José Alvim Berkenbrock

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Produções bibliográficas

• BERKENBROCK, JOSE ALVIM ; MAIL, MATTHIAS ; WELLS, GARTH ; SCHERER, TORSTEN ; ACHENBACH, SVEN . Fabrication of High-Aspect-Ratio Nanopores in Polymer Membranes: Analysis of artifacts by non-destructive testing. IEEE TRANSACTIONS ON NANOTECHNOLOGY , v. 1, p. 1-1, 2021.

• BERKENBROCK, José Alvim ; GRECCO-MACHADO, RAFAELA ; ACHENBACH, SVEN . Arsenal of microfluidic testing devices may combat COVID-19 pandemic. MRS BULLETIN , v. 45, p. 511-514, 2020.

• BERKENBROCK, José Alvim ; GRECCO-MACHADO, RAFAELA ; ACHENBACH, SVEN . Microfluidic devices for the detection of viruses: aspects of emergency fabrication during the COVID-19 pandemic and other outbreaks. PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY A-MATHEMATICAL PHYSICAL AND ENGINEERING SCIENCES , v. 476, p. 20200398, 2020.

• PINTARELLI, G. B. ; BERKENBROCK, J. A. ; RASSELE, A. C. ; RANGEL, M. M. M. ; SUZUKI, D. O.H. . Computer simulation of commercial conductive gels and their application to increase the safety of electrochemotherapy treatment. MEDICAL ENGINEERING & PHYSICS , v. 1, p. 1, 2019.

• SUZUKI, DANIELA O. H. ; BERKENBROCK, JOSÉ A. ; FREDERICO, MARISA J. S. ; SILVA, FÁTIMA R. M. B. ; RANGEL, MARCELO M. M. . Oral Mucosa Model for Electrochemotherapy Treatment of Dog Mouth Cancer: Ex Vivo, In Silico, and In Vivo Experiments. ARTIFICIAL ORGANS , v. 42, p. 297-304, 2018.

• BERKENBROCK, José Alvim ; BRASIL PINTARELLI, GUILHERME ; DE CASTRO ANTÔNIO JÚNIOR, AFRÂNIO ; SUZUKI, DANIELA OTA HISAYASU . Verification of Electroporation Models Using the Potato Tuber as In Vitro Simulation. Journal of Medical and Biological Engineering , v. 1, p. 1-6, 2018.

• BERKENBROCK, José Alvim ; MACHADO, RAFAELA GRECCO ; SUZUKI, DANIELA OTA HISAYASU . Electrochemotherapy Effectiveness Loss due to Electric Field Indentation between Needle Electrodes: A Numerical Study. Journal of Healthcare Engineering , v. 2018, p. 1-8, 2018.

• BERKENBROCK, JOSÉ-ALVIM ; MACHADO, RAFAELA GRECCO ; ACHENBACH, SVEN . How Might X-Ray Scanned Potatoes Improve Cancer Treatment?. Microscopy and Microanalysis , v. 24, p. 410-411, 2018.

• SUZUKI, DANIELA O.H. ; BERKENBROCK, JOSÉ A. ; DE OLIVEIRA, KRISHNA D. ; FREYTAG, JENNIFER O. ; RANGEL, MARCELO M.M. . Novel application for electrochemotherapy: Immersion of nasal cavity in dog. ARTIFICIAL ORGANS , v. 41, p. 767-773, 2016.

• SUZUKI, DANIELA O. H. ; PINTARELLI, GUILHERME B ; RAMOS, L. C. ; BERKENBROCK, J. A. ; RANGEL, MARCELO M. M. . Tratamento de Cânceres com Eletroquimioterapia. In: Cicilia Raquel Maia Leite; Celia Aparecida dos Reis; Pedro Canisio Binsfeld; Suelia de Siqueira Rodrigues Fleury Rosa. (Org.). Novas tecnologias aplicadas à saúde: desenvolvimento de Sistemas Dinâmicos - Conceitos, aplicações e ultilização de técnicas inteligentes e regulação. 1ed.Mossoró: EDUERN, 2019, v. 2, p. 253-290.

