Deborah Antunes dos Santos
Graduada em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado do Rio de Janeiro (2012), obtive o Mestrado (2014) e o Doutorado (2018) em Biologia Computacional e Sistemas pela Fundação Oswaldo Cruz. Atuei como Tutora Presencial no âmbito do Consórcio CEDERJ/UENF, no curso de Licenciatura em Ciências Biológicas modalidade à distância (2014-2023). Durante minha carreira, desenvolvi expertise em modelagem molecular de sistemas biológicos, com foco em Biofísica Molecular, abordando temas como modelagem de proteínas, modelagem de RNA e dinâmica molecular. Atualmente, sou pós-doutoranda na Fiocruz, com bolsa Faperj Nota 10 (PDR-10), dedicando-me à pesquisa de riboswitches e seu potencial como alvos para o desenvolvimento de fármacos antibacterianos.
Informações coletadas do Lattes em 03/11/2025
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas
2014 - 2018
Fundação Oswaldo Cruz
Título: Searching for TPP riboswitch in the human genome and comparison with others from different species
, Ano de obtenção: 2018. Ernesto Raúl Caffarena. Coorientador: Fabio Passetti. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas
2012 - 2014
Fundação Oswaldo Cruz
Título: Proposição de modelos tridimensionais da extensão COOH-terminal da cisteíno-proteinase B de Leishmania (Leishmania) amazonensis, Ano de Obtenção: 2014
Orientador: Ernesto Raúl Caffarena
Coorientador: Carlos Roberto Alves. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Extensão COOH-termnial da Cisteíno-Protease B; Leishmania (Leishmania) amazonensis; Modelagem Tridimensional de Proteínas; Dinâmica Molecular.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
Graduação em Ciências Biológicas
2008 - 2012
Universidade do Estado do Rio de Janeiro
Título: Avaliação dos guias didáticos sobre ecologia e biodiversidade produzidos por licenciandos de Ciências Biológicas da FFP - UERJ
Orientador: Regina Rodrigues Lisbôa Mendes
Pós-doutorado
2022
Pós-Doutorado. , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ, FAPERJ NOTA 10, Brasil.
2019 - 2022
Pós-Doutorado. , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2019 - 2019
Pós-Doutorado. , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas
Formação complementar
2019 - 2019
Formação Inicial de Bolsistas de Tutoria do Consórcio CEDERJ. (Carga horária: 15h). , Fundação Centro de Ciências e Educação Superior à Distância do Estado do RJ, CECIERJ, Brasil.
2015 - 2015
Applied Statistical Thermodynamics 2015: from theory to molecular dynamics. (Carga horária: 80h). , Fundación Ciencia para la Vida, FCV, Chile.
2014 - 2014
Tutoria na plataforma Moodle/CEDERJ. (Carga horária: 30h). , Fundação Centro de Ciências e Educação Superior à Distância do Estado do RJ, CECIERJ, Brasil.
2014 - 2014
Curso de Formação em EAD com ênfase na Tutoria Cederj. (Carga horária: 90h). , Fundação Centro de Ciências e Educação Superior à Distância do Estado do RJ, CECIERJ, Brasil.
2014 - 2014
Cálculo de Modos Normais em Proteínas. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2013 - 2013
Curso de Caracterização de Proteínas através de Es. (Carga horária: 24h). , Programa de Desenvolvimento Tecnológico em Insumos para a Saúde, PDTIS/FIOCRUZ, Brasil.
2011 - 2011
Minicurso em Interpretação Clínica do Hemograma. (Carga horária: 4h). , Faculdade de Formação de Professores - UERJ, FFP-UERJ, Brasil.
2010 - 2010
Minicurso de Educação em Saúde. (Carga horária: 8h). , Faculdade de Formação de Professores -UERJ, FFP-UERJ, Brasil.
2008 - 2008
Extensão universitária em Transtornos Alimentares. (Carga horária: 6h). , Universidade Federal Fluminense, UFF, Brasil.
2008 - 2008
Extensão universitária em Conservação Ambiental. (Carga horária: 12h). , Universidade Federal Fluminense, UFF, Brasil.
