Antoniel Augusto Severo Gomes

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual da Paraíba (2011), mestrado acadêmico em Biologia Celular e Molecular pela Universidade Federal da Paraíba (2014) e doutorado pela Universidade Estadual Paulista-João de Mesquita Filho (2019), com período sanduíche na École Normale Supérieure de Cachan (ENS). Durante a graduação, foi aluno de Iniciação Científica e Monitor por duas vezes. No mestrado e doutorado, desenvolveu seu conhecimento na área da Bioinformática no estudo da estrutura/função das proteínas Lys49PLA2-like de serpentes da Família Viperidae. Possui Pós-doutorado na modalidade CAPES/COFECUB (1 ano) com bolsa de seis meses suplementares financiada pelo CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique) pela Université de Montpellier, França; Pós-Doutorado Júnior (CNPq) pela UFRJ; Pós-Doutorado sênior pela Universidad Autónoma de Barcelona, financiado pelo Ministerio de Ciencia y Innovación (MICINN); e Pós-Doutorado sênior pela Université de Lorraine, financiado pela modalidade de pesquisadores internacionais Lorraine Université d'Excellence. Tem notável experiência com Receptores Acoplados às Proteínas-G (GPCRs), buscando compreender seu funcionamento e modulação a nível molecular, usando técnicas de Bioinformática Estrutural, como Docking Molecular, Análise de Modos Normais, Simulação de Dinâmica Molecular, Dinâmica Molecular excitada por Modos Normais (MDeNM), Coarse-Grained e metadinâmica.

Informações coletadas do Lattes em 22/11/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Biologia Geral e Aplicada

2015 - 2019

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Estudos Moleculares com a Bothropstoxina-I, uma Miotoxina de Bothrops jararacussu: Estudo Dinâmico do seu Estado Conformacional
com Marcos Roberto de Mattos Fontes. Coorientador: Angelo José Magro. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Veneno de serpente; PLA2s-Homólogas; BthTX-I; Dinâmica Molecular; Modos Normais; MDeNM. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformática. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

Mestrado em Biologia Celular e Molecular

2012 - 2014

Universidade Federal da Paraíba
Título: Estudo Computacional dos Efeitos Farmacológicos das Miotoxinas Lys49 de Serpentes (Família: Viperidae): Modelos Moleculares para Citotoxicidade e Miotoxicidade
, Ano de Obtenção: 2014.Plínio Delatorre.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Miotoxinas; Citotoxicidade; Miotoxicidade; Docking Molecular.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Farmacologia / Subárea: Toxicologia.

Graduação em Ciências Biológicas

2008 - 2011

Universidade Estadual da Paraíba
Título: Otimização da Técnica de Extração e Caracterização da Xilana de Sabugo de Milho no Estado da Paraíba
Orientador: Elquio Eleamen Oliveira

Pós-doutorado

2025

Pós-Doutorado. , Université de Lorraine, UL, França. , Bolsista do(a): Lorraine Université d'Excellence, LUE, França.

2022 - 2025

Pós-Doutorado. , Universitat Autònoma de Barcelona - UAB, UAB, Espanha. , Bolsista do(a): Ministerio de Ciencia y Innovación, MICINN, Espanha. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformática Estrutural. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Proteínas.

2021 - 2022

Pós-Doutorado. , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformática Estrutural. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Proteínas.

2020 - 2021

Pós-Doutorado. , Université de Montpellier, UM, França. , Bolsista do(a): Centre National de la Recherche Scientifique, CNRS, França. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformática Estrutural. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Proteínas.

2019 - 2020

Pós-Doutorado. , Université de Montpellier, UM, França. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformática Estrutural. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Proteínas.

Formação complementar

2021 - 2021

Métodos Quânticos Semiempíricos: Teoria e Prática. (Carga horária: 10h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2021 - 2021

Dinâmica Molecular Básica. (Carga horária: 10h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2019 - 2019

Extensão universitária em Biofísica Comparada. (Carga horária: 30h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2018 - 2018

Extensão universitária em Bioquímica II. (Carga horária: 12h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2014 - 2014

Introdução à Bioinformática e Genômica Comparativa. (Carga horária: 10h). , Universidade Federal da Paraíba, UFPB, Brasil.

