Mainá Bitar

Tem experiência nas áreas de Biofísica e Bioinformática, atuando principalmente nos seguintes temas: enovelamento proteico, ancoramento molecular (docking), dinâmica molecular, análise de sequências gênicas e proteicas, modelagem ab initio (através de técnicas de generalized simmulated annealing), predição e análise de RNAs não codificadores, análises de dados de RNASeq. Utiliza linguagem de programação Perl e tem experiência também em desenvolvimento de Scripts em Shell. Em 2015 concluiu o Doutorado em Bioinformática pela Universidade Federal de Minas Gerais, sob a orientação da Professora Dra. Glória Regina Franco (Laboratório de Genética Bioquímica, Brasil) e do Dr. Martin Alexander Smith, do grupo do Professor Dr. John S. Mattick (Garvan Institute for Medical Research, Austrália). Posteriormente concluiu residência Pós-Doutoral de um ano na Universidade Federal de Minas Gerais, com bolsa do Programa Mineiro de Pós-Doutorado (Capes/Fapemig), sob supervisão da Professor Dra. Glória Regina Franco. Atualmente ocupa o cargo de 'Research Officer' no QIMR (Queensland Institute of Medical Research), onde esteve por três anos sob supervisão do Dr. Guy Barry e desde 2019/02 é supervisionada pelas Dr.as Juliet French e Stacey Edwards.

Informações coletadas do Lattes em 26/08/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioinformática

2011 - 2015

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Genomic and Transcriptomic Surveys for the Study of ncRNAs with a focus on tropical parasites
Orientador: em Garvan Institute ( John Stanley Mattick / Martin Alexander Smith)
com Gloria Regina Franco. Coorientador: Martin Smith. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Graduação em Biofisica

2006 - 2010

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Revelando os Mecanismos Moleculares da Proteção Conformacional da Nitrogenase Contra o Oxigênio em Bactérias Diazotróﬁcas
Orientador: Paulo Mascarello Bisch
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Curso técnico/profissionalizante em Seguranca do Trabalho

2003 - 2005

Centro Federal de Educação Tecnológica Celso Suckow da Fonseca

Ensino Médio (2º grau)

2003 - 2005

Centro Federal de Educação Tecnológica Celso Suckow da Fonseca

Pós-doutorado

2015

Pós-Doutorado. , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais, FAPEMIG, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

Formação complementar

2015 - 2015

UCSC Genome Browser advanced workshop. (Carga horária: 4h). , University of New South Wales, UNSW, Austrália.

2011 - 2011

Extensão universitária em Intercâmbio Acadêmico. (Carga horária: 300h). , Technische Universität München, TUM, Alemanha.

2009 - 2009

Métodos Matemáticos em Biologia das Populações II. (Carga horária: 62h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2009 - 2009

Método de Monte Carlo. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2009 - 2009

Introdução ao Linux. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2009 - 2009

Comparação, Busca por Similaridade e Anotação. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2009 - 2009

Programação em Shell Script. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2009 - 2009

Modelagem e Dinâmica Molecular. (Carga horária: 18h). , Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre, SBC, Brasil.

2009 - 2009

Introdução a Docagem Molecular. (Carga horária: 18h). , Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre, SBC, Brasil.

2008 - 2008

Curso de Inverno em Bioinformática - FMRP. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2008 - 2008

RNA Bioinformatics. (Carga horária: 8h). , Brazilian Computer Society, SBC, Brasil.

2008 - 2008

Complexidade de Sistemas Biológicos. (Carga horária: 10h). , Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, CBPF, Brasil.

2008 - 2008

Curso de Bioinformática Avançada. (Carga horária: 60h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2008 - 2008

Molecular Modeling and Dynamics. (Carga horária: 8h). , Brazilian Computer Society, SBC, Brasil.

2008 - 2008

Biological Network Modeling. (Carga horária: 3h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2008 - 2008

Relógio Molecular/Inferência Tempos de Divergência. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2007 - 2007

Extensão universitária em Immunological Bioinformatics: Epitope Discovery. (Carga horária: 8h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2007 - 2007

Genomic Signal Processing. (Carga horária: 4h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2006 - 2006

Introdução aos Processos Estocásticos. (Carga horária: 4h). , Universidade Federal Fluminense, UFF, Brasil.