• Berkenbrock, J. A. ; RANGEL, M. M. M. ; SUZUKI, D. O. H. . Numerical Study for Needle Electrode in Treatment of Cutaneous Tumor Model. IFMBE Proceedings. 1ed.: Springer Singapore, 2016, v. , p. 433-436.

• BERKENBROCK, JOSE-ALVIM ; ACHENBACH, SVEN ; WELLS, GARTH ; MAIL, MATTHIAS ; SCHERER, TORSTEN . A polymer-based nano-resistive pulse sensor for detection of biomolecules: fabrication and simulation. In: 2020 IEEE 20th International Conference on Nanotechnology (IEEENANO), 2020, Montreal. 2020 IEEE 20th International Conference on Nanotechnology (IEEE-NANO), 2020. p. 310.

• BERKENBROCK, JOSE-ALVIM ; SCHERER, TORSTEN ; MAIL, MATTHIAS ; ACHENBACH, SVEN . Numerical Modelling of a Nanopore-based Resistive-Pulse Sensor for Detection of Biomolecules*. In: 2020 42nd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC) in conjunction with the 43rd Annual Conference of the Canadian Medical and Biological Engineering Society, 2020, Montreal. 2020 42nd Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC), 2020. p. 4278.

• Berkenbrock, J. A. ; PINTARELLI, G. B. ; ANTÔNIO JÚNIOR, A. C. ; SUZUKI, DANIELA O.H. . In Vitro Simulation of Electroporation Using Potato Model. In: 40th Canadian Medical and Biological Engineering Congress, 2018, Winnipeg. CMBES Proceedings, 2017. v. 40. p. 616.

• DAMIANI, Taila Becker ; BERKENBROCK, José Alvim ; SUZUKI, D. O.H. . Avaliação in silico do campo elétrico na eletroquimioterapia: Modelo de tumor real associado a tecido adiposo e hepático. In: XXV Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, 2016, Foz do Iguaçu. Anais do XXV Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica. Rio de Janeiro: Sociedade Brasileira de Engenharia Biomédica, 2016. v. 1. p. 317-320.

• PINTARELLI, GUILHERME B ; NEGREIROS, Miguel Soria ; BERKENBROCK, José Alvim ; OLIVEIRA, G. T. C. ; SILVA, FÁTIMA R.M.B. ; SUZUKI, D. O.H. . Permeabilization of Wistar rats liver tissue using monopolar pulses - Analysis of the influence of 1 Hz And 1 kHz repetition rate on electroporation. In: XXV Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, 2016, Foz do Iguaçu. Anais do XXV Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica. Rio de Janeiro: Sociedade Brasileira de Engenharia Biomédica, 2016. v. 1. p. 321-324.

• BERKENBROCK, J. A. ; RANGEL, M. M. M. ; SUZUKI, D. O.H. . Numerical Study for Needle Electrode in Treatment of Cutaneous Tumor Model. In: 1st World Congress on Electroporation and Pulsed Electric Fields in Biology, Medicine and Food & Environmental Technologies, 2015, Portoroz. 1st World Congress on Electroporation and Pulsed Electric Fields in Biology, Medicine and Food & Environmental Technologies, 2015. v. 53. p. 433-436.

• NEVES, G. G. ; BERKENBROCK, J. A. ; RANGEL, M. M. M. ; SUZUKI, D. O.H. . Estudo Numérico da Eletroquimioterapia em Tumor Cutâneo com Eletrodos de Placas e Agulhas. In: XXIV Brazilian Congress on Biomedical Engineering, 2014, Uberlândia. XXIV Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica: A Engenharia Biomédica como Propulsora de Desenvolvimento e Inovação Tecnológica em Saúde, 2014. p. 1176-1179.

• BERKENBROCK, JOSE-ALVIM ; WELLS, GARTH ; MAIL, MATTHIAS ; SCHERER, TORSTEN ; ACHENBACH, SVEN . Fabrication and simulations of high-aspect-ratio nanopores for polymer-based resistive pulse sensors. In: 2021 IEEE 21st International Conference on Nanotechnology (NANO), 2021, Montreal. 2021 IEEE 21st International Conference on Nanotechnology (NANO), 2021. p. 1.