2008 - 2008
Minicurso de Genética Forense. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
2008 - 2008
Minicurso de Perícia Criminal -Toxocologia Forense. (Carga horária: 8h). , Integra Cursos e Eventos, ICV, Brasil.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia/Especialidade: Modelagem de Sistemas Biológicos.
Participação em eventos
XV Brasilian Symposium on Bioinformatics (BSB 2022).2'-Deoxyguanosine Riboswitch Classes as Potential Targets for Antibiotics: A Structure and Dynamics Study. 2022. (Simpósio).
1º Workshop em Biologia Computacional no Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade - NUPEM/UFRJ.Estrutura e dinâmica de RNAs: simulações por dinâmica molecular e análise de redes complexas. 2019. (Simpósio).
XLIV Congresso da Sociedade Brasileira de Biofísica. TPP riboswitch as a triple antifungal target for Aspergillus oryzae. 2019. (Congresso).
X-Meeting 2016. Human riboswitch: are we close to predicting it?. 2016. (Congresso).
ISCB-LA/X-MEETING/BSB/SoiBio. Force field influence on peptides dynamics: an analysis of three-dimensional models of C-terminal extension of cysteine protease B of Leishmania (L.) amazonensis. 2014. (Congresso).
VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2014. (Outra).
V Simpósio de Estrutura Eletrônica e Dinâmica Molecular.Proposição de modelos tridimensionais da extensão COOH-terminal da cisteíno-proteinase B de Leishmania (Leishmania) amazonensis. 2014. (Simpósio).
Workshop em Métodos Computacionais Aplicados ao Desenvolvimento de Fármacoscos. 2013. (Simpósio).
X-meeting/BSB 2013 Conference. Three-dimensional solution of C-terminal extension of cysteine proteinase B of Leishmania (Leishmania) amazonensis. 2013. (Congresso).
4º Fórum de Integração dos Alunos de Pós-Graduação do Instituto Oswaldo Cruz.Apresentação do Projeto de Mestrado com discussão em mesas redondas com pesquisadores do IOC. 2012. (Outra).
II Encontro da Área de Pesquisa em Leishmanioses do IOC/Fiocruz.Reconstrução tridimensional da região COOH-terminal da císteino-proteinase B de Leishmania (Leishmania) amazonensis. 2012. (Encontro).
VI Encontro Regional de Ensino de Biologia.Vídeo Didático: Estudando a Reprodução de Peixes e Jogo Zoo & Ação: um instrumento para o fortalecimento da aprendizagem. 2012. (Outra).
11ª Semana de Graduação da Universidade do Estado do Rio de Janeiro.Os Guias Didáticos como Colaboradores da Divulgação de Espaços não Formais de Ensino. 2011. (Outra).
2ª Temporada do Programa de Férias Científicas do Instituto Vital Brazil.Estagiária Monitora. 2011. (Outra).
Água para a Vida na Ilha Grande, RJ.Concurso de Fotografias Olhares da Água para Vida na Ilha Grande, RJ. 2011. (Outra).
Ciclo de Palestras - Saúde: do macro ao micro. 2011. (Seminário).
Encontro de Professores I: Conhecendo o Museu da Vida. 2011. (Encontro).
Escorpianismo - atualização em saúde pública no Brasil - Instituto Vital Brazil. 2011. (Seminário).
I Simpósio de Parasitologia da FFP-UERJ. 2011. (Simpósio).
10ª Semana de Graduação da Universidade do Estado do Rio de Janeiro.O Processo de Registro de Guias Didáticos produzidos por Alunos e Professores da FFP/UERJ. 2010. (Outra).
3ª Jornada de Educação Matemática e 2ª Jornada Integrada FEBF/FFP/ Maracanã. 2010. (Outra).
III Encontro Articulando a Universidade e a Escola Básica no Leste Fluminense. 2010. (Encontro).
IV Seminário FFP para Todos.O Processo de Registro de Guias Didáticos Produzidos por Alunos e Professores da FFP/UERJ. 2010. (Seminário).
XII Semana de Biologia da FFP-UERJ & II Simpósio Ambiental do Leste Metropolitano do Rio de Janeiro.Guias Didáticos: Uma Alternativa no Ensino de Ecologia e Biodiversidade no Rio de Janeiro. 2010. (Simpósio).