2014 - 2014

Métodos para estudos estruturais de proteínas em solução. (Carga horária: 15h). , Universidade Federal da Paraíba, UFPB, Brasil.

2013 - 2013

Proteômica & Espectrometria de Massa. (Carga horária: 22h). , Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.

2012 - 2012

I Curso Teórico-Prático em Análise Proteômica. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal de Pernambuco, UFPE, Brasil.

2009 - 2009

Introdução à Iniciação Científica. (Carga horária: 6h). , Universidade Federal da Paraíba, UFPB, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformática Estrutural.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Proteínas.

Participação em eventos

X Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2021. (Outra).

5ª Jornada de Biofísica e Radiologia da UFPB.Avaliador dos trabalhos expostos durante o evento. 2013. (Outra).

3° Congresso Brasileiro de Biotecnologia. Extração de xilana a partir do sabugo de milho: influência do tamanho da partícula do sabugo e concentração de hidróxido de sódio. 2010. (Congresso).

5a Semana de Extensão da UEPB.Avaliação dos Estudantes da Universidade Estadual da Paraíba, Campus V, em Relação aos Impactos Ambientais e Reciclagem do Óleo de Cozinha Usado. 2010. (Outra).

II Congresso de Pós-Graduação e Pesquisa. Produção de Heteropolissacarídeo de Xilana a Partir de Resíduos Vegetais de Sabugo de Milho no Estado Da Paraiba. 2010. (Congresso).

XI Semana de Biologia da UFPB - Desenvolvimento Sustentável: quando as ideias não correspndem aos fatos. 2009. (Encontro).

3º Ciclo de Palestras do Curso de Ciências Biológicas - Conservação e Sustentabilidade. 2008. (Outra).

Orientou

Jessica Fernanda Gasparino Diaz

Uso da Ferramenta Computacional ALPHAFOLD para Estudo do Potencial das Lisinas Desacetilases de Fungos Patogénicos como Alvos de Drogas; Início: 2021; Dissertação (Mestrado em Mestrado em Microbiologia Aplicada) - Universidade Católica Portuguesa - Porto; (Coorientador);

Natalia Calixto Miranda Santos

Estudo da proteína espermática EPPIN: aspectos celulares e estruturais; Início: 2022; Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biomédicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Produções bibliográficas

  • Gomes, Antoniel A. S. ; GIRALDO, JESÚS . Structural Determinants of Buprenorphine Partial Agonism at the μ-Opioid Receptor. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING (ONLINE) , v. 65, p. 5071-5085, 2025.

  • Gomes, Antoniel A. S. ; DI MICHELE, MICHELA ; ROESSNER, RITA ANN ; DAMIAN, MARJORIE ; BISCH, PAULO M. ; SIBILLE, NATHALIE ; LOUET, MAXIME ; BANÈRES, JEAN-LOUIS ; FLOQUET, NICOLAS . Lipids modulate the dynamics of GPCR:β-arrestin interaction. Nature Communications , v. 16, p. 4982, 2025.

  • BONIFÁCIO, BRUNO SOUSA ; LEITE, ARIELY BARBOSA ; DE CASTRO NASCIMENTO SOUSA, ANA CAROLINE ; MARAN, SUELLEN RODRIGUES ; GOMES, ANTONIEL AUGUSTO SEVERO ; VASCONCELOS, ELTON J. R. ; MORETTI, NILMAR SILVIO . Beyond Histones: Unveiling the Functional Roles of Protein Acetylation in Prokaryotes and Eukaryotes. CELL BIOLOGY INTERNATIONAL , v. 49, p. 1301-1318, 2025.

