Adriana Lopes dos Santos

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• TREFAULT, NICOLE ; DE LA IGLESIA, RODRIGO ; MORENO-PINO, MARIO ; Lopes dos Santos, Adriana ; GÉRIKAS RIBEIRO, CATHERINE ; PARADA-POZO, GÉNESIS ; CRISTI, ANTONIA ; MARIE, DOMINIQUE ; Vaulot, Daniel . Annual phytoplankton dynamics in coastal waters from Fildes Bay, Western Antarctic Peninsula. Scientific Reports , v. 11, p. 1368, 2021.

• MASSICOTTE, PHILIPPE AMIRAUX, RÉMI AMYOT, MARIE-PIER ARCHAMBAULT, PHILIPPE ARDYNA, MATHIEU ARNAUD, LAURENT ARTIGUE, LISE AUBRY, CYRIL AYOTTE, PIERRE BÉCU, GUISLAIN BÉLANGER, SIMON BENNER, RONALD BITTIG, HENRY C. BRICAUD, ANNICK BROSSIER, ÉRIC BRUYANT, FLAVIENNE CHAUVAUD, LAURENT CHRISTIANSEN-STOWE, DEBRA CLAUSTRE, HERVÉ CORNET-BARTHAUX, VÉRONIQUE COUPEL, PIERRE COX, CHRISTINE DELAFORGE, AURELIE DEZUTTER, THIBAUD DIMIER, CÉLINE , et al. DOMINE, FLORENT DUFOUR, FRANCIS DUFRESNE, CHRISTIANE DUMONT, DANY EHN, JENS ELSE, BRENT FERLAND, JOANNIE FORGET, MARIE-HÉLÈNE FORTIER, LOUIS GALÍ, MARTÍ GALINDO, VIRGINIE GALLINARI, MORGANE GARCIA, NICOLE GÉRIKAS RIBEIRO, CATHERINE GOURDAL, MARGAUX GOURVIL, PRISCILLA GOYENS, CLEMENCE GRONDIN, PIERRE-LUC GUILLOT, PASCAL GUILMETTE, CAROLINE HOUSSAIS, MARIE-NOËLLE JOUX, FABIEN LACOUR, LÉO LACOUR, THOMAS LAFOND, AUGUSTIN LAGUNAS, JOSÉ LALANDE, CATHERINE LALIBERTÉ, JULIEN LAMBERT-GIRARD, SIMON LARIVIÈRE, JADE LAVAUD, JOHANN LEBARON, ANITA LEBLANC, KARINE LE GALL, FLORENCE LEGRAS, JUSTINE LEMIRE, MÉLANIE LEVASSEUR, MAURICE LEYMARIE, EDOUARD LEYNAERT, AUDE Lopes dos Santos, Adriana LOURENÇO, ANTONIO MAH, DAVID MAREC, CLAUDIE MARIE, DOMINIQUE MARTIN, NICOLAS MARTY, CONSTANCE MARTY, SABINE MASSÉ, GUILLAUME MATSUOKA, ATSUSHI MATTHES, LISA MORICEAU, BRIVAELA MULLER, PIERRE-EMMANUEL MUNDY, CHRISTOPHER-JOHN NEUKERMANS, GRIET OZIEL, LAURENT PANAGIOTOPOULOS, CHRISTOS PANGRAZI, JEAN-JACQUES PICARD, GHISLAIN PICHERAL, MARC PINCZON DU SEL, FRANCE POGORZELEC, NICOLE PROBERT, IAN QUÉGUINER, BERNARD RAIMBAULT, PATRICK RAS, JOSÉPHINE REHM, ERIC REIMER, ERIN RONTANI, JEAN-FRANÇOIS RYSGAARD, SREN SAINT-BÉAT, BLANCHE SAMPEI, MAKOTO SANSOULET, JULIE SCHMECHTIG, CATHERINE SCHMIDT, SABINE SEMPÉRÉ, RICHARD SÉVIGNY, CAROLINE SHEN, YUAN TRAGIN, MARGOT TREMBLAY, JEAN-ÉRIC Vaulot, Daniel VERIN, GAUTHIER VIVIER, FRÉDÉRIC VLADOIU, ANDA WHITEHEAD, JEREMY BABIN, MARCEL ; Green Edge ice camp campaigns: understanding the processes controlling the under-ice Arctic phytoplankton spring bloom. Earth System Science Data , v. 12, p. 151-176, 2020.

