, 2020.

• ARAUJO, S. C. S. ; SILVA-PORTELA, RITA DE CÁSSIA BARRETO ; LIMA, D. C. ; FONSÊCA, MARBELLA MARIA B. DA ; ARAUJO, W. J. ; SILVA, U. B. ; NAPP, AMANDA P. ; PEREIRA, E. ; VAINSTEIN, M. H. ; AGNEZ-LIMA, L. F. . MBSP1: a biosurfactant protein derived from a metagenomic library with activity in oil degradation.. Scientific Reports , v. 10, p. 1340, 2020.

• DA FONSECA, MARBELLA MARIA BERNARDES ; MINNICELLI, CAROLINA FONSECA ; SILVA-PORTELA, RITA DE CÁSSIA BARRETO ; DE FARIAS, MIRNA FERREIRA ; DOS SANTOS, PAULA RAFAELA SILVA ; FERNANDES, GLAUBER JOSÉ TUROLLA ; Agnez-Lima, Lucymara Fassarella . Unlocking and functional profiling of the bacterial communities in diesel tanks upon additive treatment. FUEL , v. 236, p. 1311-1320, 2019.

• GOLBERT, DAIANE CRISTINA F. ; SANTANA-VAN-VLIET, ELIANE ; RIBEIRO-ALVES, MARCELO ; FONSÊCA, MARBELLA MARIA B. DA ; LEPLETIER, AILIN ; MENDES-DA-CRUZ, DANIELLA ARÊAS ; LOSS, GUILHERME ; COTTA-DE-ALMEIDA, VINÍCIUS ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R. ; SAVINO, WILSON . Small interference ITGA6 gene targeting in the human thymic epithelium differentially regulates the expression of immunological synapse-related genes. Cell Adhesion & Migration , v. 11, p. 1-16, 2017.

• DA SILVA, VANDECLECIO ; FONSECA, ANDRÉ ; FONSECA, MARBELLA ; DA SILVA, THAYNA ; COELHO, ANA ; KROLL, JOSÉ ; DE SOUZA, JORGE ; STRANSKY, BEATRIZ ; DE SOUZA, GUSTAVO ; DE SOUZA, SANDRO . Genome-wide identification of cancer/testis genes and their association with prognosis in a pan-cancer analysis. Oncotarget , v. 10, p. 92966-92977, 2017.

• FONSECA, ANDRÉ L. ; DA SILVA, VANDECLÉCIO L. ; DA FONSÊCA, Marbella M. ; MEIRA, ISABELLA T. J. ; DA SILVA, THAYNÁ E. ; KROLL, JOSÉ E. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ M. ; FREITAS, CLÉBER R. ; FURTADO, RAIMUNDO ; DE SOUZA, JORGE E. ; STRANSKY, BEATRIZ ; DE SOUZA, SANDRO J. . Bioinformatics Analysis of the Human Surfaceome Reveals New Targets for a Variety of Tumor Types. International Journal of Genomics , v. 2016, p. 1-7, 2016.

• SIQUEIRA, FRANCIELE MABONI ; THOMPSON, CLAUDIA ELIZABETH ; VIRGINIO, VERIDIANA GOMES ; GONCHOROSKI, TAYLOR ; REOLON, LUCIANO ; ALMEIDA, LUIZ GONZAGA ; da Fonsêca, Marbella Maria ; DE SOUZA, RANGEL ; PROSDOCIMI, FRANCISCO ; SCHRANK, IRENE SILVEIRA ; Ferreira, Henrique Bunselmeyer ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA ; Zaha, Arnaldo . New insights on the biology of swine respiratory tract mycoplasmas from a comparative genome analysis. BMC Genomics , v. 14, p. 175, 2013.

• Lorenzatto, Karina Rodrigues ; Monteiro, Karina Mariante ; Paredes, Rodolfo ; Paludo, Gabriela Prado ; da Fonsêca, Marbella Maria ; Galanti, Norbel ; Zaha, Arnaldo ; Ferreira, Henrique Bunselmeyer . Fructose-bisphosphate aldolase and enolase from Echinococcus granulosus: Genes, expression patterns and protein interactions of two potential moonlighting proteins. Gene (Amsterdam) , v. 506, p. 76-84, 2012.