  • S. GOMES, ANTONIEL A. ; COSTA, MAURICIO G. S. ; LOUET, MAXIME ; FLOQUET, NICOLAS ; BISCH, PAULO M. ; PERAHIA, DAVID . Extended Sampling of Macromolecular Conformations from Uniformly Distributed Points on Multidimensional Normal Mode Hyperspheres. Journal of Chemical Theory and Computation , v. 20, p. 10770-10786, 2024.

  • MATOS, BÁRBARA ; Gomes, Antoniel A. S. ; BERNARDINO, RAQUEL ; ALVES, MARCO G. ; HOWL, JOHN ; JERÓNIMO, CARMEN ; FARDILHA, MARGARIDA . CAVPENET Peptide Inhibits Prostate Cancer Cells Proliferation and Migration through PP1γ-Dependent Inhibition of AKT Signaling. PHARMACEUTICS , v. 16, p. 1199, 2024.

  • FERRÉ, GUILLAUME ; GOMES, ANTONIEL A.S. ; LOUET, MAXIME ; DAMIAN, MARJORIE ; BISCH, PAULO M. ; SAUREL, OLIVIER ; FLOQUET, NICOLAS ; MILON, ALAIN ; BANÈRES, JEAN-LOUIS . Sodium is a negative allosteric regulator of the ghrelin receptor. Cell Reports , v. 42, p. 112320, 2023.

  • COSTA, MAURICIO G. S. ; BATISTA, PAULO R. ; GOMES, ANTONIEL ; BASTOS, LEONARDO S. ; LOUET, MAXIME ; FLOQUET, NICOLAS ; BISCH, PAULO M. ; PERAHIA, DAVID . MDexciteR: Enhanced Sampling Molecular Dynamics by Excited Normal Modes or Principal Components Obtained from Experiments. Journal of Chemical Theory and Computation , v. 19, p. 412-425, 2023.

  • Gomes, Antoniel A. S. ; SANTOS, NATÁLIA C. M. ; ROSA, LEONARDO R. ; BORGES, RAFAEL J. ; FONTES, MARCOS R. M. ; HAMIL, KATHERINE G. ; O?RAND, MICHAEL G. ; SILVA, ERICK J. R. . Interactions of the male contraceptive target EPPIN with semenogelin-1 and small organic ligands. Scientific Reports , v. 13, p. 14382, 2023.

  • MAIMONI CAMPANELLA, JONATAS ERICK ; CANDIDO, T. S. ; BARBOSA, L. C. B. ; GOMES, ANTONIEL A.S. ; LEITE, C. A. ; HIGASHI, E. S. ; BARBUGLI, P. A. ; FONTES, M. R. M. ; BERTOLINI, MARIA CÉLIA . The Neurospora crassa PCL-1 cyclin is a PHO85-1 (PGOV) kinase partner that directs the complex to glycogen metabolism and is involved in calcium metabolism regulation. Frontiers in Microbiology , v. 13, p. 1078972, 2022.

  • DAMIAN, MARJORIE ; LOUET, MAXIME ; GOMES, ANTONIEL AUGUSTO SEVERO ; M?KADMI, CÉLINE ; DENOYELLE, SÉVERINE ; CANTEL, SONIA ; MARY, SOPHIE ; BISCH, PAULO M. ; FEHRENTZ, JEAN-ALAIN ; CATOIRE, LAURENT J. ; FLOQUET, NICOLAS ; BANÈRES, JEAN-LOUIS . Allosteric modulation of ghrelin receptor signaling by lipids. Nature Communications , v. 12, p. 3938, 2021.

  • COSTA, TÁSSIA R. ; FRANCISCO, ALEFF F. ; CARDOSO, FÁBIO F. ; MOREIRA-DILL, LEANDRO S. ; FERNANDES, CARLOS A.H. ; GOMES, ANTONIEL A.S. ; GUIMARÃES, CÉSAR L.S. ; MARCUSSI, SILVANA ; PEREIRA, PAULO S. ; OLIVEIRA, HAMINE C. ; FONTES, MARCOS R.M. ; SILVA, SAULO L. ; ZULIANI, JULIANA P. ; SOARES, ANDREIMAR M. . Gallic acid anti-myotoxic activity and mechanism of action, a snake venom phospholipase A2 toxin inhibitor, isolated from the medicinal plant Anacardium humile. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 185, p. 494, 2021.