2006 - 2006

Re-significação das Operações em Frações .... (Carga horária: 4h). , Universidade Federal Fluminense, UFF, Brasil.

2006 - 2006

Modelagem e Dinâmica Molecular em Sist. Biológicos. (Carga horária: 16h). , Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, CBPF, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Matemática / Subárea: Matemática Aplicada.

Organização de eventos

FRANCO, G. R. ; BITAR, M. ; BRANDAO, M. ; PASSETTI, F. ; DURHAM, A. M. ; GRYNBERG, P. . 11th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. 2015. (Congresso).

BITAR, M. ; AZEVEDO, V. A. C. . Curso Bioinformática Estrutural e Análises do Proteoma do Centro Brasil-Argentino de Biotecnologia (CBAB). 2013. (Outro).

BITAR, M. ; FRANCO, G. R. . Seminário Especial do Instituto de Ciências Biológicas da UFMG (Dr. John Mattick). 2012. (Outro).

BITAR, M. ; LOBO, F. P. ; OLIVEIRA, G. C. . 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. 2012. (Congresso).

FRANCO, G. R. ; Bitar, M. . 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. 2010. (Congresso).

BITAR, M. ; KUSER, P. F. . 5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. 2009. (Congresso).

BITAR, M. ; ZUBELLI, J. . Workshop on Mathematical Methods and Modelling of Biophysical Phenomena 2008. 2008. (Congresso).

Bitar, M. ; MELO, M. C. R. ; BAPTISTA, P. M. . Ciclo de Encontros em Biofisica. 2007. (Outro).

Participação em eventos

4th Congreso Argentino de Bioinformática y Biologia Computacional and 4th International Conference of the Iberoamerican Society on Bioinformatics (S. The Spliced Leader Trans-Splicing Mechanism in Different Organisms: Molecular Details and Possible Biological Roles. 2013. (Congresso).

4th Congreso Argentino de Bioinformática y Biologia Computacional and 4th International Conference of the Iberoamerican Society on Bioinformatics (S. Comparative Modeling of Proteins: a Method for Engaging Students Interest in Bioinformatics Tools. 2013. (Congresso).

9th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology and Brazilian Symposium of Bioinformatica. The Role of Dnmt2 in Schistosoma mansoni: Structural Clues to an Epigenetic Mystery. 2013. (Congresso).

Reunião do Projeto Casadinho UFMG-FIOCRUZ/RJ.Comparative Modeling of Proteins from Etiological Agents of Tropical Diseases. 2013. (Encontro).

Workshop on Mathematical Methods and Modeling of Biophysical Phenomena.A Multistep Approach for the Identification and Classification of ncRNAs: Trypanosoma cruzi as a Case Study. 2013. (Oficina).

XXIX Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology. The Use of Omic Approaches to Investigate the Trypanosoma cruzi Response to Ionizing Radiation. 2013. (Congresso).

1st Regulatory & Non-Coding RNAs Meeting Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL). Revealing New Perspectives on the Mechanism of Trans-Splicing in Schistosoma mansoni. 2012. (Congresso).

1st Regulatory & Non-Coding RNAs Meeting Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL). A Comprehensive Survey of the Spliced Leader Trans-Splicing Mechanism in Different Organisms: Molecular Details, Phylogenetic Analysis and Possible Biological Roles. 2012. (Congresso).

2nd International Society for Computational Biology Latin American Regional Meeting (ISCB-Latin America).Revealing new Perspectives on the Regulation of Gene Expression by Trans-Splicing Mechanism in Schistosoma mansoni. 2012. (Encontro).

8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. A Comprehensive Survey of the Spliced Leader Trans-Splicing Mechanism in Different Organisms: Molecular Details, Phylogenetic Analysis and Possible Biological Roles. 2012. (Congresso).

III Encontro de Pesquisa em Parasitologia.Revealing New Perspectives on the Regulation of Gene Expression by the Trans-Splicing Mechanism in Schistosoma mansoni. 2012. (Encontro).

