Raphael Trevizani

Possui graduação em Tecnologia da Informação e da Comunicação pela Faculdade de Educação Tecnológica do Rio de Janeiro (2014), graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal de Juiz de Fora (2007), mestrado em Modelagem Computacional - Laboratório Nacional de Computação Científica (2011) e doutorado em Modelagem Computacional - Laboratório Nacional de Computação Científica (2014). Tem experiência na área de Ciência da Computação e Biologia Computacional, com ênfase em Modelagem Computacional. Atualmente é pesquisador da Fundação Oswaldo Cruz com interesse em imunoinformática.

Informações coletadas do Lattes em 21/09/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Modelagem Computacional

2010 - 2014

Laboratório Nacional de Computação Científica
Título: Desenvolvimento de metodologias 'de novo' para predição de estruturas de proteínas
Orientador: Laurent Emmanuel Dardenne
, Ano de obtenção: 2014. Coorientador: Fábio Lima Custódio. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Mestrado em Modelagem Computacional

2008 - 2011

Laboratório Nacional de Computação Científica
Título: Bibliotecas de Fragmentos para Predição de Estruturas de Proteínas
, Ano de Obtenção: 2011.Laurent Emmanuel Dardenne.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Graduação em andamento em Matemática

2011 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Graduação em Tecnologia da Informação e da Comunicação

2008 - 2014

Faculdade de Educação Tecnológica do Rio de Janeiro
Título: Método de estimação automática de partições para o agrupamento de fragmentos de proteínas
Orientador: Eduardo Krempser

Graduação em Ciências Biológicas

2003 - 2007

Universidade Federal de Juiz de Fora

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Francês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Modelagem Computacional.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas/Especialidade: Proteínas.

Participação em eventos

V Escola Luso-Brasileira de Computação Evolutiva. 2014. (Oficina).

5th LNCC Meeting on Computational Modelling.Evaluation of the best features of a fragment library for fragment-based method for protein structure prediction. 2012. (Encontro).

European Conference on Computational Biology. Fundamental features of protein structure prediction using fragment libraries. 2012. (Congresso).

European ISCB Student Council Sympososium. Fundamental features of protein structure prediction using fragment libraries. 2012. (Congresso).

IV Workshop de Inovação das Unidades de Pesquisa do MCTI. 2011. (Encontro).

Programa de Verão em Modelagem Computacional.Uso de Bibliotecas de Fragmentos para Predição de Estruturas de Proteínas. 2010. (Encontro).

VII Iberoamerican Congress of Biophysics. Fragment Libraries for Protein Structure Prediction. 2009. (Congresso).

XVIII International Network of Protein Engineering Centers. Assessment of the quality of a fragment library for protein folding. 2009. (Congresso).

Encontro Acadêmico de Modelagem Computacional do LNCC. 2008. (Encontro).

III LNCC Meeting on Computational Biology. 2008. (Encontro).

IV Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos. 2008. (Oficina).

Orientou

Tayná Fiúza

Desenvolvimento de um método computacional para identificação de epítopos; Início: 2017; Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal do Ceará; (Orientador);

Débora Pacheco

Construção de uma ferramenta computacional para aumento da afinidade da interação proteína-proteína; Início: 2017; Iniciação científica (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do Ceará; (Orientador);

Igor Oliveira Duarte

Análise da variação dad estabilidade de proteínas decorrente de mutações pontuais; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal do Ceará; Orientador: Raphael Trevizani;

Produções bibliográficas

TREVIZANI, RAPHAEL ; CUSTÓDIO, FÁBIO LIMA ; DOS SANTOS, KARINA BAPTISTA ; DARDENNE, LAURENT EMMANUEL . Critical Features of Fragment Libraries for Protein Structure Prediction. PLoS One , v. 12, p. e0170131, 2017.
REIS, R. C. N. ; ODA, S. C. ; ALMEIDA, M. V ; LOURENÇO, M. C. ; Vicente, F. R. C ; BARBOSA, N. R ; TREVIZANI, Raphael . SYNTHESIS AND ANTIMICROBIAL ACTIVITY OF AMPHIPHILIC CARBOHYDRATE DERIVATIVES. Journal of the Brazilian Chemical Society (Impresso) , v. 19, p. 1065-1072, 2008.
DUTRA, R. C. ; TREVIZANI, Raphael ; SILVA, F. P. ; BARBOSA, N.R. . ANTINOCICEPTIVE ACTIVITY OF THE ESSENTIAL OIL AND FRACTIONS OF PTERODON EMARGINATUS vOGEL SEEDS. Acta Farmaceutica Bonaerense , v. 27, p. 865-870, 2008.
AUAD, A. M. ; TREVIZANI, Raphael . Ocorrência de sirfídeos afidófagos (Diptera, Syrphidae) em Lavras, MG.. Revista Brasileira de Entomologia , v. 49, p. 425-426, 2005.
TREVIZANI, Raphael ; CUSTODIO, F. L. ; DARDENNE, L. E. . Evaluation of the best features of a fragment library for fragment-based method for protein structure prediction. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
TREVIZANI, Raphael ; CUSTODIO, F. L. ; DARDENNE, L. E. . Uso de Bibliotecas de Fragmentos para Predição de Estruturas de Proteínas. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
TREVIZANI, Raphael ; Baptista, KS ; Custódio, FL ; Dardenne, LE . Assessment of the Quality of a Fragment Library for Protein Folding. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
TREVIZANI, Raphael ; Baptista, KS ; Custódio, FL ; Dardenne, LE . Fragment Libraries for Protein Structure Prediction. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

2015 - Atual

Desenvolvimento de ferramenta de simulação computacional para a evolução de anticorpos, Descrição: Desenvolvimento, implementação e aplicação de algoritmos de otimização à área de modelagem molecular voltados para a evolução de anticorpos. As técnicas de simulação serão usadas para avaliar as informações de interações antígeno-anticorpo. A ferramenta cria anticorpos variantes que serão avaliados quanto às interações com um antígeno específico. As variantes serão obtidas de acordo com o fenótipo desejado. Esta técnica será acoplada a uma abordagem da evolução in vitro, utilizando bibliotecas de apresentação de fagos geradas e, posteriormente, por evolução dirigida... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Raphael Trevizani - Coordenador / Marcos Roberto Lourenzoni - Integrante / Gilvan Pessoa Furtado - Integrante.

Prêmios

2006

Certificate in English CAE - ESOL, Cambridge University.

2004

Certificate in English (FCE - ESOL), Cambridge University.

Histórico profissional

Endereço profissional

Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz - Ceará. , Avenida Santos Dumont, Hospital São Mateus, 1303, Papicu, 60180900 - Fortaleza, CE - Brasil, Telefone: (85) 32651832

Experiência profissional

2015 - Atual

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2006 - 2008

Núcleo de Identificação e Quantificação Analítica

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estágio, Carga horária: 40

Atividades

10/2006
Estágios , NIQUA.Estágio realizado, Desenvolvimento de novos fármacos: etnofarmacologia e identificação de substâncias farmacológicamente ativas.

2004 - 2005

Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária Centro Nacional de Pesquisa de

Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20

Atividades

03/2004 - 08/2005
Estágios , Centro Nacional de Pesquisa de Gado de Leite.Estágio realizado, Programa de Melhoramento de Forrageiras Tropicais.