XIV Semana de Microbiologia e Imunologia da UFRJ. 2008. (Outra).
Participação em bancas
GUIMARAES, A. C. R.;SANTOS, D. A.; TORRES, P. H. M.; MACHADO, L. A.; HOELZ, L. V. B.. Flexibilidade Conformacional e Resistência a Múltiplas Drogas: investigando o impacto de mutações na dinâmica da protease do HIV-1. 2024. Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.
SANTOS, D. A.; TORRES, P. H. M.; MATTOS, C. L. C.; SILVA, M. L.;CAFFARENA, E. R.. AbSet: um conjunto de dados de anticorpos padronizados para aplicação em aprendizagem de máquina. 2023. Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.
MATOS, N. B.; CARVALHO, C. M.;SANTOS, D. A.. Estratégias metodológicas in silico e in vitro na busca de novas moléculas contra Acinetobacter baumannii. 2023. Dissertação (Mestrado em Biologia Experimental) - Universidade Federal de Rondônia.
MAGALHAES, M. T. Q.; SANTOS, L. H. S.;SANTOS, DEBORAH ANTUNES; FERREIRA, R. S.. Domínio HIRAN variações estruturais e suas implicações na interação com ssDNA. 2020. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
CAFFARENA, E. R.; ESCOBAR, P. C.; SODERO, A. C. R.; SOUZA, M. P. C.;SANTOS, D. A.. Análises computacionais para o estudo da fumarato hidratase como potencial alvo para o desenvolvimento de fármacos leishmanicidas. 2019. Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.
PAIXAO, I. C. N. P.; SANTANA, M. V. S.; RIBEIRO, M. G.; GERALDO, R. B.;SANTOS, DEBORAH ANTUNES; GONZALEZ, M. S.; SANTOS, B. A. M. C.. Planejamento e análise de novas moléculas utilizando redes neurais artificiais como potenciais moduladores da via mTOR no transtorno do espectro autista. 2024. Tese (Doutorado em CIÊNCIAS E BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal Fluminense.
SANTOS, D. A.; SANTAREM, M. C. A.; SANTOS, L. M. B.. O conhecimento acerca da Educação Ambiental dos alunos de Gaduação de Ciências Biológicas do Cederj. 2025. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTAREM, M. C. A.; SANTOS, L. M. B.;SANTOS, D. A.. O uso de trilhas interpretativas no circuito ecológico caminhos de Maricá como ferramenta de sensibilização e Educação Ambiental. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, L. M. B.; SANTAREM, M. C. A.;SANTOS, D. A.. A importância dos modelos de ensino como ferramenta de melhoria do conhecimento científico em microbiologia. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTAREM, M. C. A.; SANTOS, L. M. B.;SANTOS, D. A.. Mudanças de hábitos como formas de prevenção ao câncer de estômago. 2024. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
LOH, R. K. T. M.; GUIMARAES, A. C. R.; COSTA, M. G. S.;SANTOS, D. A.. Desenho in silico de peptídeos inibidores do domínio de ligação ao receptor da proteína Spike de SARS-CoV-2. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Rio de Janeiro.
SANTOS, D. A.; SILVA, R. T.; PANETO, G. G.; PAULA, H.. Identificação das interações entre proteína Spike e a ECA-2 das variantes ômicron do Estado do. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal do Espírito Santo.