Seminários em Bioinformática do ICB da UFMG.Molecular Modeling of Proteins: Three case studies. 2012. (Seminário).

VI Encontro Nacional de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia (ENAPEBI).A Comprehensive Survey of the Spliced Leader Trans-Splicing Mechanism in Different Organisms: Molecular Details, Phylogenetic Analysis and Possible Biological Roles. 2012. (Encontro).

XIII International Symposium on Schistosomiasis.Characterization of the Trans-Splicing Mechanism in the Post-Transcriptional Gene Regulation of Schistosoma mansoni. 2012. (Simpósio).

XXVIII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology and XXXIX Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. A Multistep Computational Approach for the Identification and Classification of ncRNAs: Trypanosoma cruzi as a Case Study. 2012. (Congresso).

19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology. Structural Comparison Between two L-Asparaginases to Facilitate Rational Engineering of a Cancer Drug. 2011. (Congresso).

7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Revealing New Perspectives on the Regulation of Gene Expression by the Trans-Splicing Mechanism in Schistosoma mansoni. 2011. (Congresso).

7th International Society for Computational Biology Student Council Symposium.Structural Comparison Between two L-Asparaginases to Facilitate Rational Engineering of a Cancer Drug. 2011. (Simpósio).

6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Structural Analysis of the Zinc-Finger Protein SmZF1 from Schistosoma mansoni. 2010. (Congresso).

6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Identification and Classification of ncRNAs in Trypanosoma cruzi: A Multistep Approach. 2010. (Congresso).

Brasil-Deutschland Systems Biology Meeting. 2010. (Congresso).

Iberoamerican Society for Bioinformatics Meeting. Unraveling the Molecular Mechanism of Nitrogenase Conformational Protection Against Oxygen in Diazotrophic Bacteria. 2010. (Congresso).

Métodos Matemáticos em Biologia de Populações.Modelagem Matemática dos Ciclos Lebre-Lince no Canadá. 2010. (Oficina).

V Encontro Nacional de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia (ENAPEBI).Structural Analysis of the Zinc-Finger Protein SmZF1 from Schistosoma mansoni. 2010. (Encontro).

5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Unraveling the Molecular Mechanism of Nitrogenase Conformational Protection Against Oxygen in Diazotrophic Bacteria. 2009. (Congresso).

Brasilian Symposium on Bioinformatics.Molecular Modeling Studies of Nitrogenase's Conformational Protection Mechanisms in Gluconacetobacter diazotrophicus and Azotobacter vinelandii. 2009. (Simpósio).

Curso de Verão em Bioinformática USP. 2009. (Outra).

Encontro Acadêmico de Modelagem Computacional. 2009. (Encontro).

II Escola Brasileira de BIoinformatica.Molecular Modeling Studies of Nitrogenase's Conformational Protection Mechanisms in Gluconacetobacter diazotrophicus and Azotobacter vinelandii. 2009. (Outra).

Métodos Matemáticos em Biologia das Populações II.Sincronia e Dispersão. 2009. (Oficina).

Programa de Verão LNCC. 2009. (Outra).

Workshop on Mathematical Methods and Modeling of Biophysical Phenomena. Molecular Modeling Studies of Nitrogenase's Conformational Protection Mechanisms in Gluconacetobacter diazotrophicus and Azotobacter vinelandii. 2009. (Congresso).

4th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Studies of Nitrogenase's Conformational Protection Mechanism in Azotobacter vinelandii and Gluconacetobacter diazotrophicus. 2008. (Congresso).

54o Congresso Brasileiro de Genética. 2008. (Congresso).

I Escola Brasileira de Bioinformática. 2008. (Outra).

IV Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos. 2008. (Outra).

VII Escola do Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas. 2008. (Outra).

3rd International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Ab Initio Molecular Modeling Using Tsallis Statistics. 2007. (Congresso).

Workshop on Mathematical Methods and Modeling of Biophysical Phenomena. Generalized Simulated Annealing Applied in Flexible Molecular Docking and Protein Folding. 2007. (Congresso).

III Semana da Matemática da UFF. 2006. (Outra).