• YAU, SHEREE ; Lopes dos Santos, Adriana ; EIKREM, WENCHE ; GÉRIKAS RIBEIRO, CATHERINE ; GOURVIL, PRISCILLIA ; BALZANO, SERGIO ; ESCANDE, MARIE'LINE ; MOREAU, HERVÉ ; Vaulot, Daniel . Mantoniella beaufortii and Mantoniella baffinensis sp. nov. (Mamiellales, Mamiellophyceae), two new green algal species from the high arctic 1. JOURNAL OF PHYCOLOGY , v. 56, p. 37-51, 2020.

• RIBEIRO, CATHERINE GÉRIKAS ; dos Santos, Adriana Lopes ; GOURVIL, PRISCILLIA ; LE GALL, FLORENCE ; MARIE, DOMINIQUE ; TRAGIN, MARGOT ; PROBERT, IAN ; Vaulot, Daniel . Culturable diversity of Arctic phytoplankton during pack ice melting. ELEMENTA: SCIENCE OF THE ANTHROPOCENE , v. 8, p. 6, 2020.

• RIBEIRO, CATHERINE GÉRIKAS ; dos Santos, Adriana Lopes ; PROBERT, IAN ; Vaulot, Daniel ; EDVARDSEN, BENTE . Taxonomic reassignment of . (Haptophyta). PHYCOLOGIA , v. 59, p. 606-615, 2020.

• CHÉNARD, CAROLINE ; WIJAYA, WINONA ; Vaulot, Daniel ; Lopes dos Santos, Adriana ; MARTIN, PATRICK ; KAUR, AVNEET ; LAURO, FEDERICO M. . Temporal and spatial dynamics of Bacteria, Archaea and protists in equatorial coastal waters. Scientific Reports , v. 9, p. 16390, 2019.

• METZ, SEBASTIÁN ; LOPESDOSSANTOS, ADRIANA ; BERMAN, MANUEL CASTRO ; BIGEARD, ESTELLE ; LICURSI, MAGDALENA ; NOT, FABRICE ; LARA, ENRIQUE ; UNREIN, FERNANDO . Diversity of photosynthetic picoeukaryotes in eutrophic shallow lakes as assessed by combining flow cytometry cell-sorting and high throughput sequencing. FEMS Microbiology Ecology , v. 95, p. fiz038, 2019.

• TURMEL, MONIQUE ; Lopes dos Santos, Adriana ; OTIS, CHRISTIAN ; SERGERIE, ROXANNE ; LEMIEUX, CLAUDE . Tracing the Evolution of the Plastome and Mitogenome in the Chloropicophyceae Uncovered Convergent tRNA Gene Losses and a Variant Plastid Genetic Code. Genome Biology and Evolution , v. 11, p. 1275-1292, 2019.

• GUTIERREZ-RODRIGUEZ, ANDRES ; STUKEL, MICHAEL R. ; Lopes dos Santos, Adriana ; BIARD, TRISTAN ; SCHAREK, RENATE ; Vaulot, Daniel ; LANDRY, MICHAEL R. ; NOT, FABRICE . High contribution of Rhizaria (Radiolaria) to vertical export in the California Current Ecosystem revealed by DNA metabarcoding. ISME Journal , v. 13, p. 964-976, 2019.

• CYPRIANO, JEFFERSON ; WERCKMANN, JACQUES ; VARGAS, GABRIELE ; Lopes dos Santos, Adriana ; SILVA, KAREN T. ; LEÃO, PEDRO ; ALMEIDA, FERNANDO P. ; BAZYLINSKI, DENNIS A. ; FARINA, MARCOS ; LINS, ULYSSES ; ABREU, FERNANDA . Uptake and persistence of bacterial magnetite magnetosomes in a mammalian cell line: Implications for medical and biotechnological applications. PLoS One , v. 14, p. e0215657, 2019.

• KUWATA, AKIRA ; YAMADA, KAZUMASA ; ICHINOMIYA, MUTSUO ; YOSHIKAWA, SHINYA ; TRAGIN, MARGOT ; Vaulot, Daniel ; Lopes dos Santos, Adriana . Bolidophyceae, a Sister Picoplanktonic Group of Diatoms - A Review. FRONTIERS IN MARINE SCIENCE , v. 5, p. 370, 2018.

• GÉRIKAS RIBEIRO, CATHERINE ; Lopes dos Santos, Adriana ; MARIE, DOMINIQUE ; PEREIRA BRANDINI, FREDERICO ; Vaulot, Daniel . Small eukaryotic phytoplankton communities in tropical waters off Brazil are dominated by symbioses between Haptophyta and nitrogen-fixing cyanobacteria. ISME Journal , v. 12, p. 1360-1374, 2018.