SANTOS, L. M. B.; SANTOS, S. J. C.; SANTAREM, M. C. A.;SANTOS, D. A.. Percepção dos alunos de Biologia do Polo do Cederj de São Gonçalo sobre a importância da vacinação no primeiro ano de vida. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, L. M. B.; MARINHO, E. B.; SANTAREM, M. C. A.;SANTOS, D. A.. Percepção dos Licenciandos em Ciências Biológicas do Cederj sobre a sustentabilidade na indústria da moda: o caso da fast fashion e seus impactos ambientais. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTAREM, M. C. A.; SANTOS, S. J. C.; SANTOS, L. M. B.;SANTOS, D. A.. A Importância da Atividade Prática no Ensino de Ciências: Aplicação no 7º Ano Do Ensino Fundamental da Rede Pública de Ensino. 2023. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, L. M. B.;SANTOS, DEBORAH ANTUNES; IMSAURRIAGA, C. S. A.; SANTAREM, M. C. A.. A percepção dos alunos de licenciatura em ciências biológicas do polo São Gonçalo do consórcio Cederj em relação à esporotricose. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTAREM, M. C. A.;SANTOS, DEBORAH ANTUNES; IMSAURRIAGA, C. S. A.; SANTOS, L. M. B.. Censo florístico dos indivíduos arbóreos no bairro do Cafubá, Niterói?RJ e a percepção da arborização urbana pela população local. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, DEBORAH ANTUNES; SANTAREM, M. C. A.; IMSAURRIAGA, C. S. A.; SANTOS, L. M. B.. Ciências Biológicas e produtos transgênicos: uma análise investigativa sobre o conhecimento acadêmico. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SILVA, L. M.; MOREIRA, A. D. R.; SANTOS, L. M. B.;SANTOS, DEBORAH ANTUNES. Abordagens escolares sobre reciclagem e reaproveitamento em ?Quarto de despejo: diário de uma favelada? de Carolina Maria de Jesus. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
PASTOR JUNIOR, A. A.;SANTOS, DEBORAH ANTUNES; CABRAL, L. F. E.; SANTAREM, M. C. A.. Conhecimentos e abordagens de plantas alimentícias não convencionais no contexto da educação em Ciências. 2022. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTAREM, M. C. A.; SANTOS, L. M. B.;SANTOS, DEBORAH ANTUNES; GAIQUE, T. G.. Características gerais e aplicabilidade do sistema agroflorestal: uma revisão bibliográfica. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, DEBORAH ANTUNES; LEITE, D. C.; SANTOS, L. M. B.; ALMEIDA, M. N.; SOARES, R. F.. O papel da tecnologia na transição do ensino semipresencial para o EAD integral, para os alunos de licenciatura em Ciências Biológicas (Cederj- São Gonçalo) no período pandêmico. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
MAGARAO, T. G. G.; SANTOS, L. M. B.; LOPES, B. P.; SANTOS, V. P.; COSTA, P. G.;SANTOS, DEBORAH ANTUNES. Conhecimento dos licenciandos em Ciências Biológicas do Consórcio Cederj sobre animais em extinção em uma parcela da Mata Atlântica, no Rio de Janeiro. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
MUSSI, V. O.;ANTUNES, D.; SANTOS, L. M. B.; GAIO, A. O.. Importância da alimentação e atividade física na prevenção da hipertensão arterial em alunos da escola municipal Almirante Alfredo Carlos Soares Dutra em São Gonçalo-RJ. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
ANTUNES, D.; GAIQUE, T. G.; SANTOS, L. M. B.; SOARES, R. F.. Abandono de animais domésticos: principais causas da renúncia de cães e gatos de alunos do Consórcio Cederj. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
ANTUNES, D.; SANTOS, L. M. B.; GAIQUE, T. G.. Análise do conhecimento de licenciandos em ciências biológicas sobre o consumo de leite e derivados. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
LAMEGO, C. R. S.; TEMPERINI, R. S. L.; SILVA, F. L. G.;SANTOS, DEBORAH ANTUNES. Educação em saúde e alimentação saudável: reflexões a partir de documentos curriculares e livros didáticos de Ciências para os anos finais do ensino fundamental. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
CARMO, G. T.; ALMEIDA FILHO, J. L.; SANTOS, L. M. B.;SANTOS, DEBORAH ANTUNES. Metodologia tradicional ou novas metodologias? Pontos positivos em sala de aula invertida. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, D. A.; SANTOS, L. M. B.; LOURENCO, P. M.. Rabdomiólise, quando o exercício deixa de ser saudável. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, D. A.; SILVA, F. L. G.; SILVA, M. M.; SANTOS, L. M. B.. Exame de Papanicolau: rastreio do câncer do colo de útero, sua evolução e as possibilidades para a atuação do biólogo. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, D. A.; SANTOS, L. M. B.; RIBEIRO, J. D.. Evasão escolar em uma escola pública rural no município de Rio Bonito-RJ. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, D. A.; SANTOS, L. M. B.; RIBEIRO, J. D.. A literatura no ensino de ciências naturais do ensino fundamental. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, D. A.; NUNES, A. S. F.; RIBEIRO, C. R. A.. Avaliação do conhecimento de alunos do ensino médio sobre hepatite B. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
SANTOS, D. A.; SANTOS, V. P.;MENDES,R.. Confecção e utilização do guia didático do Parque Nacional da Serra dos Órgãos (sede Petrópolis, Rio de Janeiro) como subsídio de integração entre espaços formais e não-formais de ensino. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro.