  • MAIMONI CAMPANELLA, JONATAS ERICK ; RAMOS JUNIOR, SERGIO LUIZ ; RODRIGUES KIRALY, VANESSA THOMAZ ; SEVERO GOMES, ANTONIEL AUGUSTO ; DE BARROS, ANDREA COELHO ; MATEOS, PABLO ACERA ; FREITAS, FERNANDA ZANOLLI ; DE MATTOS FONTES, MARCOS ROBERTO ; BORGES, JÚLIO CESAR ; BERTOLINI, MARIA CÉLIA . Biochemical and biophysical characterization of the RVB-1/RVB-2 protein complex, the RuvBL/RVB homologues in Neurospora crassa. BIOCHIMIE , v. 191, p. 11-26, 2021.

  • LOUET, MAXIME ; CASIRAGHI, MARINA ; DAMIAN, MARJORIE ; COSTA, MAURICIO GS ; RENAULT, PEDRO ; GOMES, ANTONIEL AS ; BATISTA, PAULO R ; M'KADMI, CÉLINE ; MARY, SOPHIE ; CANTEL, SONIA ; DENOYELLE, SEVERINE ; BEN HAJ SALAH, KHOUBAIB ; PERAHIA, DAVID ; BISCH, PAULO M ; FEHRENTZ, JEAN-ALAIN ; CATOIRE, LAURENT J ; FLOQUET, NICOLAS ; BANÈRES, JEAN-LOUIS . Concerted conformational dynamics and water movements in the ghrelin G protein-coupled receptor. eLife , v. 10, p. e63201, 2021.

  • TEIXEIRA, SAMUEL COTA ; DA SILVA, MARCELO SANTOS ; GOMES, ANTONIEL AUGUSTO SEVERO ; MORETTI, NILMAR SILVIO ; LOPES, DAIANA SILVA ; FERRO, ELOISA AMÁLIA VIEIRA ; RODRIGUES, VERIDIANA DE MELO . Panacea within a Pandora's box: the antiparasitic effects of phospholipases A2 (PLA2s) from snake venoms. TRENDS IN PARASITOLOGY , v. 38, p. 80-94, 2021.

  • DOS SANTOS MOURA, LEILA ; SANTANA NUNES, VINÍCIUS ; Gomes, Antoniel A. S. ; SOUSA, ANA CAROLINE DE CASTRO NASCIMENTO ; FONTES, MARCOS R. M. ; SCHENKMAN, SERGIO ; MORETTI, NILMAR SILVIO . Mitochondrial Sirtuin TcSir2rp3 Affects TcSODA Activity and Oxidative Stress Response in Trypanosoma cruzi. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology , v. 11, p. 1, 2021.

  • CARDOSO, FÁBIO F. ; GOMES, ANTONIEL A.S. ; DREYER, THIAGO R. ; CAVALCANTE, WALTER L.G. ; DAL PAI, MAELI ; GALLACCI, MÁRCIA ; FONTES, MARCOS R.M. . Neutralization of a bothropic PLA2-like protein by caftaric acid, a novel potent inhibitor of ophidian myotoxicity. BIOCHIMIE , v. 170, p. 163-172, 2020.

  • OLIVEIRA, DAIANE M. ; FURTADO, FABIANA B. ; Gomes, Antoniel A. S. ; BELUT, BELISA R. ; NASCIMENTO, EVANDRO A. ; MORAIS, SÉRGIO A. L. ; MARTINS, CARLOS H. G. ; SANTOS, VINÍCIUS C. O. ; DA SILVA, CLAUDIO V. ; TEIXEIRA, THAISE L. ; CUNHA, LUÍS C. S. ; OLIVEIRA, ALBERTO DE ; DE AQUINO, FRANCISCO J. T. . Chemical Constituents and Antileishmanial and Antibacterial Activities of Essential Oils from Scheelea phalerata. ACS Omega , v. 5, p. 1363-1370, 2020.