• Lopes dos Santos, Adriana ; POLLINA, THIBAUT ; GOURVIL, PRISCILLIA ; CORRE, ERWAN ; MARIE, DOMINIQUE ; GARRIDO, JOSÉ LUIS ; RODRÍGUEZ, FRANCISCO ; NOËL, MARY-HÉLÈNE ; Vaulot, Daniel ; EIKREM, WENCHE . Chloropicophyceae, a new class of picophytoplanktonic prasinophytes. Scientific Reports , v. 7, p. 14019, 2017.

• Lopes dos Santos, Adriana ; GOURVIL, PRISCILLIA ; TRAGIN, MARGOT ; NOËL, MARY-HÉLÈNE ; DECELLE, JOHAN ; ROMAC, SARAH ; Vaulot, Daniel . Diversity and oceanic distribution of prasinophytes clade VII, the dominant group of green algae in oceanic waters. ISME Journal , v. 11, p. 512-528, 2017.

• EGAS, CLAUDIA ; HENRÍQUEZ-CASTILLO, CARLOS ; DELHERBE, NATHALIE ; MOLINA, ERNESTO ; dos Santos, Adriana Lopes ; LAVIN, PARIS ; DE LA IGLESIA, RODRIGO ; Vaulot, Daniel ; TREFAULT, NICOLE . Short timescale dynamics of phytoplankton in Fildes Bay, Antarctica. ANTARCTIC SCIENCE , v. 29, p. 217-228, 2017.

• Lopes dos Santos, Adriana ; GOURVIL, PRISCILLIA ; RODRÍGUEZ, FRANCISCO ; GARRIDO, JOSÉ LUIS ; Vaulot, Daniel . Photosynthetic pigments of oceanic Chlorophyta belonging to prasinophytes clade VII. Journal of Phycology , v. 52, p. 148-155, 2016.

• ICHINOMIYA, MUTSUO ; dos Santos, Adriana Lopes ; GOURVIL, PRISCILLIA ; YOSHIKAWA, SHINYA ; KAMIYA, MITSUNOBU ; OHKI, KAORI ; Audic, Stéphane ; DE VARGAS, COLOMBAN ; NOËL, MARY-HÉLÈNE ; Vaulot, Daniel ; KUWATA, AKIRA . Diversity and oceanic distribution of the Parmales (Bolidophyceae), a picoplanktonic group closely related to diatoms. The ISME Journal , v. 1, p. 1-16, 2016.

• GÉRIKAS RIBEIRO, CATHERINE ; Lopes dos Santos, Adriana ; MARIE, DOMINIQUE ; HELENA PELLIZARI, VIVIAN ; PEREIRA BRANDINI, FREDERICO ; Vaulot, Daniel . Pico and nanoplankton abundance and carbon stocks along the Brazilian Bight. PeerJ , v. 4, p. e2587, 2016.

• GÉRIKAS RIBEIRO, CATHERINE ; MARIE, DOMINIQUE ; Lopes dos Santos, Adriana ; PEREIRA BRANDINI, FREDERICO ; Vaulot, Daniel . Estimating microbial populations by flow cytometry: Comparison between instruments. LIMNOLOGY AND OCEANOGRAPHY-METHODS , v. 14, p. 750, 2016.

• TRAGIN, MARGOT ; Lopes dos Santos, Adriana ; CHRISTEN, RICHARD ; Vaulot, Daniel . Diversity and ecology of green microalgae in marine systems: an overview based on 18S rRNA gene sequences. Perspectives in Phycology , v. 3, p. 141-154, 2016.

• DECELLE, JOHAN ; ROMAC, SARAH ; STERN, ROWENA F. ; BENDIF, EL MAHDI ; ZINGONE, ADRIANA ; Audic, Stéphane ; GUIRY, MICHAEL D. ; GUILLOU, LAURE ; TESSIER, DÉSIRÉ ; LE GALL, FLORENCE ; GOURVIL, PRISCILLIA ; DOS SANTOS, ADRIANA L. ; PROBERT, IAN ; Vaulot, Daniel ; DE VARGAS, COLOMBAN ; CHRISTEN, RICHARD . PhytoREF: a reference database of the plastidial 16S rRNA gene of photosynthetic eukaryotes with curated taxonomy. Molecular Ecology Resources (Print) , v. 15, p. 1435-1445, 2015.