Orientou
Mapeamento teórico da superfície de energia livre de ligação da ribose-5-fosfato isomerase do Trypanosoma cruzi considerando efeitos do pH; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);
nálise Funcional e estrutural de mutações na proteína SUR2 e suas interações com Glibenclamida: Implicações para a Síndrome de Cantú; Início: 2024; Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);
Reposicionamento de Antivirais como Base para Novos Antibióticos via Riboswitches de 2?-desoxiguanosina; Início: 2025; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Vice-Presidência de Educação, Informação e Comunicação; (Coorientador);
Elucidação da Plasticidade Conformacional da Quinase 1 Cálcio dependente de Toxoplasma gondii (TgCDPK1): Uma Abordagem Computacional para o Desenvolvimento de Novos Inibidores e Terapias Anti-Toxoplasma; Início: 2024; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Coorientador);
Otimização in silico do neuropeptídeo VIP na interação com os receptores VPAC1, VPAC2 e PAC1; Início: 2022; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz; (Coorientador);
Análise do impacto estrutural de mutações na proteína receptora de AMP cíclico em Mycobacterium bovis BCG; Início: 2024 - Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);
Variantes em genes envolvidos na divisão meiótica: Implicações na aneuploidia humana; 2025; Dissertação (Mestrado em Programa de Pos-Graduação em Genética) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Deborah Antunes dos Santos;
In silico study and optimization of PACAP interactions with PAC1, VPAC1, and VPAC2; 2021; Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Deborah Antunes dos Santos;
TPP riboswitches as multiple targets for the treatment of fungal infections; 2022; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Vice-Presidência de Educação, Informação e Comunicação; Coorientador: Deborah Antunes dos Santos;
Ciências Biológicas e produtos transgênicos: uma análise investigativa sobre o conhecimento acadêmico; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Deborah Antunes dos Santos;
Análise da Aurora quinase A e associação com a síndrome de Down; 2022; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal Fluminense; Orientador: Deborah Antunes dos Santos;
O papel da tecnologia na transição do ensino semipresencial para o EAD integral, para os alunos de licenciatura em Ciências Biológicas (Cederj- São Gonçalo) no período pandêmico; 2021; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Deborah Antunes dos Santos;
Modelos metabólicos na predição da essencialidade de genes relacionados à biossíntese e transporte de tiaminapirofosfato em Aspergillus; 2021; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Centro Universitário da Zona Oeste; Orientador: Deborah Antunes dos Santos;
Abandono de animais domésticos: principais causas da renúncia de cães e gatos de alunos do Consórcio Cederj; 2020; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Deborah Antunes dos Santos;
Análise do conhecimento de licenciandos em ciências biológicas sobre o consumo de leite e derivados; 2020; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Deborah Antunes dos Santos;
Evasão escolar em uma escola pública rural no município de Rio Bonito-RJ; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Deborah Antunes dos Santos;
A literatura no ensino de ciências naturais do ensino fundamental; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Deborah Antunes dos Santos;
Avaliação do conhecimento de alunos do ensino médio sobre hepatite B; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro; Orientador: Deborah Antunes dos Santos;
Produções bibliográficas
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CARVALHO, JOÃO PEDRO BEZERRA ; ANTUNES, DEBORAH ; ADESSE, DANIEL ; GUIMARÃES, ANA CAROLINA . Computational Structural Comparison of Toxoplasma gondii CDPK1 and Human BUB1 kinases: Implications for Selective Inhibitor Design. ACS Omega , v. 1, p. 1, 2025.
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ANTUNES, DEBORAH ; SANTOS, LUCIANNA H. S. ; CAFFARENA, ERNESTO RAUL ; GUIMARÃES, ANA CAROLINA RAMOS . Structural and dynamic properties of guanosine-analog binding to 2--deoxyguanosine-II riboswitch: a computational study. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS , v. 1, p. 1-22, 2025.