Simpósio Nacional / Jornadas de Iniciação Científica do Instituto de Matemática Pura e Aplicada. 2006. (Simpósio).

VI Escola do Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas. 2006. (Outra).

Orientou

André Luiz Martins Reis

O uso diferencial de sítios aceptores de spliced leader trans-splicing em unidades policistrônicas de Trypanosoma cruzi; Início: 2015; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Alan Sales Barbosa

Modelagem comparativa da proteína G3BP1 de Rattus norvegicus; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Mainá Bitar;

André Luiz Martins Reis

Caracterização do uso diferencial de sítios aceptores de spliced leader trans-splicing em unidades policistônicas de Trypanosoma cruzi; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Mainá Bitar;

Produções bibliográficas

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FARIA, J. A. Q. A. ; DO VALLE, I. F. ; BITAR, M. ; GOMES, D. A. ; SILVA, F. P. . Comparative Modeling of a Novel Human Lysine Methyltransferase SETD4 Overexpressed in Breast Cancer. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012. Anais da 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.
AMBRÓSIO, L. ; ALMEIDA, G. ; TRINDADE, G. ; BITAR, M. . Structural Comparative Modeling of Vaccinia virus Soluble Type I Interferon. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012. Anais da 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.
CALIXTO, P. H. M. ; BITAR, M. ; FRANCO, G. R. ; PEDROSA, A. L. . Gene Identification and Comparative Molecular Modeling of a Trypanosoma rangeli Major Surface Protease. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012. Anais da 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.
BITAR, M. ; MOURAO, M. M. ; FRANCO, G. R. . Revealing New Perspectives on the Regulation of Gene Expression by the Trans-Splicing Mechanism in Schistosoma mansoni. In: III Encontro de Pesquisa em Parasitologia, 2012. Anais do III Encontro de Pesquisa em Parasitologia, 2012.
BITAR, M. ; FRANCO, G. R. . A Comprehensive Survey of the Spliced Leader Trans-Splicing Mechanism in Different Organisms: Molecular Details, Phylogenetic Analysis and Possible Biological Roles. In: VI Encontro Nacional de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia (ENAPEBI), 2012. Anais do VI Encontro Nacional de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia (ENAPEBI), 2012.
BITAR, M. ; OFFMAN, M. ; ROST, B. . Structural Comparison Between two L-Asparaginases to Facilitate Rational Engineering of a Cancer Drug. In: 7th International Society for Computational Biology Student Council Symposium, 2011. Anais da 7th International Society for Computational Biology Student Council Symposium, 2011.
BITAR, M. ; MOURAO, M. M. ; FRANCO, G. R. . Revealing New Perspectives on the Regulation of Gene Expression by the Trans-Splicing Mechanism in Schistosoma mansoni. In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2011. Anais da 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2011.
BITAR, M. ; OFFMAN, M. ; ROST, B. . Structural Comparison Between two L-Asparaginases to Facilitate Rational Engineering of a Cancer Drug. In: 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology, 2011. Anais do 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 10th European Conference on Computational Biology, 2011.
BITAR, M. ; GRYNBERG, P. ; FRANCO, G. R. . Identification and Classification of ncRNAs in Trypanosoma cruzi: A Multistep Approach. In: 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010. Anais da 6rd International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010.
BITAR, M. ; LERY, L. M. S. ; COSTA, M. G. S. ; BISCH, P. M. . Unraveling the Molecular Mechanism of Nitrogenase Conformational Protection Against Oxygen in Diazotrophic Bacteria. In: Iberoamerican Society for Bioinformatics Meeting (SoIBio), 2010. Anais da Iberoamerican Society for Bioinformatics Meeting (SoIBio), 2010.
BITAR, M. ; DRUMMOND, M. G. ; LOBO, F. P. ; FRANCO, G. R. . Structural Analysis of the Zinc Finger Protein SmZF1 from Schistosoma mansoni. In: V Encontro Nacional de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia, 2010. Anais do V Encontro Nacional de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia, 2010.
BITAR, M. ; DRUMMOND, M. G. ; LOBO, F. P. ; FRANCO, G. R. . Structural Analysis of the Zinc-Finger Protein SmZF1 from Schistosoma mansoni. In: 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010. Anais do 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010.