• PLOMINSKY, A. M. DELHERBE, N. UGALDE, J. A. ALLEN, E. E. BLANCHET, M. IKEDA, P. SANTIBANEZ, F. HANSELMANN, K. ULLOA, O. DE LA IGLESIA, R. VON DASSOW, P. ASTORGA, M. GALVEZ, M. J. GONZALEZ, M. L. HENRIQUEZ-CASTILLO, C. VAULOT, D. LOPES DO SANTOS, A. VAN DEN ENGH, G. GIMPEL, C. BERTOGLIO, F. DELGADO, Y. DOCMAC, F. ELIZONDO-PATRONE, C. NARVAEZ, S. SORROCHE, F. , et al. ROJAS-HERRERA, M. TREFAULT, N. ; Metagenome Sequencing of the Microbial Community of a Solar Saltern Crystallizer Pond at Cahuil Lagoon, Chile. Genome Announcements , v. 2, p. e01172-14-e01172-14, 2014.

• RACHID, CAIO T. C. C. ; SANTOS, ADRIANA L. ; PICCOLO, MARISA C. ; BALIEIRO, FABIANO C. ; COUTINHO, HEITOR L. C. ; PEIXOTO, RAQUEL S. ; Tiedje, James M. ; Rosado, Alexandre S. . Effect of Sugarcane Burning or Green Harvest Methods on the Brazilian Cerrado Soil Bacterial Community Structure. Plos One , v. 8, p. e59342, 2013.

• CARNEIRO, A. R. RAMOS, R. T. J. DALL'AGNOL, H. PINTO, A. C. DE CASTRO SOARES, S. SANTOS, A. R. GUIMARAES, L. C. ALMEIDA, S. S. BARAUNA, R. A. DAS GRACAS, D. A. FRANCO, L. C. ALI, A. HASSAN, S. S. NUNES, C. I. P. BARBOSA, M. S. FIAUX, K. K. ABURJAILE, F. F. BARBOSA, E. G. V. BAKHTIAR, S. M. VILELA, D. NOBREGA, F. DOS SANTOS, A. L. CAREPO, M. S. P. AZEVEDO, V. SCHNEIDER, M. P. C. , et al. PELLIZARI, V. H. SILVA, A. ; Genome Sequence of Exiguobacterium antarcticum B7, Isolated from a Biofilm in Ginger Lake, King George Island, Antarctica. Journal of Bacteriology (Print) , v. 194, p. 6689-6690, 2012.

• dos Santos, Henrique Fragoso ; Cury, Juliano Carvalho ; do Carmo, Flávia Lima ; Lopes, AS ; Tiedje, James ; van Elsas, Jan Dirk ; Rosado, Alexandre Soares ; Peixoto, Raquel Silva . Mangrove Bacterial Diversity and the Impact of Oil Contamination Revealed by Pyrosequencing: Bacterial Proxies for Oil Pollution. Plos One , v. 6, p. e16943, 2011.

• Lopes, AS ; Siqueira, José F. ; Rôças, Isabela N. ; Jesus, Ederson C. ; Rosado, Alexandre S. ; Tiedje, James M. . Comparing the Bacterial Diversity of Acute and Chronic Dental Root Canal Infections. Plos One , v. 6, p. e28088, 2011.

• Lopes, AS ; Rôças, IN ; FERREIRA, F. A. ; ROSADO, A. S. ; Siqueira, JF Jr . Apical Root Canal Microbiota as Determined by Reverse-capture Checkerboard Analysis of Cryogenically Ground Root Samples from Teeth with Apical Periodontitis. Journal of Endodontics , v. 36, p. 1617-1621, 2010.

• Lopes, AS ; FERREIRA, F. A. ; Siqueira, JF Jr ; CARMO, F. L. ; PEIXOTO, R. S. ; Rôças, IN ; ROSADO, A. S. . Bacterial Community Profiling of Cryogenically Ground Samples from the Apical and Coronal Root Segments of Teeth with Apical Periodontitis. Journal of Endodontics , v. 35, p. 486-492, 2009.

• Lopes, AS ; COSTA, L. J. ; Mandic R. ; Shanw K ; AGUIAR, R. S. ; TANURI, A. ; LUCIW, P. ; PETERLIN, B. M. . Interactions between SIVNef, SIVGagPol and Alix correlate with viral replication and progression to AIDS in rhesus macaques. Virology (New York, N.Y. Print) , v. 394, p. 47-56, 2009.