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URBANSKI, ALYSSON HENRIQUE ; FREITAS, FLÁVIA CRISTINA DE PAULA ; GOMES, TIAGO MINUZZI FREIRE DA FONTOURA ; SCHEMBERGER, MICHELLE ORANE ; REIS, BÁRBARA CARVALHO SANTOS DOS ; CARVALHO, FLAVIA AMÊNDOLA ANÍSIO DE ; FACCION, ROBERTA SOARES ; MACHADO, LUCAS DE ALMEIDA ; SANTOS, DEBORAH ANTUNES DOS ; CUNHA, DANIELA PRADO ; SALÚ, MARGARIDA DOS SANTOS ; MOORE, DANIELLA CAMPELO BATALHA COX ; PRESIBELLA, MAYRA MARINHO ; NOGUCHI, JULIANA FONTES ; BORGES, HENRIQUE LIRA ; TOMIURA, LAIS KIMIE ; SILVA DE CASTRO, LUIZA ; SANTOS, LETÍCIA GRAZIELA COSTA ; SILVA, ESDRAS MATHEUS GOMES DA ; PARREIRA, VINÍCIUS DA SILVA COUTINHO ; et.al . Genetic Variants Affect Distinct Metabolic Pathways in Pediatric Multisystem Inflammatory Syndrome and Severe COVID-19. JOURNAL OF MEDICAL VIROLOGY , v. 97, p. -, 2025.
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FRANCO, ANA LUIZA MENEGUCI MOREIRA ; ANTUNES, DEBORAH ; GOMES, ANA CLARA RODRIGUES MOREIRA ; DIAS, BRUNO SANTOS DE BARROS ; CINTRA, HENRIQUE PESSOA LADVOCAT ; CAROLINA RAMOS GUIMARÃES, ANA ; DE CARVALHO, ELIZEU FAGUNDES ; VARGAS, FERNANDO REGLA ; MARTINEZ DE CARVALHO, FLÁVIA . Distinct IRF6 dysfunction mechanisms in syndromic orofacial clefts: Computational evidence for allosteric versus direct disruption. COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL , v. 27, p. 4699-4709, 2025.
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DE ARAÚJO, NATASSIA SILVA ; MOREIRA, ALINE DOS SANTOS ; ABREU, RAYANE DA SILVA ; JUNIOR, VALDEMIR VARGAS ; ANTUNES, DEBORAH ; MENDONÇA, JULIA BADARÓ ; SASSARO, TAYANNE FELIPPE ; JURBERG, ARNON DIAS ; FERREIRA-REIS, RAFAELLA ; BASTOS, NINA CARROSSINI ; FERNANDES, PRISCILA VALVERDE ; GUIMARÃES, ANA CAROLINA RAMOS ; DEGRAVE, WIM MAURITS SYLVAIN ; TILLI, TATIANA MARTINS ; WAGHABI, MARIANA CALDAS . Aptamer-Based Recognition of Breast Tumor Cells: A New Era for Breast Cancer Diagnosis. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 25, p. 840, 2024.
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A R OLIVEIRA, GEORGE ; G D V MORALES, BRUNO ; M O SOUSA, ROSA ; S PEREIRA, SORAYA ; ANTUNES, DEBORAH ; CAFFARENA, ERNESTO R. ; ZANCHI, FERNANDO B. . Exploring Novel Antimalarial Compounds Targeting Plasmodium falciparum Enoyl-ACP Reductase: Computational and Experimental Insights. ACS Omega , v. 9, p. 22777-22793, 2024.
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LIMA, CARLYLE RIBEIRO ; ANTUNES, DEBORAH ; CAFFARENA, ERNESTO ; CARELS, NICOLAS . Structural Characterization of Heat Shock Protein 90β and Molecular Interactions with Geldanamycin and Ritonavir: A Computational Study. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 25, p. 8782, 2024.