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  • MAIMONI CAMPANELLA, JONATAS ERICK ; RODRIGUES KIRALY, VANESSA THOMAZ ; BARBUGLI, P. A. ; GOMES, A. A. S. ; FONTES, M. R. M. ; BORGES, JÚLIO CESAR ; BERTOLINI, MARIA CÉLIA . Biochemical and biophysical of the Neurospora crassa. In: 20th IUPAB Congress, 2021. 20th IUPAB Congress.

  • MONTEIRO, K. L. C. ; DANTAS, NATALINA ; DE ARAÚJO-JÚNIOR, JOÃO XAVIER ; DA SILVA-JÚNIOR, EDEILDO ; SIQUEIRA-JÚNIOR, JOSÉ PINTO ; MENDONÇA JUNIOR, FRANCISCO JAIME BEZERRA ; GOMES, A. A. S. ; DE AQUINO, FRANCISCO J. T. . 1st Brazil-France Symposium on Medicinal Chemistry ? Drugs for Infectious Diseases and Cancer. In: 1st Brazil-France Symposium on Medicinal Chemistry ? Drugs for Infectious Diseases and Cancer, 2019, Recife. 1st Brazil-France Symposium on Medicinal Chemistry ? Drugs for Infectious Diseases and Cancer, 2019.

  • BARBOSA LEITE, ARIELY ; SOUSA, ANA CAROLINE DE CASTRO NASCIMENTO ; GOMES, A. A. S. ; FONTES, M. R. M. ; SCHENKMAN, SERGIO ; MORETTI, NILMAR SILVIO . Acetilação Como Reguladora da Atividade da Enzima Frutose 1,6-Bisfosfato Aldolase de Trypanosoma Brucei. In: V Congresso Acadêmico da Unifesp, 2019. V Congresso Acadêmico da Unifesp.

  • ROSA, L. R. ; GOMES, A. A. S. ; BORGES, R. J. ; FONTES, M. R. M. ; SILVA, E. J. R. . In Silico Structural Evaluation of the Male Contraceptive Target EPPIN by Homology Modelling and Molecular Dynamics Simulation. In: 50th Brazilian Congress of Pharmacology and Experimental Therapeutics, 2018, Ribeirão Preto. 50th Brazilian Congress of Pharmacology and Experimental Therapeutics, 2018.

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  • BARBOSA, M. A. ; GOMES, A. A. S. ; NETO, M. O. . Estudo Estrutural da Adsorção Improdutiva Entre Fragmentos de Lignina e Glicosil Hidrolase da Família GH1. In: II Workbiotec ? Workshop de Biotecnologia: Bioenergia e Sustentabilidade, 2016, Botucatu. II Workbiotec ? Workshop de Biotecnologia: Bioenergia e Sustentabilidade, 2016.

  • Lucena, C. A. A. ; COSTA, S. C. ; GOMES, A. A. S. ; Oliveira, E. E. . Produção de Filmes Biodegradáveis à base de Xilana. In: I Mostra Científica do Campus V, 2011, João Pessoa. I Mostra Científica do Campus V, 2011.

  • COSTA, S. C. ; Lucena, C. A. A. ; GOMES, A. A. S. ; Oliveira, E. E. . Produção de Micropartículas de Xilana pela Técnica de Reticulação Polimérica Interfacial Usando Diferentes Concentrações de Trimetafosfato de Sódio. In: I Mostra Científica do Campus V, 2011, João Pessoa. I Mostra Científica do Campus V, 2011.

  • Gomes, A. A. S. ; Lucena, C. A. A. ; Costa, S. C. ; Oliveira, E. E. . Extraction of xylan from corncob: the influence of corncob particle size and sodium hydroxide concentration. In: 3º Congresso Brasileiro de Biotecnologia, 2010, Fortaleza. 3º Congresso Brasileiro de Biotecnologia, 2010.