• Lopes, AS ; PEIXOTO, R. S. ; ROSADO, A. S. . NOVOS MÉTODOS PARA ANÁLISE DA DIVERSIDADE MICROBIANA EM SISTEMAS DE TRATAMENTO DE RESÍDUOS SÓLIDOS E LÍQUIDOS. OECOLOGIA AUSTRALIS , v. 13, p. 631-648, 2009.

• Lopes, AS ; MARTINEZ, Ana Maria Barral ; HORA, Vanusa da ; MENDOZA, Raul ; GROLL, Andréa Von ; SOARES, Esmeralda AJM ; DAVILA, Nildo ; SILVEIRA, Jussara ; LEAL, Renata G ; TANURI, A. ; SOARES, M. A . Determinants of HIV-1 mother-to-child transmission in Southern Brazil. Anais da Academia Brasileira de Ciências (Impresso) , v. 78, p. 113-121, 2006.

• Lopes, AS ; COSTA, L. J. ; CHEN, N. ; AGUIAR, R. S. ; TANURI, A. ; Plemenitas, Anna ; PETERLIN, B. M. . Interactions between Nef and AIP1 proliferate multivesicular bodies and facilitate egress of HIV-1.. Retrovirology (London) , v. 3, p. 33, 2006.

• CV, V. ; Lopes, AS ; AS, H. . Adaptation of the Differential Display RT-PCR Technique to Isolate Sugarcane Induced by Plant Association with Endophytic Nitrogen Fixing Bacteria.. Anais da Academia Brasileira de Ciências (Impresso) , Brasil, v. 71, p. 515-520, 1999.

• Lopes, AS ; PEIXOTO, R. S. ; ROSADO, A. S. . Diversidade Microbiana Associada a Efluentes e Lixiviados da Região Metropolitana do Rio de Janeiro.. In: XI Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental, 2008, Fortaleza. XI ENAMA, 2008.

• VILELA, C. ; Lopes, AS ; AZEVEDO, F. ; ARAUJO, K. ; MARTINS, E. ; PEIXOTO, R. S. ; ROSADO, A. S. . DIVERSIDADE DE BACTERIAS DEGRADADORAS DE ESTRÓGENOS E LIPÍDEOS EM SISTEMAS DE TRATAMENTOS DE EFLUENTES EM AMBIENTES TROPICAIS. In: 25 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009. 25 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009.

• Lopes, AS ; Santos, AS ; Maia, D ; CARMO, F. L. ; PEIXOTO, R. S. ; ROSADO, A. S. . AVALIAÇÃO DA DIVERSIDADE BACTERIANA ASSOCIADA A LIXIVIADOS ORIUNDOS DE DISTINTOS ATERROS SANITÁRIOS. In: 25 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009. 25 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009.

• Lopes, AS ; Santos, AS ; CARMO, F. L. ; PEIXOTO, R. S. ; ROSADO, A. S. . AVALIAÇÃO DA COMUNIDADE MICROBIANA DURANTE O TRATAMENTO COMBINADO DE LIXIVIADOS COM ESGOTO DOMÉSTICO EM LAGOAS DE ESTABILIZAÇÃO. In: 25 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009. 25 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009.

• Lopes, AS ; PEIXOTO, R. S. ; ROSADO, A. S. . Microbial Diversity of wastewater treatment plants and leachate in Rio de Janeiro, Brazil.. In: XX International Congress of Genetics Berlin, 2008, Berlin. Genetics - Understanding Living Sistems, 2008.

• Lopes, AS ; Mandic R. ; Shanw K ; TANURI, A. ; LUCIW, P. ; COSTA, L. J. ; PETERLIN, B. M. . Interactions between Nef, Gagpol and ALIX contribuite to the pathogenesis of SIV in rhesus macaques. In: Cold Spring Harbor Retrovirus Conference - Retroviruses, 2007, New York. Retroviruses, 2007.

• Lopes, AS ; TANURI, A. ; LUCIW, P. ; PETERLIN, B. M. ; COSTA, L. J. . Characterization of SIVmac239 Nef protein binding to the viral precursor GagPol and Cellular Protein ALIX/AIP-1.. In: XVII Encontro Nacional de Virologia, 2006, Campos de Jordão/SP. Virus Reviews and Research, 2006. v. 11.