BITAR, M. ; LERY, L. M. S. ; COSTA, M. G. S. ; BISCH, P. M. . Unraveling the Molecular Mechanism of Nitrogenase Conformational Protection Against Oxygen in Diazotrophic Bacteria. In: 5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009. Anais da 5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009.
BITAR, M. ; LERY, L. M. S. ; COSTA, M. G. S. ; BISCH, P. M. . Molecular Modeling Studies of Nitrogenase's Conformational Protection Mechanisms in Gluconacetobacter diazotrophicus and Azotobacter vinelandii. In: Workshop on Mathematical Methods and Modeling of Biophysical Phenomena, 2009. Anais do Workshop on Mathematical Methods and Modeling of Biophysical Phenomena, 2009.
BITAR, M. ; LERY, L. M. S. ; COSTA, M. G. S. ; BISCH, P. M. . Molecular Modeling Studies of Nitrogenase's Conformational Protection Mechanisms in Gluconacetobacter diazotrophicus and Azotobacter vinelandii. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics e Escola Brasilieira de Bioinformática, 2009. Anais do Brazilian Symposium on Bioinformatics e Escola Brasilieira de Bioinformática, 2009.
BITAR, M. ; LERY, L. M. S. ; COSTA, M. G. S. ; BISCH, P. M. . Studies on Nitrogenase Conformational Protection Mechanism in Azotobacter vinelandii and Gluconacetobacter diazotrophicus. In: 4th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2008. Anais da 4th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2008.
BITAR, M. ; LERY, L. M. S. ; COSTA, M. G. S. ; BISCH, P. M. . Molecular Modeling Studies of Nitrogenase's Conformational Protection Mechanisms in Gluconacetobacter diazotrophicus and Azotobacter vinelandii. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics e Escola Brasilieira de Bioinformática, 2008. Anais do Brazilian Symposium on Bioinformatics e Escola Brasilieira de Bioinformática, 2008.
BITAR, M. ; MELO, M. C. R. ; BAPTISTA, P. M. ; DOMONT, S. ; PITTA, S. ; FERNANDES, T. ; PASCUTTI, P. G. . Generalized Simulated Annealing Applied in Flexible Molecular Docking and Protein Folding. In: Workshop on Mathematical Methods and Modeling of Biophysical Phenomena, 2007. Anais do Workshop on Mathematical Methods and Modeling of Biophysical Phenomena, 2007.
BITAR, M. ; MELO, M. C. R. ; BAPTISTA, P. M. ; DOMONT, S. ; PITTA, S. ; FERNANDES, T. ; PASCUTTI, P. G. . Ab Initio Molecular Modeling Using Tsallis Statistics. In: 3rd International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007. Anais da 3rd International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007.
BITAR, M. . Comparative Modeling of Proteins: a method for engaging student's interest in bioinformatics tools. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
BITAR, M. ; GRYNBERG, P. ; LOBO, F. P. ; MOURAO, M. M. ; BORONI, M. L. M. ; FRANCO, G. R. . Revealing new Perspectives on the Regulation of Gene Expression by Trans-Splicing Mechanism in Schistosoma mansoni. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
FRANCO, G. R. ; BITAR, M. ; MOURAO, M. M. . Characterization of the Trans-Splicing Mechanism in the Post-Transcriptional Gene Regulation of Schistosoma mansoni. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
BITAR, M. ; OFFMAN, M. ; ROST, B. . Structural Comparison Between two L-Asparaginases to Facilitate Rational Engineering of a Cancer Drug. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
BITAR, M. ; DRUMMOND, M. G. ; LOBO, F. P. ; FRANCO, G. R. . Structural Analysis of the Zinc-Finger Protein SmZF1 from Schistosoma mansoni. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
BITAR, M. ; GRYNBERG, P. ; FRANCO, G. R. . Identification and Classification of ncRNAs in Trypanosoma cruzi: A Multistep Approach. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
BITAR, M. ; LERY, L. M. S. ; COSTA, M. G. S. ; BISCH, P. M. . Unraveling the Molecular Mechanism of Nitrogenase Conformational Protection Against Oxygen in Diazotrophic Bacteria. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
BITAR, M. ; LERY, L. M. S. ; COSTA, M. G. S. ; BISCH, P. M. . Molecular Modeling Studies of Nitrogenase's Conformational Protection Mechanisms in Gluconacetobacter diazotrophicus and Azotobactervinelandii. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
BITAR, M. ; MELO, M. C. R. ; BAPTISTA, P. M. ; DOMONT, S. ; PITTA, S. ; FERNANDES, T. ; PASCUTTI, P. G. . Ab Initio Molecular Modeling Using Tsallis Statistics. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
BITAR, M. ; MELO, M. C. R. ; BAPTISTA, P. M. ; DOMONT, S. ; PITTA, S. ; FERNANDES, T. ; PASCUTTI, P. G. . Generalized Simulated Annealing Applied in Flexible Molecular Docking and Protein Folding. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Bitar, M. ; LOPES, F. M. . BioInfoNews. 2010; Tema: Canal de comunicação de estudantes e pesquisadores na área de bioinformática.. (Rede social).