• FONSÊCA, M. M. B. ; ZAHA, Arnaldo ; Caffarena, Ernesto R. ; Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro . Structure-based functional inference of hypothetical proteins from Mycoplasma hyopneumoniae. Journal of Molecular Modeling (Print) , v. xx, p. xx, 2011.

• Fonseca, Marbella Maria ; Alarcon, Frank J.B. ; Vasconcelos, Ana Tereza de ; Agnez-Lima, Lucymara Fassarela ; Fonsêca, Marbella Maria . A model for the RecA protein of Mycoplasma synoviae. Genetics and Molecular Biology (Impresso) , v. 30, p. 290-295, 2007.

• Carvalho, FabÃ&shy ; Fonseca, Marbella Maria ; Batistuzzo De Medeiros, SÃ&shy ; Scortecci, Kátia Castanho ; BLAHA, Carlos Alfredo Galindo ; Agnez-Lima, Lucymara Fassarella ; Fonsêca, Marbella Maria . DNA repair in reduced genome: The Mycoplasma model. Gene (Amsterdam) , v. 360, p. 111-119, 2005.

• FONSÊCA, M. M. B. ; ZAHA, A. ; Caffarena, Ernesto R. ; VASCONCELOS, Ana Tereza . Structure-based functional inference of hypothetical proteins from Mycoplasma hyopneumoniae. In: VI X-meeting, 2010, Ouro Preto. VI X-meeting, 2010.

• A. Delga ; JAUNEAU, A. ; POUZET, C. ; Fonsêca, Marbella Maria ; KRAUT, A. ; KNAPP, S. ; MARCO, Y. ; DESLANDES, L. . The Ralstonia solanacearum Popp2 effector acetylates bromodomain Containing proteins: towards a novel virulence stra Tegy that targets Epigenetic readers?. In: International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, 2014, Rhodes. XVI International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, 2014.

• FONSÊCA, M. M. B. ; VASCONCELOS, Ana Tereza ; ZAHA, A. . Using threading for gene function prediction in Mycoplasma hyopneumoniae 7448 genome. In: X-meeting 2007, 2007, São Paulo. X-meeting.

• FONSÊCA, M. M. B. ; ALARCON, Frank J B ; VASCONCELOS, Ana Tereza ; LIMA, Lucymara Fassarela Agnez . A structural model to RecA protein from Mycoplasma synoviae. In: In-silico Analysis of Proteins: Celebrating the 20th Anniversary of Swiss-Prot, 2006, Fortaleza. Celebrating the 20th Anniversary of Swiss-Prot, 2006.

• FONSÊCA, M. M. B. ; LIMA, Lucymara Fassarela Agnez . Análise de Polimorfismos da protéina RecA em diferentes isolados de Mycoplasma synoviae. In: VII Congresso Brasileiro de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental, 2005, Natal. VII Congresso Brasileiro de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental, 2005.

• FONSÊCA, M. M. B. ; CARVALHO, F. M. ; LIMA, L. F. A. ; MEDEIROS, S. R. B. . Reparo de DNA em genoma reduzido: Modelo Mycoplasma. In: 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004, Florianópolis. 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004.

• FONSÊCA, M. M. B. ; CARVALHO, F. M. ; DUARTE, Fábio Teixeira ; BLAHA, Carlos Galindo ; MEDEIROS, Silvia Bastistuzzo de ; LIMA, L. F. A. . Identificação de Genes Envlvidos nas vias de Reparo de DNA de Mycoplasma synoviae. In: 49° Congresso Brasileiro de Genética, 2003, Águas de Lindóia, 2003.