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REZENDE CORRÊA, PALOMA ; SCHWARZ, MARCOS GUSTAVO ARAUJO ; ANTUNES, DEBORAH ; PIÑERO, SINDY LICETTE ; CASTRO SILVA, MARLON ; MANGABEIRA CRESCÊNCIO, MAYRA ; GUIMARÃES, ANA CAROLINA RAMOS ; DEGRAVE, WIM MAURITS ; MENDONÇA-LIMA, LEILA . Characterization of Mycobacterium smegmatis Glutaminase-Free Asparaginase (MSMEG_3173). ACS Omega , v. 1, p. 1, 2024.
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ABREU, RAYANE DA SILVA ; ANTUNES, DEBORAH ; MOREIRA, ALINE DOS SANTOS ; PASSETTI, FABIO ; MENDONÇA, JULIA BADARÓ ; DE ARAÚJO, NATÁSSIA SILVA ; SASSARO, TAYANNE FELIPPE ; ALBERTO, ANAEL VIANA PINTO ; CARROSSINI, NINA ; FERNANDES, PRISCILA VALVERDE ; COSTA, MAYLA ABRAHIM ; GUIMARÃES, ANA CAROLINA RAMOS ; DEGRAVE, WIM MAURITS SYLVAIN ; WAGHABI, MARIANA CALDAS . Next Generation of Ovarian Cancer Detection Using Aptamers. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 24, p. 6315, 2023.
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ANTUNES, D. ; SANTOS, L. H. S. ; CAFFARENA, E. R. ; GUIMARÃES, ANA CAROLINA . Bacterial 2`-Deoxyguanosine Riboswitch Classes as Potential Targets for Antibiotics: A Structure and Dynamics Study. 2022. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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ANTUNES, DEBORAH . Estrutura e dinâmica de RNAs: simulações por dinâmica molecular e análise de redes complexas. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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VARGAS JUNIOR, V. C. ; ANTUNES, D. ; CAFFARENA, E. R. . TPP riboswitch as a triple antifungal target for Aspergillus oryzae. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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MEIRELES, F. A. T. P. ; ANTUNES, D. ; TEMEROZO, J. R. ; BOU-HABIB, D. C. ; CAFFARENA, E. R. . Computational study and optimization of VIP and PACAP ineteractions with their membrane receptors. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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BARCELLOS, L. T. ; ANTUNES, D. ; CUSTODIO, F. ; MOREIRA, Z. F. ; GUIMARÃES, ANA CAROLINA RAMOS ; CAFFARENA, E. R. . Structural insights and phosphorylation analysis of mutations in NFKBIA related to anhidrotic ectodermal dysplasia associated with immunodeficiency. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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MORGADO, S. M. ; ANTUNES, D. ; CAFFARENA, E. R. ; VICENTE, ANA CAROLINA PAULO . The rare lncRNA GOLLD is widespread and structurally conserved among Mycobacterium tRNA arrays. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SANTOS, DEBORAH ANTUNES . Searching for TPP riboswitch in the human genome and comparison with others from different species. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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MEIRELES, F. A. T. P. ; ANTUNES, D. ; TEMEROZO, J. R. ; BOU-HABIB, D. C. ; CAFFARENA, E. R. . Exploratory study of the interactions between PACAP and PAC1 through molecular modeling. 2019. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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KATO, R. B. ; BELCHIOR, J. C. ; ANTUNES, D. . TPP riboswitch analysis using molecular dynamic with different force fields. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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ANTUNES, D. ; PASSETTI, F. ; CAFFARENA, E. R. . Human riboswitch: are we close to predicting it?. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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PERES-DA-SILVA, A. ; ANTUNES, D. ; TORRES, A. L. Q. ; CAFFARENA, E. R. ; LAMPE, E. . Understanding the lack of simeprevir drug-resistance Q80K detection in hepatitis C virus subtype 1a clade 2 sequences. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SANTOS, D. A. ; ALVES, C. R. ; CAFFARENA, E. R. . Force field influence on peptides dynamics: an analysis of three-dimensional models of C-terminal extension of cysteine protease B of Leishmania (L.) amazonensis. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SANTOS, D. A. ; ALVES, C. R. ; CAFFARENA, E. R. . Proposição de modelos tridimensionais da extensão COOH-terminal da cisteíno-proteinase B de Leishmania (Leishmania) amazonensis. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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SANTOS, D. A. . Avaliação dos guias didáticos sobre ecologia e biodiversidade produzidos por licenciandos de Ciências Biológicas da FFP-UERJ. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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ANTUNES, D. ; CAFFARENA, E. R. ; ALVES, C. R. . Three-dimensional solution of C-terminal extension of cysteine proteinase B of Leishmania (Leishmania) amazonensis. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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SANTOS, D. A. ; ALVES, C. R. ; CAFFARENA, E. R. . Reconstrução tridimensional da região COOH-terminal da císteino-proteinase B de Leishmania (Leishmania) amazonensis. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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SANTOS, D. A. . Guias Didáticos: uma Alternativa no Ensino de Ecologia e Biodiversidade no Rio de Janeiro. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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SANTOS, D. A. ; MENDES,R. . O Processo de Registro de Guias Didáticos Produzidos por Alunos e Professores da FFP/UERJ. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).