BITAR, M. . Introdução a Programação em Perl. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

BITAR, M. . Introdução a Programação em Perl. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

BITAR, M. . Modelagem Molecular de Macromoléculas. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

BITAR, M. . Modelagem Molecular de Macromoléculas. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

2014 - 2015

Análises de dados provenientes de experimentos de RNA CaptureSeq com transcritos de regiões intergênicas associadas à doenças humanas, Descrição: Uma fração significativa de regiões intrônicas e intergênicas do genoma humano é transcrita em RNAs com funções importantes (ncRNAs). Para estudar estes transcritos, uma nova estratégia de captura e sequenciamento de RNAs em larga escala (RNA CaptureSeq) foi desenvolvida pelo grupo do Dr. John Mattick, representando uma boa estratégia para a identificação de novas classes de ncRNAs. Propomos a investigação por RNA CaptureSeq de blocos haplotípicos vazios associados a fenótipos e doenças humanas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Mainá Bitar - Integrante / Glória Regina Franco - Coordenador / Martin Smith - Integrante / John Mattick - Integrante.
2014 - Atual

Uma abordagem em larga escala para a compreensão dos efeitos da radiação gama em Trypanosoma cruzi, Descrição: Com esse projeto pretendemos avançar na caracterização molecular da resposta ao estresse de radiação no Trypanosoma cruzi. Para isto, propomos uma avaliação mais precisa e em alta definição do transcriptoma das células irradiadas, utilizando a tecnologia de RNASeq. Pretendemos ainda avaliar a possibilidade da ocorrência de trans-splicing alternativo induzido pela radiação para a geração de isoformas diferentes de proteínas em relação àquelas existentes em células normais. Também de importância é a análise, após irradiação, do perfil de mRNAs que estão presentes em ribonucleocomplexos proteicos citoplasmáticos e que poderiam estar sendo eficientemente traduzidos. Para isto, pretendemos identificar os mRNAs associados às proteínas que se ligam a cauda de poli-A (PABPs), pois estas proteínas se localizam em compartimentos ricos em ribossomos (fração polissomal). Alternativamente, a caracterização de mRNAs associados a outras proteínas que se ligam a RNAs e que tem papel efetivo de resposta a estresse (DRDB3), ou aquelas envolvidas no controle do metabolismo energético (RBP42) será de fundamental relevância para o entendimento da resposta ao estresse de radiação ionizante no parasito. Para isto, pretendemos utilizar a metodologia de precipitação de ribonucleocomplexos seguido do sequenciamento em larga escala dos mRNAs precipitados (RIP-Seq), a fim de caracterizar a dinâmica dos mRNAs no citoplasma após a irradiação gama.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Mainá Bitar - Integrante / Priscila Grynberg - Integrante / Carlos Renato Machado - Integrante / Andréa Mara Macedo - Integrante / Glória Regina Franco - Coordenador / André Luiz Martins Reis - Integrante / Helaine Graziele Santos Vieira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Pesquisa - Auxílio financeiro.
2014 - Atual