• da Fonsêca, Marbella Maria . Descontaminação biológica de água oleosa. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• da Fonsêca, Marbella Maria . Inovação e empreendedorismo na ciência nacional. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• da Fonsêca, Marbella Maria ; SILVA, Rita de Cássia Barreto da ; MINNICELLI, CAROLINA FONSECA ; SILVA, K. K. . Introdução à Biorremediação. 2021. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

• FONSÊCA, MARBELLA MARIA B. DA . Análise metagenômica: da extração do DNA a análise dos dados de sequenciamento. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

• FONSÊCA, M. M. B. . Genômica Funcional de Microrganismos Patogênicos. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Projetos de pesquisa

• 2020 - 2021

  Formulação de consórcios microbianos biorremediadores de contaminação provocada por petróleo pesado, Descrição: Recentemente, um desastre ambiental, ocasionado pelo derramamento de óleo, ocorreu no litoral do Nordeste chegando até ao Espírito Santo. Toneladas desses resíduos estão sendo retiradas da água, praias e mangues, porém, o material precisa ser tratado em unidades preparadas para tratamento de lixo industrial, requerendo uma logística para isso. Além disso, são necessárias estratégias de recuperação e monitoramento dos ambientes impactados. Em geral, os métodos físico-químicos usados para tratar esse óleo são caros e não ambientalmente seguros. Por outro lado, os processos biológicos são alternativas promissoras para remover esses contaminantes, principalmente devido à simplicidade e eficiência de custo quando comparados a outros métodos tradicionais. Os microrganismos representam a maior biomassa do planeta, mas devido às limitações das técnicas de cultivo, a maior parte desse patrimônio genético encontra-se inacessível. Com o advento das metodologias metagenômicas, essas limitações vêm sendo superadas, permitindo a exploração do pool genético de microrganismos não cultiváveis. Nesta proposta, temos como objetivos: a) Testar microrganismos isolados quanto a capacidade de degradar o óleo cru responsável pela contaminação do litoral brasileiro; b) Obter novos isolados a partir de amostras das áreas impactadas e que apresentem a capacidade de degradação de óleo cru; c) Formular consórcios microbianos com isolados alóctones e/ou autóctones para biorremediação por bioaumentação (ex situ e in situ); d) Avaliar o uso de biossurfactante proteico como adjuvante em estratégias de biorremediação; e) Monitorar a eficiência da biorremediação por estratégias de PCR multiplex e metagenômica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Lucymara Fassarela Agnez Lima - Coordenador.

• 2020 - 2021

  Biotecnologias aplicadas ao enfrentamento da COVID-19, Descrição: A presente proposta está fundamenta em quatro eixos principais: O primeiro é referente ao sequenciamento do genoma viral a partir de amostras de RNA de pacientes diagnosticados com COVID-19 nos estados do NE. Embora já existam relatos do sequenciamento do genoma viral, questões relativas a taxas de mutação e evolução viral, assim como associação entre variantes virais com prognóstico da doença ainda são escassos. A identificação de variantes em um maior número de amostras permitirá: traçar rotas de disseminação; estabelecer taxa de mutação e modelos evolutivos para o vírus; estabelecer correlação entre variantes virais, com carga viral, sinais clínicos, grupos etários e prognóstico; modelar consequências quanto a patogenicidade de proteínas virais variantes, possibilitando estimar marcadores de gravidade. A comparação das sequencias obtidas nesse estudo com sequencias de vírus animais depositada em banco de dados permitirá inferir modelos de transferência entre espécies. Proteínas variantes do vírus serão clonadas para avaliação de mecanismos de ação em modelos celulares, contribuindo assim, para validação dos modelos preditos. O segundo eixo, trata da resposta transcricional dos pacientes. Acredita- se que característica intrínsecas dos pacientes seriam determinantes no prognóstico da doença. Nesse contexto, estaremos realizando uma avaliação de transcriptoma em amostras (swab nasal, sangue e biópsias quando possível) de pacientes COVID-19 positivos (com subgrupos de sintomas leves e graves e faixas etárias) e COVID-19 negativos, visando identificação de genes diferencialmente expressos, além de identificação de variantes das regiões codantes dos genes identificados. Usando ferramentas de bioinformática, esperamos identificar rotas metabólicas e genes que possam ser usados como marcadores para prognóstico e potenciais alvos terapeuticos. Rotas e genes identificados serão estudados e validados em modelos celulares. O terceiro eixo visa análise metagenômica em amostras de pacientes COVID-19 positivos e negativos, visando identificar associações entre espécies e coinfecções. É conhecido que comunidades microbianas residem nas superfícies mucosas tendo efeitos diretos e indiretos na defesa do hospedeiro contra infecções. A análise metagenômica torna-se relevante, uma vez que, cerca de 50% das mortes de pacientes foram causadas pela infecção viral original, enquanto os outros 50% foram causados por infecções secundárias subsequentes. Não há relatos na literatura quanto a avaliação metagenômica em pacientes com COVID-19. Também será realizado análise metagenômica de área urbana visando a identificação do vírus em superfícies e no ambiente. Essa abordagem permitirá estimar carga viral ambiental, parâmetros ecológicos, co-ocorrência de espécies, entre outros, dando subsídios para geração de modelos preditivos para epidemias e pandemias futuras. O quarto eixo é o desenvolvimento de métodos de diagnóstico e tratamento, usando diferentes abordagens... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Lucymara Fassarela Agnez Lima - Coordenador.