  • Eleamen, G. R. A. ; GOMES, A. A. S. ; Costa, S. C. ; Lucena, C. A. A. ; Damasceno, B. P. G. L. . Avaliação dos Estudantes da Universidade Estadual da Paraíba, Campus V, em Relação aos Impactos Ambientais e Reciclagem do Óleo de Cozinha. In: V Semana de Extensão: Desenvolvimento Regional, Políticas Públicas e Identidades, 2010, Campina Grande. V Semana de Extensão: Desenvolvimento Regional, Políticas Públicas e Identidades, 2010.

  • Gomes, A. A. S. . Biomolecules as Coarse-Gained: Advances on Protein-Protein and Protein-Membrane Interaction. 2022. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • GOMES, A. A. S. ; LOUET, MAXIME ; BISCH, PAULO M. ; FLOQUET, NICOLAS . Coarse-grained molecular dynamics simulations of GPCRs and their favorite intracellular partners. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • GOMES, A. A. S. ; BORGES, R. J. ; MAGRO, A. J. ; PERAHIA, D. ; FONTES, M. R. M. . Computational Studies of the Active and Inactive States of BthTX-I, a Myotoxin from Bothrops jararacussu Venom. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Gomes, A. A. S. ; Lucena, C. A. A. ; COSTA, S. C. ; Oliveira, E. E. . Extraction of xylan from corncob: the influence of corncob particlesize and sodium hydroxide concentration. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Gomes, A. A. S. . Introducción a la Bioinformática estructural. 2022. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

LOUET, MAXIME ; Gomes, A. A. S. ; FLOQUET, NICOLAS . Prédire la dynamique d?interaction des Récepteurs Couplés aux Protéines-G avec leurs partenaires intra-cellulaires. 2022. (Grand Challenge: Modélisation Moléculaire Appliquée à la Biologie).

GOMES, A. A. S. ; NATAL JUNIOR, C. R. . Bioinformática Estrutural: Modelagem Molecular por Homologia, Docking Molecular e Aplicações. 2019. .

Projetos de pesquisa

  • 2019 - Atual

    Exporação Conformacional de Proteínas por Combinação de Modos Normais, Descrição: As proteínas desempenham um papel essencial no funcionamento da vida, onde sua função está diretamente relacionada a uma descrição estrutural dos seus estados conformacionais. Dessa forma, o desenvolvimento de técnicas que garantam uma rica exploração conformacional de proteínas permitirá uma melhor compreensão do seu funcionamento. Os modos normais representam uma técnica computacional capaz de capturar alterações conformacionais de proteínas com relevância funcional de forma eficiente, e portanto tem ganhado notoriedade no estudo de proteínas. Atualmente, pesquisadores trabalham combinando modos normais de baixa frequência para garantir uma melhor exploração conformacional de proteínas, entretanto há limitações na garantia de uma ótima exploração do espaço. Este projeto tem como objetivo desenvolver um protocolo de combinação de modos normais que resulte num conjunto de vetores organizados de maneira regular, preenchendo completamente o espaço conformacional das proteínas. Este protocolo será aplicado no estudo conformacional de proteínas modelo, como a lisozima, e no estudo dos Receptores Acoplados a Proteínas G, dada sua importância farmacológica. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Antoniel Augusto Severo Gomes - Coordenador / PERAHIA, DAVID - Integrante / LOUET, MAXIME - Integrante / FLOQUET, NICOLAS - Integrante / COSTA, MAURICIO GS - Integrante / BISCH, PAULO M - Integrante.