• COSTA, L. J. ; Lopes, AS ; AGUIAR, R. S. ; TANURI, A. ; PETERLIN, B. M. . Interactions between Nef and AIP-1 proliferate multivesicular bodies and facilitate egress of HIV-1.. In: XVII Encontro Nacional de Virologia, 2006, Campos de Jordão/SP. Virus Reviews and Research., 2006. v. 11.

• Lopes, AS ; COSTA, L. J. ; TANURI, A. ; PETERLIN, B. M. . Binding between Nef and GagPol is a conserved function within Lentiviruses and might be important for virus infectivity. In: VI Simpósio Brasileiro de Pesquisa Básica em HIV/AIDS, 2005, Ouro Preto/MG. SIMPAIDS abstracts & Program, 2005.

• Lopes, AS ; COSTA, L. J. ; TANURI, A. ; Shaw K. ; LUCIW, P. ; PETERLIN, B. M. . Binding between Nef and GagPol is a conserved function within Lentiviruses and might be important for virus infectivity.. In: 3rd IAS Conference on HIV Pathogenesis and Treatment, 2005, Rio de Janeiro. 3rd IAS Conference on HIV Pathogenesis and Treatment CD-ROM, 2005.

• Lopes, AS ; SOARES, A. E. R. ; COSTA, L. J. ; PETERLIN, B. M. . Binding Between Nef and GagPol is a Conserved Function within Lentiviruses and Might Be Important for Virus Infectivity.. In: XV Encontro Nacional de Virologia, 2004, São Pedro/SP. Virus Reviews and Research, 2004. v. 9.

• MARTINEZ, Ana Maria Barral ; Lopes, AS ; SILVEIRA, Jussara ; SASSI, R Mendoza ; HORA, Vanusa da ; SOARES, Esmeralda AJM ; DAVILA, Nildo ; SILVA, C. M. ; LEAL, Renata G ; SOARES, M. A . Prevalence of subtype C of human immunodeficiency virus type 1 and its influence on mother-to-child transmission in the city of Rio Grande.. In: V Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS, 2003, Rio de Janeiro. Resumos / Abstracts - V Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS, 2003.

• Lopes, AS ; HORA, Vanusa da ; MOURA, R ; SOARES, Esmeralda AJM ; SOARES, M. A . Prevalence of subtype C in pregnant women. In: XIV Encontro Nacional de Virologia, 2003, Florianópolis. Virus Reviews and Research, 2003. v. 8.

• CV, V. ; Lopes, AS ; Olivares, F.L. ; Baldani, J.I. ; Ferreira, P.C.G. ; AS, H. . Isolation and characterization of sugarcane (Saccharum spp.) genes induced by endophytic diazotrophic bacteria that encode putative membrane proteins.. In: 27a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular., 1998, Caxambu. SBBq - Programa e Resumos da 27a Reunião Anual., 1998.

• Adriana Lopes dos Santos . Organelle genomes of oceanic picophytoplankters (Chloropicophyceae) reveal convergent gene losses and a variant plastid genetic cod. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Adriana Lopes dos Santos . Protists, the other microbes: not animals, not plants, not fungus, not bacteria, just protists.. 2019. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Adriana Lopes dos Santos ; GOURVIL, P. ; Romac, S. ; Polina, Thibaut ; CORRE, E. ; RODRIGUEZ-HERNANDEZ, F. ; GARRIDO, J. L. ; Audic, Stéphane ; VARGAS, C. ; Vaulot, Daniel . Ecological diversity of prasinophytes clade VII, the dominant green algae in open oceans.. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Adriana Lopes dos Santos . Prasinophytes clade VII: Green balls in the Ocean.. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Adriana Lopes dos Santos ; VARGAS, C. ; Audic, Stéphane ; Vaulot, Daniel . Diversity and metagenomics of oceanic prasinophytes. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Adriana Lopes dos Santos ; GOURVIL, P. ; Romac, S. ; Vaulot, Daniel . Clade VII, an important open ocean Prasinophyte group.. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Adriana Lopes dos Santos ; Santos, AS ; CARMO, F. L. ; PEIXOTO, R. S. ; ROSADO, A. S. . AVALIAÇÃO DA COMUNIDADE MICROBIANA DURANTE O TRATAMENTO COMBINADO DE LIXIVIADOS COM ESGOTO DOMÉSTICO EM LAGOAS DE ESTABILIZAÇÃO. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Adriana Lopes dos Santos ; Santos, AS ; Maia, D ; CARMO, F. L. ; PEIXOTO, R. S. ; ROSADO, A. S. . Avaliação da Diversidade Bacteriana Associada a Lixiviados Oriundos de Distintos Aterros Sanitários.. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• Adriana Lopes dos Santos ; TANURI, A. ; LUCIW, P. ; PETERLIN, B. M. ; COSTA, L. J. . Characterization of SIVmac239 Nef protein binding to the viral precursor GagPol and Cellular Protein ALIX/AIP-1.. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Adriana Lopes dos Santos ; COSTA, L. J. ; TANURI, A. ; PETERLIN, B. M. . Binding between Nef and GagPol is a conserved function within Lentiviruses and might be important for virus infectivity.. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2021 - Atual