• 2016 - 2019

  Núcleo de Genômica, Descrição: O laboratório de Genômica e Biologia Molecular da UFRN oferece serviços de análise genômica de larga escala para a comunidade científica através do Núcleo de Genômica- NUGEN. O NUGEN também oferece teste de Nutrigenética e outros testes de diagnóstico molecular.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Lucymara Fassarela Agnez Lima - Coordenador / Tirzah Braz Petta Lajus - Integrante.

• 2016 - 2019

  Metagenômica aplicada à avaliação dos efeitos da injeção de CO2 na microbiota de reservatórios, Descrição: Esta proposta envolve diferentes domínios de investigação para chegar a uma abordagem multidisciplinar coordenada visando o desenvolvimento de ferramentas e procedimentos para identificar (a) padrões de diversidade taxonômica e funcional de comunidades microbianas e (b) novos genes envolvidos com redução de sulfato, metanogênese, degradação de hidrocarbonetos, produção de surfactantes, entre outros, os quais possuem potencial para o desenvolvimento de estratégias biotecnológicas aplicadas a produção de petróleo. A partir disso, pretende-se monitorar a dinâmica das comunidades microbianas presentes em reservatórios submetidos à injeção de CO2 e estimar os impactos dessas microbiotas sobre a produção de petróleo. A partir do conhecimento adquirido será possível entender melhor os mecanismos bioquímicos envolvidos e propor estratégias que visem redução de perdas e otimização de processos... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Lucymara Fassarela Agnez Lima - Coordenador., Financiador(es): PETROGAL BRASIL - Auxílio financeiro.

• 2014 - 2015

  Biologia Sistêmica do Cancer, Descrição: Identificação de genes envolvidos em câncer dentro do surfaceoma humano através da integração de dados genômicos. Além de busca por novos "Câncer/Testis Antigens" utilizando dados genômicos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Sandro José de Souza - Coordenador.

• 2012 - 2014

  Reconhecimento de histonas e análise estrutural em larga escala da família de bromodomínios (BRDs) em 12 diferentes espécies, Descrição: Fornecer uma visão geral da evolução dos BRDs em 12 organismos (Plasmodium falciparum, Cryptosporidium hominis, Entamoeba histolytica, Dictyostelium discoideum, S. cerevisiae, Monosiga brevicollis, Caenorhabditis elegans, Arabidopsis thaliana, Drosophila melanogaster, Strongylocentrotus purpuratus, Danio rerio, Mus musculus). Entender a expansão do número desses domínios dentre os organismos e correlacionar com eventos de duplicação, perda gênica. Visando complementar a análise evolutiva e a análise dos resultados de bioinformática, BRD de diversos organismos modelos, como Plasmodium falciparum, Cryptosporidium parvum, Arabidopsis thaliana e Drosophila melanogaster serao alvos de experimentos de cristalografia, screening de compostos e peptideos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Coordenador / Stefan Knapp - Integrante.