  • 2019 - Atual

    Estudo de Interações Proteína-Proteína e Proteína-Membrana através de Simulações de Dinâmica Molecular em Coarse-Grained: Acoplamento Entre GPCR e β-Arrestina e Modulação por Lipídios, Descrição: Os Receptores Acoplados às Proteínas-G (GPCRs) constituem a maior família de proteínas transmembranares, contendo aproximadamente 800 representantes que estão envolvidos em praticamente todos os eventos fisiológicos dos seres vivos, ligando-se a uma série de biomoléculas, como lipídios, íons, pequenas moléculas e proteínas, destacando-se as Proteínas-G e β-arrestinas. Sendo assim, eles possuem alto interesse farmacológico, correspondendo a 1/3 do mercado global de drogas, dada sua participação em diversas alterações metabólicas relacionadas a doenças. Nos últimos dez anos, o estudo estrutural desses receptores cresceu exponencialmente e, apesar dos esforços para compreender as bases moleculares do seu funcionamento, há uma carência na compreensão dos aspectos dinâmicos de seus mecanismos moleculares a nível molecular. Compreender tais aspectos é de suma importância, pois eles estão intimamente relacionados com as diferentes vias de sinalização as quais os GPCRs participam. Diante disto, o estudo conformacional dos GPCRs através da Simulação de Dinâmica Molecular pode ser adotado como uma alternativa promissora para compreender suas nuances estruturais e, consequentemente, seus aspectos funcionais. Assim, este projeto busca aplicar técnicas computacionais avançadas - com foco em modelos atômicos em Coarse-Grained, em associação com a técnica de Replica-Exchange - no estudo dos GPCRs, buscando explorar seus aspectos dinâmicos relacionados com seu funcionamento e também compreender o processo de Interação Proteína-Proteína, utilizando o Receptor do Secretagogo de Hormônio do Crescimento (GHSR) e a β-arrestina como modelo. Dentro deste contexto, será estudada ainda a participação de lipídios na modulação alostérica tanto do receptor quanto do complexo GHSR/β-arrestina. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Antoniel Augusto Severo Gomes - Integrante / LOUET, MAXIME - Integrante / BISCH, PAULO M. - Coordenador / FLOQUET, NICOLAS - Integrante.

  • 2015 - 2019

    Estudos Moleculars com a Bothropstoxina-I, uma Miotoxina de Bothrops jararacussu: Estudo Dinâmico do seu Estado Conformacional, Descrição: Acidentes ofídicos são considerados um problema de saúde pública global, dada sua alta ocorrência de mortes, onde alguns casos resultam em sequelas irreparáveis, deixando o indivíduo desabilitado por toda a vida. Somente no Brasil, em média 20 mil mortes ao ano são registradas. Desta forma, alguns pesquisadores têm buscado estudar a estrutura-função de componentes dos venenos de serpentes peçonhentas à fim de desenvolver alternativas terapêuticas para esse problema de grande interesse médico. Um dos componentes que tem recebido atenção nas últimas décadas é a BthTX-I, uma proteína PLA2s-homóloga não catalítica, devido seu efeitos farmacológico notadamente miotóxico. Embora diversas técnicas tenham sido empregadas na compreensão do mecanismo de ação dessas proteínas, o conhecimento nesta área permanece controverso, tornando-se necessário a continuidade de estudos. Sendo assim, métodos computacionais - como simulação de Dinâmica Molecular (MD), análise de Modos Normais (NM) e Dinâmica Molecular excitada por Modos Normais (MDeNM) e biofísicos - como Espalhamento de Luz Dinâmico (DLS) - serão aplicadas à BthTX-I nativa ou em complexo com o α-tocoferol ? molécula tida como ativadora alostérica ? na tentativa de compreender seu estado oligomérico, bem como seu comportamento dinâmico e seu espaço conformacional. Tais características são essenciais para a compreensão do mecanismo de ação da BthTX-I, aspecto chave para a miotoxicidade dessa classe de proteínas. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Antoniel Augusto Severo Gomes - Integrante / Ângelo José Magro - Integrante / Marcos Roberto de Mattos Fontes - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