Estudos sobre o mecanismo de regulacao genica mediado por Spliced Leader Trans-Splicing em diversos organismos, com enfase nos parasitos Schistosoma mansoni e Trypanosoma cruzi, Descrição: Descrição: O Spliced Leader (SL) é um gene que gera um ncRNA funcional composto de duas regiões: uma região intrônica de função não conhecida e uma região exônica (SLe) que é transferida para a porção 5 terminal de transcritos independentes, para gerar um mRNA maduro, em um processo chamado spliced leader trans-splicing (SLTS). A função mais bem descrita para o SLTS é a resolução de transcritos policistrônicos em unidades monocistrônicas, especialmente em Tryanosomatídeos. Este mecanismo foi identificado em outros metazoários e diferentes papéis biológicos foram propostos para o SLTS. Especula-se que a adição da sequência de SLe possa levar ao aumento da estabilidade do mRNA, recrutamento diferencial da maquinaria de tradução, modificação da região 5 ou uma combinação destes efeitos. Apesar de importantes aspectos do mecanismo de SLTS terem sido revelados, diversas características ainda precisam ser elucidadas. Neste projeto, propomos uma análise abrangente em diversas espécies e filos, buscando por uma caracterização molecular do mecanismo através de ferramentas de Bioinformática e análises de dados em bases públicas. Como casos de estudo, escolhemos os parasitos Trypanosoma cruzi e Schistosoma mansoni, importantes agentes etiológicos de doenças tropicais. Neste projeto, propomos experimentos de RNASeq e PCR em Tempo Real para caracterizar variantes de trans-splicing e as consequências da inserção do SLe em sítios aceptores alternativos. Este trabalho lança luz em aspectos muito cruciais e controversos do mecanismo de SLTS, representando um estudo abrangente a respeito das diferentes características desse importante mecanismo regulatório pos-transcricional.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Mainá Bitar - Integrante / Priscila Grynberg - Integrante / Marina de Moraes Mourão - Integrante / Andréa Mara Macedo - Integrante / Glória Regina Franco - Coordenador / André Luiz Martins Reis - Integrante / Helaine Graziele Santos Vieira - Integrante / MACHADO, CARLOS R. - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
2011 - Atual

Structural comparison between two L-asparaginases to facilitate rational engineering of a cancer drug, Descrição: L-asparaginase (L-ASNase) is an enzyme with antileukemic properties that has been widely employed in the treatment of acute lymphoblastic leukemia (ALL) since the 1970s. It hydrolyzes L-asparagine to L-aspartate and ammonia. Malignant lymphoblasts have low levels of asparagine synthetase and therefore undergo apoptosis once exogenous asparagine is depleted from the blood. Three different L-ASNase are clinically available, one Erwinia chrysanthemi (Era), one native and one pegylated Escherichia coli (Eca) enzyme. Although treatment is effective, some patients fail to maintain therapeutic levels of the Eca drug due to silent inactivation. Furthermore, the bacterial origin of the protein can lead to hypersensitivity. Previously, Eca mutant proteins with the potential to reduce antigenicity and toxicity have been successfully generated. Since Era has decreased antigenicity, it is a good candidate for further protein engineering. This work aims to assess similarities and differences between Eca and Era that can assist the engineering of a protein with increased activity and decreased toxicity. Two additional targets for protein engineering are glutaminase activity related residues, responsible for neurotoxic side effects, and features involved in protein half-life. Molecular dynamics simulations are performed and coupled with consensus modes analysis of protein structures. In addition, a previously developed molecular engineering protocol is employed. This is a step forward to address the molecular mechanisms of L-ASNase protein dynamics and function, elucidating the basis of specific side effects arising from its use in ALL treatment.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Mainá Bitar - Integrante / Marc Offman - Integrante / Burkhard Rost - Coordenador., Financiador(es): Technische Universität München - Bolsa.
2008 - 2010

Unraveling the molecular mechanisms of nitrogenase conformational protection against oxygen in diazotrophic bacteria, Descrição: Caracterização estrutural e funcional da proteína FeSII e do complexo nitrogenase de Gluconacetobacter diazotrophicus e Azotobacter vinelandii visando o esclarecimento do mecanismo molecular da proteção conformacional da nitrogenase em bactérias diazotróficas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Mainá Bitar - Coordenador / Letícia Miranda dos Santos Lery - Integrante / Maurício Garcia Souza Costa - Integrante / Paulo Mascarello Bisch - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

Prêmios

2015

Lorne Genome Travel Grants, Lorne Genome Conference.