• 2012 - 2012

  Abordagem multidisciplinar no estudo da biodiversidade, interação e metabolismo bacteriano em suínos, Descrição: exploração bioinformática da biodiversidade do ecossistema bacteriano do trato respiratório de suínos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / DE VASCONCELOS, ANA TEREZA - Coordenador.

• 2007 - 2011

  Genômica Computacional: geração, processamento e interpretação de dados genômicos, Descrição: Aprimorar a anotação do organismo M. hyopneumoniae 7448 utilizando a metodologia de threading, modelagem molecular e ensaios experimentais. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Ana Tereza Vasconcelos - Coordenador / Arnaldo Zaha - Integrante / Caffarena, Ernesto R. - Integrante.

• 2004 - 2006

  Genoma funcional de Chromobacterium violaceum e Mycoplasma synoviae:. Grupo RL, Descrição: Este projeto é uma continuação do projeto genoma brasileiro, formado por 25 laboratórios distribuidos por todo Brasil, sob coordenação geral da Dra. Ana Tereza de Vasconcelos (LNCC-MCT). O principal objetivo deste projeto é verificar a atividade de 28 genes, os quais foram objeto de patente, visando a validação das patentes solicitadas. Dentre as atividades que estão sendo estudadas estão: atividade antimicrobiana, biodegradação de xenobióticos, biorremediação de metais pesados, entre outras. Está sob responsabilidade do grupo RL (UFRN) os seguintes objetivos: a) realizar a caracterização da violaceína, pigmento produzido pela Chromobacterium violaceum, quanto ao seu potencial como fotossensibilizador; b) Construção de uma biblioteca de mutantes de C. violaceum por inserção aleatória de elementos de transposição c) avaliar se polimorfismos da proteína RecA de diferentes isolados de Mycoplasma synoviae e Mycoplasma hyopneumoniae estariam relacionadas a maior ou menor eficiência de recombinação em regiões repetitivas dos genomas relacionadas a patogenicidade. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Kátia Castanho Scortecci - Integrante / Silvia Bastistuzzo de Medeiros - Integrante / Lucymara Fassarela Agnez Lima - Coordenador / Lucila Carmem Monte Egito - Integrante / Aurizangela Oliveira de Sousa - Integrante.

Projetos de desenvolvimento

• 2021 - Atual

  Biotecnologia aplicada à Biorremediação, Descrição: Projeto submetido e aprovado no edital Centelha-RN para criação de uma startup (MicroCiclo) que oferece o serviço de biorremediação de resíduos contaminados. A MicroCiclo nasceu no Laboratório de Biologia Molecular e Genômica, como fruto de mais de 10 anos de investimento em pesquisa aplicada a obtenção de bactérias e bioprodutos capazes de degradar de hidrocarbonetos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Lucymara Fassarela Agnez Lima - Coordenador / MINNICELLI, CAROLINA FONSECA - Integrante / Rita de Cássia Barreto da Silva - Integrante / Kamilla Karla da Silva - Integrante., Financiador(es): Serviço de Apoio às Micro e Pequenas Empresas de Natal - Auxílio financeiro.

• 2021 - Atual

  Biotecnologia aplicada à Biorremediação, Descrição: Projeto submetido e aprovado no edital Centelha-RN para criação de uma startup (MicroCiclo) que oferece o serviço de biorremediação de resíduos contaminados. A MicroCiclo nasceu no Laboratório de Biologia Molecular e Genômica, como fruto de mais de 10 anos de investimento em pesquisa aplicada a obtenção de bactérias e bioprodutos capazes de degradar de hidrocarbonetos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Lucymara Fassarela Agnez Lima - Coordenador / MINNICELLI, CAROLINA FONSECA - Integrante / Rita de Cássia Barreto da Silva - Integrante / Kamilla Karla da Silva - Integrante., Financiador(es): Serviço de Apoio às Micro e Pequenas Empresas de Natal - Auxílio financeiro.

Prêmios