  • 2009 - 2011

    Produção de Heteropolissacarídeos de Xilana a partir de Resíduos Vegetais de Sabugo de Milho no Estado da Paraíba, Descrição: Com base no potencial biotecnológico e econômico da xilana e sua produção a partir de resíduos vegetais de milho, tornam-se importantes os estudos sobre as técnicas de extração do polímero de xilana e das técnicas de caracterização do material obtido. O objetivo deste projeto é desenvolver um método de extração de polímeros de xilana a partir de resíduos vegetais produzidos no estado da Paraíba e caracteriza-lo quanto as suas características bioquímicas e farmacotécnicas. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Antoniel Augusto Severo Gomes - Integrante / Elquio Eleamen Oliveira - Coordenador / Camilla Aquino Azevedo de Lucena - Integrante / Costa, S. C. - Integrante / Toshyiuki Nagashima Júnior - Integrante / Acarilia Eduardo Silva - Integrante / Eryvaldo Sócrates Tabosa do Egito - Integrante.

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Universitat Autònoma de Barcelona - UAB, Institut de Neurociències. , Laboratorio de Neurofarmacología Molecular y Bioinformática, Bellaterra, 08193 - Bellaterra, - Espanha, Telefone: (014) 981751233, URL da Homepage:

Experiência profissional

2010 - 2011

Universidade Estadual da Paraíba

Vínculo: PIBIC, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

Outras informações:
Título: Produção de Heteropolissacarídeo de Xilana a partir de Resíduos Vegetais de Sabugo de Milho no Estado da Paraíba. Título do sub-projeto: Produção de Heteropolissacarídeo de Xilana a partir de Sabugo de Milho e Suas Aplicações.

2010 - 2011

Universidade Estadual da Paraíba

Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 12

Outras informações:
Monitor da Disciplina de Biologia Celular no Curso de Ciências Biológicas

2009 - 2010

Universidade Estadual da Paraíba

Vínculo: PIBIC, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

Outras informações:
Título: Produção de Heteropolissacarídeo de Xilana a partir de Resíduos Vegetais de Sabugo de Milho no Estado da Paraíba. Título do sub-projeto: Produção de Heteropolissacarídeo de Xilana a partir de Sabugo de Milho e Suas Aplicações.

2009 - 2010

Universidade Estadual da Paraíba

Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 12

Outras informações:
Monitor da Disciplina de Bioquímica Metabólica no Curso de Ciências Biológicas

2009 - 2010

Universidade Estadual da Paraíba

Vínculo: Extensão, Enquadramento Funcional: Voluntário, Carga horária: 4

Outras informações:
Aluno voluntário no Projeto de Extensão entitulado "Produção de Sabão a Partir da Reciclagem de Óleo de Cozinha Usado: A conscientização Ambiental e Sustentabilidade Através da Reciclagem do Óleo de Cozinha".

2012 - 2014

Universidade Federal da Paraíba

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2015 - 2019

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 03/2022 - 04/2022

    Ensino, Programa de Pós-Graduação em Farmacologia e Biotecnologia, Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Tópicos Especiais e Farmacologia e Biotecnologia: Bioinformática Estrutural Aplicada a Biomoléculas (Carga horária da disciplina: 45 horas)

2017 - 2018

École Normale Supérieure de Cachan, ENS/Cachan

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2019 - 2021

Université de Montpellier

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Bolsista CAPES/COFECUB durante 1 ano, com 6 meses suplementares financiado pelo Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS, França)

2021 - 2022

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 05/2022 - 06/2022

    Ensino, Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Biofísica), Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Tópicos Avançados em Dinâmica Molecular (Carga horária da disciplina: 30 horas; Carga horária ministrada: 5 horas)

  • 10/2021 - 12/2021

    Ensino, Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Biofísica), Nível: Pós-GraduaçãoDisciplinas ministradas, Tópicos Avançados em Dinâmica Molecular (Carga horária da disciplina: 30 horas; Carga horária ministrada: 5 horas)

2022 - Atual

Universitat Autònoma de Barcelona - UAB

Vínculo: Investigador Ordinário, Enquadramento Funcional: Investigador Ordinário, Carga horária: 37