• BERKENBROCK, J. A. ; RANGEL, M. M. M. ; SUZUKI, D. O.H. . ESTUDO NUMÉRICO SOBRE USO DE ELETRODO DE AGULHA EM MODELO DE TUMOR CUTÂNEO. In: II Encontro Brasileiro de Eletroquimioterapia Veterinária (EBEV), 2015, São Paulo. II Encontro Brasileiro de Eletroquimioterapia Veterinária (EBEV). São Paulo: Vet Câncer Ltda, 2015. v. 1. p. 9-9.

• SUZUKI, D. O.H. ; Berkenbrock, J. A. ; OLIVEIRA, K. D. ; FREYTAG, J. O. ; RANGEL, M. M. M. . ELETROQUIMIOTERAPIA DE CAVIDADE NASAL EM CÃO. In: II Encontro Brasileiro de Eletroquimioterapia Veterinária (EBEV), 2015, São Paulo. II Encontro Brasileiro de Eletroquimioterapia Veterinária (EBEV). São Paulo: Vet Câncer Ltda, 2015. v. 1. p. 6-6.

• NEVES, G. G. ; SUZUKI, D. O.H. ; Berkenbrock, J. A. ; RANGEL, M. M. M. . Estudo numérico da eletroquimioterapia em tumor cutâneo com diferentes configurações de eletrodos. In: COMSOL Conference, 2014, Curitiba. Proceedings of the 2014 COMSOL Conference in Curitiba, 2014.

• BERKENBROCK, José Alvim ; ACHENBACH, SVEN . Numerical Analysis of the Impact of Fabrication Artifacts on the Electric Current in a Resistive Pulse Nanodetector (poster). 2019. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• BERKENBROCK, JOSÉ-ALVIM ; SIDDIQUI, A. ; TONY, A. ; JACOBS, M. ; WELLS, G. ; ACHENBACH, SVEN . X-Ray Lithography for High Aspect Ratio Polymer and Metal Micro Patterning: A Process Development Execution System at the Canadian Light Source (poster). 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• BERKENBROCK, JOSÉ-ALVIM ; MACHADO, R. G. ; ACHENBACH, SVEN . How Might X-Ray Scanned Potatoes Improve Cancer Treatment? (short talk and poster). 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Berkenbrock, J. A. ; PINTARELLI, G. B. ; ANTÔNIO JÚNIOR, A. C. ; SUZUKI, DANIELA O.H. . In Vitro Simulation of Electroporation using Potato Model (oral). 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Berkenbrock, J. A. ; RANGEL, MARCELO M.M. ; SUZUKI, DANIELA O.H. . Numerical Study for Needle Electrode in Treatment of Cutaneous Tumor Model (oral). 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Berkenbrock, J. A. ; RANGEL, MARCELO M.M. ; SUZUKI, DANIELA O.H. . Estudo Numérico sobre Uso de Eletrodo de Agulha em Modelo de Tumor Cutâneo (poster). 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• Berkenbrock, J. A. . Eletroquimioterapia no tratamento de câncer: campos elétricos, eletrodos e modelos de tecidos (ex vivo, in vivo e in silico). Florianópolis: Universidade Federal de Santa Catarina, 2016 (Dissertação de mestrado).

• BERKENBROCK, J. A. . Codificação com FPGA para Controle e Comunicação entre Placas de Instrumentação para a Medida de Posição da Fonte de Luz Síncrotron Sirius 2014 (Trabalho de conclusão de curso).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2017 - Atual