Outras produções
ANTUNES, D. ; MARTINS, T. E. P. . Curso de Férias Edição Verão 2020 de Introdução a Bioinformática e Biologia Estrutural. 2020. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
SANTORI, R. T. ; ANTUNES, D. ; AYRES, A. C. M. ; BARCELOS, A. ; CAMACHO, I. ; MATTA, R. ; NAIRLA, A. ; SANTANA, M. M. ; TELLES, J. ; WILSON, V. ; CUNHA, P. . Acorda e deixa cantar o sabiá. Aves através da janela, vol. 02, num. 01. Editora Faculdade de Formação de Professores da UERJ. ISSN 22389725. 2013. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - VídeoEducativo).
SANTORI, R. T. ; SOUZA, R. F. ; CUNHA, P. ; BASTOS, W. G. ; GUIMARAES, G. ; ANTUNES, D. ; SALOMAO, S. ; SILVA, F. B. . Te esconde bem-te-vi. As aves através da janela, número 01, volume 01. Ed. Faculdade de Formação de Professores da UERJ. ISSN 2238-9725.. 2012. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Vídeo Educativo).
SANTORI, R. T. ; BARCELOS, A. ; CUNHA, P. ; RIBAS, M.C ; SILVA, F. B. ; ANTUNES, D. . A rolinha e o feijão. As aves através da janela, volume 01, número 02. Ed. Faculdade de Formação de Professores da UERJ. ISSN 22389725. 2012. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - VídeoEducativo).
ANTUNES, D. ; MANDARINO, C. A. ; OLIVEIRA-SOARES, C. P. ; CASTRO, R. O. . Jogo Zoo & Ação: Um Instrumento para o Fortalecimento da Aprendizagem. 2010. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Jogo Didático).
Prêmios
2019
Prêmio Anual IOC de Teses Alexandre Peixoto 2019, Instituto Oswaldo Cruz.
Histórico profissional
Experiência profissional
2010 - 2012
Universidade do Estado do Rio de JaneiroVínculo: Estágio Interno Complementar, Enquadramento Funcional: Bolsista de graduação, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Bolsista do programa de registro e análise de guias didáticos sobre ecologia e biodiversidade
Atividades
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03/2010 - 12/2010
Ensino, Assistência Voluntária em Genética Básica, Nível: GraduaçãoDisciplinas ministradas, Suporte teórico em Genética Básica
2014 - 2023
Fundação Centro de Ciências e Educação Superior à Distância do Estado do RJVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Tutoria Presencial, Carga horária: 8
Outras informações:
Disciplinas ministradas ao longo dos anos: Biologia Molecular, Bioquímica 2, Instrumentação para o ensino de Bioquímica e Biologia Celular, Diversidade Biológica dos Protostomados e Introdução à Zoologia. Curso ministrado no polo São Gonçalo sob a coordenação da UENF - Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro.
2019 - Atual
Fundação Oswaldo CruzVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio pós-doutoral, Carga horária: 40
2019 - 2019
Fundação Oswaldo CruzVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio pós-doutoral, Carga horária: 40
2018 - 2019
Fundação Oswaldo CruzVínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Colaborador Voluntário, Carga horária: 19
2014 - 2018
Fundação Oswaldo CruzVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado, Carga horária: 40
2012 - 2014
Fundação Oswaldo CruzVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrado, Carga horária: 40
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