  Novos Genes Verdes, Descrição: A pesquisa genômica em algas verdes unicelulares (Chlorophyta) está longe de ter atingido seu pleno potencial e atualmente existe um viés significativo na sequência de representantes que dificulta nosso entendimento de sua diversidade, bem como de seu papel no meio ambiente. Apesar de milhares de espécies descritas (6878 catalogadas no AlgaeBase) de 13 linhagens diferentes, apenas 89 genomas nucleares de Chlorophyta estão disponíveis no GenBank. Destes, mais de 80% estão restritos a dois grupos de organismos que servem como sistemas modelo (por exemplo, Chlamydomonas reinhardtii) ou são considerados de importância econômica (por exemplo, Chlorella e Nannochloris). Aqui, propomos preencher a lacuna na árvore Chlorophyta selecionando genomas de linhagens verdes unicelulares sub-representadas. Nossa seleção inclui organismos de ambientes marinhos (pelágicos, batipelágicos e bentônicos), de água doce, terrestres e de gelo marinho. O objetivo principal deste projeto é melhorar nossa compreensão da evolução das arquiteturas do genoma, sequências de genes e capacidades metabólicas entre as clorofitas. Os organismos propostos também são de interesse para a fabricação de biocombustíveis, bioplásticos e outros bioprodutos, bem como para a engenharia ambiental de diversos microbiomas e, portanto, são de importância central para a missão do DOE. Este projeto também está bem alinhado com o plano estratégico "Beyond Basepairs" da JGI, uma vez que os dados produzidos irão fornecer uma riqueza de informações genômicas abrangendo todo o ramo filogenético da Chlorophyta, definindo o caminho para o desenvolvimento de novos organismos modelo e ferramentas genéticas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Adriana Lopes dos Santos - Coordenador / Marek Mutwil - Integrante / Claude Lemieux - Integrante / Gwenael Piganeau - Integrante / Monique Turmel - Integrante / Jean-Francois Pombert - Integrante., Financiador(es): US Department of Energy - Joint Genome Institute - Outra.

• 2021 - Atual

  Revelando as dinâmicas temporais de expressão de genes de fitoplâncton por sequencimento de ARN de células individuais., Descrição: Este projeto tem como objetivo apresentar o Drop-Seq para estudar a expressão gênica diurna em fitoplâncton marinho. Drop-Seq um é dispositivo microfluídico desenvolvido no laboratorio com baixo custo para analise de padroes de expressoes (transcriptoma) em celulas individuais. Este método de sequenciamento de célula única usa um dispositivo microfluídico para compartimentar as gotículas contendo uma única célula, tampão de lise e uma micropérola coberta com primers com código de barras. Drop-Seq nos permite capturar a expressão gênica de células fitoplanctônicas individuais, apreendendo os diferentes estados de expressão gênica de cada indivíduo durante o ciclo diurno. Estudar o ciclo celular pode nos dizer muito sobre como uma célula funciona e os mecanismos que controlam sua divisão, mas essa informação é limitada a muito poucas espécies de fitoplâncton, pois experimentos típicos requerem a coleta de muitas amostras de RNA-seq, que podem ser economicamente proibitivas. . Para este fim, construímos um dispositivo microfluídico Drop-Seq, e vamos usá-lo para estudar o ciclo celular de espécies de fitoplâncton modelo de 2 classes distintas de linhagem verde que representam o fitoplâncton de águas costeiras, oceânicas, polares e tropicais: Mamiellophyceae (uma das o principal grupo fitoplanctônico encontrado nas águas de Cingapura5) e Chloropicophyceae (a contraparte oceânica). É importante ressaltar que enquanto os experimentos típicos do ciclo celular requerem 18 amostras de RNA-seq para analisar a expressão gênica de uma espécie, nosso protocolo modificado tem o potencial de fornecer uma análise detalhada da expressão gênica diurna para várias espécies com apenas uma análise de RNA-seq.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Adriana Lopes dos Santos - Coordenador / Marek Mutwil - Integrante., Financiador(es): Nanyang Technological University - Auxílio financeiro.