  Desenvolvimento de dispositivo microfluídico para detecção de moléculas com aplicação biomédica, Descrição: Sistemas micro e nanofluídicos representam a alternativa para realização de múltiplos testes/experimentos com mínimas quantidades de insumos/amostras/reagentes. Dadas suas reduzidas dimensões (centésimos de milímetros), uma gota da solução de interesse pode proporcionar todo o material necessário para requerida análise, conforme a capacidade destes dispositivos. Em especial, análise de múltiplos parâmetros e detecção de componentes ultra diluídos permeassem como desafios tecnológicos atuais. Este projeto busca o desenvolvimento de dispositivo microfluídico para detecção de moléculas com aplicação em engenharia biomédica. Local: Synchrotron Laboratory for Micro and Nano Devices (SyLMAND), Canadian Light Source - University of Saskatchewan. Materiais e métodos: software COMSOL para resolução de modelos numéricos pelo método de elementos finitos; Plasma Etching - Reactive Ion Etching; Spin Coater; Hot Plate; Sputtering; UV-lithography; X-Ray lithography; Laser Writer; Perfilómetro; Microscópios; Patch Clamp System; Focused Ion Beam (por grupo parceiro, KNMF/KIT-Alemanha).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: José Alvim Berkenbrock - Coordenador / Sven Achenbach - Integrante.

• 2014 - Atual

  Estudo de modelos numéricos da distribuição de campo elétrico em tecidos biológico, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Daniela Ota Hisayasu Suzuki em 06/12/2017., Descrição: A complexidade e heterogeneidade dos tecidos animais apresenta desafios para a compreensão e predição da distribuição de campos elétricos neste tipo de "material". Pulsos de baixas e médias frequências (1 Hz - 1 MHz) e médias amplitudes (e.g. 1 kV/cm) tem sido aplicados em conjunto com drogas quimioterápicas para tratamento de câncer. Dado um determinado tipo de tecido ou agregado celular, a partir de um específico limiar de campo elétrico, as membranas celulares são induzidas a reorganizações locais capazes de reduzir, momentaneamente, a seletividade natural destas membranas. Esta linha de pesquisa busca incrementar o conhecimento acerca dos parâmetros envolvidos, de seu impacto na eficácia destes tratamentos e erros/falhas em potencial. Empregando experimentação in vivo e ex vivo, busca-se aprimorar os modelos matemáticos atuais, bem como avaliar e consolidar a técnica de eletroquimioterapia no Brasil. Local: Laboratório de Instrumentação Biomédica, Instituto de Engenharia Biomédica - Universidade Federal de Santa Catarina. Materiais e métodos: software COMSOL para resolução de modelos numéricos pelo método de elementos finitos; eletroporador (sistema para aplicação de pulsos curtos de tensão) desenvolvido pelo grupo; ambiente com iluminação controlada para registro fotográfico; congelador/refrigerador para conservação de amostras; analisador de impedância; biotério (por grupo colaborador); dados clínicos de tratamento veterinário por eletroquimioterapia (por grupos colaboradores).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: José Alvim Berkenbrock - Coordenador / Gabriel Gonçalves Neves - Integrante / Daniela Ota Hisayasu Suzuki - Integrante / Afrânio de Castro Antonio Júnior - Integrante / Taila Becker Damiani - Integrante / Guilherme Brasil Pintarelli - Integrante.

• 2010 - 2011

  Desenvolvimento de Dispositivo de Aplicação e Controle de Campos Elétricos de Alta Intensidade em Tecidos Biológicos, Descrição: Eletroporação é o fenômeno da abertura de poros na membrana plasmática através da aplicação de campos elétricos. Esta ferramenta é utilizada para a transferência de macro-moléculas para dentro da célula. A aplicação inclui tratamento de cânceres, transferência genética, melhoria de vacinas de DNA. Como os modelos matemáticos atuais não possibilitam a aproximação da realidade, faz-se necessário realizar simulações numéricas em alta velocidade dentro de um dispositivo portátil, a fim de validar tais modelos a partir das medições e análise dos resultados em tempo real. O projeto visa determinar a amplitude e duração da sequências de pulsos aplicados em uma suspenção de células para propor melhoria na eficiência da transferência de moléculas, fornecendo subsídios para o entendimento do fenômeno. Para isto, aplica-se a tecnologia dos FPGAs (field programmable gate arrays), circuitos eletrônicos que podem ser reprogramados para desenvolver diferentes funções.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: José Alvim Berkenbrock - Integrante / JEFFERSON LUIZ BRUM MARQUES - Coordenador / Daniela Ota Hisayasu Suzuki - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

Prêmios