2015

National Human Genome Research Institute (NHGRI) Scholarship, Keystone Symposia of Long Noncoding RNAs: From Evolution to Function.

2013

Selected for Oral Presentation, Asociación Argentina de Bioinformática y Biología Computacional e Iberoamerican Society for Bioinf.

2012

Honorable Mention for Best Oral Presentation, 13th International Symposium on Schistosomiasis.

2012

Selected for Oral Presentation, 13th International Symposium on Schistosomiasis.

2010

Best Poster, Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional (AB3C).

2009

Best Paper, Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.

2008

Second Best Poster, Brazilian Computer Society.

2008

Best Oral Presentation, Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology.

2008

Selected for Oral Presentation, Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade Federal de Minas Gerais, Instituto de Ciências Biológicas. , Avenida Presidente Antonio Carlos, 6127, Pampulha, 31270901 - Belo Horizonte, MG - Brasil, Telefone: (31) 34092537

Experiência profissional

2015 - Atual

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pos-Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

2011 - 2015

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluna de Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Aluna de Doutorado no Programa de Pós-Graduação em Bioinformática da UFMG

2010 - 2011

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Estágio de Curta Duração, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20

Atividades

01/2010 - 01/2011
Estágios , Instituto de Ciências Biológicas, .,Estágio realizado, Caracterização Estrutural da Proteína SmZF1 de Schistosoma mansoni.

2011 - 2011

Technische Universität München

Vínculo: Estudante de Intercâmbio, Enquadramento Funcional: Estudante de Intercâmbio, Carga horária: 40

Outras informações:
http://www.iscbsc.org/content/four-students-selected-internship-rost-lab The following students were selected for the internship at the RostLab at Technische Universität München, Munich campus. * Mohd. Rehan (Jawaharlal Nehru University, India) * Maina Bitar (Federal University of Rio de Janeiro (UFRJ), Brazil) * Dedan Kinuthia Githae (University of Manchester, United Kingdom / resident of Kenya) * Marian Ewejobi Itunuoluwa (Covenant University, Nigeria)

Atividades

01/2011 - 08/2011
Estágios , Department for Bioinformatics and Computational Biology, .,Estágio realizado, Comparação Estrutural entre a Erwinase e a L-Asparaginase de E.coli para Facilitar a Engenharia Racional de Drogas para o Tratamento da Leucemia Linfoblástica Aguda.

2007 - 2011

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Outro (especifique), Enquadramento Funcional: Estudante de Iniciação Científica, Carga horária: 20

Atividades

07/2009 - 01/2011
Estágios , Reitoria, Centro de Ciências da Saúde.,Estágio realizado, Estudos Estruturais do Mecanismo de Proteção Conformacional do Complexo Nitrogenase em Bactérias Diazotróficas por Modelagem e Dinâmica Molecular.
07/2008 - 12/2008
Estágios , Reitoria, Centro de Ciências da Saúde.,Estágio realizado, Estudos Estruturais do Mecanismo de Proteção Conformacional do Complexo Nitrogenase em Bactérias Diazotróficas por Modelagem e Dinâmica Molecular.
01/2008 - 06/2008
Estágios , Reitoria, Centro de Ciências da Saúde.,Estágio realizado, Estudos Matemáticos de Sequências e Séries.
07/2007 - 12/2007
Estágios , Reitoria, Centro de Ciências da Saúde.,Estágio realizado, Introdução à Programação em Dinâmica Molecular.
01/2007 - 06/2007
Estágios , Reitoria, Centro de Ciências da Saúde.,Estágio realizado, Estudos de Termodinâmica de Sistemas em Equilíbrio.
07/2006 - 12/2006
Estágios , Reitoria, Centro de Ciências da Saúde.,Estágio realizado, Métodos Proteômicos.

2014 - 2015

Garvan Institute

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Doutorado Sanduíche