• 2019 - Atual

  SIMPLE: Singapore Marine Planktonic Eukaryotes, Descrição: As águas costeiras fornecem vários serviços que beneficiam os seres humanos, incluindo aquicultura, pesca, geração de energia, abastecimento de água e diversos serviços culturais e recreativos. Um grande desafio é manter esses serviços sem afetar a biodiversidade e os processos ecossistêmicos que sustentam sua sustentabilidade. O monitoramento da biodiversidade permite avaliar o impacto ambiental das atividades antrópicas. As comunidades planctônicas são o pilar de todos os ecossistemas aquáticos e, portanto, a espinha dorsal dos programas de monitoramento ambiental. Os eucariotos unicelulares marinhos, também chamados de protistas, fazem parte de comunidades planctônicas e há muito tempo são usados em programas de biomonitoramento. Apesar da pressão de uma crescente população humana nas águas costeiras (e oceânicas) do Sudeste Asiático, as comunidades de protistas planctônicos e sua dinâmica permanecem em grande parte desconhecido nas águas costeiras tropicais e equatoriais. Por meio de uma combinação de metodologias bem estabelecidas, propomos desvendar a composição das comunidades protistas planctônicas nas águas costeiras de Cingapura e avaliar os fatores que controlam essas comunidades em escalas espaciais e temporais. O conhecimento fornecido por este projeto servirá como base para futuros programas de monitoramento que visam incluir comunidades protistas como indicadores biológicos para avaliar o estado de qualidade ecológica das águas costeiras de Cingapura. Também contribuirá para enriquecer e complementar a escassa informação sobre a dinâmica das comunidades protistas tropicais em regime de monções.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Adriana Lopes dos Santos - Coordenador., Financiador(es): Ministry of Education Academic Research Fund - Auxílio financeiro.

• 2017 - 2019

  PiSCOSouth: Picophytoplankton Study of Carbon rates in Oligotrophic waters of the South Pacific and Atlantic Oceans, Descrição: A parte sul dos oceanos Pacífico e Atlântico são regiões oceânicas sub amostradas. Em particular, eles contêm áreas mesotróficas e oligotróficas cuja produção primária é dominada por células eucarióticas muito pequenas com menos de 2-3 m (pico-fitoplâncton). Apesar de sua importância ecológica, muitos desses organismos ainda são incultos e sua morfologia e fisiologia desconhecidas. Estudos moleculares anteriores relataram grupos como prasinófitos clados VII e IX, haptófitos e crisófitos como dominantes nessas águas. A dominância desses grupos em frações de pequeno tamanho de organismo em águas oligotróficas pode, portanto, se tornar cada vez mais importante no oceano futuro afetado pelo aquecimento global e oligotroficação. Se as águas tropicais offshore se tornarem mais oligotróficas em resposta à mudança global, como previsto, uma mudança na dominância da classe de tamanho pode muito bem ocorrer entre os grupos de fitoplâncton, e esses grupos de pequenos eucariotos fotossintéticos podem se tornar dominantes nessas águas. Apesar de sua importância, pouco se sabe sobre eles, principalmente porque desses cinco grupos apenas pelagófitos e prasinófitos do clado VII têm representantes na cultura e, mesmo assim, permanecem sem uma descrição formal, como é o caso dos prasinófitos do clado VII. O objetivo desta proposta é obter informações detalhadas sobre a diversidade e produção de picofitoplânctons eucarióticos nessas águas a partir de amostras de um conjunto de cruzeiros planejados ou para os quais serão feitas aplicações no Pacífico Sul e Atlântico Sul. Iremos combinar uma gama de técnicas de ponta para este fim: gene meta-barcoding, medições de produtividade C14 em populações classificadas por citometria de fluxo, microscopia eletrônica acoplada com hibridização de sonda in situ e isolamento de cultura de alto rendimento usando classificação por citometria de fluxo. Este trabalho será realizado em colaboração com pesquisadores do Chile, França e Noruega. Isso deve resultar em um grande conjunto de dados sobre esses ecossistemas pouco conhecidos, ajudando a prever sua resposta às mudanças globais previstas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Adriana Lopes dos Santos - Coordenador / Nicole Trefault - Integrante., Financiador(es): Comisión Nacional de Investigacion Científica y Tecnológica - Auxílio financeiro.

Prêmios